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文檔簡(jiǎn)介
第四章 細(xì)菌基因轉(zhuǎn)移和基因重組2023/9/21第二節(jié)接合(conjugation)2023/9/21供體菌(F+)通過(guò)性菌毛與受體菌(F-)直接接觸,把
F質(zhì)?;蚱鋽y帶的不同長(zhǎng)度的核基因組片段傳遞給后者,并使其獲得若干新遺傳性狀
的現(xiàn)象。大腸桿菌的接合能進(jìn)行接合的微生物種類主要在細(xì)菌和放線菌中進(jìn)行。細(xì)菌中,尤其G-菌較為普遍。接合還可發(fā)生在不同屬的一些菌種間。接合的意義
抗生素抗性外毒素抗性新的代謝能力2023/9/21通過(guò)接合而獲得新遺傳性狀的受體細(xì)胞叫接合子。介導(dǎo)接合作用的質(zhì)粒叫接合質(zhì)粒(自主轉(zhuǎn)移質(zhì)粒、性質(zhì)粒)。2023/9/21
接合的特征
2023/9/21特征1:需要供體細(xì)胞和受體細(xì)胞的直接接觸,在G-是通過(guò)質(zhì)粒編碼的性菌毛介導(dǎo)的,在G+細(xì)菌中沒(méi)有性菌毛,由受體細(xì)胞分泌類似于性激素的短肽刺激細(xì)胞接合。特征2:需要質(zhì)粒參與。G-細(xì)菌中質(zhì)粒分子量較大,有幾十個(gè)tra基因參與DNA轉(zhuǎn)移,而G+細(xì)菌中質(zhì)粒小,只有幾個(gè)tra基因參與DNA轉(zhuǎn)移。2023/9/21特征3:無(wú)論G-或G+,質(zhì)粒能只從供體細(xì)胞向受體細(xì)胞轉(zhuǎn)移.是自然界微生物遺傳物質(zhì)交換的重要途徑。大腸桿菌,自主轉(zhuǎn)移質(zhì)粒是F因子。2023/9/211.
接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)與證實(shí)2023/9/211946年,J.Lederberg
&
Tatum的大腸桿菌雜交試驗(yàn):材料:大腸桿菌(E.
coli)
K12菌株的兩個(gè)營(yíng)養(yǎng)缺陷型品系:菌株A—甲硫氨酸缺陷型met-和生物素缺陷型bio-;菌株B—蘇氨酸缺陷型thr-和亮氨酸缺陷型leu-。方法:將A、B兩菌株混和,在基本培養(yǎng)基(固體)上涂布培養(yǎng)。結(jié)果:平板上長(zhǎng)出原養(yǎng)型菌落(++++)。+結(jié)果原養(yǎng)型菌株以10-5-10-6的頻率出現(xiàn)2023/9/21-?質(zhì)疑:⑴
細(xì)菌的雜交實(shí)驗(yàn)獲得的重組子可能是轉(zhuǎn)化的結(jié)果。⑵
培養(yǎng)基中含有某些代謝產(chǎn)物,混合后這些產(chǎn)物互相補(bǔ)充了對(duì)方的不足而得以在基本培養(yǎng)基上生長(zhǎng)。2
023/9(/213)
回復(fù)突變2023/9/21轉(zhuǎn)化的排除(1)當(dāng)時(shí)Lederberg
和Tatum已證明,把菌株A的培養(yǎng)液經(jīng)過(guò)滅菌,再加入到B菌株的培養(yǎng)液中,沒(méi)有原養(yǎng)型菌落,說(shuō)明并非轉(zhuǎn)化的結(jié)果。2023/9/21證實(shí)接合過(guò)程需要細(xì)胞間的直接接觸的“U”型管實(shí)驗(yàn)(
Bernard
Davis,1950
)轉(zhuǎn)化的排除(2)互養(yǎng)的排除營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株通過(guò)培養(yǎng)基交換養(yǎng)料而生長(zhǎng)的現(xiàn)象稱為互養(yǎng)。如將基因型A-B+T1s和A+B-T1r兩菌株在基本培養(yǎng)基上混合培養(yǎng),接觸較短的一段時(shí)間以后,噴上噬菌體T1,把A-B+T1s殺死,經(jīng)培養(yǎng)后仍有原養(yǎng)型菌落出現(xiàn)。A-B+T1sA+B-T1rT12023/9/21回復(fù)突變的排除2023/9/21大腸桿菌的突變率一般都是<10-8,若兩個(gè)基因同時(shí)回復(fù)突變,則可能性只有<10-16,這種幾率在平板上是很難檢測(cè)到的,所以混合培養(yǎng)能出現(xiàn)10-5-10-6頻率的菌落一定是重組的結(jié)果。J.
