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文檔簡介
DBXX/TXXX—XXXX
江西省醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)技術(shù)規(guī)范第四部分:數(shù)據(jù)存儲(chǔ)規(guī)范
1范圍
本規(guī)范規(guī)定了醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)中數(shù)據(jù)存儲(chǔ)的術(shù)語、定義進(jìn)行約束,包含了醫(yī)療大數(shù)據(jù)主題層模型存
儲(chǔ)規(guī)范、開放表存儲(chǔ)、對(duì)象存儲(chǔ)、過程數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)存儲(chǔ)等技術(shù)要求。
本規(guī)范適用于醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)的設(shè)計(jì)、開發(fā)、選型和實(shí)施,可作為醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)建設(shè)時(shí)的評(píng)測依
據(jù)。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,
僅該日期對(duì)應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本
文件。
GB/T18391.1—2009信息技術(shù)元數(shù)據(jù)注冊(cè)系統(tǒng)(MDR)第1部分:框架
GB/T34960.5—2018信息技術(shù)服務(wù)治理第5部分:數(shù)據(jù)治理規(guī)范
GB/T35294-2017信息技術(shù)科學(xué)數(shù)據(jù)引用
GB/T35295-2017信息技術(shù)大數(shù)據(jù)術(shù)語
WS445.1-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第1部分:病歷概要
WS445.2-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第2部分:門(急)診病歷
WS445.3-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第3部分:門(急)診處方
WS445.4-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第4部分:檢查檢驗(yàn)記錄
WS445.5-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第5部分:一般治療處置記錄
WS445.6-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第6部分:助產(chǎn)記錄
WS445.7-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第7部分:護(hù)理操作記錄
WS445.8-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第8部分:護(hù)理評(píng)估與計(jì)劃
WS445.9-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第9部分:知情告知信息
WS445.10-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第10部分:住院病案首頁
WS445.11-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第11部分:中醫(yī)住院病案首頁
WS445.12-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第12部分:入院記錄
WS445.13-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第13部分:住院病程記錄
WS445.14-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第14部分:住院醫(yī)囑
WS445.15-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第15部分:出院小結(jié)
WS445.16-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第16部分:轉(zhuǎn)診(院)記錄
WS445.17-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第17部分:醫(yī)療機(jī)構(gòu)信息
WS446-2014居民健康檔案醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)項(xiàng)目常用代碼
WS/T447-2014基于電子病歷的醫(yī)院信息平臺(tái)技術(shù)規(guī)范
WS/T448-2014基于居民健康檔案的區(qū)域衛(wèi)生信息平臺(tái)技術(shù)規(guī)范
WS/T303-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)元標(biāo)準(zhǔn)化規(guī)則
WS/T304-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)模式描述指南
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WS/T305-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù)規(guī)范
