花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課課件_第1頁(yè)
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花卉分子生物學(xué)主要學(xué)習(xí)內(nèi)容遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)基因和基因組復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯基因表達(dá)與調(diào)控基因功能研究方法基因工程原理花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課考試題型:一、名詞解釋(每題3分,共24分)二、單項(xiàng)選擇題(每題1.5分,共15分)三、判斷題(每題1分,共10分)四、簡(jiǎn)答題(每題6分,共36分)五、論述題(每題15分,共15分)考試成績(jī)60%,平時(shí)成績(jī)40%花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第一、二章

遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)染色體的結(jié)構(gòu)遺傳物質(zhì)的本質(zhì)及證明核酸的化學(xué)組成及理化性質(zhì)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單元核小體nuclesome8個(gè)組蛋白分子組成核小體的核心DNA在八聚體纏繞1.75圈,大約146bp組蛋白H1結(jié)合在DNA分子的出口和入口處染色體的結(jié)構(gòu)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNA是遺傳物質(zhì)的直接證據(jù)肺炎雙球菌感染實(shí)驗(yàn)(Griffith,1928)噬菌體感染實(shí)驗(yàn)(HersheyandChase,1952)3.煙草花葉病毒(TMV)感染試驗(yàn)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課核酸的化學(xué)組成及理化性質(zhì)脫氧核糖核酸

DeoxyribonucleicAcid,DNA核糖核酸

RibonucleicAcid,RNA結(jié)構(gòu)單位:核苷酸(五碳糖、堿基、磷酸)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)要點(diǎn):反向平行;

堿基配對(duì);

堿基距離為0.34nm;

螺距為3.4nm?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課核酸的雜交核酸分子雜交:具有互補(bǔ)序列(或某一區(qū)段互補(bǔ))的兩條多核苷酸鏈,通過(guò)堿基互補(bǔ)配對(duì)形成穩(wěn)定的雙鏈分子的過(guò)程。Northern、Southern、Western花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第三章DNA的生物合成復(fù)制體系復(fù)制的過(guò)程(起始、延伸、終止)

體外復(fù)制—PCR技術(shù)簡(jiǎn)介花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課復(fù)制體系

底物:

dATP,dGTP,dCTP,dTTP

聚合酶:

依賴DNA的DNA聚合酶(DNA-pol)

模板:

解開(kāi)成單鏈的DNA母鏈引物:

提供3

-OH末端使dNTP可以依次聚合

其他的酶和蛋白質(zhì)因子DNA連接酶螺旋酶DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶單鏈結(jié)合蛋白花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課參與DNA復(fù)制的酶與蛋白因子總覽圖花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課催化5’

3’方向合成多聚核苷酸

3’

5’核酸外切酶活性:使酶能從剛合成的鏈的3’末端切下核苷酸

校讀核酸外切酶活性:從合成的鏈中去除一部分已經(jīng)和模板結(jié)合的核苷酸,這一功能主要存在于細(xì)菌DNA復(fù)制后的滯后鏈過(guò)程中不連接DNA片段的連接過(guò)程中DNA聚合酶的三種活性:

花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNApolymerase基本功能花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課

聚合酶鏈反應(yīng)簡(jiǎn)稱PCR,是一項(xiàng)在短時(shí)間內(nèi)大量擴(kuò)增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)。

基因的體外復(fù)制——PCR技術(shù)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)

(polymerasechainreaction,PCR)模板引物dNTPMg2+

TaqDNA聚合酶變性延伸退火花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第四章轉(zhuǎn)錄

轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,在RNA聚合酶的作用下合成mRNA,將遺傳信息從DNA分子上轉(zhuǎn)移到mRNA分子上,這一過(guò)程稱為轉(zhuǎn)錄。

花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶其他蛋白質(zhì)因子RNA合成方向:5’→3'花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課二、參與轉(zhuǎn)錄起始的關(guān)鍵酶與元件(一)RNA聚合酶●原核生物RNA聚合酶(大腸桿菌為例)(1)全酶(holoenzyme)

