文獻(xiàn)檢索pubmed講解課件

PubMed文獻(xiàn)服務(wù)系統(tǒng)

及PubMedRSS學(xué)科跟蹤服務(wù)PubMed文獻(xiàn)服務(wù)系統(tǒng)

及PubMedRSS學(xué)科跟蹤服務(wù)1PubMed簡介

PubMed(Medline)由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（NLM）、國際MEDLARS成員（中國為第16個成員國）及合作的專業(yè)組織共同研制開發(fā)，是目前國際上公認(rèn)的檢索生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)最具權(quán)威、利用率最高、影響最廣的數(shù)據(jù)庫，也是我國衛(wèi)生部認(rèn)定的科技查新必須檢索的國外醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫。PubMed簡介PubMed(Medli2

提綱PubMed概況PubMed功能欄介紹認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)PubMed基本檢索PubMed高級檢索主題詞MeSH檢索循證及臨床查詢檢索PubMed全文獲取PubMedRSS學(xué)科跟蹤提綱PubMed概3概況網(wǎng)址：/pubmed

或PubMed收錄的期刊最早追溯至1865年，共收錄了70余個國家36000余種期刊，1900多萬篇文獻(xiàn)；PubMed的子集Medline收錄的文獻(xiàn)最早追溯至1902年，現(xiàn)有記錄1790多萬篇；目前每年增加約60余萬條文獻(xiàn)記錄；在全部記錄中有76%的文獻(xiàn)為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻(xiàn)為英文，共計收錄國內(nèi)出版的期刊170余種。概況網(wǎng)址：www.4/pubmedWelcometoPubMed使用幫助檢索詞輸入框常用工具更多服務(wù)/pubmedWel5認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)出處SO篇名TI作者AU文獻(xiàn)類型(狀態(tài))Summary認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)出處SO篇名TI作者AU文獻(xiàn)類型(狀態(tài))6認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)調(diào)整顯示設(shè)置可改變顯示模式，顯示數(shù)量及檢索結(jié)果排序顯示設(shè)置顯示摘要顯示數(shù)量排序模式認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)調(diào)整顯示設(shè)置顯示設(shè)置顯示摘要顯示數(shù)量排序7認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)在摘要顯示模式下可以看到詳細(xì)的文獻(xiàn)信息作者地址文獻(xiàn)摘要文獻(xiàn)作者文獻(xiàn)篇名全文鏈接文獻(xiàn)類型文獻(xiàn)主題詞認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)在摘要顯示模作者地址文獻(xiàn)摘要文獻(xiàn)作者文獻(xiàn)8認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)出版社上傳PreMedlinePubMedMedlinePubMed數(shù)據(jù)庫收錄的文獻(xiàn)的狀態(tài)，主要為Medline認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)出版社上傳PreMedlinePubMe9認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)非英文的文獻(xiàn)篇名上有方括號[]且注明有語種英文文獻(xiàn)土耳其語[篇名]英文文獻(xiàn)認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)非英文的文獻(xiàn)英文文獻(xiàn)土耳其語[篇名]10認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)電子優(yōu)先即最新文獻(xiàn)，一般比印刷出版提前三個月以上電子優(yōu)先2009年5月2008年9月認(rèn)識PubMed文獻(xiàn)電子優(yōu)先即最電子優(yōu)先2009年5月20011PubMed基本檢索

自由詞檢索

在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。例如：檢索腫瘤(cancer)方面的文章。在檢索框中輸入：“cancer”，再點擊“Go”按鈕。

PubMed將自動地利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進(jìn)行檢索，比如，檢索“cancer”

將自動轉(zhuǎn)換為："neoplasms"[MeSHTerms]OR"neoplasms"[AllFields]OR"cancer"[AllFields]PubMed基本檢索12自由詞檢索時PubMed自動將不規(guī)范的詞轉(zhuǎn)換成規(guī)范的詞進(jìn)行檢索自動詞匯轉(zhuǎn)換PubMed基本檢索自由詞檢索時自動詞匯轉(zhuǎn)換PubMed基本檢索13PubMed基本檢索布爾邏輯組合檢索，常用的邏輯關(guān)系詞有AND，OR，NOT等ABAB

邏輯與（AND）--檢出記錄中同時含有檢索詞A和檢索詞B.

