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花卉分子生物學(xué)主要學(xué)習(xí)內(nèi)容遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)基因和基因組復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯基因表達(dá)與調(diào)控基因功能研究方法基因工程原理花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課考試題型:一、名詞解釋(每題3分,共24分)二、單項選擇題(每題1.5分,共15分)三、判斷題(每題1分,共10分)四、簡答題(每題6分,共36分)五、論述題(每題15分,共15分)考試成績60%,平時成績40%花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第一、二章
遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)染色體的結(jié)構(gòu)遺傳物質(zhì)的本質(zhì)及證明核酸的化學(xué)組成及理化性質(zhì)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課染色質(zhì)的基本結(jié)構(gòu)單元核小體nuclesome8個組蛋白分子組成核小體的核心DNA在八聚體纏繞1.75圈,大約146bp組蛋白H1結(jié)合在DNA分子的出口和入口處染色體的結(jié)構(gòu)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNA是遺傳物質(zhì)的直接證據(jù)肺炎雙球菌感染實驗(Griffith,1928)噬菌體感染實驗(HersheyandChase,1952)3.煙草花葉病毒(TMV)感染試驗花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課核酸的化學(xué)組成及理化性質(zhì)脫氧核糖核酸
DeoxyribonucleicAcid,DNA核糖核酸
RibonucleicAcid,RNA結(jié)構(gòu)單位:核苷酸(五碳糖、堿基、磷酸)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNA的二級結(jié)構(gòu)結(jié)構(gòu)要點:反向平行;
堿基配對;
堿基距離為0.34nm;
螺距為3.4nm。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課核酸的雜交核酸分子雜交:具有互補序列(或某一區(qū)段互補)的兩條多核苷酸鏈,通過堿基互補配對形成穩(wěn)定的雙鏈分子的過程。Northern、Southern、Western花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第三章DNA的生物合成復(fù)制體系復(fù)制的過程(起始、延伸、終止)
體外復(fù)制—PCR技術(shù)簡介花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課復(fù)制體系
底物:
dATP,dGTP,dCTP,dTTP
聚合酶:
依賴DNA的DNA聚合酶(DNA-pol)
模板:
解開成單鏈的DNA母鏈引物:
提供3
-OH末端使dNTP可以依次聚合
其他的酶和蛋白質(zhì)因子DNA連接酶螺旋酶DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶單鏈結(jié)合蛋白花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課參與DNA復(fù)制的酶與蛋白因子總覽圖花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課催化5’
3’方向合成多聚核苷酸
3’
5’核酸外切酶活性:使酶能從剛合成的鏈的3’末端切下核苷酸
校讀核酸外切酶活性:從合成的鏈中去除一部分已經(jīng)和模板結(jié)合的核苷酸,這一功能主要存在于細(xì)菌DNA復(fù)制后的滯后鏈過程中不連接DNA片段的連接過程中DNA聚合酶的三種活性:
花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNApolymerase基本功能花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課
聚合酶鏈反應(yīng)簡稱PCR,是一項在短時間內(nèi)大量擴增特定的DNA片段的分子生物學(xué)技術(shù)。
基因的體外復(fù)制——PCR技術(shù)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
(polymerasechainreaction,PCR)模板引物dNTPMg2+
TaqDNA聚合酶變性延伸退火花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第四章轉(zhuǎn)錄
轉(zhuǎn)錄:以DNA為模板,在RNA聚合酶的作用下合成mRNA,將遺傳信息從DNA分子上轉(zhuǎn)移到mRNA分子上,這一過程稱為轉(zhuǎn)錄。
花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課參與轉(zhuǎn)錄的物質(zhì)原料:NTP(ATP,UTP,GTP,CTP)模板:DNA酶:RNA聚合酶其他蛋白質(zhì)因子RNA合成方向:5’→3'花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課二、參與轉(zhuǎn)錄起始的關(guān)鍵酶與元件(一)RNA聚合酶●原核生物RNA聚合酶(大腸桿菌為例)(1)全酶(holoenzyme)
由4種(5個)亞基α2ββ’σ組成(2)核心酶(coreenzyme)
α2ββ’
,參與轉(zhuǎn)錄的全過程(3)σ亞基亦稱σ因子(σfactor)—轉(zhuǎn)錄輔助因子
