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第十二章生物代謝與調(diào)節(jié)物質(zhì)酶的概述第一節(jié)酶的化學(xué)本質(zhì)第二節(jié)酶的催化特性第三節(jié)酶的結(jié)構(gòu)與功能第四節(jié)酶的催化機(jī)制第五節(jié)酶促反應(yīng)動力學(xué)第六節(jié)1.掌握酶的概念、作用特點(diǎn)及影響酶促反應(yīng)速度的各種因素;2.熟悉酶的化學(xué)結(jié)構(gòu),維生素與輔酶的關(guān)系、酶結(jié)構(gòu)與活性的關(guān)系;3.了解酶的命名、分類原則及應(yīng)用。學(xué)習(xí)目標(biāo)(一)、發(fā)展史19C中葉Pasteur葡萄糖→酒精1878Kuhne酶—提出概念1926Sumner脲酶—提出酶是蛋白質(zhì)1982Thomas
核酶—打破酶是蛋白質(zhì)觀念一、酶的概述第一節(jié)酶的概述酶是生物細(xì)胞產(chǎn)生的、具有催化功能的生物催化劑。生物催化劑酶:一般指化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì)核酶:催化活性的RNA脫氧核酶:催化活性的DNA
(二)、酶的概念系統(tǒng)名:包括所有底物的名稱和反應(yīng)類型,水可省略。系統(tǒng)名乳酸:NAD+氧化還原酶習(xí)慣名:只取一個較重要的底物名稱和反應(yīng)類型。習(xí)慣名乳酸脫氫酶(1961)酶學(xué)委員會乳酸丙酮酸(三)、酶的分類和命名簡單、常用、不準(zhǔn)確,一酶數(shù)名或一名數(shù)酶。嚴(yán)格,一個酶只有一個名稱一個編號。1.命名酶的編號乳酸脫氫酶的編號是
EC1.1.1.27表示第一大類既:氧化還原酶表示第一亞類被氧化的基團(tuán)為CHOH表示第一亞亞類氫受體為NAD+
表示該酶在此亞亞類中的順序號每一個酶的編號由4個數(shù)字組成,中間以“·”隔開。2.分類六大類
.氧化還原酶類:主要是催化氫的轉(zhuǎn)移或電子傳遞的氧化還原反應(yīng)。包括脫氫酶和氧化酶。AH2+B(O2)A+BH2(H2O2,H2O)如:乳酸脫氫酶(2).轉(zhuǎn)移酶:轉(zhuǎn)移酶催化基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)。A·X+BA+B·X如:谷丙轉(zhuǎn)氨酶CH3CHCOOHNH2HOOCCH2CH2CCOOHOHOOCCH2CH2CHCOOHNH2CH3CCOOHO(3).水解酶:水解酶催化底物的加水分解反應(yīng)。AB+H2OAOH+BH如:脂肪酶(4).裂解酶:催化從底物分子中移去一個基團(tuán)或原子形成雙鍵的反應(yīng)及其逆反應(yīng)。如:延胡索酸水合酶催化的反應(yīng)HOOCCH=CHCOOHH2OHOOCCH2CHCOOHOHH2OCOOCH2CH3RRCOOHCH3CH2OH(5).異構(gòu)酶:酶催化各種同分異構(gòu)體的相互轉(zhuǎn)化AB如:6-磷酸葡萄糖異構(gòu)酶催化(6).合成酶:又稱為連接酶,使兩個底物結(jié)合的酶類,有ATP參與。A+B+ATPA·B+ADP+Pi如:丙酮酸羧化酶丙酮酸+CO2
草酰乙酸(四)、據(jù)酶蛋白結(jié)構(gòu)特征分類1.單體酶只有一條多肽鏈的酶2.寡聚酶由幾個或多個亞基組成的酶3.多酶復(fù)合體系由幾個酶彼此嵌合形成的復(fù)合體
單個亞基沒有催化活性。
有利于細(xì)胞中一系列反應(yīng)的連續(xù)進(jìn)行。第二節(jié)酶的化學(xué)本質(zhì)一、酶的化學(xué)本質(zhì)1.大多數(shù)酶是蛋白質(zhì)證據(jù):(1)酶的結(jié)晶經(jīng)分析都是蛋白質(zhì)。(2)酶是兩性電解質(zhì)。(3)酶蛋白具有一級結(jié)構(gòu)。(4)具有膠體的性質(zhì)。(5)酶受蛋白水解酶作用喪失活性。(6)引起蛋白變性的因素,也能使酶失活。2.核酶和脫氧核酶二、酶的組成酶單純酶結(jié)合酶蛋白部分+非蛋白部分。如氧化還原酶輔因子輔酶與酶蛋白結(jié)合疏松的小分子有機(jī)物。輔基與酶蛋白結(jié)合緊密的小分子有機(jī)物。金屬離子酶的催化專一性主要決定于酶蛋白部分,輔因子通常是作為電子、原子或某些化學(xué)基團(tuán)的載體。只由氨基酸組成。如水解酶全酶=酶蛋白+輔因子第三節(jié)酶的催化特性一、酶和一般催化劑的共性1.用量少而催化效率高;2.它能夠改變化學(xué)反應(yīng)的速度,但是不能改變化學(xué)反應(yīng)平衡。3.只能催化熱力學(xué)允許的反應(yīng),在反映前后不發(fā)生改變。二、酶催化特性4.活性可調(diào)節(jié)控制:1.高效性2.專一性3.反應(yīng)條件溫和:常溫、常壓、中性酸堿度等