由4種(5個(gè))亞基α2ββ’σ組成(2)核心酶(coreenzyme)

α2ββ’

,參與轉(zhuǎn)錄的全過(guò)程(3)σ亞基亦稱σ因子(σfactor)—轉(zhuǎn)錄輔助因子

識(shí)別啟動(dòng)子,不參與轉(zhuǎn)錄過(guò)程花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課(二)啟動(dòng)子(promoter)啟動(dòng)子定義:指能被RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。41-44bp花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課原核生物啟動(dòng)子保守序列轉(zhuǎn)錄起點(diǎn)-10區(qū)(Pribnow框)T80A95T45A60a50T96-35區(qū)(Sextama框)T84T84G78A65C54a456bpCATTATAATTTGACA15~20bp-10元件-35元件-1+1+30花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課σ因子RNA聚合酶中識(shí)別及結(jié)合啟動(dòng)子的亞基,延長(zhǎng)時(shí)脫落,不參與轉(zhuǎn)錄過(guò)程,是轉(zhuǎn)錄輔助因子。σ因子識(shí)別位點(diǎn):?jiǎn)?dòng)子-35區(qū)、-10區(qū)(一)轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物三、轉(zhuǎn)錄的基本過(guò)程:起始、延伸、終止真核生物的起始

較原核生物復(fù)雜

◆順式作用元件

◆轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor,TF)

RNA聚合酶Ⅱ所需的轉(zhuǎn)錄因子

---轉(zhuǎn)錄因子Ⅱ(TFⅡ)

亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;●在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長(zhǎng)。核心酶····DNA····RNA(二)轉(zhuǎn)錄延伸花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課終止子(terminator,t)

●強(qiáng)終止子-內(nèi)部終止子

●弱終止子-需要ρ因子(rhofactor)又稱為ρ依賴性終止子(Rho-dependentterminator)不依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止(三)轉(zhuǎn)錄終止花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課四、轉(zhuǎn)錄后加工花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課mRNA轉(zhuǎn)錄后加工原核生物mRNA轉(zhuǎn)錄后一般不需要加工,轉(zhuǎn)錄的同時(shí)即進(jìn)行翻譯。亦有少數(shù)多順?lè)醋拥膍RNA需要核酸酶切成小單位,然后再翻譯。真核生物mRNA原初轉(zhuǎn)錄物很大,在加工過(guò)程中形成許多分子大小不等的中間物,稱為核內(nèi)不均一RNA(hnRNA),需要進(jìn)一步進(jìn)行加工修飾轉(zhuǎn)化為mRNA。加工包括:(1)hnRNA被剪接,剪掉內(nèi)含子(DNA上非編碼序列)轉(zhuǎn)錄序列,拼接外顯子(DNA上的編碼序列)轉(zhuǎn)錄序列。(2)3’端添加polyA“尾巴”;(3)5’端連接“帽子”結(jié)構(gòu)(m7G5

ppp5

NmpNp-)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課五、原核生物與真核生物mRNA的特征比較

1、原核生物mRNA的特征●半衰期短●多以多順?lè)醋拥男问酱嬖诙囗樂(lè)醋觤RNA:編碼多個(gè)蛋白質(zhì)的mRNA。單順?lè)醋觤RNA:只編碼一個(gè)蛋白質(zhì)的mRNA?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課●5’

端無(wú)“帽子”結(jié)構(gòu),3’

端沒(méi)有或只有較短的poly(A)結(jié)構(gòu)。SD序列:mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課2、真核生物mRNA的特征5’

端存在“帽子”結(jié)構(gòu)多數(shù)mRNA

3’

端具有poly(A)尾巴(組蛋白除外)以單順?lè)醋拥男问酱嬖诨ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課逆轉(zhuǎn)錄原理的應(yīng)用-RT-PCR

