PubMed數(shù)據(jù)庫檢索介紹

PubMed數(shù)據(jù)庫檢索介紹

河北醫(yī)科大學(xué)圖書館

于偉概況基本檢索高級檢索主題詞途徑檢索臨床查詢檢索單引文匹配檢索檢索結(jié)果處理概況基本檢索高級檢索主題詞途徑檢索臨床查詢檢索單引文匹配檢索檢索結(jié)果處理

PubMed（)

是由美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（National

Library

of

Medicine，NLM)的國家生物技術(shù)信息中心（National

Center

for

Biotech-nology

Information，NCBI)開發(fā)的一個以網(wǎng)絡(luò)為基礎(chǔ)的醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)檢索系統(tǒng),是NCBI龐大的檢索體系Entrez的一部分。

概況

收錄從1948年至今80多個國家和地區(qū)37種文字的5000多種生物醫(yī)學(xué)期刊上的文獻(xiàn)2400多萬條。每日更新（周二到周六），每天增加2000－4000條完整記錄。PUBMED引文90%為英文文獻(xiàn)，79%有英文摘要。

概況概況基本檢索高級檢索主題詞途徑檢索臨床查詢檢索單引文匹配檢索檢索結(jié)果處理

基本檢索自動詞語匹配檢索著者檢索期刊檢索詞組檢索截詞檢索布爾邏輯檢索自動詞語匹配檢索著者檢索期刊檢索詞組檢索截詞檢索布爾邏輯檢索

基本檢索對于輸入檢索框中未加標(biāo)識的檢索詞，PubMed依次在下列詞表中查找匹配的內(nèi)容：MeSHtranslationtableJournalstranslationtableFullAuthortranslationtableAuthorindex

基本檢索Keyword(s)Mesh轉(zhuǎn)換表期刊名轉(zhuǎn)換表作者索引表經(jīng)過轉(zhuǎn)換后的檢索式Pubmed系統(tǒng)進(jìn)行檢索Details分析11作者姓名轉(zhuǎn)換表

基本檢索1、Mesh轉(zhuǎn)換表由Mesh詞、款目詞、Mesh副主題詞、

文獻(xiàn)類型詞、藥理作用詞、一體化醫(yī)學(xué)語言系統(tǒng)詞及

化學(xué)物質(zhì)名稱等組成。2、期刊轉(zhuǎn)換表由Pubmed收錄期刊的刊名全稱、

MEDLINE格式刊名縮寫和ISSN三種形式組成。3、作者全名轉(zhuǎn)換表由2002年以來發(fā)表文章作者的姓名

全稱組成。檢索時，按自然順序或姓前名后的形式輸

入均可。4、作者索引Pubmed將姓全稱，后邊帶名首字母縮寫

的短語自動識別為作者姓名。

如果在上述轉(zhuǎn)換表中找不到相同匹配的詞，Pubmed會將短語拆開，按單個詞重復(fù)以上順序分別查找，直到找到相匹配的詞。

基本檢索Heartattack

自動匹配檢索"myocardialinfarction"[MeSHTerms]OR("myocardial"[AllFields]AND"infarction"[AllFields])OR"myocardialinfarction"[AllFields]OR("heart"[AllFields]AND"attack"[AllFields])OR"heartattack"[AllFields]"myocardialinfarction"[MeSHTerms]OR("myocardial"[AllFields]AND"infarction"[AllFields])OR"myocardialinfarction"[AllFields]OR("heart"[AllFields]AND"attack"[AllFields])OR"heartattack"[AllFields]自動詞語匹配檢索著者檢索期刊檢索截詞檢索詞組檢索布爾邏輯檢索

基本檢索以作者姓全稱加名首字縮寫的格式輸入姓名，PubMed通過自動匹配自動在作者字段進(jìn)行檢索。可通過在姓名前后加雙引號并加作者字段標(biāo)識[au]關(guān)閉該功能，如：“SmithJ”[au]

