血友病的基因診斷_第1頁
血友病的基因診斷_第2頁
血友病的基因診斷_第3頁
血友病的基因診斷_第4頁
血友病的基因診斷_第5頁
已閱讀5頁,還剩58頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領(lǐng)

文檔簡介

1血友病的基因診斷2背景血友病A10~20/10萬,絕對患病數(shù)約13~26萬(中國)無完整的診斷體系,誤診、漏診、病死率高替代治療:傳播疾病,經(jīng)濟負擔重感染HCV,HBV,HIV,$14萬/年/人(美國)致死(殘)率極高

遺傳后代3FVIII(Xq28)FIX(Xq27)qpX染色體血友病A、B4內(nèi)含子22倒位5結(jié)果(1)

內(nèi)含子22倒位檢測結(jié)果6內(nèi)含子1倒位機制7內(nèi)含子1倒位檢測方法2Kb1.5Kb2Kb1.5Kb8血友病攜帶者和產(chǎn)前診斷流程PCR擴增外周血DNA抽提(攜帶者)直接核酸測析間接聯(lián)鎖分析明確診斷長鏈PCR檢測內(nèi)含子1,22倒位血友病A①、②、③羊水DNA抽提(胎兒)①③②間接基因診斷血友病A10

第一代標志

F8基因內(nèi)的BclⅠRFLPF8基因內(nèi)兩個STR位點F8基因外的St14VNTR11

家系15BclIRFLP位點多態(tài)性連鎖分析12家系13st14位點VNTR多態(tài)的基因連鎖分析13內(nèi)含子13中STR多態(tài)位點用于家系12基因連鎖分析146個與F8緊密連鎖的STR位點:

DXS15、DXS9901、G6PD、DXS1073和DXS1108距F81.5Mb內(nèi)1個F8內(nèi)的STR位點(F8Civs13)性別位點為牙釉蛋白基因(Amelogeningene)終產(chǎn)物X染色體102bp,Y染色體108bp第二代標志15第三代位點的開發(fā)對象:69名正常女性、31個血友病A家系(120名相關(guān)成員)方法:在人類基因組數(shù)據(jù)庫中選擇了位于F8基因兩端0.5CM內(nèi)的三個STR位點(5_226、5_147及3_486),F(xiàn)8基因內(nèi)的1個STR位點(INTRON25)及距離F8基因2CM內(nèi)的DXS8069位點,以多重熒光PCR法檢測5個微衛(wèi)星位點的多態(tài)性16F8CA22DXS1073G6PDDXS9901DXS15DXS1108ST14F8Civs13F8Intron25DXS10735-226F8Civs133-4865-147DXS806917Marker雜合度多態(tài)性單獨可診斷率5_22672.46%1280.65%5_14749.27%654.84%DXS806972.46%664.52%3_48649.27%658.06%INTRON2531.88%341.94%聯(lián)合5個STR位點可對所有要求做攜帶者及產(chǎn)前診斷的血友病A家系提供遺傳連鎖分析結(jié)果且與F8基因直接檢測結(jié)果相符結(jié)果與討論187重熒光PCR技術(shù)降低重組發(fā)生率未見漏診和誤診診斷率和準確率100%F8Intron25DXS10735-226F8Civs133-4865-147DXS8069結(jié)果與討論特殊血友病A家系的基因診斷

20先證者自幼皮膚、頭顱撞傷后及拔牙及手術(shù)后有出血難止,曾發(fā)生過顱內(nèi)出血BT、PT正常APTT延長,F(xiàn)VIII:C2%輸注全血或抗血友病球蛋白治療有效先證者已故21FVIII:C

2%22直接基因測序結(jié)果:直接測序未檢測出突變。原因:據(jù)文獻報道FVIII直接基因測序有1%-10%的患者查不到基因突變(HumMutat.2002Oct;20(4):267-74)突變可能在內(nèi)含子中可能存在大的缺失

23攜帶者診斷結(jié)果攜帶者及待檢者F8內(nèi)含子22倒位均為陰性

24間接診斷結(jié)果

BclI酶切圖

III-1表姐:

-/-II-2舅媽:-/-II-3母親:+/-II-4父親:+/+III-2待檢者:+/+M25BclI酶切圖測序圖BclI酶切識別位點T/GATCA圖a待檢者測序圖,含BclI酶切位點圖b表姐測序圖,不含BclI酶切位點ab26間接診斷結(jié)果

ca13基因掃描III-1表姐:144/144III-2待檢者:142/142II-3母親:142/144II-2舅媽:140/144II-4父親:142/-27間接診斷結(jié)果

ca22基因掃描III-1表姐:79/79III-2待檢者:79/83II-3母親:83/79II-2舅媽:79/79II-4父親:79/-28血友病A攜帶者間接診斷結(jié)果分析表姐舅媽父親母親待檢者綜合A13、CA22及BclI信息,待檢者與其表姐有不同的X染色體。舅舅女性血友病A的基因及產(chǎn)前診斷30標本來源

先證者(II-1),女,21歲,漢族,自幼有踝關(guān)節(jié)及膝關(guān)節(jié)有自發(fā)出血,臨床診斷為血友病A,冷沉淀及濃縮FVIII輸注有效,因懷孕要求作基因診斷及產(chǎn)前診斷??APTTsPTsTTsFgg/LvWF%FVIII:C%I-128.911.317.73.3141121I-227.21018.62.4124118II-175.212.117.72.11212.1II-23911.518.82.8142107II-340.112.520.651.916411931基因檢測結(jié)果F8內(nèi)含子22倒位F8內(nèi)含子1倒位先證者陽性(攜帶者)陰性胎兒陰性陰性其他人陰性陰性先證者F8基因所有外顯子及其側(cè)翼序列擴增測序(-)32遺傳連鎖分析319218150282340172374323212150282346172365319218150282340172374325220150280340172374325220150280340172374319218150282340172374325220150280340172374323212150282346172365325220150280340172374HA患者正常男性胎兒正常女性先證者圖2家系多態(tài)性位點遺傳連鎖分析圖IIIIII121234132521213028034017237432521213028034017237433X染色體隨機滅活模式檢測

先證者來自母系的X染色體大部分被滅活,而來自父系的X染色體保留活性家系其他成員及胎兒為X染色體隨機滅活家系成員HpaII酶切前HpaII酶切后SizeHeightSizeHeight父I-131074483104083母I-2298/3041502/1183298/304285/135先證者II-1304/3102543/2424304/3101233/49妹II-2298/3106054/5233298/3103208/2166弟II-33047122304917胎兒III-1307/3106475/6024307/3101337/216334發(fā)病機制先證者一條X染色體發(fā)生了F8基因內(nèi)含子22倒位,而未檢測到其它F8基因相關(guān)突變遺傳連鎖分析發(fā)現(xiàn)該女性患者的兩條X染色體分別遺傳自其父母,排除其為單親二倍體先證者的X染色體滅活呈非隨機性滅活,其遺傳自父親的X染色體大部分保留了活性35女性血友病A

女性血友?。?FVIII:C3.4%,FVIII:Ag4.2%Leu1975Pro

和3637-3638insA父親:(FVIII:C6.9%,FVIII:Ag7.4%),Leu1975PromutationJThrombosisandhaemostasis2006363637-3638insA突變是如何產(chǎn)生的?PCR擴增患者的cDNA(2809bp,exon14toexon19),該片段含上述兩種突變,產(chǎn)物進行TA克隆測序測序結(jié)果顯示該突變來自患者的母親父親的等位基因母親的等位基因373637-3638insA突變是如何產(chǎn)生的?母親外周血DNA的F8基因沒有檢測到基因突變母親不同組織的DNAF8基因檢測也沒有檢測到突變,說明母親不是體細胞的嵌和體表明女性血友病患者3637-3638insA是一種自發(fā)突變(denovo)38框移突變(3637-3638insA)定量

RT-PCR顯示:患者的FVIIImRNA減少結(jié)論:女性血友病A患者是其F8基因中來自父親的Leu1975Pro突變和自發(fā)突變

3637-3638insA,雙重雜合突變導致的39一個血友病家系,父親為血友病A,兒子為血友病B同時存在HA和HB患者家系的基因診斷HAHB40FVIII(Xq28)FIX(Xq27)qp染色體X血友病A、B+41ResultofphynotypedetectionFamilymember

