設置對接的柔性殘基教學課件

設置對接的柔性殘基56、死去何所道，托體同山阿。57、春秋多佳日，登高賦新詩。58、種豆南山下，草盛豆苗稀。晨興理荒穢，帶月荷鋤歸。道狹草木長，夕露沾我衣。衣沾不足惜，但使愿無違。59、相見無雜言，但道桑麻長。60、迢迢新秋夕，亭亭月將圓。設置對接的柔性殘基設置對接的柔性殘基56、死去何所道，托體同山阿。57、春秋多佳日，登高賦新詩。58、種豆南山下，草盛豆苗稀。晨興理荒穢，帶月荷鋤歸。道狹草木長，夕露沾我衣。衣沾不足惜，但使愿無違。59、相見無雜言，但道桑麻長。60、迢迢新秋夕，亭亭月將圓。蛋白質與酶分子的設計與改造配體和受體的分子對接實驗第5小組配體和受體的分子對接實驗就是通過計算機及相應的軟件來模擬受體與配體的分子對接過程,以及結果的分析?？谡Z交際課是小學語文新教材的一種新課型，它不僅要求在課堂教學中訓練每個學生傾聽和說話的能力，而且要求在口語交流中培養(yǎng)語言交際能力。低年級是基礎，如果不能在這個時間段很好的培養(yǎng)學生的這種能力，肯定會影響學生將來的學習、生活和交際能力。那么如何在農村課堂教學中進行有效的口語教學，讓學生暢所欲言，一吐為快，妙語如珠呢？結合這幾年來的教學實踐，我認為可以從以下幾個方面入手：一、營造良好氛圍，實施有效交際農村小學生口語交際能力比較欠缺，我們的教學只有根據(jù)新課標的要求來設計教學方法和探求教學教學途徑，才能做到有的放矢，達到事半功倍的效果。1．開發(fā)資源,整合教材，挖掘交際內容對學生進行口語交際訓練，首先要依托語文教材。人教版低年級教材，在口語交際方面，每單元都設置了專門的口語交際課，其訓練內容富有童趣而且貼近兒童生活，是很好的交際話題。但每單元只有一至兩課時，這樣必定會使訓練面有限。要解決這個矛盾，就要充分利用課文中的資源，創(chuàng)造性地利用教材，挖掘交際話題。2.營造民主氛圍，消除學生畏說心理學生有比較強的自尊心，他們害怕說話不當、舉止失措而當眾出丑，害怕一旦說錯就被同學嗤笑、被老師批評，這些問題成為不少學生口語交際中的心理陰影。因此，保護學生口語交際的自尊心、自信心至關重要。二、拓寬交際渠道，豐富語言源泉生活是學生口語交際內容的源頭活水，只有在生活的泉源里才能激發(fā)學生口語交際的激情。因此，教師要善于捕捉現(xiàn)實生活中的精彩畫面，創(chuàng)設交際情境，讓學生進行口語交際訓練，讓每個學生參與其中,在動態(tài)的口語交際實踐中反復經(jīng)歷、體味,提高思維的敏捷性、邏輯性、深刻性和語言表達的規(guī)范性、條理性、機敏性,從而獲得真知,增強能力,逐步形成良好的語言習慣和交際態(tài)度。1.構建雙向互動，多向交流的口語交際模式口語交際是一種雙向互動的語言活動。在口語教學過程中，雙方直接交流交流，不斷互換聽說的角色，可以是學生說，學生補充；學生問，學生答。也可以是學生說，老師補充；學生問，教師答。還可以是老師說，學生補充；老師問，學生答。要使課堂上充盈著輕松、愉悅的氣氛和雙向互動的語言交流活動。教師可組織同桌之間、前后座之間、小組同學之間，通過說、問、評、比、演等方法，進行討論、交流，相互促進、相互提高。2.親身經(jīng)歷,模擬表演生活是口語交際的源泉。再現(xiàn)生活中的情境,讓學生置身于模擬的情境中觀察、說明,是增強學生體驗、激發(fā)思維和口頭表達的環(huán)境條件和動力源。有一次，個別調皮的男生居然在學習氛圍濃厚的小學校園里放鞭炮取樂。我們苦口婆心的勸告：人的健康，人的生命是最寶貴的，在放鞭炮的過程不小心傷到了自己或者其他人就危險了。然而個別男生聽了依然無動于衷。