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文檔簡(jiǎn)介
WesternBlot技術(shù)專輯之膠電泳和轉(zhuǎn)膜
倒膠的儀器我們?cè)谇懊鎃esternBlot儀器之選已經(jīng)介紹過(guò)了,除了順手的工具能防止漏
膠,配膠的試劑和配方比例對(duì)電泳結(jié)果的質(zhì)量固然有打算性的影響,這個(gè)配膠的比例,在
《分子克隆》上有具體的論述,信任大家都不難查到。簡(jiǎn)潔無(wú)視的問(wèn)題主要在于過(guò)硫酸錢
(AP)肯定要穎一一最好用小指管配AP(寫日期)保存在-20度,超過(guò)2周的AP扔掉算了,
或者己經(jīng)反復(fù)翻開(kāi)使用屢次的AP都別用,小氣病發(fā)作的后果往往是得不償失
一膠凝不好多半是這里疏忽(或者混合不勻),由于相對(duì)配膠的其他組分,AP算最活潑分
子一一假設(shè)還有諸如漏加某組分或者配比錯(cuò)誤或者Buffer搞錯(cuò),那確定是你自己找罵,不
值得憐憫。水要用去離子的純水,MilliQ級(jí)更好。Cambrex(原來(lái)的FMC)有商品化的丙烯酰胺
母液,很貴,也很好一一配出的膠對(duì)200KD以上的蛋白的區(qū)分率高于一般膠,條帶清楚秀麗,
惋惜始終沒(méi)有搞清楚配方的奇特;但是數(shù)十倍于丙烯酰胺粉劑的價(jià)格令人卻步,不過(guò),對(duì)接觸丙烯
酰胺粉塵嚴(yán)峻過(guò)敏的人可以選擇這個(gè)。更加豪華的選擇是已經(jīng)凝好的預(yù)制膠,各種配方各種
比例各種梳孔大小多少任君選擇,翻開(kāi)即用,固然更直接便利,更吸引人的是結(jié)果秀麗,區(qū)
分率高,特別是重復(fù)性好,條帶真正是“razorsharp”??!尋常都能用這么豪華的東西心情
固然超爽啊,試驗(yàn)緊湊又輕松,效率也更高啊!假照試驗(yàn)都能這么“好馬配好鞍”,想必更簡(jiǎn)
潔出結(jié)果,也就更簡(jiǎn)潔拿經(jīng)費(fèi)吧!什么時(shí)候我們的試驗(yàn)才能實(shí)現(xiàn)這種良性循環(huán)?。nvitrogen
旗下的Norvex和Cambrex(原來(lái)的FMC)r都是首選預(yù)制膠。可是在“社會(huì)主義初級(jí)階段”這
種鋪張品尋常流流口水就算了,偏偏最近Invitrogen公司推出了的優(yōu)待活動(dòng),買3盒Nu預(yù)
制膠就送電泳儀或者電轉(zhuǎn)移,面對(duì)這種誘惑,你莫非就沒(méi)有一點(diǎn)非份之想的沖動(dòng)?