基本檢索

基本檢索以作者姓全稱加名首字縮寫的格式輸入姓名，PubMed通過自動匹配自動在作者字段進(jìn)行檢索?？赏ㄟ^在姓名前后加雙引號并加作者字段標(biāo)識[au]關(guān)閉該功能，如：“SmithJ”[au]。如果只輸入作者的姓，則PubMed會在所有字段中對其進(jìn)行檢索，如只想將其作為作者檢索，需加作者字段標(biāo)識[au]。

2002年以后的論文，如果提供作者全名，可使用作者全名進(jìn)行檢索。作者姓名可正序或倒序。如：juilaswong或wongjulias。為了區(qū)分姓名全稱與首字縮寫，需加標(biāo)全名字段標(biāo)識[fau]，如：petersondo[fau]

基本檢索

檢索字段及標(biāo)識符AD(Address):第一作者所屬單位和地址ALL(AllFields):全部字段AU(Author):作者姓名DP(PublicationDate):出版時間EDAT(EntrezDate):錄入時間1AU(FirstAuthorName):第一作者姓名FAU(FullAuthorName):作者姓名全稱(02年以后）LASTAU(LastAuthor)最后一個作者（通訊作者）IP(Issue):期號、部分號、增刊號IS(ISSN):國際標(biāo)準(zhǔn)刊號LA(Language):原文語種

檢索字段及標(biāo)識符MH(MeshTerms):主題詞MAJR(MeshMajorTopic):主要主題詞PG(Pagination):頁碼（起頁）PT(PublicationType):出版類型SB(Subset):文獻(xiàn)子集SH(MeshSubheadings):副主題詞TA(JournalTitleAbbreviation):刊名縮寫TI(Title):文章題名TIAB(Title/Abstract):題名摘要TW(TextWords):文本詞VI(Volume):卷號自動詞語匹配檢索著者檢索期刊檢索截詞檢索詞組檢索布爾邏輯檢索

基本檢索

直接在檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN，PubMed通過自動匹配自動在刊名字段進(jìn)行檢索。使用PubMed資源的“JournalsDatabase”查詢特定期刊上的文章。

基本檢索

直接在檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN，PubMed通過自動匹配自動在刊名字段進(jìn)行檢索。使用PubMed資源的“JournalsDatabase”查詢特定期刊上的文章。

基本檢索

如果刊名是Mesh詞（如：GeneTherapy、Science、Cell)，或刊名是單個單詞（Scanning)，如只想將其作為刊名檢索，需加刊名字段標(biāo)識[ta]。推薦使用刊名全稱或縮寫查找，因?yàn)橛行┻^早的文獻(xiàn)沒有ISSN。

基本檢索scienceScience[ta]

直接在檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN，PubMed通過自動匹配自動在刊名字段進(jìn)行檢索。使用PubMed資源的“JournalsDatabase”查詢特定期刊上的文章。

基本檢索自動詞語匹配檢索著者檢索期刊檢索截詞檢索詞組檢索布爾邏輯檢索

基本檢索截詞檢索：可通過在詞干后加“*”檢索以該詞干開頭的所有詞的文獻(xiàn)。需要注意的是：截詞檢索將關(guān)閉PubMed的自動單詞匹配功能以及Mesh主題詞的擴(kuò)展檢索功能。如：輸入heartattack*，不會啟動自動匹配功能檢索與之匹配的Mesh主題詞“MyocardialInfarction”及其下位更專指的主題詞的相關(guān)文獻(xiàn)。

基本檢索

基本檢索截詞功能最多可使用600個詞形變化。超過600個會顯示如下圖的提示信息。

基本檢索PubMed在檢索時忽略一些常用的英語詞匯，下表為禁用詞列表

基本檢索自動詞語匹配檢索著者檢索期刊檢索截詞檢索詞組檢索布爾邏輯檢索

基本檢索

對于輸入PubMed的多詞詞組，PubMed會查詢詞組索引，如果查到相應(yīng)詞組則將其作為一個檢索詞來檢索。如果未查到相應(yīng)詞組，則將其拆分成單個詞，分別進(jìn)行檢索并以邏輯和（AND）進(jìn)行組配，如：singlecell相當(dāng)于檢索singleANDcell?？赏ㄟ^如下方式強(qiáng)制將其作為一個詞組進(jìn)行檢索：

