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文檔簡介

醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)群體遺傳詳解演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有77頁\編輯于星期六(優(yōu)選)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)群體遺傳現(xiàn)在是2頁\一共有77頁\編輯于星期六復(fù)習(xí)概念基因型頻率(genotypicfrequency)

指某種基因型個(gè)體在群體中所占的比例。表型頻率某一表型所占的比例。

f(aa表型)=aa表型/(A表型+aa表型)f(AA)=AA/(AA+Aa+aa)現(xiàn)在是3頁\一共有77頁\編輯于星期六練習(xí)1

在一個(gè)1000人的隨機(jī)群體中,AA人數(shù)為600;Aa人數(shù)為340;aa人數(shù)為60。計(jì)算基因頻率。A等位基因頻率:

p=(2×600+340)/1000×2=0.77

a等位基因頻率:

q=(2×60+340)/

1000×2=0.23已知基因型頻率現(xiàn)在是4頁\一共有77頁\編輯于星期六計(jì)算表型頻率f(

A表型)=(AA+Aa)/(AA+Aa+aa)

f(

aa表型)=aa/(AA+Aa+aa)f(

AA表型)=AA/(AA+Aa+aa)

f(

Aa表型)=Aa/(AA+Aa+aa)

f(

aa表型)=aa/(AA+Aa+aa)完全顯性時(shí):AA與Aa表型相同不完全顯性時(shí)表型頻率=基因型頻率現(xiàn)在是5頁\一共有77頁\編輯于星期六第一節(jié)群體的遺傳平衡一、遺傳平衡定律(Hardy-WeinbergLaw)

在一個(gè)大群體中,如果是隨機(jī)婚配,沒有突變,沒有自然選擇,沒有大規(guī)模遷移所致的基因流,群體中的基因頻率和基因型頻率在一代代傳遞中保持不變。遺傳平衡群體現(xiàn)在是6頁\一共有77頁\編輯于星期六基因頻率與基因型頻率的關(guān)系A(chǔ)精子(p)a精子(q)A卵子(p)AA(p2)Aa(pq)a卵子(q)Aa(pq)aa(q2)討論群體中等位基因A和a。A基因頻率為p;a基因頻率為q。(p+q)2=p2+2pq+q2現(xiàn)在是7頁\一共有77頁\編輯于星期六遺傳平衡定律的數(shù)學(xué)表達(dá)式∵p+q=1

∴遺傳平衡群體的基因頻率與基因型頻率滿足以下表達(dá)式:

(p+q)2=p2+2pq+q2

基因型頻率:f(AA)=p2f(Aa)=2pqf(aa)=q2現(xiàn)在是8頁\一共有77頁\編輯于星期六說明定律成立的理想條件:群體大、隨機(jī)婚配、無突變、無遷移、無選擇。(現(xiàn)實(shí)中不存在)但一般可把實(shí)際研究的群體看成是符合條件的群體。現(xiàn)在是9頁\一共有77頁\編輯于星期六

二、遺傳平衡定律的應(yīng)用

卷舌RR/Rr平舌rr西藏藏族平舌16%,卷舌84%。求基因頻率和基因型頻率。思路——由表及里群體調(diào)查得到表型頻率→基因頻率→基因型頻率現(xiàn)在是10頁\一共有77頁\編輯于星期六西藏藏族f(rr)=16%

求基因頻率和基因型頻率∵f(rr)=q2=0.16∴基因頻率q=√0.16=0.4p=1-q=1-0.4=0.6基因型頻率:

f(RR)=p2=0.62=0.36f(Rr)=2pq=2×0.6×0.4=0.48f(rr)=q2=0.16現(xiàn)在是11頁\一共有77頁\編輯于星期六二、遺傳平衡定律的應(yīng)用(二)在遺傳咨詢中的應(yīng)用——遺傳風(fēng)險(xiǎn)估計(jì)發(fā)病率基因頻率攜帶者頻率遺傳風(fēng)險(xiǎn)估計(jì)現(xiàn)在是12頁\一共有77頁\編輯于星期六(一)常染色體遺傳病的風(fēng)險(xiǎn)評估例1:某群體苯丙酮尿癥(AR)發(fā)病率為1/10000。求(1)基因頻率,(2)攜帶者頻率,(3)后代風(fēng)險(xiǎn)估計(jì)

