高性能集群作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)

高性能集群作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)曙光信息產(chǎn)業(yè)股份有限公司

提綱作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)概述PBS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)Maui調(diào)度器曙光Gridview作業(yè)調(diào)度中間件Q&A1.1集群使用中存在的問題節(jié)點(diǎn)多用戶多任務(wù)多系統(tǒng)資源整合異構(gòu)資源，軟硬件資源的整合任務(wù)綜合管理用戶提交的任務(wù)的統(tǒng)一安排用戶權(quán)限的管理對(duì)用戶進(jìn)行各類權(quán)限控制1.2作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的功能資源管理器： 管理集群的軟硬件資源及認(rèn)證信息等隊(duì)列管理器： 管理當(dāng)前所有已提交但還未完成的作業(yè)調(diào)度器： 為作業(yè)分配資源1.3

作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的組成作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)1.3

作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的組成1.4作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)的發(fā)展歷史

提綱作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)概述PBS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)Maui調(diào)度器曙光Gridview作業(yè)調(diào)度中間件Q&A

PBS（PortableBatchSystem）,最初由NASA的Ames研究中心開發(fā)，設(shè)計(jì)為一個(gè)能滿足異構(gòu)計(jì)算網(wǎng)絡(luò)需要的軟件包。它力求提供對(duì)批處理的初始化和調(diào)度執(zhí)行的控制，允許作業(yè)在不同主機(jī)間的路由。

PBS的開源版本為OpenPBS，目前已經(jīng)停止開發(fā)。PBS的商業(yè)版為PBSPro，由Altair公司開發(fā)和維護(hù)。TORQUE(Tera-scaleOpen-sourceResourceandQueuemanager）為OpenPBS的后續(xù)開源版本，修正了OpenPBS的很多bug，功能和可擴(kuò)展性都有很大提高。2.1

PBS作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)服務(wù)器:pbs_server調(diào)度器:pbs_sched執(zhí)行器:pbs_mom2.2PBS的組成解壓源文件包

tarzxvftorque-2.5.12.tar.gz編譯設(shè)置

cdtorque-2.5.12./configure--prefix=/usr/local\

--with-server-home=/var/spool/torque\

--enable-syslog\

--with-scp\

--enable-docs

默認(rèn)情況下，TORQUE將可執(zhí)行文件安裝在/usr/local/bin和/usr/local/sbin下。其余的配置文件和運(yùn)行時(shí)環(huán)境將安裝在/var/spool/torque下編譯和安裝

make makeinstall2.3

PBS的安裝（TorqueServer端）節(jié)點(diǎn)操作系統(tǒng)相同，可以用如下SHELL腳本在計(jì)算節(jié)點(diǎn)（torque客戶端）上安裝#在管理節(jié)點(diǎn)上makepackages#!/bin/bashforiin`seq120`;doecho=====node$i=====

ssh

node$i/public/sourcecode/torque-2.5.12/\torque-package-mom-linux-*.sh--installDone2.3PBS的安裝（TorqueClient端）以root作為torque的管理員賬號(hào)創(chuàng)建作業(yè)隊(duì)列 在torque的安裝源文件根目錄中，執(zhí)行

./torque.setuprootServer配置目錄/var/spool/torque/server_priv/計(jì)算節(jié)點(diǎn)列表及屬性：/var/spool/torque/server_priv/nodes node2np=12amdchem node3np=12amdchem node4np=8intelchem node5np=8intelchem node6np=4intelbiogpu node7np=4intelbiogpu2.3PBS

Server配置Server的系統(tǒng)啟動(dòng)腳本/etc/init.d/pbs_serverScheduler系統(tǒng)啟動(dòng)腳本/etc/init.d/pbs_schedMom系統(tǒng)啟動(dòng)腳本/etc/init.d/pbs_momTorque服務(wù)端chkconfigpbs_serveronchkconfigpbs_schedonservicepbs_serverstartservicepbs_schedstartTorque客戶端chkconfigpbs_momonservicepbs_momstart2.3

PBS系統(tǒng)服務(wù)2.4

PBS主要操作隊(duì)列設(shè)置節(jié)點(diǎn)查看提交作業(yè)查看作業(yè)作業(yè)其他操作PB矮S要能購(gòu)正常煉運(yùn)行昂還需戰(zhàn)要通錫過qm怪gr命令釣在se古rv糞er進(jìn)行盞配置沿，設(shè)壁置一戀些屬衣性。罩輸入qm智gr命令賣進(jìn)入蒼配置擋交互命令己，格盡式為qm鴉gr動(dòng)作對(duì)象揀類型肉和操假作符動(dòng)作對(duì)象類型對(duì)象名屬性操作符值（，屬性操作符值）……create創(chuàng)建一個(gè)對(duì)象delete刪除一個(gè)對(duì)象set設(shè)置對(duì)象的屬性u(píng)nset除去對(duì)象的屬性print打印對(duì)象的屬性list列出對(duì)象的屬性server服務(wù)器＝queue隊(duì)列＋＝node節(jié)點(diǎn)－＝2.蛛4.莖1PB光S的隊(duì)養(yǎng)列設(shè)省置創(chuàng)建隊(duì)列createqueue隊(duì)列名queue_type=execution打開和啟動(dòng)隊(duì)列setqueue隊(duì)列名enable=t,started=t打開調(diào)度setserverscheduling=t設(shè)置默認(rèn)隊(duì)列setserverdefault_queue=隊(duì)列名2.淘4.辟1PB掌S的隊(duì)策列設(shè)至置下面敵是讓PB伍S可以炭正?；\(yùn)行擇的基導(dǎo)本設(shè)通置導(dǎo)入se脈rv瘦er配置拾文件qm壁gr枯<身q撫ue喝ue鑰.c輸on浙f備份切配置泥文件qm壯gr火-劇c樸“p傭ri逐nt令s膨er漠ve桂r”閣>熄q限ue建ue焰.c踢on拔f配置施文件值例子

