標(biāo)準(zhǔn)解讀
《LY/T 2347-2014 剛竹屬DNA擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)分析方法》是一項(xiàng)針對(duì)剛竹屬植物的分子標(biāo)記技術(shù)標(biāo)準(zhǔn),旨在通過(guò)AFLP技術(shù)對(duì)不同種類或個(gè)體間的遺傳差異進(jìn)行鑒定。該標(biāo)準(zhǔn)詳細(xì)規(guī)定了從樣品采集到數(shù)據(jù)分析的整個(gè)流程,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性和可重復(fù)性。
首先,在樣品采集階段,標(biāo)準(zhǔn)明確了如何選擇和處理用于提取DNA的竹子材料。要求選取健康、無(wú)病蟲(chóng)害的新鮮葉片作為樣本,并且在采集后盡快進(jìn)行低溫保存以防止DNA降解。
接下來(lái)是DNA提取部分,提供了具體的步驟來(lái)獲得高質(zhì)量的基因組DNA。這一步驟對(duì)于后續(xù)的酶切反應(yīng)至關(guān)重要,因?yàn)橹挥屑兌雀咔彝暾腄NA才能保證酶切效果良好。
然后進(jìn)入AFLP核心操作環(huán)節(jié)——限制性內(nèi)切酶消化與接頭連接。通過(guò)使用特定的限制性內(nèi)切酶切割DNA,形成具有粘性末端的小片段;隨后將特制的人工合成接頭連接到這些片段上,為下一步的選擇性擴(kuò)增做準(zhǔn)備。
選擇性擴(kuò)增是指利用帶有選擇性堿基的引物對(duì)已連接接頭的DNA片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增。這一過(guò)程能夠放大那些攜帶特定序列信息的目標(biāo)片段,從而使得即使是非常細(xì)微的遺傳變異也能被檢測(cè)出來(lái)。
最后,擴(kuò)增產(chǎn)物需要經(jīng)過(guò)電泳分離,并采用銀染法或其他合適的方法顯色,以便于觀察和記錄。根據(jù)條帶的位置及數(shù)量差異,可以構(gòu)建出各個(gè)樣品之間的親緣關(guān)系圖譜。
此標(biāo)準(zhǔn)還強(qiáng)調(diào)了實(shí)驗(yàn)過(guò)程中需要注意的一些細(xì)節(jié)問(wèn)題,比如嚴(yán)格控制反應(yīng)條件(溫度、時(shí)間等),以及合理設(shè)置對(duì)照實(shí)驗(yàn)以排除假陽(yáng)性或假陰性的干擾。通過(guò)遵循這套標(biāo)準(zhǔn)化的操作流程,研究人員能夠更有效地利用AFLP技術(shù)開(kāi)展剛竹屬植物分類學(xué)研究、種質(zhì)資源評(píng)價(jià)等工作。
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....
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- 現(xiàn)行
- 正在執(zhí)行有效
- 2014-08-21 頒布
- 2014-12-01 實(shí)施
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LY/T 2347-2014剛竹屬DNA擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(AFLP)分析方法-免費(fèi)下載試讀頁(yè)文檔簡(jiǎn)介
ICS6502020
B65..
中華人民共和國(guó)林業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)
LY/T2347—2014
剛竹屬DNA擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性AFLP
()
分析方法
MethodofDNAamlificationframentlentholmorhismAFLP
pggpyp()
forPhyllostachysbamboo
2014-08-21發(fā)布2014-12-01實(shí)施
國(guó)家林業(yè)局發(fā)布
LY/T2347—2014
前言
本標(biāo)準(zhǔn)按照給出的規(guī)則起草
GB/T1.1—2009。
本標(biāo)準(zhǔn)的附錄為規(guī)范性附錄
。
本標(biāo)準(zhǔn)由全國(guó)竹藤標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會(huì)提出并歸口
(SAC/TC263)。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位國(guó)際竹藤中心北京林業(yè)大學(xué)中國(guó)林業(yè)科學(xué)研究院亞熱帶林業(yè)研究所
:、、。
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人李雪平高志民牟少華陳敏袁金玲
:、、、、。
Ⅰ
LY/T2347—2014
剛竹屬DNA擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性AFLP
()
分析方法
1范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了剛竹屬Phyllostachys竹種的提取酶切連接擴(kuò)增實(shí)驗(yàn)步驟及采用的儀器
()DNA、、、
設(shè)備
。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于剛竹屬竹種多態(tài)性的分析
DNA。
2試劑
21所用化學(xué)試劑如沒(méi)有特殊說(shuō)明均為分析純
.,。
22提取液細(xì)胞裂解液
.DNA:1mol/LTris-HClpH8.2、(1mol/LTris-HClpH7.5,0.25mol/LED-
氯化鈉與按混合在使用前加入亞硫酸鈉至終濃
TApH8.0,5mol/L,2%CTAB)5%SLS5∶5∶2,
度為
0.02mol/L。
23三氯甲烷異戊醇
.∶=24∶1。
24異丙醇
.。
25乙醇無(wú)水乙醇加蒸餾水定容到
.70%:70mL100mL。
26氯化鈉稱取氯化鈉用蒸餾水溶解后定容到
.5mol/L:29.22g,100mL。
27溴化乙錠稱取溴化乙錠用蒸餾水溶解后定容到
.0.5mg/mL:5mg,10mL。
28變性緩沖液去離子甲酰胺二甲苯青溴酚
.:50mL,EDTA(0.5mol/L,pH=8.0)1mL,FF0.125g,
藍(lán)
0.125g。
29硼酸定容到
.10×TBE:Tris108.0g,55.0g,0.5mol/LEDTA(pH8.0)40mL,1000mL。
210丙烯酰胺溶液甲叉雙丙烯酰胺丙烯酰胺混合加水定容到
.40%:2.0g,38.0g100mL。
211過(guò)硫酸胺溶液過(guò)硫酸胺加水定容到
.10%:1.0g10mL。
3儀器
31儀具有功能溫度精度
.PCR(touchdown,±0.2℃)。
32移液器
.。
33低溫離心機(jī)以上
.4℃(max14000r/min)。
34水浴鍋
.。
35電泳儀可滿足測(cè)序
.(DNA)。
36紫外分光光度計(jì)
.。
37分析天平
.。
38搖床
.。
4試驗(yàn)步驟
41DNA提取
.
按照附錄的方法提取和檢測(cè)竹子基因組電泳檢測(cè)主帶完整
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