第六章 細(xì)菌的遺傳分析_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

主要內(nèi)容細(xì)菌的細(xì)胞和基因組(自學(xué))大腸桿菌的突變型及篩選細(xì)菌的接合與染色體作圖中斷雜交與重組作圖F`因子與性導(dǎo)細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖現(xiàn)在是1頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五大腸桿菌的突變類(lèi)型突變型篩選(自學(xué))第二節(jié)大腸桿菌的突變型及篩選現(xiàn)在是2頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五一、大腸桿菌的突變類(lèi)型1、合成代謝功能的突變型——營(yíng)養(yǎng)缺陷型

合成代謝功能(anabolicfunction)

命名:Met-,Lys-原養(yǎng)型/野生型在基本培養(yǎng)基上,具有合成所有代謝和生長(zhǎng)所必須的復(fù)雜有機(jī)分子的功能。營(yíng)養(yǎng)缺陷型:一個(gè)必需的基因發(fā)生了突變不能進(jìn)行一個(gè)特定的生化反應(yīng),從而阻礙整個(gè)合成代謝功能的實(shí)現(xiàn)?,F(xiàn)在是3頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五2、分解代謝功能的突變型(catabolicfunctionalmutants)

分解代謝功能(anabolicfunction)一系列降解功能的實(shí)現(xiàn)也需要許多基因的表達(dá),其中任何一個(gè)基因突變都會(huì)影響降解功能的實(shí)現(xiàn)。如Lac-突變型不能分解乳糖,因此就不能生長(zhǎng)在以乳糖為唯一碳源的基本培養(yǎng)基上。現(xiàn)在是4頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五3、抗性突變型:細(xì)菌由于某基因的突變而對(duì)某些噬菌體或抗菌素產(chǎn)生抗性。如:抗藥突變型:抗鏈霉素突變型:Strr,(野生型Strs)抗青霉素突變型:Penr,(野生型Pens)抗phage突變型:抗T1-phage突變型:Tonr,(野生型Tons)現(xiàn)在是5頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)F因子及其轉(zhuǎn)移細(xì)菌重組的特點(diǎn)第三節(jié)細(xì)菌的接合與染色體作圖現(xiàn)在是6頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五一、細(xì)菌接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)菌株A:met-

bio-

thr+

leu+

thi+菌株B:met+

bio+

thr-

leu-

thi-Met+

bio+

thr+

leu+

thi+現(xiàn)在是7頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五二、F因子及其轉(zhuǎn)移細(xì)菌主要是無(wú)性繁殖,直到1946年人們才注意到不同品系大腸桿菌間可以雜交,并進(jìn)行了基因重組,從而首次發(fā)現(xiàn)了大腸桿菌也有“性別”。1、細(xì)菌的性別現(xiàn)在是8頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五

