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文檔簡介

劉春艷北京大學(xué)醫(yī)學(xué)圖書館信息咨詢部liucy@PubMed生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫檢索方法與技巧現(xiàn)在是1頁\一共有61頁\編輯于星期一主要內(nèi)容PubMed概況

PubMed數(shù)據(jù)來源PubMed檢索機(jī)制PubMed檢索運(yùn)算符PubMed檢索方法結(jié)果的顯示、打印、保存其他輔助功能現(xiàn)在是2頁\一共有61頁\編輯于星期一1.PubMed概況創(chuàng)建機(jī)構(gòu):美國國家醫(yī)學(xué)圖書館下設(shè)的美國生物技術(shù)信息中心(NCBI)1997年6月開始向全球開放特色:具有收錄范圍廣(免費(fèi))、內(nèi)容全、檢索途徑多、檢索體系完備等特點(diǎn),部分文獻(xiàn)還可在網(wǎng)上直接免費(fèi)獲得全文?,F(xiàn)在是3頁\一共有61頁\編輯于星期一2.PubMed數(shù)據(jù)來源MEDLINE:

[pubmed-indexedformedline]InProcessCitations:每天收錄,尚未經(jīng)規(guī)范處理的數(shù)據(jù)。[pubmed-inprocess]Publisher-SuppliedCitations:由出版商提供的電子文獻(xiàn),每條記錄標(biāo)有[PubMed-assuppliedbyPublisher]?,F(xiàn)在是4頁\一共有61頁\編輯于星期一3.PubMed檢索機(jī)制自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping)Leukemia"leukaemia"[AllFields]OR"leukemia"[MeSHTerms]OR"leukemia"[AllFields]現(xiàn)在是5頁\一共有61頁\編輯于星期一對于輸入的檢索詞,PubMed先按一定的詞表順序進(jìn)行對照匹配和轉(zhuǎn)換,再進(jìn)行檢索。詞表匹配轉(zhuǎn)換順序是:MeSH表期刊刊名表短語表作者索引如果在以上4個(gè)表中都找不到相匹配的詞,PubMed將把短語分開,以單詞為單位,分別重復(fù)以上的過程,檢索時(shí)各個(gè)詞之間是AND邏輯關(guān)系。如果仍找不到相匹配的詞,則用單個(gè)詞在所有字段查找,各個(gè)詞之間也是AND邏輯關(guān)系。3.1自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能現(xiàn)在是6頁\一共有61頁\編輯于星期一人重組三葉因子(humanrecombinanttrefoilfactor)

("humans"[MeSHTerms]OR"humans"[AllFields]OR"human"[AllFields])

ANDrecombinant[AllFields]

AND("trefoilfactor"[SupplementaryConcept]OR"trefoilfactor"[AllFields])現(xiàn)在是7頁\一共有61頁\編輯于星期一4.PubMed檢索運(yùn)算符邏輯運(yùn)算符現(xiàn)在是8頁\一共有61頁\編輯于星期一邏輯運(yùn)算符①邏輯“與”運(yùn)算AND:

檢索式寫成AandB,表示文獻(xiàn)中同時(shí)包含檢索詞A和檢索詞B的文獻(xiàn)才是命中文獻(xiàn)。

AIDSandtherapy②邏輯“或”運(yùn)算OR:

檢索式寫成AorB,表示包含檢索詞A的文獻(xiàn)或者包含檢索詞B的文獻(xiàn)或者同時(shí)包含檢索詞A和B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。

AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome③邏輯“非”運(yùn)算NOT:

檢索式寫成AnotB,表示包含檢索詞A同時(shí)不包含檢索詞B的文獻(xiàn)為命中文獻(xiàn)。

HepatitisnotAnimal現(xiàn)在是9頁\一共有61頁\編輯于星期一IP地址:PubMed網(wǎng)址現(xiàn)在是10頁\一共有61頁\編輯于星期一基本檢索高級(jí)檢索主題檢索臨床咨詢臨床實(shí)驗(yàn)現(xiàn)在是11頁\一共有61頁\編輯于星期一5.PubMed檢索方法5.1基本檢索5.2高級(jí)檢索5.3主題檢索5.4臨床咨詢現(xiàn)在是12頁\一共有61頁\編輯于星期一5.1基本檢索默認(rèn)檢索字段為主題、作者、期刊現(xiàn)在是13頁\一共有61頁\編輯于星期一關(guān)鍵詞、詞(詞組)或短語:⑴輸入任意關(guān)鍵詞:livercancer、Lungcancer;⑵帶有雙引號(hào)”