Lederberg,
E.
Tatum
(1946)14.11MCB
140
2/16/0515Novel
genotypes
in
mixed
cultures
of
biochemical
mutants
ofbacteria.
Cold
Spring
Harbor
Symp.
Quant.
Biol.
11:113-114.草履蟲(chóng)MCB
1402/16/05162023/9/21W.Hayes的實(shí)驗(yàn)(1952)該實(shí)驗(yàn)說(shuō)明細(xì)菌接合過(guò)程中遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移是單向的,即遺傳物質(zhì)從A株轉(zhuǎn)移到了B株。A:
met-
bio-
thr+
thi+B:
met+bio+
thr-
thi-大腸桿菌的兩種類型
2023/9/21Hayes(1952)研究表明:大腸桿菌兩種不同菌株(品系)接合過(guò)程中遺傳物質(zhì)的轉(zhuǎn)移是單向的;從而認(rèn)為大腸桿菌存在兩種類型:雌性與雄性,分別作為接合過(guò)程中遺傳物質(zhì)的受體與供體。供體菌稱為雄性菌,受體菌稱為雌性菌。有學(xué)者認(rèn)為,具有性菌毛的細(xì)胞可以叫做
雄性,這種細(xì)絲狀的菌毛像一種分子陰莖,與缺乏性菌毛的雌性細(xì)胞交合(德迪夫
1999)。威廉斯(
2001)的觀點(diǎn):“在細(xì)菌和病毒以及在所有高等生命體的主要類型中,遺傳重組現(xiàn)象的存在表明,性別的分子基礎(chǔ)是來(lái)自遠(yuǎn)古的進(jìn)化演變的產(chǎn)物”。2023/9/212.F質(zhì)粒的發(fā)現(xiàn)2023/9/21證明了細(xì)菌的接合是遺傳物質(zhì)的單向轉(zhuǎn)移后,
Hayes偶然發(fā)現(xiàn)了作為原始供體的A菌在冰箱里存放了一年后出現(xiàn)一種變種,變種和正常的B菌雜交時(shí)缺乏將遺傳物質(zhì)傳給B菌株的能力。他把這個(gè)不育變種的一個(gè)Strr
突變型分離出來(lái),并把它和可育的Strs
A菌株一起繁殖,將其涂布在含有鏈霉素的平板上,分離后再和B菌株雜交,結(jié)果使不育的菌株回復(fù)了可育性(大約1/3恢復(fù))。大腸桿菌的可育性解釋2023/9/21
A菌株之所以能成為供體,是因?yàn)樗幸粋€(gè)性因子(sexfactor),又稱致育因子(fertility
factor),簡(jiǎn)稱F因子。F因子的特點(diǎn)2023/9/21①
大腸桿菌的供體或雄性細(xì)胞記為F+,帶有一個(gè)性因子或致育因子F,而另一個(gè)不帶性因子F的受體細(xì)胞或雌性細(xì)胞記為F-②
雜交F+ХF-是可育的,雜交F-
Х
F-是不育的③
F因子可以轉(zhuǎn)移,從F+到F-,但必須通過(guò)細(xì)胞接觸④
F因子能自發(fā)喪失,一旦喪失就不能再恢復(fù),除非從一個(gè)F+再把它傳遞過(guò)來(lái)。⑤
F+是一種遺傳性狀,F(xiàn)因子的存在使細(xì)菌稱為F+,F(xiàn)因子的喪失使細(xì)菌成為F-,F(xiàn)+分裂仍得到F+細(xì)胞。2023/9/21⑥
其特性類似于染色體,但染色體基因轉(zhuǎn)移的頻率不超過(guò)
10-6,F(xiàn)因子轉(zhuǎn)移的頻率高達(dá)70%以上。因此,F(xiàn)因子就是質(zhì)粒Lederberg,
J.,
Cavalli,
L.
