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文檔簡(jiǎn)介

氨基酸的簡(jiǎn)介詳解演示文稿當(dāng)前第1頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)優(yōu)選氨基酸的簡(jiǎn)介當(dāng)前第2頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)1.1氨基酸的一般結(jié)構(gòu)1.2氨基酸的分類1.3氨基酸的酸堿化學(xué)1.4氨基酸的特征化學(xué)反應(yīng)1.5氨基酸的光學(xué)活性和光譜性質(zhì)1.6氨基酸混合物的分離分析當(dāng)前第3頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)1.1氨基酸的一般結(jié)構(gòu)特征:α-碳(與羧酸相鄰的碳,Cα)上都有一個(gè)氨基(α-氨基酸),此外,Cα還結(jié)合著一個(gè)H原子和一個(gè)側(cè)鏈基團(tuán)(R)每一種氨基酸的R都是不同的,側(cè)鏈上的碳依次按字母命名為β、γ、δ和ε碳,分別指的是第3,4,5和6位碳當(dāng)前第4頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

生理?xiàng)l件下(pH=7附近),氨基酸呈兼性離子形式。氨基(-NH2)質(zhì)子化為-NH3+羧基(-COOH)離子化為COO-當(dāng)前第5頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)絕大多數(shù)氨基酸是L型氨基酸α-氨基酸除R為H(甘氨酸)外,其α-碳原子是一個(gè)手性碳原子,具有旋光性,存在著兩種不能疊合的鏡像立體異構(gòu)體。將α-COO-畫在頂端,垂直畫一個(gè)氨基酸,然后與立體化學(xué)參考化合物甘油醛相比較,α-氨基位于α-碳左邊的為L(zhǎng)-異構(gòu)體,位于右邊的為D-異構(gòu)體。絕大多數(shù)氨基酸是L-型氨基酸,近年來,D-型氨基酸在哺乳動(dòng)物生命活動(dòng)中的意義引起了越來越多的關(guān)注。當(dāng)前第6頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)L-甘油醛D-甘油醛L-丙氨酸D-丙氨酸當(dāng)前第7頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)1.2氨基酸的分類1.2.1、氨基酸的表示方法:中文名,如甘氨酸、半胱氨酸等。三字母簡(jiǎn)寫:如Gly、Cys等。單字母簡(jiǎn)寫:如G、C等。當(dāng)前第8頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)記憶技巧(按字母順序記憶)AlaArgAspAsn

天酰

CysGluGlnGly

谷酰甘HisIleLeuLys

異亮亮

MetPhePro

甲硫

苯丙

SerThrTrpTyrVal

當(dāng)前第9頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)1.2.2、20種氨基酸可按其側(cè)鏈分類氨基酸的側(cè)鏈可以按照它們的化學(xué)結(jié)構(gòu)分為三類,即:脂肪族氨基酸;芳香族氨基酸;雜環(huán)氨基酸。當(dāng)前第10頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

甘氨酸Glycine一、脂肪族氨基酸(中性)(α-氨基乙酸)G當(dāng)前第11頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

甘氨酸

Glycine

丙氨酸

Alanine(α-氨基丙酸)一、脂肪族氨基酸(中性)A當(dāng)前第12頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

(α-氨基-β-甲基丁酸)甘氨酸

Glycine

丙氨酸

Alanine纈氨酸

Valine一、脂肪族氨基酸(中性)V當(dāng)前第13頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

甘氨酸

Glycine

丙氨酸

Alanine纈氨酸

Valine亮氨酸

Leucine(α-氨基-γ-甲基戊酸)L一、脂肪族氨基酸(中性)當(dāng)前第14頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