createqueuedefaultsetqueuedefaultqueue_type=executionsetqueuedefaultmax_running=10setqueuedefaultenabled=Truesetqueuedefaultstarted=Truesetserverscheduling=Truesetserverdefault_queue=defaultsetserverquery_other_jobs=True2.乞4.翁1PB淡S的隊(duì)愧列設(shè)功置資源砍和用嗚戶限教制resources_default.cput該隊(duì)列默認(rèn)的作業(yè)的CPU時(shí)間，格式：時(shí):分:秒注意：該CPU時(shí)間為：進(jìn)程數(shù)*（結(jié)束時(shí)間-開始時(shí)間）resources_default.walltime該隊(duì)列默認(rèn)的墻上時(shí)間，格式：時(shí):分:秒max_running某隊(duì)列最多可運(yùn)行的作業(yè)數(shù)，如果該項(xiàng)為0或沒有該項(xiàng)，表示沒有限制max_user_run一個(gè)用戶最多可以運(yùn)行的作業(yè)數(shù)acl_user_enable是否啟用用戶訪問控制，如果acl_user_enable=True，則在acl_users中列出的用戶才能使用該隊(duì)列acl_users格式：<用戶名@主機(jī)名>，用戶名不接受通配符acl_host_enable如果acl_host_enable=True，則acl_hosts屬性中列出的主機(jī)才能使用該隊(duì)列acl_hosts該隊(duì)列可以使用的節(jié)點(diǎn)列表2.族4.農(nóng)1PB考S的隊(duì)聾列設(shè)頭置[dawning@node1~]$pbsnodes-anode2

state=free

np=12

ntype=clusterstatus=rectime=1347344839,varattr=,jobs=,state=free,netload=1994804223313,gres=,loadave=0.15,ncpus=32,physmem=132133404kb,availmem=147084788kb,totmem=148910612kb,idletime=1721946,nusers=1,nsessions=1,sessions=2455,uname=Linuxnode22.6.32-220.el6.x86_64#1SMPWedNov908:03:13EST2011x86_64,opsys=linux

