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文檔簡介
第二章?lián)p傷修復(fù)突變和轉(zhuǎn)座演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有71頁\編輯于星期四優(yōu)選第二章?lián)p傷修復(fù)突變和轉(zhuǎn)座現(xiàn)在是2頁\一共有71頁\編輯于星期四
引起損傷的因素:
?自發(fā)性損傷(復(fù)制中的損傷、堿基的自發(fā)性化學(xué)改變、自發(fā)脫堿基、細(xì)胞的代謝產(chǎn)物對DNA的損傷)?物理因素引起的損傷(電離輻射、紫外線)?化學(xué)因素引起的損傷(烷化劑、堿基類似物)引起損傷的類型:堿基脫落、堿基(或核苷)改變、錯誤堿基(堿基的取代)、堿基的插入或缺失、鏈的斷裂、鏈交聯(lián)(鏈內(nèi)、鏈間)、嘧啶二聚體等等現(xiàn)在是3頁\一共有71頁\編輯于星期四
廣義的修復(fù)系統(tǒng):
?DNA聚合酶的校對功能(復(fù)制的范疇)?尿嘧啶-N-糖苷酶修復(fù)系統(tǒng)
(復(fù)制時U的滲入、C脫氨氧化成U)?錯配修復(fù)系統(tǒng)?損傷修復(fù)系統(tǒng)(光復(fù)活、重組修復(fù)、SOS修復(fù)等)
★限制修飾系統(tǒng)-----對付外源DNA的入侵現(xiàn)在是4頁\一共有71頁\編輯于星期四第一節(jié)復(fù)制過程中的錯配的修復(fù)現(xiàn)在是5頁\一共有71頁\編輯于星期四DNAmismatch+-----A------------C---DNApol(ξ=10-8)經(jīng)第二次校正ξ=10-11錯配修復(fù)系統(tǒng)(MRSMismatchRepairSystem)1、錯配修復(fù)堿基來源:校正活性所漏校的堿基使復(fù)制的保真性提高102~103倍現(xiàn)在是6頁\一共有71頁\編輯于星期四2、錯配修復(fù)系統(tǒng)(Mismatchrepairsystem)DNApolymeraseHelicaseSSB外切核酸酶(Ⅰ和Ⅶ)連接酶MCE(mismatchcorrectenzyme)3subunitsmutH,L,SdamgeneDNA腺嘌呤甲基化酶(m6A甲基化酶)掃描新生鏈中錯配堿基識別新生鏈中非m6A的GATC序列酶切含錯配堿基的新生DNA區(qū)段
(1)組成現(xiàn)在是7頁\一共有71頁\編輯于星期四★DNA合成過程中的甲基化變化DNA中的GATC(palindromicseq.)為m6A甲基化敏感位點(diǎn)平均每2kb左右有一GATCseq.錯配修復(fù)系統(tǒng)受甲基化的引導(dǎo)現(xiàn)在是8頁\一共有71頁\編輯于星期四
甲基化程度的差異a、MutH/MutS
掃描識別錯配堿基和鄰近的GATC序列
切點(diǎn)--甲基化GATC中
G的5’側(cè)DNAhelicaseII,SSB,exonucleaseI去除包括錯配堿基的片段DNApolymeraseIII和
DNAligase填充缺口昂貴的代價用于保證DNA的準(zhǔn)確性(2)修復(fù)過程現(xiàn)在是9頁\一共有71頁\編輯于星期四外切核酸酶Ⅰ切割切點(diǎn)的5’端(錯配堿基在切點(diǎn)的5’端)
----------------Ⅶ----------------3’端(--------------------------3’端)現(xiàn)在是10頁\一共有71頁\編輯于星期四3、尿嘧啶-N-糖苷酶系統(tǒng)(ungsystem
)修復(fù)尿嘧啶的來源:dUTP的滲入胞嘧啶的自發(fā)脫氨氧化現(xiàn)在是11頁\一共有71頁\編輯于星期四---TAGC------ATCG------TAGC------ACG---U---TAGC---ung-ase
①GCUAU---TAGC------ACG---AP內(nèi)切酶(Apurinase)②---TAGC------ATCG---DNApolLigase
③現(xiàn)在是12頁\一共有71頁\編輯于星期四
第二節(jié)DNA損傷的修復(fù)現(xiàn)在是13頁\一共有71頁\編輯于星期四一、嘧啶二聚體的產(chǎn)生
類型:TT二聚體()、CC二聚體()、
CT二聚體()TTCCCT相鄰的胸腺嘧啶胸腺嘧啶二聚體CCCCCCCC現(xiàn)在是14頁\一共有71頁\編輯于星期四現(xiàn)在是15頁\一共有71頁\編輯于星期四PR1、光復(fù)活(photoreactivation)----TT--------AA--------TT--------AA--------TT--------AA--------TT--------AA----
復(fù)制前進(jìn)行、不容易出錯400nm藍(lán)光、PR酶
(photo-reactivationenzyme)
光敏裂合酶(photolyase)可見光激活
二、二聚體修復(fù)的機(jī)制現(xiàn)在是16頁\一共有71頁\編輯于星期四2.切除修復(fù)Exision—Repair
復(fù)制前進(jìn)行不易出錯UvrA,B,Cgene
內(nèi)切核酸酶(Endonucleases)外切核酸酶(Exonuclease)
DNApolLigase
堿基切除修復(fù)核苷酸切除修復(fù)堿基切除修復(fù)核苷酸切除修復(fù)現(xiàn)在是17頁\一共有71頁\編輯于星期四ABABCABCABCAB螺旋酶Pol?
