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文檔簡介
蛋白質的相關計算Protein-relatedcalculationsPre-classquestiononproteins蛋白質課前提問1、氨基酸的元素組成、結構通式、結構特點、種類2、氨基酸形成蛋白質的方式、水中H和O的來源3、多肽的命名原則是什么?4、蛋白質結構多樣性的原因是什么?目錄CONTENT01蛋白質結構復習Proteinstructurereview04Protein-relatedcalculations蛋白質相關計算01040104蛋白質結構復習PARTONE蛋白質的基本單位——氨基酸1.元素組成除
外,有的還含有
等。C、H、O、NS2.結構通式CHH2NR氨基羧基側鏈基團COHO分子式C2H4O2N-R3.種類21種氨基酸非必需氨基酸必需氨基酸人體可自身合成的氨基酸,共13種人體不能自身合成的氨基酸,必須從外界環(huán)境中獲取,共8種
諧音巧記八種必需氨基酸苯丙氨酸、蛋(甲硫)氨酸、賴氨酸、蘇氨酸、色氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸"笨蛋,來宿舍晾一晾鞋”1.脫水縮合:
H2O肽鍵-OH‖O-C-CR2H---NH--C-CR1H2NH--‖OOH-H二肽一、氨基酸的結合方式2.肽命名原則:
肽鍵-C-COOHR3H---NH-HOH-肽鍵‖O-CR1H2NH---C-C-CR2H---NH-‖O三肽H2OH2O脫出來的H2OH來自氨基和羧基1O來自羧基2一、氨基酸的結合方式2.肽命名原則:
肽鍵-C-COOHR3H--NH-肽鍵‖O-CR1H2NH---C-C-CR2H---NH-‖O三肽H2OH2O以此類推,多個氨基酸分子脫水縮合而成的含有多個肽鍵的化合物,叫多肽。一、氨基酸的結合方式氨基酸層次肽鏈層次氨基酸的種類不同氨基酸的數量不同氨基酸的排列順序千變萬化多肽鏈盤曲、折疊的方式及其形成的空間結構千差萬別蛋白質功能的多樣性3.蛋白質結構多樣性的原因:
蛋白質相關計算PARTTWO1.肽鍵與氨基酸的關系氨基酸數肽鏈數肽鍵數脫水數888123765765---======規(guī)律1:在鏈狀多肽中:
肽鍵數=脫去的水分子數=氨基酸數-肽鏈數氨基酸數肽鍵數脫水數333555====1.肽鍵與氨基酸的關系規(guī)律2:在環(huán)肽中:
肽鍵數=脫去的水分子數=氨基酸數一.計算脫水數/肽鍵數數1.胰島素分子有A、B兩條肽鏈,A鏈有21個氨基酸,B鏈有30個氨基酸,胰島素分子中肽鍵的數目是()A.48個B.49個
C.50個D.51個B2.游離—NH2(—COOH
)數目①一條肽鏈至少含有____個羧基和_____個氨基。②m條肽鏈至少含有____個羧基和_____個氨基。11mm2.游離—NH2(—COOH
)數目規(guī)律3:至少含有的游離氨基(羧基
)=肽鏈數規(guī)律4:游離氨基(羧基)=肽鏈數+R基中氨基(羧基
)數環(huán)肽呢?2.游離—NH2(—COOH
)數目環(huán)肽:游離氨基(羧基
)=R基中氨基(羧基
)數2.現有氨基酸800個,其中氨基總數為810個,羧基總數為808個,則由這些氨基酸合成的含有2條肽鏈的蛋白質共有肽鍵、氨基和羧基的數目依次分別為()A.798、2和2B.798、12和10C.799、1和1D.799、11和9B3.蛋白質相對分子質量【規(guī)律】每形成一個肽鍵,脫去
,相對分子質量減去
?!緮U展】每形成一個二硫鍵,脫去
,相對分子質量減去
。
1個H2O182個H2SHSHSS+2H3.蛋白質相對分子質量SHSHSS+2H=氨基酸數×氨基酸平均分子質量-
。
脫水數×18=氨基酸數×氨基酸平均分子質量-
。
