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文檔簡介
酶工程酶的別構(gòu)效應(yīng)演示文稿目前一頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)優(yōu)選酶工程酶的別構(gòu)效應(yīng)目前二頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)酶的別構(gòu)效應(yīng)本章中將討論一些不符合米氏方程的酶動力學(xué),即非雙曲線動力學(xué)。有些影響酶活性的效應(yīng)劑(包括激活劑和抑制劑)作用于酶活性部位以外的部位,通過酶分子構(gòu)象的改變來調(diào)節(jié)酶的活性。這種效應(yīng)叫做別構(gòu)效應(yīng)(allostericeffects),這種效應(yīng)劑叫做別構(gòu)效應(yīng)劑,受別構(gòu)效應(yīng)劑影響的酶叫別構(gòu)酶(allostericenzyme)。
目前三頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)一、別構(gòu)酶與代謝調(diào)節(jié)生物體內(nèi)的物質(zhì)代謝都是在酶的直接作用下進(jìn)行的,要使物質(zhì)代謝協(xié)調(diào)有序地進(jìn)行,酶活性必須根據(jù)情況適時(shí)地改變。利用別構(gòu)效應(yīng)調(diào)節(jié)酶活性是各種酶活性調(diào)節(jié)方式中最迅速的一種,大多數(shù)代謝物的反饋抑制就屬于別構(gòu)調(diào)節(jié),也有一些代謝物可對代謝途徑中的酶起別構(gòu)激活作用。
目前四頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)1.別構(gòu)抑制作用反饋抑制可分為五種類型:①線性通路中的反饋抑制一條途徑的最終產(chǎn)物抑制途徑中起始酶的活性。E1目前五頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)別構(gòu)抑制作用②趨同通路中的反饋抑制
為了有效地合成D,要求B和C的濃度大致相等。當(dāng)C濃度大時(shí),對產(chǎn)生B的途徑的最初的酶有激活作用;當(dāng)B濃度大時(shí),對產(chǎn)生B的途徑的最初的酶有抑制作用。目前六頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)別構(gòu)抑制作用③
趨散通路中的反饋抑制
EC和ED為兩種同工酶,分別受C和D的反饋抑制。當(dāng)C太多時(shí),不僅抑制從B到C的第一個(gè)酶,而且抑制從A到B的第一個(gè)反應(yīng)兩種同工酶中的一種,使得B合成的速率下降。B的合成不能完全停止,因?yàn)楹铣蒁還需要B。當(dāng)D太多時(shí)情況相似。
目前七頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)別構(gòu)抑制作用④
順序反饋抑制
一條途徑中有多個(gè)反饋抑制步驟。
⑤
協(xié)調(diào)反饋抑制
需要多種代謝物共同作用才能發(fā)揮反饋抑制作用。
目前八頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)2.別構(gòu)激活作用當(dāng)一種代謝物積累后,激活某些酶,從而加強(qiáng)別的代謝途徑。如有氧呼吸旺盛時(shí),ATP大量合成,AMP和ADP減少,由于AMP和ADP是異檸檬酸脫氫酶的激活劑,因此異檸檬酸和檸檬酸濃度增高,檸檬酸能激活乙酰CoA羧化酶和己糖激酶,同時(shí)抑制PFK(磷酸果糖激酶)。激活乙酰CoA羧化酶可增強(qiáng)脂肪酸的合成,激活己糖激酶且抑制PFK,可使G-6-P更多地進(jìn)入磷酸戊糖途徑,合成更多的NADPH,供脂肪酸合成使用。
目前九頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)二、別構(gòu)酶的基本概念1.一個(gè)典型的別構(gòu)酶——天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶(aspartatetrans-carbamoylase,ATC)是嘧啶核苷酸生物合成途徑的第一個(gè)酶(→
→
→
UTP→CTP)。目前十頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶
ATC的活性受到CTP的強(qiáng)烈抑制,又受到ATP的高效激活。效應(yīng)劑
抑制%嘧啶族
胞嘧啶0胞嘧啶核苷24胞苷一磷酸(CMP)38胞苷二磷酸(CDP)68胞苷三磷酸(CTP)86尿苷三磷酸(UTP)8嘌呤族
鳥苷三磷酸(GTP)35腺苷三磷酸(ATP)-180(激活)目前十一頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶在對照、加ATP、加CTP三種情況的V對[S]圖中可以看出,對照呈S形曲線而不是雙曲線;加ATP減小了反應(yīng)的表觀Km值,使曲線向雙曲線靠近;加CTP增大了反應(yīng)的表觀Km值,使曲線的S形更加明顯。加ATP和CTP并不影響Vm。