2、F因子/性因子/致育因子

F因子:環(huán)狀DNA,含6×104個(gè)bp。大腸桿菌供體中含有,而受體無(wú)。由原點(diǎn)、致育基因、配對(duì)區(qū)三個(gè)部分組成?,F(xiàn)在是9頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五環(huán)狀F因子的模式圖現(xiàn)在是10頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五組成F因子各部分的功能原點(diǎn):是轉(zhuǎn)移的起點(diǎn)。配對(duì)區(qū):此處與大腸桿菌DNA多處核苷酸序列相對(duì)應(yīng)(即同源序列),故可通過(guò)交換而使F因子整合到大腸桿菌DNA上。致育基因:其上一些基因編碼生成F菌毛的蛋白質(zhì),即供體菌細(xì)胞表面的管狀結(jié)構(gòu),F(xiàn)菌毛與受體菌細(xì)胞表面的受體相結(jié)合,在兩個(gè)細(xì)胞間形成細(xì)胞質(zhì)橋?,F(xiàn)在是11頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五3、F+、F-與HfrF+:細(xì)胞質(zhì)中具有F因子的大腸桿菌(供體)F-:細(xì)胞質(zhì)中沒(méi)有F因子的大腸桿菌(受體)大腸桿菌性別F-F+現(xiàn)在是12頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五F+F-大腸桿菌性別大腸桿菌DNAF因子現(xiàn)在是13頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五F因子及其在雜交中的行為細(xì)胞質(zhì)橋(接合管)F+×F-F+F+現(xiàn)在是14頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五F因子轉(zhuǎn)移的頻率很高,但細(xì)菌DNA間的重組率很低,故稱F+為低頻重組品系(lowfrequencerecombination,Lfr)。F+×F-現(xiàn)在是15頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五Hfr(highfrequencerecombination)F因子整合入大腸桿菌染色體中現(xiàn)在是16頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五原點(diǎn)致育基因配對(duì)區(qū)大腸桿菌性別致育基因現(xiàn)在是17頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五原點(diǎn)配對(duì)區(qū)細(xì)菌染色體F-現(xiàn)在是18頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌DNA間的重組率很高,故稱之為高頻重組品系(highfrequencerecombination,Hfr),重組率為10-2。F因子轉(zhuǎn)移的頻率很低。現(xiàn)在是19頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五F因子的環(huán)出現(xiàn)在是20頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五4、附加體象F因子既可獨(dú)立存在于染色體之外作為一個(gè)獨(dú)立的復(fù)制子,也可整合到大腸桿菌染色體中作為大腸桿菌復(fù)制子的一部分的遺傳物質(zhì)(遺傳因子),稱為附加體?,F(xiàn)在是21頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五三、細(xì)菌重組的特點(diǎn)及機(jī)制細(xì)菌重組的特點(diǎn)細(xì)菌同源重組的分子基礎(chǔ)現(xiàn)在是22頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五(一)細(xì)菌重組的特點(diǎn)中斷雜交實(shí)驗(yàn)與重組作圖細(xì)菌重組不同于真核生物的完整二倍體的重組?,F(xiàn)在是23頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五Hfr與F-接合常會(huì)形成部分二倍體部分二倍體:這種含有一個(gè)親體F-全部基因組和另一親體部分基因組的合子叫部分合子(半合子)/部分二倍體。細(xì)菌的重組就是指F-的DNA(內(nèi)基因子)與Hfr的部分DNA(外基因子)之間的重組。F-的DNAHfr的部分DNA現(xiàn)在是24頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五現(xiàn)在是25頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五內(nèi)、外基因子的交換情況單交換部分二倍性線狀體雙交換重組體+線性片斷偶數(shù)次交換結(jié)果:只產(chǎn)生一種重組體,而無(wú)另一相應(yīng)的重組體?,F(xiàn)在是26頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五由此可見(jiàn)在細(xì)菌的重組中有下列兩個(gè)特點(diǎn):1、只有偶數(shù)次交換才能產(chǎn)生平衡的重組子;2、不出現(xiàn)相反的重組子,所以在選擇培養(yǎng)基上只出現(xiàn)一種重組子?,F(xiàn)在是27頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五(二)細(xì)菌同源重組的分子基礎(chǔ)RecBCD識(shí)別chi序列引發(fā)重組RecA催化單鏈同化Ruv系統(tǒng)解離Holiday連接點(diǎn)現(xiàn)在是28頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五1、RecBCD識(shí)別chi序列引發(fā)重組保守的8堿基非對(duì)稱序列大腸桿菌DNA每5-10Kb自然出現(xiàn)一次被recBCD編碼的酶所識(shí)別刺激重組——重組熱點(diǎn)1)chi

位點(diǎn)現(xiàn)在是29頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五2)RecBCD酶的功能①能降解DNA的核酸酶(核酸外切酶Ⅴ)②解旋酶活性③ATP酶活性目標(biāo):提供一條含游離3’端的單鏈區(qū)域(RecA可以作用的底物)現(xiàn)在是30頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五RecBCD酶識(shí)別chi序列引發(fā)重組含游離3’端的單鏈現(xiàn)在是31頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五2、RecA催化單鏈同化①具有蛋白酶活性②在單鏈DNA和ATP存在的條件下啟動(dòng)DNA單鏈和與之互補(bǔ)的雙鏈分子進(jìn)行堿基配對(duì)。單鏈同化:RecA可使一條DNA單鏈置換一條雙鏈DNA分子中同源鏈的反應(yīng)。單鏈同化需要的條件:a.必須有一個(gè)單鏈DNA分子區(qū)域。b.必須有一個(gè)具游離3’端的DNA分子;c.該單鏈區(qū)域和3’端必須位于這兩個(gè)分子的互補(bǔ)區(qū)域中?,F(xiàn)在是32頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五具有游離3’端的單鏈單鏈具有游離3’端現(xiàn)在是33頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五3、Ruv系統(tǒng)解離Holiday連接點(diǎn)RuvA:識(shí)別Holliday連接點(diǎn)的結(jié)構(gòu)RuvB:具ATP酶的活性,為分支遷移提供動(dòng)力。RuvC:具有核酸內(nèi)切酶活性,可特異識(shí)別Holliday連接點(diǎn)?,F(xiàn)在是34頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五現(xiàn)在是35頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五一、中斷雜交實(shí)驗(yàn)原理二、中斷雜交作圖三、重組作圖(自學(xué))第四節(jié)中斷雜交與重組作圖現(xiàn)在是36頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五一、中斷雜交實(shí)驗(yàn)原理Hfr細(xì)胞和F-細(xì)胞雜交,基因從Hfr細(xì)胞按次序轉(zhuǎn)入F-細(xì)胞,可根據(jù)基因進(jìn)入F-細(xì)胞的時(shí)間和次序制作基因圖譜。實(shí)驗(yàn)材料

