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第四章核酸化學(xué)第一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日認(rèn)識(shí)核酸在生命科學(xué)上的重要性弄清堿基、核苷、核苷酸和核酸分子結(jié)構(gòu)上的關(guān)系了解核酸的化學(xué)本質(zhì)及DNA和RNA在組分、結(jié)構(gòu)和功能上的差異認(rèn)識(shí)核酸的結(jié)構(gòu)與其性質(zhì)與功能之間的關(guān)系。學(xué)習(xí)要求第二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第四章的知識(shí)網(wǎng)絡(luò)第三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日目錄第一節(jié)核酸的概念、分類和功能
第二節(jié)核酸的組成和分子結(jié)構(gòu)
第三節(jié)DNA的結(jié)構(gòu)
第五節(jié)核酸的性質(zhì)及分離、分析
第六節(jié)核酸的應(yīng)用★★第四節(jié)RNA的結(jié)構(gòu)
★第四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第一節(jié)核酸的概念、分類和功能一、核酸的發(fā)現(xiàn)二、核酸概念和分類第五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1868年,F(xiàn).Miescher首先從傷員繃帶的膿細(xì)胞中分離得到稱為“核素”的核酸1889年,Altman等從酵母和動(dòng)物的細(xì)胞核中制備出不含蛋白質(zhì)的核酸,這是首次使用核酸這一詞。1944年,通過(guò)轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)證實(shí)DNA是主要的遺傳物質(zhì)1953年,J.D.Watson和提出DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型核酸的發(fā)現(xiàn)和研究簡(jiǎn)史第六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1968年Nirenberg發(fā)現(xiàn)遺傳密碼。1975年Temin和Baltimore發(fā)現(xiàn)逆轉(zhuǎn)錄酶。1981年Gilbert和Sanger建立DNA測(cè)序方法。1985年Mullis發(fā)明PCR技術(shù)。1990年美國(guó)啟動(dòng)人類基因組計(jì)劃(HGP)。1994年中國(guó)人類基因組計(jì)劃啟動(dòng)。2000年人類基因組計(jì)劃。第七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第一節(jié)核酸的概念、分類和功能核酸(nucleicacid)是生物體內(nèi)含有磷酸基團(tuán)的重要生物大分子,主要作用是信息的儲(chǔ)存和傳遞。核酸分為脫氧核糖核酸(DNA)以及核糖核酸(RNA)兩類,DNA所含核苷酸分子數(shù)比RNA大得多。RNA分為三個(gè)類型,即核糖體RNA(rRNA)、信使RNA(mRNA)和轉(zhuǎn)移RNA(tRNA),它們都參與蛋白質(zhì)合成。第八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日DNA是遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),負(fù)責(zé)遺傳信息的貯存和發(fā)布,遺傳基因就是DNA鏈上的若干核苷酸所組成的片段。RNA負(fù)責(zé)遺傳信息的表達(dá),直接參與蛋白質(zhì)生物合成,轉(zhuǎn)錄DNA所發(fā)布的遺傳信息,并將之翻譯給蛋白質(zhì),使生命機(jī)體的生長(zhǎng)、發(fā)育、繁殖和遺傳得以繼續(xù)進(jìn)行。核酸的功能第九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日核酸核苷酸磷酸核苷戊糖堿基水解核蛋白蛋白質(zhì)第二節(jié)核酸的組成和分子結(jié)構(gòu)
組成元素(C,H,O,N,P)第十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日一、戊糖三、核苷二、堿基四、核苷酸第二節(jié)核酸的組成和分子結(jié)構(gòu)
五、核酸第十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日組成核酸的戊糖有兩種
組成DNA
組成RNA一、戊糖第十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日二、堿基1.嘧啶堿基2.嘌呤堿基3.稀有堿基4.堿基的性質(zhì)第十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日核酸中的堿基分兩類:(1)嘧啶堿:胞嘧啶(C)尿嘧啶(U)胸腺嘧啶(T)(2)嘌呤堿:腺嘌呤(A)鳥(niǎo)嘌呤(G)二、堿基第十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日尿嘧啶U胸腺嘧啶T胞嘧啶CDNA特有RNA特有1.嘧啶堿基第十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日鳥(niǎo)嘌呤G腺嘌呤A2.嘌呤堿基第十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日3.