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生化學(xué)習(xí)要點(diǎn)第一頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日題型一、名詞解釋(共5題,3分/題,共15分二、單項(xiàng)選擇題(共20題,1分/題,共20分)三、填空題(共20空,0.5分/空,共10分)四、簡(jiǎn)答題(共5題,35分)五、生化術(shù)語(yǔ)中英對(duì)譯(共10題,0.5分/題,共5分)六、問答題(共1題,共15分)第二頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日◆緒論◆第一章蛋白質(zhì)◆第二章酶◆第三章核酸◆第四章維生素◆第五章生物氧化◆第六章糖代謝◆第七章脂代謝◆第八章蛋白質(zhì)的酶促降解和氨基酸代謝◆第九章核酸的酶促降解及核苷酸代謝◆第十章物質(zhì)代謝的聯(lián)系與調(diào)節(jié)學(xué)習(xí)要點(diǎn)提示及思考題第三頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日
第一章蛋白質(zhì)化學(xué)要點(diǎn)提示
第四頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日重點(diǎn)1、蛋白質(zhì)的化學(xué)組成——各種AA代號(hào)、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)測(cè)定方法(酶法及化學(xué)法切割位點(diǎn))2、
氨基酸的性質(zhì)——兩性性質(zhì)及等電點(diǎn)計(jì)算、化學(xué)反應(yīng)及顏色反應(yīng)3、肽平面、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)——鍵及概念、特點(diǎn)等4、蛋白質(zhì)的性質(zhì)——膠體性質(zhì)、沉淀、變性與復(fù)性等5、蛋白質(zhì)的分離提純第五頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日一、組成1、蛋白質(zhì)是由20種氨基酸組成的。氨基酸性質(zhì)方面的差別反映了它們側(cè)鏈的不同。除了Gly沒有手性碳以外,其他19種氨基酸都至少含有一個(gè)手性碳。第六頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日非極性
Ala
ValLeuIleMetPheTrpPro極性不帶電GlySerThrAsnGlnTyrCys 極性帶正電
LysArgHis極性帶負(fù)電
GluAsp必需氨基酸與非必需氨基酸的概念第七頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日2、氨基酸的構(gòu)型與旋光性構(gòu)型(Configuration)是指一個(gè)分子由于其中各原子特有的固定的空間排列,而使該分子所具有的特定的立體化學(xué)形式。由一種構(gòu)型轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N構(gòu)型時(shí),將涉及共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。注意:構(gòu)型與構(gòu)象的概念差別構(gòu)象(Conformation):指取代基團(tuán)圍繞單鍵旋轉(zhuǎn)時(shí)可形成不同的立體結(jié)構(gòu)。其空間位置的改變不涉及共價(jià)鍵的破裂。第八頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日3、氨基酸和多肽的酸性和堿性基團(tuán)的離子狀態(tài)取決于pH兩性離子:同一個(gè)氨基酸分子上帶有能放出質(zhì)子的-NH3+正離子和能接受質(zhì)子的-COO-負(fù)離子。pI:溶液中AA分子所含的-NH3+和-COO-數(shù)目正好相等,凈電荷為0時(shí)的pH值即為氨基酸的等電點(diǎn)。第九頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日中性氨基酸:pI=(pK`-COO+pK`-NH2)/2酸性氨基酸:pI=(pK`-COO+pK`R-COO-
)/2堿性氨基酸:pI=(pK`-NH2+pK`R-NH2)/2第十頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日4、氨基酸的化學(xué)性質(zhì)注意:反應(yīng)的機(jī)理、涉及的化學(xué)術(shù)語(yǔ)簡(jiǎn)稱第十一頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日二、蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)第十二頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1、多肽鏈中相鄰氨基酸殘基通過肽鍵連接。
肽鍵具有部分雙鍵特性,所以整個(gè)肽單位是一個(gè)極性的平面結(jié)構(gòu)。由于立體上的限制,肽鍵的構(gòu)型大都是反式構(gòu)型。繞N-Cα和Cα-C鍵的旋轉(zhuǎn)賦予了多肽鏈構(gòu)象上的柔性。
