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文檔簡(jiǎn)介
ICS**.***.**
C**
團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)
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當(dāng)歸配方顆粒PCR鑒別
PCRidentificationofDangguiPeifangkeli
(文件類型:公示稿)
(完成時(shí)間:2020年11月)
20**-**-**發(fā)布20**-**-**實(shí)施
中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)發(fā)布
T/CACM****-20**
前言
(必備要素)
本標(biāo)準(zhǔn)按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》
的規(guī)定起草。
本標(biāo)準(zhǔn)由中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心提出。
本標(biāo)準(zhǔn)由中華中醫(yī)藥學(xué)會(huì)歸口。
本標(biāo)準(zhǔn)起草單位:中國(guó)中醫(yī)科學(xué)院中藥資源中心、華潤(rùn)三九醫(yī)藥股份有限公司、安徽省
食品藥品檢驗(yàn)研究院、浙江省中醫(yī)院、成都中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院、安徽華潤(rùn)金蟾藥業(yè)股份有
限公司、華潤(rùn)三九(雅安)藥業(yè)有限公司
本標(biāo)準(zhǔn)主要起草人:袁媛、張輝、蔣超、張亞中、蒲婧哲、胡沖、鄭敏霞、鄭琰、高波、
吳建國(guó)
II
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當(dāng)歸配方顆粒PCR鑒別
1.范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了使用PCR鑒別當(dāng)歸配方顆粒的通用方法和要求。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于當(dāng)歸配方顆粒的鑒別。
2.規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)本標(biāo)準(zhǔn)的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用
于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用本標(biāo)準(zhǔn)。
《中華人民共和國(guó)藥典》
GB/T6682《分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法》
GB/T27403《實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)》
T/CACM010-2016《中藥分子鑒定通則》
3.術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本標(biāo)準(zhǔn)。
3.1
當(dāng)歸配方顆粒dangguipeifangkeli
為傘形科植物當(dāng)歸Angelicasinensis(Oliv.)Diels的干燥根經(jīng)炮制并按標(biāo)準(zhǔn)湯劑的主要
質(zhì)量指標(biāo)加工制成的配方顆粒。
4.儀器設(shè)備
應(yīng)符合規(guī)范性附錄A的要求。
5.試劑
應(yīng)符合規(guī)范性附錄A的要求。
6.鑒別引物序列
Danggui-224F:5'-CTCGTGGAGCTGTACTGGTA-3'
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Danggui-224R:5'-GGTAGTCCCGCCTGACCT-3'。
7.檢驗(yàn)程序
為防止交叉污染,收樣、取樣、粉碎、DNA提取、核酸擴(kuò)增與產(chǎn)物檢測(cè)應(yīng)在不同操作
間或在同一操作間不同隔離區(qū)域進(jìn)行,進(jìn)入各區(qū)域應(yīng)嚴(yán)格按照單一方向進(jìn)行,即樣品制備區(qū)
→核酸制備區(qū)→擴(kuò)增區(qū)→檢測(cè)區(qū)。
7.1取樣
送檢樣品總量應(yīng)不低于10g,每批分為3等份,1/3供實(shí)驗(yàn)室分析用,另1/3供復(fù)核用,其
余1/3留樣保存。收樣時(shí)應(yīng)檢查包裝的完整性,并在樣品袋上貼上標(biāo)簽,填寫采集數(shù)據(jù)表。
對(duì)商品包裝和送樣說明進(jìn)行拍照記錄,照片隨樣品一起備檔。送檢樣品抽樣方法參照《中華
人民共和國(guó)藥典》四部通則0211進(jìn)行取樣。
7.2DNA提取
送檢樣品DNA提取步驟如下:
a)取樣品1g,粉碎成粉末。
b)取上述粉末0.02g,置2mL離心管中,加入細(xì)胞核裂解液300μL、乙二胺四乙酸