上樣電泳:上樣前蛋白樣品最好離心,上樣量不宜過(guò)多,以免看結(jié)果時(shí),每個(gè)條帶都彎彎地
“笑”你貪多嚼不爛哦。其他的操作,依據(jù)說(shuō)明把握電流,不要過(guò)多重復(fù)使用電泳Buffer
(別小氣,重復(fù)使用會(huì)降低緩沖力量的),好似根本不會(huì)出問(wèn)題了。當(dāng)預(yù)染的Marker告知
你,你要區(qū)分的蛋白已經(jīng)到達(dá)最正確區(qū)分區(qū)一一分別膠的2/3處,0K,電泳完畢了。
電泳結(jié)果檢查:假設(shè)要做WesternBlot,是否需要先檢查電泳結(jié)果呢?能先看看結(jié)果如何
再進(jìn)展下一步轉(zhuǎn)膜固然最好??捡R斯亮藍(lán)使用簡(jiǎn)便快速,可以區(qū)分lug左右的條帶,是最經(jīng)
濟(jì)通用的蛋白膠電泳染色方法。銀染操作簡(jiǎn)單一些但區(qū)分率高很多,可以區(qū)分2-5ng蛋白。
可是由于考馬斯亮藍(lán)染色或者銀染經(jīng)過(guò)固定不行逆結(jié)合,會(huì)干擾后面的WesternBlot
試驗(yàn),很多人會(huì)選擇省略掉這一步一一同樣的樣品跑2塊膠,一塊染色一塊轉(zhuǎn)膜,一般也可以
說(shuō)明問(wèn)題。假設(shè)想在轉(zhuǎn)膜前看看電泳結(jié)果,你需要用SYPROTangerine——這種金色熒光蛋白
染料靈敏度很高一一檢測(cè)4ng-8ng蛋白,接近銀染,但使用格外簡(jiǎn)潔,最重要的是由于不用酸
堿或者有機(jī)溶劑固定,不干擾蛋白活性,特別適合Western轉(zhuǎn)膜前的染色,或者非變性膠的活
性蛋白的檢測(cè)(比方染色后還需要在膠上進(jìn)展活性檢測(cè)等等)。惋惜SYPROTangerine價(jià)格
挺貴的,500ul(5000x)要2022元,即使很節(jié)約的用只夠或許100屢次呢。所以最經(jīng)濟(jì)實(shí)惠
的方法是:麗春紅S,直接染色轉(zhuǎn)移膜,檢測(cè)轉(zhuǎn)膜效果,充分脫色后不干擾Western結(jié)果。麗
春紅的檢測(cè)靈敏度和考馬斯亮藍(lán)差不多。
轉(zhuǎn)膜:經(jīng)過(guò)電泳分別后的蛋白質(zhì)樣品需要經(jīng)過(guò)“轉(zhuǎn)膜”步驟一一從膠轉(zhuǎn)移到膜上固定,才
能用各種方法進(jìn)展WesternBlot的檢測(cè)和顯色,而且為了防止沒(méi)有電場(chǎng)的狀況下已經(jīng)分別
的蛋白條帶集中,轉(zhuǎn)移要盡快進(jìn)展轉(zhuǎn)膜的首要是選膜。在轉(zhuǎn)移膜上顯色其實(shí)就像是畫家在畫布
上作畫一樣,不光要有好的畫筆和顏料,適合的畫布也是相當(dāng)之重要。WesternBlotting亦
是如此,沒(méi)有選擇好適宜的轉(zhuǎn)移膜是無(wú)法做出秀麗的結(jié)果的。因此,選擇適合的轉(zhuǎn)移膜,要
讓轉(zhuǎn)移“膜”高一尺,幫襯而不是阻礙到我們的試驗(yàn)。
WesternBlot印跡常用的轉(zhuǎn)移膜主要是硝酸纖維素膜(NitrocelluloseBlotting
Membranes,NO和PVDF膜(Polyvinylidene-Fluoride),此外也有用尼龍膜、DEAE纖
維素膜做蛋白印跡。具體哪種膜適合于哪些試驗(yàn)?zāi)??選擇的依據(jù)主要有:a.膜與目的蛋白分子
的結(jié)合力量(也就是單位面積的膜能結(jié)合蛋白的載量),以及膜的孔徑(也就是攔截蛋白的
大小);b.不影響后續(xù)的顯色檢測(cè)(也就是適和用于所選的顯色方法,信噪比好);c.假設(shè)
