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文檔簡介
17核酸合成第十七章核酸的生物合成17核酸合成DNA↓DNA→RNA→蛋白質(zhì)→性狀←↓RNA中心法則復(fù)制
轉(zhuǎn)錄反轉(zhuǎn)錄RNA復(fù)制
翻譯17核酸合成一、半保留復(fù)制(掌握)據(jù)Watson,Crick推測。
子代DNA分子的一條鏈來自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻摹?958年Meselson和Stahl用15N標(biāo)記DNA試驗證明試驗用氮源為H415NCl的培養(yǎng)基培養(yǎng)大腸桿菌12代后轉(zhuǎn)入H4NCl培養(yǎng)基培養(yǎng),定時分離DNA氯化銫密度梯度離心第一節(jié)DNA的復(fù)制17核酸合成0代1代2代對照15N15N14N14N15N14N17核酸合成二、復(fù)制起點、方式等概念(掌握)
復(fù)制子
能獨立進行復(fù)制的DNA片段。復(fù)制起點控制復(fù)制起始的DNA片段。
復(fù)制方向復(fù)制叉前移方向。
復(fù)制方式從復(fù)制起點開始向一端復(fù)制,叫單向復(fù)制。從復(fù)制起點開始向兩端復(fù)制,叫雙向復(fù)制。兩鏈同時復(fù)制,叫對稱復(fù)制。
兩鏈不同時(一前一后)復(fù)制,叫不對稱復(fù)制。
復(fù)制叉
兩鏈局部解開后形成的Y(丫)字狀結(jié)構(gòu)。17核酸合成
單向復(fù)制
終點
復(fù)制子
復(fù)制眼
復(fù)制叉→
起點
17核酸合成
雙向復(fù)制
起點
終點
終點
復(fù)制叉→←復(fù)制叉
復(fù)制子
復(fù)制子
復(fù)制眼17核酸合成單鏈環(huán)狀DNA主要采用滾環(huán)式復(fù)制5′3′5′3′5′17核酸合成θ型17核酸合成單向復(fù)制i雙向復(fù)制觀察到的放射自顯影圖象17核酸合成真核生物DNA的多起點雙向復(fù)制17核酸合成三、原核細胞DNA復(fù)制有關(guān)酶類(重點)(一)DNA聚合酶(Pol)(dNMP)n+dNTPMg2+(dNMP)n+1+PPi2、特點(1)底物是dNTP(2)需模板。(單鏈DNA,方向3′→5′。)(3)需引物3′-OH。(4)新鏈合成方向是5′→3′。1、反應(yīng)(5)產(chǎn)物與母DNA分子相同。
或者新合成的鏈與模板鏈互補。17核酸合成OH+OHPPPPPPPPP17核酸合成
3、酶功能多個功能a聚合功能合成新鏈b3′→5′外切功能校對c5′→3′外切功能
切除引物17核酸合成4、大腸桿菌DNA聚合酶聚合酶ⅠⅡⅢⅣⅤ結(jié)構(gòu)基因polApolBpolCdinBumuC/D
亞基數(shù)1≥7≥10相對分子質(zhì)量103000880008300003′外切功能+++5′外切功能+聚合速度(個1000~1200240015000~60000持續(xù)合成能力3~2001500≥500000功能切引物、修復(fù)修復(fù)復(fù)制SOS修復(fù)17核酸合成(二)DNA連接酶1、反應(yīng)===-===→=======T4連接酶也可==+==→====2、能量原核NAD+真核、噬菌體ATP3、過程
