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文檔簡介
學(xué)習(xí)好資料歡迎下載學(xué)習(xí)好資料歡迎下載學(xué)習(xí)好資料歡迎下載生物化學(xué)名詞解釋集錦第一章蛋白質(zhì)1.兩性離子:指在同一氨基酸分子上含有等量的正負(fù)兩種電荷,又稱兼性離子或偶極離子。2.必需氨基酸:指人體(和其它哺乳動物)自身不能合成,機(jī)體又必需,需要從飲食中獲得的氨基酸。3.
氨基酸等電點:指氨基酸的正離子濃度和負(fù)離子濃度相等時的pH
值,用符號pI表示。4.稀有氨基酸:指存在于蛋白質(zhì)中的20
種常見氨基酸以外的其它罕見氨基酸,它們是正常氨基酸的衍生物。5.非蛋白質(zhì)氨基酸:指不存在于蛋白質(zhì)分子中而以游離狀態(tài)和結(jié)合狀態(tài)存在于生物體的各種組織和細(xì)胞的氨基酸。6.構(gòu)型:指在立體異構(gòu)體中不對稱碳原子上相連的各原子或取代基團(tuán)的空間排布。構(gòu)型的轉(zhuǎn)變伴隨著共價鍵的斷裂和重新形成。8.構(gòu)象:指有機(jī)分子中,不改變共價鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原子旋轉(zhuǎn)所產(chǎn)生的原子的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時,不涉及共價鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會改變分子的光學(xué)活性。7.蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)多肽鏈中氨基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。9.蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu):指在蛋白質(zhì)分子中的局部區(qū)域內(nèi),多肽鏈沿一定方向盤繞和折疊的方式。15.超二級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)分子中相鄰的二級結(jié)構(gòu)單位組合在一起所形成的有規(guī)則的、在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體。11.蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu):指蛋白質(zhì)在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。13.蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu):指多亞基蛋白質(zhì)分子中各個具有三級結(jié)構(gòu)的多肽鏈以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)的三維結(jié)構(gòu)。10.結(jié)構(gòu)域:指蛋白質(zhì)多肽鏈在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步卷曲折疊成幾個相對獨立的近似球形的組裝體。12.氫鍵:指蛋白質(zhì)在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上借助各種次級鍵卷曲折疊成特定的球狀分子結(jié)構(gòu)的構(gòu)象。14.離子鍵:帶相反電荷的基團(tuán)之間的靜電引力,也稱為靜電鍵或鹽鍵。16.疏水鍵:非極性分子之間的一種弱的、非共價的相互作用。如蛋白質(zhì)分子中的疏水側(cè)鏈避開水相而相互聚集而形成的作用力。17.范德華力:中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一種弱的分子間的力。當(dāng)兩個原子之間的距離為它們的范德華半徑之和時,范德華力最強(qiáng)。18.二硫鍵:通過兩個(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價鍵。18.鹽析:在蛋白質(zhì)溶液中加入一定量的高濃度中性鹽(如硫酸氨),使蛋白質(zhì)溶解度降低并沉淀析出的現(xiàn)象稱為鹽析。19.鹽溶:在蛋白質(zhì)溶液中加入少量中性鹽使蛋白質(zhì)溶解度增加的現(xiàn)象。20.蛋白質(zhì)變性:蛋白質(zhì)分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照、熱、有機(jī)溶劑以及一些變性劑的作用時,次級鍵遭到破壞導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,但其一級結(jié)構(gòu)不發(fā)生改變。21.蛋白質(zhì)復(fù)性:指在一定條件下,變性的蛋白質(zhì)分子恢復(fù)其原有的天然構(gòu)象并恢復(fù)生物活性的現(xiàn)象。22.蛋白質(zhì)沉淀:在外界因素影響下,蛋白質(zhì)分子失去水化膜或被中和其所帶電荷,導(dǎo)致溶解度降低從而使蛋白質(zhì)變得不穩(wěn)定而沉淀的現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)的沉淀作用。23.凝膠電泳:以凝膠為介質(zhì),在電場作用下分離蛋白質(zhì)或核酸等分子的分離純化技術(shù)。24.層析:按照在移動相(可以是氣體或液體)和固定相(可以是液體或固體)之間的分配比例將混合成分分開的技術(shù)。1.氨基酸:是含有一個堿性氨基和一個酸性羧基的有機(jī)化合物,氨基一般連在α-碳上。2.茚三酮反應(yīng):在加熱條件下,氨基酸或肽與茚三酮反應(yīng)生成紫色(與脯氨酸反應(yīng)生成黃色)化合物的反應(yīng)。3.肽鍵:一個氨基酸的羧基與另一個的氨基的氨基縮合,除去一分子水形成的酰氨鍵。4.肽:兩個或兩個以上氨基通過肽鍵共價連接形成的聚合物。5.肽單位:又稱為肽基,是肽鍵主鏈上的重復(fù)結(jié)構(gòu)。是由參于肽鏈形成的氮原子,碳原子和它們的4個取代成分:羰基氧原子,酰氨氫原子和兩個相鄰α-碳原子組成的一個平面單位。6.透析(dialysis):通過小分子經(jīng)過半透膜擴(kuò)散到水(或緩沖液)的原理,將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。7.離子交換層析:使用帶有固定的帶電基團(tuán)的聚合樹脂或凝膠層析柱8.凝膠過濾層析:也叫做分子排阻層析。一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì),按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。9.親合層析:利用共價連接有特異配體的層析介質(zhì),分離蛋白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白質(zhì)或其它分子的層析技術(shù)。10.高壓液相層析(HPLC):使用顆粒極細(xì)的介質(zhì),在高壓下分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物的層析技術(shù)。11.SDS-聚丙烯酰氨凝膠電泳(SDS):在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰氨凝膠電泳。SDS只是按照分子的大小,而不是根據(jù)分子所帶的電荷大小分離的。12.等電聚膠電泳(IFE):利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質(zhì))在聚丙烯酰氨凝膠制造一個pH梯度,電泳時,每種蛋白質(zhì)遷移到它的等電點(pI)處,即梯度足的某一pH時,就不再帶有凈的正或負(fù)電荷了。13.雙向電泳:等電聚膠電泳和SDS的組合,即先進(jìn)行等電聚膠電泳(按照pI)分離,然后再進(jìn)行SDS(按照分子大小分離)。經(jīng)染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質(zhì)圖。14.Edman降解:從多肽鏈游離的N末端測定氨基酸殘基的序列的過程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個殘基)被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。15.同源蛋白質(zhì):來自不同種類生物的序列和功能類似的蛋白質(zhì),例如血紅蛋白。16.α-螺旋:蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。17.β-折疊:蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu),是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構(gòu)象是通過一個肽鍵的羰基氧和位于同一個肽鏈的另一個酰氨氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列。18.β-轉(zhuǎn)角:多肽鏈中常見二級結(jié)構(gòu),是連接蛋白質(zhì)分子中的二級結(jié)構(gòu),使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū),一般含有2~16個氨基酸殘基。含有5個以上的氨基酸殘基的轉(zhuǎn)角又常稱為環(huán)。常見的轉(zhuǎn)角含有4個氨基酸殘基有兩種類型:轉(zhuǎn)角I的特點是:第一個氨基酸殘基羰基氧與第四個殘基的酰氨氮之間形成氫鍵;轉(zhuǎn)角Ⅱ的第三個殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第二個殘侉大都是脯氨酸。19.纖維蛋白:一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有呈現(xiàn)相同二級結(jié)構(gòu)的多肽鏈許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為單個細(xì)胞或整個生物體提供機(jī)械強(qiáng)度,起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)上的作用。20.球蛋白:緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白質(zhì),許多都溶于水。典形的球蛋白含有能特異的識別其它化合物的凹陷或裂隙部位。21.角蛋白:由處于α-螺旋或β-折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成不溶于水的起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)作用蛋白質(zhì)。22.膠原蛋白:是動物結(jié)締組織最豐富的一種蛋白質(zhì),它是由原膠原蛋白分子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。每個原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。23.伴娘蛋白:與一種新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它正確折疊成具有生物功能構(gòu)向的蛋白質(zhì)。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。24.肌紅蛋白:是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,是肌肉內(nèi)儲存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。25.血紅蛋白:是由含有血紅素輔基的4個亞基組成的結(jié)合蛋白。血紅蛋白負(fù)責(zé)將氧由肺運輸?shù)酵庵芙M織,它的氧飽和曲線為S型。26.波爾效應(yīng):CO2濃度的增加降低細(xì)胞內(nèi)的pH,引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白氧親和力下降的現(xiàn)象。27.別構(gòu)效應(yīng):又稱為變構(gòu)效應(yīng),是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性喪失的現(xiàn)象。28.鐮刀型細(xì)胞貧血病:血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白β—亞基N端的第六個氨基酸殘缺是纈氨酸,而不是下正常的谷氨酸殘基。膠體性質(zhì):布朗運動,丁達(dá)爾現(xiàn)象,不能透過半透膜,粘度大氨基酸三個重要反應(yīng):(1)茚三酮反應(yīng):Pro產(chǎn)生黃色物質(zhì),其它為藍(lán)紫色
(2)Edman反應(yīng):氨基酸的α氨基酸在弱堿性條件先下能與苯異硫氰酸脂生成
(3)桑格反應(yīng):氨基酸的α氨基與2,4-二硝基氟苯在弱堿性溶液中反應(yīng)生成黃色的二硝基苯基氨基酸1.不同蛋白質(zhì)種含氮量頗為接近,平均為
16%
.
3.蛋白質(zhì)能穩(wěn)定地分散在水中,主要靠兩個因素:水化膜和電荷層
4.堿性氨基酸有三種,包括精氨酸、組氨酸和賴氨酸。
5.維系蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵是肽鍵6.蛋白質(zhì)最高吸收峰波長是
280nm
.
7.維系蛋白質(zhì)分子中α-螺旋的化學(xué)鍵是氫鍵。
8.蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)形式有α-螺旋、β-片層、β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲等
9.在280nm波長處有吸收峰的氨基酸為酪氨酸、色氨酸1.
蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)的層次性:
(1)
一級結(jié)構(gòu):是指氨基酸在肽鍵中的鏈接方式排列順序及二硫鍵的位置。
(2)
二級結(jié)構(gòu):指多肽鏈骨架的幾何走向,即多肽酶的螺旋和折疊,包括α-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角、無規(guī)則卷曲
(3)
三級結(jié)構(gòu):具有二級結(jié)構(gòu)的多肽鏈進(jìn)一步折疊、卷曲形成的復(fù)雜的球狀結(jié)構(gòu),多肽鏈所發(fā)生的盤旋是由蛋白質(zhì)分子中氨基酸殘基側(cè)鏈(R基因)的順序決定的。
(4)
四級結(jié)構(gòu):由具有三級結(jié)構(gòu)的亞基以次級鍵締合而成的空間結(jié)構(gòu)
(5)
在二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)之間還有超二級結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域
2.蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu),空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系
(1)蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu)與功能關(guān)系的高度統(tǒng)一性
(2)一級結(jié)構(gòu)決定高級結(jié)構(gòu)
(3)蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)發(fā)揮生物功能的基礎(chǔ),空間結(jié)構(gòu)的改變必然導(dǎo)致功能的改變,所以生物體內(nèi)各種分子間復(fù)雜、專一、靈活而多樣的功能表現(xiàn)都是因為蛋白質(zhì)具有其相應(yīng)的空間結(jié)構(gòu)。第二章核酸1.