5.穩(wěn)定性差
酶濃度、酶活性、激素
用
-淀粉酶催化淀粉水解,1克結(jié)晶酶在65C條件下可催化2噸淀粉水解。6*106
mol/mol.S。2H2O22H2O+O2酶的催化作用可使反應(yīng)速度提高106-1012倍。例如:過氧化氫分解Fe+:6*10-4
mol/mol.S過氧化氫酶:專一性絕對專一性相對專一性只能對一種立體異構(gòu)體起催化作用。基團(tuán)專一性:除了要求A和B之間的鍵合適外,還對其所作用鍵兩端的基團(tuán)具有不同的專一性。
鍵專一性:只要求底物分子上有適合的化學(xué)鍵就可以起催化作用。除一種底物以外,其它任何物質(zhì)它都不起催化作用。立體專一性專一性:酶只催化某一類底物發(fā)生特定的反應(yīng),產(chǎn)生一定的產(chǎn)物。第四節(jié)酶的結(jié)構(gòu)和功能一、酶的活性中心必需基團(tuán):
與酶活性相關(guān)的基團(tuán)。如,Ser:OH,His:咪唑基,Cys:SH,Glu,Asp:COOH.
酶的活性中心:
酶分子中與底物結(jié)合并起催化反應(yīng)的場所,由少數(shù)幾個氨基酸殘基構(gòu)成的。AspHisSer胰凝乳蛋白酶的活性中心必需基團(tuán)結(jié)合基團(tuán):活性中心外的必需基團(tuán):非必需基團(tuán)
決定酶的專一性
酶的活性中心催化基團(tuán):催化底物轉(zhuǎn)變成產(chǎn)物決定酶的催化效率與底物相結(jié)合的基團(tuán)維持酶的空間構(gòu)象二、酶的別構(gòu)中心概念有些酶分子除具有與底物結(jié)合的活性中心外,還具有與非底物的化合物結(jié)合的部位,這個部位叫做酶的別構(gòu)中心。
與別構(gòu)中心結(jié)合的物質(zhì)稱為調(diào)節(jié)劑或別構(gòu)劑
激活劑:使酶反應(yīng)速度增高的。抑制劑:使酶反應(yīng)速度降低的。具有別構(gòu)部位的酶稱為別構(gòu)酶(變構(gòu)酶)
調(diào)節(jié)物與酶分子中的別構(gòu)中心結(jié)合后,引起酶蛋白構(gòu)象的變化,使酶活性中心對底物的結(jié)合和催化作用受到影響,從而調(diào)節(jié)酶促反應(yīng)速度及代謝過程,此效應(yīng)稱為酶的“別構(gòu)效應(yīng)”。別構(gòu)激活(正協(xié)同效應(yīng))和別構(gòu)抑制(負(fù)協(xié)同效應(yīng))
酶原:沒有活性的酶的前體。三、酶原和酶原的激活酶原的激活:酶原在一定條件下經(jīng)適當(dāng)?shù)奈镔|(zhì)作用可轉(zhuǎn)變成有活性的酶。酶原轉(zhuǎn)變成酶的過程稱為酶原的激活。本質(zhì):酶原的激活實(shí)質(zhì)上是酶活性部位形成或暴露的過程。分子結(jié)構(gòu)不同:理化性質(zhì)和免疫學(xué)性質(zhì)不同。四、同功酶能催化同一化學(xué)反應(yīng)的一類酶?;钚灾行南嗨苹蛳嗤捍呋换瘜W(xué)反應(yīng)。乳酸脫氫酶(LDH)MHM4M3HM2H2MH3H4MMMMMMMHMMHHMHHHHHHH五、共價修飾酶六、誘導(dǎo)酶七、核糖酶八、酶與抗體——抗體酶最常見的共價修飾形式是磷酸化與脫磷酸化。第五節(jié)酶的催化機(jī)制一、酶促反應(yīng)使反應(yīng)的活化能降低E+SP+EES能量水平反應(yīng)過程
G
E1
E2S[舉例]2H2O2→2H2O+O2無催化劑活化能為75348J/molPt48976J/mol過氧化氫酶8372J/mol說明:酶的催化效率極高[酶為何能降低反應(yīng)的活化能?可用中間產(chǎn)物學(xué)說來解釋。]二、中間產(chǎn)物學(xué)說EPESSEkk+??????+21???-1kEP1ES1S1ES+??+2P2+??E