連接酶+ATP/NAD→AMP-連接酶′
+PPi/NMP
AMP-連接酶′
+
5′——→AMP
5′——+連接酶
——3′+AMP
5′——→————+AMP
4、功能
在復(fù)制、修復(fù)、重組中均起重要作用17核酸合成(三)引物(合成)酶合成引物
除底物是核苷三磷酸、不需引物外,同DNA聚合酶與轉(zhuǎn)錄酶區(qū)別:在DNA單鏈上合成10核苷酸。(四)解鏈酶(解螺旋酶、DnaB)破壞氫鍵,解開雙螺旋。(五)拓撲異構(gòu)酶Ⅰ切1不需ATP用于復(fù)制或轉(zhuǎn)錄Ⅱ切2需ATP用于復(fù)制(六)單鏈結(jié)合蛋白與單鏈結(jié)合,穩(wěn)定單鏈區(qū)17核酸合成17核酸合成四、復(fù)制過程(重點、難點)(一)起始主要反應(yīng):由DnaA識別起點并解開3個;由DnaB(C助之)解鏈擴大單鏈區(qū);由拓撲異構(gòu)酶消除超螺旋;由單鏈結(jié)合蛋白穩(wěn)定單鏈區(qū);形成復(fù)制叉由引物酶在起點合成引物。17核酸合成※#起點終點DnaADnaADnaBDnaB拓撲酶拓撲酶SSBSSBDnaBDnaB拓撲酶拓撲酶SSBSSB17核酸合成(二)延伸主要反應(yīng):
聚合酶Ⅲ在引物3′端緊隨復(fù)制叉連續(xù)合成前導(dǎo)鏈;解鏈繼續(xù)至適當(dāng)位置,反向合成滯后鏈引物,聚合酶Ⅲ在引物3′端反向合成岡崎片段,如此反復(fù)斷續(xù)合成;岡崎片段合成至前一個引物5′端,由聚合酶Ⅰ切除引物并填補。
由連接酶連接相鄰的岡崎片段;
直至復(fù)制叉前移至終點(終止子)。17核酸合成引物前導(dǎo)鏈適當(dāng)位置岡崎片段適當(dāng)位置半不連續(xù)合成半保留復(fù)制滯后鏈17核酸合成17核酸合成引物前導(dǎo)鏈岡崎片段聚合酶Ⅲ聚合酶Ⅰ連接酶DnaB拓撲酶SSBSSB引物酶17核酸合成(三)終止主要反應(yīng):兩鏈解開,由聚合酶Ⅰ填補空缺;連接酶連接。終止子上結(jié)合有相關(guān)蛋白質(zhì),阻止復(fù)制叉繼續(xù)前移。若是單向復(fù)制,則無終止子,轉(zhuǎn)一圈即可。17核酸合成聚合酶Ⅰ連接酶17核酸合成五、真核DNA復(fù)制特點(重點)鏈狀DNA1、起點多2、雙向復(fù)制3、岡崎片段小4、聚合速度慢5、聚合酶不同6、終止不明顯7、末端復(fù)制復(fù)雜17核酸合成
動物DNA聚合酶(P425表5)
α/Ⅰβ/Ⅳγ/Mδ/Ⅲε/Ⅱ定位核核線粒體核核亞基數(shù)4122≥1外切活性無無3′3′3′引物合成有活性無無無無持續(xù)能力中低高有PCNA時高高抑制劑
蚜腸霉素雙脫氧TTP雙脫氧TTP蚜腸霉素蚜腸霉素功能合成引物修復(fù)復(fù)制復(fù)制修復(fù)17核酸合成細菌和真核復(fù)制酶比較(P426表6)
組成細菌真核
復(fù)制酶聚合酶Ⅲ聚合酶αδ
進行性因子β夾子PCNA
定位因子γ復(fù)合物RF-C
引物合成酶引物酶聚合酶α
去除引物聚合酶ⅠRNaseH1/MF-1
滯后鏈修復(fù)聚合酶Ⅰ連接酶聚合酶ε連接酶Ⅰ
解螺旋酶DnaBT抗原
消除張力拓撲異構(gòu)酶拓撲異構(gòu)酶
單鏈結(jié)合SSBRP-A17核酸合成端粒
線性DNA分子末端的特殊結(jié)構(gòu),由許多重復(fù)的短序列組成,富含GC對。