后繼試驗(yàn)有其他要求,比方要做蛋白測(cè)序或者質(zhì)譜分析,還要依據(jù)不同目的來(lái)選擇不同的轉(zhuǎn)移
膜,就像國(guó)畫要選擇宣紙,油畫要挑亞麻布或薄棉扣布一樣。
首先來(lái)比較下這幾種膜的特點(diǎn)
<?xml:namNC膜尼龍膜PVDF膜
espace
prefix=o
/>
靈敏度和分高高高
辨率
背景低較高低
125—200ug/cm2(適合于
結(jié)合力量80-110ug/cm2>400ug/cm2SDS存在下與蛋白質(zhì)的結(jié)
合)
材料質(zhì)地干的NC膜易脆軟而結(jié)實(shí)機(jī)械強(qiáng)度高
溶劑耐受性無(wú)無(wú)有
操作程序緩沖液潤(rùn)濕,避開(kāi)氣泡緩沖液潤(rùn)濕使用前100%甲醇潤(rùn)濕
常規(guī)染色,比較于NC膜,
常規(guī)染色,可用放射性和可用考馬斯亮藍(lán)染色,可
檢測(cè)方式不能用陰離子染料
非放射性檢測(cè)用于ECL檢測(cè),快速免疫
檢測(cè)。
0.45um一般蛋白低濃度小分子蛋
0.2um一分子量小于20kD白、酸性蛋白、糖
適用范圍蛋白蛋白和蛋白多糖糖蛋白檢測(cè)和蛋白質(zhì)測(cè)序
0.lum一分子量小于7kD蛋(主要用在核酸檢
白測(cè)中)
價(jià)格價(jià)格較廉價(jià)廉價(jià)較貴
1.硝酸纖維素膜
硝酸纖維素膜是蛋白印跡最廣泛使用的轉(zhuǎn)移介質(zhì),對(duì)蛋白有很強(qiáng)的結(jié)合力量,而且適用于
各種顯色方法,包括同位素,化學(xué)發(fā)光(Luminol類)、常規(guī)顯色、染色和熒光顯色;背景
低,信噪比高。NC膜的使用也很簡(jiǎn)便,比方不需要甲醛預(yù)處理,只要在無(wú)離子水面浸潤(rùn)排
出膜內(nèi)氣泡,再在電泳緩沖液中平衡幾分鐘就可以了;比方NC膜很簡(jiǎn)潔封閉,也不需要特
別嚴(yán)謹(jǐn)?shù)那逑礂l件。轉(zhuǎn)移到NC膜上的蛋白在適宜的條件下可以穩(wěn)定保存很長(zhǎng)時(shí)間,
Schleicher&Schull公司的一個(gè)試驗(yàn)說(shuō)明,轉(zhuǎn)移到NC膜上的幾種蛋白4度條件下保存5
年照舊保持免疫識(shí)別特性,照舊可以得到清楚可信的WesternBlot結(jié)果。不過(guò)要留意的是
純的硝纖膜在比較脆,又簡(jiǎn)潔卷,操作要留神,不適合用于需要屢次重復(fù)清洗的用途——因
為經(jīng)不起屢次“熬煎”。選擇硝纖膜時(shí)要留意的是選擇適宜的孔徑,通常20KD以上的大分
子蛋白用0.45um孔徑的膜,小于20KD的話建議選擇0.2um的,假設(shè)小于7KD的話最好選擇
0.luni的膜。另外還要留意選擇純的NC膜一一混有含醋酸纖維(CM)的NC膜結(jié)合力會(huì)有所
降低。另外提示一句:由于NC膜上結(jié)合的蛋白會(huì)由于一些去污劑而被代替,因此在封閉時(shí)
最好使用較溫存的Tween20,而且濃度不要超過(guò)0.3%(據(jù)說(shuō)0.05%效果最好)。
硝纖膜最為大家生疏和認(rèn)可的品牌就是Schleicher&Schull;Millipore;PALL,另外
羅氏、Invitrogen、GE(Amersham)>SantaCruz等公司都有供給各式的硝纖膜(估量OEM
的可能性比較大,不過(guò)有時(shí)挺驚異的,OEM的有時(shí)比生產(chǎn)廠家賣的還廉價(jià))。Schleicher&
Schull的名字拗口一一那或許需要舌頭在口腔里經(jīng)過(guò)假設(shè)干次不同弧度和不同速度的上下來(lái)