單核苷酸(mononucleotide):核苷與磷酸縮合生成的磷酸酯稱為單核苷酸。2.
磷酸二酯鍵(phosphodiesterbonds):單核苷酸中,核苷的戊糖與磷酸的羥基之間形成的磷酸酯鍵。3.
不對稱比率(dissymmetryratio):不同生物的堿基組成由很大的差異,這可用不對稱比率(A+T)/(G+C)示。4.
堿基互補規(guī)律(complementarybasepairing):在形成雙螺旋結(jié)構(gòu)的過程中,由于各種堿基的大小與結(jié)構(gòu)的不同,使得堿基之間的互補配對只能在G?C(或C?G)和A=T(或T=A)之間進(jìn)行。5.
反密碼子(anticodon):在tRNA
鏈上有三個特定的堿基,組成一個密碼子,由這些反密碼子按堿基配對原則識別mRNA
鏈上的密碼子。反密碼子與密碼子的方向相反。6.
順反子(cistron):基因功能的單位;一段染色體,它是一種多肽鏈的密碼;一種結(jié)構(gòu)基因。7.
核酸的變性、復(fù)性(denaturation、renaturation):當(dāng)呈雙螺旋結(jié)構(gòu)的DNA
溶液緩慢加熱時,其中的氫鍵便斷開,雙鏈DNA
便脫解為單鏈,這叫做核酸的變性。在適宜的溫度下,分散開的兩條DNA
鏈可以完全重新結(jié)合成和原來一樣的雙股螺旋。這個DNA
螺旋的重組過程稱為“復(fù)性”。8.
退火(annealing):當(dāng)將雙股鏈呈分散狀態(tài)的DNA
溶液緩慢冷卻時,它們可以發(fā)生不同程度的重新結(jié)合而形成雙鏈螺旋結(jié)構(gòu),這現(xiàn)象稱為“退火”。9.
增色效應(yīng)(hyperchromiceffect):當(dāng)DNA
從雙螺旋結(jié)構(gòu)變?yōu)閱捂湹臒o規(guī)則卷曲狀態(tài)時,它在260nm
處的吸收便增加,這叫“增色效應(yīng)”。10.
減色效應(yīng)(hypochromiceffect):DNA
在260nm
處的光密度比在DNA
分子中的各個堿基在260nm
處吸收的光密度的總和小得多(約少35%-40%),
這稱為“減色效應(yīng)”。11.
噬菌體(phage):一種病毒,它可破壞細(xì)菌,并在其中繁殖。也叫細(xì)菌的病毒。12.
發(fā)夾結(jié)構(gòu)(hairpinstructure):RNA
是單鏈線形分子,只有局部區(qū)域為雙鏈結(jié)構(gòu)。這些結(jié)構(gòu)是由于RNA
單鏈分子通過自身回折使得互補的堿基對相遇,形成氫鍵結(jié)合而成的,稱為發(fā)夾結(jié)構(gòu)。13.
DNA
熔解溫度:引起DNA
發(fā)生“熔解”的溫度變化范圍只不過幾度,這個溫度變化范圍的中點稱為熔解溫度(Tm)。14.
分子雜交(molecularhybridization):不同的DNA
片段之間,DNA
片段與RNA
片段之間,如果彼此間的核苷酸排列順序互補也可以復(fù)性,形成新的雙螺旋結(jié)構(gòu)。這種按照互補堿基配對而使不完全互補的兩條多核苷酸相互結(jié)合的過程稱為分子雜交。15.
環(huán)化核苷酸(cyclicnucleotide):單核苷酸中的磷酸基分別與戊糖的3’-OH
及5’-OH形成酯鍵,這種磷酸內(nèi)酯的結(jié)構(gòu)稱為環(huán)化核苷酸。1.核苷:是嘌呤或嘧啶堿通過共價鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的β-N-糖鍵連接。2.核苷酸:核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。3.cAMP:3ˊ,5ˊ-環(huán)腺苷酸,是細(xì)胞內(nèi)的第二信使,由于某部些激素或其它分子信號刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成的。4.DNA:含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸,脫氧核苷酸之間是是通過3ˊ,5ˊ-磷酸二脂鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。5.RNA:通過3ˊ,5ˊ-磷酸二脂鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。6.mRNA:一類用作蛋白質(zhì)合成模板的RNA.7.rRNA:作為組成成分的一類RNA,是細(xì)胞內(nèi)最豐富的RNA.8.tRNA:一類攜帶激活氨基酸,將它帶到蛋白質(zhì)合成部位并將氨基酸整合到生長著的肽鏈上RNA。tRNA含有能識別模板mRNA上互補密碼的反密碼。10.轉(zhuǎn)化:一個外源DNA通過某種途徑導(dǎo)入一個宿主菌,引起該菌的遺傳特性改變的作用。11.轉(zhuǎn)導(dǎo):借助于病毒載體,遺傳信息從一個細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個細(xì)胞。12.堿基對:通過堿基之間氫鍵配對的核酸鏈中的兩個核苷酸。13.夏格夫法則:所有DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等(A=T),鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等(G=C),既嘌呤的總含量相等(A+G=T+C)。DNA的堿基組成具有種的特異性,但沒有組織和器官的特異性。另外,生長和發(fā)育階段`營養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。15.大溝和小溝:繞B-DNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽(溝),寬的溝稱為大溝,窄溝稱為小溝。大溝,小溝都、是由于堿基對堆積和糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。16.DNA超螺旋:DNA本身的卷曲一般是DNA雙`螺旋的彎曲欠旋(負(fù)超螺旋)或過旋(正超螺旋)的結(jié)果。17.拓?fù)洚悩?gòu)酶:通過切斷DNA的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵,然后重新纏繞和封口來改變DNA連環(huán)數(shù)的酶。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ、通過切斷DNA中的一條鏈減少負(fù)超螺旋,增加一個連環(huán)數(shù)。某些拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ也稱為DNA促旋酶。18.核小體:用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位,是由DNA鏈纏繞一個組蛋白核構(gòu)成的。19.染色質(zhì):是存在與真核生物間期細(xì)胞核內(nèi),易被堿性染料著色的一種無定形物質(zhì)。染色質(zhì)中含有作為骨架的完整的雙鏈DNA,以及組蛋白`非組蛋白和少量的DNA。20.染色體:是染色質(zhì)在細(xì)胞分裂過程中經(jīng)過緊密纏繞`折疊`凝縮和精細(xì)包裝形成的具有固定形態(tài)的遺傳物質(zhì)存在形式。簡而言之,染色體是一個大的單一的雙鏈DNA分子與相關(guān)蛋白質(zhì)組成的復(fù)合物,DNA中含有許多貯存和傳遞遺傳信息的基因。26.核酸內(nèi)切酶:核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶。27.核酸外切酶:從核酸鏈的一端逐個水解核甘酸的酶。28.限制性內(nèi)切酶:一種在特殊核甘酸序列處水解雙鏈DNA的內(nèi)切酶。Ⅰ型限制性內(nèi)切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而Ⅱ型限制性內(nèi)切酶只催化非甲基化的DNA的水解。29.限制酶圖譜:同一DNA用不同的限制酶進(jìn)行切割,從而獲得各種限制酶的切割位點,由此建立的位點圖譜有助于對DNA的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。30.反向重復(fù)序列:在同一多核甘酸內(nèi)的相反方向上存在的重復(fù)的核甘酸序列。在雙鏈DNA中反向重復(fù)可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。31.重組DNA技術(shù):也稱之為基因工程.利用限制性內(nèi)切酶和載體,按照預(yù)先設(shè)計的要求,將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉(zhuǎn)入另一生物細(xì)胞中進(jìn)行復(fù)制`轉(zhuǎn)錄和表達(dá)的技術(shù)。32.基因:也稱為順反子.泛指被轉(zhuǎn)錄的一個DNA片段。在某些情況下,基因常用來指編碼一個功能蛋白或DNA分子的DNA片段。是指DNA分子上具有遺傳效應(yīng)的特定核苷酸序列的總稱,是DNA分子中最小的功能單位,基因包含于DNA大分子中,存在于染色體上,基因在遺傳中具有獨立性和完整性。33.tRNA的二級結(jié)構(gòu)是三葉草型,三級結(jié)構(gòu)是倒L型。
在核酸中占9%-10%并可用于計算核酸含量的元素為磷元素核酸分類及功能:脫氧核糖核酸:生物繁殖、遺傳、變異
核糖核酸:蛋白質(zhì)的生物合成
核酸化學(xué)組成:核酸完全水解產(chǎn)生嘌呤和嘧啶等堿性物質(zhì)、戊糖(核糖或脫氧核糖)和磷酸的混合物。核酸部分水解則產(chǎn)生核苷和核苷酸。核酸一般性質(zhì):
(1)兩性解離/一般呈酸性(在中性溶液中帶負(fù)電荷),微溶于水,不溶于有機(jī)溶劑
(2)線性大分子(粘度高??辜羟辛Σ睿?/p>
(3)可用電泳或離子交換(色譜)進(jìn)行分離
(4)核酸紫外吸收性質(zhì):DNA和RNA溶液中加入溴化乙錠(EB),在紫外光下發(fā)出熒光,最大吸收峰值260nm組成DNA、RNA的核苷酸有哪些?
組成DNA的四種核苷酸是dAMP、dGMP、dCMP和dTMP;
組成RNA的四種核苷酸是AMP、GMP、CMP和UMP。
DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)特點是什么?
DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)特點是:
①DNA分子由兩條相互平行但走向相反的脫氧多核苷酸鏈組成,以右手螺旋方式繞同一公共軸盤。
②.兩鏈以-脫氧核糖-磷酸-為骨架,在外側(cè);堿基垂直螺旋軸,居雙螺旋內(nèi)側(cè),與對側(cè)堿基形成氫鍵配對(互補配對形式:A=T;
G=C)。
③.螺旋直徑為2nm;相鄰堿基平面距離0.34nm,螺旋一圈螺距3.4nm,一圈10對堿基。
④DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的因素:a.氫鍵維持雙鏈橫向穩(wěn)定性;b.堿基堆積力維持雙鏈縱向穩(wěn)定性。
mRNA、tRNA、rRNA各自的功能是什么?
mRNA的功能:蛋白質(zhì)合成的直接模板。
tRNA的功能:活化、搬運氨基酸到核糖體,參與蛋白質(zhì)的翻譯。
rRNA的功能:參與組成核蛋白體,作為蛋白質(zhì)生物合成的場所。第三章酶與輔酶1.米氏常數(shù):用Km
值表示,是酶的一個重要參數(shù)。Km
值是酶反應(yīng)速度(V)達(dá)到最大反應(yīng)速度(Vmax)一半時底物的濃度(單位M
或mM)。是酶的特征常數(shù),只與酶性質(zhì)有關(guān),不受底物濃度和酶濃度的影響。同一酶對于不同底物有不同的Km值。2.底物專一性:酶的專一性是指酶對底物及其催化反應(yīng)的嚴(yán)格選擇性。通常酶只能催化一種化學(xué)反應(yīng)或一類相似的反應(yīng),不同的酶具有不同程度的專一性,可分為三種類型:絕對專一性、相對專一性、立體專一性。3.輔基:酶的輔因子或結(jié)合蛋白質(zhì)的非蛋白部分,與酶或蛋白質(zhì)結(jié)合得非常緊密,用透析法不能除去。4.單體酶:只有一條多肽鏈的酶稱為單體酶,它們不能解離為更小的單位。5.寡聚酶:有幾個或多個亞基組成的酶稱為寡聚酶。寡聚酶中的亞基可以是相同的,也可以是不同的。亞基間以非共價鍵結(jié)合,容易為酸堿,高濃度的鹽或其它的變性劑分離。寡聚酶的分子量從35000
到幾百萬。6.多酶體系:由幾個酶彼此嵌合形成的復(fù)合體稱為多酶體系。多酶復(fù)合體有利于細(xì)胞中一系列反應(yīng)的連續(xù)進(jìn)行,以提高酶的催化效率,同時便于機(jī)體對酶的調(diào)控。多酶復(fù)合體的分子量都在幾百萬以上。7.激活劑:凡是能提高酶活性的物質(zhì),都稱激活劑,其中大部分是離子或簡單的有機(jī)化合物。8.抑制劑:能使酶的必需基團(tuán)或酶活性部位中的基團(tuán)的化學(xué)性質(zhì)改變而降低酶的催化活性甚至使酶的催化活性完全喪失的物質(zhì)。9.變構(gòu)酶:或稱別構(gòu)酶,是代謝過程中的關(guān)鍵酶,它的催化活性受其三維結(jié)構(gòu)中的構(gòu)象變化的調(diào)節(jié)。10.同工酶:是指有機(jī)體內(nèi)能夠催化同一種化學(xué)反應(yīng),但其酶蛋白本身的分子結(jié)構(gòu)組成卻有所不同的一組酶。11.誘導(dǎo)酶:是指當(dāng)細(xì)胞中加入特定誘導(dǎo)物后誘導(dǎo)產(chǎn)生的酶,它的含量在誘導(dǎo)物存在下顯著增高,這種誘導(dǎo)物往往是該酶底物的類似物或底物本身。12.酶原:酶的無活性前體,通常在有限度的蛋白質(zhì)水解作用后,轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂谢钚缘拿浮?3.酶的比活力:比活力是指每毫克蛋白質(zhì)所具有的活力單位數(shù),可以用下式表示:比活力=
蛋白質(zhì)量(mg)14.活性中心:在酶分子表面有必需基團(tuán)組成的能和底物結(jié)合并催化底物發(fā)生反應(yīng),生成相應(yīng)產(chǎn)物的部分區(qū)域,包括結(jié)合部位和催化部位兩個部位。2.脫脯基酶蛋白:酶中除去催化活性可能需要的有機(jī)或無機(jī)輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。3.全酶:具有催化活性的酶,包括所有必需的亞基,輔基和其它輔助因子。4.酶活力單位:酶活力單位的量度。1個酶活力單位是指在特定條件(25oC,其它為最適條件)下,在1min內(nèi)能轉(zhuǎn)化1μmol底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中1μmol的有關(guān)基團(tuán)的酶量。6.活化能:將1mol反應(yīng)底物中所有分子由其態(tài)轉(zhuǎn)化為過度態(tài)所需要的能量。7.活性部位:酶中含有底物結(jié)合部位和參與催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的氨基酸殘基部分?;钚圆课煌ǔN挥诘鞍踪|(zhì)的結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙或是蛋白質(zhì)表面的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很進(jìn)的一些氨基酸殘基組成。8.酸-堿催化:質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反應(yīng)的催化作用。9.共價催化:一個底物或底物的一部分與催化劑形成共價鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個底物。許多酶催化的基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過共價方式進(jìn)行的。10.靠近效應(yīng):非酶促催化反應(yīng)或酶促反應(yīng)速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位處反應(yīng)劑有效濃度增大的結(jié)果,這將導(dǎo)致更頻繁地形成過度態(tài)。11.初速度:酶促反應(yīng)最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度,這一階段產(chǎn)物的濃度非常低,其逆反應(yīng)可以忽略不計。12.米氏方程:表示一個酶促反應(yīng)的起始速度(υ)與底物濃度([s])關(guān)系的速度方程:υ=υmax[s]/(Km+[s])14.催化常數(shù)(Kcat):也稱為轉(zhuǎn)換數(shù)。是一個動力學(xué)常數(shù),是在底物處于飽和狀態(tài)下一個酶(或一個酶活性部位)催化一個反應(yīng)有多快的測量。催化常數(shù)等于最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度(υmax/[E]total)?;蚴敲磕γ富钚圆课幻棵腌娹D(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的量(摩[爾])。15.雙倒數(shù)作圖:稱為Lineweaver_Burk作圖。一個酶促反應(yīng)的速度的倒數(shù)(1/V)對底物度的倒數(shù)(1/LSF)的作圖。x和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度的倒數(shù)。18.反競爭性抑制作用:抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合而不與游離的酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km和υmax都變小但υmax/Km不變。19,絲氨酸蛋白酶:活性部位含有在催化期間起親核作用的絲氨殘基的蛋白質(zhì)。21.調(diào)節(jié)酶:位于一個或多個代謝途徑內(nèi)的一個關(guān)鍵部位的酶,它的活性根據(jù)代謝的需要而增加或降低。22.別構(gòu)調(diào)節(jié)酶:那稱為別構(gòu)效應(yīng)物。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位,調(diào)節(jié)酶催化活性的生物分子。別構(gòu)調(diào)節(jié)物可以是是激活劑,也可以是抑制劑。23.別構(gòu)調(diào)節(jié)劑:結(jié)合在別構(gòu)調(diào)節(jié)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。24.齊變模式:相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式,按照最簡單的齊變模式,由于一個底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)相在T(對底物親和性低的構(gòu)象)和R(對底物親和性高的構(gòu)象)之間變換。這一模式提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有相同的構(gòu)象,或是T構(gòu)象,或是R構(gòu)象。25.序變模式:相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡單的序變模式,一個配體的結(jié)合會誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級結(jié)構(gòu)的變化,并使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個亞基對配體具有高的親和力。酶的概念及其化學(xué)本質(zhì):酶是生物體內(nèi)產(chǎn)生的具有催化活性的蛋白質(zhì),是生物催化劑。其化學(xué)本質(zhì)是蛋白質(zhì),還有少量RNA。
酶原的激活:酶原是不具催化活性的酶的前體。某種物質(zhì)作用于酶原使之轉(zhuǎn)變成有活性的酶的過程稱為酶原的激活。酶原激活的本質(zhì)是:酶活性中心的形成或暴露的過程。酶的共價修飾:酶蛋白肽鏈上某些氨基酸殘基,在另一種酶的催化下,發(fā)生可逆的共價修飾,從而改變酶的活性,酶的這種調(diào)節(jié)方式稱為化學(xué)修飾調(diào)節(jié)變構(gòu)(酶)調(diào)節(jié):體內(nèi)一些代謝物可以與某些酶分子活性中心外的某一部位可逆結(jié)合,使酶發(fā)生變構(gòu)并改變其催化活性,對酶催化活性的這種調(diào)節(jié)方式稱為..受變構(gòu)調(diào)節(jié)的酶稱為變構(gòu)酶
蛋白酶及肽酶:蛋白酶種類很多,作用是分解蛋白質(zhì)或肽分子中的肽鍵。根據(jù)蛋白酶作用的部位不同,將其分為內(nèi)肽酶和外肽酶。內(nèi)肽酶水解蛋白質(zhì)多肽鏈內(nèi)部的肽鍵,通常稱之為蛋白酶。外肽酶作用于多肽酶兩端的肽鍵。比活力:是表示酶制劑純度的一個指標(biāo),指每毫克酶蛋白(或每毫克蛋白氮)所含的酶活力單位數(shù)(有時也用每克酶制劑或每毫升酶制劑含多少活力單位來表示),即:比活力=活力單位數(shù)/酶蛋白(氮)毫克數(shù)。填空題1.酶的催化作用不同于一般催化劑,主要是其具有高效性和特異性的特點。
2.根據(jù)酶對底物選擇的嚴(yán)格程度不同,又將酶的特異性分為絕對特異性、相對特異性、立體異構(gòu)特異性。
3.影響酶促反應(yīng)速度的主要因素有底物濃度、酶濃度、溫度、pH值、激活劑、抑制劑。
4.磺胺藥物的結(jié)構(gòu)和對氨基苯甲酸結(jié)構(gòu)相似,它可以競爭性抑制細(xì)菌體內(nèi)的二氫葉酸合成酶的活性(或二氫葉酸的合成)。
5.所有的酶都必須有催化活性中心。
6.化學(xué)路易士氣(有機(jī)砷化合物)是巰基酶的抑制劑。有機(jī)磷農(nóng)藥是生物體內(nèi)羥基酶(膽堿酯酶)的抑制劑。
7.含LDH1豐富的組織是心肌,含LDH5豐富的組織是肝臟。
8.酶蛋白決定酶的特異性,輔助因子決定反應(yīng)的類型、可起傳遞電子或原子的作用。酶的催化特征
(1)反應(yīng)條件溫和(2)催化效率高
(3)轉(zhuǎn)移性強(qiáng)(4)能夠自動調(diào)控
競爭性抑制劑和非競爭性抑制劑及其區(qū)別?
競爭性抑制劑:某些和底物結(jié)構(gòu)相似的物質(zhì),當(dāng)存在于酶促反應(yīng)系統(tǒng)中時,能夠同底物競爭地與酶活性中心結(jié)合。妨礙底物與酶形成中間產(chǎn)物。從而使酶活性受到抑制,這種方式稱競爭性抑制。
非競爭性抑制劑:抑制劑和底物可同時結(jié)合在酶的不同部位,即抑制劑與酶結(jié)合后不妨礙再與底物結(jié)合,但所形成的酶-底物-抑制劑三元復(fù)合物不能發(fā)生反應(yīng)區(qū)別:競爭性抑制劑:作用的特點:(1)抑制劑和底物結(jié)構(gòu)相似;(2)抑制作用的部位在活性中心;(3)抑制作用的強(qiáng)弱取決于抑制劑濃度與底物的比值,
a.
可利用增加底物濃度的方法解除其抑制
b.
底物與抑制劑結(jié)合在酶的同一部位
c.
最大反應(yīng)速度不變,km值增大
非競爭性抑制劑:
a.
