臨床微生物學(xué)與檢驗

關(guān)于臨床微生物學(xué)與檢驗概述細(xì)菌分類學(xué)（Bacterialtaxonomy）是微生物分類學(xué)的一個分支，是對細(xì)菌進(jìn)行分類（classification）鑒定（identification）、命名（nomenclature）的一門科學(xué)。第2頁,共16頁，2024年2月25日，星期天1.分類分類的任務(wù)是通過收集大量的個體資料，經(jīng)過科學(xué)的歸納、整理，使之形成一個完整的分類系統(tǒng)。

基本概念第3頁,共16頁，2024年2月25日，星期天分類方法：（1）人為分類法：以細(xì)菌形態(tài)和生理生化特征為依據(jù)，分為：傳統(tǒng)分類法（classicalclassification）數(shù)值分類法(numericalclassification)（2）系統(tǒng)分類法：將化學(xué)分析和核酸分析方法引入細(xì)菌分類，使細(xì)菌種群的劃分更為客觀。以細(xì)菌大分子物質(zhì)（核酸、蛋白質(zhì)）結(jié)構(gòu)的同源程度進(jìn)行分類，稱為種系分類（phylogeneticclassification）或自然分類（naturalclassfication）。第4頁,共16頁，2024年2月25日，星期天3、鑒定將未知細(xì)菌按分類原則放入系統(tǒng)中某一適當(dāng)位置和已知細(xì)菌比較其相似性，用對比分析方法確定細(xì)菌的分類地位。若與已知細(xì)菌相同即采用已知菌的名稱，不同者則按命名原則確定一個新名稱。2、命名：在分類基礎(chǔ)上，給予每種細(xì)菌一個科學(xué)名稱，使之在生產(chǎn)實踐、臨床實踐和科學(xué)研究工作中相互交流成為可能。按照細(xì)菌命名的法規(guī)，能保證所有的科研工作者以同樣方式給予細(xì)菌命名。第5頁,共16頁，2024年2月25日，星期天分類等級：界（Kingdom）門（Division）綱（class）目（Order）科（Family）屬（Genus）種（Species）第6頁,共16頁，2024年2月25日，星期天命名法

細(xì)菌科學(xué)名稱（學(xué)名）的命名法采用生物雙名法（binominalnomenclature）。具備拉丁化文字的形式和明確的分類等級兩個特點，即由一個屬名和一個種名構(gòu)成。

細(xì)菌學(xué)名的中文譯名：種名在前，屬名在后。如：Mycobecteriumtuberculosis（結(jié)核分枝桿菌）Salmonellatyphi（沙寒沙門菌）。第7頁,共16頁，2024年2月25日，星期天細(xì)菌的分類法一、生物學(xué)特性分類法——人為分類法（一）傳統(tǒng)分類法（二）數(shù)值分類法第8頁,共16頁，2024年2月25日，星期天二、遺傳學(xué)分類法——系統(tǒng)分類法（一）DNA堿基比例的測定（G+Cmol%）

（二）核酸分子雜交法（hybridizationofacids）

（三）rRNA寡核苷酸分析（oligonucleotidecatalog）第9頁,共16頁，2024年2月25日，星期天細(xì)菌分類命名系統(tǒng)一、細(xì)菌分類系統(tǒng)概況二、伯杰（Bergey）細(xì)菌分類系統(tǒng)及命名第10頁,共16頁，2024年2月25日，星期天卷次及主要細(xì)菌種類群細(xì)菌屬/類群第1卷1~11組包括醫(yī)學(xué)、工業(yè)、農(nóng)業(yè)重要的革蘭陰性細(xì)菌1234567891011螺旋體革蘭陰性、需氧、微需氧、有動力、螺形菌革蘭陰性、無動力、彎曲菌革蘭陰性、需氧、桿菌或球菌革蘭陰性、兼性厭氧、桿菌革蘭陰性、厭氧、桿菌或螺形菌異化還原硫酸鹽的細(xì)菌革蘭陰性、厭氧球菌立克次體和衣原體支原體內(nèi)共生菌第11頁,共16頁，2024年2月25日，星期天第2卷12~17組包括除放線菌以外的革蘭陽性細(xì)菌121314151617革蘭陽性球菌革蘭陽性、形成芽胞的球菌和桿菌革蘭陽性、規(guī)則的無芽胞桿菌革蘭陽性、不規(guī)則的無芽胞桿菌分枝桿菌諾卡菌形的細(xì)菌第12頁,共16頁，2024年2月25日，星期天第3卷18~25組包括光合細(xì)菌、古細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌、其他革蘭陰性細(xì)菌1819202122232425不產(chǎn)氧光合細(xì)菌產(chǎn)氧光合細(xì)菌需氧、化能自氧菌及有關(guān)細(xì)菌出芽和（或）有附屬物的細(xì)菌鞘細(xì)菌非光合、無子實體的滑行細(xì)菌形成子實體的滑行細(xì)菌——粘細(xì)菌古生菌第13頁,共16頁，2024年2月25日，星期天第4卷26~33組包括可形成菌絲體的放線菌2627282930313233諾卡菌形放線菌多腔孢囊放線菌游動放線菌鏈霉菌和有關(guān)菌屬馬杜拉菌高溫單胞菌有有關(guān)菌屬高溫放線菌其他屬第14頁,共16頁，2024年2月25日，星期天

細(xì)菌的分類方法主要有兩類：人為分類法和系統(tǒng)分類法。系統(tǒng)分類法以細(xì)菌的核酸、蛋白質(zhì)等組成的同源程度進(jìn)行分類，更具科學(xué)性和穩(wěn)定性。其中16SrRNA寡核苷酸分析，由于其核苷酸數(shù)目適中、信息量大、具有高度穩(wěn)定性、易于提取和分析，成為理想的研究工具。