Hfr:thr+leu+azistonslac+gal+strs

F-:thr-leu-azirtonrlac-gal-

strr

strr(F-可以在鏈霉素培養(yǎng)基上生長(zhǎng))strs(Hfr不能在鏈霉素培養(yǎng)基上生長(zhǎng))現(xiàn)在是37頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五實(shí)驗(yàn)方法-中斷雜交實(shí)驗(yàn)兩品系在液體培養(yǎng)基里,通氣混合培養(yǎng),定時(shí)取樣,猛烈攪拌以中斷雜交,釋稀菌液,在含Str的基本培養(yǎng)基上培養(yǎng)?,F(xiàn)在是38頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五AABBCCDDDDCCB現(xiàn)在是39頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五二、中斷雜交作圖實(shí)驗(yàn)結(jié)果混合時(shí)間(min)結(jié)果8出現(xiàn)的菌落與F-相同,說(shuō)明Hfr的基因未進(jìn)入F-9出現(xiàn)少量的azis菌落,說(shuō)明azis己從Hfr轉(zhuǎn)移到F-11出現(xiàn)azistons型的F-菌落18出現(xiàn)azistonslac+型的F-菌落24出現(xiàn)azistonslac+gal+型的F-菌落現(xiàn)在是40頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五隨時(shí)間推移,具有某一基因的菌落逐漸增加,達(dá)到一定頻率后就不再變動(dòng),而且愈早轉(zhuǎn)入的基因,所達(dá)到的頻率也愈高。現(xiàn)在是41頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五實(shí)驗(yàn)結(jié)果說(shuō)明:Hfr的DNA從一端開(kāi)始,以線性方式逐段進(jìn)入F-,這一端叫原點(diǎn)或O點(diǎn)。O點(diǎn)azis

tons

lac+gal+

現(xiàn)在是42頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五時(shí)間單位法以轉(zhuǎn)移時(shí)間單位(每分鐘)作為基因間距單位,可作出Hfr的“染色體”上的基因分布圖(基因連鎖圖)?,F(xiàn)在是43頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五E.coli的連鎖群E.coliK12的基因組環(huán)形圖為100min現(xiàn)在是44頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五假如讓Hfr×F-雜交持續(xù)2h后中斷雜交,發(fā)現(xiàn)一些F-

F+。這說(shuō)明Hfr的全部基因轉(zhuǎn)移到F-內(nèi),排列到最后的F因子才進(jìn)入F-,使F-

F+。中斷雜交實(shí)驗(yàn)與重組作圖現(xiàn)在是45頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五原點(diǎn)致育基因配對(duì)區(qū)致育基因F因子在細(xì)菌染色體上有很多插入位點(diǎn),并且插入的取向不同一個(gè)F+品系可以產(chǎn)生很多Hfr品系現(xiàn)在是46頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五現(xiàn)在是47頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五幾個(gè)Hfr菌株的線性連鎖群的產(chǎn)生HfrH菌株的基因轉(zhuǎn)移順序thrprolacpurgalhisglythiHfr1菌株的基因轉(zhuǎn)移順序thrthiglyhisgalpurlacpro現(xiàn)在是48頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五F′因子的形成細(xì)菌染色體第五節(jié)F′因子與性導(dǎo)現(xiàn)在是49頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五一、F′因子與F′菌株帶有部分細(xì)菌染色體的F因子稱F′因子。特點(diǎn):能獨(dú)立復(fù)制

F′菌株:指帶有F′因子的細(xì)菌?,F(xiàn)在是50頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五二、性導(dǎo)(sexduction或F′

