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文檔簡介
ICS11.020
C62DB32
江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB32/T3762.14—2021
新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范
第14部分:N亞基因組熒光PCR檢測程序
TechnicalspecificationsforSARS-CoV-2detection
Part14:Real-timefluorescencePCRtestNsubgenomicRNAprocedure
2021-12-09發(fā)布2022-01-09實施
江蘇省市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB32/T3762.14—2021
前??言
DB32/T3762《新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范》目前分為以下部分:
——第1部分:生物樣本采集、運輸和保存;
——第2部分:病毒分離與鑒定;
——第3部分:核酸熒光PCR檢測程序;
——第4部分:重組酶介導(dǎo)等溫擴(kuò)增程序;
——第5部分:血清IgM和IgG抗體酶聯(lián)免疫吸附檢測程序;
——第6部分:血清IgM和IgG抗體膠體金免疫層析檢測程序;
——第7部分:空氣樣本檢測與評估;
——第8部分:物體表面檢測與評估;
——第9部分:醫(yī)務(wù)人員職業(yè)暴露檢測與評估。
——第10部分:微量血清中和試驗;
——第11部分:全基因組高通量測序;
——第12部分:藥物體外抗病毒效果測定;
——第13部分:疊氮溴化丙錠-熒光PCR檢測程序;
——第14部分:N亞基因組熒光PCR檢測程序;
——第15部分:血清/血漿IgM和IgG抗體磁微粒化學(xué)發(fā)光法檢測程序;
——第16部分:核酸數(shù)字PCR法;
——第17部分:核酸檢測用假病毒陽性質(zhì)控品;
——第18部分:規(guī)模化核酸檢測程序。
本文件為DB32/T3762的第14部分。
本文件按照GB/T1.1-2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定起
草。
本文件由江蘇省衛(wèi)生健康委員會提出。
本文件由江蘇省衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會歸口。
本文件起草單位:江蘇省疾病預(yù)防控制中心、無錫市疾病預(yù)防控制中心、鎮(zhèn)江市疾病預(yù)防控制中心、
常州市疾病預(yù)防控制中心。
本文件主要起草人:朱小娟、崔侖標(biāo)、朱寶立、葛以躍、吳濤、吳斌、趙康辰、喬喬、陳銀、肖勇、
徐虹、王鳳鳴。
II
DB32/T3762.14—2021
新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第14部分:N亞基因組熒光PCR檢測程序
1范圍
本文件規(guī)定了新型冠狀病毒N亞基因組熒光PCR檢測環(huán)境與設(shè)施、設(shè)備與耗材、試劑與材料、樣
本前處理與核酸提取、擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增、結(jié)果判定。
本文件適用于新型冠狀病毒N亞基因組熒光PCR檢測,為判斷樣本中的新型冠狀病毒是否具有感
染性提供輔助手段。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改版)適用于本
文件。
DB32/T3762.3新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第3部分:核酸熒光PCR檢測程序
3術(shù)語和定義
3.1
亞基因組RNAsubgenomicRNA,SgRNA
在結(jié)構(gòu)上由病毒5’UTR區(qū)Leader序列及各基因轉(zhuǎn)錄RNA片段構(gòu)成,亞基因組的出現(xiàn)可反應(yīng)病毒復(fù)制
狀態(tài),從而代表病毒的感染性。
4環(huán)境與設(shè)施
同DB32/T3762.3的4.1條和4.2條。
5設(shè)備與耗材
同DB32/T3762.3的5.1條和5.2條。
6試劑與材料
6.1試劑
6.1.1病毒核酸提取試劑盒。
6.1.2實時熒光PCR檢測試劑。
6.2引物與探針
1
DB32/T3762.14—2021
新型冠狀病毒N亞基因組的熒光定量PCR引物、探針組合物(序列見附錄A),其中探針的5’端
標(biāo)記的是FAM熒光報告基團(tuán),3’端標(biāo)記的是BHQ1熒光淬滅基團(tuán)。陰性對照為DEPC水、陽性對照為含N
亞基因組片段的質(zhì)粒(序列見附錄A)。
6.3材料
同DB32/T3762.3的6.2條。
7樣本前處理與核酸提取
同DB32/T3762.3-2020的7.1條和7.2條。
8擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增
8.1采用實時熒光PCR檢測試劑,根據(jù)試劑說明書配制熒光PCR擴(kuò)增體系,N亞基因組反應(yīng)體系中
上/下游引物(20μmol/L)0.4μL/0.4μL,探針(10μmol/L)0.4μL每個反應(yīng)體系中加入模板RNA4μL
(或陽性、陰性對照)、無RNAase滅菌水加至20μL。
8.2按以下參數(shù)進(jìn)行熒光PCR擴(kuò)增(具體擴(kuò)增條件可根據(jù)實時熒光PCR檢測試劑進(jìn)行調(diào)整),42℃
5min,95℃10sec,45個循環(huán)的95℃5sec,55℃34sec,在每個55℃反應(yīng)結(jié)束時收集熒光信號。
9結(jié)果判定
9.1閾值設(shè)定
閾值設(shè)定原則以閾值線剛好超過陰性對照擴(kuò)增曲線的最高點,結(jié)果顯示陰性為準(zhǔn)。
9.2質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
9.2.1一般要求
檢測結(jié)果中的陰、陽性對照均符合以下情況,如對照不成立,此次試驗視為無效。
9.2.2陰性對照
陰性對照無擴(kuò)增曲線,或Ct值大于40。
9.2.3陽性對照
陽性對照出現(xiàn)典型的擴(kuò)增曲線呈S型,且Ct值小于或等于35。
9.3結(jié)果判斷
9.3.1陽性判定:檢測樣本N亞基因組的Ct值小于或等于40,并有明顯擴(kuò)增曲線,則判定為亞基因
陽性。
9.3.2陰性判定:在對照成立下,如果檢測樣本N亞基因組沒有出現(xiàn)擴(kuò)增曲線,或Ct值大于40,則
判定為亞基因陰性。
9.3.3不確定結(jié)果:在對照成立下,如果檢測樣本N亞基因組擴(kuò)增曲線不典型,結(jié)果不確定,建議重
復(fù)檢測。
2
DB32/T3762.14—2021
AA
附錄A
(規(guī)范性附錄)
新型冠狀病毒N亞基因組實時熒光PCR引物與探針序列及陽性對照片段序列
A.1表A.1中給出了新型冠狀病毒N亞基因組實時熒光PCR檢測的引物與探針及陽性對照片段序列。
