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RibosomalRNAsasEvolutionaryChronometersReasons:AncientmoleculesFunctionallyconstantUniversallydistributedModeratelywellconservedinsequenceacrossbroadphylogeneticdistancesThe16SrRNAor18SrRNATechniqueInProkaryotes:5SrRNAistoosmall,containslimitedinfo23SrRNAistoolarge,toodifficulttomanage16SrRNAhastherightsizeforstudiesInEukaryotes:18SrRNAisusedforphylogeneticmeasurementsPhylogeneticTreesfromDNASequences
第二節(jié)微生物的分類單位和命名一、種以上的系統(tǒng)分類單位界Kingdom(拉,Regnum)門Phylum(拉,Phylum)亞門綱Class(拉,Classis)亞綱目Order(拉,Ordo)亞目科Family(拉,F(xiàn)amilia)亞科屬Genus(拉,Genus
)亞屬種Species(拉,Species)亞種第三節(jié)細(xì)菌分類的依據(jù)和方法
一、形態(tài)學(xué)特征細(xì)胞形態(tài)
群體形態(tài):平板菌落特征和液體培養(yǎng)特征
二、生理生化特征:
1、利用營養(yǎng)物質(zhì)的能力
2、細(xì)菌對生活環(huán)境的要求及抗逆性
3、生化反應(yīng)和酶
4、營養(yǎng)類型
5、代謝產(chǎn)物
6、對抗生素的敏感性三、血清學(xué)試驗(yàn)與噬菌體分型四、氨基酸順序和蛋白質(zhì)分析五、核酸的堿基組成和分子雜交
1、DNA(G+C)mol/L2、核酸雜交(DNA-DNA,DNA-rRNA,核酸探針)
3、16SrRNA核苷酸分類目錄六、遺傳重組第四節(jié)細(xì)菌的分類系統(tǒng)和分類位置細(xì)菌的分類系統(tǒng)微生物分類的國際性權(quán)威著作<<伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊>>,從1923年來出版9個(gè)版本,新版為<<伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌手冊>>Bergey`sManualofDeterminativeBacteriology,9th1994。QuestionsWhyisRibosomalRNAsusedasEvolutionaryChronometersWhyis16SrRNAemployedtostudyphylogeneticsratherthanthesmaller5SrRNRandthelarge23SrRNAinProkaryotics?Howtosequence16SrRNAfrominsidethecells?Howtoidentifyaprokaryoticoreukaryoticorganismbasedon16Sor18SrRNA?HowtobuildPhylogeneticTreesfromDNASequences?Whyitissaidthearc
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