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雙向電泳的操作2007-7-4步驟樣品制備(Samplepreparation)固相pH梯度膠條的水化(IPGstriprehydration)第一向等電聚焦(IEF)第一向膠條的平衡(IPGstripequilibration)第二向SDS電泳(SDS)檢測(cè)染色(Detection/Staining)蛋白點(diǎn)的挖取,收集質(zhì)譜分析總的策略一般性原則
盡可能的提高樣品蛋白的溶解度,抽提最大量的總蛋白,減少蛋白質(zhì)的損失減少對(duì)蛋白質(zhì)的人為修飾破壞蛋白質(zhì)與其他生物大分子的相互作用,并使蛋白質(zhì)處于完全變性狀態(tài)樣品制備需要的試劑
離液劑(chaotropes):
尿素(Urea)和硫脲(thiourea)表面活性劑(sufactants)也稱(chēng)去垢劑:
NP-40、TritonX-100等非離子去垢劑CHAPS與Zwittergent系列等雙性離子去垢劑還原劑(reducingagents)二硫蘇糖醇(DTT)二硫赤蘚糖醇(DTE)磷酸三丁酯(TBP)選擇性的加入
Tris-base蛋白酶抑制劑(如EDTA、Pefablocproteaseinhibitor、PMSForProteaseinhibitorcocktails)核酸酶常用裂解液UreaThioureaCHAPSDTTPharmalytepH3-10Tris-BasePefablocproteaseinhibitor1%SDS樣品制備程序
培養(yǎng)細(xì)胞(culturecell)樣品處理方法(1)培養(yǎng)細(xì)胞的收集;(2)用磷酸緩沖液(PBS)洗細(xì)胞3次(室溫,1000g,各2min);(3)將細(xì)胞分裝到1.5mlEppendof管中,吸干殘留的PBS;(4)加入裂解緩沖液(1.5x106個(gè)細(xì)胞大約加入100μL裂解液),在室溫振蕩1h,使其充分溶解;(5)4℃,40,000g,離心1h;(6)吸取上清并用Brandford法定量蛋白,然后分裝至Eppendof管里保存在-78℃?zhèn)溆谩=M織樣品處理方法
三氯醋酸-丙酮沉淀法(TCA/acetoneprecipitation)超速離心法BACK加樣品水化加樣品水化BACKIEF限流50uA200V1hr500V1hr1000V1hr8000V30mingradient8000V5hr(40000Vh)500V維持BACK第二向SDS電泳(SDS)BACK2-DE膠蛋白質(zhì)點(diǎn)的檢測(cè)
1)考馬斯亮蘭染色法;2)銀染法;3)負(fù)染法;4)熒光染色法;5)放射性同位素標(biāo)記法??捡R斯亮蘭染色法經(jīng)典的考馬斯亮蘭染色(R-250)局限:靈敏度低(≈1μgprotein/spot)Neuhoff膠體考染法優(yōu)點(diǎn):背景低,靈敏度高,可達(dá)到200ngprotein/spot熱考馬斯亮蘭染色及二次染色法.SYPRORuby
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