如四膜蟲為TTGGG或GGGTTG;
人為TTAGGG。
端粒酶
含有與端?;パa的RNA的逆轉(zhuǎn)錄酶。(RNA長約150個)
作用:延長端粒
分布:生殖細胞和癌細胞
端粒功能
穩(wěn)定末端結(jié)構(gòu),輔助末端復(fù)制17核酸合成生物細胞DNA復(fù)制分子機制的基本特點1、復(fù)制是半保留式的2、復(fù)制起始于特定位置,真核有多個3、復(fù)制可單向,可雙向4、新鏈延長方向為5′→3′,每次增加一個核苷酸5、復(fù)制是半不連續(xù)的6、需引物,后被切去17核酸合成
DNA損傷
一些理化生等因素引起的DNA一級結(jié)構(gòu)改變。
理紫外線、電離輻射等化堿基類似物、堿基修飾劑、嵌入染料等5-BrU烷化劑、亞硝酸吖啶生堿基錯配、DNA重組、病毒整合等DNA損傷修復(fù)
DNA損傷通過一定作用復(fù)原或基本復(fù)原的過程。
突變DNA損傷未能復(fù)原引起細胞遺傳性狀改變。第二節(jié)DNA損傷、修復(fù)與突變17核酸合成
一、修復(fù)(熟悉)
(一)錯配修復(fù)
定義與GATC序列相關(guān)的針對錯配核苷酸的切除修復(fù)。過程Muts二聚體找到錯配點,Mutl二聚體與之結(jié)合,DNA在聚合體移動至GATC序列,使錯配段成環(huán),MutH在GATC向5′端切開,切除錯配鏈,由聚合酶Ⅲ填補,連接酶連接。
特點(與切除修復(fù)之異)與GATC序列有關(guān)切除片段大由聚合酶Ⅲ填補17核酸合成
○Muts
Mutl
GATC
MutH(內(nèi)切酶)
核酸外切酶Ⅰ/Ⅹ
核酸外切酶Ⅶ/RecJ
3′
5′
5′
3′17核酸合成
(二)直接修復(fù)
定義光復(fù)活酶利用可見光對紫外線引起的嘧啶二聚體的修復(fù)過程。又叫光復(fù)活、光修復(fù)過程光復(fù)活酶找到嘧啶二聚體與之結(jié)合,
利用可見光能量使之解聚。
特點
需光照只能修復(fù)紫外線引起的嘧啶二聚體17核酸合成
(三)切除修復(fù)
定義
在多種酶作用下,將損傷部分切除,并以完整鏈為模板重新合成的過程。過程內(nèi)切酶在損傷端切一口,外切酶切除損傷段(或無此步),聚合酶補之(或邊切邊補),連解酶連之。
特點
需多種酶,且都是復(fù)制酶類;可修復(fù)各種損傷。17核酸合成
(四)重組修復(fù)
定義DNA復(fù)制時,損傷段不復(fù)制形成空缺,復(fù)制完成后與完好鏈交換,完好鏈再修補的修復(fù)過程過程重組,修復(fù)。
特點
損傷并未除去,但被稀釋。17核酸合成5′5′5′重組修復(fù)5′復(fù)制17核酸合成
(五)誘導(dǎo)修復(fù)
定義
由SOS反應(yīng)誘導(dǎo)產(chǎn)生誘導(dǎo)酶對DNA損傷的修復(fù)過程過程復(fù)制至損傷部位后,誘導(dǎo)產(chǎn)生誘導(dǎo)酶,無校對復(fù)制。
特點
復(fù)制后可能有差錯。
易錯修復(fù)、差錯傾向修復(fù)。
其它稱無差錯傾向修復(fù)、避免差錯的修復(fù)
前途有三對錯突變死亡17核酸合成
SOS反應(yīng)引起DNA損傷的因素導(dǎo)致的細胞一系列復(fù)雜的誘導(dǎo)效應(yīng),也叫應(yīng)急反應(yīng),包括誘導(dǎo)修復(fù)
修復(fù)成功
誘變效應(yīng)