于是我猛然想到，何不充分利用語文教學的優(yōu)勢來集思廣益？第二天的口語教學課上，我就給學生布置了這樣一個作業(yè)：有個別調皮的男生在校園放鞭炮，嚴重影響其他同學休息和學習。假如你老師，你該如何批評教育他們？請把你要批評的話說出來。學生一聽幫老師解決問題,思維活躍紛紛說出許多見解。這樣一下子進入了問題情境,把口語交際回歸到生活體驗,打開學生的話匣子,學生就會產(chǎn)生積極的交流欲望。三、規(guī)范語言,培養(yǎng)交際習慣農村孩子所處的社會環(huán)境特別是家長素質的影響,使小學生存在著一些不良的交際習慣，同時，方言的大量使用給學生的交際帶來極大地阻礙。一部分在學生在交際時出現(xiàn)了不會說的現(xiàn)象，致使說話時磕磕巴巴、詞不達意。發(fā)展、規(guī)范語言是一項艱巨的任務，必須在實際實踐中規(guī)范語言，在互動中培養(yǎng)學生學會傾聽的良好習慣。1.師生互動，規(guī)范語言教師是課堂的組織者，更是學生的學習的引導者和合作者。在口語交際過程中教師必須從“說話能力”上對學生的言語進行指導、修正，并做好典范。2.善于引導,培養(yǎng)交際習慣只有“認真傾聽”才能了解對方“講話的內容”,弄清自己“不理解的地方”,才能向對方請教;請教時,如果出現(xiàn)不同意見,就要“與人商討”,以求問題的解決。所以,培養(yǎng)學生學會傾聽至關重要。四、關注過程，重視評價口語交際教學除了分年段對學生進行知識、能力、情感等目標的評價外，還應重視在教學中及時評價。教師不但要在學生發(fā)言過程過程中注重及時評價，還應讓學生成為評價的主體，培養(yǎng)他們的參與意識，從而獲得知識，提高能力。1.言語賞識多一些表揚,少一些批評,把相信人人能成功的期望傳達給每個學生。如看到學生忘了說什么時,教師可耐心地說:“別著急,慢慢說”;當學生疙疙瘩瘩說不清楚時,教師可說:“老師聽明白了,我再幫你說一說”;當學生發(fā)言膽怯時,教師可說:“你講得很棒,能不能說得再響亮些,讓同學們學習學習?”這樣才讓學生有表達自信心。2.重視學生自評和互評在課堂教學中，教師要經(jīng)常把對學生的評價換成學生對學生的評價。如“請大家仔細聽，這位同學讀得怎么樣？”“請大家評一評剛才某同學的回答”等等，小學生參與評價，從內容上說，一是評價交際的語言是否清楚明白；二是評價交際的習慣（說話姿勢、心理因素、普通話是否標準）。這是對學生口語交際信心的激發(fā)和對口語交際技能的強化訓練?？傊?，培養(yǎng)學生的口語交際能力，是一項長期的教學實踐活動，口語交際的訓練任重而道遠。我們只有在教學實踐中不斷探討、研究,認清其實質,準確把握教材，合理利用教材，創(chuàng)造寬松、愉悅的交際環(huán)境，才能摸索、總結出科學的、行之有效的農村口語交際的教學對策,以提高低年級學生的口語交際能力。隨著我國新一輪課改的進行，思想品德教學應當逐漸從過去“滿堂灌”的教學方式轉變?yōu)樽⒅貙W生生活經(jīng)驗和社會實踐的聯(lián)系，促進正確思想觀念和良好道德品質的形成和發(fā)展的一種教育教學方式。教師在新課改的大環(huán)境中應當開展各種豐富多彩的活動，不斷擴展學生的知識技能，完善知識結構。然而，任何事物都具有兩重性，課堂活動固然具有其優(yōu)勢，但一些教師在課堂互動環(huán)節(jié)中設計不當，師生之間的互動同樣會產(chǎn)生各種問題。關于初中思想品德課堂教學中師生互動的探究顯得尤為重要。一、師生課堂互動中存在的問題1、脫離教學目標。