二鈉溶液50μL、蛋白酶K溶液20μL、RNA酶A溶液5μL,充分渦旋震蕩混勻3min,
56℃下水浴60min。
c)離心(12000×g)5min后,吸取上清液250μL至一新的2mL離心管中,加入裂
解緩沖液250μL,混勻,轉(zhuǎn)移至純化柱,將純化柱放入離心機(jī),離心(12000×g)5min;
棄去濾過液。
d)往純化柱中加入洗脫液700μL,離心(12000×g)1min。
e)重復(fù)步驟d)2次。
f)棄去濾過液,再離心(12000×g)2min,取出純化柱,室溫放置2min,晾干吸附
材料中的剩余洗脫液。
g)將純化柱換入一個(gè)新的2mL離心管,向吸附膜的中央懸空滴加無菌雙蒸水100μL,
靜置3min,離心(12000×g)2min,取濾過液的上清液,作為供試品溶液,可置-20℃
下保存?zhèn)溆谩?/p>
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除上述方法外,也可用等效的DNA提取方法提取試樣DNA。
7.3PCR擴(kuò)增
首次使用本方法時(shí),應(yīng)校對(duì)PCR儀溫控準(zhǔn)確性,并使用陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照以核對(duì)使
用的TaqDNA聚合酶或PCR預(yù)混液的適用性。
7.3.1對(duì)照試驗(yàn)
送檢樣品應(yīng)平行檢測(cè)2次,并設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照(使用當(dāng)歸對(duì)照藥材,按7.2提取DNA,
所獲的液體作為PCR擴(kuò)增的陽(yáng)性對(duì)照)、陰性對(duì)照(可選擇白芷對(duì)照藥材,按7.2提取DNA,
所獲的液體作為PCR擴(kuò)增的陰性對(duì)照)和空白對(duì)照。
7.3.2PCR反應(yīng)體系
在200μL離心管中依次加入2×M5SuperFastTaqPCRMasterMixPCR預(yù)混液12.5μL、
引物溶液(含正向和反向引物)各0.4μL、模板DNA(10ng~50ng)3μL,用無菌雙蒸水
補(bǔ)足反應(yīng)體積至25μL。將反應(yīng)液振蕩混勻,瞬時(shí)離心。
7.3.3PCR反應(yīng)參數(shù)
將離心管置于PCR儀中,PCR反應(yīng)參數(shù)為:95°C預(yù)變性5min,循環(huán)反應(yīng)40次(95°C
30s,60°C30s,72°C30s),72°C延伸5min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,取出離心管,對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物
按7.5進(jìn)行檢測(cè)。
或置4°C下保存。
7.4限制性內(nèi)切酶酶切
在200μL離心管中依次加入PCR反應(yīng)產(chǎn)物溶液25μL、10×限制性內(nèi)切酶緩沖液3μL,
SmlI限制性內(nèi)切酶0.5μL,用無菌雙蒸水補(bǔ)足反應(yīng)體積至30μL。將反應(yīng)液振蕩混勻,瞬時(shí)
離心。將離心管置PCR儀,55°C保溫60min,取出離心,對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)或置4°C
下保存。
7.5擴(kuò)增/酶切產(chǎn)物檢測(cè)
配制2%瓊脂糖凝膠,膠中加入適量核酸染料GelRed。取送檢樣品、陽(yáng)性對(duì)照、陰性
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對(duì)照及空白對(duì)照的酶切反應(yīng)各1μL產(chǎn)物,分別加入6×上樣緩沖液各5μL,混勻,分別上
樣于同一瓊脂糖凝膠上,DL1000DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)溶液上樣量為2μL(0.5μg/μL)。按《中
華人民共和國(guó)藥典》四部通則1001“瓊脂糖凝膠電泳法(核酸檢測(cè)用)”試驗(yàn)。電泳結(jié)束后,
取凝膠片在凝膠成像儀上或紫外透射儀上檢視。
8.結(jié)果判定
在陰性對(duì)照、陽(yáng)性對(duì)照和空白對(duì)照結(jié)果符合規(guī)定的情況下,供試品凝膠電泳圖譜中,在
與對(duì)照藥材凝膠電泳圖譜相應(yīng)的位置上,在100~200bp間有單一DNA條帶者為陽(yáng)性,否則為
陰性結(jié)果。
9.結(jié)果報(bào)告
9.1一般要求
檢測(cè)結(jié)果應(yīng)表示為陽(yáng)性或陰性,陽(yáng)性和陰性分別用“+”和“-”符號(hào)表示。
9.2檢測(cè)報(bào)告
樣品經(jīng)檢測(cè)后,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)的具體操作程序和結(jié)果做好詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)記錄,出具檢