WS/T306-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)集分類與編碼規(guī)則
3術(shù)語和定義
GB/T18391.1—2009、GB/T34960.5—2018、GB/T35294-2017、GB/T35295-2017、WS445、WS446、
WS447、WS448界定的以及下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
主題層存儲(chǔ)
為實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)解耦而設(shè)計(jì)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)方式,根據(jù)數(shù)據(jù)之間的依賴性和業(yè)務(wù)關(guān)聯(lián),進(jìn)行數(shù)據(jù)主題域劃分,
降低使用時(shí)數(shù)據(jù)跨表查詢復(fù)雜度。
3.2
結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)存儲(chǔ)
面向海量分析型數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)方式,支持標(biāo)準(zhǔn)SQL接口,采用基于分布式計(jì)算的數(shù)據(jù)倉庫技術(shù),可以
實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的分布式存儲(chǔ)和處理,以及大數(shù)據(jù)挖掘分析。
3.3
實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)
面向?qū)崟r(shí)性、海量的流式數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)方式,采用分布式流式處理技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)實(shí)時(shí)流式數(shù)據(jù)存儲(chǔ)
和處理。
3.4
對(duì)象數(shù)據(jù)存儲(chǔ)
面向醫(yī)療影像數(shù)據(jù)、文本文件、json對(duì)象、XML文件等對(duì)象數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)方式,采用分布式的、面向
列的、多維的NoSQL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),可以實(shí)現(xiàn)對(duì)像數(shù)據(jù)的快速檢索和存儲(chǔ)。
4縮略語
下列縮略語適用于本文件:
——TTL:TimeToLive(生存時(shí)間價(jià)值);
——MPP:MassivelyParallelProcessing(大規(guī)模并行處理技術(shù));
——SDK:SoftwareDevelopmentKit(軟件開發(fā)工具包);
——API:ApplicationProgrammingInterface(應(yīng)用程序接口);
——ETL:Extract-Transform-Load(抽取、轉(zhuǎn)換、加載);
——HDFS:HadoopDistributedFileSystem(分布式文件系統(tǒng));
——Redis:RemoteDictionaryServer(遠(yuǎn)程字典服務(wù));
——SQL:StructuredQueryLanguage(結(jié)構(gòu)化查詢語言)。
5數(shù)據(jù)存儲(chǔ)規(guī)范
2
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5.1數(shù)據(jù)存儲(chǔ)架構(gòu)
由于醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)需要存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)量大、類別多且復(fù)雜,在存儲(chǔ)時(shí)應(yīng)采用分層分域的存儲(chǔ)架構(gòu),
降低數(shù)據(jù)之間的耦合性,應(yīng)建立包含主題層、匯總層、應(yīng)用層的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)架構(gòu)。
主題層是在接口層采集的原始數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上進(jìn)行主題劃分,形成關(guān)聯(lián)性強(qiáng)的主題域表,應(yīng)包括但不限
于:
——病人信息;
——就診信息;
——醫(yī)囑信息;
——費(fèi)用;
——診斷;
——過敏;
——檢查;
——檢驗(yàn);
——手術(shù);
——護(hù)理;
——病案;
——病歷文書;
——腫瘤;
——報(bào)告卡;
——體檢;
——其他。
匯總層是在主題層基礎(chǔ)上,根據(jù)不同數(shù)據(jù)使用需求,對(duì)不同粒度的數(shù)據(jù)進(jìn)行一定匯總處理,提高數(shù)
據(jù)使用效率,便于后續(xù)使用。其設(shè)計(jì)應(yīng)滿足如下原則:
——應(yīng)保障匯總數(shù)據(jù)的共用性;
——應(yīng)能夠提高數(shù)據(jù)使用效率;
——應(yīng)與原始事實(shí)表維度保持一致;
應(yīng)用層是在匯總層基礎(chǔ)上,通過構(gòu)建指標(biāo)集、標(biāo)簽集、應(yīng)用寬表等數(shù)據(jù)存儲(chǔ)形式,以滿足各類數(shù)據(jù)