稀有堿基核酸中的部分稀有堿基DNARNA嘌呤7-甲基鳥(niǎo)嘌呤N6-甲基腺嘌呤N6-甲基腺嘌呤N6,N6-二甲基腺嘌呤7-甲基鳥(niǎo)嘌呤嘧啶5-甲基胞嘧啶5-羥甲基胞嘧啶假尿嘧啶二氫尿嘧啶第十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日3.稀有堿基第十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日假尿苷()二氫尿嘧啶(DHU)AmCH3CH3H3Cm26AHH52’-O-甲基腺苷(Am)第十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日4.堿基的性質(zhì)酮式-烯醇式互變異構(gòu)氨基-亞氨基互變異構(gòu)具有吸收紫外光的性質(zhì),最大吸收波長(zhǎng)在260nm左右堿基的紫外吸收光譜隨pH的改變而改變化學(xué)性質(zhì)比較穩(wěn)定嘌呤堿基還可以被銀鹽沉淀第二十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日三、核苷1.核苷的結(jié)構(gòu)2.核苷的書寫第二十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日核苷是一種糖苷,由戌糖和堿基縮合而成。糖與堿基之間以糖苷鍵相連接。糖的第一位上的碳原子(C1)與嘧啶堿的第一位上的氮原子(N1)或嘌呤堿的第九位上的氮原子(N9)相連,所以糖與堿基間的連鍵是N-C鍵,一般稱之為N-糖苷鍵。1.核苷的結(jié)構(gòu)第二十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日糖與堿基之間以C-N糖苷鍵連接11191.核苷的結(jié)構(gòu)1’2’3’4’5’(OH)1’2’3’4’5’(OH)嘧啶核苷嘌呤核苷第二十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日2.核苷的書寫核苷可用單字符號(hào)A(腺嘌呤核苷,簡(jiǎn)稱腺苷)、G(鳥(niǎo)苷)、C(胞苷)、U(尿苷)表示。脫氧核苷則在單字符號(hào)前面加一個(gè)小寫的d,如dA(腺嘌呤脫氧核糖核苷,簡(jiǎn)稱脫氧腺苷)、dG(脫氧鳥(niǎo)苷)、dC(脫氧胞苷)、dT(脫氧胸苷)。稀有堿基(或稱為修飾堿基)與戊糖通過(guò)糖苷鍵結(jié)合生成的核苷稱為稀有核苷(或稱為修飾核苷)。第二十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1.核苷酸的種類2.核苷酸的結(jié)構(gòu)與命名3.多磷酸核苷及其衍生物4.環(huán)核苷酸5.核苷酸的性質(zhì)四、核苷酸第二十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日核苷中的戌糖羥基被磷酸酯化,就形成核苷酸作為DNA或RNA結(jié)構(gòu)單元的核苷酸分別是5′-磷酸-脫氧核糖核苷和5′-磷酸-核糖核苷。1.核苷酸的種類第二十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1.核苷酸的種類第二十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日核苷或脫氧核苷與磷酸通過(guò)酯鍵結(jié)合構(gòu)成核苷酸(ribonucleotide)或脫氧核苷酸(deoxyribonucleotide)。NNNN9NH2OOHOHHHHCH2H1'2'OPO-HOO糖苷鍵酯鍵第二十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日2.核苷酸的結(jié)構(gòu)與命名第二十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第三十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第三十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日M-單(D-二;T-三);P-磷酸RNA的名稱為某(單、二、三)磷酸核苷酸,DNA在某(單、二、三)前加脫氧兩字。如AMP稱腺苷-磷酸(或腺苷酸),dAMP稱為脫氧腺苷-磷酸(脫氧腺苷酸)。八種核苷酸的表示2.核苷酸的結(jié)構(gòu)與命名第三十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日參與核酸生物合成的直接原料不是一磷酸核苷酸,而是三磷酸核苷酸,如ATP(三磷酸腺苷酸)。ATP上的磷酸殘基用α、β、γ來(lái)編號(hào)。ATP含有兩個(gè)高能磷酸酯鍵(~P),其水解時(shí)釋放出的能量為7.3千卡/克分子(普通磷酸酯鍵為2千卡/克分子)。ATP在細(xì)胞能量代謝中起著及其重要的作用。3.多磷酸核苷及其衍生物第三十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1.繼續(xù)磷酸化AMPADPATP3.多磷酸核苷及其衍生物第三十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日環(huán)化磷酸化:cAMP和cGMP在細(xì)胞的代謝調(diào)節(jié)中有重要作用,稱為第二信使cAMPcGMP3.多磷酸核苷及其衍生物第三十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日3、含核苷酸的生物活性物質(zhì):