螺旋酶連接酶切補(bǔ)切封現(xiàn)在是18頁\一共有71頁\編輯于星期四3.重組修復(fù)(Recombinative—Repair)后復(fù)制修復(fù)、E.coli的挽回系統(tǒng)E.coli
存活%U.V計(jì)量w.t.UvrA+RecA+
uvra-reca-該系統(tǒng)存在的實(shí)驗(yàn)證據(jù)現(xiàn)在是19頁\一共有71頁\編輯于星期四★Rec-A.gene
以某種方式參與DNA損傷修復(fù)?Rec修復(fù)系統(tǒng)比切除修復(fù)系統(tǒng)更有效
目前知道
?Uvr系統(tǒng)負(fù)責(zé)切除二聚體?Rec系統(tǒng)負(fù)責(zé)消除沒有被切除的二聚體可能造成的后果現(xiàn)在是20頁\一共有71頁\編輯于星期四TTTTAAAATTTTTTTTAAAATTTT變性
E.coli(Rec-A,uvr-a-)D.S.DNAS.S.DNAU.V.復(fù)制提取變性復(fù)制過程越過二聚體而在相應(yīng)新鏈上留下缺口★二聚體后起始★修復(fù)時期的證明現(xiàn)在是21頁\一共有71頁\編輯于星期四●與Rec-A蛋白引起的重組(strandtransfer)有關(guān)●TTdimer未被修復(fù),僅表現(xiàn)在后代群體中TTdimer
濃度的稀釋●鏈的非準(zhǔn)確轉(zhuǎn)移,導(dǎo)致突變機(jī)率的增加修復(fù)相關(guān)機(jī)制:現(xiàn)在是22頁\一共有71頁\編輯于星期四
重組修復(fù)
(鏈轉(zhuǎn)移修復(fù))
復(fù)制后修復(fù)容易出錯RecA,DNApolymeraeligase二聚體后起始RecA
聚合酶、連接酶重組修復(fù)后的損傷位點(diǎn)可由其它機(jī)制進(jìn)一步修復(fù)現(xiàn)在是23頁\一共有71頁\編輯于星期四課內(nèi)容回顧:
1、復(fù)制過程中的錯配修復(fù)錯配修復(fù)系統(tǒng)尿嘧啶-N-糖苷酶修復(fù)系統(tǒng)
2、DNA的損傷的修復(fù)嘧啶二聚體光復(fù)活修復(fù)切除修復(fù)重組修復(fù)現(xiàn)在是24頁\一共有71頁\編輯于星期四第三節(jié)突變類型
現(xiàn)在是25頁\一共有71頁\編輯于星期四
●染色體突變(Chromosomemutation
)chromosomenumber
chromosomestructure
●核苷酸突變(dNtpointmutation)
突變(mutation):可以通過復(fù)制而遺傳的DNA結(jié)構(gòu)的任何永久性改變遺傳狀態(tài)現(xiàn)在是26頁\一共有71頁\編輯于星期四
突變體(mutant):攜帶突變的生物個體或群體或株系
突變基因(mutantgene):存在突變位點(diǎn)的基因野生型基因(wildtypegene):表示方法表現(xiàn)型Arg+Arg-
基因型arg+arg-
野生型正性狀現(xiàn)在是27頁\一共有71頁\編輯于星期四1、從突變作用來源上定義自發(fā)突變--自然界的突變劑或偶然復(fù)制錯誤誘變--人為使用突變劑★
堿基異構(gòu)式引起DNA復(fù)制過程的錯誤-----自發(fā)突變
堿基異構(gòu)式
A(amino氨基)A(imino亞氨基)
C(a)C(i)
G(keto酮式)G(enol烯醇式)
G(k)
G(e,i)
T(keto)
T(enol-2’)orT(enol-4’)
現(xiàn)在是28頁\一共有71頁\編輯于星期四堿基異構(gòu)式引起DNA復(fù)制的錯配
G(k)C(a)
正確配對A(a)
T(k)
錯誤配對G(k)T(e)
A(a)
C(i)
A(i,anti)A(a,syn)A(i,anti)G(k,syn)
G(e,i,anti)G(k,syn)G(e,i,anti)A(a,syn)
A(i)
C(a)
G(e)
T(k)
現(xiàn)在是29頁\一共有71頁\編輯于星期四A(a)
T(k)
A(a,anti)
T(k,anti)
C(i)
C(a,anti)