應(yīng)。其在醫(yī)療機(jī)構(gòu)主要支撐建立科研大數(shù)據(jù)應(yīng)用平臺(tái)、人工智能應(yīng)用平臺(tái)、運(yùn)營管理系統(tǒng)等基于大數(shù)據(jù)
的智慧應(yīng)用。
5.2醫(yī)療大數(shù)據(jù)主題層數(shù)據(jù)表存儲(chǔ)目錄
5.2.1數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化
5.2.1.1原則
醫(yī)療數(shù)據(jù)中心中的醫(yī)療數(shù)據(jù)應(yīng)遵循統(tǒng)一的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)并優(yōu)先采用國家、衛(wèi)生行業(yè)已經(jīng)制定的相關(guān)數(shù)據(jù)
標(biāo)準(zhǔn)作為基準(zhǔn),對(duì)非標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)進(jìn)行轉(zhuǎn)換處理。若沒有相應(yīng)的國家或衛(wèi)生行業(yè)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)可以引用,應(yīng)按照
國家衛(wèi)生信息標(biāo)準(zhǔn)制定的有關(guān)要求完成數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)制定工作。
5.2.1.2通用電子病歷數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)
對(duì)于醫(yī)療機(jī)構(gòu)的主要業(yè)務(wù)斷面和相關(guān)數(shù)據(jù),應(yīng)符合WS445-2014(所有部分)《電子病歷基本數(shù)據(jù)
集》里的有關(guān)規(guī)定。
5.2.1.3未標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)的標(biāo)準(zhǔn)化
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對(duì)于國家或者衛(wèi)生行業(yè)尚未制定標(biāo)準(zhǔn)的數(shù)據(jù),醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺(tái)數(shù)據(jù)集應(yīng)按照WS/T303-2009、WS/T
304-2009、WS/T305-2009、WS/T306-2009的要求形成標(biāo)準(zhǔn)化數(shù)據(jù)元,并按照附錄A要求構(gòu)建數(shù)據(jù)集
及標(biāo)準(zhǔn)化存儲(chǔ)。
5.3結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)要求
結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)存儲(chǔ)計(jì)算面向的是從結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)庫采集的海量數(shù)據(jù),主要應(yīng)用于海量結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)分析,
應(yīng)用時(shí)需滿足以下技術(shù)要求:
——結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)存儲(chǔ)應(yīng)基于MPP架構(gòu)實(shí)現(xiàn)分布式列式數(shù)據(jù)倉庫;
——應(yīng)提供標(biāo)準(zhǔn)的SQL接口,減少傳統(tǒng)數(shù)據(jù)應(yīng)用遷移成本,降低開發(fā)運(yùn)維人員使用門檻;
——應(yīng)提供準(zhǔn)實(shí)時(shí)的數(shù)據(jù)插入,以滿足用戶對(duì)實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)的實(shí)時(shí)交互式分析;
——應(yīng)提供壓縮存儲(chǔ),以有效節(jié)約存儲(chǔ)成本,并基于分布式文件系統(tǒng)的多副本機(jī)制實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)安全
存儲(chǔ);
——應(yīng)提供基于多種編程語言(如python、R、Java等)編寫的Map/Reduce程序或自定義函數(shù)的
上傳接口,支持定制化數(shù)據(jù)處理需求;
——應(yīng)支持多租戶管理,便于將大數(shù)據(jù)平臺(tái)計(jì)算存儲(chǔ)資源進(jìn)行合理劃分,提高資源使用效率;
——應(yīng)支持多種計(jì)算引擎(如HiveSQL、Spark算子、SparkSQL、Map/Reduce等計(jì)算引擎)。
5.4實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)要求
實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)主要應(yīng)用于接收醫(yī)療生命體征監(jiān)測儀器、物聯(lián)網(wǎng)可穿戴設(shè)備采集的海量實(shí)時(shí)數(shù)據(jù),由
于需要的數(shù)據(jù)吞吐能力、處理能力更高,傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫及處理方式難以滿足需求,實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)應(yīng)基于當(dāng)