第十三頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日2、蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括一級(jí)結(jié)構(gòu)(primarystructure)二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondarystructure)三級(jí)結(jié)構(gòu)(tertiarystructure)四級(jí)結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)高級(jí)結(jié)構(gòu)超二級(jí)結(jié)構(gòu)與結(jié)構(gòu)域注意維系各個(gè)結(jié)構(gòu)的作用力第十四頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日3、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式
-螺旋(-helix)
-折疊(-pleatedsheet)
-轉(zhuǎn)角(-turn)
無(wú)規(guī)卷曲(randomcoil)
掌握各種結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)。第十五頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日4、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)測(cè)序
1)注意二硫鍵的斷裂方法(氧化法、還原法)
2)分析N端和C端的方法
3)肽鏈的部分裂解(注意內(nèi)肽酶切位置和化學(xué)裂解)
4)一級(jí)結(jié)構(gòu)序列的分析第十六頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日三、蛋白質(zhì)的性質(zhì)第十七頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1、蛋白質(zhì)的兩性離解和電泳現(xiàn)象(概念)2、蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)(兩個(gè)因素)3、蛋白質(zhì)的沉淀作用(兩種方式)4、蛋白質(zhì)的變性5、蛋白質(zhì)的紫外吸收6、蛋白質(zhì)的顏色反應(yīng)第十八頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日四、蛋白質(zhì)的分離純化第十九頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日蛋白質(zhì)的分離純化
(一)根據(jù)分子大小不同的分離方法(二)利用溶解度差別的分離(三)根據(jù)電荷大小進(jìn)行分離(四)蛋白質(zhì)的選擇吸附分離(五)利用生物親和力蛋白質(zhì)含量的測(cè)定蛋白質(zhì)純度等的測(cè)定注意幾種電泳概念、原理;能判斷電泳的方向、速度等注意離子交換、分子層析的原理第二十頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日五、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能的關(guān)系第二十一頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1、蛋白質(zhì)功能的多樣性2、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系3、蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系第二十二頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日注意:肌紅蛋白的氧飽和曲線為雙曲線型,而血紅蛋白的氧飽和曲線是S型的。概念:波爾效應(yīng);協(xié)同效應(yīng)第二十三頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日第二章酶一、要點(diǎn)提示第二十四頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1、酶和一般催化劑的共性
2、酶催化作用特性
一、酶是生物催化劑1.高效性2、酶的專一性3、反應(yīng)條件溫和4、可調(diào)節(jié)5、易失活第二十五頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日二、酶的化學(xué)本質(zhì)
除了某些RNA之外,絕大部分酶是蛋白質(zhì),或是帶有輔助因子的蛋白質(zhì)。酶的反應(yīng)類型分為六大類:脫氫酶、轉(zhuǎn)移酶、水解酶、裂解酶、異構(gòu)酶和合成酶。第二十六頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日三、酶活性部位:結(jié)合部位、催化部位與酶功能的聯(lián)系第二十七頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日四、酶的催化作用機(jī)理(一).酶作用專一性機(jī)理(誘導(dǎo)契合學(xué)說(shuō))(二).酶作用高效性機(jī)理
