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文檔簡介
第四章DNA的復(fù)制第一節(jié)DNA復(fù)制概述第二節(jié)原核生物DNA的復(fù)制第三節(jié)真核生物DNA的復(fù)制
第四章DNA的復(fù)制(4)DNA復(fù)制(replication)是指遺傳物質(zhì)的傳代,以母鏈DNA為模板合成子鏈DNA的過程。第四章DNA的復(fù)制(4)生物體內(nèi)遺傳信息的傳遞復(fù)制DNA是遺傳信息的載體,生物體要保持物種的延續(xù),子代必須從親代繼承控制個體發(fā)育的遺傳信息。生物體通過細(xì)胞分裂來實(shí)現(xiàn)物種的傳遞和個體數(shù)目的增殖,在此過程中細(xì)胞染色體的數(shù)目加倍,作為遺傳物質(zhì)的DNA分子的數(shù)目也加倍(復(fù)制),并伴隨染色體平均分配到兩個子代細(xì)胞中。第四章DNA的復(fù)制(4)第一節(jié)DNA復(fù)制概述一、半保留復(fù)制二、DNA復(fù)制的一些概念三、DNA的半不連續(xù)復(fù)制四、DNA復(fù)制的酶體系五,DNA復(fù)制的高保真性第四章DNA的復(fù)制(4)一、半保留復(fù)制
DNA復(fù)制過程中,新合成的兩個子代DNA分子中,一條鏈?zhǔn)切潞铣傻?,另外一條鏈來自親代,即子代細(xì)胞中只有一半的遺傳物質(zhì)來自親代,這種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。
復(fù)制親代DNA子代DNA第四章DNA的復(fù)制(4)半保留復(fù)制機(jī)理證明1958,Meselson,Stahl15N
14NCsCl密度梯度離心
半保留復(fù)制機(jī)理說明了DNA在代謝上的穩(wěn)定性第四章DNA的復(fù)制(4)二、DNA復(fù)制的一些概念◎復(fù)制子(replicon):基因組中控制DNA復(fù)制的復(fù)制單位。它包括控制復(fù)制開始的復(fù)制起點(diǎn)和終止復(fù)制的終止子。
所有的原核生物的染色體、噬菌體僅有一個復(fù)制子;真核生物的染色體有多個復(fù)制子,哺乳動物細(xì)胞含有50000-100000個,每個復(fù)制子約長50-200kb。第四章DNA的復(fù)制(4)
原核生物:一個復(fù)制起始位點(diǎn)。E.coli:oriC,全長245bp,該序列在所有細(xì)菌復(fù)制起始位點(diǎn)中都是保守的。真核生物:DNA的復(fù)制是從許多起始點(diǎn)同時開始的,所以每個DNA分子上有許多個復(fù)制子。
第四章DNA的復(fù)制(4)◎復(fù)制起點(diǎn)和終點(diǎn)無論是原核細(xì)胞還是真核細(xì)胞,復(fù)制都是從DNA分子上的特定位點(diǎn)開始的,這一位點(diǎn)稱為復(fù)制起始點(diǎn)(origin)。而終止復(fù)制的位點(diǎn)稱為復(fù)制終點(diǎn)(termini)。第四章DNA的復(fù)制(4)◎復(fù)制叉(replicationfork):復(fù)制時雙鏈打開,分開成兩股,新鏈沿著張開的模板生成,復(fù)制中形成的這種Y字形的結(jié)構(gòu)稱為復(fù)制叉。第四章DNA的復(fù)制(4)
◎復(fù)制方向
復(fù)制可以單向﹑雙向進(jìn)行,取決于在復(fù)制起始點(diǎn)有一個還是兩個復(fù)制叉。通過放射自顯影實(shí)驗(yàn)可以判斷DNA復(fù)制是雙向還是單向進(jìn)行的。
從復(fù)制叉走勢上看,有三種復(fù)制方式適合半保留復(fù)制機(jī):相向復(fù)制單向復(fù)制雙向復(fù)制第四章DNA的復(fù)制(4)相向復(fù)制:
