DB51∕T 2758-2021 實驗用小型豬 遺傳質(zhì)量控制

ICS 65.020.30CCS B

44DB

51 DB51/T

2758—2021實驗用小型豬

遺傳質(zhì)量控制Genetic

quality

control

of

pig 四川省市場監(jiān)督管理局發(fā)

布DB51/T 5

—2021 前言

................................................................................

II1

..............................................................................

12

規(guī)范性引用文件

....................................................................

13

術(shù)語和定義

........................................................................

14

遺傳分類及命名

....................................................................

15

..............................................................................

26

遺傳質(zhì)量監(jiān)測

......................................................................

3DB51/T 5

—2021 本文件按照

GB/T

1.1-2020

《標準化工作導則

第

1

部分：標準化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起草。請注意本文件的某些內(nèi)容可能涉及專利。本文件的發(fā)布機構(gòu)不承擔識別專利的責任。本文件由四川省科學技術(shù)廳提出、歸口并解釋。本文件起草單位：四川省農(nóng)村科技發(fā)展中心、四川大學實驗動物中心、四川省醫(yī)學科學院?四川省人民醫(yī)院實驗動物研究所。本文件主要起草人：王敬東、陳兵、尹海林、鄒弈星、王崢屹、彭旭。本文件首次發(fā)布。IIDB51/T 5

—2021

1 范圍本文件規(guī)定了實驗用小型豬的遺傳分類及命名、繁殖、遺傳質(zhì)量監(jiān)測的要求。本文件適用于實驗用小型豬的遺傳質(zhì)量控制。2 規(guī)范性引用文件下列文件的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中，注日期的引用文件，文件。GB

14923 實驗動物

哺乳類實驗動物的遺傳質(zhì)量控制NY/T

1673 畜禽微衛(wèi)星遺傳多樣性檢測技術(shù)規(guī)程3 術(shù)語和定義下列術(shù)語和定義適用于本文件。3.1實驗用小型豬 experimental

miniature

pig12月齡體重小于50kg，用于科學研究、教學、生產(chǎn)、檢驗檢測以及其它科學實驗的小型豬。3.2近交系 inbred

strain經(jīng)連續(xù)2020以后代數(shù)的一對共同祖先。近交系的近交系數(shù)（

）應大于98.6%。3.3封閉群 closed

colony4代以上的群體。4 遺傳分類及命名4.1 遺傳分類根據(jù)遺傳特點的不同，實驗用小型豬分為近交系和封閉群。4.2 命名4.2.1 近交系命名DB51/T 5

—2021根據(jù)動物的來源、歷史和培育經(jīng)過，以一系列字母和數(shù)字作為品系代碼（

code）來表示。1示例2）。示例1：ADBA示例2：C57BLC3H4.2.2 近交代數(shù)近交系的近交代數(shù)用大寫英文字母F表示。示例1：當一個近交系的近交代數(shù)為30代時，寫成。4.2.3 其他近交系亞系、重組近交系、同源突變近交系、同源導入近交系的定義和命名按照GB

14923執(zhí)行。4.2.4 封閉群命名封閉群命名按照GB

14923執(zhí)行。5 繁殖5.1 近交系的繁殖5.1.1 原則保持近交系實驗用小型豬的同基因性及基因純合性。5.1.2 引種特點及主要生物學特征等的完整檔案。5.1.3 方法礎群、血緣擴大群和生產(chǎn)群的具體繁殖方式按照

14923

執(zhí)行。5.2 封閉群的繁殖5.2.1 原則保持封閉群實驗用小型豬的遺傳異質(zhì)性及基因多態(tài)性，避免近交系數(shù)隨繁殖代數(shù)增加而過快上升。5.2.2 引種5.2.2.1 應遺傳背景明確，來源清楚，有較完整的檔案（包括種群名稱、來源、遺傳基因特點及主要生物學特征等）。分子標記名稱染色體位置等位基因數(shù)（個）等位基因片段范圍（bp）熒光標記引物序列