gpus=0node3state=down

np=12

ntype=cluster…2.糞4.陳2PB膝S查看獵節(jié)點(diǎn)宋狀態(tài)pb居sn傭od摸es命令辱的主知要參矮數(shù)-a列出仍所有止結(jié)點(diǎn)鼠及其贈(zèng)屬性睜，屬暈性包逝括“st討at出e”和“st款at誘us煙”-o將指些定結(jié)膠點(diǎn)的版狀態(tài)踏標(biāo)記敲為“of柄fl枯in寒e”。這撤將幫淘助管戴理員夾暫時(shí)論停止剛某些概結(jié)點(diǎn)梨的服柔務(wù)-l以行末的方雪式列穗出被夢(mèng)標(biāo)記冬的結(jié)單點(diǎn)的違狀態(tài)晌，如-l灣f貿(mào)re碼e，-l歐o麗ff縣li字ne-c清除蒼結(jié)點(diǎn)字列表瓶中的影“of匠fl碑in巧e”或“do夫wn默”狀態(tài)益設(shè)置順，使址結(jié)點(diǎn)鼓可以缸被分單配給開作業(yè)-r清除郵指定淘結(jié)點(diǎn)果的“of尺fl界in盯e”狀態(tài)2.宿4.氣2PB倉(cāng)S查看帶節(jié)點(diǎn)文狀態(tài)步驟你：準(zhǔn)備：編隔寫描萍述該作業(yè)籌的腳李本，口包括撤作業(yè)嘩名，芒需要壓的資稿源等耕。提交：使毯用qs達(dá)ub命令協(xié)將該脂作業(yè)兩提交福給PB儀S服務(wù)則器排隊(duì)：服啊務(wù)器歷將該扇任務(wù)攔排入驚適當(dāng)號(hào)的隊(duì)到列調(diào)度：服恰務(wù)器番檢查敲各工擦作節(jié)粘點(diǎn)的奇狀態(tài)邀是否展符合烤該作鵝業(yè)的澆要求丘，并孤進(jìn)行霉調(diào)度含。執(zhí)行：當(dāng)殃條件株滿足曲時(shí)，每作業(yè)朽被發(fā)辦給相移應(yīng)的溪執(zhí)行眾服務(wù)窩器執(zhí)距行。而程序蹤蝶運(yùn)行歷時(shí)執(zhí)氧行服呈務(wù)器蟻會(huì)收傾集程殲序的莊標(biāo)準(zhǔn)紅輸出藝和標(biāo)羞準(zhǔn)錯(cuò)愿誤流辣，等飽程序最結(jié)束士時(shí)，企將這畫些信猛息返宮回給壓用戶扶。查詢孩和調(diào)擇整：當(dāng)興作業(yè)躬在運(yùn)傻行時(shí)媽，用定戶可蔬以使圣用qs駐ta蝦t進(jìn)行戲狀態(tài)蟻查詢抵。用機(jī)戶發(fā)閣現(xiàn)作館業(yè)提前交錯(cuò)尼誤時(shí)漏，可璃以使懼用qd腐el刪除曉正在腦運(yùn)行賄的作疼業(yè)。查看香結(jié)果：使陵用文慕本編們輯軟條件vi或者月系統(tǒng)掛命令ca絡(luò)t,頁l碌es魚s等查亡看輸子出及茫錯(cuò)誤滔信息腎顯示訪。2.榆4.幸3PB急S作業(yè)獻(xiàn)提交在PB票S系統(tǒng)柔中，欣用戶齊使用qs拒ub命令路提交膀用戶窄程序妖。用鞋戶運(yùn)廚行程管序的場(chǎng)命令吸及PB風(fēng)S環(huán)境檢變量替設(shè)置接組成PB怒S作業(yè)腳本準(zhǔn)，如順下qsub<PBS作業(yè)腳本>2.蔽4.握3PB瘋S作業(yè)酸提交情基本乖命令#PBS-Nvasp#PBS-lnodes=2:ppn=1#PBS-lwalltime=12:00:00#PBS-qdefaultcd$PBS_O_WORKDIR./test.exe作業(yè)廈腳本把使用強(qiáng)如下燈格式津提交培到PB允S系統(tǒng)運(yùn)行運(yùn)行參數(shù)說明-a<作業(yè)開始運(yùn)行的時(shí)間>向PBS系統(tǒng)指定作業(yè)運(yùn)行的開始時(shí)間。作業(yè)運(yùn)行時(shí)間格式為：[[[[CC]YY]MM]DD]hhmm[.SS]-A<用戶名>使用不同的用戶來提交作業(yè)，缺省使用當(dāng)前用戶名-o<標(biāo)準(zhǔn)輸出文件的路徑>-e<標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出的路徑>該參數(shù)指定標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出的位置，缺省的情況下，PBS系統(tǒng)把標(biāo)準(zhǔn)輸出和標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出放在用戶qsub命令提交作業(yè)的目錄下。標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出：<作業(yè)名>.o<作業(yè)號(hào)>標(biāo)準(zhǔn)錯(cuò)誤輸出：<作業(yè)名>.e<作業(yè)號(hào)>路徑使用如下格式標(biāo)準(zhǔn)：[<節(jié)點(diǎn)名>:]<路徑名>-N<作業(yè)名>指定提交的作業(yè)名-q<目標(biāo)隊(duì)列>指定作業(yè)提交的目標(biāo)隊(duì)列。如果該參數(shù)沒有指定，命令qsub會(huì)把作業(yè)腳本提交到缺省的隊(duì)列中。-l<申請(qǐng)資源列表>該參數(shù)指定作業(yè)腳本申請(qǐng)的PBS系統(tǒng)資源列表。申請(qǐng)資源列表使用如下格式：

<資源名>[=[<數(shù)量>]][,資源名[=[<數(shù)量>]]，…..]例如作業(yè)希望申請(qǐng)?jiān)陔p路節(jié)點(diǎn)上申請(qǐng)4個(gè)CPU資源的情況，則可以在腳本中如下：#PBS–lnodes=2:ppn=2運(yùn)行惕參數(shù)賣在PB擱S腳本請(qǐng)和qs磚ub命令魚行中居均有屬效，qs著ub命令蒜行參凱數(shù)的俯優(yōu)先北級(jí)更陜高2.肝4.貧3PB校S運(yùn)行猛參數(shù)變量名說明登陸SHELL繼承來的變量包括$HOME，$LANG，$LOGNAME，$PATH，$MAIL，$SHELL和$TZ。$PBS_O_HOSTqsub提交的節(jié)點(diǎn)名稱$PBS_O_QUEUEqsub提交的作業(yè)的最初隊(duì)列名稱$PBS_O_WORKDIRqsub提交的作業(yè)的絕對(duì)路徑$PBS_JOBID作業(yè)被PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)號(hào)$PBS_JOBNAME用戶指定的作業(yè)名，可以在作業(yè)提交的時(shí)候用qsub–N<作業(yè)名>指定，或者在PBS腳本中加入#PBS–N<作業(yè)名>。$PBS_NODEFILEPBS系統(tǒng)指定的作業(yè)運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)名。該變量在并行機(jī)和機(jī)群中使用。當(dāng)在PBS腳本中用#PBS–lnodes=2:ppn=2指定程序運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)數(shù)時(shí)，可以使用$PBS_NODEFILE在腳本中引用PBS系統(tǒng)指定的作業(yè)運(yùn)行的節(jié)點(diǎn)名。比如：#PBS–lnodes=2:ppn=2mpirun–np4–machinefile$PBS_NODEFILE<程序名>$PBS_QUEUEPBS腳本在執(zhí)行時(shí)的隊(duì)列名2.根4.樣3PB偏S環(huán)境矩變量#這是一個(gè)串行作業(yè)腳本的例子#PBS-Ntest#PBS-lnodes=1:ppn=1cd$HOME/test/./a.out>$HOME/result/a.result#這是一個(gè)并行作業(yè)腳本的例子#PBS-Nvasp_job#PBS-lnodes=2:ppn=2#PBS-qlowechoThisjobis$PBS_JOBID@$PBS_QUEUEcd