從兩個起點(diǎn)開始的,形成兩個復(fù)制叉,各以一個單一方向復(fù)制出一條新鏈。某些線性DNA病毒以這種方式進(jìn)行復(fù)制,如:腺病毒。第四章DNA的復(fù)制(4)單向復(fù)制:
復(fù)制從一個起始點(diǎn)開始,以同一方向生長出兩條鏈,形成一個復(fù)制叉。
質(zhì)粒colE1是個典型的例子第四章DNA的復(fù)制(4)雙向復(fù)制:
從一個特定位點(diǎn)解鏈,沿著兩個相反的方向各生長出兩條鏈,形成一個復(fù)制泡,用電子顯微鏡可以觀察到復(fù)制泡的存在。原核生物和真核生物DNA復(fù)制最主要的形式第四章DNA的復(fù)制(4)◎復(fù)制方式有三種θ型復(fù)制滾環(huán)復(fù)制D環(huán)復(fù)制第四章DNA的復(fù)制(4)θ型復(fù)制細(xì)菌常見的復(fù)制方式;雙鏈環(huán)狀DNA的復(fù)制眼可以形成一種θ結(jié)構(gòu),復(fù)制的中間產(chǎn)物為θ型結(jié)構(gòu),形狀像希臘字母θθ型復(fù)制可以是雙向或單向,大多為等速的雙向,少數(shù)為不等速的雙向復(fù)制單向雙向◎復(fù)制方式三種θ型復(fù)制滾環(huán)復(fù)制D環(huán)復(fù)制第四章DNA的復(fù)制(4)第四章DNA的復(fù)制(4)3’-OH5’-P53535’5’5’3’3’3’3’5’滾環(huán)復(fù)制
指一些簡單低等生物或染色體以外的DNA采取的特殊復(fù)制形式。如
X174和M13噬菌體等。環(huán)狀DNA復(fù)制時,雙鏈一股先打開一個缺口,5′端向外伸展,在伸展出的單鏈上進(jìn)行不連續(xù)復(fù)制;沒有開環(huán)的一股則可以一邊滾動,一邊進(jìn)行連續(xù)復(fù)制.兩股鏈均直接作為模板,不需要引物.第四章DNA的復(fù)制(4)dNTPDNA-polγ
特點(diǎn):
復(fù)制起始點(diǎn)不在雙鏈DNA同一位點(diǎn),內(nèi)、外環(huán)復(fù)制有時序差別。左:第一個引物在第一起始點(diǎn)上合成右:延長至第二起始點(diǎn),合成第二引物最后完成兩個雙鏈環(huán)狀DNA的復(fù)制。復(fù)制中呈字母D形狀而得名。D環(huán)復(fù)制是線粒體DNA(mtDNA)的復(fù)制形式。復(fù)制時需合成引物。第四章DNA的復(fù)制(4)◎復(fù)制速度
真核生物其復(fù)制叉移動速度為1000-3000bp/min,細(xì)菌DNA復(fù)制叉的移動速度為50,000bp/min.真核生物基因組比原核生物大,染色體結(jié)構(gòu)復(fù)雜,復(fù)制時需要解開核小體,之后又需重新形成核小體,真核生物染色體DNA上有許多復(fù)制起點(diǎn),可分段復(fù)制真核生物染色體在全部復(fù)制完成之前起點(diǎn)不再重新開始復(fù)制;而在快速生長的原核生物中,起點(diǎn)可以連續(xù)發(fā)動復(fù)制。第四章DNA的復(fù)制(4)表
細(xì)菌和真核生物復(fù)制的比較生物復(fù)制子數(shù)復(fù)制子長度復(fù)制速率細(xì)菌(E.coli)14,200Kb50Kb/min酵母(S.cerevisiae)50040Kb3.6Kb/min果蠅(D.melanogaster)3,50040Kb2.6Kb/min爪蟾(X.laevis)15,000200Kb500bp/min小鼠(M.musculus)25,000150Kb2.2Kb/min植物(V.faba)35,000300Kb
作業(yè):1名詞解釋:半保留復(fù)制復(fù)制子復(fù)制叉
2DNA復(fù)制方式有幾種?各有如何特點(diǎn)?第四章DNA的復(fù)制(4)三、DNA復(fù)制的酶體系