現(xiàn)在是13頁\一共有77頁\編輯于星期六怎樣計(jì)算基因頻率?已知:發(fā)病率f(aa)=1/10000=q21、計(jì)算群體中的A和a基因頻率p和q。f(aa)=q2=1/10000q=√1/10000=0.01p=1-q=1-0.01=0.99現(xiàn)在是14頁\一共有77頁\編輯于星期六怎樣計(jì)算攜帶者頻率?(1中已求得p=0.99;q=0.01)2、求群體中的雜合子(攜帶者)頻率。f(Aa)=2pq=2×0.99×0.01≈0.02

≈1/50≈2q攜帶者頻率遠(yuǎn)高于發(fā)病率,它是遺傳病風(fēng)險(xiǎn)評估的重要信息。現(xiàn)在是15頁\一共有77頁\編輯于星期六怎樣估計(jì)遺傳風(fēng)險(xiǎn)?3、如果一個(gè)肯定攜帶者與家族中無病史者婚配。計(jì)算其后代的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。2中已求得攜帶者頻率f(Aa)=1/50∵如果夫妻都是攜帶者,后代才會有1/4的可能為患者aa。這對夫妻都是攜帶者的風(fēng)險(xiǎn)為:1×1/50

∴后代患病風(fēng)險(xiǎn)f(aa)=1×1/50×1/4=1/200現(xiàn)在是16頁\一共有77頁\編輯于星期六某人群中尿黑酸癥(AR)的發(fā)病率為4/1000000。計(jì)算致病基因頻率和攜帶者頻率。練習(xí)∵發(fā)病率=f(aa)

=q2=4/1000000=4×10-6攜帶者頻率:f(Aa)≈2q=2×2×10-3(致病基因頻率)現(xiàn)在是17頁\一共有77頁\編輯于星期六后代發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)估計(jì)家族中都無病史的兩人隨機(jī)婚配,其后代的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)是多少?思路:后代患病風(fēng)險(xiǎn)=丈夫是攜帶者的可能性×妻子是攜帶者的可能性×1/4攜帶者頻率f(Aa)≈4×10-3現(xiàn)在是18頁\一共有77頁\編輯于星期六囊性纖維化(AR)在歐洲白種人的發(fā)病率約為1/2000,預(yù)測白種人中囊性纖維化致病基因攜帶者頻率是多少?發(fā)病率=q2=1/2000;q=0.022p=1-q=1-0.022=0.978攜帶者頻率=2pq=2×0.978×0.022=0.043≈4%為什么攜帶者頻率2pq對囊性纖維化家族的遺傳咨詢重要?

現(xiàn)在是19頁\一共有77頁\編輯于星期六表6-9發(fā)病率對攜帶者/患者比率的影響發(fā)病率(q2)

基因頻率(q)攜帶者頻率(2pq)攜帶者/患者(2pq/q2)1/10001/321/161000/16=62.51/50001/711/365000/36=1391/100001/1001/5010000/50=2001/500001/2441/11250000/112=4461/1000001/3161/518100000/158=633你可以從此表看出1、何種規(guī)律?2、2pq的重要性?現(xiàn)在是20頁\一共有77頁\編輯于星期六P84表6-9發(fā)病率對攜帶者/患者比率的影響發(fā)病率越低,致病基因頻率和攜帶者頻率越低,但攜帶者與患者的比例越高。——有何規(guī)律?現(xiàn)在是21頁\一共有77頁\編輯于星期六(二)X連鎖遺傳病風(fēng)險(xiǎn)評估因?yàn)槟行允前牒献?,男性發(fā)病率等于致病基因頻率。

XR:q=f(XaY)=男性發(fā)病率

q2=f(XaXa)=女性發(fā)病率攜帶者頻率f(XAXa)=

2pqXD:p=f(XAY)=男性發(fā)病率

女性發(fā)病率=2pq+p2≈2p現(xiàn)在是22頁\一共有77頁\編輯于星期六例2:紅綠色盲(XR)在英國男性中發(fā)病率為1/12求攜帶者頻率f(XAXa)