識別啟動子,不參與轉(zhuǎn)錄過程花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課(二)啟動子(promoter)啟動子定義:指能被RNA聚合酶識別、結(jié)合并啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。41-44bp花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課原核生物啟動子保守序列轉(zhuǎn)錄起點-10區(qū)(Pribnow框)T80A95T45A60a50T96-35區(qū)(Sextama框)T84T84G78A65C54a456bpCATTATAATTTGACA15~20bp-10元件-35元件-1+1+30花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課σ因子RNA聚合酶中識別及結(jié)合啟動子的亞基,延長時脫落,不參與轉(zhuǎn)錄過程,是轉(zhuǎn)錄輔助因子。σ因子識別位點:啟動子-35區(qū)、-10區(qū)(一)轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物三、轉(zhuǎn)錄的基本過程:起始、延伸、終止真核生物的起始
較原核生物復(fù)雜
◆順式作用元件
◆轉(zhuǎn)錄因子(transcriptionfactor,TF)
RNA聚合酶Ⅱ所需的轉(zhuǎn)錄因子
---轉(zhuǎn)錄因子Ⅱ(TFⅡ)
●
亞基脫落,RNA–pol聚合酶核心酶變構(gòu),與模板結(jié)合松弛,沿著DNA模板前移;●在核心酶作用下,NTP不斷聚合,RNA鏈不斷延長。核心酶····DNA····RNA(二)轉(zhuǎn)錄延伸花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課終止子(terminator,t)
●強終止子-內(nèi)部終止子
●弱終止子-需要ρ因子(rhofactor)又稱為ρ依賴性終止子(Rho-dependentterminator)不依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止依賴Rho(ρ)因子的轉(zhuǎn)錄終止(三)轉(zhuǎn)錄終止花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課四、轉(zhuǎn)錄后加工花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課mRNA轉(zhuǎn)錄后加工原核生物mRNA轉(zhuǎn)錄后一般不需要加工,轉(zhuǎn)錄的同時即進行翻譯。亦有少數(shù)多順反子的mRNA需要核酸酶切成小單位,然后再翻譯。真核生物mRNA原初轉(zhuǎn)錄物很大,在加工過程中形成許多分子大小不等的中間物,稱為核內(nèi)不均一RNA(hnRNA),需要進一步進行加工修飾轉(zhuǎn)化為mRNA。加工包括:(1)hnRNA被剪接,剪掉內(nèi)含子(DNA上非編碼序列)轉(zhuǎn)錄序列,拼接外顯子(DNA上的編碼序列)轉(zhuǎn)錄序列。(2)3’端添加polyA“尾巴”;(3)5’端連接“帽子”結(jié)構(gòu)(m7G5
ppp5
NmpNp-)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課五、原核生物與真核生物mRNA的特征比較
1、原核生物mRNA的特征●半衰期短●多以多順反子的形式存在多順反子mRNA:編碼多個蛋白質(zhì)的mRNA。單順反子mRNA:只編碼一個蛋白質(zhì)的mRNA?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課●5’
端無“帽子”結(jié)構(gòu),3’
端沒有或只有較短的poly(A)結(jié)構(gòu)。SD序列:mRNA中用于結(jié)合原核生物核糖體的序列?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課2、真核生物mRNA的特征5’
端存在“帽子”結(jié)構(gòu)多數(shù)mRNA
3’
端具有poly(A)尾巴(組蛋白除外)以單順反子的形式存在花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課逆轉(zhuǎn)錄原理的應(yīng)用-RT-PCR
反轉(zhuǎn)錄PCR:是將RNA的反轉(zhuǎn)錄(RT)和cDNA的聚合酶鏈擴增(PCR)相結(jié)合的技術(shù)。主要用于基因表達(dá)的檢測。ProteinBiosynthesis
蛋白質(zhì)的生物合成第五章翻譯
花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課mRNA簡并性通用性連續(xù)性搖擺性
每3個核苷酸為一組,對應(yīng)一個氨基酸,叫做一個密碼子(codon)。
起始密碼子:AUGGUG;終止密碼子:UAAUAGUGA一、DNA與遺傳密碼(一)mRNA是蛋白質(zhì)生物合成的模板起始密碼子:AUG終止密碼子:UAA,UGA,UAG編碼區(qū)非編碼區(qū)開放讀框(openreadingframe,ORF)二、3種RNA分子(二)tRNA—轉(zhuǎn)運氨基酸(二)tRNA—轉(zhuǎn)運氨基酸通過密碼子與反密碼子的相互作用
堿基互補配對原則tRNA的功能真核生物:游離核糖體或與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)結(jié)合原核生物:游離核糖體或與mRNA結(jié)合成串狀的多核糖體(三)核糖體(rRNA)—蛋白質(zhì)合成場所三、蛋白質(zhì)的生物合成過程三種RNA:mRNA、tRNA、rRNA原料:20種aa需要酶及眾多蛋白因子、ATP、GTP等蛋白質(zhì)合成方向:N端→C端mRNA的翻譯方向:5ˊ→3ˊ(一)蛋白質(zhì)合成的一般特征(二)蛋白質(zhì)生物合成的過程兩個前提:氨基酸活化核糖體解離進位成肽轉(zhuǎn)位(三)肽鏈的延伸第六章基因和基因組