$PBS_O_WORKDIRmpirun-np16-machinefile

$PBS_NODEFILE./vasp2.晌4.陽3PB閘S腳本嫁舉例#PBS-lnodes=2:ppn=4:amd:chem#PBS-lnodes=1:ppn=8:chem+1:ppn=8:bio#PBS-lnodes=node1:ppn=8+node2:ppn=8指定節(jié)點(diǎn)特性一些幣軟件幟有特桂殊的狠節(jié)點(diǎn)陶指定當(dāng)格式愁，比爸如AN翼SY衰S的命郵令行飼參數(shù)格式為：an鑰sy池s1范21咱-捎di奮s-m壞ac驅(qū)hi雜ne竿sno熱de絲式1:明2:男no行de輛2:盈2-i蛾t杏es菌t.肚in爭(zhēng)p跑-ote炭st峰.l童og這時(shí)慶我們芒可以段對(duì)$P生BS丈_N默OD畝EF欠IL湯E進(jìn)行瞞字符矮處理朋，得非到需明要的淺格式2.最4.僑3PB或S腳本崗舉例#這是一個(gè)ANSYS并行作業(yè)的例子#PBS-Nansys_job#PBS-lnodes=2:ppn=8#PBS-qlowINPUTFILE=test.inpOUTPUTFILE=test.loghosts=`cat$PBS_NODEFILE|uniq-c|awk'{print$2":"$1}'|tr'\n'':'|sed's/:$//'`cd$PBS_O_WORKDIRansys121-dis-machines$hosts

-i$INPUTFILE-o$OUTPUTFILE作業(yè)提交后，會(huì)生成一個(gè)作業(yè)號(hào)，如：[dawning@node1~]$qsubtest.pbs93.node1查看集群作業(yè)運(yùn)行狀態(tài)：[dawning@node1~]$qstat

JobidNameUserTimeUseSQueue--------------------------------------------------------------93.node1test.pbstest0Rdefault95.node1vasp.Hg

vasp0Edefault111.node1structureamber0Qdefault2.嗽4.潮4PB招S查看扎作業(yè)疤狀態(tài)E：退出Q：排隊(duì)H：掛起R：運(yùn)行C：結(jié)束查詢某個(gè)作業(yè)運(yùn)行狀態(tài)：qstat93.node1(或者qstat93)顯示作業(yè)運(yùn)行在哪些節(jié)點(diǎn)上:qstat

-n93.node1顯示作業(yè)運(yùn)行詳細(xì)信息:qstat

-f93.node1[dawning@node1~]$qstat

JobidNameUserTimeUseSQueue--------------------------------------------------------------93.node1test.pbszhaocs0Rdefault95.node1vasp.Hg

vasp0Edefault111.node1structureamber0Qdefaultqdel93.node1注：費(fèi)用戶墨只能訂刪除填自己冰的作尋業(yè)，綢管理炎員可頁以刪扭除所柏有用崇戶作飯業(yè)2.知4.騎5PB避S作業(yè)樂其他囑操作刪除孔作業(yè)[dawning@node1~]$qstat

JobidNameUserTimeUseSQueue--------------------------------------------------------------93.node1test.pbszhaocs0Rdefault95.node1vasp.Hg

vasp0Edefault111.node1structureamber0Qdefault掛起作業(yè)：qhold111.node1取消作業(yè)掛起qrls111.node1作業(yè)璃掛起碧及取汪消2.羽4.鏡5PB稀S作業(yè)犁其他成操作[dawning@node1~]$qstat

JobidNameUserTimeUseSQueue--------------------------------------------------------------93.node1test.pbszhaocs0Rdefault95.node1vasp.Hg

vasp0Edefault111.node1structureamber0Qdefault更改撥作業(yè)2.材4.勝5PB尸S作業(yè)兄其他歲操作更改作業(yè)運(yùn)行隊(duì)列：qmovehigh111.node1更改作業(yè)資源屬性：qalter-lwalltime=10:00:00111.node1交換施作業(yè)析順序2.洽4.櫻5PB緣瑞S作業(yè)驚其他表操作[dawning@node1~]$qstat

JobidNameUserTimeUseSQueue--------------------------------------------------------------93.node1test.pbszhaocs0Rdefault95.node1vasp.Hg

vasp0Edefault111.node1structureamber0Qdefault112.node1gaussiangauss0Qdefault交換兩個(gè)作業(yè)的排隊(duì)順序：qorder111.node1112.node1[dawning@node1~]$qstat

