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文檔簡介
關(guān)于蛋白質(zhì)合成及轉(zhuǎn)運(yùn)王鏡巖生物化學(xué)全第一節(jié)
蛋白質(zhì)合成的分子基礎(chǔ)
(要件)第2頁,共42頁,星期六,2024年,5月一、mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板
mRNA以核苷酸序列的方式攜帶遺傳信息,通過這些信息來指導(dǎo)合成多肽鏈中的氨基酸的序列。每一個氨基酸可通過mRNA上3個核苷酸序列組成的遺傳密碼來決定,這些密碼以連續(xù)的方式連接,組成讀碼框架。mRNA第3頁,共42頁,星期六,2024年,5月原核細(xì)胞mRNA的結(jié)構(gòu)特點5′3′順反子順反子順反子插入順序插入順序先導(dǎo)區(qū)末端順序AGGAGGUSD區(qū)半衰期短許多原核生物mRNA以多順反子形式存在AUG作為起始密碼;AUG上游7~12個核苷酸處有一被稱為SD序列的保守區(qū),16SrRNA3’-端反向互補(bǔ)而使mRNA與核糖體結(jié)合。第4頁,共42頁,星期六,2024年,5月真核細(xì)胞mRNA的結(jié)構(gòu)特點5′
“帽子”PolyA
3′
順反子m7G-5′ppp-N-3′p帽子結(jié)構(gòu)功能使mRNA免遭核酸酶的破壞使mRNA能與核糖體小亞基結(jié)合并開始合成蛋白質(zhì)被蛋白質(zhì)合成的起始因子所識別,從而促進(jìn)蛋白質(zhì)的合成。Poly(A)尾巴的功能是mRNA由細(xì)胞核進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)所必需的形式它大大提高了mRNA在細(xì)胞質(zhì)中的穩(wěn)定性AAAAAAA-OH第5頁,共42頁,星期六,2024年,5月
tRNA在蛋白質(zhì)合成中處于關(guān)鍵地位,它不但為每個三聯(lián)體密碼子譯成氨基酸提供接合體,還為準(zhǔn)確無誤地將所需氨基酸運(yùn)送到核糖體上提供運(yùn)送載體。1、tRNA的結(jié)構(gòu)特征—三葉草型二級結(jié)構(gòu)2、tRNA的功能:(1)被特定的氨酰-tRNA合成酶識別,使tRNA接受正確的活化氨基酸。(2)識別mRNA鏈上的密碼子。(3)在蛋白質(zhì)合成過程中,tRNA起著連接生長的多肽鏈與核糖體的作用。
tRNA第6頁,共42頁,星期六,2024年,5月tRNA含有兩個關(guān)鍵的部位:一個是氨基酸結(jié)合部位,另一個是與mRNA的結(jié)合部位。對于組成蛋白質(zhì)的20種氨基酸來說,每一種至少有一種tRNA來負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)運(yùn)。第7頁,共42頁,星期六,2024年,5月氨酰-tRNA合成酶特點a、專一性:
對氨基酸有極高的專一性,每種氨基酸都有專一的酶,只作用于L-氨基酸,不作用于D-氨基酸。
對tRNA具有極高專一性。含同義密碼子的tRNA由相同的氨酰-tRNA合成酶識別.b、校對作用:氨酰-tRNA合成酶的水解部位可以水解錯誤活化的氨基酸。
第8頁,共42頁,星期六,2024年,5月tRNA分子攜帶氨基酸的分子機(jī)制tRNA分子上與多肽合成有關(guān)的位點至少有4個,分別為:3’端CCA上的氨基酸接受位點氨酰-tRNA合成酶識別的位點核糖體識別位點反密碼子位點。第9頁,共42頁,星期六,2024年,5月氨基酸的活化EEAAEAAtRNAAAEtRNAAAEtRNAAA氨基酸ATP+氨酰腺苷酸E-AMPPPi第一步AMP第二步E氨基酸的活化3-氨酰-tRNA第10頁,共42頁,星期六,2024年,5月第11頁,共42頁,星期六,2024年,5月密碼子與反密碼子的配對關(guān)系反密碼子tRNA5
