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文檔簡介

聚丙烯酰胺凝膠雙向電泳第一部分實驗簡介一、實驗?zāi)康?/p>

通過雙向電泳實驗,初步掌握電泳的基本理論、雙向電泳實驗的設(shè)計原理和實驗技能。二、實驗原理根據(jù)不同的蛋白質(zhì)具有不同的分子量和等電點的特點。利用這一性質(zhì)首先通過毛細(xì)管聚丙烯酰胺凝膠等電聚焦技術(shù)將不同等電點的蛋白質(zhì)分開,然后通過SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳將相同或相近等電點而分子量不同的蛋白質(zhì)進行相對分子量分離。經(jīng)過二維電泳分離的蛋白質(zhì)在二維電泳圖譜所處的位置,就是該蛋白質(zhì)的相對分子量和等電點。三、實驗流程蛋白樣品的制備↓等電聚焦凝膠溶液的配制↓灌注毛細(xì)管凝膠↓組裝第一向電泳槽↓聚焦電泳↓停止電泳↓取出毛細(xì)管膠↓毛細(xì)管膠置平衡液中平衡第二部分實驗方法第一向電泳——毛細(xì)管等電聚焦電泳(IEF)1.儀器準(zhǔn)備雙向電泳系統(tǒng)一套(見清單)燒杯1000mL、50mL各1個量筒1000mL(或500mL)、100mL、10mL各1個注射器1mL(帶長針頭)、微量注射器100μL(或50μL)各1支大塑料盒1個滴管1支2.溶液配制(1)覆蓋溶液(25mL/班)

含8mol/L尿素,1%兩性電解質(zhì)pH3~9.5,5%(w/v)NP40(NonidetP40Substitute)和100mmol/LDTT取12g尿素,0.25mL兩性電解質(zhì)(pH3~9.5),12.5mL的10%的NP40和0.386gDTT,用重蒸水溶解后,定容到25mL。溶液不能受熱,儲存在冰箱中。(2)平衡溶液(250mL/班)Tris-HCl(pH6.8)緩沖液,含2%SDS,100mmol/LDTT和10%甘油15mLTris-HCl(pH6.8),50mL10%SDS,3.86gDTT和29mL甘油,用重蒸水定容到250mL,室溫存放。

(3)30%Acrylamide第一向儲液(100mL/班)

含28.4%(w/v)acrylamide和1.6%(w/v)N,N'-methylene-bis-acrylamide用重蒸水先將1.6gbisacrylamide溶解后,再加入28.4gacrylamide,溶解,用重蒸水定容到100mL。如果溶液混濁,需要進行過濾。溶液存放在棕色瓶中,4°C貯藏,3~4星期內(nèi)使用。(4)10%(w/v)NP40(20mL/班)

配制100mL溶液,稱量10gNP40,用重蒸水定容到100mL,室溫存放。(5)20mmol/LNaOH配制500mL,稱0.4gNaOH用蒸餾水定容到500mL。(6)10mmol/LH3PO4

配制2000mL,量取1.35mLH3PO4(85%)用蒸餾水定容到2000mL。(7)固定液

乙醇35mL,三氯乙酸10g,磺基水楊酸3.5g,加蒸餾水定容到100mL。(8)脫色液

乙醇25mL,冰乙酸10mL,加蒸餾水定容到100mL。(9)10%過硫酸銨0.1g過硫酸銨溶于1mL重蒸水中,在4oC冰箱中可保存3~4個星期。(3)灌制第一向凝膠(每組2人共制作4根膠柱)

取1支1mL注射器和一根長針頭,吸取約0.5mL第一向凝膠溶液,再取1支玻璃管,用手指墊一塊封口膜堵住玻璃管的一端,將長針頭全部插入玻璃管中,一邊注入凝膠溶液一邊后退針頭,注意針頭不要露出膠面,直至凝膠溶液到達(dá)玻璃管頂端,撤出針頭,用濾紙擦干玻璃管口的凝膠溶液,然后用封口膜封住該端管口,將玻璃管倒置,將長針頭從玻璃管的另一端插入管內(nèi)凝膠液面下,用同樣方法加入凝膠溶液至距管口2cm處,將玻璃管垂直放置,然后立即用微量注射器在膠面上加少量重蒸水覆蓋,大約30min后凝膠聚合。

(4)加樣

待凝膠聚合后,用微量注射器吸去覆蓋在膠上的重蒸水。在每根膠柱上加20~30μL蛋白質(zhì)樣品溶液,然后再加入覆蓋溶液至管口。(5)安裝電泳槽

加樣后將玻璃管插入電泳槽的架子上,在上槽中玻璃管上端露出1cm,剝?nèi)ゲAЧ芟露说姆饪谀?,?zhǔn)備電泳。在電泳槽的下槽加2000mL10mmol/LH3PO4溶液,將柱膠下端浸入到H3PO4溶液中,注意膠下端不可有氣泡(如果有氣泡,可以先用注射器將膠下端用H3PO4溶液灌滿,再將柱膠插入H3PO4溶液中)。上槽倒入500mL20mmol/LNaOH溶液,蓋上電泳槽蓋,注意正負(fù)電極。(8)平衡:將推出的一條凝膠條放入盛有10ml平衡液的小燒杯中,浸泡平衡20min,然后進行第二向電泳.(9)染色:另一條膠放入固定液中固定1~2h,用考馬斯亮藍(lán)R250染色1h,再用脫色液脫色,觀察第一向聚焦效果。第二向電泳--SDS-聚丙烯酰胺凝膠電(SDS)1.溶液配制(1)30%Acrylamide第二向儲液(500mL/班)