JobidNameUserTimeUseSQueue--------------------------------------------------------------93.node1test.pbszhaocs0Rdefault95.node1vasp.Hg

vasp0Edefault112.node1gaussiangauss0Qdefault111.node1structureamber0Qdefault2.郊4.闖5PB領(lǐng)S作業(yè)標(biāo)其他為操作PB看S腳本硬中可憲以指衡定多烤個(gè)作巡壽業(yè)之致間的靈依賴逗關(guān)系哪，比熟如作圾業(yè)提將交前異另一廟個(gè)作戶業(yè)必褲須完擦成，澡否則懲處于磚排隊(duì)洪狀態(tài)#PBS-Nstep2#PBS-lnodes=4:ppn=4#PBS-qhigh#PBS-Wdepend=after:<JOB_ID>…#PBS-Njob_rerun#PBS-lnodes=4:ppn=4#PBS-qhigh#PBS-Wdepend=afternotok:<JOB_ID>…當(dāng)指而定作經(jīng)業(yè)非狂正常休結(jié)束謙，作沖業(yè)才殿能提交機(jī)運(yùn)行作業(yè)抱調(diào)度競(jìng)系統(tǒng)門概述PB掠S作業(yè)辰調(diào)度倡系統(tǒng)Ma螺ui調(diào)度喂器曙光Gr權(quán)id神vi連ew作業(yè)柳調(diào)度稅中間值件Q&葛A提綱To截rq碎ue帶有軌自己迫的默孕認(rèn)調(diào)潤(rùn)度策釣略器糾（pb筒s_特sc攝he鴿d），密但是圾這個(gè)隸最基以本的扯調(diào)度錯(cuò)策略繭并不蟲高級(jí)武。它雄根據(jù)fi隔fo的原妙則安咐排作嘗業(yè)，脂對(duì)一標(biāo)般的條集群斗管理鞋應(yīng)該哈是足盾夠了鬼，但傍如果挽你的攏集群阻有幾百個(gè)以誤上節(jié)剃點(diǎn)，缺分成棒若干緣瑞個(gè)隊(duì)巴列，猛那pb事s_疊sc職he吳d就力晴不從抗心了綿。為此攤，可沉以使棋用一叼系列泄第三臘方的峽調(diào)度舟策略碑進(jìn)行哀補(bǔ)充著。Ma冰ui就是福被廣雹泛使勾用的調(diào)度策略畫之一。3.秘1Ma渣ui調(diào)度紙器介擦紹3.暮1Ma徐ui調(diào)度粗器介時(shí)紹Ma篩ui采用違積極豪的調(diào)聽度策態(tài)略優(yōu)化蜓資源偷的利幟用和減少作傻業(yè)的棕響應(yīng)缸時(shí)間。Ma腹ui的資座源和魄負(fù)載東管理收允許瞧高級(jí)勸的參委數(shù)配覽置：蒙作業(yè)疏優(yōu)先啊級(jí)(J由ob我P允ri書or娘it禮y)尖、調(diào)度牢和分毫配(S勉ch浴ed備ul醒in君g格an沒d攻Al蜓lo棚ca僚ti疤on臘)、公平普性和商公平耳共享(F陪ai唉rn堅(jiān)es涼s皆an鉆d除Fa墳ir端sh敘ar緞e)和預(yù)指留策奮略(R飲es肅er鮮va達(dá)ti辣on幣P萄ol趕ic糖y)迫。M閉au鈔i的Qo哨S機(jī)制塵允許幼資源泄和服跡務(wù)的詞直接透?jìng)鬟f悲、策圍略解悉除(P粱ol顛ic鉗y臥Ex聰em產(chǎn)pt要io疤n)和指溜定特蓬征的炊受限汁訪問覽。Ma枯ui需要兄資源醬管理烈器和曾其配士合使奶用。紀(jì)我們否可以罵把Ma詠ui想象番為PB蘆S中的造一個(gè)訂插入雀部件因。集群估已安堤裝配吉置好To榮rq免ue解壓憤源文常件包ta股r隔zx宮vf燥m叮au趟i-3沈.2姨.6議p1慎7.屠ta甲r.隔gz編譯昌設(shè)置cd胸m趁au萍i-3木.2茄.6摟p1框7./浩co元nf熊ig榮ur慘e診--罪wi頁th密-p芬bs穩(wěn)=/例us胡r/萌lo持ca喜l--降wi即th沿-p肯bs指定To灣rq憤ue安裝賢目錄編譯帶和安永裝ma婆kema詳ke釋i恐ns儉ta鬧ll3.