細(xì)菌的分類與命名課件

細(xì)菌的分類與命名

動(dòng)植物林奈分類體系細(xì)菌細(xì)胞不同于動(dòng)植物細(xì)胞前

言第一節(jié)細(xì)菌分類地位

一、分類地位

細(xì)菌過去歸屬植物界，自1974年以來，劃為原核生物。細(xì)菌作為另一個(gè)系統(tǒng)進(jìn)行類別的原核生物，包括對(duì)動(dòng)物和人具有致病作用的衣原體、立克次體、霉形體、螺旋體、放線菌等，此外還涉及藍(lán)細(xì)菌、紫色光合細(xì)菌等。第一節(jié)細(xì)菌分類地位

二、分類單元

屬種菌株具有共性的若干種的組合，應(yīng)與其他屬有明顯的差異。不同屬之間的16SrRnA序列有較大的差異，但尚未提出差異的量化標(biāo)準(zhǔn)。是微生物學(xué)分類的最基本單元，種可認(rèn)為是一群性質(zhì)相似的菌株，它與其他菌株群體有明顯差異。凡是16SrRNA序列同源性大于97%的兩株細(xì)菌即可確定為同一種。是不同來源的某一種細(xì)菌的純培養(yǎng)物。同一種細(xì)菌可以有許多菌株，其主要性狀應(yīng)完全相同，其次要性狀可稍有差異。第二節(jié)細(xì)菌的命名

一、俗名法

二、學(xué)名法

約定俗成的名字細(xì)菌的命名依據(jù)“國際細(xì)菌命名法規(guī)”的規(guī)定，學(xué)名用拉丁文，遵循“雙名法”。所謂“雙名法”就是每一種細(xì)菌的拉丁文名稱由屬名和種名兩部分構(gòu)成，屬名第一個(gè)字母必須大寫，其余均應(yīng)小寫，即使科名是以人名或地名命名的，種名頭一個(gè)字母也用小寫。整個(gè)屬名及種名在出版物中應(yīng)排成斜體。第三節(jié)細(xì)菌分類鑒定的標(biāo)準(zhǔn)

一、表型特征鑒定

二、種系發(fā)生關(guān)系鑒定

測(cè)定DNA中G+Cmol%核酸雜交法

16sRNA寡聚核苷酸序列

長(zhǎng)期以來，細(xì)菌分類鑒定的主要依據(jù)是其表型特征，即形態(tài)、染色、培養(yǎng)、細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)、生理生化及抗原性的特征。第四節(jié)細(xì)菌分類的方法

一、條目分類法

長(zhǎng)期以來，細(xì)菌分類采用傳統(tǒng)的雙歧檢索條目分類法。此法首選要在細(xì)菌的各種性狀中，選擇一項(xiàng)或數(shù)項(xiàng)被認(rèn)為是最主要的基本性質(zhì)，作為分類指征，在最高一級(jí)的分類等階上將細(xì)菌分成若干類別；然后在這些類別中選擇數(shù)項(xiàng)次要性狀為指征，將細(xì)菌作次一等階分類，依此類推，一直劃分到種。第四節(jié)細(xì)菌分類的方法

二、數(shù)值分類法

原理是根據(jù)數(shù)值分析，借助電子計(jì)算機(jī)，將擬分類的細(xì)菌按其性狀相似程度歸類定位。第五節(jié)細(xì)菌的分類體系

一、伯吉氏系統(tǒng)學(xué)手冊(cè)二、原核生物

三、國際系統(tǒng)與進(jìn)化微生物學(xué)雜志

四、國際著名的菌種保藏機(jī)構(gòu)

第六節(jié)細(xì)菌的鑒定

一、分類培養(yǎng)

一般只有純培養(yǎng)的細(xì)菌才能進(jìn)行鑒定。第六節(jié)細(xì)菌的鑒定

二、鑒定方法

除按表型特征、DNA同源性或rRNA序列比較等方法鑒定細(xì)菌外，還有用其他方法，如測(cè)定細(xì)菌的脂肪酸組成，用氣相－液相－質(zhì)譜分析細(xì)菌的脂肪酸譜，每一種細(xì)菌的脂肪酸譜是恒定的，可重復(fù)性好，因此此法可用于細(xì)菌的鑒定或分類，往往結(jié)合常規(guī)方法參照應(yīng)用。在有條件的單位可用PCR技術(shù)檢測(cè)鑒定細(xì)菌。第六節(jié)細(xì)菌的鑒定

三、鑒定程序

革蘭氏陽性細(xì)菌球菌桿菌絲狀及樹枝狀產(chǎn)生芽孢革蘭氏陽性大桿菌無芽孢抗酸染色陽性抗酸染色陰性革蘭氏陰性細(xì)菌球菌/球桿菌桿菌MZN染色陽性MZN染色陰性弧狀桿菌絲狀菌中等大小桿菌螺旋狀菌本次課小節(jié)4.《伯吉氏細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》和《伯吉氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》建立了細(xì)菌分類的公認(rèn)體系。建立了一套動(dòng)物致病菌檢測(cè)程序，商品化的快速鑒定系統(tǒng)已應(yīng)用于常規(guī)細(xì)菌學(xué)鑒定。

1.細(xì)菌的分類基本單元是種，屬和菌株也是動(dòng)物微生物學(xué)中常用的單元，細(xì)菌種命名遵循雙名法。2.細(xì)菌分類標(biāo)準(zhǔn)長(zhǎng)期以來以細(xì)菌的表型特征為依據(jù)的。3.近年來人們采用核酸分類方法逐漸得到認(rèn)識(shí)，特別是根據(jù)16SRNA基因序列進(jìn)行分類顯示出極大的優(yōu)越性。討論、思考題、作業(yè)1.細(xì)菌分類基本單元是什么，其概念如何。細(xì)菌屬和菌株的概念。

2.利用細(xì)菌株的概念分析“三株口服液”的科學(xué)性