測(cè)報(bào)告。檢測(cè)報(bào)告包含的基本內(nèi)容應(yīng)參照T/CACM010-2016《中藥分子鑒定通則》的要求。
10.質(zhì)量保證
兩份平行樣檢測(cè)結(jié)果應(yīng)一致。當(dāng)一份送檢樣品的結(jié)果為陽(yáng)性,另一份為陰性時(shí),要重新
測(cè)試??梢赃m當(dāng)增加核酸擴(kuò)增反應(yīng)體系中DNA模板量,使兩份試樣得到同樣的結(jié)果。平行
樣本檢測(cè)結(jié)果不一致時(shí)應(yīng)檢測(cè)模板DNA的質(zhì)量,確保提取的DNA片段大于擴(kuò)增片段。如果
經(jīng)過兩次以上從核酸提取開始的重復(fù)檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果不一致,可在測(cè)試報(bào)告中表述該實(shí)驗(yàn)室
樣品的測(cè)試結(jié)果為陰性,并注明定量檢測(cè)和定性檢測(cè)方法的檢測(cè)低限。進(jìn)行PCR反應(yīng)前,應(yīng)
確認(rèn)所使用的聚合酶符合本標(biāo)準(zhǔn)的要求。
11.廢棄物處理
檢測(cè)過程中的廢棄物處理應(yīng)符合GB/T27403《實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)》
的要求。
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附錄A
(規(guī)范性)
為執(zhí)行本包括本標(biāo)準(zhǔn),以下儀器、試劑必不可少:
A.1儀器設(shè)備
離心機(jī)(離心機(jī)最高重力離心力應(yīng)≥12000×g)、金屬浴(應(yīng)可放置2mL離心管,也可使
用水浴鍋替代)、制冰機(jī)、渦旋振蕩器、高壓滅菌鍋、PCR儀(使用前應(yīng)進(jìn)行溫度校準(zhǔn)、電
泳儀及其附件(應(yīng)包括水平電泳槽、制膠器、鯊魚齒梳等)、凝膠成像儀(或紫外透射儀等
凝膠觀察設(shè)備)、核酸蛋白儀、電子天平(感量0.01g)、連續(xù)可調(diào)微量移液槍(至少應(yīng)該包
括2.5μL、10μL、200μL、1000μL等4種不同規(guī)格,并包括配套一次性吸頭)、低溫冰箱
(溫度可維持在4°C及-20°C)
A.2試劑與試藥
除另有規(guī)定外,實(shí)驗(yàn)試劑為不含DNA和DNase的分析純或生化試劑;實(shí)驗(yàn)用水符合GB/T
6682的要求;所配制的試劑均應(yīng)滅菌后保存,并在容器上注明試劑名稱、濃度、配制時(shí)間、
保存條件、失效日期和配制者姓名;PCR試劑應(yīng)小量分裝保存以減少污染;材料及試劑的保
存都應(yīng)有防污染措施。
主要試劑與試藥包括:2×M5SuperFastTaqPCRMasterMixPCR預(yù)混液、DNA提取試
劑盒(可采用商品化DNA提取試劑盒,包括細(xì)胞核裂解液、乙二胺四乙酸二鈉溶液、裂解
緩沖液、洗脫液、DNA純化柱等)、DNA提取試劑盒(應(yīng)在-20°C下保存,使用時(shí)置冰上操
作)、引物溶液(用無菌雙蒸水將上述引物溶解至10μmol/L)、DL1000DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)溶
液(DL1000DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)溶液經(jīng)凝膠電泳后應(yīng)出現(xiàn)100bp、200bp、300bp、400bp、500
bp和1000bp大小的指示條帶)、50×TAE電泳緩沖液、6×上樣緩沖液、當(dāng)歸對(duì)照藥材粉末、
20mg/mL蛋白酶K溶液、10mg/mL核糖核酸酶A(RNA酶A)溶液、SmlI限制性內(nèi)切酶、
10×限制性內(nèi)切酶緩沖液(應(yīng)根據(jù)不同限制性內(nèi)切酶選擇對(duì)應(yīng)的限制性內(nèi)切酶緩沖液)、核
酸凝膠染色劑GelRed(10mg/mL或10000×)、2%瓊脂糖凝膠
50×TAE電泳緩沖液配制方法:在800mL去離子水中溶解242gTris,37.2g乙二胺四乙
酸二鈉(Na2EDTA·2H2O),加入57.1mL的醋酸,充分混勻,加去離子水定容至1L,室溫
保存,使用時(shí)用去離子水50倍稀釋?;蚴褂猛纫?guī)格商業(yè)產(chǎn)品。
6×上樣緩沖液配制方法:在80mL去離子水中溶解溴酚藍(lán)0.25g,二甲苯氰FF0.25g,蔗
糖40g,加水定容至100mL,分裝?;蚴褂猛纫?guī)格商業(yè)產(chǎn)品。
2%瓊脂糖凝膠配制方法:參照《中華人民共和國(guó)藥典》四部1001進(jìn)行配制。取瓊脂糖
2.0g適量,加入電泳緩沖液100mL,加熱使溶脹完全,加人適量核酸染色劑,混勻,倒入
插有鯊魚齒梳的模具中,待凝膠結(jié)成無氣泡的均勻薄層,即得。
A.3適用范圍
本標(biāo)準(zhǔn)不適用于正偽混合樣品的鑒定。
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附錄B
(資料性)
當(dāng)歸配方顆粒PCR反應(yīng)體系的建立
B.1當(dāng)歸PCR-RFLP鑒別引物設(shè)計(jì)