回準(zhǔn)確運(yùn)動(dòng)再協(xié)作適當(dāng)?shù)耐職獠拍茏x得準(zhǔn)確優(yōu)雅,不過(guò)作為第一個(gè)供給硝纖膜的廠家照舊廣為
人知,其NC膜分為純NC膜和強(qiáng)化NC膜兩種:Protrannitrocellulosemembrane和
Optitrannitrocellulosemembrane。前者Protran始終是Schleicher&Schul1驕傲的產(chǎn)
品,這種a100%PureNitrocelluloseMembranes"。一般而言,NC膜越純,其蛋白結(jié)合力
量就越高,所以要增加WB的靈敏度和區(qū)分率,提高所使用膜的純度是個(gè)可以考慮的選擇。假
設(shè)NC膜攙雜一些醋化纖維素——這在前面己經(jīng)提到,會(huì)影響蛋白質(zhì)結(jié)合。而Protran在制作過(guò)
程中去除了各種雜質(zhì),保證了其純度,從而增加了蛋白結(jié)合力量。除了這一點(diǎn)以外,Protran還有
低背景、多孔徑選擇(0.45,0.2,0.lum)和保存時(shí)間長(zhǎng)(試驗(yàn)證明膜上蛋白識(shí)別時(shí)間可長(zhǎng)
達(dá)5年!真是“路遙知馬力”的典范)等優(yōu)點(diǎn)。但是Protran由于是純NC膜,比較脆,機(jī)械
耐受力欠佳,需要留神操作,假設(shè)擔(dān)憂自己“粗手粗腳”,那么就可以考慮一下Optitran或
者Pall公司的以耐受力著稱的BioTraceNTNitrocelluloseTransferMembrane,
Optitran是在一層超薄聚酯支撐膜的兩面均勻鋪上100%純的硝酸纖維素,結(jié)果外表看
起來(lái)和純硝纖膜完全一樣,保持了NC膜各種優(yōu)點(diǎn),只是內(nèi)部多了一層中性支持物,大大增
加這種強(qiáng)化NC膜的柔韌度和機(jī)械耐受力,不簡(jiǎn)潔卷曲,便利操作,特別是重復(fù)標(biāo)記和洗脫
的試驗(yàn)。不過(guò)有的使用過(guò)的人反響不如純NC膜結(jié)合力量強(qiáng)。NC膜除了一般的Discs、Rolls
和Sheets以夕卜,像Invitrogen、Bio-Rad公司還有一種便利顧客使用的"sandwich”三明
治形,格外好玩。說(shuō)它好玩是由于考慮周到,利于高通量操作,但其實(shí)也就是將濾紙和NC
膜紙?zhí)壮蔀V紙一NC膜一濾紙的層迭形式,預(yù)先切割裝訂好,便利使用。不過(guò),卷膜確定是
最實(shí)惠的選擇,只不過(guò)要自己動(dòng)手裁剪——切記,必需帶手套操作。不知道為什么在國(guó)外硝
纖膜會(huì)被當(dāng)作危急品來(lái)運(yùn)輸還要加收運(yùn)費(fèi),所以貨期蠻長(zhǎng)的,所以還是卷膜好,一卷用n
年一一假設(shè)非要給這個(gè)n加個(gè)期限,那就是至少可以用到等我畢業(yè)之后。
2.PVDF膜
剛開(kāi)頭做WB的人或許會(huì)有這種疑問(wèn):為什么試驗(yàn)室的教師(或者師兄師姐們)在教我們
做WB的時(shí)候,假設(shè)是用PVDF膜做,總是留神翼翼的剪,節(jié)約著用,甚至一些邊邊角角也舍
不得丟掉呢?其實(shí),這不僅是由于PVDF膜比較貴,還由于PVDF膜是做WB的“殺手銅”。
聚偏二氟乙烯(PVDF)膜作為基質(zhì)的轉(zhuǎn)印膜由Millipore公司在1985年首先推出。與
硝酸纖維素膜相比,PVDF膜在蛋白質(zhì)截留力量,機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)相容性上都更優(yōu)越的性能