∵q=1/12,p=1-q=11/12∴f(XAXa)=2pq=2×11/12×1/12=22/144=0.15求女性發(fā)病率f(XaXa)f(XaXa)=q2=(1/12)2=1/144=0.007答:攜帶者頻率為0.15(女性15%為攜帶者),女性發(fā)病率為0.007(0.7%女性患病)?,F(xiàn)在是23頁\一共有77頁\編輯于星期六練習(xí):甲型血友病(XR)男性發(fā)病率為0.00008求女性發(fā)病率求攜帶者頻率f(XaXa)=q2=0.000082=6.4×10-9f(XAXa)=2pq≈2q=2×0.00008=1.6×10-4現(xiàn)在是24頁\一共有77頁\編輯于星期六小結(jié):從發(fā)病率求致病基因的頻率(1)常染色體遺傳AR:隱性致病基因頻率q=√發(fā)病率AD:顯性致病基因頻率(2)X連鎖遺傳XR:隱性致病基因(Xa)頻率q=男性發(fā)病率=√女性發(fā)病率XD:顯性致病基因(XA)頻率p=男性發(fā)病率≈1/2女性發(fā)病率↑第一次課p≈(1/2)發(fā)病率現(xiàn)在是25頁\一共有77頁\編輯于星期六AD遺傳中顯性致病基因的頻率p=(1/2)發(fā)病率I群體中患者多為雜合子Aa發(fā)病率I=f(Aa)=2pq≈2pp=(1/2)I現(xiàn)在是26頁\一共有77頁\編輯于星期六第二節(jié)影響遺傳平衡的因素非隨機(jī)婚配突變選擇遺傳漂變(小群體)基因流

(遷移)現(xiàn)在是27頁\一共有77頁\編輯于星期六一、非隨機(jī)婚配現(xiàn)在是28頁\一共有77頁\編輯于星期六(一)近婚系數(shù)近婚系數(shù)F:

近親婚配使子女得到一對相同基因的概率。親緣系數(shù)r:有共同祖先的兩個(gè)人,在某一基因座上帶有相同基因的概率?,F(xiàn)在是29頁\一共有77頁\編輯于星期六親緣系數(shù)(r)親屬級別親緣系數(shù)雙親-子女一級親屬1/2同胞(兄弟姐妹)一級親屬1/2叔(姑、舅、姨)-侄(甥)二級親屬1/4祖-孫二級親屬1/4表/堂兄妹三級親屬1/8現(xiàn)在是30頁\一共有77頁\編輯于星期六近親婚配現(xiàn)在是31頁\一共有77頁\編輯于星期六1/21/21/21/21、常染色體遺傳的近婚系數(shù)思路:一步一半(1/2),步步相乘左右匯;四個(gè)基因,最終純合同機(jī)會。F=4×(1/2)4現(xiàn)在是32頁\一共有77頁\編輯于星期六1/21/21/21/2(1)兄妹近婚系數(shù)S獲得A1途徑(4步):P1→B1→S:1/2×1/2P1→B2→S:1/2×1/2

S基因型為A1A1的概率:

=1/2×1/2×1/2×1/2=1/16=(1/2)(2+2)現(xiàn)在是33頁\一共有77頁\編輯于星期六兄妹近婚系數(shù)S獲得A2A2、A3A3、A4A4的概率各為(1/2)(2+2)S獲得A1A1、A2A2、A3A3、A4A4中任何一對的概率:F=4×(1/2)(2+2)1/4現(xiàn)在是34頁\一共有77頁\編輯于星期六常染色體遺傳的近婚系數(shù)公式:F=4×(1/2)(n1+n2)說明:n1:共同祖先到丈夫的世代數(shù)。n2:共同祖先到妻子的世代數(shù)?,F(xiàn)在是35頁\一共有77頁\編輯于星期六近婚系數(shù)推導(dǎo)練習(xí)F=4×(1/2)(3+3)

=1/16表兄妹近婚系數(shù):現(xiàn)在是36頁\一共有77頁\編輯于星期六近婚系數(shù)推導(dǎo)練習(xí)F=4×(1/2)(2+3)=1/8舅甥女近婚系數(shù):現(xiàn)在是37頁\一共有77頁\編輯于星期六3、表兄妹婚配中等位基因的傳遞圖解1.S獲得A1途徑:P1→B1→C1→S:P1→B1→C2→SS獲得A1概率:

=(1/2)6=1/642.獲得A2A2、A3A3、A4A4的概率均各為:1/64。3.獲得A1A1、A2A2、A3A3、A4A4中任何一對的概率即總概率:4×1/64=1/16現(xiàn)在是38頁\一共有77頁\編輯于星期六2、X連鎖遺傳的近婚系數(shù)男傳男,概率0,路中斷。男傳女,概率1,不統(tǒng)計(jì)。女下傳,1/2,要乘積。方法:1.看路通否;2.標(biāo)男傳女;3.標(biāo)女傳遞;4.算總概率。1111/21/21/21/2現(xiàn)在是39頁\一共有77頁\編輯于星期六計(jì)算舅表兄妹近婚系數(shù)X1X1概率為0X2X2概率:(1/2)4X3X3概率:(1/2)4獲得一對純合的X基因的概率是:F=(1/2)4+(1/2)4=1/81111/21/21/21/2某男娶了他舅舅的女兒現(xiàn)在是40頁\一共有77頁\編輯于星期六姨表兄妹近婚系數(shù)1.S獲得X1途徑:P1→B1→C1→S:P1→B1→C2→SS獲得X1X1概率:

=(1/2)3=1/82.S獲得X2X2

,X3X3的概率均各為:

(1/2)5=

1/32。3.S獲得X1X1,X2X2,X3X3中任何一對的概率F=1/8+2×1/32=3/16111/21/21/211/21/2某男娶了他阿姨的女兒現(xiàn)在是41頁\一共有77頁\編輯于星期六堂兄妹近婚系數(shù)計(jì)算堂兄妹近婚系數(shù):X1X1:0X2X2:0X3X3:0F=0某男娶了叔叔的女兒現(xiàn)在是42頁\一共有77頁\編輯于星期六姑表兄妹近婚系數(shù)因?yàn)閄不能男傳男,途徑中斷:X1X1——0X2X2——0X3X3——0所以F=0某男娶了姑姑的女兒現(xiàn)在是43頁\一共有77頁\編輯于星期六X連鎖近婚系數(shù)計(jì)算舅表兄妹近婚系數(shù):X1X1:0X2X2:(1/2)4X3X3:(1/2)4F=2×(1/2)4

=1/8某男娶了舅舅的女兒111現(xiàn)在是44頁\一共有77頁\編輯于星期六婚配關(guān)系與近親系數(shù)婚配類型親緣系數(shù)近親系數(shù)兄妹1/21/4舅舅-外甥女;姑姑-侄子1/41/8表/堂兄妹1/81/16二級表(堂)兄妹1/321/64常染色體遺傳:現(xiàn)在是45頁\一共有77頁\編輯于星期六(二)平均近婚系數(shù)a平均近婚系數(shù)反映了群體的近婚程度。a=Σ(MiFi)/NMi:某一類型近親婚配數(shù)Fi:某一類型婚配的近婚系數(shù)N:總婚配數(shù)現(xiàn)在是46頁\一共有77頁\編輯于星期六例:一群體有1000例婚配,

近婚情況如下表近婚類型及例數(shù)M相應(yīng)類型近婚系數(shù)F兄妹婚配:1例1/4姑侄婚配:1例1/8舅甥女婚配:1

例1/8表兄妹婚配:45例1/16二級表兄妹婚配:18例1/64二級半表親婚配:6例1/128三級表兄妹婚配:3例1/256現(xiàn)在是47頁\一共有77頁\編輯于星期六二級表親婚配一級表親婚配一級半表親婚配現(xiàn)在是48頁\一共有77頁\編輯于星期六計(jì)算a=Σ(MiFi)/Na=[(11/4)+(11/8)+(11/8)+(451/16)+(181/6)+(61/128)+(31/256)]/1000

=0.003315(a值達(dá)0.01為高值)現(xiàn)在是49頁\一共有77頁\編輯于星期六不同國家、地區(qū)人群中

近親結(jié)婚率和平均近婚系數(shù)群體近親結(jié)婚率(%)平均近婚系數(shù)美國110.00008日本160.004法國0.670.00023德國0.590.00019意大利1.900.00070現(xiàn)在是50頁\一共有77頁\編輯于星期六不同國家、地區(qū)人群中