通過測(cè)序及從GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)查找正品當(dāng)歸及當(dāng)歸常見混偽品(獨(dú)活A(yù)ngelica
pubescens、白芷Angelicadahurica、前胡Peucedanumpraeruptorum、歐當(dāng)歸Levisticum
officinale、及當(dāng)歸屬其他物種)ITS序列。用BioEdit軟件進(jìn)行序列比較,找到當(dāng)歸特異性
SNP位點(diǎn),該位點(diǎn)位于SmlI識(shí)別位點(diǎn)(CTYRAG)上,當(dāng)歸可被酶切成短片段,當(dāng)歸混偽
品不具有該識(shí)別序列,無法酶切,并設(shè)計(jì)相應(yīng)鑒別引物Danggui-224F:5'-
CTCGTGGAGCTGTACTGGTA-3'和Danggui-224R:5'-GGTAGTCCCGCCTGACCT-3',PCR
擴(kuò)增并使用SmlI內(nèi)切酶進(jìn)行酶切后(即聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-限制性內(nèi)切酶酶切長(zhǎng)度多態(tài)性圖譜,
PCR-RFLP),當(dāng)歸可被酶切成為162bp和62bp的短片段,當(dāng)歸混偽品無法擴(kuò)增不具有該
識(shí)別序列,無法酶切,依然保留224bp條帶或因無法擴(kuò)增而無條帶。引物設(shè)計(jì)如圖1所示。
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圖1當(dāng)歸特異性酶切鑒定引物設(shè)計(jì)
B.2聚合酶對(duì)PCR鑒別結(jié)果的影響
選擇不同公司的Taq酶及其Mix進(jìn)行測(cè)試,包括2×T5SuperPCRMix(北京擎科新業(yè)
生物技術(shù)有限公司)、2×M5SuperFastTaqPCRMasterMix(聚合美生物有限公司)、
MightyAmpDNAPolymeraseVer.2(Takara生物科技有限公司)、2×TransStart?FastPfuFly
PCRSuperMix(全式金生物技術(shù)有限公司)進(jìn)行測(cè)試。2×M5SuperFastTaqPCRMasterMix
和MightyAmpDNAPolymeraseVer.2在當(dāng)歸藥材、當(dāng)歸配方顆粒浸膏、當(dāng)歸配方顆粒中均能
擴(kuò)增出224bp的單一條帶,2×TransStart?FastPfuFlyPCRSuperMix無法從配方顆粒DNA
中擴(kuò)增出條帶,2×T5SuperPCRMix擴(kuò)增條帶較弱,難以進(jìn)行下游酶切鑒別操作,選擇2×M5
SuperFastTaqPCRMasterMix進(jìn)行后續(xù)研究(圖2)。
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圖2不同聚合酶種類對(duì)當(dāng)歸PCR擴(kuò)增結(jié)果的影響
M:Trans2KDNAMarker;As:當(dāng)歸;AsE:當(dāng)歸配方顆粒浸膏;AsG:當(dāng)歸配方顆粒;Lo:
歐當(dāng)歸;Ad:白芷;Pp:前胡;Ap:獨(dú)活;Asp:野當(dāng)歸;Ls:藁本;N:空白對(duì)照
B.3方法的適用性考察
采用標(biāo)準(zhǔn)中所述體系對(duì)不同來源的當(dāng)歸配方顆粒進(jìn)行鑒定,當(dāng)歸配方顆粒均可酶切獲得
約160bp特異性鑒別條帶,混偽品配方顆粒在相應(yīng)位置上均無擴(kuò)增條帶(圖3,圖4)。
圖3不同企業(yè)、批次當(dāng)歸配方顆粒鑒定結(jié)果
M:Trans2KDNAMarker;1-3:當(dāng)歸配方顆粒浸膏;4-24:當(dāng)歸配方顆粒。
圖4不同企業(yè)、批次當(dāng)歸配方顆?;靷纹疯b定結(jié)果
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M:Trans2KDNAMarker;1:當(dāng)歸藥材;2:當(dāng)歸配方顆粒;3-6:獨(dú)活配方顆粒;7-9:前
胡配方顆粒;10-12:白芷配方顆粒;13-15:藁本配方顆粒;N:空白對(duì)照。
9
參考文獻(xiàn)
[1]聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法通則起草組.《中國(guó)藥典》聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)法的建立[J].中國(guó)中藥
雜志,2020,45(19):4537-4544.
10
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目次
前言...........................................................................................................錯(cuò)誤!未定義書簽。