NAD+、NADP+、CoASH、FAD等3.多磷酸核苷及其衍生物第三十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日4.核苷酸的性質(zhì)堿基可以發(fā)生酮式和烯醇式的互變異構(gòu),體內(nèi)以酮式為主。核苷酸在240~290nm具有強(qiáng)烈的光吸收,最大吸收波長(zhǎng)在260nm左右。核苷酸是兩性電解質(zhì),在不同的pH條件下,其解離程度不同,在某一pH值時(shí),對(duì)外不表現(xiàn)出電性,該pH值稱為其等電點(diǎn)。核苷酸在日常生活中也有重要用途,如在食品行業(yè)中作為鮮味劑,稱為呈味核苷酸。一般物理性質(zhì):第三十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1、核酸的結(jié)構(gòu)2、核酸的降解五、核酸第三十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日脫H2O脂鍵相連3`,5`-磷酸二酯鍵首尾3`5`5`3`1、核酸的結(jié)構(gòu)第三十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日2、核酸的降解(1)堿水解(2)酸水解(3)酶水解第四十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(1)堿水解RNA用0.3mol/L的NaOH在37℃條件下處理16~18h可被完全降解,得到2’-核苷酸和3’-核苷酸。同樣的條件下DNA十分穩(wěn)定,不被降解。利用此性質(zhì)可以進(jìn)行DNA和RNA的鑒別和分離。第四十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(1)堿水解RNA水解產(chǎn)物中會(huì)含有2’-核苷酸?第四十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(2)酸水解在不同的酸濃度下,核酸的水解產(chǎn)物不同。嘌呤的糖苷鍵比嘧啶的糖苷鍵對(duì)酸更不穩(wěn)定。脫氧核糖的糖苷鍵比核糖的糖苷鍵更易被酸水解。第四十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(3)酶水解按照核酸酶作用底物:分為核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶按照核酸酶對(duì)底物作用方式:分為核酸外切酶和核酸內(nèi)切酶按照核酸酶所作用化學(xué)鍵:分為磷酸二酯酶和磷酸單酯酶第四十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(3)酶水解核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶。核酸外切酶和核酸內(nèi)切酶。磷酸二酯酶和磷酸單酯酶。第四十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日一、DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)三、DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)二、DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)四、核酸序列的研究方法第三節(jié)DNA的結(jié)構(gòu)
五、DNA基因組第四十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日一、DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)雙鏈線性分子:細(xì)胞核內(nèi)的DNA、有些動(dòng)物病毒。環(huán)狀雙鏈DNA:原核生物染色體DNA、質(zhì)粒DNA、真核生物細(xì)胞器DNA、有些動(dòng)物病毒。第四十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日各核苷酸殘基沿多核苷酸鏈排列的順序叫核酸的一級(jí)結(jié)構(gòu)。連接鍵:3,5一磷酸二酯鍵連接起來(lái)的直線形或環(huán)形分子。DNA沒(méi)有側(cè)鏈。一、DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)第四十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日DNA線條縮寫:戊糖5`-磷酸PA核苷酸5`3`首端末端PPPPPPAGCTGCOH3`-OH
核苷酸順序又稱堿基順序,是蛋白質(zhì)與核酸結(jié)構(gòu)的生物語(yǔ)言。堿基一、DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)
第四十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日DNA字母簡(jiǎn)寫:
5`
…
P
A
P
G
P
C
P
T
P
GP
C-OH
…3`
或
5`
…
AGCTGC
…3`一、DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)第五十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日公認(rèn)的為1953年watson和crick提出的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。二、DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)第五十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日二、DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)1.實(shí)驗(yàn)證據(jù)2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)3.雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性4.DNA雙螺旋的不同類型5.三螺旋DNA和四螺旋DNA第五十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1.實(shí)驗(yàn)證據(jù)(1)20世紀(jì)40年代末,Avery證實(shí)了遺傳物質(zhì)是DNA(2)20世紀(jì)50年代初,Chargaff規(guī)則:①無(wú)組織特異性;②不隨生物體的年齡、營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)或環(huán)境變化而改變;③A=T,G=C;④不同生物來(lái)源的DNA堿基組成不同。(3)1952年,Wilkins和Franklin等人研究DNA的X光衍射圖譜,說(shuō)明DNA分子可能含有螺旋結(jié)構(gòu)。(4)1952年,Gulland和Jordan,說(shuō)明DNA分子中的堿基間會(huì)形成氫鍵。