前流行的開源大數(shù)據(jù)處理技術(shù),實(shí)現(xiàn)分布式流數(shù)據(jù)處理服務(wù),使其具有高可靠、高可用、高性能和動(dòng)態(tài)
擴(kuò)展的特性,以滿足醫(yī)療大數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)要求,應(yīng)用時(shí)需滿足以下技術(shù)要求:
——應(yīng)集成通信網(wǎng)關(guān)實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)采集,并通過數(shù)據(jù)采集網(wǎng)關(guān)對(duì)接多種醫(yī)療/可穿戴監(jiān)測設(shè)備,實(shí)現(xiàn)設(shè)
備海量數(shù)據(jù)的自動(dòng)存取;
——應(yīng)提供實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)和歷史數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)服務(wù),兩者均應(yīng)采用分布式架構(gòu),以滿足海量數(shù)據(jù)的存儲(chǔ);
——應(yīng)通過分布式消息隊(duì)列和分布式流式計(jì)算框架,以確保數(shù)據(jù)得到快速處理。
5.5對(duì)象數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)要求
對(duì)象數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)底層是基于分布式的、面向列的、多維的NoSQL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),它具備高容錯(cuò)性和
高可擴(kuò)展性。傳統(tǒng)的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫,如Oracle和MySQL等,如果數(shù)據(jù)記錄在億級(jí)別,則查詢和寫入的性
能都會(huì)呈指數(shù)級(jí)下降,所以更大的數(shù)據(jù)量級(jí)并不適用于傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫,而對(duì)象數(shù)據(jù)存儲(chǔ)技術(shù)對(duì)于存儲(chǔ)百億、
千億甚至更多的數(shù)據(jù)都不存在任何問題。應(yīng)用時(shí)需滿足以下技術(shù)要求:
——對(duì)象數(shù)據(jù)存儲(chǔ)應(yīng)提供海量、安全和高可靠的云端對(duì)象存儲(chǔ)服務(wù),以解決海量圖片文件的存儲(chǔ)
與檢索問題;
——應(yīng)支持多租戶模式,為每個(gè)租戶提供獨(dú)立的底層表存儲(chǔ),租戶之間應(yīng)相互隔離;
——應(yīng)提供基本的分類管理功能,每個(gè)租戶應(yīng)可創(chuàng)建若干個(gè)不同的Bucket,不同的Bucket存儲(chǔ)不
同類型或用途的對(duì)象文件;
——每個(gè)Bucket中存儲(chǔ)的Object數(shù)據(jù)對(duì)象,應(yīng)以O(shè)bject和Bucket的名稱作為單行記錄主鍵,
并以此作為檢索條件;
——每個(gè)Bucket中應(yīng)支持存儲(chǔ)百億級(jí)的Object;
——存儲(chǔ)Object在縱向維度上支持的數(shù)據(jù)量級(jí)應(yīng)能彈性擴(kuò)展;
——用戶應(yīng)可通過調(diào)用API,在任何應(yīng)用、任何時(shí)間及任何地點(diǎn)上傳和下載圖片數(shù)據(jù),也可通過
Web控制臺(tái)管理界面對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行管理;
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——存儲(chǔ)在對(duì)象存儲(chǔ)中的圖片文件,應(yīng)可直接通過圖片鏈接方式進(jìn)行分享;
——用戶應(yīng)可直接將圖片鏈接嵌入至HTML頁面,并作為頁面的組成部分進(jìn)行發(fā)布。
5.6數(shù)據(jù)存儲(chǔ)安全技術(shù)要求
為保障大數(shù)據(jù)平臺(tái)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)安全,應(yīng)按照數(shù)據(jù)分級(jí)分類原則制定不同等級(jí)的安全策略,實(shí)施時(shí)需滿
足以下技術(shù)要求:
——數(shù)據(jù)存儲(chǔ)應(yīng)支持多副本備份,保障數(shù)據(jù)存儲(chǔ)安全;
——涉及數(shù)據(jù)分級(jí)分類的,宜按照GB∕T39725-2020信息安全技術(shù)健康醫(yī)療數(shù)據(jù)安全指南執(zhí)行;
——涉及網(wǎng)絡(luò)和系統(tǒng)安全的,宜按照GB/T22081-2016、GB/T22239-2019執(zhí)行;
——涉及基礎(chǔ)安全和數(shù)據(jù)服務(wù)安全的,宜按照GB/T35274-2017執(zhí)行;
——涉及云計(jì)算安全的,宜按照GB/T31168執(zhí)行;
——應(yīng)建立數(shù)據(jù)存儲(chǔ)安全應(yīng)急處置方案,以應(yīng)對(duì)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)突發(fā)情況,快速恢復(fù)備份數(shù)據(jù);