中間產(chǎn)物學(xué)說(shuō)(三).影響酶高效性的因素
1.鄰近定向效應(yīng)
2.底物的形變和誘導(dǎo)契合
3.親核催化/親電催化(共價(jià)催化)
4.酸堿催化
5.微環(huán)境的影響第二十八頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日五、酶促反應(yīng)動(dòng)力學(xué)(一).底物濃度(米氏常數(shù))(二).溫度、pH值、酶濃度、激活劑(三).抑制劑
1.類型
2.特點(diǎn)
3.差異
第二十九頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日抑制劑類型公式VmaxKm無(wú)抑制劑競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑非競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑反競(jìng)爭(zhēng)性VmaxKm不變?cè)黾訙p小不變減小減小第三十頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日六、酶活力的測(cè)定方法(一).酶活力(二).比活力(三).總活力
(四).轉(zhuǎn)換數(shù)
第三十一頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日第三章核酸
一、要點(diǎn)提示
第三十二頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日重點(diǎn)核酸的概念和重要性(種類、在細(xì)胞中的分布、功能等)核苷酸(組成、DNA與RNA區(qū)別)DNA的結(jié)構(gòu)
RNA的結(jié)構(gòu)(各種RNA)
核酸的理化性質(zhì)(變性、復(fù)性、Tm值等)
第三十三頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日二、DNA的結(jié)構(gòu)DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)就是指DNA分子中脫氧核糖核苷酸的排列順序及連接方式。生物界物種的多樣性即取決于DNA分子中四種核苷酸千變?nèi)f化的不同排列組合。1、DNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)第三十四頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日2、DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)1953年J.Watson和F.Crick提出了著名的DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型。注意DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型的結(jié)構(gòu)要點(diǎn)第三十五頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日三
RNA的結(jié)構(gòu)
mRNArRNAtRNA三種RNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)和高級(jí)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)。第三十六頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日兩性性質(zhì)紫外吸收核酸的水解變性、復(fù)性與分子雜交沉降電泳核酸序列測(cè)定四、核酸的理化性質(zhì)涉及增色效應(yīng)、減色效應(yīng)涉及兩種方法的原理第三十七頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日(一)
雙脫氧終止法(末端終止法)英國(guó)Sanger
1955
確定牛胰島素結(jié)構(gòu),1958獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)
1975設(shè)計(jì)出DNA測(cè)序法,1980獲諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)合成一段與待測(cè)DNA序列互補(bǔ)的DNA片段群。第三十八頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日雙脫氧終止法原理1、DNA的復(fù)制需要:DNA聚合酶,單鏈DNA模板,帶有3‘-OH末端的單鏈寡核苷酸引物,4種dNTP(dATP、dGTP、dTTP和dCTP)。2、聚合酶用模板作指導(dǎo),不斷地將dNTP加到引物的3‘-OH末端,使引物延伸,合成出新的互補(bǔ)DNA鏈。3、如果加入雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)---在脫氧核糖的3’位置缺少一個(gè)羥基---故不能同后續(xù)的dNTP形成磷酸二酯鍵。4、采用聚丙烯酰胺凝膠電泳區(qū)分長(zhǎng)度差一個(gè)核苷酸的單鏈DNA,從而讀取DNA的核苷酸序列。第三十九頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日(二)化學(xué)裂解法