抑制劑與底物結(jié)合在酶的不同部位
b.底物與抑制劑結(jié)合在酶的不同部位
c.最大反應(yīng)速度變小,km不變
磺胺類藥物作用的機(jī)理。
答:細(xì)菌利用對氨基苯甲酸、二氫蝶呤及谷氨酸作原料,在二氫葉酸合成酶的催化下合成二氫葉酸,后者還可轉(zhuǎn)變?yōu)樗臍淙~酸,是細(xì)菌合成核酸所不可缺的輔酶。磺胺藥的化學(xué)結(jié)構(gòu)與對氨基苯甲酸十分相似,故能與對氨基苯甲酸競爭二氫葉酸合成酶的活性中心,造成該酶活性抑制,進(jìn)而減少四氫葉酸和核酸的合成,最終導(dǎo)致細(xì)菌繁殖生長停止。
影響酶促反應(yīng)的因素及影響
(1)溫度對酶反應(yīng)的影響
○1一方面是溫度升高,酶促反應(yīng)速度加快。
○2另一方面,溫度升高,酶的高級結(jié)構(gòu)將發(fā)生變化或變性,導(dǎo)致酶活性降低甚至喪失。
○3因此大多數(shù)酶都有一個最適溫度。在最適溫度條件下,反應(yīng)速度最大。
(2)酶濃度對酶反應(yīng)的影響
在酶促反應(yīng)體系的pH,溫度等條件不變的情況下,底物濃度足夠大時,酶的濃度與酶促反反應(yīng)速度成正比關(guān)系。
(3)
底物濃度的影響
a.
在低底物濃度時,反應(yīng)速度與底物濃度成正比,表現(xiàn)為一級反應(yīng)特征。
b.
當(dāng)?shù)孜餄舛冗_(dá)到一定值,幾乎所有的酶都與底物結(jié)合后,反應(yīng)速度達(dá)到最大值(Vmax),此時再增加底物濃度,反應(yīng)速度不再增加,表現(xiàn)為零級反應(yīng)。
(4)PH對酶反應(yīng)的影響
在最適pH時,酶的活性最高,酶促反應(yīng)速度最大。
試用分子活化能學(xué)說和中間產(chǎn)物學(xué)說解釋酶的作用機(jī)理
(1)活化能學(xué)說內(nèi)容:一個反應(yīng)能夠發(fā)生、關(guān)鍵是反映體系中的分子必須具備一定能量,即分子處于活化狀態(tài),活化分子比一般分子多含的能量,稱為活化能,反應(yīng)體系中活化分子越多反映越快。因此,增加活化能的分子數(shù)量,是加快化學(xué)反應(yīng)的唯一途徑,可通過兩條途徑實現(xiàn)此目的:○1向反應(yīng)體系中加入能量,如熱量等
○2降低反應(yīng)活化能,酶的作用就是降低反應(yīng)活化能
(2)中間產(chǎn)物學(xué)說:酶在催化和產(chǎn)物,化學(xué)反應(yīng)時,首先與底物形成不穩(wěn)定的中間產(chǎn)物,最后再分解為酶,即酶將原來活化能較高的反應(yīng)分成兩個活化能較低的反應(yīng)來進(jìn)行,從而加快反應(yīng)速度。維生素1.維生素:一類動物本身不能合成,但對動物生長和健康又是必需的有機(jī)物,所以必需從食物中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。2.水溶性維生素:一類能溶于水的有機(jī)營養(yǎng)分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸等。3.脂溶性維生素:由長的碳?xì)滏溁虺憝h(huán)組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括A,D,E,和K,這類維生素能被動物貯存。4.輔酶:某些酶在發(fā)揮催化作用時所需的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。輔酶與酶結(jié)合松散,可以通過透析除去。5.輔基:是與酶蛋白質(zhì)共價結(jié)合的金屬離子或一類有機(jī)化合物,用透析法不能除去。輔基在整個酶促反應(yīng)過程中始終與酶的特定部位結(jié)合。6.尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+):含有尼克酰胺的輔酶,在某些氧化還原中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔。7.黃素單核苷酸(FMN):一種核黃素磷酸,是某些氧化還原反應(yīng)的輔酶。8.硫胺素焦磷酸:是維生素B1的輔形式,參與轉(zhuǎn)醛基反應(yīng)。9.黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD):是某些氧化還原反應(yīng)的輔酶,含有核黃素。10.磷酸吡哆醛:是維生素B6(吡哆醇)的衍生物,是轉(zhuǎn)氨酶,脫羧酶和消旋酶的酶。11.生物素:參與脫羧反應(yīng)的一種酶的輔助因子。12.輔酶A:一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反應(yīng)中作為?;妮d體。13.類胡蘿卜素:由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。14.轉(zhuǎn)氨酶:那稱為氨基轉(zhuǎn)移酶,在該酶的催化下,一個α-氨基酸的氨基可轉(zhuǎn)移給別一個α-酮酸。維生素主要功能:對物質(zhì)代謝過程起調(diào)節(jié)作用,在機(jī)體的生長、代謝、發(fā)育過程中發(fā)揮著重要的作用。B族維生素與輔助因子的關(guān)系輔助因子的名稱所含維生素轉(zhuǎn)運功能
NAD+、NADP+維生素PP氫原子
FAD、FMN維生素B2氫原子
TPP維生素B1醛基
CoA泛酸?;?/p>
硫辛酸硫辛酸?;?/p>
鈷胺素類維生素B12烷基
生物素生物素二氧化碳
磷酸吡哆醛維生素6氨基
四氫葉酸葉酸一碳單位將維生素D3羥化成25-羥維生素D3的器官是肝臟。第四章
生物氧化與氧化磷酸化1.生物氧化:生物體內(nèi)有機(jī)物質(zhì)氧化而產(chǎn)生大量能量的過程稱為生物氧化。生物氧化在細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行,氧化過程消耗氧放出二氧化碳和水,所以有時也稱之為“細(xì)胞呼吸”或“細(xì)胞氧化”。生物氧化包括:有機(jī)碳氧化變成CO2;底物氧化脫氫、氫及電子通過呼吸鏈傳遞、分子氧與傳遞的氫結(jié)成水;在有機(jī)物被氧化成CO2
和H2O的同時,釋放的能量使ADP
轉(zhuǎn)變成ATP。2.呼吸鏈:有機(jī)物在生物體內(nèi)氧化過程中所脫下的氫原子,經(jīng)過一系列有嚴(yán)格排列順序的傳遞體組成的傳遞體系進(jìn)行傳遞,最終與氧結(jié)合生成水,這樣的電子或氫原子的傳遞體系稱為呼吸鏈或電子傳遞鏈。電子在逐步的傳遞過程中釋放出能量被用于合成ATP,以作為生物體的能量來源。3.氧化磷酸化:在底物脫氫被氧化時,電子或氫原子在呼吸鏈上的傳遞過程中伴隨ADP
磷酸化生成ATP
的作用,稱為氧化磷酸化。氧化磷酸化是生物體內(nèi)的糖、脂肪、蛋白質(zhì)氧化分解合成ATP
的主要方式。4.磷氧比::氧化磷酸化過程中某一代謝過程消耗無機(jī)磷酸和氧的比值。電子經(jīng)過呼吸鏈的傳遞作用最終與氧結(jié)合生成水,在此過程中所釋放的能量用于ADP
磷酸化生成ATP。經(jīng)此過程消耗一個原子的氧所要消耗的無機(jī)磷酸的分子數(shù)(也是生成ATP
的分子數(shù))稱為磷氧比值(P/O)。如NADH
的磷氧比值是3,F(xiàn)ADH2
的磷氧比值是2。5.底物水平磷酸化:在底物被氧化的過程中,底物分子內(nèi)部能量重新分布產(chǎn)生高能磷酸鍵(或高能硫酯鍵),由此高能鍵提供能量使ADP(或GDP)磷酸化生成ATP(或GTP)的過程稱為底物水平磷酸化。此過程與呼吸鏈的作用無關(guān),以底物水平磷酸化方式只產(chǎn)生少量ATP。6.電子傳遞磷酸化:生物氧化過程中產(chǎn)生的電子或氫經(jīng)電子傳遞鏈傳遞給氧時可生成很多能量,這一過程可與磷酸化偶聯(lián)從而將一部分能量轉(zhuǎn)移給ADP生成ATP,這種ATP的生成機(jī)制稱為電子傳遞磷酸化。6.能荷:能荷是細(xì)胞中高能磷酸狀態(tài)的一種數(shù)量上的衡量,能荷大小可以說明生物體中ATP-ADP-AMP
系統(tǒng)的能量狀態(tài)。能荷=[ATP]+12[ADP][ATP]+[ADP]+[AMP]3.化學(xué)滲透理論:一種學(xué)說,主要論點是底物氧化期間建立的質(zhì)子濃度梯度提供了驅(qū)動ADP和ATP和Pi形成ATP的能量。4.解偶聯(lián)劑:一種使電子傳遞與ADP磷酸化之間的的緊密偶聯(lián)關(guān)系解除的化合物,eg2,4-二硝基苯酚。5.P/O比:在氧化磷酸化中,每1/2O2被還原成ADP的摩爾數(shù)。電子從NADH傳遞給O2時,P/O=3,而電子從FADH2傳遞給O2時,P/O=2。6.高能化合物:在標(biāo)準(zhǔn)條件下水解時,自由能大幅度減少和化合物。一般是指水解釋放的能量能驅(qū)動ADP磷酸化合成ATP的化合物。反饋調(diào)節(jié):代謝終末段的某一產(chǎn)物,可返回影響代謝初的某步反應(yīng),并對代謝全程起限速作用,這種調(diào)節(jié)方式稱反饋調(diào)節(jié)生物轉(zhuǎn)化:來自體內(nèi)外的非營養(yǎng)物質(zhì)在肝臟進(jìn)行氧化、還原、水解和結(jié)合反應(yīng),這一過程稱為..化學(xué)滲透學(xué)說:
(1)呼吸鏈中遞氫體和遞電子體在線粒內(nèi)膜中交替排列,有特定的位置和次序,形成有方向性的質(zhì)子轉(zhuǎn)移氧化還原系統(tǒng)。
(2)遞氫體具有氫泵的作用。遞氫體從內(nèi)膜內(nèi)側(cè)接受底物脫去的一對氫(2H),將其中的電子(e)傳給其后的遞電子體,而將2H+泵出內(nèi)膜。
(3)H+不能自由通過內(nèi)膜。泵出內(nèi)膜外側(cè)的H+不能自由返回內(nèi)膜內(nèi)側(cè),從而形成膜兩側(cè)的質(zhì)子濃度差和電位差,即膜外質(zhì)子濃度高、電位高,膜內(nèi)質(zhì)子濃度低、電位低。這種電化學(xué)梯度是合成ATP的動力。