——數(shù)據(jù)存儲(chǔ)應(yīng)按照最小權(quán)限原則管理,對(duì)各數(shù)據(jù)使用用戶進(jìn)行權(quán)限管理,降低數(shù)據(jù)泄露風(fēng)險(xiǎn)。
5.7數(shù)據(jù)存儲(chǔ)管理要求
5.7.1數(shù)據(jù)存儲(chǔ)管理包括數(shù)據(jù)的分類和標(biāo)準(zhǔn)的命名方法,數(shù)據(jù)的存儲(chǔ)、數(shù)據(jù)的保密規(guī)范和數(shù)據(jù)的備份
要求等。
5.7.2管理要求應(yīng)包括以下內(nèi)容:
——應(yīng)指定專人負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)的管理,明確職責(zé);安排專人負(fù)責(zé)涉密數(shù)據(jù)資源的傳輸、存儲(chǔ)、共享和
使用;
——應(yīng)對(duì)存儲(chǔ)數(shù)據(jù)的設(shè)備及基礎(chǔ)設(shè)施重點(diǎn)做好安全防護(hù),包括落實(shí)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)設(shè)備的操作終端安全
管控措施及接入鑒權(quán)機(jī)制;
——應(yīng)設(shè)置訪問控制策略,定期實(shí)施安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,配置安全基線、部署必要的安全存儲(chǔ)技術(shù)手
段等;
——應(yīng)對(duì)不同安全等級(jí)的數(shù)據(jù)采用差異化安全存儲(chǔ);
——應(yīng)根據(jù)數(shù)據(jù)備份制度和策略,按照操作規(guī)程進(jìn)行系統(tǒng)和數(shù)據(jù)日常備份,在出現(xiàn)異常時(shí)根據(jù)備
份策略進(jìn)行恢復(fù)操作;
——應(yīng)根據(jù)維護(hù)計(jì)劃定期進(jìn)行數(shù)據(jù)資源目錄、數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)維護(hù);
——應(yīng)加強(qiáng)數(shù)據(jù)備份介質(zhì)的管理,對(duì)各類介質(zhì)進(jìn)行控制和保護(hù);
——應(yīng)根據(jù)所承載的數(shù)據(jù)和軟件的重要程度對(duì)介質(zhì)實(shí)行分類和標(biāo)識(shí),并實(shí)行存儲(chǔ)環(huán)境專人管理。
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A
A
附錄A
(規(guī)范性)
醫(yī)療大數(shù)據(jù)主題層數(shù)據(jù)表存儲(chǔ)目錄
表A.1HDR(HospitalDataRepository)表集合
業(yè)務(wù)域表名描述
organization機(jī)構(gòu)信息
company公司信息
standard_system標(biāo)準(zhǔn)系統(tǒng)信息
system系統(tǒng)信息
patient_id_type病人標(biāo)識(shí)類型表
standard_class基準(zhǔn)分類表
code_domain代碼域
code_system代碼系統(tǒng)表
code_set通用代碼集合
code_map通用代碼對(duì)照表
department科室信息
dept_category科室分類表
mdm(主數(shù)據(jù))employee員工信息
medical_group醫(yī)療組信息
medical_group_empl醫(yī)療組人員
drug藥品字典
item項(xiàng)目字典表
order_item_class開單項(xiàng)目分類表
order_item_relationship開單項(xiàng)目關(guān)系表
diagnose診斷字典表
operation手術(shù)字典表
bed床位字典表
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lis_item_map檢驗(yàn)項(xiàng)目對(duì)照表
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6
DBXX/TXXX—XXXX
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radiology_report放射學(xué)報(bào)告
radiology_report_item放射學(xué)報(bào)告檢查項(xiàng)目
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ecg_result_detail心電報(bào)告結(jié)果明細(xì)
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ecg_report_item心電報(bào)告檢查項(xiàng)目
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DBXX/TXXX—XXXX
ultrasound_report_item超聲報(bào)告檢查項(xiàng)目
ultrasound_result_detail超聲報(bào)告檢查結(jié)果報(bào)告
pathology_report病理報(bào)告
pathology_report_item病理報(bào)告檢查項(xiàng)目
other_report其他檢查報(bào)告
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lab_report檢驗(yàn)報(bào)告
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