修復(fù)失敗
細胞分裂抑制
防止產(chǎn)生無DNA的細胞
溶源性細胞釋放原病毒
SOS反應(yīng)意義提高修復(fù)酶的合成速度,加強無差錯修復(fù)能力;誘導(dǎo)新的修復(fù)酶,進行差錯修復(fù)。結(jié)果提高細胞存活率。它是生物在不利環(huán)境中求得生存的一種基本功能。17核酸合成
二、突變(熟悉)DNA數(shù)目和一級結(jié)構(gòu)變化引起的生物遺傳性狀改變。
涉及一個基因,叫基因突變。
涉及若干基因,叫染色體畸變?;蛲蛔兓騼?nèi)部核苷酸順序改變引起的遺傳性狀改變。
點突變堿基置換(互變異構(gòu)、堿基修飾等)
移碼突變加減一兩個核苷酸
染色體畸變?nèi)旧w結(jié)構(gòu)或數(shù)目異常引起的遺傳性狀的改變。結(jié)構(gòu)缺失、重復(fù)、倒位、易位數(shù)目非整倍缺一條、I條;多一條、I條等整倍單倍體、三倍體、四……17核酸合成
DNA指導(dǎo)的RNA合成過程。
遺傳信息從DNA分子轉(zhuǎn)移到RNA分子的過程。
一、RNA聚核酶(轉(zhuǎn)錄酶)(掌握)
1、作用
nNTP+模板→RNA+模板+(n-1)PPi
模板雙鏈DNA優(yōu)于單鏈只有一條鏈可轉(zhuǎn)錄(模板鏈、負(-)鏈)
DNA分子上的一個片段(轉(zhuǎn)錄單位)閱讀方向3′→5′。
反應(yīng)機制除底物為NTP、不需引物和解鏈酶外,同復(fù)制酶第三節(jié)轉(zhuǎn)錄17核酸合成2、性質(zhì)原核生物轉(zhuǎn)錄酶由五個亞基組成全酶:ααββ′σ和ω、Zn亞基基因亞基數(shù)功能αrpoA2裝配酶、與啟動子上游元件和活化因子結(jié)合βrpoB1催化中心β′rpoC1與模板結(jié)合σrpoD1識別啟動子、促轉(zhuǎn)錄起始ω1未知Zn與β′結(jié)合17核酸合成
酶功能對鵝膏堿
Ⅰ轉(zhuǎn)錄rRNA不敏感
Ⅱ轉(zhuǎn)錄mRNA和核內(nèi)小RNA敏感
Ⅲ轉(zhuǎn)錄tRNA、5SRNA等中等敏感真核生物轉(zhuǎn)錄酶有多種。17核酸合成二、啟動子和轉(zhuǎn)錄因子(熟悉)啟動子RNA聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。轉(zhuǎn)錄因子
RNA聚合酶起始轉(zhuǎn)錄需要的輔助因子。
(一)原核啟動子為從轉(zhuǎn)錄起點-1到-40的序列。其中含有兩個保守序列,-10序列和-35序列。TTGACATATAAT
-35序列-10序列上游-n起點1下游n
或識別區(qū)或Pribmow框作用
σ的識別信號開始解鏈開始轉(zhuǎn)錄17核酸合成
(二)真核啟動子1、類別Ⅰ啟動子為RNA聚合酶Ⅰ啟動子
-187-107-45起點20
上游控制元件核心啟動子上游控制元件由USF(上游結(jié)合因子)1識別并結(jié)合,然后SL1(選擇性因子)結(jié)合,復(fù)合因子移到起點介導(dǎo)聚合酶Ⅰ結(jié)合。USF1SL117核酸合成2、類別Ⅱ啟動子為RNA聚合酶Ⅱ啟動子
不定-30-25-4起點3
上游元件(應(yīng)答元件)基本啟動子起始子基本啟動子又叫TATA框、Goldberg-Hognessk框功能促進轉(zhuǎn)錄
(激活轉(zhuǎn)錄)
酶定位、解鏈