甘氨酸

Glycine丙氨酸

Alanine纈氨酸

Valine亮氨酸

Leucine異亮氨酸

IleucineI一、脂肪族氨基酸(中性)(α-氨基-β-甲基戊酸)當(dāng)前第15頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)甘氨酸是唯一不含手性碳原子的氨基酸,因此不具旋光性。異亮氨酸分子中的α碳和β碳都是不對(duì)稱碳原子,所以異亮氨酸具有四種可能的異構(gòu)體:L-異亮氨酸、D-異亮氨酸、L-別構(gòu)異亮氨酸和D-別構(gòu)異亮氨酸。通常出現(xiàn)在蛋白質(zhì)中的為L(zhǎng)-異亮氨酸。丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸和異亮氨酸的側(cè)鏈具有高度疏水性,在維持蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)中起重要作用。注意:當(dāng)前第16頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)一、脂肪族氨基酸(含羥基或硫)

絲氨酸

Serine

(α-氨基-β-羥基丙酸)S當(dāng)前第17頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

絲氨酸

Serine

蘇氨酸

Threonine(α-氨基-β-羥基丁酸)T一、脂肪族氨基酸(含羥基或硫)當(dāng)前第18頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)L-ThreonineD-ThreonineL-allo-ThreonineD-allo-Threonine蘇氨酸的光學(xué)異構(gòu)體當(dāng)前第19頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

絲氨酸

Serine

蘇氨酸

Threonine半胱氨酸Cysteine(α-氨基-β-巰基丙酸)C一、脂肪族氨基酸(含羥基或硫)當(dāng)前第20頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)+兩個(gè)半胱氨酸氧化可生成胱氨酸當(dāng)前第21頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)人頭發(fā)的電子顯微鏡照片與模型當(dāng)前第22頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)燙發(fā)過程:1、加還原劑(巰基乙醇)打開二硫鍵。2、加氧化劑(雙氧水)重新生成錯(cuò)位二硫鍵。當(dāng)前第23頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

絲氨酸

Serine

蘇氨酸

Threonine半胱氨酸Cysteine甲硫氨酸Methionine(α-氨基-γ-甲硫基丁酸)M一、脂肪族氨基酸(含羥基或硫)當(dāng)前第24頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)絲氨酸和蘇氨酸側(cè)鏈含有β-羥基,具有伯醇和仲醇的離子化特性。絲氨酸的羥甲基可以參與很多酶的活性部位反應(yīng)。蘇氨酸具有兩個(gè)手性碳原子,通常出現(xiàn)在蛋白質(zhì)中的是L-蘇氨酸。半胱氨酸在蛋白質(zhì)中經(jīng)常以其氧化型的胱氨酸存在。胱氨酸是由兩個(gè)半胱氨酸通過它們側(cè)鏈上的-SH氧化成共價(jià)的二硫橋連接形成的。注意:當(dāng)前第25頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)一、脂肪族氨基酸(酸性aa、酰胺)

天冬氨酸

Aspartate

α-氨基丁二酸D當(dāng)前第26頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

天冬氨酸

Aspartate天冬酰氨AsparagineN一、脂肪族氨基酸(酸性aa、酰胺)當(dāng)前第27頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)天冬氨酸

Aspartate天冬酰氨Asparagine谷氨酸

Glutamate

α-氨基戊二酸E一、脂肪族氨基酸(酸性aa、酰胺)當(dāng)前第28頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)天冬氨酸

Aspartate天冬酰氨Asparagine谷氨酸

Glutamate谷氨酰胺

Glutamine

Q一、脂肪族氨基酸(酸性aa、酰胺)當(dāng)前第29頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)天冬氨酸和谷氨酸是二羧基氨基酸,除了含有α-羧基外,天冬氨酸含β-羧基,谷氨酸含γ-羧基。生理?xiàng)l件下,二者呈酸性。天冬酰胺和谷氨酰胺分別是天冬氨酸和谷氨酸的酰胺化產(chǎn)物。盡管這兩個(gè)氨基酸的側(cè)鏈不帶電荷,但其極性很強(qiáng)。另外,這兩種氨基酸的酰胺鍵可以與其它極性氨基酸的側(cè)鏈上的原子形成氫鍵。注意:當(dāng)前第30頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)

精氨酸

Arginineα-氨基-δ-胍基戊酸R一、脂肪族氨基酸(堿性aa)當(dāng)前第31頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)精氨酸