如：AANDB

邏輯非（NOT）--在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。如：ANOTB

邏輯或（OR）--檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時含有檢索詞A和B的文獻(xiàn)。如：AORBABPubMed基本檢索布爾邏輯組合A14PubMed基本檢索

作者姓名檢索按照姓+名縮寫（不用標(biāo)點）的格式鍵入作者姓名，如：smithja或jonesk,系統(tǒng)會自動在作者字段內(nèi)進(jìn)行檢索。姓名第一個字母可用大寫也可用小寫，姓前名后,姓用全稱，名字一般用縮寫?？紤]到作者姓名的不同形式，PubMed采用自動轉(zhuǎn)換功能進(jìn)行作者姓名檢索，如：smithj將檢索成smithja,smithjb,smithjr等。精確檢索：可以用雙引號將作者名引起來，再加作者字段限定[AU]，如："smithj"[au]，這樣可避免PubMed自動轉(zhuǎn)換，實現(xiàn)精確查找。PubMed基本檢索15PubMed基本檢索作者姓名檢索按照姓(全寫)+名(縮寫)，之間不用標(biāo)點鍵入作者姓名smithjPubMed基本檢索作者姓名檢索smithj16PubMed基本檢索精確檢索避免PubMed自動詞匯轉(zhuǎn)換，實現(xiàn)精確查找"smithj"[au]PubMed基本檢索精確檢索避免"smithj"[au]17PubMed基本檢索期刊檢索在檢索框中鍵入期刊名，如：Europeanjournalofimmunology，系統(tǒng)的“自動詞語匹配”功能會將它轉(zhuǎn)換成"EurJImmunol"[Journal]OR"europeanjournalofimmunology"[AllFields]進(jìn)行檢索。也可以直接輸入Medline的期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式，如：EurJImmunol

，或者是輸入刊物的ISSN（國際標(biāo)準(zhǔn)出版物代碼）進(jìn)行檢索，如：0014-2980。如果一個雜志名恰好是主題詞或關(guān)鍵詞，如：cancer，science，cell等，PubMed會首先將這些詞轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中的主題詞進(jìn)行檢索。因此，需要將檢索請求進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理，即在雜志名后面加[TA]。如："cell"[ta]PubMed基本檢索期刊檢索18PubMed基本檢索期刊的一般檢索，是在檢索輸入框中鍵入期刊名或期刊的ISSN號EurJImmunolPubMed基本檢索期刊的一般檢EurJImmunol19PubMed基本檢索期刊的標(biāo)準(zhǔn)檢索，是在期刊名后面加字段限定[TA].比如:"cell"[ta]"cell"[ta]PubMed基本檢索期刊的標(biāo)準(zhǔn)檢"cell"[ta]20PubMed基本檢索

期刊數(shù)據(jù)庫（journaldatabase)期刊數(shù)據(jù)庫的作用：1、可以查看期刊的詳細(xì)信息，包括出版國家，出版社，出版語言，期刊類目等等；2、可以根據(jù)期刊的主題分類，查看medline收錄的各學(xué)科的期刊，比如查看medline收錄的關(guān)于麻醉學(xué)(Anesthesiology)方面的期刊；2、方便檢索某本期刊上被PubMed收錄的所有文章。比如：我們想知道期刊AcadPediatr的全稱以及具體的出版社，以方便投稿，如何查？操作方法：點擊導(dǎo)航欄上的Journaldatabase，打開期刊數(shù)據(jù)庫檢索界面，在檢索框中輸入AcadPediatr，再點擊Go按鈕即可。PubMed基本檢索期刊數(shù)21PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角部分期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫在期刊數(shù)據(jù)庫22PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以查看指定期刊的詳細(xì)信息Elsevier出版期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可Elsevier出版期刊數(shù)據(jù)23PubMed基本檢索按期刊主題瀏覽medline收錄的各學(xué)科的期刊期刊主題期刊數(shù)據(jù)庫PubMed基本檢索按期刊主題瀏期刊主題期刊數(shù)據(jù)庫24PubMed基本檢索按字母順序瀏覽medline收錄的各學(xué)科期刊麻醉學(xué)方面PubMed基本檢索按字母順序瀏麻醉學(xué)方面25PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可以方便的查看medline收錄的各學(xué)科方面的期刊medline收錄的麻醉學(xué)方面的期刊PubMed基本檢索期刊數(shù)據(jù)庫可medline收錄的麻醉學(xué)方26PubMed基本檢索