目前十二頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)天冬氨酸轉(zhuǎn)氨甲酰酶目前十三頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)ATC的結(jié)構(gòu)與功能為了解釋這種現(xiàn)象,研究者設(shè)想在酶分子中有兩個(gè)分開的部位,一個(gè)部位與底物結(jié)合并催化反應(yīng),另一個(gè)部位是ATP或CTP等效應(yīng)劑的結(jié)合位點(diǎn)。利用選擇性修飾法修飾后一個(gè)部位后,ATC的活性并不喪失,但對CTP抑制的敏感性下降,這種現(xiàn)象稱為脫敏作用。選擇性修飾實(shí)驗(yàn)證實(shí)了兩個(gè)部位的設(shè)想?,F(xiàn)在我們知道,ATC由12條多肽鏈組成,2個(gè)α3亞基,3個(gè)β2亞基。
目前十四頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)ATCase的亞基結(jié)合方式rrcc目前十五頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)ATC的特點(diǎn)
根據(jù)對ATC的研究,得出了5點(diǎn)結(jié)論:①酶分子上有兩個(gè)結(jié)合部位,結(jié)合底物并催化反應(yīng)的部位叫活性部位,結(jié)合效應(yīng)劑的部位叫別構(gòu)部位或調(diào)節(jié)部位。②這兩個(gè)部位能同時(shí)分別被底物和效應(yīng)劑占據(jù)。③調(diào)節(jié)部位可與多種效應(yīng)劑結(jié)合,并產(chǎn)生不同的效應(yīng)。④效應(yīng)劑的結(jié)合影響酶分子的構(gòu)象,從而影響酶與底物的結(jié)合能力和催化能力。⑤
調(diào)節(jié)部位的效應(yīng)是構(gòu)成別構(gòu)抑制或別構(gòu)激活的基礎(chǔ),而后兩者又是代謝調(diào)節(jié)的有效方式之一。
目前十六頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)2.別構(gòu)酶的協(xié)同效應(yīng)協(xié)同效應(yīng)(cooperativeeffects)也是多亞基別構(gòu)酶的一個(gè)特征。能與酶結(jié)合的底物、激活劑和抑制劑統(tǒng)稱配體,所謂協(xié)同效應(yīng)是指當(dāng)一個(gè)配體與酶結(jié)合以后,可以促進(jìn)或抑制另一個(gè)配體與酶結(jié)合。
目前十七頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)(1)協(xié)同效應(yīng)的分類①
同種效應(yīng)和異種效應(yīng)
同種效應(yīng)(homotropiceffects)指的是一分子配體與酶結(jié)合后影響另一分子同種配體與酶的結(jié)合;異種效應(yīng)(heterotropiceffects)指的是一分子配體與酶結(jié)合后影響另一分子異種配體與酶的結(jié)合。
目前十八頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)協(xié)同效應(yīng)的分類②正協(xié)同和負(fù)協(xié)同
一分子配體與酶結(jié)合后促進(jìn)另一分子配體與酶結(jié)合叫正協(xié)同(positivecooperation),抑制另一分子配體與酶結(jié)合叫負(fù)協(xié)同(negativecooperation)。同種效應(yīng)一般是正協(xié)同;異種效應(yīng)有正協(xié)同,也有負(fù)協(xié)同。
目前十九頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)(2)協(xié)同效應(yīng)的鑒別方法通過動力學(xué)作圖,可以鑒別底物之間的正協(xié)同、負(fù)協(xié)同和無協(xié)同。
目前二十頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)動力學(xué)作圖法鑒別協(xié)同效應(yīng)目前二十一頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)(3)協(xié)同指數(shù)和協(xié)同系數(shù)
協(xié)同指數(shù)(cooperativeindex,CI)是指酶的底物結(jié)合位點(diǎn)被底物飽和90%和飽和10%(即V=0.9Vm和V=0.1Vm)時(shí)的底物濃度之比,故協(xié)同指數(shù)又稱飽和比值(Ratiosaturation,Rs)。目前二十二頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)
對于一個(gè)可結(jié)合n個(gè)底物分子的酶,其反應(yīng)式可用下式表示:按米氏方程的推導(dǎo)過程可得式中這里假設(shè)n個(gè)底物是同時(shí)結(jié)合上去和同時(shí)解離下來的。
協(xié)同系數(shù)…………①return目前二十三頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)協(xié)同系數(shù)當(dāng)V=0.9Vm
時(shí),[S]0.9=
;當(dāng)V=0.1Vm時(shí),[S]0.1=