目錄...........................................................................................................錯(cuò)誤!未定義書簽。
1.范圍..............................................................................................................................................1
2.規(guī)范性引用文件..........................................................................................................................1
3.術(shù)語(yǔ)和定義..................................................................................................................................1
4.儀器設(shè)備......................................................................................................................................1
5.試劑..........................................................................................................................................1
6.鑒別引物序列..............................................................................................................................1
7.檢驗(yàn)程序......................................................................................................................................2
8.結(jié)果判定......................................................................................................................................4
9.結(jié)果報(bào)告......................................................................................................................................4
10.質(zhì)量保證....................................................................................................................................4
11.廢棄物處理................................................................................................................................4
附錄A...............................................................................................................................................5
附錄B...............................................................................................................................................6
參考文獻(xiàn).........................................................................................................................................10
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當(dāng)歸配方顆粒PCR鑒別
1.范圍
本標(biāo)準(zhǔn)規(guī)定了使用PCR鑒別當(dāng)歸配方顆粒的通用方法和要求。
本標(biāo)準(zhǔn)適用于當(dāng)歸配方顆粒的鑒別。
2.規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)本標(biāo)準(zhǔn)的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用
于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用本標(biāo)準(zhǔn)。
《中華人民共和國(guó)藥典》
GB/T6682《分析實(shí)驗(yàn)室用水規(guī)格和試驗(yàn)方法》
GB/T27403《實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)》
T/CACM010-2016《中藥分子鑒定通則》
3.術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本標(biāo)準(zhǔn)。
3.1
當(dāng)歸配方顆粒dangguipeifangkeli
為傘形科植物當(dāng)歸Angelicasinensis(Oliv.)Diels的干燥根經(jīng)炮制并按標(biāo)準(zhǔn)湯劑的主要
質(zhì)量指標(biāo)加工制成的配方顆粒。
4.儀器設(shè)備
應(yīng)符合規(guī)范性附錄A的要求。
5.試劑
應(yīng)符合規(guī)范性附錄A的要求。
6.鑒別引物序列
Danggui-224F:5'-CTCGTGGAGCTGTACTGGTA-3'
1
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Danggui-224R:5'-GGTAGTCCCGCCTGACCT-3'。
7.檢驗(yàn)程序
為防止交叉污染,收樣、取樣、粉碎、DNA提取、核酸擴(kuò)增與產(chǎn)物檢測(cè)應(yīng)在不同操作
間或在同一操作間不同隔離區(qū)域進(jìn)行,進(jìn)入各區(qū)域應(yīng)嚴(yán)格按照單一方向進(jìn)行,即樣品制備區(qū)
→核酸制備區(qū)→擴(kuò)增區(qū)→檢測(cè)區(qū)。
7.1取樣
送檢樣品總量應(yīng)不低于10g,每批分為3等份,1/3供實(shí)驗(yàn)室分析用,另1/3供復(fù)核用,其
余1/3留樣保存。收樣時(shí)應(yīng)檢查包裝的完整性,并在樣品袋上貼上標(biāo)簽,填寫采集數(shù)據(jù)表。
對(duì)商品包裝和送樣說明進(jìn)行拍照記錄,照片隨樣品一起備檔。送檢樣品抽樣方法參照《中華
人民共和國(guó)藥典》四部通則0211進(jìn)行取樣。
7.2DNA提取
送檢樣品DNA提取步驟如下:
a)取樣品1g,粉碎成粉末。
b)取上述粉末0.02g,置2mL離心管中,加入細(xì)胞核裂解液300μL、乙二胺四乙酸
二鈉溶液50μL、蛋白酶K溶液20μL、RNA酶A溶液5μL,充分渦旋震蕩混勻3min,
56℃下水浴60min。
c)離心(12000×g)5min后,吸取上清液250μL至一新的2mL離心管中,加入裂
解緩沖液250μL,混勻,轉(zhuǎn)移至純化柱,將純化柱放入離心機(jī),離心(12000×g)5min;
棄去濾過液。
d)往純化柱中加入洗脫液700μL,離心(12000×g)1min。
e)重復(fù)步驟d)2次。
f)棄去濾過液,再離心(12000×g)2min,取出純化柱,室溫放置2min,晾干吸附
材料中的剩余洗脫液。
g)將純化柱換入一個(gè)新的2mL離心管,向吸附膜的中央懸空滴加無菌雙蒸水100μL,
靜置3min,離心(12000×g)2min,取濾過液的上清液,作為供試品溶液,可置-20℃
下保存?zhèn)溆谩?/p>
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除上述方法外,也可用等效的DNA提取方法提取試樣DNA。
7.3PCR擴(kuò)增
首次使用本方法時(shí),應(yīng)校對(duì)PCR儀溫控準(zhǔn)確性,并使用陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照以核對(duì)使
用的TaqDNA聚合酶或PCR預(yù)混液的適用性。
7.3.1對(duì)照試驗(yàn)
送檢樣品應(yīng)平行檢測(cè)2次,并設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照(使用當(dāng)歸對(duì)照藥材,按7.2提取DNA,
所獲的液體作為PCR擴(kuò)增的陽(yáng)性對(duì)照)、陰性對(duì)照(可選擇白芷對(duì)照藥材,按7.2提取DNA,
所獲的液體作為PCR擴(kuò)增的陰性對(duì)照)和空白對(duì)照。
7.3.2PCR反應(yīng)體系
在200μL離心管中依次加入2×M5SuperFastTaqPCRMasterMixPCR預(yù)混液12.5μL、
引物溶液(含正向和反向引物)各0.4μL、模板DNA(10ng~50ng)3μL,用無菌雙蒸水
補(bǔ)足反應(yīng)體積至25μL。將反應(yīng)液振蕩混勻,瞬時(shí)離心。
7.3.3PCR反應(yīng)參數(shù)
將離心管置于PCR儀中,PCR反應(yīng)參數(shù)為:95°C預(yù)變性5min,循環(huán)反應(yīng)40次(95°C
30s,60°C30s,72°C30s),72°C延伸5min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,取出離心管,對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物