DNA分子復(fù)制是通過DNA聚合酶及各種相關(guān)酶蛋白、蛋白因子的協(xié)同有序工作完成的。
復(fù)制體(Replisome):DNA復(fù)制是一個非常復(fù)雜的酶學(xué)過程,它需要30種以上的酶和蛋白質(zhì),人們常把這些酶和蛋白質(zhì)稱為復(fù)制體系,其中一部分酶和蛋白質(zhì)結(jié)合在一起,協(xié)同動作,構(gòu)成復(fù)制體。第四章DNA的復(fù)制(4)DNA聚合酶DNA連接酶解旋酶單鏈結(jié)合蛋白引物酶DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶第四章DNA的復(fù)制(4)◆
DNA聚合酶(DNApolymerase)
n1dATP+n2dGTP+n3dCTP+n4dTTP+DNAdAMP+dAMP+dAMP+dAMPMg2+DNA聚合酶+DNA+nPP1N聚合酶反應(yīng)式DNA聚合酶反應(yīng)特點(diǎn)☆以4種dNTP作為底物☆反應(yīng)需要接受模板指導(dǎo)☆鏈延伸需要引物3‘-羥基存在☆鏈延伸方向5’3’☆
產(chǎn)物DNA極性與模板相對都是脫氧核糖核苷酸
第四章DNA的復(fù)制(4)如E.ColiDNA聚合酶☆DNA聚合酶I(PolI)☆
DNA聚合酶Ⅱ(PolⅡ)☆
DNA聚合酶Ⅲ(PolⅢ)第四章DNA的復(fù)制(4)323個氨基酸小片段35KD5
核酸外切酶活性大片段/Klenow片段
68KD604個氨基酸DNA聚合酶活性
5
核酸外切酶活性N端C端木瓜蛋白酶DNA聚合酶I
(PolI)Klenow片段是實(shí)驗(yàn)室合成DNA,進(jìn)行分子生物學(xué)研究中常用的工具酶。
多功能酶PolI在復(fù)制過程中主要起修復(fù)損傷,校對的功能第四章DNA的復(fù)制(4)第四章DNA的復(fù)制(4)
此酶MW為120KD,每個細(xì)胞內(nèi)約有100個酶分子,但活性只有DNApolⅠ的5%。該酶的催化特性如下:聚合作用:該酶催化DNA的聚合,對模板有特殊要求。最適模板是雙鏈DNA而中間有空隙(gap)的單鏈DNA部份,且該單鏈空隙長不到100個核苷酸。對長的單鏈DNA模板區(qū)該酶的聚合活性很低。但用單鏈結(jié)合蛋白(SSBP)可以提高其聚合速率,可達(dá)原來的50-100倍。該酶也具有3'→5'外切酶活性,但無5'→3'外切酶活性。該酶對作用底物的選擇性較強(qiáng),一般只能將2-脫氧核苷酸摻入到DNA鏈中。該酶不是復(fù)制的主要聚合酶,因此酶缺陷的大腸桿菌突變株DNA復(fù)制都正常??赡茉贒NA損傷修復(fù)中起到一定的作用。DNA聚合酶Ⅱ(PolⅡ)第四章DNA的復(fù)制(4)
DNA聚合酶Ⅲ(PolⅢ)它是由一個多亞基組成的蛋白質(zhì)分子,其分子量>600kDa整個酶分子形成一個不對稱的二聚體,每個大腸桿菌細(xì)胞中只有1000個酶分子,催化dNTP參入DNA鏈的速率卻是最快的,約為9000核苷酸/分/酶分子。這也證明DNA
polⅢ是DNA復(fù)制過程中主要發(fā)揮作用的酶。第四章DNA的復(fù)制(4)(a)核心酶:(
,,)(b)β二聚體:保持全酶結(jié)合在DNA模板上(c)γ復(fù)合物:幫助β二聚體結(jié)合在模板上(d)τ二聚體:連接核心酶與γ復(fù)合物第四章DNA的復(fù)制(4)大腸桿菌(E.Coli)DNA聚合酶性質(zhì)的比較