新課程改革強調培養(yǎng)和提高學生的自主探究的能力，師生互動無疑是課堂上達成這一目標的有效形式。但是，現(xiàn)階段初中思想品德課堂教學中大部分活動設計往往沒有依據(jù)教學內容和學生的認知特點來制定。而且，教師在課堂中設計的互動環(huán)節(jié)如果不考慮活動內容與教學目標的有效結合，僅僅為活動而活動的話，課堂的教學意義很難得不到體現(xiàn)。另一方面，初中生已具備觀察社會、討論時事政治的能力，一旦教師為組織簡單的問題組織一場討論，課堂設計的科學性和合理性就難以凸顯出來。2、互動形式單一。現(xiàn)階段，由于對互動的認識不足，一些教師在教學師生互動中容易走向兩種極端。一種互動設計形式單一、缺乏變化，全部采用“你問我答”的方法。這種教學形式雖然能夠得到有效直觀的教學反饋，但一味地采用這種方法，學生產(chǎn)生厭煩情緒，影響教學效果。另一種則是活動過于繁雜，在課堂活動中教師沒有起到主導作用反而充當為“導演”，小品、辯論、才藝表演、討論輪番上陣。課堂表面上的熱鬧不僅不能提高學生的思想道德修養(yǎng)，教師角色的錯位也會對學生造成一定的負面影響。3、過度依賴多媒體教學?，F(xiàn)代教學技術為教師在教學過程中提供了更為直觀形象的展現(xiàn)。就思想品德課教學來說，其能將抽象枯燥的理論演繹為活潑生動的畫面，增強課程的德育功能。但是，多媒體教學只是教學的一種輔助手段，師生之間的活動應該更強調口頭語言和肢體語言之間的信息傳遞?，F(xiàn)階段，有些教師在多媒體教學的應用中存在不恰當使用的情況。例如在案例教學中，教師將案例內容和最后啟發(fā)式思考結果均設計進課件。教師向學生展現(xiàn)案例時，往往不等學生充分思考，案例的啟發(fā)結論已躍然而出。這種方式完全抑制了學生獨立思考的能力。其次，部分教師存在“輕板書，重特效”的問題。為追求課件的美觀活潑，在課件中添加大量的FLASH特效，雖然凸顯出新奇不同，但導致學生注意力得到分散。這種本末導致的行為違背了新課程理念下運用多媒體教學原則的。二、建立良好的師生互動師生之間應當建立起多層次、多渠道、多樣式的有效互動形式，從而構建出高效的課堂教學。師生之間的信息交流的優(yōu)化可以從以下幾個方面改善。1、營造融洽的師生關系。師生互動的是指教學活動中的一種雙邊活動，只有在和諧融洽的師生關系中，學生才勇于表達自己的觀點。這就要求廣大初中思想品德教師充分尊重學生真實思考的能力，與學生平等地探討、交流、認真的傾聽學生的表達，這樣才能最大限度地促進學生思維的發(fā)展。其次，在教學過程中教師應當多鼓勵，少批評，努力發(fā)掘學生的閃光點，進而激發(fā)起他們勤奮好學的上進心。最后，教師要充分考慮學生之間的差異性，在引導深入思考的同時保持學生個性的發(fā)展，使學生能夠創(chuàng)造性地發(fā)揮自己的潛能。2、優(yōu)化課堂設計。（1）教師發(fā)揮主導作用。教師在教學過程中要發(fā)揮起主導作用與學生之間進行有效互動。這就要求教師在師生活動中將突出理論難點、化解學生疑點作為有效教學的重要環(huán)節(jié)。教師創(chuàng)設互動環(huán)節(jié)中應當尊重學生的主體地位，鼓勵學生各抒己見，加強互動引導，引導學生學會傾聽，學會提問。只有與學生進行積極互動時要注意對學生的反饋進行總結，才能夠全面了解學生知識的掌握情況和摸清初中生的認知規(guī)律，借此來完善學生的理論知識構架，更好的達到教學標。（2）學生自主能力探究。教師教學中要尊重學生的主體地位，調動主觀能動性，引導自主、合作、探究的學習方式。