(4)由質(zhì)子濃度梯度和電位梯度生成的能量促成ATP的形成。當(dāng)兩個質(zhì)子穿過膜上的ATP酶再回到內(nèi)膜內(nèi)部時,由ADP和無機(jī)磷酸就會以特殊的方式形成一個ATP分子。第五章糖代謝1.糖異生:非糖物質(zhì)(如丙酮酸乳酸甘油生糖氨基酸等)轉(zhuǎn)變?yōu)槠咸烟堑倪^程。糖異生不是糖酵解的簡單逆轉(zhuǎn)。雖然由丙酮酸開始的糖異生利用了糖酵解中的七步進(jìn)似平衡反應(yīng)的逆反應(yīng),但還必需利用另外四步酵解中不曾出現(xiàn)的酶促反應(yīng),繞過酵解過程中不可逆的三個反應(yīng)。2.Q
酶:Q
酶是參與支鏈淀粉合成的酶。功能是在直鏈淀粉分子上催化合成(α-1,6)糖苷鍵,形成支鏈淀粉。3.乳酸循環(huán):指肌肉缺氧時產(chǎn)生大量乳酸,大部分經(jīng)血液運到肝臟,通過糖異生作用肝糖原或葡萄糖補充血糖,血糖可再被肌肉利用,這樣形成的循環(huán)稱乳酸循環(huán)。4.發(fā)酵:厭氧有機(jī)體把糖酵解生成NADH
中的氫交給丙酮酸脫羧后的產(chǎn)物乙醛,使之生成乙醇的過程稱之為酒精發(fā)酵。如果將氫交給病酮酸丙生成乳酸則叫乳酸發(fā)酵。5.變構(gòu)調(diào)節(jié):變構(gòu)調(diào)節(jié)是指某些調(diào)節(jié)物能與酶的調(diào)節(jié)部位結(jié)合使酶分子的構(gòu)象發(fā)生改變,從而改變酶的活性,稱酶的變構(gòu)調(diào)節(jié)。9.磷酸戊糖途徑:磷酸戊糖途徑指機(jī)體某些組織(如肝、脂肪組織等)以6-磷酸葡萄糖為起始物在6-磷酸葡萄糖脫氫酶催化下形成6-磷酸葡萄糖酸進(jìn)而代謝生成磷酸戊糖為中間代謝物的過程,又稱為磷酸已糖旁路。10.D-酶:一種糖苷轉(zhuǎn)移酶,作用于α-1,4
糖苷鍵,將一個麥芽多糖的片段轉(zhuǎn)移到葡萄糖、麥芽糖或其它多糖上。11.糖核苷酸:單糖與核苷酸通過磷酸酯鍵結(jié)合的化合物,是雙糖和多糖合成中單糖的活化形式與供體。1.醛糖:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-1)是一個醛基。2.酮糖:一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-2)是一個酮基。3.異頭物:僅在氧化數(shù)最高的C原子(異頭碳)上具有不同構(gòu)形的糖分子的兩種異構(gòu)體。4.異頭碳:環(huán)化單糖的氧化數(shù)最高的C原子,異頭碳具有羰基的化學(xué)反應(yīng)性。5.變旋:吡喃糖,呋喃糖或糖苷伴隨它們的α-和β-異構(gòu)形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。7.糖苷:單糖半縮醛羥基與別一個分子的羥基,胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。8.糖苷鍵:一個糖半縮醛羥基與另一個分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖醛鍵有O—糖苷鍵和N—糖苷鍵。10.多糖:20個以上的單糖通過糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線形的或帶有分支的。11.還原糖:羰基碳(異頭碳)沒有參與形成糖苷鍵,因此可被氧化充當(dāng)還原劑的糖。12.淀粉:一類多糖,是葡萄糖殘基的同聚物。有兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是沒有分支的,只是通過α-(1→4)糖苷鍵的葡萄糖殘基的聚合物;另一類是支鏈淀粉,是含有分支的,α-(1→4)糖苷鍵連接的葡萄糖殘基的聚合物,支鏈在分支處通過α-(1→6)糖苷鍵與主鏈相連。13.糖原:是含有分支的α-(1→4)糖苷鍵的葡萄糖殘基的同聚物,支鏈在分支點處通過α-(1→6)糖苷鍵與主鏈相連。14.極限糊精:是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心部位,該部分經(jīng)支鏈淀粉酶水解作用,糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的進(jìn)一步降解需要α-(1→6)糖苷鍵的水解。15.肽聚糖:N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替連接的雜多糖與不同的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細(xì)菌細(xì)胞壁的主要成分。16.糖蛋白:含有共價連接的葡萄糖殘基的蛋白質(zhì)。17.蛋白聚糖:由雜多糖與一個多肽連組成的雜化的在分子,多糖是分子的主要成分。1.巴斯德效應(yīng):氧存在下,酵解速度放慢的現(xiàn)象。2.回補反應(yīng):酶催化的,補充檸檬酸循環(huán)中間代謝物供給的反應(yīng),例如由丙酮酸羧化酶生成草酰乙酸的反應(yīng)。4.戊糖磷酸途徑:那稱為磷酸已糖支路。是一個葡萄糖-6-磷酸經(jīng)代謝產(chǎn)生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑。該途徑包括氧化和非氧化兩個階段,在氧化階段,葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子NADPH;在非氧化階段,核酮糖-5-磷酸異構(gòu)化生成核糖-5-磷酸或轉(zhuǎn)化為酵解的兩用人才個中間代謝物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。6.糖醛酸途徑:從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸開始,經(jīng)UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸的動物體內(nèi),才可以通過該途徑合成維生素C。7.無效循環(huán):也稱為底物循環(huán)。一對酶催化的循環(huán)反應(yīng),該循環(huán)通過ATP的水解導(dǎo)致熱能的釋放。Eg葡萄糖+ATP=葡萄糖6-磷酸+ADP與葡萄糖6-磷酸+H2O=葡萄糖+Pi反應(yīng)組成的循環(huán)反應(yīng),其凈反應(yīng)實際上是ATP+H2O=ADP+Pi。8.磷酸解作用::通過在分子內(nèi)引入一個無機(jī)磷酸,形成磷酸脂鍵而使原來鍵斷裂的方式。實際上引入了一個磷?;?。9.半乳糖血癥:人類的一種基因型遺傳代謝缺陷,是由于缺乏1-磷酸半乳糖尿苷酰轉(zhuǎn)移酶,導(dǎo)致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。10.尾部生長:一種聚合反應(yīng)機(jī)理經(jīng)過私有化的單體的頭部結(jié)合到聚合的尾部,連接到聚合物尾部的單體的尾部又生成了接下一個單體的受體。糖的有氧氧化:葡萄糖或糖原在有氧條件下,經(jīng)歷糖酵解途徑、丙酮酸脫氫脫羧和TCA循環(huán)徹底氧化,生成C02和水,并產(chǎn)生大量能量的過程。血糖:指血液當(dāng)中的葡萄糖,主要來源是膳食中消化吸收入血的葡萄糖及肝糖原分解產(chǎn)生的葡萄糖,另外還有糖異生作用由中間代謝物合成的葡萄糖。TCA調(diào)控及意義三羧酸循環(huán):又稱TCA循環(huán),是糖有氧氧化的第三個階段,由乙酰輔酶A和草酰乙酸縮合生成檸檬酸開始,經(jīng)歷四次氧化及其他中間過程,最終又生成一分子草酰乙酸,如此往復(fù)循環(huán),每一循環(huán)消耗一個乙?;?,生成CO2和水及大量能量。意義:(1)是有機(jī)體獲得生命活動所需能量的最有效方式
(2)是糖、脂、蛋白質(zhì)等物質(zhì)代謝和轉(zhuǎn)化的中心樞紐
(3)形成多種重要的中間產(chǎn)物糖酵解的定義及意義
EMP途徑:又稱糖酵解途徑。指葡萄糖在無氧條件下經(jīng)過一定反應(yīng)歷程被分解為丙酮酸并產(chǎn)生少量ATP和NADH+H+的過程。是絕大多數(shù)生物所共有的一條主流代謝途徑。由10步酶促反應(yīng)組成。通過該途徑,一分子葡萄糖轉(zhuǎn)化為兩分子丙酮酸,同時凈生成兩分子ATP和兩分子NADH。意義:(1)是葡萄糖在生物體內(nèi)進(jìn)行有氧或無氧分解的共同途徑,通過糖酵解,生物體獲得生命活動所需要的能量;
(2)形成多種重要的中間產(chǎn)物,為氨基酸、脂類合成提供碳骨架;(3)為糖異生提供基本途徑。催化糖代謝關(guān)鍵部位的酶TCA循環(huán):檸檬酸合成酶(限速酶)、異檸檬酸脫氫酶、α-酮戊二酸脫氫酶
糖酵解:己糖激酶、磷酸果糖(限速酶)、丙酮酸激酶
第六章脂類代謝1.必需脂肪酸:為人體生長所必需但有不能自身合成,必須從事物中攝取的脂肪酸。在脂肪中有三種脂肪酸是人體所必需的,即亞油酸,亞麻酸,花生四烯酸。2.α-氧化:α-氧化作用是以具有3-18碳原子的游離脂肪酸作為底物,有分子氧間接參與,經(jīng)脂肪酸過氧化物酶催化作用,由α碳原子開始氧化,氧化產(chǎn)物是D-α-羥脂肪酸或少一個碳原子的脂肪酸。3.
脂肪酸的β-氧化:脂肪酸的β-氧化作用是脂肪酸在一系列酶的作用下,在α碳原子和β碳原子之間斷裂,β碳原子氧化成羧基生成含2個碳原子的乙酰CoA
和比原來少2
個碳原子的脂肪酸。4.
脂肪酸ω-氧化:ω-氧化是C5、C6、C10、C12脂肪酸在遠(yuǎn)離羧基的烷基末端碳原子被氧化成羥基,再進(jìn)一步氧化而成為羧基,生成α,ω-二羧酸的過程。5.
乙醛酸循環(huán):是某些植物,細(xì)菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式,在其異檸檬酸和蘋果酸之間反應(yīng)順序有改變,以及乙酸是用作能量和中間物的一個來源。某些植物和微生物體內(nèi)有此循環(huán),他需要二分子乙酰輔酶A的參與;并導(dǎo)致一分子琥珀酸的合成。通過該循環(huán)可以收乙乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過了檸檬酸循環(huán)中生成兩個CO2的步驟。6.