APTT(s)PT(s)TT(s)Fg(g/L)FⅧ:C(%)FⅨ:C(%)I-337.312.316.82.8149.0104.7I-442.514.017.04.3128.094.4II-139.512.116.42.5154.078.3II-340.612.517.02.5145.068.4II-688.012.215.33.20.398.3II-739.912.519.82.198.082.2II-836.611.616.32.8139.098.1III-790.012.016.22.375.81.9Referencerange

35±1013±317±32.0-4.050-15050-15042基因診斷結(jié)果

F8INV22:父親(+)其他成員(-)

F8INV1:所有成員(-)F9測序:兒子mutation(32772A→T,Ser365Cys),

母親同位置雜合子阿姨、外公(-)父親(-)43

Resultoflinkageanalysis

399340208166313365399340208166313365399340208166313365399340208166313365389336210164313358395350212180313358395350212180313358395350212180313358ⅠⅡⅢ346789107??+:FIX基因缺陷++__44外周血細胞、組織細胞外公體細胞、生殖細胞嵌合體外公

阿姨Peripheralbloodbuccalcavitycells

Enqomphesisrate:14.1%嵌合體檢測

45凝血因子V和VIII聯(lián)合缺陷;常染色體隱性遺傳性疾病;發(fā)病率為1/100萬,男女均可發(fā)病致病基因并非F5,F(xiàn)8基因,而是與蛋白轉(zhuǎn)運相關(guān)受體的編碼基因突變導致:LMAN1(70%),MCFD2(30%)分子發(fā)病機制研究F5F8D家系基因診斷46F5F8D家系基因診斷先證者1:10歲女孩,口腔粘膜反復出血患者母親懷孕要求做產(chǎn)前診斷47二、F5F8D家系基因診斷先證者2:50歲女性,貧血,凝血功能不佳,長期痔瘡出血先證者3:47歲女性,凝血功能不佳48二、F5F8D家系基因診斷先證者4:50歲男性,平時無明顯的凝血功能異?,F(xiàn)象,因痔瘡出血難止于術(shù)前進行凝血功能篩查49先證者APTTsPTsFV:C%FVIII:C%182.219.69.124.2271.622.17.625374.618.314.519.6470.318.29.415.7F5F8D家系實驗室檢測結(jié)果50F5F8D家系基因檢測結(jié)果先證者1:LMAN1:Exon8nt925-933insA305frameshift編碼20個氨基酸后終止LMAN1:Exon11nt1387C>CT(X71661.1)456Arg>Stop母親父親產(chǎn)前診斷:胎兒女性,且攜帶了來自父親的突變51先證者2、3:MCFD2:Exon4nt501T>C,導致第136位氨基酸錯義突變,136Ile>Thr

F5F8D家系基因檢測結(jié)果52F5F8D家系基因檢測結(jié)果先證者4:LMAN1:Exon5nt636C>T,導致202R>Stop先證者4之子(雜合子):LMAN1:Exon5nt636C>CT間接診斷中的基因重組54HA家系情況先證者II-3為重型血友病A患者,F(xiàn)8C<1.0%II-5要求作攜帶者診斷?55HA家系檢測結(jié)果22倒位:均為陰性1倒位:先證者(II-3)為陽性,女性(II-5)為攜帶者。2Kb1.5Kb2Kb1.5Kb56HA家系遺傳連鎖分析的結(jié)果5A1542032031241568086C1542032031241568496B1541951951281568086ⅠⅡ123B1541951951281568086C1542032031281568086A1542032031241568086?F8F8F8F857HA家系診斷結(jié)果內(nèi)含子1倒位是該家系HA發(fā)生的致病機制,II-5為內(nèi)含子1倒位攜帶者遺傳連鎖分析發(fā)現(xiàn)II-5在ST14,DXS15,DXS9901,G6PD與DXS1073,F(xiàn)8Civs13,CA22,DXS1108間發(fā)生染色體的同源重組58結(jié)論

在應用間接診斷進行HA家系攜帶者及產(chǎn)前診斷時,不能僅使用單一的位點進行診斷,必須聯(lián)合應用多

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論