1.加雙引號，如：“singlecell”2.加標(biāo)段標(biāo)識[tw]:singlecell[tw]3.使用短橫線“-”將兩詞連接起來：single-cell4.使用截詞符*：singlecell*

基本檢索

基本檢索自動詞語匹配檢索著者檢索期刊檢索截詞檢索詞組檢索布爾邏輯檢索

基本檢索概況基本檢索高級檢索主題詞途徑檢索臨床查詢檢索單引文匹配檢索檢索結(jié)果處理

PUBMED的AdvancedSearch頁面整合了多種對檢索有用的輔助功能，可實(shí)現(xiàn)如下操作：

?Searchingbyaspecificfield?

Browsingtheindexofterms?Combiningsearchesusinghistory?Displayingthesearchdetails

高級檢索

PUBMED的AdvancedSearch頁面整合了多種對檢索有用的輔助功能，可實(shí)現(xiàn)如下操作：

?Searchingbyaspecificfield?

Browsingtheindexofterms?Combiningsearchesusinghistory?Displayingthesearchdetails

高級檢索作者檢索：通過AdvancedSearch頁面中的“SearchBuilder”下拉列表選擇“Author”字段，在字段后的檢索框中輸入作者姓名，姓名的輸入具有自動完成屬性。

高級檢索

期刊檢索：通過AdvancedSearch頁面中的“SearchBuilder”下拉列表選擇“Journal”字段，在字段后的檢索框中輸入刊名全稱、Medline縮寫及ISSN

高級檢索通過高級檢索頁面的“SearchBuilder”可以進(jìn)行特定字段的限定檢索。

首先在下拉列表中選擇要檢索的字段，然后在檢索框中輸入檢索詞。再選擇“AND”、“OR”、“NOT”三種邏輯關(guān)系之一，即可將輸入的檢索詞在所選字段中檢索的策略以相應(yīng)的邏輯關(guān)系加入到檢索框中。

高級檢索nature

高級檢索Searchingbyaspecificfield

PUBMED的AdvancedSearch頁面整合了多種對檢索有用的輔助功能，可實(shí)現(xiàn)如下操作：

?Searchingbyaspecificfield

?

Browsingtheindexofterms?Combiningsearchesusinghistory?Displayingthesearchdetails

高級檢索

通過“SearchBuilder”檢索框下面的“ShowIndex”選項(xiàng)可查詢在所有字段或某一特定字段中的索引，可以從索引中選擇一個或幾個詞來完善檢索策略。

高級檢索chronicproctitis

PUBMED的AdvancedSearch頁面整合了多種對檢索有用的輔助功能，可實(shí)現(xiàn)如下操作：

?Searchingbyaspecificfield?

Browsingtheindexofterms

?Combiningsearchesusinghistory?Displayingthesearchdetails

高級檢索

檢索史按檢索式運(yùn)行的順序列出各檢索式，包括檢索式序號、檢索策略、檢索時間、檢索到的文獻(xiàn)條數(shù)。檢索史最多保存100條檢索式，檢索史將在離開PubMed或其他Entrez數(shù)據(jù)庫8小時后消失。單擊檢索式后的文獻(xiàn)數(shù)鏈接可顯示該檢索式的檢索結(jié)果。可通過檢索策式的序號對檢索策略進(jìn)行組配，如：#2AND#6，#3AND(drugtherapyORdiettherapy)單擊檢索史窗口下方的ClearHistory按鈕可將所有檢索式刪除。

高級檢索Deletefromhistory:從檢索史中刪除該條檢索式Showsearchresults:查看該條檢索策略的檢索結(jié)果Showsearchdetails:顯示該條檢索策略的具體執(zhí)行情況SaveinMyNCBI：在MyNCBI中保存該條檢索策略。

PUBMED的AdvancedSearch頁面整合了多種對檢索有用的輔助功能，可實(shí)現(xiàn)如下操作：

?Searchingbyaspecificfield?