檸檬酸穿梭:就是線粒體內(nèi)的乙酰CoA
與草酰乙酸縮合成檸檬酸,然后經(jīng)內(nèi)膜上的三羧酸載體運至胞液中,在檸檬酸裂解酶催化下,需消耗ATP
將檸檬酸裂解回草酰乙酸和,后者就可用于脂肪酸合成,而草酰乙酸經(jīng)還原后再氧化脫羧成丙酮酸,丙酮酸經(jīng)內(nèi)膜載體運回線粒體,在丙酮酸羧化酶作用下重新生成草酰乙酸,這樣就可又一次參與轉(zhuǎn)運乙酰CoA
的循環(huán)。7.乙酰CoA
羧化酶系:大腸桿菌乙酰CoA
羧化酶含生物素羧化酶、生物素羧基載體蛋白(BCCP)和轉(zhuǎn)羧基酶三種組份,它們共同作用催化乙酰CoA
的羧化反應(yīng),生成丙二酸單酰-CoA。8.脂肪酸合酶系統(tǒng):脂肪酸合酶系統(tǒng)包括酰基載體蛋白(ACP)和6
種酶,它們分別是:乙酰轉(zhuǎn)酰酶;丙二酸單酰轉(zhuǎn)酰酶;β-酮脂酰ACP
合成酶;β-酮脂酰ACP
還原酶;β-羥;脂酰ACP
脫水酶;烯脂酰ACP
還原酶。1.脂肪酸:是指一端含有一個羧基的長的脂肪族碳?xì)滏?。脂肪酸是最簡單的一種脂,它是許多更復(fù)雜的脂的成分。2.飽和脂肪酸:不含有—C=C—雙鍵的脂肪酸。3.不飽和脂肪酸:至少含有—C=C—雙鍵的脂肪酸。4.必需脂肪酸:維持哺乳動物正常生長所必需的,而動物又不能合成的脂肪酸,Eg亞油酸,亞麻酸。5.三脂酰苷油:那稱為甘油三酯。一種含有與甘油脂化的三個脂?;孽ァV竞陀褪侨8视偷幕旌衔?。6.磷脂:含有磷酸成分的脂。Eg卵磷脂,腦磷脂。7.鞘脂:一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂,一端連接著一個長連的脂肪酸,另一端為一個極性和醇。鞘脂包括鞘磷脂,腦磷脂以及神經(jīng)節(jié)苷脂,一般存在于植物和動物細(xì)胞膜內(nèi),尤其是在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織內(nèi)含量豐富。8.鞘磷脂:一種由神經(jīng)酰胺的C-1羥基上連接了磷酸毛里求膽堿(或磷酸乙酰胺)構(gòu)成的鞘脂。鞘磷脂存在于在多數(shù)哺乳動物動物細(xì)胞的質(zhì)膜內(nèi),是髓鞘的主要成分。9.卵磷脂:即磷脂酰膽堿(PC),是磷脂酰與膽堿形成的復(fù)合物。10.腦磷脂:即磷脂酰乙醇胺(PE),是磷脂酰與乙醇胺形成的復(fù)合物。11.脂質(zhì)體:是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡(小泡)。12.生物膜:鑲嵌有蛋白質(zhì)的脂雙層,起著畫分和分隔細(xì)胞和細(xì)胞器作用生物膜也是與許多能量轉(zhuǎn)化和細(xì)胞內(nèi)通訊有關(guān)的重要部位。13.內(nèi)在膜蛋白:插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。14.外周膜蛋白:通過與膜脂的極性頭部或內(nèi)在的膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內(nèi)或外表面弱結(jié)合的膜蛋白。15.流體鑲嵌模型:針對生物膜的結(jié)構(gòu)提出的一種模型。在這個模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質(zhì)的流體脂雙層,脂雙層在結(jié)構(gòu)和功能上都表現(xiàn)出不對稱性。有的蛋白質(zhì)“鑲“在脂雙層表面,有的則部分或全部嵌入其內(nèi)部,有的則橫跨整個膜。另外脂和膜蛋白可以進(jìn)行橫向擴(kuò)散。16.通透系數(shù):是離子或小分子擴(kuò)散過脂雙層膜能力的一種量度。通透系數(shù)大小與這些離子或分子在非極性溶液中的溶解度成比例。17.通道蛋白:是帶有中央水相通道的內(nèi)在膜蛋白,它可以使大小適合的離子或分子從膜的任一方向穿過膜。18.(膜)孔蛋白:其含意與膜通道蛋白類似,只是該術(shù)語常用于細(xì)菌。19.被動轉(zhuǎn)運:那稱為易化擴(kuò)散。是一種轉(zhuǎn)運方式,通過該方式溶質(zhì)特異的結(jié)合于一個轉(zhuǎn)運蛋白上,然后被轉(zhuǎn)運過膜,但轉(zhuǎn)運是沿著濃度梯度下降方向進(jìn)行的,所以被動轉(zhuǎn)達(dá)不需要能量的支持。20.主動轉(zhuǎn)運:一種轉(zhuǎn)運方式,通過該方式溶質(zhì)特異的結(jié)合于一個轉(zhuǎn)運蛋白上然后被轉(zhuǎn)運過膜,與被動轉(zhuǎn)運運輸方式相反,主動轉(zhuǎn)運是逆著濃度梯度下降方向進(jìn)行的,所以主動轉(zhuǎn)運需要能量的驅(qū)動。在原發(fā)主動轉(zhuǎn)運過程中能源可以是光,ATP或電子傳遞;而第二級主動轉(zhuǎn)運是在離子濃度梯度下進(jìn)行的。21.協(xié)同運輸:兩種不同溶質(zhì)的跨膜的耦聯(lián)轉(zhuǎn)運??梢酝ㄟ^一個轉(zhuǎn)運蛋白進(jìn)行同一方向(同向轉(zhuǎn)運)或反方向(反向轉(zhuǎn)運)轉(zhuǎn)運。22.胞吞(信用):物質(zhì)被質(zhì)膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形成(物質(zhì)在囊泡內(nèi))被帶入到細(xì)胞內(nèi)的過程脂肪酸降解:最主要是β-氧化反應(yīng),在線粒體中進(jìn)行脂肪動員:儲存在脂肪組織細(xì)胞中的脂肪,經(jīng)脂肪酶逐步水解為游離脂肪酸和甘油并釋放入血,被組織利用的過程稱為..酮體:在肝臟中,脂肪酸不完全氧化生成的中間產(chǎn)物乙酰乙酸、β-羥基丁酸及丙酮統(tǒng)稱為酮體。在饑餓時酮體是包括腦在內(nèi)的許多組織的燃料,酮體過多會導(dǎo)致中毒。第八章含氮化合物代謝1.蛋白酶:以稱肽鏈內(nèi)切酶(Endopeptidase),作用于多肽鏈內(nèi)部的肽鍵,生成較原來含氨基酸數(shù)少的肽段,不同來源的蛋白酶水解專一性不同。2.肽酶:只作用于多肽鏈的末端,根據(jù)專一性不同,可在多肽的N-端或C-端水解下氨基酸,如氨肽酶、羧肽酶、二肽酶等。3.氮平衡:正常人攝入的氮與排出氮達(dá)到平衡時的狀態(tài),反應(yīng)正常人的蛋白質(zhì)代謝情況。4.生物固氮:利用微生物中固氮酶的作用,在常溫常壓條件下將大氣中的氮還原為氨的過程(N2
+3H2→
2NH3)。生物固氮只發(fā)生在少數(shù)的細(xì)菌和藻類中。5.硝酸還原作用:在硝酸還原酶和亞硝酸還原酶的催化下,將硝態(tài)氮轉(zhuǎn)變成氨態(tài)氮的過程,植物體內(nèi)硝酸還原作用主要在葉和根進(jìn)行。6.氨的同化:由生物固氮和硝酸還原作用產(chǎn)生的氨,進(jìn)入生物體后被轉(zhuǎn)變?yōu)楹袡C(jī)化合物的過程。7.轉(zhuǎn)氨作用:在轉(zhuǎn)氨酶的作用下,把一種氨基酸上的氨基轉(zhuǎn)移到α-酮酸上,形成另一種氨基酸。8.尿素循環(huán):尿素循環(huán)也稱鳥氨酸循環(huán),是將含氮化合物分解產(chǎn)生的氨在肝臟中,由兩分子氨一分子二氧化碳在相關(guān)酶的催化作用下,轉(zhuǎn)變成尿素的過程,有解除氨毒害的作用。9.生糖氨基酸:在分解過程中能轉(zhuǎn)變成丙酮酸、α-酮戊二酸乙、琥珀酰輔酶A、延胡索酸和草酰乙酸的氨基酸稱為生糖氨基酸。10.生酮氨基酸:在分解過程中能轉(zhuǎn)變成乙酰輔酶A
和乙酰乙酰輔酶A
的氨基酸稱為生酮氨基酸。11.核酸酶:作用于核酸分子中的磷酸二酯鍵的酶,分解產(chǎn)物為寡核苷酸或核苷酸,根據(jù)作用位置不同可分為核酸外切酶和核酸內(nèi)切酶。12.限制性核酸內(nèi)切酶:能作用于核酸分子內(nèi)部,并對某些堿基順序有專一性的核酸內(nèi)切酶,是基因工程中的重要工具酶。13.氨基蝶呤:對嘌呤核苷酸的生物合成起競爭性抑制作用的化合物,與四氫葉酸結(jié)構(gòu)相似,又稱氨基葉酸。14.一碳單位:僅含一個碳原子的基團(tuán)如甲基(CH3-、亞甲基(CH2=)、次甲基(CH≡)、甲?;∣=CH-)、亞氨甲基(HN=CH-)等,一碳單位可來源于甘氨酸、蘇氨酸、絲氨酸、組氨酸等氨基酸,一碳單位的載體主要是四氫葉酸,功能是參與生物分子的修飾。3.脫氨:在酶的催化下從生物分子(氨基酸或核苷酸)中除去氨基的過程。4.氧化脫氨:α-氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應(yīng)的α-酮酸的過程。氧化脫氨實際上包括氧化和脫氨兩個步驟。(脫氨和水解)6.乒乓反應(yīng):在該反應(yīng)中,酶結(jié)合一個底物并釋放一個產(chǎn)物,留下一個取代酶,然后該取代酶再結(jié)合第二個底物和釋放出第二個產(chǎn)物,最后酶恢復(fù)到它的起始狀態(tài)。9.苯酮尿癥:是由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙酸堆積的代謝遺傳病。缺乏丙酮酸羥化酶,苯丙氨酸只能靠轉(zhuǎn)氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆積對神經(jīng)有毒害,使智力發(fā)肓出現(xiàn)障礙。10.尿黑酸癥:是酪氨酸代謝中缺乏尿黑酸酶引起的代謝遺傳病。這種病人的尿中含有尿黑酸,在堿性條件下暴露于氧氣中,氧化并聚合為類似于黑色素的物質(zhì),從而使尿成黑色。蛋白質(zhì)降解:脫氨基:氧化脫氨基作用、轉(zhuǎn)氨基作用、聯(lián)合脫氨基作用、脫酰胺作用
脫羧基聯(lián)合脫氨基作用:是體內(nèi)氨基酸分解代謝主要的脫氨方式。主要有兩種反應(yīng)途徑:一是由L-谷氨酸脫氫酶所催化的氧化脫氨基作用和轉(zhuǎn)氨酶催化的轉(zhuǎn)氨基作用聯(lián)合脫去氨基;二是由L-谷氨酸脫氫酶所催化的氧化脫氨基作用和嘌呤核苷酸循環(huán)聯(lián)合作用脫去氨基。補救途徑:利用體內(nèi)游離的嘌呤或嘌呤核苷、嘧啶或嘧啶核苷經(jīng)過簡單的反應(yīng)過程,合成嘌呤或嘧啶核苷酸的過程。此合成途徑主要在腦、骨髓中進(jìn)行第九章核酸的生物合成1.半保留復(fù)制:雙鏈DNA