表A.1新型冠狀病毒N亞基因組實時熒光PCR引物與探針序列及陽性對照片段序列
引物名稱引物序列(5'to3')長度(bp)
nCov-SgRNAN-FACCAACTTTCGATCTCTTGTAGA23
nCov-SgRNAN-RTGAGGGTCCACCAAACGTA19
nCov-SgRNAN-ProbeCAGCGAAATGCACCCCGCA19
ACCTTCCCAGGTAACAAACCAACCAACTTT
陽性對照新型冠狀病毒N亞CGATCTCTTGTAGATCTGTTCTATGTCTGATA
115
基因片段ATGGACCCCAAAATCAGCGAAATGCACCCC
GCATTACGTTTGGTGGACCCTCA
_________________________________
3
DB32/T3762.14—2021
目??次
前??言..............................................................................................................................................................II
1范圍.................................................................................................................................................................1
2規(guī)范性引用文件.............................................................................................................................................1
3術(shù)語和定義.....................................................................................................................................................1
4環(huán)境與設(shè)施.....................................................................................................................................................1
5設(shè)備與耗材.....................................................................................................................................................1
6試劑與材料.....................................................................................................................................................1
7樣本前處理與核酸提取.................................................................................................................................2
8擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增.....................................................................................................................................2
9結(jié)果判定.........................................................................................................................................................2
10附錄A..............................................................................................................................................................3
I
DB32/T3762.14—2021
新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第14部分:N亞基因組熒光PCR檢測程序
1范圍
本文件規(guī)定了新型冠狀病毒N亞基因組熒光PCR檢測環(huán)境與設(shè)施、設(shè)備與耗材、試劑與材料、樣
本前處理與核酸提取、擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增、結(jié)果判定。
本文件適用于新型冠狀病毒N亞基因組熒光PCR檢測,為判斷樣本中的新型冠狀病毒是否具有感
染性提供輔助手段。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改版)適用于本
文件。
DB32/T3762.3新型冠狀病毒檢測技術(shù)規(guī)范第3部分:核酸熒光PCR檢測程序
3術(shù)語和定義
3.1
亞基因組RNAsubgenomicRNA,SgRNA
在結(jié)構(gòu)上由病毒5’UTR區(qū)Leader序列及各基因轉(zhuǎn)錄RNA片段構(gòu)成,亞基因組的出現(xiàn)可反應(yīng)病毒復(fù)制
狀態(tài),從而代表病毒的感染性。
4環(huán)境與設(shè)施
同DB32/T3762.3的4.1條和4.2條。
5設(shè)備與耗材
同DB32/T3762.3的5.1條和5.2條。
6試劑與材料
6.1試劑
6.1.1病毒核酸提取試劑盒。
6.1.2實時熒光PCR檢測試劑。
6.2引物與探針
1
DB32/T3762.14—2021
新型冠狀病毒N亞基因組的熒光定量PCR引物、探針組合物(序列見附錄A),其中探針的5’端
標(biāo)記的是FAM熒光報告基團(tuán),3’端標(biāo)記的是BHQ1熒光淬滅基團(tuán)。陰性對照為DEPC水、陽性對照為含N
亞基因組片段的質(zhì)粒(序列見附錄A)。
6.3材料
同DB32/T3762.3的6.2條。
7樣本前處理與核酸提取
同DB32/T3762.3-2020的7.1條和7.2條。
8擴(kuò)增體系配制與擴(kuò)增
8.1采用實時熒光PCR檢測試劑,根據(jù)試劑說明書配制熒光P
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