Arginine賴氨酸

Lysine

α,ε-二氨基己酸K一、脂肪族氨基酸(堿性aa)當(dāng)前第32頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)精氨酸是堿性最強(qiáng)的氨基酸,側(cè)鏈上的胍基是已知堿性最強(qiáng)的有機(jī)堿,pKa值為12.48,生理?xiàng)l件下完全質(zhì)子化。賴氨酸的側(cè)鏈上含有一個(gè)氨基,側(cè)鏈氨基的pKa為10.53。生理?xiàng)l件下,Lys側(cè)鏈帶有一個(gè)正電荷(—NH3+),同時(shí)它的側(cè)鏈?zhǔn)?個(gè)C的直鏈,柔性較大,使側(cè)鏈的氨基反應(yīng)活性增大。注意:當(dāng)前第33頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)二、芳香族氨基酸

苯丙氨酸Phenylalanine(α-氨基-β-苯基丙酸)F當(dāng)前第34頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)二、芳香族氨基酸苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸Tyrosine

(α-氨基-β-對(duì)羥苯基丙酸)Y當(dāng)前第35頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)二、芳香族氨基酸苯丙氨酸Phenylalanine酪氨酸Tyrosine色氨酸

Tryptophan

(α-氨基-β-吲哆基丙酸)W當(dāng)前第36頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)三、雜環(huán)族氨基酸

組氨酸

Histidineα-氨基-β-咪唑基丙酸H當(dāng)前第37頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)三、雜環(huán)族氨基酸