。
CI=Rs==目前二十四頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)協(xié)同系數(shù)n的意義因此,當(dāng)n=1時(shí),CI=81,和以前講過的單底物單產(chǎn)物反應(yīng)的米氏方程相同,無協(xié)同效應(yīng)。當(dāng)n>1時(shí),CI<81,為正協(xié)同,表示V對[S]改變的靈敏度增加,且n越大正協(xié)同效應(yīng)越大;當(dāng)n<1時(shí),CI>81,為負(fù)協(xié)同,表示V對[S]改變的靈敏度減小,且n越小負(fù)協(xié)同效應(yīng)越大。n值即為協(xié)同系數(shù)。
CI=Rs==目前二十五頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)n值的理論錯(cuò)誤從理論上推導(dǎo)上式時(shí),n是與酶結(jié)合的底物分子數(shù),但實(shí)際上測出的n值(測定方法見后)有小于1的情況。上面說的n
>1、n=1、n<1指的是實(shí)際測定值,這是因?yàn)橥茖?dǎo)上式時(shí)的前提就不正確,n個(gè)底物并不是同時(shí)結(jié)合上去和同時(shí)解離下來的。
目前二十六頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)別構(gòu)效應(yīng)劑對n值的影響別構(gòu)激活劑常可減少正協(xié)同效應(yīng)(底物和底物之間的正協(xié)同)的n值,使正協(xié)同效應(yīng)減弱,在V對[S]作圖中,可使S形曲線趨向雙曲線。相反,別構(gòu)抑制劑常可增加正協(xié)同效應(yīng)的n值,使正協(xié)同效應(yīng)增強(qiáng),使S形曲線彎曲更加明顯。
目前二十七頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)(4)半位反應(yīng)性兔肌和細(xì)菌的3-磷酸甘油醛脫氫酶由4個(gè)同種亞基組成,每個(gè)亞基上有1個(gè)NAD+結(jié)合位點(diǎn),但實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)該酶往往只能結(jié)合2個(gè)NAD+分子,這就是半位反應(yīng)性。半位反應(yīng)性實(shí)際上是一種極端的負(fù)協(xié)同效應(yīng),當(dāng)?shù)谝?、二個(gè)NAD+與酶結(jié)合后,第三個(gè)結(jié)合位點(diǎn)與NAD+的親和力已降得很低,實(shí)際上已不能與NAD+結(jié)合。
目前二十八頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)(5)協(xié)同效應(yīng)的生理意義異種協(xié)同效應(yīng)分為別構(gòu)激活(異種正協(xié)同)和別構(gòu)抑制(異種負(fù)協(xié)同)效應(yīng)。它們的意義就是通過效應(yīng)劑與酶結(jié)合來激活或抑制酶的活性,從而調(diào)節(jié)代謝速率。
異種協(xié)同效應(yīng)的生理意義目前二十九頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)協(xié)同效應(yīng)的生理意義正協(xié)同效應(yīng)提供了一個(gè)V對[S]的敏感區(qū)域,即S形曲線中的“陡段”,當(dāng)細(xì)胞內(nèi)底物濃度處于這個(gè)“陡段”時(shí),[S]的輕微變化可使V發(fā)生很大的變化,有穩(wěn)定[S]的作用。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)底物濃度處于低[S]的平緩段時(shí),[S]的變化不會使V有太大的變化,有穩(wěn)定V的作用。別構(gòu)激活劑和別構(gòu)抑制劑可使“陡段”左移和右移。底物引起的同種正協(xié)同效應(yīng)
目前三十頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)協(xié)同效應(yīng)的生理意義底物引起的同種負(fù)協(xié)同效應(yīng)在更大的[S]范圍里使V穩(wěn)定,如3-磷酸甘油醛脫氫酶在低NAD+濃度時(shí),能順利地進(jìn)行糖酵解,而當(dāng)其他反應(yīng)影響使NAD+濃度增加時(shí),即使大幅度地增加NAD+(100倍以內(nèi)),都可因其半位反應(yīng)性而不增加酶反應(yīng)速度。底物引起的同種負(fù)協(xié)同效應(yīng)
目前三十一頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)3.別構(gòu)酶的其他動力學(xué)術(shù)語①S0.5
前面①式中的KS’=[S]n時(shí),。由于別構(gòu)酶不符合米氏動力學(xué),我們將時(shí)的底物濃度稱為表觀
Km
或
S0.5
。
前面的①式目前三十二頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)別構(gòu)酶的其他動力學(xué)術(shù)語②
K型效應(yīng)劑和V型效應(yīng)劑
在別構(gòu)效應(yīng)劑中,只影響表觀Km(或者說S
0.