反轉(zhuǎn)錄PCR:是將RNA的反轉(zhuǎn)錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈擴(kuò)增(PCR)相結(jié)合的技術(shù)。主要用于基因表達(dá)的檢測(cè)。ProteinBiosynthesis

蛋白質(zhì)的生物合成第五章翻譯

花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課mRNA簡(jiǎn)并性通用性連續(xù)性搖擺性

每3個(gè)核苷酸為一組,對(duì)應(yīng)一個(gè)氨基酸,叫做一個(gè)密碼子(codon)。

起始密碼子:AUGGUG;終止密碼子:UAAUAGUGA一、DNA與遺傳密碼(一)mRNA是蛋白質(zhì)生物合成的模板起始密碼子:AUG終止密碼子:UAA,UGA,UAG編碼區(qū)非編碼區(qū)開(kāi)放讀框(openreadingframe,ORF)二、3種RNA分子(二)tRNA—轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸(二)tRNA—轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸通過(guò)密碼子與反密碼子的相互作用

堿基互補(bǔ)配對(duì)原則tRNA的功能真核生物:游離核糖體或與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)合原核生物:游離核糖體或與mRNA結(jié)合成串狀的多核糖體(三)核糖體(rRNA)—蛋白質(zhì)合成場(chǎng)所三、蛋白質(zhì)的生物合成過(guò)程三種RNA:mRNA、tRNA、rRNA原料:20種aa需要酶及眾多蛋白因子、ATP、GTP等蛋白質(zhì)合成方向:N端→C端mRNA的翻譯方向:5ˊ→3ˊ(一)蛋白質(zhì)合成的一般特征(二)蛋白質(zhì)生物合成的過(guò)程兩個(gè)前提:氨基酸活化核糖體解離進(jìn)位成肽轉(zhuǎn)位(三)肽鏈的延伸第六章基因和基因組

花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課1950年,發(fā)現(xiàn)玉米粒的顏色經(jīng)常發(fā)生變化認(rèn)為:一種控制基因在玉米基因組中移動(dòng)的結(jié)果移動(dòng)基因(movablegenens)指可在DNA分子間進(jìn)行轉(zhuǎn)移的DNA片段。也叫跳躍基因(jumpinggenes)?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課DNA-RNA方式轉(zhuǎn)座子DNA-DNA方式轉(zhuǎn)座子花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課基因家族基因家族(multigenefamily)指DNA序列具有較高的同源性(通常大于50%),并且其編碼產(chǎn)物具有相同或相似生理功能的一組結(jié)構(gòu)基因。直系同源(orthology)是指不同物種內(nèi)的同源序列,它們來(lái)源于物種形成時(shí)的共同祖先基因。旁系同源(paralogy)基因是指同一基因組(或同一物種的基因組)中,由于始祖基因的加倍而橫向/水平方向(horizontal)產(chǎn)生的幾個(gè)同源基因?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課RNAmRNA外顯子1外顯子2外顯子3內(nèi)含子1內(nèi)含子2DNA剪切斷裂基因指基因的編碼序列在DNA分子上是不連續(xù)排列的,而是被不編碼的序列所隔開(kāi)?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課真核生物基因組

真核生物的基因組定義:一個(gè)物種的單倍體的染色體數(shù)目稱為該物種的基因組?;蚪M的大小(C值):一個(gè)基因組含有的堿基總數(shù)。表達(dá)序列、重復(fù)序列和非編碼序列。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課

高等生物具有比低等生物更復(fù)雜的生命活動(dòng),所以,理論上應(yīng)該是它們的C值也應(yīng)該更高。但是事實(shí)上C值沒(méi)有體現(xiàn)出與物種進(jìn)化程度相關(guān)的趨勢(shì)。高等生物的C值不一定就意味著它的C值高于比它低等的生物。這種生物學(xué)上的DNA總量的比較和矛盾,稱為C值悖論?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課真核生物基因組都是由大分子雙鏈線狀DNA構(gòu)成。染色體通常成對(duì)出現(xiàn)(雙倍體)?;蚪M非常龐大,結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜,有多個(gè)復(fù)制起始位點(diǎn)?;蚪M中存在大量的重復(fù)序列以及非編碼序列。在一定程度上也是生物進(jìn)化的標(biāo)尺。真核生物基因組中也存在一些可移動(dòng)的DNA序列(轉(zhuǎn)座元件)。真核生物基因組的特點(diǎn)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課微衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)