的復(fù)制方式,其中親代鏈分離,每一子代DNA
分子由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。2.不對稱轉(zhuǎn)錄:因為1.只以DNA雙鏈中的一條鏈為模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄而另一條鏈無轉(zhuǎn)錄功能;2.DNA雙鏈的多個基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄的模板并不總在同一條DNA鏈上。5.復(fù)制叉:復(fù)制DNA
分子的Y
形區(qū)域。在此區(qū)域發(fā)生鏈的分離及新鏈的合成。6.領(lǐng)頭鏈:DNA
的雙股鏈?zhǔn)欠聪蚱叫械模粭l鏈?zhǔn)?/→3/方向,另一條是3/→5/方向,上述的起點處合成的領(lǐng)頭鏈,沿著親代DNA
單鏈的3/→5/方向(亦即新合成的DNA沿5/→3/方向)不斷延長。所以領(lǐng)頭鏈?zhǔn)沁B續(xù)的。7.隨后鏈:已知的DNA
聚合酶不能催化DNA
鏈朝3/→5/方向延長,在兩條親代鏈起點的3/
端一側(cè)的DNA
鏈復(fù)制是不連續(xù)的,而分為多個片段,每段是朝5/→3/方向進(jìn)行,所以隨后鏈?zhǔn)遣贿B續(xù)的。8.有意義鏈:即華森鏈,華森克里格型DNA
中,在體內(nèi)被轉(zhuǎn)錄的那股DNA
鏈。簡寫為Wstrand。9.光復(fù)活:將受紫外線照射而引起損傷的細(xì)菌用可見光照射,大部分損傷細(xì)胞可以恢復(fù),這種可見光引起的修復(fù)過程就是光復(fù)活作用。10.重組修復(fù):這個過程是先進(jìn)行復(fù)制,再進(jìn)行修復(fù),復(fù)制時,子代DNA
鏈損傷的對應(yīng)部位出現(xiàn)缺口,這可通過分子重組從完整的母鏈上,將一段相應(yīng)的多核苷酸片段移至子鏈的缺口處,然后再合成一段多核昔酸鍵來填補母鏈的缺口,這個過程稱為重組修復(fù)。11.內(nèi)含子:真核生物的mRNA
前體中,除了貯存遺傳序列外,還存在非編碼序列,稱為內(nèi)含子。12.外顯子:真核生物的mRNA
前體中,編碼序列稱為外顯子。在DNA分子中或hnRNA分子中既能被轉(zhuǎn)錄又能被翻譯的核苷酸序列。.13.基因載體:外源DNA
片段(目的基因)要進(jìn)入受體細(xì)胞,必須有一個適當(dāng)?shù)倪\載工具將帶入細(xì)胞內(nèi),并載著外源DNA
一起進(jìn)行復(fù)制與表達(dá),這種運載工具稱為載體。14.質(zhì)粒:是一種在細(xì)菌染色體以外的遺傳單元,一般由環(huán)形雙鏈DNA
構(gòu)成,其大小從1?200Kb。1.核苷酸磷酸化酶:能分解核苷生成含氮堿和戊糖的磷酸酯的酶。2.核苷水解酶:能分解核苷生成含氮堿和戊糖的酶。3.從頭合成:生物體內(nèi)用簡單的前體物質(zhì)合成生物分子的途徑,例如核苷酸的從頭合成。4.痛風(fēng):是尿酸過量生產(chǎn)或尿酸排瀉不充分引起的尿酸堆積造成的,尿酸結(jié)晶堆積在軟骨,軟組織,腎臟以及關(guān)節(jié)處。在關(guān)節(jié)處的沉積會造成劇烈的疼痛。5.別嘌呤醇:是結(jié)構(gòu)上煩惱于黃嘌呤的化合物(在嘌呤環(huán)上第七位是C,第八位是N),對黃嘌呤氧化酶有很強(qiáng)的抑制作用,常用來治療痛風(fēng)。6.自殺抑制作用:底物煩惱物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成了該酶的抑制劑,如別嘌呤醇對黃嘌呤氧化酶的抑制。7.Lesch-Nyhan綜合癥:也稱為自毀容貌癥,由次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶的遺傳缺陷引起的。缺乏該酶使得次黃嘌呤和鳥嘌呤不能轉(zhuǎn)換為IMP和GMP,而是降解為尿酸,過量尿酸將導(dǎo)致。8.DNA聚合酶:以DNA為模板,催化核苷酸殘基加到已存在的聚核苷酸3ˊ末端反應(yīng)的酶。某些DNA聚全酶具有外切核酸酶的活性,可用來校正新合成的核苷酸的序列。10.復(fù)制體:一種多蛋白復(fù)合體,包含DNA聚合酶,引發(fā)酶,解旋酶,單鏈結(jié)合蛋白和其它輔助因子。復(fù)制體位于每個復(fù)制叉處進(jìn)行細(xì)菌染色體DNA復(fù)制的聚合反應(yīng)。11.單鏈結(jié)合蛋白(SSB):一種與單鏈DNA結(jié)合緊密的蛋白,它的結(jié)構(gòu)可以防止復(fù)制叉處單鏈DNA本身重新折疊回雙鏈區(qū)。12.滾環(huán)復(fù)制:復(fù)制環(huán)狀DNA的一種模式,在該模式中,DNA聚合酶結(jié)合在一個缺口鏈的3ˊ端繞環(huán)合成與模板鏈互補的DNA,每一輪都是新合成的DNA取代前一輪合成的DNA。13.逆轉(zhuǎn)錄酶:一種催化以RNA為模板合成DNA的DNA聚合酶,具有RNA指導(dǎo)的DNA合成,水解RNA和DNA指導(dǎo)的DNA合成的酶活性。13.互補NDA(cDNA):通過逆轉(zhuǎn)錄酶由mRNA模板合成的雙鏈DNA。14.聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR):擴(kuò)增樣品中的DNA量和富集眾多DNA分子中的一個特定的DNA序列的一種技術(shù)。在該反應(yīng)中,使用與目的DNA序列互補的寡核苷酸作為引物,進(jìn)行多輪的DNA合成。其中包括DNA變性,引物退火和在TapDNA聚合酶催化下的DNA合成。15.直接修復(fù):是通過一種可連續(xù)掃描DNA,識別出損傷部位的蛋白質(zhì),將損傷部位直接修復(fù)的方法。該修復(fù)方法不用切斷DNA或切除堿基。16.切除修復(fù):通過切除-修復(fù)內(nèi)切酶使DNA損傷消除的修復(fù)方法。一般是切除損傷區(qū),然后在DNA聚合酶的作用下,以露出的單鏈為模板合成新的互補鏈,最后用連接酶將缺口連接起來。17.錯配修復(fù):在含有錯配堿基的DNA分子中,使正常核苷酸序列恢復(fù)的修復(fù)方式。這種修復(fù)方式的過程是:識別出下正確地鏈,切除掉不正確鏈的部分,然后通過DNA聚合酶和DNA連接酶的作用,合成正確配對的雙鏈DNA。轉(zhuǎn)錄:以DNA的一條鏈為模板,按照堿基互補配對原則合成一條RNA鏈的過程。翻譯:以mRNA為模板,按照三個堿基決定一個氨基酸的原則合成具有一定氨基酸排列順序的蛋白質(zhì)的過程。引發(fā)體:DNA的生物合成起始時由DNA模板鏈、多種蛋白因子和酶(包括引發(fā)酶,解旋酶等)所形成的復(fù)合體,功能是合成引物和起始DNA的生物合成。岡崎片段:DNA復(fù)制合成時,由于DNA聚合酶的特性,后隨鏈不能連續(xù)復(fù)制,只能一段一段地復(fù)制,然后連接成完整的DNA鏈。這種不連續(xù)復(fù)制而合成的DNA片段稱為岡崎片段。Klenow片段:E.coliDNA聚合酶I經(jīng)部分水解生成的C末端605個氨基酸殘基片段。該片段保留了DNA聚合酶I的5ˊ-3ˊ聚合酶和3ˊ-5ˊ外切酶活性,但缺少完整酶的5ˊ-3ˊ外切酶活性。多核蛋白體:細(xì)胞內(nèi)多個核蛋白體連接在同一條mRNA分子上,各自以不同的進(jìn)度合成一種相同的多肽鏈,這種聚合體稱...分子?。河捎贒NA分子的遺傳性缺陷引起mRNA分子異常和蛋白質(zhì)的合成障礙,導(dǎo)致體內(nèi)某些蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和功能異常,由此造成的疾病稱..探針:人工制成的放射性同位素標(biāo)記的已知核苷酸順序的DNA小片段,用于檢測未知DNA分子中是否有同源性區(qū)段。核酸酶種類:據(jù)對底物的專一性分為:RNase;DNase;非特異性核酸酶
據(jù)作用方式可分為:核酸外切酶;核酸內(nèi)切酶參與DNA復(fù)制的酶
聚合酶、解鏈酶、引物酶、鏈接酶半保留復(fù)制的生物學(xué)意義:有助于遺傳的穩(wěn)定性前導(dǎo)鏈與滯后都是由同一套DNA聚合酶完成的。
多核糖體:提高生物合成效率
操縱子學(xué)說:DNA分子上控制蛋白質(zhì)合成的功能單位,包括啟動基因,操縱基因和結(jié)構(gòu)基因
遺傳密碼及其基本特性
遺傳密碼:mRNA的核苷酸排列順序與蛋白質(zhì)多肽鏈中的氨基酸排列順序之間有嚴(yán)格的對應(yīng)關(guān)系。mRNA分子上從5'→3'方向,由起始密碼子AUG開始,每3個核苷酸組成的三聯(lián)體,決定肽鏈上某一個氨基酸或蛋白質(zhì)合成的起始、終止信號,稱為三聯(lián)體密碼,也叫密碼子。
基本特性:(1)讀碼不重疊無間隔
(2)密碼的簡并性,幾組不同的密碼子可編碼同一種氨基酸
(3)密碼的通用性,幾乎所有的生物都可以公用一套遺傳密碼
DNA復(fù)制過程的特點
(1)
半保留復(fù)制
(2)
有特定的起點(原核生物為單起點,真核生物為多起點)
(3)
需要RNA作為引物,以后引物被切除,補上DNA
(4)
DNA合成方向是5`→3`
(5)
復(fù)制可以是單向也可以是雙向,速度不一定相等
(6)
半不連續(xù)復(fù)制,有前導(dǎo)鏈(連續(xù))和后滯鏈(不連續(xù))之分
蛋白質(zhì)因子及其功能:
(1)拓樸異構(gòu)酶使DNA超螺旋變?yōu)樗神Y態(tài);它兼有內(nèi)切酶和連接酶的活力,能迅速使DNA鏈斷開后再接上。
(2)解螺旋酶解開雙鏈
(3)引物酶結(jié)合在解開的DNA單鏈上,以DNA為模板、NTP為原料合成一段RNA引物
(4)DNA連接酶催化一個DNA鏈的5`-Pi與另一個DNA鏈的3`-OH形成磷酸二酯鍵
(5)DNA聚合酶III結(jié)合到模板鏈上第十一章代謝調(diào)節(jié)1.