截詞檢索截詞檢索的作用：擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率。截詞符：用*表示，代表多個字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進(jìn)行檢索。如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria，bacteriophage，bacterium，等最多600個單詞。PubMed基本檢索27PubMed基本檢索截詞檢索可以擴(kuò)大檢索范圍提高查全率。bacter*[TI]PubMed基本檢索截詞檢索可以bacter*[TI]28PubMed基本檢索

字段限制檢索采用字段限制方式進(jìn)行檢索，其規(guī)則是：檢索詞1[字段標(biāo)識]邏輯運(yùn)算符檢索詞2[字段標(biāo)識]如：查找作者為crick在1993年發(fā)表的有關(guān)DNA方面的文獻(xiàn).檢索式：crick[au]AND1993[dp]ANDDNAPubMed基本檢索29PubMed基本檢索crick[au]AND1993[dp]ANDDNA字段限制檢索其規(guī)則是：檢索詞+[字段標(biāo)識]

PubMed基本檢索crick[au]AND1993[d30PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識Title[ti]：篇名字段Abstract[ab]：摘要字段Affiliation[ad]：著者地址字段。Authorname[au]：文章的作者，檢索格式：姓+名。如："smithja"[au]Journaltitle[ta]：期刊名稱。如：cell[ta]Language[la]：論文出版語種。語種檢索時可只輸入前3個字母，如：chi[la]=chinese[la]；English[lang]=eng[la]比如：檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)檢索式:hypertension[ti]ANDchi[la]PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識31PubMed基本檢索hypertension[ti]ANDchi[la]檢索文章題目中含有高血壓的中文文獻(xiàn)PubMed基本檢索hypertension[ti]AND32PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識Publicationdate[dp]:出版日期指論文所在期刊的出版日期日期檢索的形式為：YYYY/MM/DD[DP]要檢索一段時期內(nèi)的文章，日期之間可以加冒號，如：1993/01:1995/06[DP]Publicationtype[pt]:出版類型。有綜述，新聞，傳記，臨床試驗等。如：review[pt]MeSHterms[mh]：主題詞字段。如：hypertension[mh]Subheadings[sh]:副主題詞。與主題詞組配檢索.比如：檢索1995年到1996年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)。1995/01:1996/12[DP]ANDhypertension[mh]ANDreview[pt]PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識33PubMed基本檢索檢索