生1Ma行ui安裝(S厲er今ve旨r)編輯陶啟動(dòng)繡腳本cd康m擇au輩i-3閃.2腔.6襲p1腫7cp舊e設(shè)tc恩/m鐮au肥i.悼d篇/e別tc政/i循ni械t.頌d/vi司m組/e畏tc戚/i沖ni蜻t.像d/劈燕ma咳ui盲.d修改遲其中微的”MA沈UI百_P奔RE腐FI陡X=仁/u卻sr逝/l拐oc閱al蹄/m貼au顆i”(m璃au制i的安拴裝目圣錄)停用pb夏s_世sc肥he鋼d，啟概用ma床uich具kc傭on救fi男g(shù)蠶pb坦s_灰sc傳he莊d戶of頌fch黨kc績(jī)on趁fi斜g姑ma石ui須.d荒o盈nse屋rv將ic慮e里pb婆s_述sc宮he編d酷st噸opse撒rv浙ic脅e捧ma鄭ui最.d竹s調(diào)ta霜rt3.霸1Ma淚ui安裝(S注er軍ve鞏r)Ma昏ui的配稍置參老數(shù)都立寫在僅配置瞞文件ma烈ui貍.c抬fg中，配置參數(shù)狂可以勒參考替官方械手冊(cè)Ma執(zhí)ui法A該dm佩in創(chuàng)is絕tr藍(lán)at蹈or航's巧G棍ui春de主要帳參數(shù)林如下舊：vi桌m(xù)賄ma良ui索.c毒fg#設(shè)置Ma醫(yī)ui服務(wù)頌器主纖機(jī)名SE擋RV擾ER抬HO村STse紙rv她er#一級(jí)枝權(quán)限登用戶克，擁芝有Ma嫩ui所有風(fēng)控制銷權(quán)限隔，包遍括更澤改調(diào)牽度策肉略，疲更改壟作業(yè)捉屬性AD蟻MI或N1英ro所ot#二級(jí)孔權(quán)限疾用戶播，不嘉能更倡改調(diào)句度策甲略，濾但能捆更改腦作業(yè)甜屬性AD怎MI雜N2螺zh盤an蛙g給wa顛ng辛z菊ha織o#三級(jí)配權(quán)限夠用戶校，只嫌有查誓看權(quán)畢限，AL情L(zhǎng)表示娃所有座賬戶AD改MI罵N3誓AL屋L3.磨2Ma并ui配置#定義設(shè)資源瓣管理輛器（Re率so板ur知ce皺M處an沒ag裳er），德指定汁類型瀉為PB撤S，以傭及To乳rq鞠ue服務(wù)盤器主鐵機(jī)名，刷架新資葡源信端息的促時(shí)間剛，端暫口號(hào)RM馬CF陷G[質(zhì)0]TY董PE典=P橡B(yǎng)S范H邁OS稠T=濕se溜rv癥erRM渾PO它LL絨IN哀TE尸RV闖AL犧00扭:0當(dāng)0:溉30謊SE嚇RV扛ER剖PO摩RT42芹55荷9SE雞RV你ER樸MO侍DE正NO揪RM父AL#日志芹設(shè)置LO蒙GF雷IL航E千ma責(zé)ui緒.l卻og羊LO仆GF幅IL脫EM甚AX西SI榨ZE帳10魂00松00駕00夢(mèng)LO頁GL諸EV輪EL扶33.鍛2Ma奇ui配置#設(shè)置Fa威ir琴s稱ha棄re策略#F待SP衛(wèi)OL椒IC服Y擴(kuò)P械SD腎ED簡(jiǎn)IC洋AT賽ED旗#盟FS猾DE歪PT纏H隸7狼#F輪SI昨NT緒ER燥VA杯L拘8途64進(jìn)00橫#腥FS選DE偽CA盛Y事0.卷80#設(shè)置另回填安（Ba鍬ck劍fi暫ll）策仔略BA歪CK敬FI窮LL礎(chǔ)PO留LI丘CY累F識(shí)IR言ST祥FI辰T持RE綠SE袋RV朵AT恰IO葉NP獵OL重IC毒Y律CU厭RR懂EN霜TH仇IG牧HE搜ST#節(jié)點(diǎn)塔分配門策略#N剛OD調(diào)EA米LL言O(shè)C眉AT煤IO壺NP捆OL敢IC補(bǔ)Y輸M姑IN疲RE是SO揉UR仙CE咬#哲NO秋DE概AL給LO區(qū)CA已TI肅ON干PO浙LI滅CY我CP易UL永OA跳D#NO規(guī)DE嘆AL腿LO碗CA臨TI柔ON飾PO捉LI差CYSH燭AR貴ED璃N仆OD熊EA蘋LL謠OC弱AT拴IO驢NP蹲OL意IC任Y殿F星IR海ST樂AV供AI堂LA迫BL災(zāi)E3.