3
AUC5
mRNA3
密碼子123第12頁,共42頁,星期六,2024年,5月核糖體核糖體是由rRNA和多種蛋白質(zhì)結(jié)合而成的一種大的核糖核蛋白顆粒,蛋白質(zhì)肽鍵的合成就是在這種核糖體上進(jìn)行的。1、核糖體的結(jié)構(gòu)和組成2、核糖體的功能第13頁,共42頁,星期六,2024年,5月核糖體的組成原核生物核糖體的組成原核生物核糖體結(jié)構(gòu)示意圖第14頁,共42頁,星期六,2024年,5月第15頁,共42頁,星期六,2024年,5月原核細(xì)胞70S核糖體的A位、P位及mRNA結(jié)合部位示意圖anticodoncodon30S與mRNA結(jié)合部位P位(結(jié)合或接受肽基的部位)A位(結(jié)合或接受AA-tRNA的部位)50S5
3
mRNA第16頁,共42頁,星期六,2024年,5月第二節(jié)蛋白質(zhì)合成的機(jī)理
(原核生物)第17頁,共42頁,星期六,2024年,5月氨基酸的活化EEAAEAAtRNAAAEtRNAAAEtRNAAA氨基酸ATP+氨酰腺苷酸E-AMPPPi第一步AMP第二步E氨基酸的活化3-氨酰-tRNA第18頁,共42頁,星期六,2024年,5月N-甲酰甲硫氨酰-tRNAtMet的形成CHO-HN-CH-COO-tRNACH2CH2SCH3
+H2N-CH-COO-tRNACH2CH2SCH3Met-tRNAtMetfMet-tRNAtMetN10-甲酰FH4FH4轉(zhuǎn)甲酰酶第19頁,共42頁,星期六,2024年,5月原核生物多肽鏈的合成過程
原核生物多肽鏈的合成分為三個階段:肽鏈合成的起始、肽鏈的延伸、肽鏈合成的終止和釋放。1、肽鏈合成的起始2、肽鏈的延長3、肽鏈合成的終止及釋放第20頁,共42頁,星期六,2024年,5月翻譯開始于mRNA與核糖體的結(jié)合.在原核細(xì)生物中一個mRNA上可以有多個起始位點,為多個蛋白質(zhì)編碼。原核細(xì)胞中的核糖體是如何對mRNA分子內(nèi)如此眾多的AUG起始位點進(jìn)行識別?第21頁,共42頁,星期六,2024年,5月細(xì)菌的mRNA通常含有一段富含嘌呤堿基的序列,稱作SD序列,它們通常在起始AUG序列上游10個堿基左右的位置,能與細(xì)菌16SrRNA3’端的7個嘧啶堿基進(jìn)行堿基互補(bǔ)性的識別,以幫助從起始AUG處開始翻譯。第22頁,共42頁,星期六,2024年,5月
在真核生物的mRNA中,最靠近5’端的AUG序列通常是起始密碼。核糖體小亞基首先結(jié)合在mRNA的5’端,然后向3’端移動,直到AUG序列被tRNAiMet上的反密碼子識別。這種識別被類似GCCGCCpuCCAUGG這樣的序列所加強(qiáng),核糖體與它怎樣進(jìn)行的識別過程目前尚不清楚。無此序列,小亞基將不能識別AUG.第23頁,共42頁,星期六,2024年,5月階段原核真核功能
IF1
IF2
eIF2參與起始復(fù)合物的形成
IF3
eIF3、eIF4C起始CBPI與mRNA帽子結(jié)合
eIF4ABF參與尋找第一個AUG
eIF5協(xié)助eIF2、eIF3、eIF4C的釋放
eIF6協(xié)助60S亞基從無活性的核糖體上解離
EF-Tu
eEF1
協(xié)助氨酰-tRNA進(jìn)入核糖體延長EF-Ts
eEF1
幫助EF-Tu、eEF1
周轉(zhuǎn)
EF-G
eEF2移位因子
RF-1終止eRF釋放完整的肽鏈
RF-2第24頁,共42頁,星期六,2024年,5月肽鏈合成的起始30S亞基?mRNAIF3-IF1復(fù)合物30S?mRNA?GTP-fMet–tRNA-IF2-IF1復(fù)合物70S起始復(fù)合物codonanticodonP位A位
mRNA