5’→3’退火溫度（℃）鎂離子濃度(mM)S015517148-164FAWF-TGTTCTCTGTTTCTCCTCTGTTTGR-AAAGTGGAAAGAGTCAATGGCTAT581.5S001029102-124FAWF-TTAACATGGCTGTCTGGACCR-GTCCCTGTCCAACCATAAGA601.5SW349321148-184FAWF-CCTGTTGTAGGCTCCATGAGR-CTAGGAGTCGGCCCTGAAC621.5S000146175-189FAWF-TGGATGGGTCTCATTCTCAGR-TGATTCCTAGCCTGAGAAGC501.5S0005510200-248FAWF-TCCTTCCCTCCTGGTAACTAR-GCACTTCCTGATTCTGGGTA553.0S0087617161-220FAWF-GACAAGCTCCAGGAAGCTTTCCTGR-ATTGCCTTGTGATCCCAAGGGGCA581.5S0101713196-230FAWF-GAATGCAAAGAGTTCAGTGTAGGR-GTCTCCCTCACACTTACCGCAG581.5S022587170-194HEXF-GCTAATGCCAGAGAAATGCAGAR-CAGGTGGAAAGAATGGAATGAA581.5SW17495123-136TAMRAF-GCCAAAATAGCTATTGGACAGCR-TCATGCTATTTTGTTCCAGATG581.5SW16261014117-170FAWF-GCCAATTTCTAGCAAAGTGACCR-TGGAAGATGACATAAGAAAGGG621.5DB51/T 5

—20215.2.2.2 根據(jù)繁殖方式，在保證每代近交系數(shù)增量不大于

1％的前提下，決定最小引種規(guī)模。宜采用循環(huán)交配方式，引種數(shù)量不應少于

對無血緣關系（三代以內(nèi)無共同祖先）的種豬；也可采用隨機交配方式，引種數(shù)量不應少于

25

對無血緣關系的種豬。5.2.3 方法具體繁殖方法按照GB

執(zhí)行。6 遺傳質(zhì)量監(jiān)測6.1 監(jiān)測方法采用微衛(wèi)星標記檢測方法。具體方法按照NY/T

1673執(zhí)行，各微衛(wèi)星標記的染色體位置、等位基因數(shù)、等位基因片段范圍、引物序列、熒光標記、退火溫度、鎂離子濃度等見表1。表1 各微衛(wèi)星

分子標記檢測條件列表分子標記名稱染色體位置等位基因數(shù)（個）等位基因片段范圍（bp）熒光標記引物序列

5’→3’退火溫度（℃）鎂離子濃度(mM)S000911996-133FAWF-AAACATACCAAGAAGCCCAGR-TAATCTTTGCCATCCCTTGT621.5SW605125109-135TAMRAF-AGCCTTCTGTGCAGAAAAGCR-CCCCAGGTTCTCTGCTCTC581.5SW769137104-139HEXF-GGTATGACCAAAAGTCCTGGGR-TCTGCTATGTGGGAAGAATGC553.0SW857146134-160TAMRAF-TGAGAGGTCAGTTACAGAAGACCR-GATCCTCCTCCAAATCCCAT551.5S03551514243-277HEXF-TCTGGCTCCTACACTCCTTCTTGATGR-TTGGGTGGGTGCTGAAAAATAGGA553.0S002616590-111FAWF-AACCTTCCCTTCCCAATCACR-CACAGACTGCTTTTTACTCC581.5S03321724111-168FAWF-TGGTTTCCTCACCAAGACAAGTACR-CCCAAGGAGCTACAGCAAGGCAAG581.5SW1984182195-158FAWF-TTTTTAGTGTCCAAGGAGGTCCR-GGAGCACTAATAGACCACCACC551.5SW2476X688-106TAMRAF-CTGGAGCAGGAGAAAGTAAGTTCR-GGACAGTTACAGACAGAAGAAGG621.5表示正向引物，群體規(guī)模抽樣數(shù)量≤50450～含)6>100不少于

6%DB51/T 5

—2021表

1 各微衛(wèi)星

DNA

分子標記檢測條件列表（續(xù)）6.2 近交系遺傳質(zhì)量監(jiān)測6.2.1 時間間隔對生產(chǎn)群，每2年至少進行1次。6.2.2 抽樣對基礎群，凡在子代留有種豬的雙親動物都應該進行檢測。對生產(chǎn)群，按照表2要求從每個近交系中隨機抽取非同窩成年實驗用小型豬，公母各半。表2 近交系實驗用小型豬生產(chǎn)群遺傳監(jiān)測抽樣要求單位：頭單位：頭監(jiān)測結(jié)果判定達到平衡狀態(tài)未發(fā)現(xiàn)遺傳變異沒有達到平衡狀態(tài)遺傳發(fā)生變異平衡狀態(tài)判定方法見NY/T

1673監(jiān)測結(jié)果判定與標準遺傳概貌完全一致未發(fā)現(xiàn)遺傳變異有一個位點的標記基因與標準遺傳概貌不一致遺傳發(fā)生變異群體規(guī)模抽樣數(shù)量≤100不少于

10

頭>100不少于

20

頭DB51/T 5

—20216.2.3 結(jié)果判定結(jié)果判定按照表3執(zhí)行。表3 近交系實驗用小型豬遺傳質(zhì)量監(jiān)測結(jié)果判定6.2.4 判定結(jié)論近