(5)1953年,Watson和Crick,DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。第五十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(1)兩條多核苷酸鏈組成反向平行(p5’-糖3’-p的結(jié)構(gòu)與p3’-糖5’-p的結(jié)構(gòu)相對(duì))兩條鏈的糖-磷酸主鏈都是右手螺旋,有一共同螺旋軸2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)第五十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(2)兩條鏈上的堿基互補(bǔ)配對(duì):A-T,C-G或T-A,G-CA與T之間為二個(gè)氫鍵,C與G之間為三個(gè)氫鍵2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)第五十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)雙螺旋的螺距為3.4nm,螺旋的直徑為2nm,相鄰堿基對(duì)平面間的距離是0.34nm。雙螺旋的每一轉(zhuǎn)有10對(duì)核苷酸,相鄰核苷酸之間的夾角為36°。
(3)第五十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日螺旋表面有一條大溝和一條小溝大溝小溝2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)(4)第五十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)(5)堿基平面與雙螺旋的中心軸垂直,糖環(huán)平面與中心軸平行。第五十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)(6)雙螺旋結(jié)構(gòu)橫向靠氫鍵穩(wěn)定,縱向靠堿基堆積力維系穩(wěn)定。第五十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日2.B-DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的要點(diǎn)(7)一個(gè)鏈的堿基順序確定后,則另一條鏈必有相對(duì)應(yīng)的堿基順序。堿基互補(bǔ)原則具有極重要意義,DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、反轉(zhuǎn)錄等過(guò)程的分子基礎(chǔ)都是堿基互補(bǔ)配對(duì)。第六十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(1)氫鍵;(2)離子鍵及范德華力;(3)堿基堆積力;3.雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性第六十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(1)氫鍵:兩條鏈間堿基的相互作用,A與T之間為二條氫鍵,C與G之間為三條氫鍵。氫鍵作用力很弱,但DNA分子中存在大量氫鍵,因此氫鍵為一重要穩(wěn)定因素;(2)離子鍵及范德華力:DNA分子中磷酸基團(tuán)在生理?xiàng)l件下解離,使DNA成為一種多陰離子,這有利于它與帶正電荷的其它陽(yáng)離子基團(tuán)發(fā)生靜電作用,這樣減少雙鏈間的靜電排斥,有利于雙螺旋的穩(wěn)定;(3)堿基堆積力:目前普遍認(rèn)為堆積堿基間的疏水作用是穩(wěn)定DNA結(jié)構(gòu)的更重要的因素。大量堿基層層堆積,兩相鄰堿基的平面十分貼近,于是使雙螺旋結(jié)構(gòu)內(nèi)部形成一個(gè)強(qiáng)大的疏水區(qū),與介質(zhì)中的小分子隔開(kāi),有利于互補(bǔ)堿基之間氫鍵的形成;3.雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性第六十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日4.DNA雙螺旋的不同類型B型DNA(B-DNA):在相對(duì)濕度為92%時(shí),所得到的DNA鈉鹽纖維;A型DNA(A-DNA):在相對(duì)濕度低于75%時(shí),獲得的DNA鈉鹽纖維;此外還有Z-DNA等;第六十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日4.DNA雙螺旋的不同類型第六十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日5.三螺旋DNA和四螺旋DNA雙螺旋DNA可以與單鏈DNA分子結(jié)合形成三螺旋DNA;人工合成的單鏈DNA序列(T/A)mGn(m=1~4,n=1~8)中的4個(gè)鳥(niǎo)嘌呤可以通過(guò)Hoogsteen氫鍵配對(duì)形成分子內(nèi)或分子間的四螺旋DNA;第六十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日5.三螺旋DNA和四螺旋DNA第六十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日