聚合酶I聚合酶II聚合酶III5'→3'多聚酶√√√3'→5'外切酶√√√5'→3'外切酶√××結(jié)構(gòu)多肽多肽多亞基復(fù)合物分子量109kD90kD900kD基因polApolBDNAE,DNAN,DNAQ,DNAX和其他未知亞基功能基本的修復(fù)、聚合酶和引物切除錯誤傾向修復(fù)聚合酶(SOS誘導(dǎo))基本的復(fù)制聚合酶第四章DNA的復(fù)制(4)◆DNA連接酶催化雙鏈DNA切口處的3′-OH和5′-P生成磷酸二酯鍵,完成鏈與鏈之間的連接ATP或NAD供應(yīng)能量第四章DNA的復(fù)制(4)
解旋酶是一類解開氫鍵的酶,由ATP來供給能量。它常常依賴于單鏈的存在,并識別復(fù)制叉的單鏈結(jié)構(gòu)。目前,大腸桿菌中發(fā)現(xiàn)有兩類解旋酶參與這個過程,一類稱為解旋酶Ⅱ或解旋酶Ⅲ,與模板DNA結(jié)合沿5‘→3’方向運(yùn)動;第二類稱為Rep蛋白,和模板DNA結(jié)合沿3'→5'方向運(yùn)動。
◆解旋酶第四章DNA的復(fù)制(4)◆單鏈結(jié)合蛋白(SSB)
螺旋酶沿復(fù)制叉方向向前推進(jìn)產(chǎn)生了一段單鏈區(qū),但是這種單鏈DNA不會長久存在,會很快重新配對形成雙鏈DNA或被核酸酶降解。避免單鏈退活形成鏈內(nèi)氫鍵及保護(hù)單鏈不被降解SSB與DNA結(jié)合時無序列專一性;SSB可加強(qiáng)單鏈DNA對DNA聚合酶的親和力;可以重復(fù)使用,當(dāng)新生的DNA鏈合成到某一位置時,該處的SSB便會脫落,并被重復(fù)利用。第四章DNA的復(fù)制(4)
DNA在細(xì)胞內(nèi)常以超螺旋狀態(tài)存在,DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶催化同一DNA分子不同超螺旋狀態(tài)之間的轉(zhuǎn)變。DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶有兩類,拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ.
作用是暫時切斷一條DNA鏈,形成酶-DNA共價(jià)中間物而使超螺旋DNA松弛化,再將切斷的單鏈DNA連接起來,不需要任何輔助因子。拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ(旋轉(zhuǎn)酶(DNAgyrase)),能將負(fù)超螺旋引入DNA分子,該酶能暫時性地切斷和重新連接雙鏈DNA,同時需要ATP水解為ADP以供能。
◆
DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(DNATopisomerase)第四章DNA的復(fù)制(4)DNA復(fù)制起始的關(guān)健步驟是前導(dǎo)鏈DNA的合成,前導(dǎo)鏈DNA聚合開始,隨從鏈DNA的合成也隨著。前導(dǎo)鏈的合成是連續(xù)進(jìn)行的,起始相對簡單,而隨從鏈的合成不連續(xù),所以引發(fā)階段比較復(fù)雜。
引物酶:
特殊的RNA聚合酶,催化短片段RNA的合成。短RNA片段十幾至數(shù)十個核苷酸不等,它在DNA復(fù)制起始處做引物。RNA引物的3′-OH末端供DNA聚合酶催化形成DNA分子的第一個磷酸二酯鍵的位置。
引發(fā)體:高度解鏈的模板DNA與多種蛋白質(zhì)因子形成的引發(fā)前體促進(jìn)引物酶結(jié)合,共同形成引發(fā)體,引發(fā)體主要在DNA隨從鏈上開始,它連續(xù)地與引物酶結(jié)合并解離,從而在不同部位引導(dǎo)引物酶合成RNA引物,在引物RNA的3′-OH末端再合成DNA片段,因此隨從鏈?zhǔn)遣贿B續(xù)合成的開始?!粢l(fā)體的形成第四章DNA的復(fù)制(4)四、DNA的半不連續(xù)復(fù)制
DNA在復(fù)制過程中,一條鏈?zhǔn)沁B續(xù)合成的,而另一條鏈合成是不連續(xù)的,這樣的復(fù)制過程稱為半不連續(xù)合成。第四章DNA的復(fù)制(4)半不連續(xù)復(fù)制相關(guān)概念岡崎片段(Okazakifragment)