”作為短語檢索:”cancertherapy”;⑶帶有連接號(hào)”-”作為一個(gè)詞組檢索(英文可以,中文不行):interleukin-6。限制檢索字段:如livercancer[ti]作者:SmithJ、僅知道作者姓,則必須加上字段標(biāo)識(shí),如:Smith[au]2002年以后的文獻(xiàn)若文中有作者全稱可用全稱檢索如:JoshuaLederberg5.1基本檢索現(xiàn)在是14頁\一共有61頁\編輯于星期一期刊刊名:⑴可用期刊全稱:GENETHERAPY[TA];

⑵可用期刊簡稱:JAMA[TA];(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)

復(fù)雜表達(dá)式:livercancerANDtherapy帶有摘要文獻(xiàn)的檢索:livercancerANDhasabstract5.1基本檢索現(xiàn)在是15頁\一共有61頁\編輯于星期一分析該檢索課題,包含兩個(gè)方面:肝癌:livercancer;酒精:alcohol兩個(gè)主題之間的邏輯關(guān)系是AND,即livercancerANDalcohol

基本檢索舉例:肝癌和酒精的關(guān)系現(xiàn)在是16頁\一共有61頁\編輯于星期一基本檢索舉例:肝癌和酒精的關(guān)系輸入:livercancerANDalcohol現(xiàn)在是17頁\一共有61頁\編輯于星期一“肝癌和酒精的關(guān)系”的基本檢索結(jié)果現(xiàn)在是18頁\一共有61頁\編輯于星期一5.2高級(jí)檢索高級(jí)檢索現(xiàn)在是19頁\一共有61頁\編輯于星期一5.2高級(jí)檢索現(xiàn)在是20頁\一共有61頁\編輯于星期一5.2高級(jí)檢索現(xiàn)在是21頁\一共有61頁\編輯于星期一分析該檢索課題,包含兩個(gè)方面:作者為:馬大龍(madl);作者單位為:北京大學(xué)(pekinguniversity)。

高級(jí)檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)現(xiàn)在是22頁\一共有61頁\編輯于星期一高級(jí)檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)輸入:madl輸入:pekinguniversity現(xiàn)在是23頁\一共有61頁\編輯于星期一高級(jí)檢索舉例:北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部馬大龍教授發(fā)表的文獻(xiàn)現(xiàn)在是24頁\一共有61頁\編輯于星期一5.3主題檢索根據(jù)medline數(shù)據(jù)主題標(biāo)引的規(guī)范性,利用主題詞進(jìn)行的研究,對提高查全率、查準(zhǔn)率會(huì)有相當(dāng)?shù)膸椭?。點(diǎn)擊MeSHDatabase打開主題檢索界面現(xiàn)在是25頁\一共有61頁\編輯于星期一高級(jí)檢索主題檢索基本檢索現(xiàn)在是26頁\一共有61頁\編輯于星期一5.3主題檢索現(xiàn)在是27頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)分析該檢索課題,有2個(gè)概念:長春新堿(Vincristine)、白血病(leukemia):對長春新堿來說是利用其治療疾病,故其應(yīng)組配副主題詞“治療應(yīng)用(therapeuticuse)”;對白血病來說是利用藥物來治療,故其應(yīng)組配副主題詞“藥物療法(drugtherapy)”。同時(shí)這兩個(gè)概念之間是AND的關(guān)系?,F(xiàn)在是28頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血病(leukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用現(xiàn)在是29頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用現(xiàn)在是30頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用副主題詞現(xiàn)在是31頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血病(leukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用現(xiàn)在是32頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第1步:檢索長春新堿/治療應(yīng)用現(xiàn)在是33頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血病(leukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法現(xiàn)在是34頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法現(xiàn)在是35頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血病(leukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法現(xiàn)在是36頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)第2步:檢索白血病/藥物療法現(xiàn)在是37頁\一共有61頁\編輯于星期一主題檢索舉例:

長春新堿(Vincristine)治療白血?。╨eukemia)的文獻(xiàn)現(xiàn)在是38頁\一共有61頁\編輯于星期一5.4臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)可以使用戶方便快捷地檢索到有關(guān)臨床方面的文獻(xiàn),如臨床疾病的診斷、治療、病因和預(yù)后等;也可以用它來檢索臨床實(shí)踐過程中遇到的一些具體問題,如系統(tǒng)性綜述、元分析、臨床試驗(yàn)、循證醫(yī)學(xué)、實(shí)踐指導(dǎo)以及有關(guān)遺傳學(xué)方面的問題等。

現(xiàn)在是39頁\一共有61頁\編輯于星期一5.4臨床咨詢和系統(tǒng)評價(jià)臨床咨詢系統(tǒng)評價(jià)檢索醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究方面的文獻(xiàn)現(xiàn)在是40頁\一共有61頁\編輯于星期一現(xiàn)在是41頁\一共有61頁\編輯于星期一6.結(jié)果的顯示、打印、保存顯示保存、打印現(xiàn)在是42頁\一共有61頁\編輯于星期一6.1結(jié)果的顯示顯示格式:系統(tǒng)提供的顯示格式很多,一般較常用的有以下4種:(1)Summary:為默認(rèn)顯示格式。顯示的信息包括文獻(xiàn)的標(biāo)題、著者、出處、PMID、綜述出版類型、非英文文獻(xiàn)的原文語種等。(2)Abstract:顯示信息除了文獻(xiàn)標(biāo)題、著者、出處等基本信息外,還包括摘要信息,以便用戶了解文獻(xiàn)詳細(xì)內(nèi)容。現(xiàn)在是43頁\一共有61頁\編輯于星期一(3)MEDLINE:以MEDLINE數(shù)據(jù)庫的記錄格式來顯示檢索結(jié)果。字段內(nèi)容主要包括PMID、題目、摘要、作者、作者地址、語種、出版類型、出處、MeSH、文獻(xiàn)ID、出版狀態(tài)等。6.1結(jié)果的顯示現(xiàn)在是44頁\一共有61頁\編輯于星期一6.1結(jié)果的顯示現(xiàn)在是45頁\一共有61頁\編輯于星期一6.1結(jié)果的顯示現(xiàn)在是46頁\一共有61頁\編輯于星期一保存記錄在“sendto”下拉菜單中選擇“File”,可完成將記錄保存為文件。選擇“E-mail”,則可將結(jié)果發(fā)送至郵箱。在檢索結(jié)果顯示頁面可將某一次檢索的全部記錄或標(biāo)記記錄保存;而“Clipboard”頁面可用于保存一次或多次檢索的結(jié)果記錄。6.2檢索結(jié)果的保存

現(xiàn)在是47頁\一共有61頁\編輯于星期一6.2檢索結(jié)果的保存

現(xiàn)在是48頁\一共有61頁\編輯于星期一6.2檢索結(jié)果的保存

現(xiàn)在是49頁\一共有61頁\編輯于星期一6.2檢索結(jié)果的保存

現(xiàn)在是50頁\一共有61頁\編輯于星期一7其他輔助功能7.1檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用7.2全文鏈接7.3相關(guān)文獻(xiàn)鏈接現(xiàn)在是51頁\一共有61頁\編輯于星期一7.1檢索策略的存儲(chǔ)和調(diào)用使用MyNCBI(Cubby)首先要登記注冊保存檢索策略(savesearch)定期瀏覽新的檢索結(jié)果(注冊時(shí)設(shè)置,自動(dòng)按照檢索式定期重新檢索出文章)現(xiàn)在是52頁\一共有61頁\編輯于

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