含29.1%(w/v)acrylamide和0.9%(w/v)N,N'-methylene-bis-acrylamide,配制方法同第一向儲液。(2)10%SDS稱10gSDS用重蒸水溶解,定容到100mL,室溫存放。

(3)分離膠緩沖液(300mL/班)1.5mol/LTris-HCl緩沖液,pH8.9。稱Tris109g,取1mol/LHCl144mL,用重蒸水定容至300mL,4°C保存。(4)濃縮膠緩沖液(300mL/班)0.5mol/LTris-HCl緩沖液,pH8.9。稱Tris6g,取1mol/LHCl48mL,用重蒸水定容至100mL,4°C保存。(5)電極緩沖液(2500mL/2組)

稱6g的Tris,29g甘氨酸,2.5gSDS,用蒸餾水定容到2.5L。

2.實驗步驟 (1)組裝夾心式玻璃板、制膠支架底座調(diào)水平;取一塊長玻璃板和一塊帶磨口槽的短玻璃板,將短玻璃板帶磨口槽的一邊位于上端與長玻璃相對,兩玻璃板之間的左、右兩端各放入一條間隔條,對齊,插入玻璃板固定夾,將上面的固定螺絲擰緊,將此夾心式玻璃板放入制膠支架底座,插入凸輪,向內(nèi)側(cè)推入并旋轉(zhuǎn)180o,夾心式玻璃板即被固定。(2)分離膠配制分離膠按照凝膠濃度不同分為三層,自下而上濃度遞減,每層高度約4~5cm,分別按照表2配制,并依次灌制。

試劑凝膠濃度

18%12%7%30%Acrylamide儲液/mL7.24.82.8

分離膠緩沖液/mL3.03.03.0

重蒸水/mL1.64.06.0

10%SDS/mL0.120.120.12

TEMED/μL202020

10%AP/μL303030

總體積/mL121212

(3)灌注分離膠首先將配制的第一層凝膠溶液用滴管沿著長玻璃板內(nèi)側(cè)緩緩加入凝膠腔,小心不產(chǎn)生氣泡,然后用少量1/4濃度的分離膠緩沖液封膠面(高度約2mm),凝膠聚合大約30min。待凝膠聚合后用濾紙片吸干封膠緩沖液,灌注第二層凝膠溶液,并封膠面。凝膠聚合后灌注第三層凝膠溶液,最終凝膠距離短玻璃板上沿3cm左右,最后用1/4濃度的分離膠緩沖液封膠面(約20mm)。

試劑凝膠濃度

5%30%Acrylamide儲液/mL2.5

濃縮膠緩沖液/mL2.0

重蒸水/mL10.2

10%SDS/mL0.15

TEMED/μL30

10%AP/μL45

總體積/mL15

(5)安裝第二向電泳裝置在冷卻槽上取下紅色密封條,安裝上白色密封條,將夾心式凝膠板從灌膠支架底座上取下,安裝在冷卻槽上。(6)凝膠拼接①

將平衡好的膠條用少量的電極緩沖液漂洗,擺放在一塊干凈的玻璃板上,膠條的正極端位于小加樣槽一端。膠條兩端各切去約2cm,使凝膠長度略短于加樣槽;②輕輕拔出樣品槽模板,在小加樣槽中加入5~10μL標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì);③用滴管將已加熱融化的用電極緩沖液配制的1%瓊脂快速加在濃縮膠上,使瓊脂在濃縮膠上鋪開形成一層水平的膠層,瓊脂高度為1~2mm;(7)電泳將電泳裝置放入電泳槽中,在上槽中灌入電極緩沖液,緩沖液高過短板,其余緩沖液到入下槽,應(yīng)高過凝膠板下沿2cm。蓋上電泳槽蓋子,接通電源,恒壓60V,電泳30min,樣品進入凝膠后,調(diào)節(jié)恒壓250V,電泳至溴酚蘭到達(dá)分離膠底部1cm左右時停止。(8)固定倒去電極緩沖液,拆開電泳槽,取下凝膠板,放入固定液中,室溫過夜。(9)染色和脫色用考馬斯亮藍(lán)R250染色液染色2h,用脫色液脫色,直至背景清晰。(10)實驗結(jié)果凝膠掃描。3\操作步驟①將膠置于150ml40%甲醇-10%冰醋酸中浸泡,搖動固定過夜。②取出膠,置于120ml10%甲醇-5%冰醋酸中浸泡,搖動固定30min。③用去離子水將膠浸泡、漂洗,第一、二次,每次間隔20min。④去離子水搖動漂洗,第三、四次,每次間隔30min換水一次。⑤傾出去離

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