:DNA復(fù)制時,不連續(xù)合成的親代單鏈(5′→3′)先合成小的DNA片段,再連接稱完整的鏈,這些片段由岡崎等人發(fā)現(xiàn),稱為岡崎片段。前導(dǎo)鏈
(leadingstrand):以復(fù)制叉向前移動的方向?yàn)闃?biāo)準(zhǔn),3′→5′方向的模板鏈其上DNA以5′→3′方向連續(xù)合成,稱為前導(dǎo)鏈。后隨鏈(laggingstrand):復(fù)制叉移動方向相反,隨著復(fù)制叉的移動,形成許多不連續(xù)的岡崎片段,最后連接成一條完整的DNA鏈,稱為后隨鏈。第四章DNA的復(fù)制(4)第四章DNA的復(fù)制(4)五,DNA復(fù)制的高保真性
為了保證遺傳的穩(wěn)定,DNA的復(fù)制必須具有高保真性。保真性主要與下列因素有關(guān):遵守嚴(yán)格的堿基配對規(guī)律;
DNA聚合酶對底物的選擇作用;對復(fù)制過程中出現(xiàn)的錯誤及時進(jìn)行校正。
第四章DNA的復(fù)制(4)
第二節(jié)原核生物的DNA復(fù)制
以大腸桿菌染色體DNA的復(fù)制為例.復(fù)制過程分為3個階段:起始、延伸和終止。其間的反應(yīng)和參與作用的酶與輔助因子各有不同,DNA復(fù)制的階段表現(xiàn)在其復(fù)制體結(jié)構(gòu)的變化上153頁第四章DNA的復(fù)制(4)一、大腸桿菌染色體DNA復(fù)制的起始◎復(fù)制起始區(qū)的DNA結(jié)構(gòu)特點(diǎn):全長245bp,該序列在所有細(xì)菌復(fù)制起始位點(diǎn)中都是保守的富含A-T,這可能和雙鏈易于解開起始復(fù)制有關(guān)含有多個回文結(jié)構(gòu)(9-14個GATC,E.coli含有11個)8個GATC較保守,CATC中的“A”已甲基化。具有4個反向重復(fù)順序,作為蛋白結(jié)合位點(diǎn);第四章DNA的復(fù)制(4)
◎
DNA復(fù)制的起始
●DnaA單體首先結(jié)合到oriC
的4個含9bp的重復(fù)順序上。
●
20~40個DnaA單體結(jié)合到oriC上形成一個核心。
●在DnaA蛋白的作用下,位于oriC右側(cè)的3個含13bp的重復(fù)順序開始解鏈形成開放復(fù)合體。
●
DnaB和DnaC蛋白形成一個復(fù)合體。在引發(fā)體中,每個DnaB六聚體結(jié)合6個DnaC單體,形成480Kd,直徑為6nm的球狀復(fù)合體。
●
DnaB提供解旋酶(helicase)活性,使DNA解旋形成復(fù)制叉。
DnaB還具有激活DnaG引發(fā)酶的能力第四章DNA的復(fù)制(4)●
DnaG加入形成引發(fā)體(oriC引發(fā)體),合成引物RNA●引物合成后,DNApol組裝到引發(fā)的RNA上,完成復(fù)制體的組裝第四章DNA的復(fù)制(4)
表在oriC上前引發(fā)所需的蛋白蛋白
功能對蛋白質(zhì)的要求DnaA協(xié)同結(jié)合于9bp和13bp重復(fù)順序20-40單體DnaB結(jié)合于DnaA,提供解旋酶活性1-2六聚體DnaC和DnaB形成復(fù)合體六個單體HU組蛋白樣蛋白,激發(fā)復(fù)合體形成~5個雙體ssB(F)穩(wěn)定單鏈化學(xué)劑量,四聚體第四章DNA的復(fù)制(4)二、大腸桿菌染色體DNA復(fù)制的延伸前導(dǎo)鏈的合成方向與復(fù)制叉運(yùn)動的方向一致,因此只需要一次引發(fā)事件,PolⅢ全酶就能連續(xù)不斷地延伸前導(dǎo)鏈。后隨鏈合成方向與復(fù)制叉的運(yùn)動方向相反,因此后隨鏈的延伸是一個不連續(xù)的過程,需要重復(fù)不斷地合成RNA引物,再通過PolⅢ全酶延伸成短的岡崎片段。在復(fù)制延伸階段,同時進(jìn)行前導(dǎo)鏈和后隨鏈的合成第四章DNA的復(fù)制(4)