L.,andLederberg,
E.
M.,
Nov.
1952,"Sexcompatibility
in
Escherichia
coli",
Genetics37(6):720-7303.F質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)2023/9/21已經(jīng)對(duì)F質(zhì)粒的基因組進(jìn)行了全序列測(cè)定。F質(zhì)粒為雙鏈環(huán)狀DNA分子,DNA長(zhǎng)度為99159bp(約100kb),約是大腸桿菌基因組的2%,其中
1/3的基因與接合作用有關(guān)。整個(gè)基因組由3個(gè)主要區(qū)段組成:轉(zhuǎn)移區(qū)、復(fù)制區(qū)、插入?yún)^(qū)。2023/9/21轉(zhuǎn)移區(qū)2023/9/21轉(zhuǎn)移區(qū)的長(zhǎng)度為33kb,由23個(gè)基因組成,構(gòu)成一個(gè)tra操縱子。與性菌毛的形成有關(guān)??刂苹蜣D(zhuǎn)移該區(qū)最后進(jìn)入受體細(xì)胞復(fù)制區(qū)2023/9/21復(fù)制區(qū)負(fù)責(zé)F質(zhì)粒的自我復(fù)制,F(xiàn)質(zhì)粒的自主復(fù)制區(qū)為oriV,在oriV中包含復(fù)制起點(diǎn)。F質(zhì)粒的復(fù)制是按θ型方式進(jìn)行雙向復(fù)制,是一種嚴(yán)緊型質(zhì)粒,1-2拷貝/細(xì)胞。Inc基因產(chǎn)物使細(xì)胞具有不相容性。插入?yún)^(qū)2023/9/21包含4個(gè)插入順序:2個(gè)IS3,一個(gè)IS2,1個(gè)Tn1000,它們與F質(zhì)粒的整合、切除和易位有關(guān)。F因子為附加體質(zhì)粒,既可以脫離染色體在細(xì)胞內(nèi)獨(dú)立存在,也可插入(整合)到染色體上2023/9/21高頻重組(High
frequencerecombination,Hfr)2023/9/211951年 Cavalli發(fā)現(xiàn)用氮芥處理F+ 然后將處理后的F+×F-—1—0-41954年
Hayes 也分離了Hfr品系,發(fā)現(xiàn):(1)Hfr使重組能力增加,但無(wú)傳遞F因子的能力,Hfr×F
F-
-(2)Hfr只能將供體基因組的一部分傳給受體,Hayes的解釋是Hfr的F因子發(fā)生了永久性改變。+
-
F
×F
Hfr2023/9/214. F質(zhì)粒在細(xì)胞內(nèi)的存在狀態(tài)根據(jù)細(xì)胞中是否存在F因子以及其存在方式的不同,可把E.coli分以下四種相互有聯(lián)系的接合型的菌株。a)F-菌株, 不含F(xiàn)因子,沒(méi)有性菌毛,但可以通過(guò) 接合作用接收F因子而變成雄性菌株(F+);F+菌株,
F因子獨(dú)立存在,細(xì)胞表面有性菌毛。Hfr菌株,F(xiàn)因子插入到染色體DNA上,細(xì)胞表面有性菌毛。
d)F′菌株,Hfr菌株內(nèi)的F因子因不正常切割而脫離染色體時(shí),形成游離的但攜帶一小段染色體基因的F因子,特稱為F′因子。 細(xì)胞表面同樣有性菌毛。2023/9/21細(xì)菌接合的電鏡照片2023/9/215.F質(zhì)粒與接合作用2023/9/21(1)