花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課1950年,發(fā)現(xiàn)玉米粒的顏色經(jīng)常發(fā)生變化認(rèn)為:一種控制基因在玉米基因組中移動的結(jié)果移動基因(movablegenens)指可在DNA分子間進行轉(zhuǎn)移的DNA片段。也叫跳躍基因(jumpinggenes)?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課DNA-RNA方式轉(zhuǎn)座子DNA-DNA方式轉(zhuǎn)座子花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課基因家族基因家族(multigenefamily)指DNA序列具有較高的同源性(通常大于50%),并且其編碼產(chǎn)物具有相同或相似生理功能的一組結(jié)構(gòu)基因。直系同源(orthology)是指不同物種內(nèi)的同源序列,它們來源于物種形成時的共同祖先基因。旁系同源(paralogy)基因是指同一基因組(或同一物種的基因組)中,由于始祖基因的加倍而橫向/水平方向(horizontal)產(chǎn)生的幾個同源基因。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課RNAmRNA外顯子1外顯子2外顯子3內(nèi)含子1內(nèi)含子2DNA剪切斷裂基因指基因的編碼序列在DNA分子上是不連續(xù)排列的,而是被不編碼的序列所隔開?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課真核生物基因組
真核生物的基因組定義:一個物種的單倍體的染色體數(shù)目稱為該物種的基因組?;蚪M的大?。–值):一個基因組含有的堿基總數(shù)。表達(dá)序列、重復(fù)序列和非編碼序列。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課
高等生物具有比低等生物更復(fù)雜的生命活動,所以,理論上應(yīng)該是它們的C值也應(yīng)該更高。但是事實上C值沒有體現(xiàn)出與物種進化程度相關(guān)的趨勢。高等生物的C值不一定就意味著它的C值高于比它低等的生物。這種生物學(xué)上的DNA總量的比較和矛盾,稱為C值悖論?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課真核生物基因組都是由大分子雙鏈線狀DNA構(gòu)成。染色體通常成對出現(xiàn)(雙倍體)?;蚪M非常龐大,結(jié)構(gòu)非常復(fù)雜,有多個復(fù)制起始位點?;蚪M中存在大量的重復(fù)序列以及非編碼序列。在一定程度上也是生物進化的標(biāo)尺。真核生物基因組中也存在一些可移動的DNA序列(轉(zhuǎn)座元件)。真核生物基因組的特點花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課微衛(wèi)星DNA(satelliteDNA)
其重復(fù)單位為2~5bp,存在于常染色體,常見于內(nèi)含子中。人類基因組DNA中平均每6~10kb就有一個STR位點。不同個體之間在一個同源STR位點的重復(fù)次數(shù)不同。由于重復(fù)單位及重復(fù)次數(shù)不同,使其在不同種族,不同人群之間的分布具有很大差異性,構(gòu)成了STR遺傳多態(tài)性。(CA)n和(TG)n:核心序列結(jié)構(gòu)相同,重復(fù)單位數(shù)目10-60個花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課第七章真核生物基因表達(dá)的調(diào)控DNA水平上的調(diào)控染色質(zhì)水平上的調(diào)控轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控轉(zhuǎn)錄后調(diào)控翻譯后調(diào)控花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課真核基因表達(dá)調(diào)控的順式作用元件順式作用元件(cis-actingelement)是指DNA分子上對基因表達(dá)有調(diào)節(jié)活性的特定核苷酸序列。順式作用元件多位于基因上游或內(nèi)含子中,只影響同一DNA分子上的基因。真核基因的順式作用元件按其功能可以分為:啟動子,增強子,靜止子1.轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課組成型啟動子
組成型啟動子在所有組織中都能啟動基因的表達(dá)。組織特異型啟動子誘導(dǎo)型啟動子
所謂誘導(dǎo)型啟動子就是在某些特定的物理或化學(xué)的刺激下,此種啟動子可以大幅度地提高基因的轉(zhuǎn)錄水平,因此,亦稱為誘導(dǎo)型調(diào)節(jié)序列或誘導(dǎo)型增強子啟動子類型及應(yīng)用研究花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課反式作用因子
反式作用因子(trans-acting
factor)指一些與基因表達(dá)調(diào)控有關(guān)的蛋白質(zhì)因子。真核生物反式作用因子通常指轉(zhuǎn)錄因子(transcription
factor,TF)。反式作用因子與順式作用元件之間的共同作用,才能夠達(dá)到對特定基因進行調(diào)控的目的?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課特異轉(zhuǎn)錄因子(specialtranscriptionfactors)能夠選擇性調(diào)控某種或某些基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的蛋白質(zhì)因子稱為特異性轉(zhuǎn)錄因子.為個別基因轉(zhuǎn)錄所必需,決定該基因的時間、空間特異性表達(dá)。一般轉(zhuǎn)錄因子特殊轉(zhuǎn)錄因子花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子結(jié)構(gòu)DNA結(jié)合域轉(zhuǎn)錄激活域TF蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)結(jié)合域二聚化結(jié)構(gòu)域與RNA聚合酶結(jié)合與順式元件識別、結(jié)合花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課2.DNA水平的調(diào)控DNA水平上的調(diào)控是通過改變基因組中有關(guān)基因的數(shù)量和結(jié)構(gòu)順序而控制基因的表達(dá)?;驍U增基因重排