復(fù)制體(replisome)是由解旋酶、引發(fā)酶和DNAPolⅢ全酶組成的復(fù)合體。DNA合成時,沿著復(fù)制叉的方向移動?;丨h(huán)模型
DNA合成時,沿著復(fù)制叉的方向移動。后隨鏈模板形成了一個回環(huán),使環(huán)中RNA引物和岡崎片段的合成方向與前導(dǎo)鏈一致,以適應(yīng)雙鏈在同一復(fù)制體上進(jìn)行復(fù)制。此模型稱回環(huán)模型。第四章DNA的復(fù)制(4)
兩個催化核心分別和DNA的兩條模板鏈結(jié)合,全酶延著前導(dǎo)鏈模板隨著復(fù)制叉的移動而移動,而后隨鏈模板從復(fù)制體上“拉出”一段,形成一個環(huán)。DnaB產(chǎn)生了解鏈點(diǎn),并沿著后隨鏈以其5′→3′方向移動。第四章DNA的復(fù)制(4)當(dāng)polⅢ全酶在DNA遇到一個裂口時核心復(fù)合體和滑動的“夾子”離開,然后在別的地方再和新的β亞基結(jié)合。在岡崎片段末端發(fā)生這種反應(yīng):當(dāng)核心酶合成完一段岡崎片段時,核心復(fù)合體就會和模板解離,將環(huán)釋放出來,另一個(也可能是同一個)核心復(fù)合體再和一個β夾子結(jié)合,起始下一個岡崎片段的合成。
岡崎片段上的引物要被切除,這樣會形成一個空缺,由PolⅠ合成短片段DNA來填補(bǔ)這個空缺,再由連接酶完成連接任務(wù)第四章DNA的復(fù)制(4)回環(huán)模型的生物學(xué)意義前導(dǎo)鏈和后隨鏈的協(xié)同合成對于生存是必須的,在DNA合成時遇到一個損傷位點(diǎn)將導(dǎo)致一條鏈合成停止,此時如果另一條鏈的合成不能相應(yīng)停止,會造成更大的危害。第四章DNA的復(fù)制(4)三、大腸桿菌染色體DNA復(fù)制的終止復(fù)制叉相遇
復(fù)制叉2復(fù)制起點(diǎn)復(fù)制叉1
圖11-33E.coli復(fù)制終止區(qū)(引自B.Lewin:GENESⅦ,2000,Fig.
12-7)
大腸桿菌染色體的終止區(qū)域含有兩對反向重復(fù)順序(terE,D,A和terC,B),位于相遇點(diǎn)的另一側(cè)100Kb處。每一終點(diǎn)對復(fù)制叉移動的方向是特異的,它們這樣排列是為了使復(fù)制叉能通過另一個終點(diǎn)而延伸。終止需要tus
基因的產(chǎn)物結(jié)合蛋白Tus(36kD),它能識別ter保守順序,ter-Tus復(fù)合物可能通過抑制螺旋酶活性來阻止復(fù)制叉前進(jìn)而實(shí)行終止。
第四章DNA的復(fù)制(4)基因座產(chǎn)物功能dnaE多聚酶III全酶的α亞基DNA聚合和校對dnaG引發(fā)酶,單體起始岡崎片段,合成RNAdnaN多聚酶III全酶的β亞基鏈的延伸dnaQ多聚酶III全酶的ε亞基校對功能dnaTi蛋白,引發(fā)體成分參與前引發(fā)danZX多聚酶III全酶的γ亞基形成γ復(fù)合體danZX多聚酶III全酶的τ亞基使核心酶形成二聚體gyrADNA回旋酶亞基α解除正超螺旋,引入負(fù)超螺旋gyrBDNA回旋酶亞基β解除正超螺旋,引入負(fù)超螺旋ligDNA連接酶,單體封閉岡崎片段之間的裂隙ori復(fù)制起點(diǎn)與dnaA,dnaB,dnaC結(jié)合,形成復(fù)制起始復(fù)合體polADNA聚合酶I修復(fù),切除引物并填補(bǔ)岡崎片段間的空隙rnhARNaseH降解引物ssb單鏈結(jié)合蛋白使DNA單鏈保持穩(wěn)定,暫不形成雙鏈PriA解旋酶(3′→5′)位點(diǎn)識別,(一個分子/復(fù)制叉)取代SSBPriB引發(fā)體成分參與前引發(fā)PriC引發(fā)參與前引發(fā)ter復(fù)制終止區(qū)供終止蛋白識別、結(jié)合,終止復(fù)制tus終止蛋白識別、結(jié)合復(fù)制終止區(qū),終止復(fù)制第四章DNA的復(fù)制(4)第三節(jié)真核生物DNA的復(fù)制表