-duction)通過(guò)F′因子將供體細(xì)胞的基因?qū)胧荏w形成部分二倍體的過(guò)程叫性導(dǎo)?,F(xiàn)在是51頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五性導(dǎo)F′因子F-部分二倍體F′菌株Hfr菌株F′菌株現(xiàn)在是52頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五aa現(xiàn)在是53頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與作圖細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖第六節(jié)細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與轉(zhuǎn)導(dǎo)作圖現(xiàn)在是54頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五一、細(xì)菌的轉(zhuǎn)化與作圖轉(zhuǎn)化作用:從細(xì)菌的培養(yǎng)物提取的DNA可以在體外轉(zhuǎn)移到受體細(xì)菌中的過(guò)程。發(fā)生轉(zhuǎn)化的頻率很低:大約為1%的受體細(xì)菌可吸收外源DNA并發(fā)生轉(zhuǎn)化?,F(xiàn)在是55頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五原因:受體細(xì)菌的受體部位的數(shù)目是有限的。外源DNA片段只是在受體部位通過(guò)。外源DNA的進(jìn)入,除受體部位外,還必須有酶或蛋白質(zhì)分子,以及能量等的協(xié)同作用。外源DNA只有在酶促旺盛的受體部位進(jìn)入?,F(xiàn)在是56頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五感受態(tài)細(xì)胞與感受態(tài)因子感受態(tài)細(xì)胞:這種能接受外源DNA分子并被轉(zhuǎn)化的細(xì)菌細(xì)胞。感受態(tài)因子:促進(jìn)轉(zhuǎn)化作用的酶或蛋白質(zhì)的分子?,F(xiàn)在是57頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五感受態(tài)細(xì)胞單鏈通過(guò)交換進(jìn)行整合現(xiàn)在是58頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五座位轉(zhuǎn)化體類(lèi)別trp2+---+++his2++-+--+tyr1+++--+-11940366068541826001071180親本型(++)重組型(+-)和(-+)重組值(重組體數(shù)/總數(shù))Trp2-his2Trp2-tyr1His2-tyr1供體trp2+his2+tyr1+

DNA向受體trp2-his2-tyr1-

轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)中轉(zhuǎn)化體的類(lèi)別及重組值的計(jì)算11940+11802600+107+3660+41811940+1072600+1180+3660+68511940+3660418+1180+685+107現(xiàn)在是59頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五轉(zhuǎn)化基因間重組值的計(jì)算

轉(zhuǎn)化子數(shù)(重組體數(shù))親組合數(shù)+轉(zhuǎn)化子數(shù)

trp2—his2的重組值=34%trp2—tyr1的重組值=40%his2—tyr1的重組值=13%根據(jù)重組值作圖:trp234cM

his2

13cMtyr1重組值=

=

(+-)+(-+)(++)+(+-)+(-+)

現(xiàn)在是60頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五二、細(xì)菌的轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖特異性轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖(后學(xué))轉(zhuǎn)導(dǎo)作用:以噬菌體為媒介,將細(xì)菌的小片段DNA或基因,從一個(gè)細(xì)菌轉(zhuǎn)移到另一細(xì)菌的過(guò)程叫轉(zhuǎn)導(dǎo)作用。現(xiàn)在是61頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五(一)普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)與作圖J.Lederberg和N.Zinder做了這樣一個(gè)雜交試驗(yàn):鼠沙門(mén)氏菌的2個(gè)突變菌株:LA22:phe-trp-met+his+LA2:phe+trp+met-his-LA22+LA2混合培養(yǎng)得野生型(10-5)現(xiàn)在是62頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五U型管實(shí)驗(yàn)只允許DNA等大分子及病毒通過(guò),細(xì)菌細(xì)胞不能通過(guò)。Hfr現(xiàn)在是63頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五實(shí)驗(yàn)結(jié)果:右臂得到了野生型細(xì)胞現(xiàn)在是64頁(yè)\一共有70頁(yè)\編輯于星期五實(shí)驗(yàn)結(jié)果的解釋p22的釋放:LA22是帶有P22原phage的細(xì)菌;在培養(yǎng)過(guò)程中,少數(shù)LA22細(xì)菌自溶釋放出游離的p22。p22的侵染:

這種游離的p22通過(guò)濾孔進(jìn)入左臂而感染了LA2細(xì)菌。轉(zhuǎn)導(dǎo)噬菌體的形成:在裂解LA2過(guò)程中,宿主LA2環(huán)狀染色體被裂解成小片段,某些

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