開始轉(zhuǎn)錄識別上游因子或轉(zhuǎn)錄輔助因子轉(zhuǎn)錄激活因子通用轉(zhuǎn)錄因子17核酸合成3、類別Ⅲ啟動子為RNA聚合酶Ⅲ啟動子
-55起點80
在80~-55有框架A、中間元件、框架C等三個功能序列識別TFⅢA、B、C(聚合酶Ⅲ轉(zhuǎn)錄因子)17核酸合成三、終止子和終止因子(熟悉)終止子提供轉(zhuǎn)錄終止信號的一段DNA序列。終止因子
協(xié)助RNA聚合酶識別終止信號的輔助因子。
抗終止因子
具有阻止轉(zhuǎn)錄終止作用的蛋白質(zhì)。通讀
由于抗終止因子的作用使轉(zhuǎn)錄越過終止子繼續(xù)轉(zhuǎn)錄的現(xiàn)象。
原核終止子
1、不依賴rho(ρ)的終止子(簡單終止子)
2、依賴rho(ρ)的終止子17核酸合成…TTAG…CTAA……AATC…GATT……AAUC…GAUU…/…TTAG…CUAA…
回文結(jié)構(gòu)反向閱讀順序相同的DNA片段
回文結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物可以形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)17核酸合成
富含GC區(qū)UUUUUU…非富含GC區(qū)不依賴rho的終止子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物
依賴rho的終止子轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物
由UUUUUU提供終止信號
由rho
促使聚合酶脫離模板17核酸合成四、轉(zhuǎn)錄過程(掌握)1、識別
由σ等因子識別啟動子并引導(dǎo)RNA聚合酶與之結(jié)合并解鏈。
-35序列-10序列起點
或識別區(qū)或Pribmow框
σ的識別信號開始解鏈開始轉(zhuǎn)錄TTGACATATAAT17核酸合成2、起始
依賴模板鏈確定底物,后者5′三磷酸與前者3′羥基脫焦磷酸,通過3′,5′磷酸二酯鍵連接2~9個,σ因子脫離。
C
A
TCGPPPUUPPPP17核酸合成U
GPPPPAPGPUPAPUPTA3、延伸
核心酶沿模板鏈3′→5′方向依上述原則繼續(xù)向前合成RNA鏈(方向5′→3′,步伐:一步一個核苷酸),至終止子合成。17核酸合成4、終止
終止子轉(zhuǎn)錄后,在終止因子協(xié)助下識別終止信號,轉(zhuǎn)錄停止,釋放原初轉(zhuǎn)錄物(新生RNA),DNA復(fù)原。
UGPPPPAPGPUPAPUPTAU
GPPPPAPGPUPAPUP17核酸合成17核酸合成五、轉(zhuǎn)錄后加工(熟悉)原初轉(zhuǎn)錄物轉(zhuǎn)化為成熟RNA的過程。又叫RNA的成熟主要方式有:切除、連接、修飾。17核酸合成(一)rRNA前體的轉(zhuǎn)錄后加工原核細胞30S前體17S25S16S23S5S真核細胞45S前體18S28S5.8S先甲基化、再RNase內(nèi)切、再外切酶修剪基本同原核。5S在tRNA基因族。17核酸合成(二)tRNA前體的加工原核1、內(nèi)切(RNaseP切5′端,RNaseF切3′端)2、修剪(RNaseD從3′端切至CCA)3、加CCA(不需模板,部分)4、修飾(產(chǎn)生稀有堿基)