1995

年到

1996

年出版的關(guān)于高血壓方面的綜述性文獻(xiàn)1995/01:1996/12[DP]ANDhypertension[mh]ANDreview[pt]PubMed基本檢索檢索1995年1995/01:19934PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識FILTER[Filter]：由PubMed系統(tǒng)鏈接的外部資源站點所使用的用來限定文獻(xiàn)的技術(shù)標(biāo)識，此檢索字段常用來限定檢索比如被F1000M評價的文獻(xiàn)等Facultyof1000是英國現(xiàn)代生物出版集團(tuán)（BioMedCentral）為彌補(bǔ)只用期刊影響因子（IF）來衡量刊物的不足，近年來提出了“Facultyof1000”計劃。從全世界邀請數(shù)千名頂尖的生物學(xué)家和醫(yī)學(xué)專家，請他們從每年所發(fā)表的生物醫(yī)學(xué)SCI論文中評選出一小部分（約占0.1%）的文章，賦予F1000論文稱號，推薦給全世界的生物學(xué)和醫(yī)學(xué)工作者，并由“Facultyof1000”中的科學(xué)家對F1000論文逐篇加以評論。例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngealcancer治療方面的被Medline正式收錄且被F1000評價過的研究文獻(xiàn)”要求查準(zhǔn)不要求查全，對此構(gòu)建的檢索式：(nasopharyngealcancer)AND(Therapy/Narrow[filter])ANDmedline[sb]ANDloprovf1000m[filter]PubMed基本檢索常用檢索字段描述和標(biāo)識35PubMed基本檢索檢索鼻咽癌治療方面的且被Medline正式收錄及F1000評價過的研究文獻(xiàn)F1000M文獻(xiàn)評價PubMed基本檢索檢索鼻咽癌治F1000M文獻(xiàn)評價36PubMed基本檢索強(qiáng)制檢索功能PubMed允許使用雙引號來強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語檢索。如：在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“singlecell”，并用雙引號引起來。點擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進(jìn)行檢索。如果不使用雙引號進(jìn)行強(qiáng)制檢索，系統(tǒng)就會將其分成2個詞：single和cell檢索，其檢索表達(dá)式為：singleANDcell.很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號要求的。PubMed基本檢索強(qiáng)制檢索功能37PubMed基本檢索強(qiáng)制檢索普通檢索"singlecell"singlecellPubMed基本檢索強(qiáng)制檢索普通檢索"singlecell38PubMed高級檢索高級檢索PubMed高級檢索高級檢索39PubMed高級檢索限定欄預(yù)覽高級檢索界面下可以看到明細(xì)欄，預(yù)覽，檢索史，限定和高級檢索等檢索史明細(xì)欄高級檢索更多服務(wù)PubMed高級檢索限定欄預(yù)覽高級檢索界面檢索史明細(xì)欄高級檢40PubMed高級檢索姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻(xiàn)姚開泰作者PubMed高級檢索姚開泰院士姚開泰作者41PubMed高級檢索姚開泰院士2001年以來被Medline收錄的文獻(xiàn)時間2001使用說明PubMed高級檢索姚開泰院士時間2001使用說明42PubMed高級檢索Limit限定年齡物種子集全文字段時間性別語言文獻(xiàn)類型PubMed高級檢索Limit限定年齡物種子集全文字段時間性43PubMed高級檢索限定檢索范圍為近半年來以英文發(fā)表的循證醫(yī)學(xué)方面的文獻(xiàn)限定為英文限定為循證等文獻(xiàn)限定為近半年P(guān)ubMed高級檢索限定檢索范圍限定為英文限定為循證等文獻(xiàn)限44PubMed高級檢索限定檢索范圍為被Medline正式收錄的有電子全文鏈接的中老年病例限定為Medline限定為有電子全文限定為中老年P(guān)ubMed高級檢索限定檢索范圍限定為Medline限定為有45主題詞MeSH檢索

《醫(yī)學(xué)主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)

《醫(yī)學(xué)主題詞表》是對生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析、標(biāo)引和檢索的權(quán)威性詞表，它的作用是使醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的主題標(biāo)引和檢索達(dá)到統(tǒng)一和一致，并指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)。它可以指導(dǎo)用戶從同義詞發(fā)現(xiàn)主題詞，告訴用戶主題詞如何使用，顯示主題詞之間的相互關(guān)系。主題詞MeSH檢索《醫(yī)學(xué)主題詞46主題詞MeSH檢索

《醫(yī)學(xué)主題詞表》數(shù)據(jù)庫(MeSHDatabase)利用主題詞進(jìn)行檢索方法:1、點擊主頁右下角的MeSHDatabase進(jìn)入主題詞檢索界面；2、輸入檢索詞后，點擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主題詞；3、點擊該主題詞進(jìn)一步顯示該主題詞的定義、樹狀結(jié)構(gòu)、組配的副主題詞；4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點擊sendto按鈕，進(jìn)入檢索表達(dá)式瀏覽窗口；5、點擊SearchPubMed將顯示檢索結(jié)果。主題詞MeSH檢索《醫(yī)學(xué)主題詞47主題詞MeSH檢索主題詞數(shù)據(jù)庫在PubMed首頁導(dǎo)航欄的右下角主題詞數(shù)據(jù)庫主題詞MeSH檢索主題詞數(shù)據(jù)庫主題詞數(shù)據(jù)庫48主題詞MeSH檢索輸入普通詞查找對應(yīng)主題詞MeSH主題詞檢索可以指導(dǎo)用戶高質(zhì)量地檢索醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)主題詞MeSH檢索輸入普通詞MeSH主題詞檢索可49主題詞MeSH檢索一般一個主題詞還要配合一個副主題詞進(jìn)行組合檢索選擇副主題詞主題詞MeSH檢索一般一個主題選擇副主題詞50SearchBoxwithAND主題詞MeSH檢索點Sentto

