臨床微生物學(xué)檢驗(yàn)：4-微生物的分類與命名

微生物的分類與命名

M的分類與命名對M的分類鑒定,特別是新種屬的分類鑒定有著十分重要的意義.

一、微生物在生物分類學(xué)中的地位

微生物包括細(xì)菌、支原體、螺旋體、立克次體、衣原體、放線菌、真菌和病毒共8類。其中前6類為原核生物界（單細(xì)胞)，真菌為真核界(單細(xì)胞或多細(xì)胞)，病毒屬病毒界(非細(xì)胞形態(tài)微生物)。

（一）原核生物界分類等級依次為：界（kingdom)、門（divisions)、綱（classes)、目（orders)、科（families）屬（genera）、種（species）。

（二）真菌界原核生物與真核生物細(xì)胞結(jié)構(gòu)比較

原核生物真核生物核無核膜、核仁、只有擬核有核膜、核仁和染色體細(xì)胞器無線粒體、細(xì)胞器不完善有完整細(xì)胞器，有線粒體細(xì)胞壁肽聚糖為基本成分無肽聚糖細(xì)胞分裂二分裂有絲分裂、芽生（三）病毒界病毒界的分類等級不同，病毒的最高分類等級為科，依次為屬、種。科、屬均用首寫字母大寫的斜體字表示，而種名則用首寫字母小寫的正體字表示。如PicornaviridaeEnteroviruspolioIvirus,HerpesviridaeSimplexvirusherpessimplex2virus。

二、細(xì)菌的分類單位、系統(tǒng)和命名

（一）細(xì)菌的分類單位和命名常用的分類單位是科、屬、種。種是細(xì)菌分類的基本單位。在同一菌種內(nèi)還可分組。差異較明顯的稱亞種(subspecies)和變種(variety）,現(xiàn)不主張使用變種;差異微小的為型（type)，不同來源的同一種細(xì)菌稱為該菌的不同菌株。具有該種細(xì)菌典型特征的菌株稱為該菌的標(biāo)準(zhǔn)菌株(standardstrain）或模式菌株(typestrain)，在細(xì)菌的分類、鑒定和命名時都以標(biāo)準(zhǔn)菌株為依據(jù)，也可作為質(zhì)量控制的標(biāo)準(zhǔn)。

命名：常采用拉丁文雙命名法（林奈雙命法），即兩個拉丁字組成，前一字為屬名，用名詞，首字母大寫；后一字為種名，用形容詞,首字母小寫用斜體字，中文譯名則種名在前,屬名在后。

Staphylococcusepidermidis；

Mycobacteriumtuberculosis；

Salmonellatyphi。亞種的名稱是由三名組成；如S.aureussubsp.anaerobius,譯名金黃色葡萄球菌厭氧亞種.

有時泛指某一屬細(xì)菌，而不特指其中某個菌種，則可在屬名之后加上sp.復(fù)數(shù)用spp.sp代表菌種（species)，如Staphylococcussp、Mycobacteriumsp、Salmonellasp。細(xì)菌的命名由國際細(xì)菌命名法規(guī)所決定。凡有關(guān)細(xì)菌研究的學(xué)術(shù)論文必須使用細(xì)菌命名批準(zhǔn)目錄中正式的細(xì)菌學(xué)名。凡亞種以上的分類需按命名法規(guī)的規(guī)定，亞種以下的分類則用細(xì)菌的血清群，血清型、毒素抗原性、噬菌體型與藥敏鑒定等，其命名不受法規(guī)的約束。

（二）、細(xì)菌的分類系統(tǒng)國際上普遍采用伯杰（Bergey)分類系統(tǒng)。臨床上也有采用ＣＤＣ系統(tǒng)分類。

該系統(tǒng)由美國疾病控制和預(yù)防中心(centerfordiseasecontrolandprevention)使用核酸雜交和核酸序列分析結(jié)果編排，對許多菌屬的分類均有所修改，并增加了許多新的菌種。

三、細(xì)菌的分類方法（一）生理學(xué)與生物化學(xué)分類法

目前，以生理生化作細(xì)菌分類廣泛采用方法有兩種：１、傳統(tǒng)分類法——生物的基本性質(zhì)（主要的、次要的）。２、數(shù)值分類法——與傳統(tǒng)主次原則不同，而是根據(jù)“等重要原則”進(jìn)行分類。

（二）遺傳學(xué)分類法

遺傳學(xué)分類是根據(jù)細(xì)菌的核酸、蛋白質(zhì)等在組成上的同源程度而分類。該分類具有下述優(yōu)點(diǎn)：①、對細(xì)菌的“種”有一個較為一致的概念；②、使分類不會出現(xiàn)經(jīng)常性和根本性的變化；③、根據(jù)分類法，可制定可靠的細(xì)菌鑒定方案；④、有利于了解細(xì)菌的進(jìn)化和原始親緣關(guān)系。１、ＤＮＡＧ＋Cmol%測定

２、核酸同源值（ＤＮＡ雜交）測定３、核蛋白體ＲＮＡ堿基序列的測定

四、病毒的分類病毒的分類是將自然界存在的病毒按其生理生化特性相似性和親緣關(guān)系加以歸納分類，國際病毒分類委員會（ＩＣＴＶ）對脊椎動物病毒提出的分類原則是：

１、核酸類型、結(jié)構(gòu)與分子量；

2、病毒的形狀大??；３、病毒的形態(tài)結(jié)構(gòu)；４、對乙醚或氯仿的敏感性；５、Ａg性；６、在細(xì)胞培養(yǎng)物上的生長特性；７、對理化因素的敏感性；８、宿主種類、傳播方式和媒介種類，流行病學(xué)特點(diǎn)及臨床病理學(xué)特征。

與人類感染有關(guān)的病毒：ＤＮＡ－Ｖ：微小V科、乳多空V科、腺v科、嗜肝Ｖ科、皰疹Ｖ科、虹彩Ｖ科、痘Ｖ科。ＲＮＡ－Ｖ：小核糖核酸Ｖ科、嵌杯樣Ｖ科呼腸Ｖ科、披蓋Ｖ科、黃Ｖ科。正粘Ｖ科、副粘Ｖ科。沙粒樣Ｖ科、彈狀Ｖ科、冠狀Ｖ科、本揚(yáng)V科和逆轉(zhuǎn)錄Ｖ科。

傳統(tǒng)分類：常根據(jù)virus的傳播途徑和臨床特點(diǎn)而將病毒分成。１、呼吸道Ｖ：流感Ｖ、副流感ｖ、風(fēng)疹Ｖ、腺Ｖ科、腮腺炎Ｖ、呼吸道合胞Ｖ、冠狀Ｖ、呼腸孤Ｖ；２、肝炎病毒：甲、乙、丙、丁、戌型肝炎Ｖ；３、腸道病毒:小核糖核酸V科:poloiv、coxsackiev、ECHOv；

４、痘類Ｖ：天花Ｖ、類天花Ｖ、牛痘Ｖ、傳染性軟疣Ｖ。主要由呼吸道飛沫傳播與皮膚接觸傳播，引起皮膚和粘膜的病變；５、瘡疹Ｖ：水痘一帶狀痘疹Ｖ、巨細(xì)胞Ｖ、ＥＢ病毒和猴B病毒。主要引起皮膚病變，大多有潛伏感染形式和腫瘤有關(guān)；

６、蟲媒Ｖ：乙型腦炎Ｖ、森林腦炎Ｖ、登革熱Ｖ、黃