脫水數×18-二硫鍵數×23.組成某蛋白質的氨基酸的平均相對分子質量為128,1條含有100個肽鍵的多肽鏈的分子質量為多少?蛋白質的相對分子質量=氨基酸數×氨基酸的平均相對分子質量—脫水數×18蛋白質分子質量=101×128-100×18=11128肽鏈數目氨基酸數肽鍵數目脫去水分子數氨基數目羧基數目多肽(蛋白質)的相對分子質量1條nm條n環(huán)狀多肽nn-1n-1至少1個至少1個na-18(n-1)n-mn-m至少m個至少m個na-18(n-m)nn至少0個至少0個na-18n蛋白質的計算相關小結
設氨基酸的平均相對分子質量為a,由n個氨基酸分別形成1條鏈狀多肽或m條鏈狀多肽。注:若肽鏈間含有二硫鍵,則蛋白質的相對分子質量=
。(p為二硫鍵的個數,n為氨基酸數,m為肽鏈數,a為氨基酸的平均相對分子質量)。na-18(n-m)-2p4.蛋白質中原子個數的計算?一個氨基酸中:
C2H4O2N-R①C原子數=R基中的C原子數+2②H原子數=R基中的H原子數+4③
O原子數=R基中的O原子數+2④N原子數=R基中的N原子數+1
氨基酸脫水縮合形成多肽過程中,脫去水,H、O原子數目減少,C、N原子數目不減少CHRCOOHH2N
—CH2NR1H—C—ON—H
C—R2H—C—ON—H
C—R3H—C—ON—HR4HCCOOH4.蛋白質中原子個數的計算C原子、H原子規(guī)律?蛋白質上C原子數=
蛋白質上H原子數=
R基中的C原子數氨基酸數×2(主鏈上)各氨基酸中H原子總數脫去水分子數×2+-蛋白質上N原子數=
蛋白質上O原子數=
肽鏈上的N原子、O原子規(guī)律?肽鍵數肽鏈數R基上的N原子數肽鍵數肽鏈數×2R基上的O原子數=各氨基酸中N原子的總數=各氨基酸中O原子總數-脫水數
—CH2NR1H—C—ON—H
C—R2H—C—ON—H
C—R3H—C—ON—HR4HCCOOH4.蛋白質中原子個數的計算++++4.某蛋白質分子中有M個氨基酸,其中有N條肽鏈,則此蛋白質中至少含有多少個氧原子()A.2MB.M-NC.MD.M+N
—CH2NHR1—C—ON—H
CHR2—C—ON—H
C—COOHHR3O=肽鍵數+2×肽鏈數+R基上O原子數D四.計算N、O原子的數目常用公式總結①脫水數=肽鍵數=__________-肽鏈數②氨基數=肽鏈數+________________=各氨基酸中氨基的總數-肽鍵數③羧基數=肽鏈數+R基上的羧基數=_______________________-肽鍵數④蛋白質相對分子質量=
各氨基酸平均相對分子質量×氨基酸數-18×脫水數⑤N原子數=肽鍵數+肽鏈數+R基上的N原子數=各氨基酸中N的總數⑥O原子數=肽鍵數+_____________+R基上的O原子數=各氨基酸中O的總數-___________氨基酸數R基上的氨基數各氨基酸中羧基的總數2×肽鏈數脫水數5.氨基酸的排列與多肽的種類計算1、3種氨基酸,每種足量,可形成
種三肽2、n種氨基酸,每種足量,可形成
種m肽?3、3種氨基酸,每種只有一個,可形成
種三肽4、n種氨基酸,每種只有一個,可形成
種多肽33nm3×2×1n×(n-1)×(n-2)×....×1333、、、nnnn321、、、nn-1n-21氨基酸肽鍵3×3×3n×n×n×、、、×n當堂小測1
如圖為牛胰島素結構圖,該物質中—S—S—是由兩個—SH脫去兩個H形成的。下列說法正確的是A.牛胰島素含有50個肽鍵B.牛胰島素中至少含有2個—NH2和2個
—COOHC.牛胰島素水解產物含有21種不同的氨基酸D.牛胰島素形成時,減少的相對分子質量為882當堂小測2如圖表示某蛋白質(無環(huán)狀肽)中氨基酸和相關基團的數目。下列有關敘述錯誤的是A.共有2條肽鏈B.共有124個肽鍵C.形成此蛋白質時,相對
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