:酶S:底物ES:中間產(chǎn)物P
:產(chǎn)物三、誘導(dǎo)契合學(xué)說酶活性中心在結(jié)構(gòu)上有一定柔性,當(dāng)?shù)孜铮せ顒┗蛞种苿┡c酶分子結(jié)合時,酶蛋白的構(gòu)象發(fā)生了有利于與底物結(jié)合的變化,使反應(yīng)所需的催化基團(tuán)和結(jié)合基團(tuán)正確地排列和定向,使酶與底物成互補(bǔ)形狀而結(jié)合成中間產(chǎn)物。誘導(dǎo)契合學(xué)說
四、
酶作用高效性的機(jī)理鄰近效應(yīng):酶與底物形成中間復(fù)合物后使底物之間、酶的催化基團(tuán)與底物之間相互靠近,提高了反應(yīng)基團(tuán)的有效濃度。
定向效應(yīng):由于酶的構(gòu)象作用,底物的反應(yīng)基團(tuán)之間、酶與底物的反應(yīng)基團(tuán)之間正確取向的效應(yīng)。
定義:酶促反應(yīng)動力學(xué)是研究酶促反應(yīng)速度以及各種條件下對酶反應(yīng)速度的影響第六節(jié)酶促反應(yīng)動力學(xué)一酶濃度對酶促反應(yīng)速度的影響當(dāng)反應(yīng)系統(tǒng)中底物的濃度足夠大時,酶促反應(yīng)速度與酶濃度成正比。
即ν=k[E]。
在低底物濃度時,反應(yīng)速度與底物濃度成正比,為一級反應(yīng)。底物濃度增大與速度的增加不成正比,為混合級反應(yīng).
當(dāng)?shù)孜餄舛冗_(dá)到一定值,幾乎所有的酶都與底物結(jié)合后,反應(yīng)速度達(dá)到最大值(Vmax),此時再增加底物濃度,反應(yīng)速度不再增加,表現(xiàn)為零級反應(yīng)。一底物濃度對酶促反應(yīng)速度的影響(一)V-S曲線1913年,德國化學(xué)家Michaelis和Menten根據(jù)中間產(chǎn)物學(xué)說對酶促反映的動力學(xué)進(jìn)行研究,推導(dǎo)出了表示整個反應(yīng)中底物濃度和反應(yīng)速度關(guān)系的著名公式,稱為米氏方程。Km—
米氏常數(shù)Vmax—
最大反應(yīng)速度(二)米氏方程米氏方程Km即為米氏常數(shù),Vmax為最大反應(yīng)速度當(dāng)反應(yīng)速度等于最大速度一半時,即V=1/2Vmax,Km=[S]上式表示,米氏常數(shù)是反應(yīng)速度為最大值的一半時的底物濃度。因此,米氏常數(shù)的單位為mol/L。(三)米氏常數(shù)的意義及測定米氏常數(shù)Km的意義不同的酶具有不同Km值,它是酶的一個重要的特征物理常數(shù)。Km值只是在固定的底物,一定的溫度和pH條件下,一定的緩沖體系中測定的,不同條件下具有不同的Km值。Km值表示酶與底物之間的親和程度:Km值大表示親和程度小,酶的催化活性低;Km值小表示親和程度大,酶的催化活性高。
米氏常數(shù)的測定
基本原則:將米氏方程變化成相當(dāng)于y=ax+b的直線方程,再用作圖法求出Km。例:雙倒數(shù)作圖法(Lineweaver-Burk法)米氏方程的雙倒數(shù)形式:
1Km11—=——.—+——
vVmax[S]Vmax
1Km11
=
+
V
Vmax[S]Vmax取米氏方程式的倒數(shù)形式:1/Vmax斜率=Km/Vmax-1/Km米氏常數(shù)Km的測定:酶的Km在實(shí)際應(yīng)用中的意義
鑒定酶:通過測定Km,可鑒別不同來源或相同來源但在不同發(fā)育階段,不同生理狀態(tài)下催化相同反應(yīng)的酶是否是屬于同一種酶。判斷酶的最適底物。(天然底物)計(jì)算一定速度下底物濃度。了解酶的底物在體內(nèi)具有的濃度水平。判斷反應(yīng)方向或趨勢。判斷抑制類型。從米氏方程中求得:當(dāng)反應(yīng)速度達(dá)到最大反應(yīng)速度的90%,則90%V=100%V[S]/(km+[S])v=——————Vmax·[S]km+[S]即[S]=9km在進(jìn)行酶活力測定時,通常用4km的底物濃度即可。計(jì)算一定速度下底物濃度三pH的影響在一定的pH下,酶具有最大的催化活性,通常稱此pH為最適pH。pHv最適pH(optimumpH)pH
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