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實驗三的酶切第一頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二實驗原理限制性內(nèi)切酶能特異地結(jié)合于一段被稱為限制性酶識別序列的DNA序列之內(nèi)或其附近的特異位點上,并切割雙鏈DNA。第二頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二限制性內(nèi)切酶酶分子識別位點切割位點限制作用是否需用ATPⅠ類三亞基雙功能酶二分非對稱至少在識別位點外1000bpYesⅡ類內(nèi)切酶與甲基化酶分子不在一起4-6bp,大多數(shù)為回文對稱結(jié)構(gòu)

在識別位點中或靠近識別位點無特異性NoⅢ類二亞基雙功能酶5-7

bp非對稱在識別位點下游24-26bpYes限制性內(nèi)切酶可分為三類第三頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二Ⅱ類限制性內(nèi)切酶

Ⅱ類酶切割位點在識別序列中,有的在對稱軸處切割,產(chǎn)生平末端的DNA片段(如SmaⅠ:5‘-CCC↓GGG-3’);有的切割位點在對稱軸一側(cè),產(chǎn)生帶有單鏈突出末端的DNA片段稱粘性末端,如EcoRⅠ切割識別序列后產(chǎn)生兩個互補的粘性末端。

5'…G↓AATTC…3'→5'…GAATTC…3'3'…CTTAA↑G…5'→3'…CTTAAG…5'

第四頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二實驗材料和試劑實驗材料:玉米基因組DNA實驗試劑:BamHI酶及其酶切緩沖液:購買成品。SalI酶及其酶切緩沖液:購買成品。瓊脂糖(Agarose):進口或國產(chǎn)的電泳用瓊脂糖均可。

第五頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二實驗儀器恒溫水浴鍋第六頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二用手指輕彈管壁使溶液混勻,使溶液集中在管底混勻反應(yīng)體系后,37℃水浴保溫2-3h電泳檢測EP管編號實驗步驟反應(yīng)體系20μL酶液

DNA15μLBamHⅠ1μLSalⅠ1μL10×BufferT3μL第七頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二對質(zhì)粒DNA酶切反應(yīng)

限制性內(nèi)切酶用量可按標(biāo)準(zhǔn)體系1μgDNA加1單位酶,消化1-2h。但要完全酶解則必須增加酶的用量,一般增加2-3倍,甚至更多,反應(yīng)時間也要適當(dāng)延長。第八頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二電泳檢測示例第九頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二實驗注意事項限制性內(nèi)切酶用量可按標(biāo)準(zhǔn)體系1μgDNA加1單位酶,消化1-2h。但要完全酶解則必須增加酶的用量,一般增加2-3倍,甚至更多,反應(yīng)時間也要適當(dāng)延長。酶切時所加的DNA溶液體積不能太大,否則DNA溶液中其他成分會干擾酶反應(yīng)。許多實驗制備的DNA不易于降解,需適當(dāng)增加酶的使用量。反應(yīng)液中加入過量的酶是不合適的,除考慮成本外,酶液中的微量雜質(zhì)可能干擾隨后的反應(yīng)。市場銷售的酶一般濃度很大,為節(jié)約起見,使用時可事先用酶反應(yīng)緩沖液(1×)進行稀釋。另外,酶通常保存在50%的甘油中,實驗中,應(yīng)將反應(yīng)液中甘油濃度控制在1/10之下,否則酶活性將受影響。

第十頁,共十一頁,編輯于2023年,星期二思考題

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