其重復(fù)單位為2~5bp,存在于常染色體,常見(jiàn)于內(nèi)含子中。人類基因組DNA中平均每6~10kb就有一個(gè)STR位點(diǎn)。不同個(gè)體之間在一個(gè)同源STR位點(diǎn)的重復(fù)次數(shù)不同。由于重復(fù)單位及重復(fù)次數(shù)不同,使其在不同種族,不同人群之間的分布具有很大差異性,構(gòu)成了STR遺傳多態(tài)性。(CA)n和(TG)n:核心序列結(jié)構(gòu)相同,重復(fù)單位數(shù)目10-60個(gè)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第七章真核生物基因表達(dá)的調(diào)控DNA水平上的調(diào)控染色質(zhì)水平上的調(diào)控轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控轉(zhuǎn)錄后調(diào)控翻譯后調(diào)控花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課真核基因表達(dá)調(diào)控的順式作用元件順式作用元件(cis-actingelement)是指DNA分子上對(duì)基因表達(dá)有調(diào)節(jié)活性的特定核苷酸序列。順式作用元件多位于基因上游或內(nèi)含子中,只影響同一DNA分子上的基因。真核基因的順式作用元件按其功能可以分為:?jiǎn)?dòng)子,增強(qiáng)子,靜止子1.轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控

花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課組成型啟動(dòng)子

組成型啟動(dòng)子在所有組織中都能啟動(dòng)基因的表達(dá)。組織特異型啟動(dòng)子誘導(dǎo)型啟動(dòng)子

所謂誘導(dǎo)型啟動(dòng)子就是在某些特定的物理或化學(xué)的刺激下,此種啟動(dòng)子可以大幅度地提高基因的轉(zhuǎn)錄水平,因此,亦稱為誘導(dǎo)型調(diào)節(jié)序列或誘導(dǎo)型增強(qiáng)子啟動(dòng)子類型及應(yīng)用研究花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課反式作用因子

反式作用因子(trans-acting

factor)指一些與基因表達(dá)調(diào)控有關(guān)的蛋白質(zhì)因子。真核生物反式作用因子通常指轉(zhuǎn)錄因子(transcription

factor,TF)。反式作用因子與順式作用元件之間的共同作用,才能夠達(dá)到對(duì)特定基因進(jìn)行調(diào)控的目的?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課特異轉(zhuǎn)錄因子(specialtranscriptionfactors)能夠選擇性調(diào)控某種或某些基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的蛋白質(zhì)因子稱為特異性轉(zhuǎn)錄因子.為個(gè)別基因轉(zhuǎn)錄所必需,決定該基因的時(shí)間、空間特異性表達(dá)。一般轉(zhuǎn)錄因子特殊轉(zhuǎn)錄因子花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子結(jié)構(gòu)DNA結(jié)合域轉(zhuǎn)錄激活域TF蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)結(jié)合域二聚化結(jié)構(gòu)域與RNA聚合酶結(jié)合與順式元件識(shí)別、結(jié)合花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課2.DNA水平的調(diào)控DNA水平上的調(diào)控是通過(guò)改變基因組中有關(guān)基因的數(shù)量和結(jié)構(gòu)順序而控制基因的表達(dá)。基因擴(kuò)增基因重排