5)的效應(yīng)劑稱為K型效應(yīng)劑,它們與競爭性抑制劑的效應(yīng)相似;競爭性抑制劑只會使Km增大,而K型效應(yīng)劑根據(jù)其是激活還是抑制,分別使S
0.
5降低和升高。只影響Vm的效應(yīng)劑稱為V型效應(yīng)劑,它們與非競爭性抑制劑的效應(yīng)相似;非競爭性抑制劑只會使Vm下降,而V型效應(yīng)劑根據(jù)其是激活還是抑制,分別使Vm升高和降低。目前三十三頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)4.別構(gòu)酶的通性①由多個(gè)亞基組成,亞基可以是同種或異種。②有調(diào)節(jié)部位和催化部位。③可結(jié)合多個(gè)配體。④配體的結(jié)合有協(xié)同效應(yīng),一分子配體與酶結(jié)合后使酶的構(gòu)象改變,從而影響下一分子配體的結(jié)合。⑤根據(jù)CI值或n值可鑒別協(xié)同效應(yīng)的類型。⑥
其V對[S]的曲線不是雙曲線,而是S形曲線(正協(xié)同)或“表觀雙曲線”(負(fù)協(xié)同)。
目前三十四頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)三、別構(gòu)機(jī)制的模式1.Hill模式2.Adair模式3.MWC模式4.KNF模式目前三十五頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)1.Hill模式
Hill模式是Hill在1909年提出來的,當(dāng)時(shí)是試圖解釋O2與血紅蛋白結(jié)合的S形曲線的,后來用于別構(gòu)酶反應(yīng)中。以下是求Hill系數(shù)n值(協(xié)同系數(shù))的方法:
式中
…………③設(shè)酶被底物飽和的分?jǐn)?shù)為,則
…②目前三十六頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)求n值的方法由②得
…④將④代入③得
…②…………③目前三十七頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)求n值的方法,,…⑤∵
,代入⑤式得
目前三十八頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)求n值的方法以對作圖,可得一直線,其斜率為n,縱軸截距為,橫軸截距為lgS
0.
5
。目前三十九頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)求n值的方法當(dāng)[S]過高或者過低時(shí)([S]>[S]0.9或[S]<[S]0.1),n常等于1,故在一個(gè)廣泛的[S]范圍內(nèi)作圖時(shí),得到的是折線。目前四十頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)n值與底物結(jié)合位點(diǎn)數(shù)的關(guān)系
Hill模式忽略了ES,ES2,…ESn-1等形式的存在,由于協(xié)同效應(yīng)和前述忽略不飽和結(jié)合形式的影響,根據(jù)Hill作圖計(jì)算出來的n值往往小于酶對底物的結(jié)合位點(diǎn)數(shù),Hb(hemoglobin,血紅蛋白)上有4個(gè)O2結(jié)合位點(diǎn),但計(jì)算的結(jié)果是n=2.6~2.8。在負(fù)協(xié)同效應(yīng)中,每分子酶也結(jié)合n個(gè)底物,但計(jì)算的結(jié)果卻是n
<1。所以Hill系數(shù)只能作為鑒別協(xié)同性的指標(biāo)。
目前四十一頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)2.Adair模式
Adair模式允許有穩(wěn)定的未被底物飽和的ESx復(fù)合物存在。對于一個(gè)有4個(gè)底物結(jié)合位點(diǎn)的酶,有
其中K1、K2、K3、K4實(shí)際上是微觀或內(nèi)在解離常數(shù)(microscopicorintrinsicdissociationconstants),如果4分子底物是分別結(jié)合在四聚體酶的4個(gè)亞基上,則4個(gè)表觀解離常數(shù)(apparentdissociationconstants)為:
目前四十二頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)微觀解離常數(shù)與表觀解離常數(shù)的關(guān)系取上面第二式證明如下:
目前四十三頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)Adair模式的速度方程………⑥目前四十四頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)將5種酶存在形式的濃度表達(dá)式代入⑥式得