(Pluskal,etal.,1986).市售硝酸纖維素膜的典型結(jié)合量是80T00口g/cm2,而PVDF膜結(jié)
合量是100-200Mg/cm2(而結(jié)合強(qiáng)度PVDF比硝纖膜強(qiáng)6倍?。T诎滩《荆℉IV)血清
學(xué)檢驗(yàn)中直接比較PVDF和硝酸纖維素膜,PVDF膜具有更好的截留總HIV抗原力量并提高抗
體檢測(cè)糖基化被膜抗原的性能。但是PVDF膜最大的優(yōu)點(diǎn)不僅于此:更好的機(jī)械強(qiáng)度和化學(xué)
耐受性使PVDF膜在各種染色應(yīng)用和多重免疫檢測(cè)中成為抱負(fù)選擇;而且單個(gè)凝膠的泳道復(fù)
本可用于多種目的,如考馬斯亮藍(lán)染色后切出條帶并進(jìn)展N-末端測(cè)序、蛋白消化/肽分別/
內(nèi)部測(cè)序和免疫檢測(cè)(Kurien,etal.,2022)?特別是需要做N端蛋白測(cè)序,在相當(dāng)“嚴(yán)酷”
的清洗條件下,當(dāng)尼龍或者硝纖膜已經(jīng)降解的狀況下PVDF膜照舊保持本色,笑傲江湖。所
以PVDF也是要做蛋白測(cè)序的唯一選擇。此外,個(gè)人閱歷,一些強(qiáng)疏水蛋白用PVDF膜效果會(huì)更
好一些。PVDF膜適用的檢測(cè)方法也不少,化學(xué)發(fā)光、常規(guī)顯色、同位素和標(biāo)準(zhǔn)染色都一樣
0K,但不適合熒光。PVDF膜特別留意的是需要100%甲醇預(yù)處理(不超過(guò)15秒)再用緩沖液
平衡,才能用,而且適用過(guò)程中萬(wàn)一干了也要同樣程序再處理(不過(guò)要真消滅這種問(wèn)題也是自
己欠扁,誰(shuí)要你不留神呢,轉(zhuǎn)膜前處理也就罷了,轉(zhuǎn)膜后再這樣處理可能會(huì)影響后繼的抗體識(shí)
別呢)。PVDF膜同樣分0.45um和0.2um的,后者孔徑小,對(duì)小分子蛋白有較好的攔截吸附,
背景可能會(huì)比前者稍高。
PVDF膜常見(jiàn)的有以下幾個(gè)品牌
口
公司產(chǎn)口口X名/孔徑適用范圍參考價(jià)格
MilliporeImmobilonTransfer0.45um$212
Membranes0.2urn
Bio-RadImmun-BlotPVDFChemiluminescent,
Membranecolorimetricwestern
blots,
amino-terminal
sequenceandtotal
aminoacid
composition
PiercePVDFMembrane0.45umWestern,Southern,
0.2umNorthern,anddot
blots
PallLifeBioTracePVDFTransfer0.45umNucleicacidand$149
ScienceMembraneproteintransfers.
Proteinsequencing
InvitrogenPVDFMembrane0.45umProteinsequencing,¥1625.8
0.2urnimmunoblotting
WhatmanWestranClearSignal0.45umWesternblots
PVDFMembrane
作為PVDF膜的鼻祖,Millipore公司的PVDF膜Immobilon系列分為Immobilon-P
(0.45um),-PSQ(O.2um),-FL(用于熒光顯色)和BlottingSandwichesforHighTroughput
四種。Immobilon-P膜孔徑均一,具有極強(qiáng)的吸附力量,染色性能好、抗溶劑力量強(qiáng)和信噪