DNA的甲基化花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課DNA的甲基化指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)的作用下,以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)為甲基供體,將甲基添加在DNA分子中的堿基上?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課DNA甲基化導(dǎo)致某些區(qū)域DNA構(gòu)象變化,從而影響了蛋白質(zhì)與DNA的相互作用,抑制了轉(zhuǎn)錄因子與啟動區(qū)DNA的結(jié)合效率從而引起基因的失活?;钴S表達(dá)的基因都是甲基化不足的基因。表達(dá)活性與甲基化程度呈負(fù)相關(guān)。甲基化可以調(diào)控基因表達(dá)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課3.染色質(zhì)水平的調(diào)控
組蛋白質(zhì)修飾
組蛋白的乙?;突虮磉_(dá)的狀態(tài)相關(guān)。
被組蛋白覆蓋的基因如果要表達(dá),首先要改變組蛋白的修飾狀態(tài),使其與DNA的結(jié)合由緊變松,這樣靶基因才能與轉(zhuǎn)錄復(fù)合物相互作用。因此,組蛋白是重要的染色體結(jié)構(gòu)維持單元和基因表達(dá)的負(fù)控制因子。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課4.轉(zhuǎn)錄后調(diào)控mRNA剪接RNA干擾microRNA花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課(1)mRNA的剪接大多數(shù)真核生物基因是不連續(xù)的,外顯子與內(nèi)含子相間排列而轉(zhuǎn)錄的時候外顯子和內(nèi)含子是一起轉(zhuǎn)錄的轉(zhuǎn)錄以后必須降內(nèi)含子切除,才能形成成熟的mRNA分子這個過程成為內(nèi)含子的剪接(splicing)花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課可變剪接同一初級轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物通過不同的剪接方式,形成不同的成熟mRNA分子。
選擇性剪接的不同形式*深藍(lán):均保留的exon;
淺藍(lán):僅在一個mRNA中保留的exon;
黃色:intron;
紅線:被剪切去的區(qū)域?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課(2)RNA干擾
一些小的雙鏈RNA可以高效、特異地阻斷體內(nèi)特定基因表達(dá),促使mRNA降解,誘使細(xì)胞表現(xiàn)出特定基因缺失的表型,稱為RNA干擾(RNAinterference,RNAi,也譯作RNA干預(yù)或者干涉或者沉默)?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課(3)microRNAmiRNA是廣泛存在于真核生物中的一組短小的、不編碼蛋白質(zhì)的RNA家族,它們是由19-25個核苷酸組成的單鏈RNA;類似于siRNA的分子,由高等真核生物基因組編碼,miRNA通過和靶基因mRNA堿基配對引導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)降解mRNA或阻礙其翻譯。
花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課5.翻譯后調(diào)控直接來自核糖體的線狀多肽鏈?zhǔn)菦]有功能的,必須經(jīng)過加工、蛋白質(zhì)折疊才具有活性。
花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課按照育種目標(biāo),根據(jù)已知的目標(biāo)性狀的遺傳背景,進行嚴(yán)密的分子設(shè)計,通過體外DNA重組技術(shù)和DNA轉(zhuǎn)移技術(shù),有目的地改造生物體,以創(chuàng)造出新的生物類型的技術(shù)體系。第十章植物基因工程花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課基因工程中的工具酶限制性內(nèi)切核酸酶
DNA連接酶
DNA聚合酶反轉(zhuǎn)錄酶最重要的工具酶是限制性內(nèi)切核酸酶花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課
將外源DNA片段運送進宿主細(xì)胞進行擴增或表達(dá)的運載工具稱為載體。植物基因工程載體
克隆載體:分離和擴增目的基因使用的載體。轉(zhuǎn)化載體:將目的片斷導(dǎo)入受體細(xì)胞并使之表達(dá)的載體。花卉分子生物學(xué)復(fù)習(xí)課植物基因工程中常用的選擇標(biāo)記和報告基因功能:在選擇壓力下把轉(zhuǎn)化體選擇出來。特點:在特定培養(yǎng)基上生長;與目的基因嵌和表達(dá)?;ɑ芊肿由飳W(xué)復(fù)習(xí)課報告基因和選擇基因的
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