分子分母同乘以得
………⑦目前四十五頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)如果酶分子中4個(gè)底物結(jié)合位點(diǎn)是相同的,并且它們之間沒有相互作用,無協(xié)同性,則內(nèi)在解離常數(shù)K1=K2=K3=K4,可用Ks統(tǒng)一表示它們,因此
將這4個(gè)表達(dá)式代入⑦式得
分子分母同除以得
目前四十六頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)分子分母同除以得
目前四十七頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)∵
,
∴,與米氏方程相同。如果每一底物結(jié)合位點(diǎn)的內(nèi)在解離常數(shù)不同時(shí),就會出現(xiàn)協(xié)同性。K1>K2>K3>K4是正協(xié)同性,K1<K2<K3<K4是負(fù)協(xié)同性。
目前四十八頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)∵
,∴
時(shí)
,即
余相似,,
在這些條件下就會導(dǎo)致正協(xié)同性。同理可得出負(fù)協(xié)同性的關(guān)系式。
Adair模式正負(fù)協(xié)同性的判斷目前四十九頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)3.MWC模式
1965年,Monod,Wyman和Changeux提出了一個(gè)根據(jù)酶的構(gòu)象變化來說明協(xié)同效應(yīng)的分子模式,MWC模式即以他們3人的姓縮寫命名。根據(jù)此模式的特點(diǎn),又稱為齊變模式(concertedmodel)。此模式規(guī)定了以下幾點(diǎn):①
別構(gòu)酶是寡聚酶,由同種亞基組成,這些亞基稱為原體(protomer),它們在寡聚體中占有均等的地位。②一個(gè)原體對一種配體只有一個(gè)結(jié)合位點(diǎn)。
目前五十頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)MWC模式的規(guī)定③原體有兩種構(gòu)象狀態(tài),分別為R型(relaxed,松弛態(tài))和T型(tensed,緊張態(tài)),這兩種狀態(tài)在與底物的親和力、對別構(gòu)效應(yīng)劑的反應(yīng)、催化活力方面可以不同,同一種狀態(tài)的原體在這些方面是相同的。④在一個(gè)寡聚體中,所有的原體均處于同一種構(gòu)象。各原體構(gòu)象的轉(zhuǎn)變是同步的,在一個(gè)寡聚體中,不存在R型和T型的雜合體。⑤
R型和T型之間有一個(gè)轉(zhuǎn)換平衡。
目前五十一頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)(1)底物同種協(xié)同效應(yīng)(以4聚體為例)目前五十二頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)MWC模式的速度方程(推導(dǎo)略)式中n等于一個(gè)寡聚體中的原體數(shù),在上例中n=4。
設(shè),,則。
目前五十三頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)討論①
當(dāng)L無窮小時(shí),體系中只有R型,。②當(dāng)L無窮大時(shí),體系中只有T型,。③當(dāng)時(shí),(兩種內(nèi)在解離常數(shù)相等),目前五十四頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)討論④
因?yàn)镽型對底物的親和力恒大于T型,所以值不可能大于1,C可在0~1之間取值。當(dāng)C
=
1時(shí)無協(xié)同效應(yīng);當(dāng)C=0時(shí)正協(xié)同效應(yīng)最大。C越小正協(xié)同效應(yīng)越大。⑤L越大正協(xié)同效應(yīng)越大。