近親結(jié)婚率和平均近婚系數(shù)群體近親結(jié)婚率(%)平均近婚系數(shù)南印度39.370.02834埃及(Nubic)75.760.03335中國漢族(北京、湖北)1.400.000665回族(甘肅)9.70.00494彝族(四川)14.60.00913朝鮮族(吉林)00

現(xiàn)在是51頁\一共有77頁\編輯于星期六(三)近親婚配的危害——增加了隱性純合子的頻率例:表兄妹婚配的后代為隱性純合子aa的風(fēng)險(xiǎn)有多大?(AR發(fā)病風(fēng)險(xiǎn))分析:后代為aa的原因有兩個(gè)。

①基因a來自共同祖先P1、P2,

概率=Fq=(1/16)q

②基因a來自非共同祖先B3、B4,概率=(1-F)q2B3B4現(xiàn)在是52頁\一共有77頁\編輯于星期六

表兄妹婚配的后代為隱性純合子aa的風(fēng)險(xiǎn)有多大?(續(xù))總概率為①和②相加總概率

=Fq+(1-F)q2

=(1/16)q+(15/16)q2=q/16(1+15q)=q/16(p+q+15q)=(pq/16)+q2F=1/16近婚后代風(fēng)險(xiǎn):Fpq+q2現(xiàn)在是53頁\一共有77頁\編輯于星期六近親婚配與隨機(jī)婚配后代風(fēng)險(xiǎn)比較表親婚配后代發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(pq/16)+q2隨機(jī)婚配后代發(fā)病風(fēng)險(xiǎn):q2表婚風(fēng)險(xiǎn)與隨機(jī)風(fēng)險(xiǎn)比值:

(pq/16)+q2/q2q越小,比值越大。隱性遺傳病越罕見,患兒來自表親婚配的幾率越大。現(xiàn)在是54頁\一共有77頁\編輯于星期六近親婚配與非近親婚配對

后代影響的比較(表7-11)組別近親婚配非近親婚配婚配對數(shù)203199父母平均年齡37.6338.14子女?dāng)?shù)11581001早產(chǎn)、流產(chǎn)數(shù)(%)61(5.27)34(3.40)先天畸形數(shù)(%)15(1.34)4(0.44)9歲前死亡數(shù)(%)233(19.26)131(13.09)現(xiàn)在是55頁\一共有77頁\編輯于星期六二、選擇環(huán)境因素對特定表型或基因型的作用,使個(gè)體的生活力和生育力可能降低。引入兩個(gè)概念:適合度選擇系數(shù)病例:軟骨發(fā)育不全癥現(xiàn)在是56頁\一共有77頁\編輯于星期六

適合度(fitness,f)

適合度是在一定的環(huán)境條件下,某一基因型個(gè)體能夠生存并將基因傳給后代的能力。大小用相對生育率表示?,F(xiàn)在是57頁\一共有77頁\編輯于星期六計(jì)算相對生育率(適合度,f)

例6:丹麥一項(xiàng)調(diào)查發(fā)現(xiàn):108名軟骨發(fā)育不全性侏儒生育了27個(gè)孩子,這些侏儒的457個(gè)正常同胞共生育了582個(gè)孩子。侏儒患者的相對生育率(適合度,f)則為:=(27/108)÷(582/457)=0.20含義:患者生育率只有正常人的20%,選擇作用淘汰掉了80%現(xiàn)在是58頁\一共有77頁\編輯于星期六選擇系數(shù)

(selectioncoefficient,s)

選擇系數(shù):選擇作用下,適合度降低的程度。

s=1-ffs現(xiàn)在是59頁\一共有77頁\編輯于星期六在特定條件下,正常人留下的后代為1時(shí),患者只能留下f(0.20)的后代,而選擇作用淘汰掉了s(0.80)的后代。fs如何理解f與s的關(guān)系?s=1-f選擇作用會降低致病基因頻率現(xiàn)在是60頁\一共有77頁\編輯于星期六三、突變突變是指遺傳物質(zhì)發(fā)生的改變。突變率μ:群體中每代某一基因座位上基因突變的頻率。(大約為10-5~10-7)如:a→