F+×F-雜交帶有F質(zhì)粒的細(xì)胞在形態(tài)學(xué)上與F-明顯區(qū)別。除共有大量的表面菌毛外,F(xiàn)+還有少量性菌毛。接合作用分兩步:接合配對(duì)和DNA轉(zhuǎn)移F+菌株的F因子向F-細(xì)胞轉(zhuǎn)移,但含F(xiàn)因子的宿主細(xì)胞的染色體DNA一般不被轉(zhuǎn)移。2023/9/21①
F+細(xì)菌通過(guò)性毛與F-細(xì)菌接觸并發(fā)生相互作用,產(chǎn)生胞質(zhì)橋;2023/9/21②
F+細(xì)菌的F因子出現(xiàn)缺口,雙鏈之一被切斷,從斷端轉(zhuǎn)移F因子的一條鏈到F-細(xì)菌中。③
F因子的一條鏈一進(jìn)入F-細(xì)菌中,就在F-細(xì)菌中復(fù)制新的F因子。④
復(fù)制完成后,F(xiàn)-細(xì)菌變成F+,同時(shí)原有F+細(xì)胞也完成F因子另一條鏈的復(fù)制,所以轉(zhuǎn)移是F+的拷貝。最終雜交的結(jié)果是F-細(xì)菌變成F+細(xì)菌,而原有的F+細(xì)菌則不變。(2)Hfr
×F-雜交2023/9/21Hfr菌株的F因子插入到染色體DNA上,因此只要發(fā)生接合轉(zhuǎn)移過(guò)程,就可以把部分甚至全部細(xì)菌染色體傳遞給F-細(xì)胞并發(fā)生重組,由此為高頻重組菌株。質(zhì)粒通過(guò)不同的機(jī)理整合到染色體上,包括質(zhì)粒和染色體序列的同源重組。正常的重組需要兩個(gè)DNA之間有同源性,但大多數(shù)質(zhì)粒的序列具有不同于染色體的獨(dú)特性。但質(zhì)粒和染色體有共同插入序列和轉(zhuǎn)座因子。這些轉(zhuǎn)座因子間的同源重組可導(dǎo)致質(zhì)粒的整合。
插入如何產(chǎn)生Hfr?
大腸桿菌染色體有7個(gè)IS1、13個(gè)IS2和6個(gè)IS3,F(xiàn)質(zhì)粒有1個(gè)IS2和2個(gè)IS3,因此大腸桿菌染色體上有19個(gè)IS介導(dǎo)的Hfr形成位點(diǎn)。F質(zhì)粒插入染色體上位置隨機(jī),方向隨機(jī),結(jié)果產(chǎn)生不同的Hfr菌株。2023/9/212023/9/21Hfr菌株的形成及其基因重組Hfr與F-菌株接合過(guò)程2023/9/21Hfr菌株仍然保持著F+細(xì)胞的特征,具有F性菌毛,并象F+一樣與F-細(xì)胞進(jìn)行接合。所不同的是,當(dāng)OriT序列被酶識(shí)別而產(chǎn)生缺口后,F(xiàn)因子的先導(dǎo)區(qū)(leadingregion)結(jié)合著染色體DNA向受體細(xì)胞轉(zhuǎn)移。F因子除先導(dǎo)區(qū)以外,其余部分是處于轉(zhuǎn)移染色體的末端,由于轉(zhuǎn)移過(guò)程常被中斷,因此F因子不易轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞中。Hfr與F-菌株接合結(jié)果2023/9/21Hfr×F-雜交后的受體細(xì)胞(或接合子)大多數(shù)仍然是F-。染色體上越靠近F因子的先導(dǎo)區(qū)的基因,進(jìn)入的機(jī)會(huì)就越多,在F-中出現(xiàn)重組子的時(shí)間就越早,頻率也高。2023/9/21(3)F′×F-雜交2023/9/21Hfr菌株內(nèi)的F因子因不正常切割而脫離染色體時(shí),形成游離的但攜帶一小段染色體基因的F因子,特稱為F′因子。F′×F-與F+×F-的不同:供體的部分染色體基因隨F′一起轉(zhuǎn)入受體細(xì)胞a)與染色體發(fā)生重組;b)繼續(xù)存在于F′因子上,形成一種部分二倍體;n