比高,有助于提高檢測(cè)靈敏度,而且開(kāi)放的孔構(gòu)造簡(jiǎn)潔接近被吸附的蛋白質(zhì),并有助于去除背
景上沒(méi)有吸附的探針,可以說(shuō)是免疫印跡檢測(cè)抱負(fù)的印跡膜。Immobilon-PSQ轉(zhuǎn)印膜是印跡小
分子蛋白質(zhì)(<20KDa)的抱負(fù)選擇一一優(yōu)良的蛋白質(zhì)吸附性能,滲漏少。內(nèi)外表面積較大,
可供蛋白質(zhì)吸附從而提高蛋白質(zhì)測(cè)序的得率。由于不含污染性支撐物或外表活性劑,
Immobilon-PSQ層析譜上的背景峰值微小。Immobilon-FL也是Millipore值得傲慢的產(chǎn)品,
由于這是第一個(gè)特地為熒光顯色優(yōu)化的轉(zhuǎn)移膜。通過(guò)試驗(yàn)證明,這種膜在Kodak成像系統(tǒng)可以
顯示僅7ng的蛋白,聽(tīng)起來(lái)不錯(cuò)吧,有興趣可以試一試。這幾種膜除了一般的PVDF膜的優(yōu)點(diǎn)
之外,最大特點(diǎn)就是一個(gè)字快。依據(jù)Millipore的操作手冊(cè),Immobilon可以在保
證質(zhì)量的前提下縮短福時(shí)間到2個(gè)小時(shí)一一主要是縮短封閉和洗脫時(shí)間。這可真是個(gè)好消息,
由于坐在那兒等WB結(jié)果多鋪張時(shí)間啊!縮短這個(gè)費(fèi)時(shí)而枯燥的過(guò)程,早出結(jié)果,可以提高試
驗(yàn)效率,利于我們分析試驗(yàn)結(jié)果,考慮下步對(duì)策嘛。卷膜經(jīng)濟(jì)實(shí)惠,裁剪剩下的邊角料還可以
用來(lái)做點(diǎn)雜交,而預(yù)裁剪的即用膜更適合高通量等等''用金錢換時(shí)間”的試驗(yàn)。再次強(qiáng)調(diào)的是,
疏水PVDF膜在用前必需經(jīng)過(guò)50%或以上體積比的甲醇或者乙醇溶液處理幾分鐘,待膜變成半
透亮后用MilliQ水或者純水漂洗一下,轉(zhuǎn)入電泳緩沖液平衡才能用。
Invitrogen公司的PVDF膜也有大家風(fēng)范:膜是與兩張預(yù)裁的濾紙同時(shí)供給,便利使用;雖
然一般而言0.2um的膜滲漏少適用性會(huì)更強(qiáng),但I(xiàn)nvitrogen的0.45umPVDE膜自有自家優(yōu)
勢(shì)——特別適合于低背景,高敏感度的印跡反響,同樣需要在乙醇或者甲醇,或者異丙醇中浸
泡5分鐘就可以用了。
3.尼龍膜
尼龍膜更多是用于核酸的轉(zhuǎn)移,也有見(jiàn)于蛋白印跡,比方dotblot,比較于NC膜來(lái)說(shuō),
它的優(yōu)點(diǎn)是結(jié)合力強(qiáng),特結(jié)實(shí)又松軟且不易卷曲,機(jī)械強(qiáng)度大,便于操作,缺點(diǎn)是背景高——由于
尼龍膜電荷密度高,使得非結(jié)合區(qū)的封閉比疏水性NC膜困難,對(duì)于靈敏度高的檢測(cè)方法,背
景問(wèn)題尤為突出(據(jù)分子克隆HI說(shuō)通過(guò)熱處理的酪蛋白和1%聚乙烯毗咯烷酮延長(zhǎng)封閉時(shí)間
可以改善),而且當(dāng)轉(zhuǎn)移緩沖液中存在有SDS時(shí)蛋白質(zhì)就簡(jiǎn)潔從尼龍膜上泄漏(通過(guò)甲醛固定
可以緩解這一狀況)。另外至今也沒(méi)有適合尼龍膜上的直接染色方法。因此在許多狀況下試
驗(yàn)室人員進(jìn)展邨試驗(yàn)不選擇尼龍膜。
盡管如此,一些產(chǎn)品卻能“取其精華,去其糟粕”,將尼龍膜一些不利于蛋白印跡的因素
縮小或者去除,使其成為有效的蛋白轉(zhuǎn)移介質(zhì)。比方說(shuō),化學(xué)發(fā)光底物做得相當(dāng)精彩的
