家蠶RNA剪接分析與真核生物內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制研究的開(kāi)題報(bào)告

家蠶RNA剪接分析與真核生物內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制研究的開(kāi)題報(bào)告摘要：RNA剪接是真核生物mRNA后期加工的重要過(guò)程，它決定了基因表達(dá)的多樣性。本研究以家蠶為研究對(duì)象，通過(guò)對(duì)家蠶基因組數(shù)據(jù)的分析，探究家蠶RNA剪接的模式和內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制。通過(guò)RNA-seq實(shí)驗(yàn)和生物信息學(xué)分析，評(píng)估家蠶RNA剪接異構(gòu)體的多樣性和組織特異性，以及探究家蠶RNA剪接谷田?；D(zhuǎn)移酶的功能和調(diào)控機(jī)制。同時(shí)，本研究將進(jìn)一步探究RNA剪接的機(jī)制，以及驗(yàn)證家蠶內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制是否與真核生物相同。該研究將為家蠶基因組學(xué)和RNA剪接研究提供重要信息，也將對(duì)真核生物RNA剪接的機(jī)制和內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制做出貢獻(xiàn)。關(guān)鍵詞：RNA剪接、家蠶、內(nèi)含子、谷田?；D(zhuǎn)移酶、機(jī)制、生物信息學(xué)分析1.研究背景RNA剪接是真核生物mRNA后期加工的重要過(guò)程，它決定了基因表達(dá)的多樣性。該過(guò)程可以使一個(gè)基因產(chǎn)生多個(gè)不同的mRNA，其中含有不同的外顯子組合形成不同的蛋白質(zhì)。在RNA剪接過(guò)程中，內(nèi)含子是被剪接去除的序列，因此研究?jī)?nèi)含子識(shí)別機(jī)制對(duì)于理解RNA剪接機(jī)制和基因表達(dá)的多樣性具有重要的意義。家蠶是中國(guó)重要的經(jīng)濟(jì)昆蟲(chóng)，其基因組已經(jīng)被我們的實(shí)驗(yàn)室測(cè)序完成。家蠶作為絲綢蛋白素質(zhì)量和數(shù)量高產(chǎn)種，其基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制及進(jìn)一步的RNA剪接研究十分重要。2.研究目的本研究的主要目的是探究家蠶RNA剪接的模式和內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制。具體來(lái)說(shuō)，我們將通過(guò)以下步驟實(shí)現(xiàn)目的：1）通過(guò)RNA-seq實(shí)驗(yàn)測(cè)序和生物信息學(xué)分析，評(píng)估家蠶RNA剪接的多樣性和組織特異性。2）分析家蠶RNA剪接谷田酰基轉(zhuǎn)移酶的功能和調(diào)控機(jī)制，并探究其對(duì)家蠶RNA剪接的調(diào)節(jié)作用。3）驗(yàn)證家蠶內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制是否與真核生物相同，進(jìn)一步探究RNA剪接的機(jī)制。3.研究方法本研究將采用以下研究方法：1）RNA-seq實(shí)驗(yàn)和生物信息學(xué)分析，評(píng)估家蠶RNA剪接異構(gòu)體的多樣性和組織特異性。2）系統(tǒng)生物學(xué)分析家蠶RNA剪接中的谷田酰基轉(zhuǎn)移酶功能和調(diào)控機(jī)制，包括基因組結(jié)構(gòu)、編碼和調(diào)節(jié)。3）基于實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和模擬，驗(yàn)證家蠶內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制是否與真核生物相同，探究RNA剪接的機(jī)制。4.研究意義RNA剪接是真核生物mRNA后期加工的重要過(guò)程。本研究以家蠶為研究對(duì)象，將研究家蠶RNA剪接的模式和內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制，評(píng)估家蠶RNA剪接異構(gòu)體的多樣性和組織特異性。通過(guò)探究家蠶RNA剪接谷田?；D(zhuǎn)移酶的功能和調(diào)控機(jī)制，有利于解決絲綢蛋白素生產(chǎn)過(guò)程中的絲區(qū)化問(wèn)題。同事，本研究將為探究RNA剪接機(jī)制和基因表達(dá)的多樣性提供重要信息，有助于對(duì)RNA剪接機(jī)制和內(nèi)含子識(shí)別機(jī)制做出深入的探討。參考文獻(xiàn)：[1]ZhangC.,MaiK.,MaH.,etal.Transcriptomeanalysisanddiscoveryofgenesinvolvedinimmunepathwaysinlargeyellowcroaker(Larimichthyscrocea)inresponsetobacterialpathogens.Fish&ShellfishImmunology,2020,100(2):503-515.[2]GuoH,ZhangH,WangS,etal.ARNA-seqanalysisandfunctionalannotationofgenesinresponsetoheatstressinwhitelegshrimp,Litopenaeusvannamei,atdifferenttimeperiods.Aquaculture,2021,533:7360