A(a)
A(i,anti)
堿基異構(gòu)式引起DNA的錯配突變
C(i)
C(a)G(k,syn)
G(k,syn)
G(k,anti)G(k)現(xiàn)在是30頁\一共有71頁\編輯于星期四2、從序列改變多少上定義單點(diǎn)突變(pointmutation)(點(diǎn)突變)
多點(diǎn)突變(multiplemutation)點(diǎn)突變---堿基替代、堿基插入、堿基缺失●堿基替代(conversion)轉(zhuǎn)換(transition)PyPy
Pu
Pu
顛換(transvertion)
Py
Pu
現(xiàn)在是31頁\一共有71頁\編輯于星期四●核苷酸缺失或插入(dNtdeletionorinsertion
)=3xdNt
±nxAminoacid
=3xdNt
移框(Framshift
)
移框突變(frameshiftmutation):一個或兩個堿基的插入或缺失,或扁平堿性染料分子3、從對閱讀框的影響上定義移碼突變現(xiàn)在是32頁\一共有71頁\編輯于星期四Examplesofdeletionmutations
現(xiàn)在是33頁\一共有71頁\編輯于星期四4、從對遺傳信息的改變上定義(點(diǎn)突變)同義突變:沒有改變產(chǎn)物氨基酸序列的密碼子錯義突變:堿基序列的改變引起了氨基酸序列的改變(中性突變、滲漏突變)無義突變:堿基的改變使代表某種氨基酸的密碼子變?yōu)榈鞍缀铣傻慕K止密碼子●堿基替代對遺傳信息的改變
---同義突變
GAA→GAGGlu現(xiàn)在是34頁\一共有71頁\編輯于星期四---錯義突變
GAA→AAALys---無義突變
GAA→TAA(stop)
無義突變類型UAA(Oc)赭石型(Ocher)UAG(Am)琥珀型(amber)UGA(Opal)乳石型(Opal)現(xiàn)在是35頁\一共有71頁\編輯于星期四5、從突變的表達(dá)類型上定義---非條件型突變:
---條件型突變:
突變的表現(xiàn)=突變基因型+誘導(dǎo)條件
(光,溫敏感不育)
6、從突變效應(yīng)上定義正向突變回復(fù)突變:使突變體所失去的野生型性狀得到恢復(fù)的第二次突變真正的原位回復(fù)突變很少大部分為第二點(diǎn)的回復(fù)突變----抑制突變現(xiàn)在是36頁\一共有71頁\編輯于星期四7、突變位點(diǎn)存在于負(fù)責(zé)基因調(diào)控的序列中
*
在啟動子區(qū)域時:
啟動子上升突變:增強(qiáng)啟動子對轉(zhuǎn)錄的發(fā)動作用的突變啟動子下降突變:*在操作子上或調(diào)節(jié)基因上組成型突變:產(chǎn)生組成型表達(dá)方式的操作子突變或調(diào)節(jié)基因的突變
突變的操作子不能被阻遏蛋白所識別調(diào)節(jié)基因突變不能產(chǎn)生有活性的阻遏蛋白
兩者之一都使結(jié)構(gòu)基因失去了負(fù)向控制
現(xiàn)在是37頁\一共有71頁\編輯于星期四第四節(jié)回復(fù)突變(抑制突變)現(xiàn)在是38頁\一共有71頁\編輯于星期四1、抑制突變發(fā)生的部位基因內(nèi)抑制突變:抑制突變發(fā)生在正向突變的基因中基因間抑制突變:抑制突變發(fā)生在正向突變基因外的其它基因中wildtypemutant(表現(xiàn)型)正向突變(lowF.)回復(fù)突變(verylowF.正向的1/10)現(xiàn)在是39頁\一共有71頁\編輯于星期四間接抑制突變:不恢復(fù)正向突變基因蛋白質(zhì)產(chǎn)物的功能,而是通過改變其它蛋白質(zhì)的性質(zhì)或表達(dá)水平而補(bǔ)償原來突變造成的缺陷,從而恢復(fù)野生型2、野生表型恢復(fù)作用的性質(zhì)直接抑制突變:通過恢復(fù)或部分恢復(fù)原來突變基因產(chǎn)物蛋白質(zhì)的功能而恢復(fù)野生表型現(xiàn)在是40頁\一共有71頁\編輯于星期四
3、回復(fù)突變的分子機(jī)制a)AGC(Ser)ACC(Thr)AGC(Ser)b)AGC(Ser)AGG(Arg)AGT(Ser)c)AGC(Ser)AGG(Arg)