在師生互動時運用啟發(fā)式教學這一指導思想，引導學生開展積極的思維活動，促進學生主動建構知識、培養(yǎng)和提高各方面能力。例如在案例教學的環(huán)節(jié)中，教師先引入貼近生活的感性材料，將抽象概念和道德觀點具體化，啟發(fā)學生更全面更深入的探討問題，最后教師在綜合學生自主探究后的成果對理論進行提升。這樣教師既滿足了學生的內在需求和接受能力，又提高了學生自主學習獨立解決問題的能力。實踐證明，思想品德課堂中的師生互動符合新課改的理念。我們在教學中應積極設計好師生互動，營造和諧師生關系、優(yōu)化課程設計、轉變教師角色、尋求科學有效的教學策略，使思想品德課堂教學育人效果更好。蛋白質與酶分子的設計與改造配體和受體的分子對接實驗第5小組配體和受體的分子對接實驗就是通過計算機及相應的軟件來模擬受體與配體的分子對接過程,以及結果的分析。↓AUTODOCK是用于分子對接的軟件,可以給出可能的構象,進行簇分析,給出對應的結合能等。autodocktools是autodock的前處理圖形化界面,主要是用來完成配體,受體和對接區(qū)域選擇的準備工作。軟件的下載和安裝軟件的下載autodock.scrippsedu/downloads/autodockregistrationhttp.:///downloadAutoDockautodocl.2.3win32auAutoDockTools(ADT)MGLTools-1.5.4必須安裝在c盤ADT(autobus面:1.PMV菜單:主要通過使用菜單命令對分子進行相關操作,以及進行可視化設置2.PMv工具欄:PMⅤ菜單中一些常用命令的快捷按鈕3.ADT菜單:Autogrid和AutoDock的圖形化操作菜單4.分子顯示窗口:3D模型分子的顯示和操作窗口5.儀表板窗口部件:快速查看及設置分子的顯示模型及著色方式5.信息欄:顯示相關操作信息FeE”"匯Dp"CclerCompueGnd30HytrogenBendsFPMV菜單PMV工星柱xialeResiduesGnaDockingRunanalyzeADT菜單分子顯示窗儀表板窗口部件wfer口日8388日8883m信息欄HV蛋白及其扣制劑的結合autodock.scrippsedu/fags-help/tutorial/usingautodock4With-autodocktools上下載受體文件hsg1pdb和配體文件indpdb1準備對接文件2格點參數(shù)設置3格點計算4設置對接參數(shù)5.分子對接計算6.對接結果分析準備對接文件準備大分子File->Readmolecule(讀入大分子Select>SelectFromString(要標定水分子)->AddEdit-DeleteAtomSet->Continue(刪除水分子)Edit→Hydrogen->Ad(添加極性氨原子File->Save->WritePDBQT(保存文件)Edit->Delete->Deleteallmolecule(清空顯示窗口)2.準備配體igand->Input.->Open(讀入配體Ligand→Torsiontree-ChooseTorsions→orsoncount(設置可旋轉的鍵Ligand→Torsiontree→Setnumberoftorsions→設置fewestatoms為6Ligand->Output->SaveasPDBQT(保存配體)Edit->Delete->Deleteallmolecule(清空顯示窗口)3準備柔性殘基文件ADT→Flexibleresidues→Input→OpenMacromolecule..(選擇編