A,或B→b突變會使群體中致病基因頻率上升。AAAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaA突變A選擇淘汰μsp現(xiàn)在是61頁\一共有77頁\編輯于星期六群體平衡時(shí),突變增加的基因等于選擇淘汰掉的基因AD:μ=spAR:μ=sq2

(淘汰的是aa)XR:μ=(1/3)sq(淘汰的是XaY)AAAaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaA突變A選擇淘汰μsp現(xiàn)在是62頁\一共有77頁\編輯于星期六實(shí)際工作中的應(yīng)用

——求出致病基因突變率群體發(fā)病率→基因頻率→突變率AD:μ=spAR:μ=sq2

XR:μ=(1/3)sq現(xiàn)在是63頁\一共有77頁\編輯于星期六(一)顯性致病基因突變率的計(jì)算例7:在100000個(gè)出生人口中有12人患同一種AD病,其中的兩個(gè)患兒的父母一方有同種病,其他10個(gè)患兒是由于基因新突變所致。求突變率。解:通過新發(fā)病例可知突變率=10/(100000×2)=1/20000答:每代每20000個(gè)配子將發(fā)生1個(gè)突變現(xiàn)在是64頁\一共有77頁\編輯于星期六例8:94075嬰兒中有10個(gè)為某AD病患者,求突變率μ。(該病s=0.80)解:發(fā)病率I=10/94075=1.063×10-4∵發(fā)病率I=

p2+2pq≈2pq≈2p∴p=(1/2)Iμ=sp=0.8×1/2×1.063×10-4

=4.25×10-5答:每代中致病基因突變率為4.25×10-5(一)顯性致病基因突變率的計(jì)算現(xiàn)在是65頁\一共有77頁\編輯于星期六(二)AR致病基因突變率的計(jì)算例9:苯丙酮尿癥(AR)的發(fā)病率為6.0×10-5。求致病基因突變率。(s=0.85)解:發(fā)病率I=6.0×10–5=q2

突變率μ=sq2

=sI=0.85×

6.0×10–5=5.1×10–5答:每代中致病基因突變率為5.1×10–5

現(xiàn)在是66頁\一共有77頁\編輯于星期六(三)XR致病基因突變率的計(jì)算例10:甲型血友?。╔R)男性發(fā)病率為8.0×10-5。求致病基因突變率?(該病s=0.75)解:已知男性發(fā)病率=8.0×10–5=q

突變率μ=(1/3)sq

=1/3×

0.75×8.0×10–5

=2.0×10–5答:每代中致病基因突變率為2.0×10–5現(xiàn)在是67頁\一共有77頁\編輯于星期六小結(jié):選擇與突變適合度f與選擇系數(shù)s的關(guān)系:s=1-f從發(fā)病率→基因(型)頻率→突變率的計(jì)算公式:

AD:μ=sp

(發(fā)病率I≈2p)

XD:μ=sp(男性發(fā)病率I=p)(女性發(fā)病率I=2p)

AR:μ=sq2

(發(fā)病率I=q2)

XR:μ=(1/3)sq

(男性發(fā)病率I=q)

現(xiàn)在是68頁\一共有77頁\編輯于星期六四、遺傳漂變

小的隔離群體中,由于機(jī)會所造成的某一等位基因頻率的隨機(jī)增減的現(xiàn)象。01020304050607080901001101201301401501601.00.90.80.70.60.50.40.30.20.1基因A的頻率世代數(shù)25人250人2500人現(xiàn)在是69頁\一共有77頁\編輯于星期六五、遷移與基因流

一個(gè)群體遷入另一群體,并相互婚配,新的等位基因的進(jìn)入,將導(dǎo)致基因頻率改變。這種等位基因跨越種族或地界的漸近混合稱基因流?,F(xiàn)在是70頁\一共有77頁\編輯于星期六人口遷移與基因流tt苯硫脲嘗味能力缺乏現(xiàn)在是71頁\一共有77頁\編輯于星期六南方部分省份β地貧發(fā)生率名稱樣本大小例數(shù)發(fā)生率(%)海南3140812003.821廣東27527127210.988廣西495597271.467福

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