酵母雙雜交(自激活)_第1頁
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文檔簡介

酵母雙雜交(自激活)第一頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五真核生物的轉(zhuǎn)錄因子是由兩個(gè)可以分開的、功能上相互獨(dú)立的結(jié)構(gòu)域(domain)組成的。一、原理酵母的轉(zhuǎn)錄激活因子GAL4,在N端有一個(gè)由147個(gè)氨基酸組成的DNA結(jié)合域(DNAbindingdomain,BD),C端有一個(gè)由113個(gè)氨基酸組成的轉(zhuǎn)錄激活域(transcriptionactivationdomain,AD)。第二頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五

GAL4分子的BD可以同上游激活序列(upstreamactivatingsequence,UAS)結(jié)合。

AD則能激活UAS下游的基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。單獨(dú)的BD和AD都不能激活UAS的下游基因,它們之間只有通過某種方式結(jié)合在一起才具有完整的轉(zhuǎn)錄激活功能。第三頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五第四頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五第五頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五His,β-gal第六頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五一般情況下,單獨(dú)的BD可以與GAL4上游活化序列(GALUAS)結(jié)合,但不能引起轉(zhuǎn)錄。然而,將一段具有轉(zhuǎn)錄激活活性的轉(zhuǎn)錄因子基因構(gòu)建到BD載體上,若其表達(dá)產(chǎn)生的BD單獨(dú)與UAS結(jié)合也可以引起下游報(bào)告基因的轉(zhuǎn)錄,那么就稱之為酵母雙雜中的自激活現(xiàn)象。反過來,可以利用這種自激活現(xiàn)象來驗(yàn)證某個(gè)轉(zhuǎn)錄因子是否具有轉(zhuǎn)錄激活活性。第七頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五His,β-gal自激活原理TranscriptionfactorsGAL4BD第八頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五YPDA液體500ml固體100ml蛋白胨10g2g酵母提取物5g1g瓊脂——2g0.2%ade10ml2ml葡萄糖10g2gYPDA培養(yǎng)基0.2gade定容至100ml→0.2%的ade母液pH6.5滅菌121℃15min第九頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五正對(duì)照:pGAL4負(fù)對(duì)照:pBD-GAL4第十頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五將-70℃下凍存的酵母菌在YPAD平板上劃線,倒置于30℃培養(yǎng)2-3天。挑取2-4個(gè)大菌落(直徑2-3mm)于1.5mlYPAD液體培養(yǎng)基中,劇烈震蕩5min,打散菌落,接種于50mlYPAD液體培養(yǎng)基中(250ml三角瓶),230-250轉(zhuǎn)/min,30℃培養(yǎng)18-24hr。取菌液測定其OD600值,需達(dá)到1.5。若不到,再培養(yǎng)1~2hr,若還不到,換單克隆重?fù)u。取50ml菌液于300mlYPAD培養(yǎng)基中(1-2L大三角瓶),30℃,230rpm,搖培3hr,至OD600值為0.4~0.6。4000rpm5min于常溫收集菌體,重復(fù)一次。室溫下1000g離心5min,去上清,加入50ml超純水清洗懸浮3次。1000g離心5min,棄上清,用新配的1.5ml1×TE/LiAc重懸細(xì)胞,置冰上,即成為酵母感受態(tài)細(xì)胞。(只能現(xiàn)做現(xiàn)用,不能貯存,室溫只能放置1-2hr)。酵母菌株感受態(tài)細(xì)胞制備:第十一頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五

酵母轉(zhuǎn)化鮭魚精DNA(20μg/μl)沸水中煮20min,冰上冷卻10min。加入100μl酵母感受態(tài)細(xì)胞、1~2μl構(gòu)建質(zhì)粒(約200ng)、100μg鮭魚精、600μlTE-LiAc-PEG,變速渦旋10s~1min至混勻。30℃,200rpm/min,恒溫?fù)u床振蕩30min。加入70μlDMSO,溫和顛倒混勻。42℃水浴熱休克15min,后冰浴10min。常溫下,3000rpm離心10s;棄上清(去干凈),用0.5ml1×TE重懸細(xì)胞。(1×TE室溫只能放置1~2hr)將轉(zhuǎn)化后的酵母培養(yǎng)于SD/-Trp培養(yǎng)基上,30℃倒置培養(yǎng)約3-5天,直至出現(xiàn)菌落。第十二頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五陽性克隆的篩選:將在SD/-Trp培養(yǎng)基上長出的酵母菌落轉(zhuǎn)移到SD/-His培養(yǎng)基上進(jìn)行篩選。30℃培養(yǎng)2天,檢查生長情況。對(duì)生長狀態(tài)較好的單克隆進(jìn)行β-半乳糖苷酶活性分析。第十三頁,共十五頁,編輯于2023年,星期五β-半乳糖苷酶活性分析(酵母克隆濾紙顯色分析)取2ml的Z緩沖液/X-gal溶液潤透2張濾紙;小心取一張濾紙覆蓋于生長有轉(zhuǎn)化子的平皿上,用涂布棒小心趕出氣泡,使濾紙盡可能與酵母菌接觸(1min);用一根針在濾紙上刺個(gè)小孔以標(biāo)記菌落位置,用鑷子輕輕取出濾紙,沾有菌的面朝上置液氮中10s,夾出濾紙,室溫解凍;重復(fù)3次;沾有菌的面朝上,緊貼于預(yù)先用Z緩沖液/X-gal溶液潤透過的那張濾

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