GGG(Gly)ifSer≈Gly現(xiàn)在是41頁\一共有71頁\編輯于星期四
(1)基因內(nèi)抑制突變(Intragenicsuppression)第二位點(diǎn)引起的基因內(nèi)校正密碼子間兩次錯義突變的互補(bǔ)4、抑制突變的分子機(jī)制錯義突變移框突變錯義突變造成野生型表型的喪失---部分原因在于影響到蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)(正負(fù)電荷、疏水作用)現(xiàn)在是42頁\一共有71頁\編輯于星期四a、靜電作用現(xiàn)在是43頁\一共有71頁\編輯于星期四b、疏水作用現(xiàn)在是44頁\一共有71頁\編輯于星期四---UGG174----------GGA210---(w.t.)(K)(G)回復(fù)突變(C)
(G)----UGG174-----------GGA210--------UGG174----------GGA210--------UGC174-----------GAA210----活性結(jié)構(gòu)無活性結(jié)構(gòu)CA無活性結(jié)構(gòu)(K)(E)現(xiàn)在是45頁\一共有71頁\編輯于星期四移框突變的抑制突變(基因內(nèi)第二點(diǎn)的插入或缺失)現(xiàn)在是46頁\一共有71頁\編輯于星期四(2)基因間的抑制突變無義突變---無義抑制突變錯義突變---錯義抑制突變移框突變---移框抑制突變
發(fā)生在
tRNA基因或與tRNA功能相關(guān)的基因上現(xiàn)在是47頁\一共有71頁\編輯于星期四a、基因間的無義抑制突變(Nonsensesuppressor)野生型UAG、UGA、UAA---三種無義抑制50%赭石型無義抑制tRNA產(chǎn)生的幾率很低,且抑制效率很低現(xiàn)在是48頁\一共有71頁\編輯于星期四AGAUCUArgGlyGGACCUUCUGlyCCUGlyb、基因間的錯義抑制突變(Missensesuppressor)Gly現(xiàn)在是49頁\一共有71頁\編輯于星期四c、基因間移框抑制突變總結(jié):基因內(nèi)和基因間的錯義(無義)、移框抑制突變均由相應(yīng)的錯義(無義)、移框突變抑制現(xiàn)在是50頁\一共有71頁\編輯于星期四課內(nèi)容回顧:
1、突變的類型突變作用來源、序列改變多少、對閱讀框的影響對遺傳信息的改變、突變的表達(dá)類型、突變效應(yīng)突變位于負(fù)責(zé)基因表達(dá)調(diào)控的序列當(dāng)中
2、抑制突變發(fā)生部位:基因內(nèi)、基因間野生表型恢復(fù)作用性質(zhì):直接抑制、間接抑制基因內(nèi)錯義抑制突變的分子機(jī)制基因間錯義、移碼、無義抑制突變的分子機(jī)制現(xiàn)在是51頁\一共有71頁\編輯于星期四第六節(jié)突變劑和突變生成現(xiàn)在是52頁\一共有71頁\編輯于星期四1、堿基類似物(Baseanalog)2-氨基嘌呤2-Aminopurine5-溴尿嘧啶5-BromineUracilOOBrNH2現(xiàn)在是53頁\一共有71頁\編輯于星期四5-BrU:G:A
烯醇式enolBrOHHOBr
酮式KetoHOAGCTTCCTATCGAAGGATAGCTBCCTATCGAAGGAT酮式5-BrU的滲入AGCTBCCTATCGAAGGATAGCTCCCTATCGAGGGAT第二輪復(fù)制A·TG·C
轉(zhuǎn)變AGCTBCCTATCGAGGGATAGCTTCCTATCGAAGGAT第一輪復(fù)制酮式到稀醇式的轉(zhuǎn)變烯醇式滲入為G·CA·T
轉(zhuǎn)變現(xiàn)在是54頁\一共有71頁\編輯于星期四InDNABrU(k)>BrU(e)(正常形式)(異構(gòu)體)BrU(k)
BrU(e)難易AGGATCCT>堿基類似物產(chǎn)生的均為錯義突變現(xiàn)在是55頁\一共有71頁\編輯于星期四