細(xì)胞基因的這種轉(zhuǎn)移過(guò)程又常稱為性導(dǎo)(sexduction)、F因子轉(zhuǎn)導(dǎo)(F-duction),或F因子媒介的轉(zhuǎn)導(dǎo)(F-mediated
transduction)。2023/9/212023/9/21部分二倍體:2023/9/21
當(dāng)Hfr菌的部分染色體進(jìn)入F-細(xì)胞后,F(xiàn)-細(xì)胞中就成為部分二倍體(partialdiploid)或部分合子(merozygote)。6.中斷雜交(interrupted
mating)技術(shù)2023/9/21Hfr細(xì)菌和F-接合后,染色體按一定速度和方向進(jìn)入F-,由于DNA轉(zhuǎn)移從oriT起始,F(xiàn)質(zhì)粒的主要部分應(yīng)該在最后進(jìn)入受體,但雜交后,
F-并不轉(zhuǎn)變?yōu)镕+說(shuō)明大部分F因子并沒(méi)有進(jìn)入受體。利用Hfr×F-的接合過(guò)程,在不同時(shí)間取樣,并把樣品猛烈攪拌以分散接合中的細(xì)菌,然后分析受
體細(xì)菌基因型,以時(shí)間(分鐘)為單位繪制遺傳圖
譜,該圖譜是細(xì)菌染色體上基因順序的直接反映。中斷雜交實(shí)驗(yàn)作圖(interrupted
matingexperiment)中斷雜交實(shí)驗(yàn)
1957年E.Wollman和E.Jacob設(shè)計(jì)完成供體:Hfr受體:F-strs
thr+
leu+
azirstrr
thr-
leu-
azistonr
lac+
gal+tons
lac-gal-中斷雜交F-Hfr雜交一定時(shí)間間隔基本培養(yǎng)基含鏈霉素thr+leu+strr重組子2023/9/21將大約10倍的F-菌和Hfr對(duì)數(shù)期的菌混合,輕輕振蕩培養(yǎng),在不同時(shí)間間隔取樣,然后在組織攪拌器中劇烈振蕩。振蕩后的培養(yǎng)物涂布于加了鏈霉素的基本培養(yǎng)基上,篩選thr+
leu+
strr重組子。再對(duì)每一個(gè)重組子的非選擇性標(biāo)記azi
ton
lac
gal進(jìn)行測(cè)定。2023/9/212023/9/21從圖可知,混合5分鐘后取樣時(shí),所得菌落的非選擇標(biāo)記全部和F-菌株相同,表明還沒(méi)有任何Hfr菌的基因進(jìn)入受2023/9/21體菌。混合10分鐘取樣,重組體中有10%含Hfr的azi基因,但幾乎沒(méi)有ton和gal基因,25分鐘時(shí),gal基因才出現(xiàn)。在60分鐘后,thr+leu+strr重組體的數(shù)目達(dá)到最高點(diǎn),非選擇性供體標(biāo)記趨于平衡。在這些重組體之間,非選擇性供體標(biāo)記從azi基因的90%到gal基因的25%。因此Hfr和F雜交建立起穩(wěn)定的接合對(duì)時(shí),供體的染色體的轉(zhuǎn)移是從一個(gè)固定點(diǎn)開(kāi)始的,以0-thr-leu-azi-ton-
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