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文檔簡介
第dna氫鍵形成的條件DNA中氫鍵的形成原因:
氫鍵:
氫原子與電負性大的原子某以共價鍵結(jié)合,若與電負性大.半徑小的原子Y(OFN等)接近,在某與Y之間以氫為媒介,生成某-H…Y形式的一種特殊的分子間或分子內(nèi)相互作用,稱為氫鍵。[某與Y可以是同一種類分子,如水分子之間的氫鍵;也可以是不同種類分子,如一水合氨分子(NH3·H2O)之間的氫鍵]
在蛋白質(zhì)的a-螺旋的情況下是N-H…O型的氫鍵,DNA的雙螺旋情況下是N-H…O,N-H…N型的氫鍵,因為這樣的氫鍵很多,因此這些結(jié)構(gòu)是穩(wěn)定的。此外,水和其他溶媒是異質(zhì)的,也由于在水分子間生成O-H—…O型氫鍵。
因此,這也就成為疏水結(jié)合形成的原因。
(1)存在與電負性很大的原子A形成強極性鍵的氫原子。
(2)存在較小半徑、較大電負性、含孤對電子[1]、帶有部分負電荷的原子B(F、O、N)
氫鍵的本質(zhì):強極性鍵(A-H)上的氫核與電負性很大的、含孤電子對并帶有部分負電荷的原子B之間的靜電作用力。
(3)表示氫鍵結(jié)合的通式
氫鍵結(jié)合的情況如果寫成通式,可用某-H…Y①表示。式中某和Y代表F,O,N等電負性大而原子半徑較小的非金屬原子。
某和Y可以是兩種相同的元素,也可以是兩種不同的元素。
(4)對氫鍵的理解
氫鍵存在雖然很普遍,對它的研究也在逐步深入,但是人們對氫鍵的定義至今仍有兩種不同的理解。
第一種把某-H…Y整個結(jié)構(gòu)叫氫鍵,因此氫鍵的鍵長就是指某與Y之間的距離,例如F-H…F的鍵長為255pm。
第二種把H…Y叫做氫鍵,這樣H…F之間的距離163pm才算是氫鍵的鍵長。這種差別,我們在選用氫鍵鍵長數(shù)據(jù)時要加以注意。
不過,對氫鍵鍵能的理解上是一致的,都是指把某-H…Y-H分解成為H某和HY所需的能量。
(5)氫鍵的飽和性和方向性
氫鍵不同于范德華力,它具有飽和性和方向性。由于氫原子特別小而原子A和B比較大,所以A—H中的氫原子只能和一個B原子結(jié)合形成氫鍵。同時由于負離子之間的相互排斥,另一個電負性大的原子B′就難于再接近氫原子,這就是氫鍵的飽和性。
氫鍵具有方向性則是由于電偶極矩A—H與原子B的相互作用,只有當A—H…B在同一條直線上時最強,同時原子B一般含有未共用電子對,在可能范圍內(nèi)氫鍵的方向和未共用電子對的對稱軸一致,這樣可使原子B中負電荷分布最多的部分最接近氫原子,這樣形成的氫鍵最穩(wěn)定。
DNA分子內(nèi)氫鍵是復制時自動形成的,不需要酶
dna聚合酶:DNA復制時合成3,5磷酸二酯鍵所需要的酶,同時基因工程中反轉(zhuǎn)錄法合成目的基因時也要用
DNA解旋酶:復制時解開氫鍵所需的酶
dna連接酶:基因工程導入目的基因“縫合”DNA黏性末端所需要的酶
RNA聚合酶:在DNA轉(zhuǎn)錄中,催化DNA轉(zhuǎn)錄為RNA的酶。
關(guān)于DNA份子中氫鍵的問題:
一、G和C三個氫鍵,A和T二個氫鍵的結(jié)構(gòu)情況
二、氫鍵簡介
氫鍵是分子間作用力的一種,是一種永久偶極之間的作用力,氫鍵發(fā)生在已經(jīng)以共價鍵與其它原子鍵合的氫原子與另一個原子之間(某-H…Y),通常發(fā)生氫鍵作用的氫原子兩邊的原子(某、Y)都是電負性較強的原子。
氫鍵既可以是分子間氫鍵,也可以是分子內(nèi)的(DNA中的氫鍵是堿基對之間,可以認為是分子間的)。其鍵能最大約為200kJ/mol,一般為5-30kJ/mol,比一般的共價鍵、離子鍵和金屬鍵鍵能要小,但強于靜電引力。
三、氫鍵不是化學鍵
化學鍵存在于分子內(nèi),是將原子結(jié)合成分子的力;分子間作用力存在于分子間,是保持物質(zhì)聚集狀態(tài)的力,它們本質(zhì)上都是靜電引力,但大小相差好幾個數(shù)量級。
氫鍵既存在于分子內(nèi)又存在于分子間(高中不要求分子內(nèi)的情況),但無論是哪種情況,它都不是形成分子的必要條件,因為破壞氫鍵只改變聚集狀態(tài)而不使分子本身發(fā)生變化,而且它只存在于少數(shù)分子之間,大小又與其他分子間作用力相近,表示時也只用虛線,表示它和化學鍵不是一個級別,因此它是分子間作用力。
四、DNA分子中氫鍵的特性
DNA穩(wěn)定因素主要是堿基之間的氫鍵和堿基對平面之間的堆積力。
DNA分子中雙螺旋分子中局部雙螺旋可因加熱或化學試劑如尿素、甲酰胺等作用,使配對堿基間氫鍵斷裂,有序的雙螺旋解離成無序的單鏈的過程稱核糖變性,紫外吸收值達最大增加值一半時的溫度稱核酸的變性溫度(Tm表示)
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