DNA的甲基化花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNA的甲基化指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)的作用下,以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)為甲基供體,將甲基添加在DNA分子中的堿基上?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課DNA甲基化導(dǎo)致某些區(qū)域DNA構(gòu)象變化,從而影響了蛋白質(zhì)與DNA的相互作用,抑制了轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)區(qū)DNA的結(jié)合效率從而引起基因的失活。活躍表達(dá)的基因都是甲基化不足的基因。表達(dá)活性與甲基化程度呈負(fù)相關(guān)。甲基化可以調(diào)控基因表達(dá)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課3.染色質(zhì)水平的調(diào)控

組蛋白質(zhì)修飾

組蛋白的乙?;突虮磉_(dá)的狀態(tài)相關(guān)。

被組蛋白覆蓋的基因如果要表達(dá),首先要改變組蛋白的修飾狀態(tài),使其與DNA的結(jié)合由緊變松,這樣靶基因才能與轉(zhuǎn)錄復(fù)合物相互作用。因此,組蛋白是重要的染色體結(jié)構(gòu)維持單元和基因表達(dá)的負(fù)控制因子?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課4.轉(zhuǎn)錄后調(diào)控mRNA剪接RNA干擾microRNA花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課(1)mRNA的剪接大多數(shù)真核生物基因是不連續(xù)的,外顯子與內(nèi)含子相間排列而轉(zhuǎn)錄的時(shí)候外顯子和內(nèi)含子是一起轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄以后必須降內(nèi)含子切除,才能形成成熟的mRNA分子這個(gè)過(guò)程成為內(nèi)含子的剪接(splicing)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課可變剪接同一初級(jí)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物通過(guò)不同的剪接方式,形成不同的成熟mRNA分子。

選擇性剪接的不同形式*深藍(lán):均保留的exon;

淺藍(lán):僅在一個(gè)mRNA中保留的exon;

黃色:intron;

紅線:被剪切去的區(qū)域。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課(2)RNA干擾

一些小的雙鏈RNA可以高效、特異地阻斷體內(nèi)特定基因表達(dá),促使mRNA降解,誘使細(xì)胞表現(xiàn)出特定基因缺失的表型,稱為RNA干擾(RNAinterference,RNAi,也譯作RNA干預(yù)或者干涉或者沉默)?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課(3)microRNAmiRNA是廣泛存在于真核生物中的一組短小的、不編碼蛋白質(zhì)的RNA家族,它們是由19-25個(gè)核苷酸組成的單鏈RNA;類似于siRNA的分子,由高等真核生物基因組編碼,miRNA通過(guò)和靶基因mRNA堿基配對(duì)引導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)降解mRNA或阻礙其翻譯。

花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課5.翻譯后調(diào)控直接來(lái)自核糖體的線狀多肽鏈?zhǔn)菦](méi)有功能的,必須經(jīng)過(guò)加工、蛋白質(zhì)折疊才具有活性。

花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課按照育種目標(biāo),根據(jù)已知的目標(biāo)性狀的遺傳背景,進(jìn)行嚴(yán)密的分子設(shè)計(jì),通過(guò)體外DNA重組技術(shù)和DNA轉(zhuǎn)移技術(shù),有目的地改造生物體,以創(chuàng)造出新的生物類型的技術(shù)體系。第十章植物基因工程花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課基因工程中的工具酶限制性內(nèi)切核酸酶

DNA連接酶

DNA聚合酶反轉(zhuǎn)錄酶最重要的工具酶是限制性內(nèi)切核酸酶花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課

將外源DNA片段運(yùn)送進(jìn)宿主細(xì)胞進(jìn)行擴(kuò)增或表達(dá)的運(yùn)載工具稱為載體。植物基因工程載體

克隆載體:分離和擴(kuò)增目的基因使用的載體。轉(zhuǎn)化載體:將目的片斷導(dǎo)入受體細(xì)胞并使之表達(dá)的載體?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課植物基因工程中常用的選擇標(biāo)記和報(bào)告基因功能:在選擇壓力下把轉(zhuǎn)化體選擇出來(lái)。特點(diǎn):在特定培養(yǎng)基上生長(zhǎng);與目的基因嵌和表達(dá)?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課報(bào)告基因和選擇基因的

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