當(dāng)研究某些小病毒、線粒體、葉綠體及某些細(xì)菌中分離出來(lái)降解的DNA時(shí),發(fā)現(xiàn)它們的雙螺旋二級(jí)結(jié)構(gòu)還可進(jìn)一步緊縮成閉鏈環(huán)狀或開(kāi)鏈環(huán)狀以及麻花狀等,這是DNA形成的三級(jí)結(jié)構(gòu)。松弛形解鏈環(huán)形負(fù)超螺旋三、DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)第六十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu):在細(xì)胞內(nèi),由于DNA分子與其它分子(主要是蛋白質(zhì))的相互作用,使DNA雙螺旋進(jìn)一步扭曲形成的高級(jí)結(jié)構(gòu)。超螺旋是指雙螺旋進(jìn)一步扭曲或再螺旋的構(gòu)象;正超螺旋(盤繞方向與DNA雙螺旋方同相同
)和負(fù)超螺旋(盤繞方向與DNA雙螺旋方同相反
);人類46條染色體的DNA總長(zhǎng)可達(dá)1.7m,經(jīng)過(guò)螺旋化壓縮,實(shí)際總長(zhǎng)只有200nm;三、DNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)第六十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第六十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日原核生物DNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)第七十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日真核生物DNA的存在形式--核小體真核生物中DNA雙螺旋沿著組蛋白八聚體核心的短軸繞1.75圈,形成左手超螺旋,稱核小體。染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單位是核小體。串珠狀結(jié)構(gòu)進(jìn)一步卷曲形成螺線管,后者再進(jìn)一步卷曲形成超螺旋管,形成染色單體。第七十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第七十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第七十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第七十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日一、RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)二、RNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)第四節(jié)RNA的結(jié)構(gòu)
第七十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)指的是多核苷酸鏈中核糖核苷酸的排列順序,即多核苷酸鏈中堿基的排列順序。RNA是無(wú)分支的線形結(jié)構(gòu)。一、RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)第七十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日RNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)基本上是單股分子,其二級(jí)結(jié)構(gòu)比DNA簡(jiǎn)單的多,但也存在少數(shù)堿基配對(duì)區(qū)域即雙螺環(huán)結(jié)構(gòu)。二、RNA的高級(jí)結(jié)構(gòu)第七十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(1)占總RNA的15%(2)一種氨基酸對(duì)應(yīng)最少一種RNA(3)分子中含有較多修飾成分(4)3‘-末端都具有CCAOH結(jié)構(gòu)(5)半數(shù)堿基可經(jīng)過(guò)自身回折,形成局部雙螺旋“莖”結(jié)構(gòu),其間是單鏈形成的“環(huán)”。絕大多數(shù)tRNA經(jīng)過(guò)這樣的折疊形成4個(gè)莖和4個(gè)環(huán)組成的特征性三葉草形二級(jí)結(jié)構(gòu)。1、tRNA第七十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日占總RNA的80%2、rRNA原核生物真核生物核糖體rRNA核糖體rRNA30s70s50s16s5s、23s40s80s50s18s5s、5.8s、28s5sRNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)第七十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日
占總RNA的3%~5%3、mRNA和hnRNA真核細(xì)胞mRNA的3‘-末端有一段長(zhǎng)達(dá)200個(gè)核苷酸左右的聚腺苷酸(polyA),稱為“尾結(jié)構(gòu)”,5’-末端有一個(gè)甲基化的鳥(niǎo)苷酸,稱為”帽結(jié)構(gòu)“。hnRNA內(nèi)含子mRNA外顯子第八十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日3、mRNA和hnRNA真核生物mRNA特征:“帽子”(m7G-5′ppp5′-N-3′p)+單順?lè)醋?“尾巴”(PolyA)第八十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日真核細(xì)胞mRNA的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)AAAAAAA-OH5′