Browsingtheindexofterms?Combiningsearchesusinghistory

?Displayingthesearchdetails

高級檢索

“Details”(細(xì)節(jié)）可實(shí)現(xiàn)如下功能：1、查看檢索策略被PubMed的自動單詞匹

配功能、檢索規(guī)則和句法轉(zhuǎn)換后的形式。2、存儲和編輯檢索策略并重新發(fā)送出該項(xiàng)策略。3、提示出錯信息和說明。

高級檢索

限定檢索可限定只檢索那些提供全文或免費(fèi)全文的文獻(xiàn)，也可將檢索策略限定于特定的年齡組、性別、人類與動物研究、語種、文獻(xiàn)類型、PubMed的特定文獻(xiàn)子集等。

由于inprocesscitations和publishersuppliedcitaions沒有進(jìn)行標(biāo)引，因此選擇某些限定功能，PubMed將僅在Medline中進(jìn)行檢索。選擇了某種限定條件并進(jìn)行檢索后當(dāng)前的限定條件顯示于檢索結(jié)果頁面上方，進(jìn)行新的檢索時需單擊限定條件后的“Remove”選項(xiàng)清除當(dāng)前的限定條件，否則將使用相同的限定條件進(jìn)行檢索。

限定檢索限定檢索概況基本檢索高級檢索主題詞途徑檢索臨床查詢檢索單引文匹配檢索檢索結(jié)果處理通過主題詞數(shù)據(jù)庫可以查詢Mesh詞、副主題詞、出版類型、物質(zhì)名和藥物作用等，并生成檢索策略。可以使用Mesh詞、Mesh款目詞、副主題詞、出版類型、物質(zhì)名或Mesh范疇注釋中的詞檢索Mesh數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)。主題詞途徑檢索

MeshDatabasehighbloodpressure√√√概況基本檢索高級檢索主題詞途徑檢索臨床查詢檢索單引文匹配檢索檢索結(jié)果處理

PubMed在其臨床查詢頁面為臨床醫(yī)生提供如下特殊的PubMed檢索服務(wù):?SearchbyClinicalStudyCategory?FindingSystematicReviews?MedicalGeneticsSearches

臨床查詢檢索

1.按臨床研究類別檢索文獻(xiàn)使用內(nèi)建過濾器專門查詢有關(guān)臨床研究類別的文獻(xiàn)，提供5種研究類別（etiology、diagnosis、therapy、prognosis、clinicalpredictionguides）和2種強(qiáng)調(diào)類型（narrowspecificsearch、broadsensitivesearch）臨床查詢檢索ResearchMethodologyFilters臨床查詢檢索2.查詢系統(tǒng)綜述

系統(tǒng)綜述包括如下文獻(xiàn)類型：

systematicreviewsmeta-analysisreviewsofclinicaltrialsevidence-basedmedicineconsensusdevelopmentconferencesguidelines

臨床查詢檢索3.醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究用來查找醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)相關(guān)的各主題的文獻(xiàn)，包括：DiagnosisDifferentialDiagnosisClinicalDescriptionManagementGeneticCounselingMolecularGeneticsGeneticTesting臨床查詢檢索

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UsingClinicalQueries

UsingClinicalQueries概況基本檢索高級檢索主題詞途徑檢索臨床查詢檢索單引文匹配檢索檢索結(jié)果處理以填空的方式填入已知的期刊信息，查詢一篇已知論文或指定期刊某一卷或期上的一批論文。期刊名和作者名有自動完成屬性，輸入部分信息