Pierce公司,其旗下的BiodyneA&BNylonTransferMembrane就是這樣一"^產(chǎn)品。這種
分為A,B兩型的尼龍膜做工精良,孔徑大小全都,為了保有尼龍膜高靈敏度的優(yōu)點(diǎn)和摒棄
背景影響大的缺點(diǎn),Biodyne承受了適宜的signalto-noise比例來(lái)調(diào)整,從而到達(dá)了
200ug/cm2的蛋白結(jié)合力量,同時(shí)有比大多數(shù)尼龍膜甚至比一些NC膜都要小的低背景。除此
之外,B型的Biodyne對(duì)于一些帶負(fù)電蛋白是一種抱負(fù)的轉(zhuǎn)移膜,由于它在A型的根底上提
高了正電荷集團(tuán)的濃度。另外Biodyne相對(duì)于NC膜來(lái)說(shuō)還是一種“打不怕,撕不爛,燒不
著(200℃一下)”的“堅(jiān)韌”的轉(zhuǎn)移膜。
二、SDS-聚丙烯酸胺凝膠電泳(SDS-)
A:實(shí)際操作
1.做膠前的預(yù)備
1)檢查是否有足夠的、干凈的spacer、comb和架子。
2)檢查是否有穎的,足量10%APS,沒(méi)有馬上重配。
3)按將要檢測(cè)的抗體對(duì)應(yīng)的原始抗原的分子量大小,計(jì)算出膠的濃度,并算出分別膠各組分的用
量。
2.制膠,電泳
1)裝好架子。
2)依據(jù)下面配方配制分別膠。(單位:ml,Total:8ml)
7.5%10%15%
2XSep.buffer444
30%Gel.sol2.02.74
ddH201.91.20
TEMED8ul8ul8ul
10%APS80ul80ul80ul
在膠上面參加一層蒸鐲水,促進(jìn)膠更好的凝集。
3)待分別膠凝集后,配制濃縮膠。(單位:ml,Total:3.5ml)
3%
2XStacking.buffer1.7
30%Gel.sol0.35
ddHO1.4
TEMED5ul
10%APS50ul
倒好后插入預(yù)先預(yù)備好的梳子。
4)待膠凝集好后,上樣,電泳。上層膠用60-80V電壓,當(dāng)樣品至分別膠時(shí),用100-120V
電壓。一般電泳時(shí)間在1.5小時(shí)左右。
B:留意事項(xiàng)及常遇到的問(wèn)題
1)分別膠不要倒的太滿,需要有肯定的濃縮膠空間,否則起不到濃縮效果。
2)上樣蛋白量不應(yīng)超過(guò)30ug/nw(載荷面即:假設(shè)你的膠槽是5mmX1mm,則載荷面為:
ImmX5mm=5mm2)。
3)gel通常在0.5-lh內(nèi)凝集最好,過(guò)快表示TEMED.APS用量過(guò)多,此時(shí)膠太硬易龜裂,
而且電泳時(shí)簡(jiǎn)潔燒膠。太慢則說(shuō)明兩種試劑用量不夠或者系統(tǒng)實(shí)際不純或?qū)嵭А?/p>
4)混合攪拌速度太快產(chǎn)生氣泡影響聚合,導(dǎo)致電泳帶畸形。太慢不均勻,特別是甘油。
5)電泳中常消滅的一些現(xiàn)象:
-條帶呈笑臉狀,緣由:凝膠不均勻冷卻,中間冷卻不好。
條帶呈皺眉狀,可能是由于裝置不適宜,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或
者兩邊聚合不完全。
拖尾:樣品溶解不好。
紋理(縱向條紋):樣品中含有不溶性顆粒。
條帶偏斜:電極不平衡或者加樣位置偏斜。
條帶兩邊集中:加樣量過(guò)多。
三、轉(zhuǎn)移
在電流的作用下,使蛋白質(zhì)從膠轉(zhuǎn)移至固相載體(膜)上。
膜的選擇:印跡中常用的固相材料有NC膜、DBM、DDT、尼龍膜、PVDF等。我們選用PVDF
(聚偏二氟乙烯),其具有更好的蛋白吸附、物理強(qiáng)度,以及具有更好的化學(xué)兼容性。有兩