“帽子”PolyA
3′
m7G-5′ppp-N-3′p第八十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日RNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)在tRNA二級(jí)結(jié)構(gòu)中未配對(duì)的某些并不互補(bǔ)的堿基參與了三級(jí)結(jié)構(gòu)中特殊的氫鍵作用,tRNA鏈中的核糖-磷酸骨架與某些堿基甚至其他的骨架之間也能產(chǎn)生作用。
第八十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日第五節(jié)核酸的性質(zhì)及分離、分析
一、核酸的理化性質(zhì)二、核酸的分離三、核酸的分析四、核酸測(cè)序的研究方法第八十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日一、核酸的理化性質(zhì)一、一般物理性質(zhì)二、核酸的水解三、兩性解離四、紫外吸收性質(zhì)五、穩(wěn)定性六、變性七、復(fù)性與雜交第八十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(一)一般物理性質(zhì)1、DNA白色纖維狀固體,RNA白色粉末狀固體,都微溶于水,不溶于乙醇,因此常用乙醇來(lái)沉淀DNA;DNA溶液黏度大于RNA;2、DNA難溶于0.14mol/L的NaCl溶液,可溶于1—2mol/L的NaCl溶液,RNA則相反,可據(jù)此分離二者;第八十六頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(二)核酸的水解1.核酸分子中的磷酸二酯鍵可在酸或堿性條件下水解切斷。2.DNA和RNA對(duì)酸或堿的耐受程度有很大差別。室溫條件下,DNA在堿中變性,但不水解,RNA水解。例如,在0.1mol/LNaOH溶液中,RNA幾乎可以完全水解;DNA在同樣條件下則不受影響。第八十七頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日
DNA的相對(duì)分子質(zhì)量較大,一般為106~109bp,大多數(shù)DNA為線性分子,分子極不對(duì)稱,雖然其長(zhǎng)度可達(dá)cm級(jí)但分子的直徑只有nm級(jí)。RNA的相對(duì)分子質(zhì)量較小,通常為104~106bp。第八十八頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(三)兩性解離1.核酸含酸性的磷酸基團(tuán),又含弱堿性的堿基,為兩性電解質(zhì),可發(fā)生兩性解離;2.核酸相當(dāng)于多元酸,pH大于4時(shí),呈陰離子狀態(tài);第八十九頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(四)紫外吸收在核酸分子中嘌呤堿和嘧啶堿都含有共軛雙鍵體系,在260nm有吸收;可以作為區(qū)別蛋白質(zhì)和對(duì)核酸及其組份定性和定量測(cè)定的依據(jù),進(jìn)行核酸純度鑒定,也可作為核酸變性和復(fù)性的指標(biāo)。第九十頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日1.DNA或RNA的定量OD260=1.0相當(dāng)于50μg/ml雙鏈DNA40μg/ml單鏈DNA(或RNA)20μg/ml寡核苷酸2.判斷核酸樣品的純度DNA純品:OD260/OD280=1.8RNA純品:OD260/OD280=2.0第九十一頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(五)DNA的穩(wěn)定性DNA的溶液呈粘稠狀,但實(shí)際上DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)僵直而有剛性,易斷成碎片,這也是目前難以獲得完整大分子DNA的原因。溶液狀態(tài)的DNA易受DNA酶作用而降解,抽干水分的DNA性質(zhì)十分穩(wěn)定。第九十二頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日(六)DNA的變性核酸的變性:指核酸雙螺旋區(qū)氫鍵斷裂,變成單鏈,它并不涉及共價(jià)鍵(磷酸二酯鍵)的斷裂。第九十三頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日DNA的變性的條件能夠引起核酸變性的因素有:溫度升高;酸堿度改變、pH(>11.3或<5.0);有機(jī)溶劑如甲醛和尿素、甲酰胺等;低離子強(qiáng)度。第九十四頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日DNA變性的特征變性核酸將失去其部分或全部的生物活性。變性改變了DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)。核酸的變性并不涉及磷酸二酯鍵的斷裂,所以它的一級(jí)結(jié)構(gòu)(堿基順序)保持不變。DNA的變性過(guò)程是突變性的,它在很窄的溫度區(qū)間內(nèi)完成。DNA解鏈溫度紫外吸收值明顯增加,即增色效應(yīng)。粘度降低,沉降系數(shù)增加。第九十五頁(yè),共一百零八頁(yè),2022年,8月28日DNA解鏈溫度(熔點(diǎn),Tm
)當(dāng)50%的DNA變性時(shí)的溫度稱為該DNA的解鏈溫度,一般DNA的Tm值在70-85C之間。均一DNA(如病毒)的Tm值范圍較小。分子中G和C的含量越高,越
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