組氨酸

Histidine脯氨酸

Prolineβ-吡咯烷基-α-羧酸P當(dāng)前第38頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)組氨酸含咪唑環(huán),咪唑環(huán)的pKa在游離氨基酸中和在多肽鏈中不同,前者pKa為6.00,后者為7.35,它是20種氨基酸中側(cè)鏈pKa值最接近生理pH值的一種,在接近中性pH時(shí),可離解平衡。它是在生理pH條件下唯一具有緩沖能力的氨基酸。脯氨酸是唯一的一種環(huán)狀結(jié)構(gòu)的氨基酸,它的α-亞氨基是環(huán)的一部分,因此具有特殊的剛性結(jié)構(gòu)。它在蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)中具有極重要的作用,一般出現(xiàn)在兩段α-螺旋之間的轉(zhuǎn)角處,Pro殘基所在的位置必然發(fā)生骨架方向的變化。注意:當(dāng)前第39頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)根據(jù)氨基酸側(cè)鏈的極性可以分為非極性氨基酸和極性氨基酸。極性氨基酸又可分為不帶電荷的極性氨酸、酸性氨基酸和堿性氨基酸。當(dāng)前第40頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)非極性氨基酸(八種)當(dāng)前第41頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)不帶電何的極性氨基酸(八種)當(dāng)前第42頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)帶負(fù)電荷的氨基酸(2種)當(dāng)前第43頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)帶正電荷的氨基酸(2種)當(dāng)前第44頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)有些蛋白質(zhì)中還含有少數(shù)特殊的氨基酸,稱為蛋白質(zhì)的稀有氨基酸。這些氨基酸都是正常氨基酸的衍生物,如彈性蛋白和膠原蛋白中的4-羥基脯氨酸和5-羥基賴氨酸;肌球蛋白和組蛋白中含有6-N-甲基賴氨酸;凝血酶原中存在γ-羧基谷氨酸;酪蛋白中存在磷酸絲氨酸;哺乳動(dòng)物的肌肉中存在N-甲基甘氨酸等。蛋白質(zhì)中的稀有氨基酸在遺傳上是特殊的,因?yàn)樗鼈儧]有三聯(lián)體密碼,所有已知的稀有氨基酸都是在蛋白質(zhì)合成后,在常見的氨基酸的基礎(chǔ)上經(jīng)過化學(xué)修飾而形成的。1.2.3不常見蛋白質(zhì)氨基酸和非蛋白質(zhì)氨基酸當(dāng)前第45頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)在各種組織和細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)約150種其它氨基酸,它們不存在于蛋白質(zhì)中,而是以游離或結(jié)合狀態(tài)存在于生物體內(nèi),所以稱為非蛋白質(zhì)氨基酸。這些氨基酸大多數(shù)是蛋白質(zhì)中存在的L-型α-氨基酸的衍生物,如鳥氨酸(ornithine)、瓜氨酸(citrulline)、高絲氨酸(homeserine)、高半胱氨酸等,但也有一些是β-、γ-或δ-氨基酸,如β-丙氨酸、γ-氨基丁酸。另外,還有些是D型氨基酸。這些氨基酸雖然不參與蛋白質(zhì)組成,但在生物體中往往具有一定的生理功能,如鳥氨酸和瓜氨酸是合成精氨酸的前體,β-丙氨酸是維生素泛酸的組成成分,γ-氨基丁酸是神經(jīng)傳導(dǎo)的化學(xué)物質(zhì)。植物中含有很多非蛋白質(zhì)氨基酸,其中有些具有特殊的生物功能,但大多數(shù)非蛋白質(zhì)氨基酸的功能還不清楚。當(dāng)前第46頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)1.3、氨基酸的酸堿化學(xué)氨基酸是個(gè)兩性電解質(zhì),既可進(jìn)行酸解離也可進(jìn)行堿解離,用解離方程式表示就是:Ka1Ka2當(dāng)前第47頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)氨基酸的離子狀態(tài)完全取決于溶液的pH值。如果調(diào)節(jié)溶液的pH值使得其中的氨基酸呈電中性,那么,我們就把這個(gè)pH值稱為氨基酸的等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)。pI是氨基酸的重要常數(shù)之一,它的意義在于,物質(zhì)在pI處的溶解度最小,這是分離純化蛋白質(zhì)或氨基酸的重要依據(jù)。當(dāng)前第48頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)甘氨酸的解離與等電點(diǎn)——滴定曲線當(dāng)前第49頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)當(dāng)甘氨酸在酸性溶液中,它是以帶凈的正電荷的形式存在的,可以看作是一個(gè)二元弱酸,具有兩個(gè)可解離的H+,即-COOH和-NH3+上的H+。根據(jù)上述甘氨酸的解離方程可得到:當(dāng)前第50頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)K1、K2為解離常數(shù),當(dāng)達(dá)到等電點(diǎn)時(shí),[Gly+]=[Gly-],即:則:K1K2=[H+]2方程兩邊取負(fù)對(duì)數(shù):pH=1/2*(PK1+PK2)當(dāng)前第51頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)例題:Gly的-NH3+有1/3解離時(shí),溶液的pH值?pH=pK2+lg([Gly-]/[Gly0])pH=9.6+lg(1/2)pH=9.3當(dāng)前第52頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)帶有可解離側(cè)鏈的氨基酸:Glu的滴定曲線:當(dāng)前第53頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)Lys的滴定曲線當(dāng)前第54頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)1.4氨基酸的特征化學(xué)反應(yīng)1、2,4-二硝基氟苯(DNFB)與氨基酸氨基的反應(yīng)(Sanger法鑒定多肽、蛋白質(zhì)的N末段氨基酸)當(dāng)前第55頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)2、苯異硫氰酸酯(PITC)與氨基的反應(yīng)。(Edman試劑,測(cè)定氨基酸序列)當(dāng)前第56頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)3、丹磺酰氯與氨基酸的反應(yīng)(生成熒光性強(qiáng)和穩(wěn)定的磺胺衍生物,常用于蛋白質(zhì)和氨基酸的微量分析)當(dāng)前第57頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)4、茚三酮與氨基酸的反應(yīng)(紙層析分離鑒定氨基酸,紫色產(chǎn)物)當(dāng)前第58頁(yè)\共有64頁(yè)\編于星期五\19點(diǎn)旋光性Gly無旋光,17個(gè)AA含一個(gè)不對(duì)稱碳原子,兩個(gè)含(Thr和

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