Maxam-Gilbert,1977原理:利用特異性的化學(xué)裂解法,制備出長(zhǎng)度只差一個(gè)核苷酸的片段群,然后將此片段群經(jīng)測(cè)序膠電泳和放射自顯影得到測(cè)序圖譜。WalterGilbert第四十頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日DNA化學(xué)裂解反應(yīng)體系反應(yīng)體系修飾試劑修飾反應(yīng)鏈斷裂試劑斷裂點(diǎn)G硫酸二甲酯(DMS)G甲基化六氫吡啶GG+A甲酸/哌啶脫嘌呤作用六氫吡啶G和AC+T肼/哌啶嘧啶開環(huán)六氫吡啶C和TC肼/2mol/LNaClC六氫吡啶C第四十一頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日基本步驟
第一步,對(duì)特定堿基(或特定類型的堿基)進(jìn)行化學(xué)修飾;第二步,修飾堿基從糖環(huán)上脫落,修飾堿基5和3的磷酸二酯鍵斷裂;第三步,比較G、A+G、C+T、C和A>C各個(gè)泳道,可從測(cè)序凝膠的放射自顯影片上讀取DNA序列。第四十二頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日第四章維生素和輔酶
一、要點(diǎn)提示第四十三頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日維生素脂溶性水溶性ADEK在體內(nèi)直接參與代謝的調(diào)節(jié)作用B1、B2、PP、B6、泛酸、生物素、葉酸、B12和VC等通過轉(zhuǎn)變成輔酶對(duì)代謝起調(diào)節(jié)作用第四十四頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1)維生素的種類→組成特點(diǎn)及性質(zhì);2)水溶性維生素與輔酶的關(guān)系→輔酶在酶催化作用中起何種作用;3)注意維生素缺乏時(shí)所引起的后果。第四十五頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日第五章生物氧化第四十六頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日一、生物氧化的概念有機(jī)物質(zhì)(糖、脂肪和蛋白質(zhì))在生物細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行氧化分解而生成CO2和H2O并釋放出能量的過程稱為生物氧化。生物氧化通常需要消耗氧→又稱為呼吸作用。區(qū)別體內(nèi)氧化與體外氧化的差異第四十七頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日二、呼吸鏈的概念和電子傳遞系統(tǒng)的組成、電子傳遞的方向等
按照它們的還原電勢(shì)的大?。河傻碗娢灰来蜗蚋唠娢慌帕?。第四十八頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日三、ATP產(chǎn)生的方式化學(xué)滲透學(xué)說(shuō)氧化磷酸化與底物水平磷酸化區(qū)別第四十九頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日四、氧化磷酸化抑制劑注意:原理第五十頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日第六章糖代謝第五十一頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日糖代謝分解代謝合成代謝無(wú)氧分解有氧分解糖原異生光合作用糖的生物合成糖酵解三羧酸循環(huán)磷酸戊糖途徑其他途徑第五十二頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1)糖酵解是基礎(chǔ)2)
三羧酸循環(huán)的核心;3)磷酸戊糖途徑是衍生;4)糖原合成與分解(糖基載體)5)糖異生注意各代謝途徑的亞細(xì)胞定位、步驟、能量的消耗與產(chǎn)生、關(guān)鍵酶及調(diào)節(jié)、生理意義第五十三頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日糖
酵
解
總
過
程2394568101G-6-PGF-6-PF-1,6-2PDHAPG-3-P3-磷酸甘油酸×22-磷酸甘油酸×2PEP丙酮酸×21,3-二磷酸甘油酸×27-ATP-ATP+2ATP+2ATP+2NADH1.葡萄糖激酶3.磷酸果糖激酶6.3-磷酸甘油醛脫氫酶7.3-磷酸甘油酸激酶10.丙酮酸激酶消耗2ATP產(chǎn)生4ATP2NADH第五十四頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日NADH+H++CO2丙酮酸脫氫酶系NAD++HSCoA*H3C-C~S-CoAOH3C-C-COOHOTCA過程第五十五頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1丙酮酸脫氫酶系酶丙酮酸脫羧酶E1二氫硫辛酸乙酰轉(zhuǎn)移酶E2二氫硫辛酸脫氫酶E3輔助因子TPP硫辛酸FADNAD+CoAMg2+第五十六頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日檸檬酸草酰乙酸1乙酰CoA3`草酰琥珀酸-酮戊二酸3琥珀酰-CoA4延胡索酸6蘋果酸785琥珀酸CO2CO2NADH+H+FADH2GTPNADH+H+NADH+H+二次脫羧異檸檬酸2四次脫氫一次GTP注意:乙醛酸循環(huán)第五十七頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日注意TCA中催化兩次CO2
