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文檔簡介

Resting-statefMRI:

DataProcessing嚴(yán)超贛Ph.D.Candidateycg.

?2008SKLCNL嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingOutline

預(yù)處理

ALFF,ReHo,FC計(jì)算統(tǒng)計(jì)結(jié)果呈現(xiàn)文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

數(shù)據(jù)整理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing數(shù)據(jù)整理被試信息整理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing數(shù)據(jù)整理被試信息整理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing數(shù)據(jù)整理被試信息整理原始數(shù)據(jù)整理靜息功能數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)DTI數(shù)據(jù)嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing數(shù)據(jù)整理被試信息整理原始數(shù)據(jù)整理靜息功能數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)DTI數(shù)據(jù)嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingDICOM->NIFTIMRIcroN’sdcm2niiguiSPM5’sDICOMImport嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingSliceTimingWhy?嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingSliceTimingWhy?Huetteletal.,2004嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingSliceTiming1:2:33,2:2:323322-(2/33)33嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingSliceTiming嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingRealignWhy?嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingRealign嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingRealign檢查頭動(dòng)?b=load(‘rp_name.txt’);c=max(abs(b));c(4:6)=c(4:6)*180/pi;嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingNormalizeWhy?Huetteletal.,2004嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingmean_name.imgr*.imgEPI.nii-90-126-72;9090108333嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingNormalize嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingSmoothWhy?減少被試間的空間結(jié)構(gòu)差異;有利統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)的有效性;嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingw*.img平滑核Smooth嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing去線性漂移嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing預(yù)處理

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Filter:0.01-0.08嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing濾波Why?關(guān)心低頻的活動(dòng)嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing濾波嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingOutline

預(yù)處理

ALFF,ReHo,FC計(jì)算統(tǒng)計(jì)結(jié)果呈現(xiàn)文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingALFFZangetal.,2007嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingALFF嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingReHo注意:預(yù)處理時(shí)不做平滑,計(jì)算完ReHo后再進(jìn)行平滑。Zangetal.,2004嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingReHo嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing功能連接提取協(xié)變量

頭動(dòng)參數(shù):rp_name.txt

全腦信號、腦脊液、白質(zhì)信號嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing提取協(xié)變量嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing提取協(xié)變量嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing提取協(xié)變量嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing提取協(xié)變量嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing提取協(xié)變量嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing提取協(xié)變量嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing提取協(xié)變量嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing功能連接提取協(xié)變量

頭動(dòng)參數(shù):rp_name.txt

全腦信號、腦脊液、白質(zhì)信號協(xié)變量組合:RPCov=load('rp_name.txt');BCWCov=load('ROI_FCMap_name.txt');Cov=[RPCov,BCWCov];save('Cov.txt','Cov','-ASCII','-DOUBLE','-TABS');嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing功能連接Voxel-wiseROI-wiser=0.36嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingVoxel-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingVoxel-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingVoxel-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingVoxel-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingVoxel-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingVoxel-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingVoxel-wise1by1Cov.txt嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingROI-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingROI-wise嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingROI-wise1by1Cov.txt嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingOutline

預(yù)處理

ALFF,ReHo,FC計(jì)算統(tǒng)計(jì)結(jié)果呈現(xiàn)文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing統(tǒng)計(jì)單樣本T檢驗(yàn)雙樣本T檢驗(yàn)嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing單樣本T檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)準(zhǔn)備

ALFF:mALFFReHo:smReHoFC:zFC嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing單樣本T檢驗(yàn)mALFF-1,smReHo-1m圖像1by1i1-1嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing單樣本T檢驗(yàn)m*-1圖像;zFC圖像存放SPM.mat的目錄嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing單樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing單樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat1嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing單樣本T檢驗(yàn)HeightthresholdT=2.687659{p<0.05(FDR)}Extentthresholdk=10voxelsspmT_0001.imgPD_1T.img準(zhǔn)備制作雙樣本T檢驗(yàn)的MASK嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing雙樣本T檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)準(zhǔn)備

ALFF:mALFFReHo:smReHoFC:zFCMask嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing雙樣本T檢驗(yàn)MaskMask=PD_1T.img+CON_1T.img>0PD_1T.imgCON_1T.imgMask_2T.imgi1+i2>0嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing雙樣本T檢驗(yàn)兩組的m*圖像;zFC圖像存放SPM.mat的目錄Mask_2T.img嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing雙樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing雙樣本T檢驗(yàn)上一步生成的spm.mat1-1嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing雙樣本T檢驗(yàn)HeightthresholdT=Inf{p<0.05(FDR)}Extentthresholdk=0voxelsspmT_0001.img嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingOutline

預(yù)處理

ALFF,ReHo,FC計(jì)算統(tǒng)計(jì)結(jié)果呈現(xiàn)文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)SPM5xjviewrest_sliceviewerMRIcroN嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)—SPM5嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)—SPM5嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)—xjview嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)—xjview嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)—rest_sliceviewer嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)—MRIcroN嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing結(jié)果呈現(xiàn)—MRIcroN嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessingOutline

預(yù)處理

ALFF,ReHo,FC計(jì)算統(tǒng)計(jì)結(jié)果呈現(xiàn)文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)處理DataProcessing文獻(xiàn)管理嚴(yán)超贛的靜息態(tài)數(shù)據(jù)

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