真核生物復(fù)制生物復(fù)制子數(shù)復(fù)制子長度復(fù)制速率細(xì)菌(E.coli)14,200Kb50Kb/min酵母(S.cerevisiae)50040Kb3.6Kb/min果蠅(D.melanogaster)3,50040Kb2.6Kb/min爪蟾(X.laevis)15,000200Kb500bp/min小鼠(M.musculus)25,000150Kb2.2Kb/min植物(V.faba)35,000300Kb
在真核生物中DNA復(fù)制開始于特定位點(diǎn).以酵母為例:第四章DNA的復(fù)制(4)
DNA聚合酶α(Ⅰ)δ(Ⅲ)ε(Ⅱ)βγ位置核核核核線粒體功能后隨鏈的合成和引發(fā)前導(dǎo)鏈的合成修復(fù)修復(fù)復(fù)制分子量300kD170~230kD250kD40kD180~300kD亞基催化核心(180kD)兩個引物酶(60,50kD)一個未知催化核心(125kD)一個未知(25kD)需PCNA(37kD)催化核心一個未知催化催化3′→5′外切-++-+雙脫氧T不影響不影響弱抑制抑制蚜黃素抑制抑制抑制不影響不影響
一、真核生物的DNA聚合酶第四章DNA的復(fù)制(4)表
真核生物DNA復(fù)制需要的酶和蛋白蛋白亞基功能DNA聚合酶α/引發(fā)酶4后隨鏈合成(DnaG)DNA聚合酶δ2前導(dǎo)鏈合成PCNA1行進(jìn)性因子(β夾子)復(fù)制因子C3定位因子(γ復(fù)合體)復(fù)制因子A3單鏈結(jié)合(SSB)拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅰ和Ⅱ
維持DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)第四章DNA的復(fù)制(4)圖11-36真核的DNA復(fù)制模型
第四章DNA的復(fù)制(4)復(fù)制體性質(zhì)/成分細(xì)菌真核生物一般性質(zhì)的比較
復(fù)制起點(diǎn)單個很多延伸速度100kbpmin-12kbpmin-1岡崎片段1-2kbp100-200bp引發(fā)策略引發(fā)酶產(chǎn)生引物,由polIII延伸由polα延伸,由polδ完成復(fù)制多聚酶單體有不同進(jìn)行性的異源二聚體每條鏈有不同的酶,有不同的進(jìn)行性拓?fù)鋵W(xué)疏松和卷曲之間存在平衡,凈為負(fù)超螺旋濃縮在核小體中的負(fù)超螺旋。高級結(jié)構(gòu)影響拓?fù)鋵W(xué)復(fù)制體成分的比較
復(fù)制多聚酶polIII全酶polδ/polα進(jìn)行性因子β亞基PCNA定位因子夾γ亞基RF-C引發(fā)酶DnaGpolα:引發(fā)酶解旋酶DnaB(定位需要DnaC)?幾個候選者引物去除RNaseH和polIRNaseH1和MF-1核酸酶后滯鏈修復(fù)polI和DNA連接酶polδ/polε和DNA連接酶I拓?fù)洚悩?gòu)酶DNA回旋酶topoII單鏈結(jié)合SSBRF-A原核﹑真核生物DNA復(fù)制比較第四章DNA的復(fù)制(4)二、端粒的復(fù)制◎端粒酶
(telomerase)組成端粒酶RNA(humantelome
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