將檢索詞添加到檢索表達(dá)式瀏覽窗口SearchBoxwithAND主題詞MeSH檢索點S51主題詞MeSH檢索SearchPubMed主題詞檢索可以達(dá)到比較滿意的查全率和查準(zhǔn)率主題詞MeSH檢索SearchPubMed主題詞檢索可52主題詞MeSH檢索主題詞檢索是在有主題標(biāo)引的Medline數(shù)據(jù)庫中檢索主題詞檢索結(jié)果主題詞MeSH檢索主題詞檢索是主題詞檢索結(jié)果53主題詞MeSH檢索普通詞不是規(guī)范化的主題詞檢索結(jié)果相關(guān)度低普通詞檢索結(jié)果主題詞MeSH檢索普通詞不是規(guī)普通詞檢索結(jié)果54臨床查詢檢索

“Clinicalqueries”是專門為臨床醫(yī)生研究設(shè)計的內(nèi)置的臨床方法學(xué)“過濾器”（ClinicalMethodologyFilters），這組檢索策略模型是由加拿大臨床流行病學(xué)和生物統(tǒng)計學(xué)研究人員HaynesRB等人在1994年提出來的，并進(jìn)行了查全率和查準(zhǔn)率分析。用戶通過這一臨床方法學(xué)檢索過濾器，不需掌握復(fù)雜的檢索策略，即可檢索所需的臨床研究文獻(xiàn)。臨床查詢檢索55臨床查詢檢索

使用方法:1、點擊主頁左側(cè)導(dǎo)航欄的ClinicalQueries進(jìn)入臨床查詢頁面；2、在檢索框中輸入檢索詞，并選擇副主題詞組配，指定檢索結(jié)果是查全(sensitive)，還是查準(zhǔn)(specific)；3、點擊GO按鈕執(zhí)行檢索。例如：檢索“鼻咽癌nasopharyngealcancer治療方面的研究文獻(xiàn)”臨床查詢檢索56臨床查詢檢索臨床查詢在PubMed首頁導(dǎo)航欄的中間部分臨床查詢臨床查詢檢索臨床查詢在臨床查詢57臨床查詢檢索臨床查詢主要用于檢索臨床方面的研究文獻(xiàn)臨床查詢檢索臨床查詢檢索臨床查詢主要臨床查詢檢索58臨床查詢檢索臨床查詢主要包括某種疾病的治療，診斷病因和預(yù)后四個方面檢索結(jié)果臨床查詢檢索臨床查詢主要檢索結(jié)果59PubMed全文獲取

通過PubMed檢索出來的文獻(xiàn)，部分我們通過瀏覽摘要即可，部分我們還需要查看全文，以作進(jìn)一步的研究，那么，我們?nèi)绾潍@取全文呢？一：免費的全文PubMed全文獲取通過PubMed檢索出來的60PubMed全文獲取PubMed收錄的文獻(xiàn)大約有5%是免費的可以直接打開全文免費全文可直接打開PubMed全文獲取PubMed收錄免費全文可直接打開61PubMed全文獲取打開PDF全文免費的全文并不代表學(xué)術(shù)價值低，大部分的生命科學(xué)的全文都是免費的PubMed全文獲取打開PDF全文免費的全文并62PubMed全文獲取二：學(xué)校已訂購的全文如果我們所需要的文獻(xiàn)，學(xué)校已訂購了該文獻(xiàn)所在的全文型數(shù)據(jù)庫，我們也可以直接打開或到相應(yīng)的全文數(shù)據(jù)庫中查找。PubMed全文獲取63國內(nèi)出版的期刊，學(xué)校一般都有訂購，請查找清華同方或維普，萬方學(xué)校已訂購PubMed全文獲取國內(nèi)出版的期學(xué)校已訂購PubMed全文獲取64PubMed全文獲取SpringerLink和EBSCO等外文全文庫，一般學(xué)校也有訂購學(xué)校已訂購PubMed全文獲取Sp