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文檔簡(jiǎn)介
Chapter4TheReplicationofDNA
Chapter8ofthebookIntroductionWhenwilltheDNAreplicationhappen?
(4)細(xì)菌(E.coli)DNA每個(gè)細(xì)胞周期只復(fù)制一次1、Semi-ConservativeReplication
1958Meselson-stahl設(shè)計(jì)的CsCl超離心試驗(yàn)證實(shí)了
DNA復(fù)制的這一特性概念:復(fù)制過程中各以雙螺旋DNA的其中一條鏈為模
板合成其互補(bǔ)鏈,新生的互補(bǔ)鏈與母鏈構(gòu)成子
代DNA分子
聚合反應(yīng):substrate--dNTPPoly(核苷酸)n-3’-OH+dNTP→
Poly(核苷酸)n+1-3’-OH+
2PiThedirectionofreplication子鏈DNA延伸方向只能是5’-3’5’OHTCATCAC5’OH3’ppp
OH
C++
ppi
如果DNA的延伸方向是3’→5’
ATCG
+5’pppOH3’GpppOHGATCG5’pppOH3’ATCG
+5’pppOH3’GpppOH
G
5’
pppa、因能量的需要,
DNA的5’端必須帶有PPP游離dNTP具有ppppppOH3’ATCG
在0.2MNacl的生理環(huán)境中,使dNTP難以聚合到DNA的5’端
需要其他機(jī)制以解脫
1)、解螺旋酶(helicase):又稱解旋酶,通過水解ATP獲得能量,解開DNA雙鏈.
2).
單鏈結(jié)合蛋白(SSB):結(jié)合在DNA單鏈上,有時(shí)有協(xié)同效應(yīng).3)、
DNA旋轉(zhuǎn)酶:消除復(fù)制叉前進(jìn)過程中產(chǎn)生的正超螺旋,產(chǎn)生負(fù)超螺旋.TheinitiationofDNAreplication(1)OriCinE.colichromosomalDNA?四個(gè)9bp的重復(fù)序列
dnaA結(jié)合位點(diǎn)?三個(gè)13bp的重復(fù)序列若干GATC位點(diǎn)Replicationfork
真核生物(Eukaryote):多復(fù)制起點(diǎn)即--一個(gè)genome中有多個(gè)復(fù)制單位TheinitiationofDNAreplicationDnaAistheinitiator
引發(fā)體(包括引發(fā)酶)pppRNA引物DNApolymeraseIIIpppDNApolymeraseIDNApolymeraseIDNAligase
DNALigase
所需條件:
a、
切刻的3’-OH和5’-P相鄰
b、
切刻各自堿基處于配對(duì)狀態(tài)
c、需要能量原核(ATP、NAD)真核(ATP)
用途:復(fù)制過程中,5’端RNA引物被置換后切刻的連接修復(fù)、重組3’-5’exonucleaseactivity(polymeraseI,II,III)
校對(duì)功能(proofreading)
5’-3’
exonucleaseactivity(polymeraseI,III)
DNApolⅠ的5’-3’外切活性有以下三個(gè)特點(diǎn):
?必須有5’-磷酸末端?被除去的核苷酸必須是已經(jīng)配對(duì)的?被除去的可以是脫氧核糖核苷酸,也可以是核糖核苷酸(切刻平移)
其中DNApolⅢ
全酶有十種共22個(gè)亞基β二聚體--滑動(dòng)鉗InteractionbetweenDNAandDNApolymeraseTheinitiationofDNAsynthesisinE.coli
2、真核生物的DNA聚合酶
α、β、δ、ε、γ五種
位置核內(nèi)核內(nèi)核內(nèi)核內(nèi)
線粒體
合成
與引發(fā)修復(fù)合成合成,修復(fù)復(fù)制功能酶結(jié)合前導(dǎo)鏈
后隨鏈3’-5’校NONOYesYesYes正活性
α
β
δ
ε
γActivationofthepre-RCleadstotheassemblyoftheeukaryoticreplicationforkTheactivationofpre-RCsistightlyregulatedbycyclin-dependentkinases(Cdks)
(3)復(fù)制終止a、終止序列
E.coli有兩個(gè)終止區(qū)域,分別結(jié)合專一性的終止蛋白
序列一:terEterDterA
序列二:terFterBterC
每個(gè)區(qū)域只對(duì)一個(gè)方向的復(fù)制叉起作用
b、專一性終止蛋白
E.coli中由tusgene編碼(terminusutilizationsubstance)通過抑制DNA螺旋酶而發(fā)揮終止作用每次復(fù)制時(shí)只使用一個(gè)終止位點(diǎn)ter5、復(fù)制忠實(shí)性的保證
1、DNApol的3’5’外切酶活性