同2Ma判ui配置#免QO懶S配置QO勞SC倉(cāng)FG品[p立re換em暑pt西or頃]善QF斜LA鎮(zhèn)GS查=P猜RE查EM壤PT筆ORQO慮SC攤FG范[p徑re蠅em先pt挎ee鞠]免QF湖LA季GS童=P蝴RE蘿EM昌PT歸EECL命AS宿SC先FG遇[h道ig耽h]簽P肺RI摧OR程IT卵Y=丘11卸00眠0賀QD限EF巧=p押re妻em土pt宏orCL糧AS培SC掩FG計(jì)[l表ow刺]嚼PR郊IO狐RI法TY賴=6疼00旱0帽QD初EF擴(kuò)=p纖re鑰em岔pt館eeCL憑AS辱SC碌FG陪[m洞id卵dl凍e]抱P威RI鎖OR床IT驅(qū)Y=不90寸00饞Q被DE德F=緒pr跨ee奧mp肌te弱e#用戶痕優(yōu)先雪級(jí)設(shè)見置US吹ER雪CF系G[攔ro鼻ot獻(xiàn)]賄MA悄XP高RO獄C=喊40合0陪MA招XN悲OD糟E=滿10訴0鉆MA凝XJ愚OB現(xiàn)=1涂00US侵ER出CF訊G[蠻te腐st公]伸PR斬IO扒RI于TY洞=1語00刑M干AX曲PR惜OC順=2贈(zèng)00糧M崖AX損JO僅B=顯10US涼ER斃CF沉G[嗚DE樹FA病UL模T]前P救RI湖OR次IT粱Y=素10密0蔬M(jìn)A線XP承RO鞭C=哭10撓0因MA絨XJ公OB菜=43.奇2Ma遲ui配置作業(yè)割調(diào)度切系統(tǒng)緣瑞概述PB桿S作業(yè)霉調(diào)度鞋系統(tǒng)Ma亭ui調(diào)度理器曙光Gr掘id穿vi象ew作業(yè)需調(diào)度賤中間浮件Q&牧A提綱4曙光Gr楚id權(quán)vi蝦ew作業(yè)剖調(diào)度違中間梁件介紹功能中間件應(yīng)捕用使用坊方法作業(yè)時(shí)調(diào)度中間件結(jié)疫構(gòu)圖4.兔1曙光Gr固id盟vi宿ew作業(yè)惕調(diào)度儲(chǔ)中間湖件增加節(jié)點(diǎn)修改節(jié)點(diǎn)刪除節(jié)點(diǎn)創(chuàng)建隊(duì)列修改隊(duì)列刪除隊(duì)列隊(duì)列節(jié)點(diǎn)用戶修改用戶身份修改用戶等級(jí)修改用戶權(quán)限強(qiáng)大姿的資礙源管植理4.突2作業(yè)為調(diào)度中間件功能基于WEB圖形界面集成度高,嵌入到Gridview中流程簡(jiǎn)單界面友好1423輕巧徒的專共業(yè)應(yīng)冷用提歐交4.棗2作業(yè)槍調(diào)度中間件功能管理多個(gè)集群1提供才完善牛的參巨數(shù)設(shè)址置2靈活評(píng)的提旺交方鼻式34.議2作業(yè)坡調(diào)度中間件功能作業(yè)長(zhǎng)提交提供盆作業(yè)最監(jiān)控于功能1提供修改作業(yè)狀態(tài)功能2提供宅多集曉群作腦業(yè)監(jiān)星控34.連2作業(yè)影調(diào)度中間件功能作業(yè)風(fēng)管理提供秧多個(gè)俯時(shí)間裕段的唐報(bào)表提供脾多種挺存儲(chǔ)談格式實(shí)用咸的用糠戶管票理和繩記賬業(yè)功能4.前2作業(yè)配調(diào)度中間件功能穩(wěn)定言性高4.務(wù)2作業(yè)菠調(diào)度中間件功能代碼保護(hù)審查嚴(yán)格備份作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)恢復(fù)作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)功能穩(wěn)定01測(cè)試嚴(yán)格02具有備份功能單元測(cè)試嚴(yán)格集成測(cè)試嚴(yán)格兼容性測(cè)試嚴(yán)格03MPI程序,例如:Vasp、WRF、mpiBLAST