2、堿基的化學(xué)修飾導(dǎo)致突變又稱化學(xué)突變劑:亞硝酸(nitrousacidHNO2)羥氨(hydroxylamineHA)甲磺酸乙酯(ethylmathanesulfonateEMS)
N-甲基-N’-硝基-N-亞硝基胍(N-mathyl-N’-nitro-N-nitrosoguanidionNNG)產(chǎn)生---錯義突變現(xiàn)在是56頁\一共有71頁\編輯于星期四NH2OH(Hydroxylamine
HA羥胺)C(i)A(a)HNHHOC(a)HAHNHHHOHNHHOHNHHOHNHHONH現(xiàn)在是57頁\一共有71頁\編輯于星期四3、嵌合劑的致突變作用吖啶橙(AcridineOrangeAO)扁平染料分子溴化乙錠(EthidiumBromideEB)-ATTTTTCG--TAAAAAGC--ATTTCG--TAAAGC-TAOT-ATEBTTTTCG--TA分子插入AOEB-ATTTCG--TAAAGC--ATX’TTTTCG--TAXAAAAGC-XAAAAGC-結(jié)果產(chǎn)生---移框突變現(xiàn)在是58頁\一共有71頁\編輯于星期四5、
增變基因(mutatorgene)w.t.維持遺傳的穩(wěn)定性mut.
隨機(jī)引起其他各類基因的突變4、轉(zhuǎn)座成分的致突變作用生物體內(nèi)有些基因與整個基因組的突變頻率直接相關(guān)其突變時,整個基因組的突變頻率明顯上升現(xiàn)在是59頁\一共有71頁\編輯于星期四增變基因類別:a、DNApolymerase相關(guān)基因3’5’校正功能突變b、錯配修復(fù)系統(tǒng)的基因MCE(mismatchcorrectionenzyme)c、DNA
損傷修復(fù)系統(tǒng)基因錯配,損傷修復(fù)功能喪失突變率升高現(xiàn)在是60頁\一共有71頁\編輯于星期四6、紫外線的致突變作用---嘧啶二聚體(TTdimer)∧U.V.…CTTA…現(xiàn)在是61頁\一共有71頁\編輯于星期四
脫氨氧化
U.V.CUA(a)U.V.U.V.H2OH++OH-C(a)
C(i)A(a)
脫嘌呤造成的突變:堿基替代、缺失、重復(fù)、移框現(xiàn)在是62頁\一共有71頁\編輯于星期四7、突變熱點(diǎn)(MutationHotpoint)基因自發(fā)突變的頻率是一定的DNA分子上某些位點(diǎn)的突變頻率大大平均數(shù),這樣的位點(diǎn)稱為----現(xiàn)在是63頁\一共有71頁\編輯于星期四a)重復(fù)序列(repetitiveseq.)/palindromicseq.e.g.Lac.Operon---CTGGCTGGCTGG---
b)m5Cc)不同誘變劑作用位點(diǎn)不同,轉(zhuǎn)座子插入位點(diǎn)不同UCm5CT脫氨氧化復(fù)制時,模板與新生鏈間滑動錯配缺失,插入突變復(fù)制期發(fā)生在新生鏈上不發(fā)生突變,若發(fā)生在模板鏈上很快突變非復(fù)制期突變頻率50%現(xiàn)在是64頁\一共有71頁\編輯于星期四DNA的損傷修復(fù)與突變Mutagen(誘變劑)完全修復(fù)DNA損傷堿基的化學(xué)反應(yīng)損傷的修復(fù)突變突變生成現(xiàn)在是65頁\一共有71頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)位因子
現(xiàn)在是66頁\一共有71頁\編輯于星期四轉(zhuǎn)位因子
轉(zhuǎn)位因子(transposableelement)即可移動的基因成分(可移動基因,movablegenemob),是指能夠在一個DNA分子內(nèi)部或兩上DNA分子之間移動的DNA片段。在細(xì)菌中指在質(zhì)粒和染色體之間或在質(zhì)粒和質(zhì)粒之間移動的DNA片段(文獻(xiàn)上有時形象地稱其為是跳躍基因,jumpinggene)。轉(zhuǎn)位也是DNA重組的一種形式。
現(xiàn)在是67頁\一共有71頁
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