種規(guī)格:Immobilon-P(0.45um)和Immobilon-PSQ(0.2umforMW<20kDa)=
A半干法
馬上凝膠夾層組合放在吸有轉(zhuǎn)印緩沖液的濾紙之間,通過(guò)濾紙上吸附的緩沖液傳導(dǎo)電
流,起到轉(zhuǎn)移的效果。由于電流直接作用在膜膠上,所以其轉(zhuǎn)移條件比較嚴(yán)酷,但是其轉(zhuǎn)移
時(shí)間短,效率高。
1試驗(yàn)條件的選擇
電流lmA-2mA/cm2,我們通常100mA/膜,依據(jù)目的蛋白分子大小、膠濃度選擇轉(zhuǎn)移時(shí)間,
具體可以依據(jù)實(shí)際適當(dāng)調(diào)整。
目的蛋白分子大小(kDa)膠濃度轉(zhuǎn)移時(shí)間(h)
80——1408%1.5-2.0
25——80101.5
15—40120.75
<20150.5
2試驗(yàn)操作
(1)濾紙和膜的預(yù)備(在電泳完畢前20分鐘應(yīng)開(kāi)頭預(yù)備工作)。
A.檢查是否有足夠的transferbuffer,沒(méi)有馬上配制。
B.檢查是否有適宜大小的濾紙和膜。
C.將膜泡入甲醇中,約1-2分鐘。再轉(zhuǎn)入transferbuffer中。
D.將適宜的靠膠濾紙和靠膜濾紙分別泡入transferbuffer中。
(2)轉(zhuǎn)移
A.在電轉(zhuǎn)移儀上鋪好下層濾紙。一般用三層。
B.將膜鋪在靠膜濾紙上,留意和濾紙間不要有氣泡,再倒一些transferbuffer到
膜上,保持膜的潮濕。
C.將膠剝出,去掉stackgel,留神的移到膜上。
D.剪去膜的左上角,在膜上用鉛筆標(biāo)記出膠的位置。
E.將一張靠膠濾紙掩蓋在膠上。倒上些transferbuffer,再鋪兩張靠膠濾紙。
F.裝好電轉(zhuǎn)移儀,依據(jù)需要選定所需的電流和時(shí)間。
G.轉(zhuǎn)移過(guò)程中要隨時(shí)觀看電壓的變化,如有特別應(yīng)準(zhǔn)時(shí)調(diào)整。
CATHODE(-)
F#efPaper/
CathooeBufler
SDSgel
TrarsferMembrjMe
FilterPaper/
AnodeII
RltecPaper/
AnodeBirfterI
Fig.1.Semi-drytransle?stack0ssem附
3留意事項(xiàng)及常遇到的問(wèn)題
1)濾紙、膠、膜之間的大小,一般是濾紙>=膜>=膠。
2)濾紙、膠、膜之間千萬(wàn)不能有氣泡,氣泡會(huì)造成短路。
3)由于膜的疏水性,膜必需首先在甲醛中完全浸濕。而且在以后的操作中,膜也必需
隨時(shí)保持潮濕(干膜法除外)。
4)濾紙可以重復(fù)利用,上層濾紙(靠膜)內(nèi)吸附有很多轉(zhuǎn)移透過(guò)的蛋白質(zhì),所以上下
濾紙肯定不能弄混,在不能區(qū)分的狀況下,可以將靠膠濾紙換的。
5)轉(zhuǎn)移時(shí)間一般為1.5小時(shí),(1mA-2mA/cm2,10%gel),可依據(jù)分子量大小調(diào)整轉(zhuǎn)移時(shí)間
和電流大小。
B濕法
我們根本上不用此方法,這里暫不做介紹。
C轉(zhuǎn)移后效果的鑒定
1.染膠
用考馬斯亮蘭染色經(jīng)destain脫色后,看膠上是否還有蛋白來(lái)反映轉(zhuǎn)移的效果。
2.染膜
有兩類染液選擇,可逆的和不行逆的。可逆的有ponceau-sred、FastgreenFC^CPTS
等,這類染料染色后,色素可以被洗掉,膜可以用做進(jìn)一步的分析用。但是不行逆的染料,
如考馬斯亮蘭、indiaink、Amido.black10B等,染色后膜就
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