+30S亞基-IF3A位IF-35
3
IF2GTPP位IF3IF2IF1IF2-GTP-fMet-tRNAIF350S亞基IF2+IF1+GDP+PiIF-1IF170S起始復(fù)合物第25頁,共42頁,星期六,2024年,5月肽鏈的延長12122323進(jìn)位肽鍵形成移位進(jìn)位(Tu\Ts)GTPGTPN-端235′3′C-端肽鍵形成15′3′(EF-G)
第26頁,共42頁,星期六,2024年,5月肽鏈合成的終止及釋放(1)釋放因子RF1或RF2進(jìn)入核糖體A位。(2)多肽鏈的釋放(3)70S核糖體解離5
3
UAG30S亞基50S亞基5
3
UAGtRNARF第27頁,共42頁,星期六,2024年,5月肽鍵的形成第28頁,共42頁,星期六,2024年,5月Tu\Ts循環(huán)第29頁,共42頁,星期六,2024年,5月多核糖體與核糖體循環(huán)合成完畢的肽鏈多核糖體3ˊmRNA延伸中的肽鏈5ˊ核糖體循環(huán)第30頁,共42頁,星期六,2024年,5月多核糖體第一個編碼區(qū)第一個編碼區(qū)第二個編碼區(qū)第二個編碼區(qū)終止\起始終止起始mRNAmRNA5′5′3′3′第31頁,共42頁,星期六,2024年,5月真核生物多肽鏈的合成1、真核細(xì)胞核糖體比原核細(xì)胞核糖體更大更復(fù)雜;2、起始氨基酸為Met,不是fMet;3、肽鏈合成的起始:由40S核糖體亞基首先識別mRNA的5’端-帽子,然后沿mRNA移動尋找AUG;4、起始因子有12種,但只有2種延長因子和1種終止因子;5、真核細(xì)胞種線粒體、葉綠體的核糖體大小、組成及蛋白質(zhì)合成過程都類似于原核細(xì)胞。第32頁,共42頁,星期六,2024年,5月第三節(jié)
蛋白質(zhì)的運(yùn)輸及翻譯后修飾
第33頁,共42頁,星期六,2024年,5月在核糖體上新合成的多肽被送往細(xì)胞的各個部分,以行使各自的生物功能,所以新合成的多肽的輸送是有目的、定向地進(jìn)行的。
對真核生物來說,游離狀態(tài)的核糖體停留在胞漿中,只合成供裝配線粒體及葉綠體膜的蛋白質(zhì)。結(jié)合于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的核糖體新合成的多肽進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)進(jìn)行后加工。
第34頁,共42頁,星期六,2024年,5月一、蛋白質(zhì)通過其信號肽引導(dǎo)到目的地
每需要運(yùn)輸?shù)亩嚯亩己幸欢伟被嵝蛄校Q為信號肽序列(signalleadersequence),引導(dǎo)多肽至不同的運(yùn)系統(tǒng)。在真核細(xì)胞中,當(dāng)某一種多肽的N端剛開始合成不久,這種多肽合成后的去向就已被決定。
疏水性的氨基酸區(qū)
信號肽酶識別位點
第35頁,共42頁,星期六,2024年,5月SRP:信號識別體;2個功能(1)識別信號肽,(2)暫時阻止肽鏈延伸。
SRP受體停泊蛋白第36頁,共42頁,星期六,2024年,5月分泌蛋白質(zhì)的合成和胞吐作用內(nèi)質(zhì)網(wǎng)高爾基體泡泡泡融入質(zhì)膜核糖體芽泡第37頁,共42頁,星期六,2024年,5月線粒體外膜線粒體內(nèi)膜帶有導(dǎo)肽的線粒體蛋白質(zhì)前體跨膜運(yùn)送過程示意圖內(nèi)外膜接觸位點的蛋白質(zhì)通道線粒體hsp70受體蛋白hsp70導(dǎo)肽蛋白酶切除導(dǎo)肽第38頁,共42頁,星期六,2024年,5月1、肽鏈末端的修飾:
N-端fMet或Met的切除2、信號序列的切除3、二硫鍵的形成4、部分肽段的切
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