真核1、內(nèi)切(不需為單個前體4.5S)2、修剪(內(nèi)、外切酶)3、加CCA(不需模板。所有)4、修飾(產(chǎn)生稀有堿基)17核酸合成(三)mRNA前體的加工原核多順反子RNA。多數(shù)不需加工直接翻譯,少數(shù)切成單順反子后翻譯。真核單順反子RNA。稱為核內(nèi)不均一RNA加工方式有1、加帽子2、接尾巴3、甲基化4、拼接17核酸合成1、加帽子PPPNNRNA解Pi,與GTP脫PPi,給G甲基化,得0型帽子,依次…2、接尾巴由多聚腺苷酸聚合酶完成,連20~200個。3、甲基化有些有。4、拼接指除去內(nèi)含子,使外顯子成為連續(xù)序列的過程。一般由核內(nèi)小RNA與內(nèi)含子末端配對,形成環(huán)突,使相鄰?fù)怙@子接近,然后內(nèi)切、連接。17核酸合成
核內(nèi)小RNAUUUCCC
內(nèi)含子
外顯子
外顯子GGGAAA17核酸合成一、RNA復(fù)制(熟悉)1、定義2、酶RNA依賴的RNA聚合酶3、病毒RNA復(fù)制方式(1)含正鏈RNA如噬菌體Qβ。
正鏈→復(fù)制酶
----→負鏈→正鏈↓病毒粒子蛋白質(zhì)第四節(jié)RNA指導(dǎo)的核酸合成17核酸合成(2)含負鏈及復(fù)制酶如狂犬病病毒負鏈-→正鏈-→負鏈-→蛋白質(zhì)病毒粒子(3)含雙鏈及復(fù)制酶如呼腸孤病毒雙鏈-→正鏈-→雙鏈-→蛋白質(zhì)病毒粒子“轉(zhuǎn)錄”
(4)含正鏈及逆轉(zhuǎn)錄酶如各種致癌病毒、艾滋病病毒乙型肝炎病毒等17核酸合成二、逆轉(zhuǎn)錄(熟悉)1、定義2、酶逆轉(zhuǎn)錄酶多種功能依賴RNA的DNA聚合活力核酸酶H活力依賴DNA的DNA聚合活力反應(yīng)性質(zhì)除模板外,同復(fù)制酶結(jié)構(gòu)特點2個亞基。17核酸合成3、過程(簡)
RNA→RNA·DNA→cDNA→cDND·DNA詳過程見P496圖36
R
U5
PB
gagpolenv
U3
R
AntRNA聚合負鏈依賴RNA的DNA聚合活力水解核酸酶H活力R′
R
U5
PB
gagpolenv
U3
R
An17核酸合成R-R′配對轉(zhuǎn)換模板(跳躍)(第一次)R′聚合負鏈依賴RNA的DNA聚合活力R′PB
gagpolenv
U3
R
AnR′17核酸合成水解核酸酶H活力聚合正鏈依賴DNA的DNA聚合活力水解核酸酶H活力R′17核酸合成PB-PB′配對轉(zhuǎn)換模板(跳躍)(第二次)聚合負鏈依賴DNA的DNA聚合活力聚合正鏈依賴DNA的DNA聚合活力17核酸合成17核酸合成
從中可見:三個功能不是依次,而是交替進行
(聚負-水解-聚負-水解-聚正-水解-聚負、聚正)功能1的引物是5′端附近的tRNA
(分3次進行,跳躍2次)功能3的引物是RNA
(分2次進行)4、逆轉(zhuǎn)錄病毒繁殖過程被膜與寄主細胞膜融合,核衣殼進入,經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄得cDNA,在整合酶作用下整合到寄主染色體中(稱之為原病毒),隨寄主細胞分裂而增殖。當(dāng)受外界刺激時,轉(zhuǎn)錄病毒RNA、翻譯病毒蛋白質(zhì),經(jīng)組裝
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