等等典型的商業(yè)軟件，例如：Gaussian、Fluent、Ansys等等應(yīng)用與作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)相結(jié)合常用的mpi程序常用的商業(yè)軟件用戶自己開發(fā)的串行并行程序4.征3旁Gr南id巷Vi槽ew作業(yè)情調(diào)度答的應(yīng)譜用常用軟件DOCKMPIBLAST···常用軟件常用軟件工程量子力學(xué)生物常用軟件AMBERCHARMMGROMACSNAMDLAMMPS···分子動(dòng)力學(xué)應(yīng)用您與作肺業(yè)調(diào)萌度系跪統(tǒng)相翠結(jié)合高性牛能主恢要領(lǐng)株域主要競(jìng)業(yè)務(wù)抗軟件得到超各個(gè)查領(lǐng)域跑的首嗓席工柄程師管的驗(yàn)敢證4.普3皮Gr論id川Vi橋ew作業(yè)戶調(diào)度荷的應(yīng)族用AN肌SY銀SLS封DY榜NACF殿XCO艷MS憑OLFL加UE柿NT··坐·AB便IN穗ITGA部US閘SI灑ANPW歇SC縣FVA聞SP··爹·4.逆4籌Gr產(chǎn)id史Vi風(fēng)ew作業(yè)騙調(diào)度北的使守用4.門4.兼1節(jié)點(diǎn)濃監(jiān)控節(jié)點(diǎn)洽監(jiān)控掩提供聽以下設(shè)幾個(gè)功能(1森)監(jiān)控?fù)]節(jié)點(diǎn)亡狀態(tài)(2貌)增加炮節(jié)點(diǎn)(3劍)刪除柄節(jié)點(diǎn)(4劣)重啟紹節(jié)點(diǎn)騾進(jìn)程4.敘4.赤1節(jié)點(diǎn)汪監(jiān)控4.禾4.獨(dú)2隊(duì)列峽管理隊(duì)列頃管理血主要布包含害對(duì)隊(duì)蒜列的潛創(chuàng)建漂、刪霧除、苗修改霜和查駕看等撥操作多。只有ro掛ot用戶怠和用認(rèn)戶管鞏理中克規(guī)定赴的管駛理員渴才能文打開擺隊(duì)列桑管理扒的主撿頁面勞，從姜而操收作控臘制隊(duì)被列。4.亮4.箏2隊(duì)列拖管理4.偽4.襖2隊(duì)列齊管理4.幕4.防3用戶桐設(shè)置用戶管理鄙主要很是對(duì)層用戶肉在作嘩業(yè)調(diào)韻度系蓄統(tǒng)中稿的身聞份、姑優(yōu)先艘級(jí)，寇以及醫(yī)在作百業(yè)調(diào)差度系民統(tǒng)對(duì)期資源軍的使餓用和要使用俱上限授進(jìn)行撫設(shè)置爺、修利改和廟查看可。這再里的胡用戶夏是指蒜已經(jīng)包存在時(shí)于操魄作系史統(tǒng)中寶的一毅般用關(guān)戶，日不包據(jù)括ro乏ot用戶溝和用撞戶ID小于50禮0的系紛統(tǒng)用施戶。4.違4.央3用戶多設(shè)置4.妹4.蠟4作業(yè)宅提交該作業(yè)戚調(diào)度鑒系統(tǒng)零主要嘴通過we糖b頁面驗(yàn)將作煙業(yè)提狀交給們調(diào)度涼器。臨系統(tǒng)腿中有裹三種獲提交組方式翁：(1)解Po燈rt持al提交(2比)腳本厲方式橡提交(3戰(zhàn))命令智行方寺式提交每次只能帆選擇劃一種填方式貪提交郊，在麻打開鎖提交飽窗口料時(shí)，易默認(rèn)攪是第餐一種厲提交腎方式。4.忌4.宮4.劃1姐p壯or陶ta嗓l提交根據(jù)獄應(yīng)用擔(dān)特點(diǎn)乏定制皺，目國(guó)前集院成了19種軟刃件，且具體披使用妄方法狼見手屆冊(cè)《G桐ri鹿dv旦ie已w_應(yīng)用Po遵rt勁al多_用戶敏手冊(cè)》4.淋4.剩4.茶1郵p墨or熄ta師l提交4.夫4.盯4.坡1嫌p真or腹ta問l提交用戶彩針對(duì)旦應(yīng)用當(dāng)特殊沃配置每個(gè)托應(yīng)用跳在$H張OM革E/金.凝cl最us枝po泥rt界al/目錄侍下有荒個(gè)對(duì)殼應(yīng)的.s耕et囑ti接ng文件梳，卵前綴堪為應(yīng)閥用名刺。Fluentfluent.setting##runsettingprog_default=/public/software/ansys_inc/v121/fluent/bin/fluentprog_list=/public/software/ansys_inc/v121/fluent/bin/fluent:##runfilesettingFluent_ENVFILE=/public/software/profile.d/fluent-env.sh4.質(zhì)4.維4.鞭2腳本猛和命驗(yàn)令行騰提交4.竹4.盤4.憂2腳本歷和命察令行貫提交4.減4.劣4.給1推p爛or顧ta陰l提交機(jī)群假上作時(shí)業(yè)情奸況my梳j改ob剝i斃d漸is榮3財(cái)26粒.n私od先e1ru因n跨no覺de頁s脂is滴f們ol擋lo文wi族ng城:no重de躬4no圈de鉆4no宗de章4no宅de歉4be噸gi陳n貞ti稀me仰i揪s道Tu屠e騰Au規(guī)g償21江1冊(cè)1:申09決:3索4沿CS匪T施20蠶12/p已ub斥li搞c/說so擦ft滾wa敢re棕/a匹ns姜ys狼_i宇nc墻/v犬12境1/出fl避ue值nt頓/f亡lu筑en賤t1幣2.陽1.餅4/轉(zhuǎn)bi黑n/蹦fl燈ue嘗nt銜-紐奉r1奴2.蛾1.堤4乒2d帽-改g偉-t店4神-c扛nf展=/剃op帳t/虹gr取id換vi宴ew芬//奴pb震s/眼/d燥is洲pa潔tc丹he家r/止au癥x/處/3綠26蚊.n壘od蜓e1拐-北ss瓦h(yuǎn)估-m彈pi雞=o排pe磚nm戲pi皆-梢i等/h狠om熊e/牛sh刃en克j/苗wo踏rk咐/f超lu鉗en執(zhí)t/廁3/連ca寫vi早ty含.j跡ou……>pa虧ra是ll賣el余/t閱im滴er犧/u乎sa詳gePe糞rf攔or昆ma區(qū)nc必e殊Ti軟me臂r狂fo義r材30父0與it壤er仁at塵io嗎ns閉o甩n梢4鋤co山mp位ut僅e花no征de位sAv猜er英ag感e笛wa亞ll纖-c科lo猾ck嗓t貼im冬e魂pe麗r驗(yàn)it較er徒at顫io民n:私0.卷00趁2何se隆cGl銀ob銷al璃r少ed盼uc埋ti虛on灑s皇pe場(chǎng)r溫it夢(mèng)er評(píng)at跌io抗n:盟5場(chǎng)3謹(jǐn)op姐sGl繡ob紐奉al精r縮慧ed均uc露ti幟on件s吸ti尺me從p瓶er側(cè)i旺te浸ra煎ti榮on羨:彈0.桐00延0務(wù)se家c區(qū)(0帳.0猴%)……To票ta舍l雞wa筐ll籍-c籃lo坊ck竊t法im擺e:蒼0.艱56放0碎se禍cTo點(diǎn)ta柱l饅CP壁U匠ti固me永:須2.慌30向0刷se傳c……en魯d憤ti充m