按7.5進(jìn)行檢測(cè)。
或置4°C下保存。
7.4限制性內(nèi)切酶酶切
在200μL離心管中依次加入PCR反應(yīng)產(chǎn)物溶液25μL、10×限制性內(nèi)切酶緩沖液3μL,
SmlI限制性內(nèi)切酶0.5μL,用無菌雙蒸水補(bǔ)足反應(yīng)體積至30μL。將反應(yīng)液振蕩混勻,瞬時(shí)
離心。將離心管置PCR儀,55°C保溫60min,取出離心,對(duì)反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行檢測(cè)或置4°C
下保存。
7.5擴(kuò)增/酶切產(chǎn)物檢測(cè)
配制2%瓊脂糖凝膠,膠中加入適量核酸染料GelRed。取送檢樣品、陽(yáng)性對(duì)照、陰性
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對(duì)照及空白對(duì)照的酶切反應(yīng)各1μL產(chǎn)物,分別加入6×上樣緩沖液各5μL,混勻,分別上
樣于同一瓊脂糖凝膠上,DL1000DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)溶液上樣量為2μL(0.5μg/μL)。按《中
華人民共和國(guó)藥典》四部通則1001“瓊脂糖凝膠電泳法(核酸檢測(cè)用)”試驗(yàn)。電泳結(jié)束后,
取凝膠片在凝膠成像儀上或紫外透射儀上檢視。
8.結(jié)果判定
在陰性對(duì)照、陽(yáng)性對(duì)照和空白對(duì)照結(jié)果符合規(guī)定的情況下,供試品凝膠電泳圖譜中,在
與對(duì)照藥材凝膠電泳圖譜相應(yīng)的位置上,在100~200bp間有單一DNA條帶者為陽(yáng)性,否則為
陰性結(jié)果。
9.結(jié)果報(bào)告
9.1一般要求
檢測(cè)結(jié)果應(yīng)表示為陽(yáng)性或陰性,陽(yáng)性和陰性分別用“+”和“-”符號(hào)表示。
9.2檢測(cè)報(bào)告
樣品經(jīng)檢測(cè)后,實(shí)驗(yàn)室應(yīng)根據(jù)實(shí)驗(yàn)的具體操作程序和結(jié)果做好詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)記錄,出具檢
測(cè)報(bào)告。檢測(cè)報(bào)告包含的基本內(nèi)容應(yīng)參照T/CACM010-2016《中藥分子鑒定通則》的要求。
10.質(zhì)量保證
兩份平行樣檢測(cè)結(jié)果應(yīng)一致。當(dāng)一份送檢樣品的結(jié)果為陽(yáng)性,另一份為陰性時(shí),要重新
測(cè)試??梢赃m當(dāng)增加核酸擴(kuò)增反應(yīng)體系中DNA模板量,使兩份試樣得到同樣的結(jié)果。平行
樣本檢測(cè)結(jié)果不一致時(shí)應(yīng)檢測(cè)模板DNA的質(zhì)量,確保提取的DNA片段大于擴(kuò)增片段。如果
經(jīng)過兩次以上從核酸提取開始的重復(fù)檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果不一致,可在測(cè)試報(bào)告中表述該實(shí)驗(yàn)室
樣品的測(cè)試結(jié)果為陰性,并注明定量檢測(cè)和定性檢測(cè)方法的檢測(cè)低限。進(jìn)行PCR反應(yīng)前,應(yīng)
確認(rèn)所使用的聚合酶符合本標(biāo)準(zhǔn)的要求。
11.廢棄物處理
檢測(cè)過程中的廢棄物處理應(yīng)符合GB/T27403《實(shí)驗(yàn)室質(zhì)量控制規(guī)范食品分子生物學(xué)檢測(cè)》
的要求。
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附錄A
(規(guī)范性)
為執(zhí)行本包括本標(biāo)準(zhǔn),以下儀器、試劑必不可少:
A.1儀器設(shè)備
離心機(jī)(離心機(jī)最高重力離心力應(yīng)≥12000×g)、金屬?。☉?yīng)可放置2mL離心管,也可使
用水浴鍋替代)、制冰機(jī)、渦旋振蕩器、高壓滅菌鍋、PCR儀(使用前應(yīng)進(jìn)行溫度校準(zhǔn)、電
泳儀及其附件(應(yīng)包括水平電泳槽、制膠器、鯊魚齒梳等)、凝膠成像儀(或紫外透射儀等
凝膠觀察設(shè)備)、核酸蛋白儀、電子天平(感量0.01g)、連續(xù)可調(diào)微量移液槍(至少應(yīng)該包
括2.5μL、10μL、200μL、1000μL等4種不同規(guī)格,并包括配套一次性吸頭)、低溫冰箱
(溫度可維持在4°C及-20°C)
A.2試劑與試藥
除另有規(guī)定外,實(shí)驗(yàn)試劑為不含DNA和DNase的分析純或生化試劑;實(shí)驗(yàn)用水符合GB/T
6682的要求;所配制的試劑均應(yīng)滅菌后保存,并在容器上注明試劑名稱、濃度、
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