誘導(dǎo)酶:由于誘導(dǎo)物的存在,使原來關(guān)閉的基因開放,從而引起某些酶的合成數(shù)量明顯增加,這樣的酶稱為誘導(dǎo)酶2.
標(biāo)兵酶:在多酶促系列反應(yīng)中,受控制的部位通常是系列反應(yīng)開頭的酶,這個酶一般是變構(gòu)酶,也稱標(biāo)兵酶。3.
操縱子:在轉(zhuǎn)錄水平上控制基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,包括啟動子(P)、操縱基因(O)和在功能上相關(guān)的幾個結(jié)構(gòu)基因。4.
衰減子:位于結(jié)構(gòu)基因上游前導(dǎo)區(qū)調(diào)節(jié)基因表達(dá)的功能單位,前導(dǎo)區(qū)轉(zhuǎn)錄的前導(dǎo)RNA通過構(gòu)象變化終止或減弱轉(zhuǎn)錄。5.
阻遏物:由調(diào)節(jié)基因產(chǎn)生的一種變構(gòu)蛋白,當(dāng)它與操縱基因結(jié)合時,能夠抑制轉(zhuǎn)錄的進(jìn)行。6.
輔阻遏物:能夠與失活的阻碣蛋白結(jié)合,并恢復(fù)阻遏蛋白與操縱基因結(jié)合能力的物質(zhì)。輔阻遏物一般是酶反應(yīng)的產(chǎn)物。7.
降解物基因活化蛋白:由調(diào)節(jié)基因產(chǎn)生的一種cAMP
受體蛋白,當(dāng)它與cAMP
結(jié)合時被激活,并結(jié)合到啟動子上促進(jìn)轉(zhuǎn)錄進(jìn)行。是一種正調(diào)節(jié)作用。8.
腺苷酸環(huán)化酶:催化ATP
焦磷酸裂解產(chǎn)生環(huán)腺苷酸(cAMP)的酶。9.
共價修飾:某種小分子基團(tuán)可以共價結(jié)合到被修飾酶的特定氨基酸殘基上,引起酶分子構(gòu)象變化,從而調(diào)節(jié)代謝的方向和速度。10.
級聯(lián)系統(tǒng):在連鎖代謝反應(yīng)中一個酶被激活后,連續(xù)地發(fā)生其它酶被激活,導(dǎo)致原始調(diào)節(jié)信號的逐級放大,這樣的連鎖代謝反應(yīng)系統(tǒng)稱為級聯(lián)系統(tǒng)。11.
反饋抑制:在代謝反應(yīng)中,反應(yīng)產(chǎn)物對反應(yīng)過程中起作用的酶產(chǎn)生的抑制作用。12.
交叉調(diào)節(jié):代謝產(chǎn)物不僅對本身的反應(yīng)過程有反饋抑制作用,而且可以控制另一代謝物在不同途徑中的合成。13.
前饋激活:在反應(yīng)序列中,前身物質(zhì)對后面的酶起激活作用,使反應(yīng)向前進(jìn)行。14.
鈣調(diào)蛋白:一種依賴于鈣的蛋白激酶,酶蛋白與鈣結(jié)合引起酶分子構(gòu)象變化,調(diào)解酶的活性。如磷酸化酶激酶是一種依賴于鈣的蛋白激酶。第十二章蛋白質(zhì)的生物合成1.密碼子(codon):存在于信使RNA
中的三個相鄰的核苷酸順序,是蛋白質(zhì)合成中某一特定氨基酸的密碼單位。共有64
個密碼子,其中61
個是氨基酸的密碼,3個是作為終止密碼子。2.同義密碼子(synonymcodon)或簡并密碼(degeneratecodon):為同一種氨基酸編碼的幾個密碼子之一。3.反密碼子(anticodon):在tRNA
反密碼子環(huán)中的三個核苷酸的序列,在蛋白質(zhì)合成中通過互補的堿基配對,這部分結(jié)合到信使RNA
的特殊密碼上。7.反義RNA(antisenseRNA):具有互補序列的RNA。反義RNA
可以通過互補序列與特定的mRNA
相結(jié)合,結(jié)合位置包括mRNA
結(jié)合核糖體的序列(SD
序列)和起始密碼子AUG,從而抑制mRNA
的翻譯。又稱干擾mRNA
的互補RNA。4.變偶假說(Wobblehypothesis):克里克為解釋tRNA
分子如何去識別不止一個密碼子而提出的一種假說。據(jù)此假說,反密碼子的前兩個堿基(3ˊ端)按照堿基配對的一般規(guī)律與密碼子的前兩個(5ˊ端)堿基配對,然而tRNA
反密碼子中的第三個堿基,在與密碼子上3ˊ端的堿基形成氫鍵時,則可有某種程度的變動,使其有可能與幾種不同的堿基配對。5.移碼突變(frame-shiftmutation):一種突變,其結(jié)果為導(dǎo)致核酸的核苷酸順序之間的正常關(guān)系發(fā)生改變。移碼突變是由刪去或插入一個核苷酸的點突變構(gòu)成的,在這種情況下,突變點以前的密碼子并不改變,并將決定正確的氨基酸順序;但突變點以后的所有密碼子都將改變。且將決定錯誤的氨基酸順序。6.氨基酸同功受體(isoacceptor):每一個氨基酸可以有多過一個tRNA
作為運載工具,這些tRNA
稱為該氨基酸同功受體。8.信號肽(signalpeptide):
信號肽假說認(rèn)為,編碼分泌蛋白的mRNA在翻譯時首先合成的是N
末端帶有疏水氨基酸殘基的信號肽,它被內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上的受體識別并與之相結(jié)合。信號肽經(jīng)由膜中蛋白質(zhì)形成的孔道到達(dá)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔,隨即被位于腔表面的信號肽酶水解,由于它的引導(dǎo),新生的多肽就能夠通過內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜進(jìn)入腔內(nèi),最終被分泌到胞外。翻譯結(jié)束后,核糖體亞基解聚、孔道消失,內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜又恢復(fù)原先的脂雙層結(jié)構(gòu)。10.核糖體(ribosome):
核糖體是很多亞細(xì)胞核蛋白顆粒中的一個,由大約等量的RNA和蛋白質(zhì)所組成,是細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)合成的場所。由兩個不相同的亞基組成,這兩個亞基通過鎂離子和其它非共價鍵地結(jié)合在一起。已證實有四類核糖核蛋白體(細(xì)菌、植物、動物和線粒體)它們以其單體的、亞單位的和核糖核蛋白體RNA
的沉降系數(shù)相區(qū)別。11.多核糖體(polysome):在信使核糖核酸鏈上附著兩個或更多的核糖體。12.氨?;课唬╝minoacylsite):在蛋白質(zhì)合成過程中進(jìn)入的氨酰-tRNA結(jié)合在核蛋白體上的部位。13.肽?;课唬╬eptidysite):指在蛋白質(zhì)合成過程中,當(dāng)下一個氨酰基轉(zhuǎn)移RNA接到核糖核蛋白體的氨基部位時,肽酰tRNA所在核蛋白體上的結(jié)合點。14.肽基轉(zhuǎn)移酶(peptidyltransferase):蛋白質(zhì)合成中的一種酶。它能催化正在增長的多肽鏈與下一個氨基酸之間形成肽鍵。在細(xì)菌中此酶是50S
核糖核蛋白體亞單位中的蛋白質(zhì)之一。15.氨酰-tRNA
合成酶(aminoacy-tRNAsynthetase):催化氨基酸激活的偶聯(lián)反應(yīng)的酶,先是一種氨基酸連接到AMP
生成一種氨酰腺苷酸,然后連接到轉(zhuǎn)移RNA
分子生成氨酰-tRNA
分子。16.蛋白質(zhì)折疊(proteinfolding):蛋白質(zhì)的三維構(gòu)象,稱為蛋白質(zhì)的折疊。是由蛋白質(zhì)多肽鏈的氨基酸順序所決定的。自然條件下自發(fā)進(jìn)行的,在生物體內(nèi)條件下,是熱力學(xué)上最穩(wěn)定的形式。多肽鏈在核糖體上一面延長,一面自發(fā)地折疊成其本身獨有的構(gòu)象。當(dāng)肽鏈終止延長并從核糖體上脫落時,它也就折疊成天然的三維結(jié)構(gòu)。17.核蛋白體循環(huán)(polyribosome):是指已活化的氨基酸由tRNA轉(zhuǎn)運到核蛋白體合成多肽鏈的過程。18.鋅指(zinefinger):是調(diào)控轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)因子中與DNA
結(jié)合的一種基元,它由大約30
個氨基酸殘基的肽段與鋅螯合形成的指形結(jié)構(gòu),鋅以4
個配位鍵與肽鏈的Cys或His
殘基結(jié)合,指形突起的肽段含12-13
個氨基酸殘基,指形突起嵌入DNA
的大溝中,由指形突起或其附近的某些氨基酸側(cè)鏈與DNA
的堿基結(jié)合而實現(xiàn)蛋白質(zhì)與DNA
的結(jié)合。19.亮氨酸拉鏈(leucinezipper):這是真核生物轉(zhuǎn)錄調(diào)控蛋白與蛋白質(zhì)及與DNA
結(jié)合的基元之一。兩個蛋白質(zhì)分子近處C
端肽段各自形成兩性α-螺旋,α-螺旋的肽段每隔7
個氨基酸殘基出現(xiàn)一個亮氨酸殘基,兩個α-螺旋的疏水面互相靠攏,兩排亮氨酸殘基疏水側(cè)鏈排列成拉鏈狀形成疏水鍵使蛋白質(zhì)結(jié)合成二聚體,α-螺旋的上游富含堿性氨基酸(Arg
、Lys)肽段借Arg
、Lys
側(cè)鏈基團(tuán)與DNA
的堿基互相結(jié)合而實現(xiàn)蛋白質(zhì)與DNA
的特異結(jié)合。20.順式作用元件(cis-actingelement):真核生物DNA
的轉(zhuǎn)錄啟動子和增強(qiáng)子等序列,合稱順式作用元件。21.反式作用因子(trans-actingfactor):調(diào)控轉(zhuǎn)錄的各種蛋白質(zhì)因子總稱反式作用因子。22.螺旋環(huán)螺旋(helix-loop-helix):這種蛋白質(zhì)基元由兩個兩性α?螺旋通過一個肽段連結(jié)形成螺旋?環(huán)?螺旋結(jié)構(gòu),兩個蛋白質(zhì)通過兩性螺旋的疏水面互相結(jié)合,與DNA
的結(jié)合則依靠此基元附近的堿
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