目前五十五頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)MWC模式的Ys對α作圖(不同C值)目前五十六頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)MWC模式的Ys對α作圖(不同L值)目前五十七頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)某些別構(gòu)酶(別構(gòu)蛋白)的別構(gòu)常數(shù)別構(gòu)蛋白配體結(jié)合位點(diǎn)數(shù)Hill系數(shù)LC血紅蛋白O242.83×1050.01酵母丙酮酸激酶磷酸烯醇式丙酮酸42.89×1030.01酵母3-P-甘油醛脫氫酶NAD+42.3600.04目前五十八頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)(2)MWC模式的異種協(xié)同效應(yīng)假設(shè)底物優(yōu)先與R型結(jié)合,別構(gòu)激活劑A也優(yōu)先與R型結(jié)合,則A的存在可使R和T之間的平衡偏向R型,即L值降低,提供更多的R型供底物結(jié)合用,使Ys上升,表現(xiàn)出激活效應(yīng),同時(shí)底物正協(xié)同效應(yīng)減弱。如果A與R型的結(jié)合不改變R型的催化效應(yīng),也不改變KR,則A為K型激活劑。
目前五十九頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)MWC模式的異種協(xié)同效應(yīng)
相反,K型抑制劑I優(yōu)先與T型結(jié)合,使L值上升,T型增加,Ys降低,表現(xiàn)出抑制作用,同時(shí)底物正協(xié)同效應(yīng)增強(qiáng)。
如果KR=KT,但R型有較高的催化效率,則與R型結(jié)合的A成為V型激活劑,與T型結(jié)合的I成為V型抑制劑。
MWC模式?jīng)]有能夠解釋負(fù)協(xié)同效應(yīng)。目前六十頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)4.KNF模式
1966年,Koshland,Nemethy和Filmer對Adair模式進(jìn)行了擴(kuò)展,提出了KNF模式,根據(jù)此模式的特點(diǎn),又被稱為序變模式(sequentialmodel)。其要點(diǎn)如下:①在底物或效應(yīng)劑不存在時(shí),酶的各個(gè)原體以同一種構(gòu)象存在。
目前六十一頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)KNF模式的要點(diǎn)②
當(dāng)?shù)孜锱c一個(gè)原體結(jié)合后,可引起此原體構(gòu)象的變化,同時(shí)使鄰近的原體改變對底物的親和力;第二分子底物與第二個(gè)原體結(jié)合后,使第二個(gè)原體構(gòu)象發(fā)生改變,同時(shí)又影響了剩余原體對底物的親和力。
K1>K2>K3>K4(內(nèi)在解離常數(shù))為正協(xié)同效應(yīng),K1<K2<K3<K4為負(fù)協(xié)同效應(yīng)。
目前六十二頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)四、引起非雙曲線動力學(xué)的其他現(xiàn)象1.酶的記憶現(xiàn)象
有些單體酶能表現(xiàn)出S形曲線,這也是因?yàn)閯e構(gòu)效應(yīng)引起的。1967年Rabin提出酶——底物復(fù)合物能進(jìn)行異構(gòu)作用的機(jī)制來解釋S形曲線。
ES必須先緩慢地異構(gòu)成FS,然后快速地分解(breakdown)成F和P,F(xiàn)能夠回復(fù)到E,也可以直接與S結(jié)合形成FS。
return目前六十三頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)酶的記憶現(xiàn)象引起S形曲線的機(jī)理在低濃度S時(shí),酶主要以E和ES形式存在,產(chǎn)物形成速度被緩慢的異構(gòu)化作用所限制。由于[S]低,F(xiàn)有較多的比例回復(fù)到了E,只有少量的F直接與S結(jié)合成FS。當(dāng)[S]高時(shí),有較多的F直接與S結(jié)合成FS,由于直接生成FS,避免了這個(gè)限速步驟,所以大幅度地加快了反應(yīng)速度,從而表現(xiàn)出S形曲線。
反應(yīng)式目前六十四頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)別構(gòu)效應(yīng)劑對記憶酶的影響別構(gòu)激活劑與E結(jié)合后可以提高異構(gòu)化速率,別構(gòu)抑制劑則降低異構(gòu)化速率。別構(gòu)效應(yīng)劑通過影響k4及k1’也會影響S形曲線的形狀。
目前六十五頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)記憶酶舉例
FS釋放出產(chǎn)物后仍保持F構(gòu)象可以認(rèn)為是一種“記憶”現(xiàn)象。有記憶現(xiàn)象的酶稱為記憶酶。記憶酶有單底物單產(chǎn)物的,也有雙底物雙產(chǎn)物的。動物肝臟中的葡萄糖激酶和大麥胚中的己糖激酶都是典型的記憶酶。
目前六十六頁\總數(shù)七十一頁\編于六點(diǎn)2.可引起正協(xié)同
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