脫羧的關(guān)鍵酶第五十八頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日5-磷酸核糖5-磷酸木酮糖糖酵解G-6-P6-磷酸葡萄糖酸NADP+NADPH+H+5-磷酸核酮糖NADP+NADPH+H+CO27-磷酸景天酮糖3-磷酸甘油醛F-6-P4-磷酸赤蘚糖G-3-P+F-6-PA.過程
氧化階段(脫碳產(chǎn)能)非氧化階段(重組)G→G-6-PPPP過程第五十九頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日第七章脂類代謝主要內(nèi)容:
脂肪的分解代謝(包括甘油和脂肪酸)
脂肪的合成代謝(重點(diǎn)是脂肪酸的合成)第六十頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日1)脂肪酸的氧化分解——β氧化2)甘油的氧化分解3)脂肪酸的合成——循環(huán)4)酮體的組成、合成與分解部位等5)甘油磷酯的生物合成(兩條途徑、載體)第六十一頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日脂肪脂肪酸甘油+3-磷酸甘油磷酸二羥丙酮脂酰CoA乙酰CoA丙酮酸EMP糖異生GTCA乙酰CoA細(xì)胞質(zhì)線粒體脂酰CoA-氧化清蛋白運(yùn)輸自由運(yùn)輸?shù)诹?yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日甘油3-磷酸甘油DHAPNADH+H+丙酮酸NADH+H+-ATP2ATPCO2TCA4NADH+H+FADH21GTP甘油徹底氧化的總能量16.5或18.5ATP第六十三頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日脂肪酸脂酰CoA脂酰CoA2反式烯脂酰CoA加水-羥脂酰CoA-酮脂酰CoA脫氫脫氫硫解脂酰CoA(少2個(gè)C)乙酰CoA+TCA乙酰CoA細(xì)胞質(zhì)線粒體-氧化FADH2NADH+H+-ATP(AMP)16C的軟脂酰CoAβ-氧化次數(shù)和產(chǎn)物?7次β-氧化產(chǎn)物:8分子乙酰CoA7×(FADH2+NADH)第六十四頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日偶數(shù)碳原子的脂肪酸,凈生成的ATP數(shù)目公式循環(huán)一次產(chǎn)生的ATP數(shù)TCA產(chǎn)生的ATP數(shù)β-氧化的循環(huán)次數(shù)產(chǎn)生的乙酰CoA的個(gè)數(shù)第六十五頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日縮合乙酰CoA線粒體細(xì)胞質(zhì)乙酰CoA穿梭體系丙二酸單酰CoA還原D--羥丁酰ACP巴豆酰ACP脫水乙酰乙酰ACP丁酰ACP還原乙酰-S-ACP丙二酸單酰ACP進(jìn)入下一輪循環(huán)-NADPH+H+-ATP-NADPH+H+軟脂酸的合成第六十六頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日軟脂酸分解與合成代謝的區(qū)別p264區(qū)別合成氧化1、部位2、?;d體3、參與的二碳單位4、電子供體或受體5、羥脂酰中間體立體異構(gòu)6、轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制7、酶系8、方向9、循環(huán)10、能量變化細(xì)胞質(zhì)ACP丙二酸單酰ACPNADPHD型三羧酸(檸檬酸)7種酶蛋白組成復(fù)合體甲基端羧基縮合、還原、脫水、還原-7ATP-14NADPH線粒體CoA乙酰CoAFAD,NADL型肉堿載體4種酶羧基甲基端脫氫、加水、脫氫、硫解+106ATP第六十七頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日四、甘油的生物合成3-磷酸甘油脫氫酶NAD+NADH+H+來(lái)自脂肪水解
來(lái)自EMP途徑3-磷酸甘油
甘油ADP合成脂肪的原料磷酸激酶ATP第六十八頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日p243酮體:脂肪酸在肝臟線粒體中氧化分解生成的乙酰乙酸、β-羥丁酸和丙酮三種中間代謝產(chǎn)物
CH3COCH2COOH乙酰乙酸CH3CH(OH)CH2COOHβ-羥丁酸CH3COCH3丙酮酮體在肝外組織代謝。第六十九頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日第八章蛋白質(zhì)及氨基酸代謝第七十頁(yè),共八十二頁(yè),編輯于2023年,星期日重點(diǎn)與難點(diǎn):1)氨基酸的脫氨基作用與脫羧
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