(exonucleaseactivity)
2、DNApol只能從引物的3’
端延伸DNA
(需要RNA引物)
a、堿基配對(duì)協(xié)同性導(dǎo)致最初幾個(gè)堿基錯(cuò)配率高,且不易校正
b、RNA引物最終被降解而避免錯(cuò)誤
3、后隨鏈的不連續(xù)合成因其有利于錯(cuò)配堿基的校正
3.6.真核生物DNA的復(fù)制(DNAreplicationinEukaryote)
3.真核生物DNA復(fù)制的引發(fā)酶
●DNApolα+primase形成緊密的復(fù)合物
6-9NtRNAasprimer
●引發(fā)酶(primase):50-60kd
●作用方式為陣發(fā)性的,每次作用拷貝6~15個(gè)核苷酸
●既能利用NTP,又能利用dNTP
●SV40體外DNA復(fù)制情況分析
端粒位于真核生物染色體DNA的3’末端,由獨(dú)特的DNA重復(fù)序列及相關(guān)蛋白組成的復(fù)合體。端粒的功能:①維持染色體的完整性,決定細(xì)胞的壽命。若無端粒,兩個(gè)染色體末端很可能融合一起。②解決末端復(fù)制問題,端粒酶能與端粒作用,延伸其長(zhǎng)度。端粒的結(jié)構(gòu)①DNA端粒由簡(jiǎn)單的串聯(lián)重復(fù)序列組成人和其他脊椎動(dòng)物:AGGGTT纖毛原生動(dòng)物四膜蟲:GGGGTT和GGGGTTTT面包酵母:G1-3T和G1-5A共同特點(diǎn):富含G;長(zhǎng)度達(dá)幾百到幾kb;人類DNA端粒長(zhǎng)幾kb到幾十kb。端粒酶(Telomerase)是催化端粒合成的酶。它是由一條RNA和多種蛋白質(zhì)構(gòu)成的核糖核蛋白復(fù)合體。端粒酶中的蛋白部份具有逆轉(zhuǎn)錄酶活性,能以其自身攜帶的RNA為模板逆轉(zhuǎn)錄合成端粒DNA。端粒酶的作用機(jī)制:端粒酶的RNA分子與端粒DNA配對(duì),以RNA為模板進(jìn)行類似逆轉(zhuǎn)錄合成DNA,向5’→3’延伸端粒至模板RNA末端后,延長(zhǎng)的DNA末端與RNA模板解離,端粒酶移動(dòng),重新定位于延長(zhǎng)后的DNA3’端,開始下一輪延長(zhǎng)過程,如此反復(fù)可達(dá)數(shù)百次合成幾百個(gè)或數(shù)千個(gè)重復(fù)序列。(3)補(bǔ)齊過程
通過TG鏈的回折形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)(G·G氫鍵)---尺蠖模型
→→實(shí)現(xiàn)端粒酶位置的調(diào)整大多數(shù)體細(xì)胞不合成端粒酶,每次分裂后端粒就變短(約30~200bp)。當(dāng)端粒比正常的長(zhǎng)度短數(shù)kb時(shí)細(xì)胞就不再分裂。所以端粒變短是一種老化的象征。實(shí)驗(yàn)證明將端粒酶加進(jìn)體細(xì)胞,可以增加體細(xì)胞分裂次數(shù)。癌細(xì)胞主要特性是能無限期的分裂增生,這需要不斷表達(dá)端粒酶。實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)癌細(xì)胞的端粒酶活性很強(qiáng)。這點(diǎn)可被用來檢驗(yàn)癌細(xì)胞。實(shí)驗(yàn)表明--人體細(xì)胞通過監(jiān)測(cè)失去的端粒的重復(fù)數(shù)而計(jì)數(shù)細(xì)胞分裂次數(shù),當(dāng)端粒長(zhǎng)度下降到某一臨界值時(shí),細(xì)胞終止分裂---衰老、死亡“多莉”的衰老
研究端粒丟失的速率,預(yù)測(cè)人類的壽命
>XXXYwhy?研究推測(cè)端粒酶與腫瘤的關(guān)系ColE1質(zhì)粒DNA的復(fù)制是從一個(gè)特定的復(fù)制起點(diǎn)(ori)開始,并沿著環(huán)DNA分子單向性地進(jìn)行??刂拼朔N質(zhì)粒DNA復(fù)制啟動(dòng)的兩種關(guān)鍵因素RNAI和RNAⅡ兩種RNA分子,都是由ColE1DNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的。其中RNAⅡ也叫做復(fù)制引物。RNAⅡ分子在轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)附近同互補(bǔ)的模板DNA形成一種雜交分子,被RnaseH酶所切割,從而釋放出3′-OH末端,作為供DNA聚合酶Ⅰ合成DNA的引物。RNAⅠ可以通過同RNAⅡ結(jié)合,以阻止其與模板DNA發(fā)生雜交作用。原核細(xì)胞DNA復(fù)制的調(diào)控
真核生物的復(fù)制起始受許可因子的控制a、復(fù)制子的大小(Sizesofreplicon):Yeastorfly 平均40kbMam
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