醫(yī)學(xué)科研數(shù)據(jù)挖掘方法-數(shù)據(jù)分析思路的構(gòu)建與實(shí)例-4,5

數(shù)據(jù)分析思路的構(gòu)建(ɡòujiàn)與實(shí)例北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部流行病學(xué)與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系陳大方博士/教授/博士生導(dǎo)師(dǎoshī)電話：+(010)82802644箱：dafangchen@共六十頁(yè)決定論文水平思路的重要性體現(xiàn)作者知識(shí)寬度與深度不怕(bùpà)做不到，就怕想不到共六十頁(yè)如何獲得創(chuàng)新思路基于文獻(xiàn)閱讀基于數(shù)據(jù)挖掘基于工作基礎(chǔ)共六十頁(yè)如何基于數(shù)據(jù)挖掘產(chǎn)生(chǎnshēng)文章思路？共六十頁(yè)群體（個(gè)體）家系一次調(diào)查/測(cè)量多時(shí)點(diǎn)調(diào)查（重復(fù)測(cè)量）數(shù)據(jù)三要素記錄（對(duì)象）數(shù)據(jù)挖掘變量（研究?jī)?nèi)容）時(shí)間（研究設(shè)計(jì)）觀察結(jié)局(因變量)研究因素(自變量)混雜因素(協(xié)變量）連續(xù)變量、分類(lèi)變量（二分類(lèi)，等級(jí)(děngjí)變量、無(wú)序變量）環(huán)境因素、臨床指標(biāo)、遺傳易感性(基因多態(tài)性)……共六十頁(yè)思考點(diǎn)從研究(yánjiū)變量之間關(guān)系角度思考從研究對(duì)象構(gòu)成的角度思考從研究的時(shí)間角度思考從以上兩個(gè)或以上思考共六十頁(yè)芳香烴有機(jī)溶劑暴露(bàolù)對(duì)女性生殖結(jié)局的影響研究(NIHProject1996——2000)數(shù)據(jù)挖掘?qū)嵗?shílì)共六十頁(yè)課題研究背景

芳香烴類(lèi)有機(jī)溶劑在環(huán)境中普遍存在，是一種潛在的生殖毒物，主要包括苯、甲苯、二甲苯、苯乙稀等。它在高濃度下對(duì)健康所產(chǎn)生的危害已為國(guó)內(nèi)外較多研究所證實(shí)(zhèngshí)。但是，女性長(zhǎng)期暴露于低濃度芳香烴有機(jī)溶劑對(duì)生殖結(jié)局的影響研究報(bào)道較少。共六十頁(yè)研究目的了解石油石化工冶煉廠女工芳香烴有機(jī)溶劑等職業(yè)有害因素(yīnsù)的暴露情況。探討職業(yè)、環(huán)境因素暴露，遺傳易感性與女性生殖結(jié)局的關(guān)系。共六十頁(yè)問(wèn)卷調(diào)查臨床(línchuánɡ)體檢新婚(xīnhūn)體檢停止避孕分娩妊娠新婚隨訪新婚日記每日晨尿暴露評(píng)價(jià)孕期隨訪問(wèn)卷調(diào)查出生記錄共六十頁(yè)基本信息基本情況生活習(xí)慣一般(yībān)健康狀況疾病(jíbìng)史基線職業(yè)情況膳食營(yíng)養(yǎng)月經(jīng)情況家庭居住檢查、檢測(cè)體格、肝腎血清營(yíng)養(yǎng)暴露評(píng)價(jià)β-hcg檢測(cè)遺傳易感性孕期隨訪新婚隨訪早孕隨訪中孕隨訪基線隨訪分娩住院記錄研究?jī)?nèi)容I相代謝酶基因和II相代謝酶基因，共12個(gè)基因多態(tài)性位點(diǎn)職業(yè)情況膳食營(yíng)養(yǎng)月經(jīng)情況家庭居住情況其他血紅蛋白鐵維生素B6維生素B12葉酸鐵蛋白轉(zhuǎn)鐵蛋白受體同型半胱氨酸監(jiān)測(cè)車(chē)間內(nèi)芳香烴有機(jī)溶劑濃度個(gè)體主動(dòng)采樣泵采樣暴露評(píng)價(jià)問(wèn)卷上班時(shí)活動(dòng)情況共六十頁(yè)2.研究對(duì)象(duìxiàng)

(記錄)1600對(duì)在燕山石化工作的新婚體檢對(duì)象：芳香烴有機(jī)溶劑暴露組800對(duì)非暴露組800對(duì)共六十頁(yè)3.研究設(shè)計(jì)(時(shí)間(shíjiān))前瞻性隊(duì)列研究設(shè)計(jì)（新婚體檢---臨床分娩或一年）共六十頁(yè)

2.構(gòu)建研究因素與結(jié)局之間關(guān)系——思路與內(nèi)容創(chuàng)新

1.把數(shù)據(jù)變量進(jìn)行分類(lèi)(研究因素/混雜因素/觀察結(jié)局)

3.初步分析數(shù)據(jù)——數(shù)據(jù)預(yù)處理、數(shù)據(jù)基本描述

4.提煉結(jié)果，構(gòu)建文章初步思路

5.深入分析數(shù)據(jù)——技術(shù)與方法創(chuàng)新

6.文章結(jié)果——形成文章完整思路文章思路構(gòu)建(ɡòujiàn)步驟共六十頁(yè)初步構(gòu)建論文思路

將數(shù)據(jù)變量進(jìn)行分類(lèi)01觀察(guānchá)結(jié)局一般人口學(xué)特征(tèzhēng)，如年齡、性別、職業(yè)疾病史芳香烴有機(jī)溶劑暴露，如笨、二甲苯等職業(yè)因素，如倒班、噪聲、工作體位生活行為，如吸煙、飲酒等膳食營(yíng)養(yǎng)體格檢查，如身高、體重、血壓臨床生化檢查：如肝腎功能血清營(yíng)養(yǎng)素，如維生素B6，B12，葉酸、鐵蛋白，轉(zhuǎn)鐵蛋白受體尿液檢測(cè)，如β-hcg遺傳易感性，如CYP、GST

研究因素/混雜出生結(jié)局，如出生體重、孕周受孕時(shí)間早早孕丟失臨床懷孕月經(jīng)功能，如月經(jīng)周期、痛經(jīng)共六十頁(yè)初步構(gòu)建論文思路構(gòu)建研究因素與結(jié)局之間關(guān)系02預(yù)處理研究因素描述中間表型結(jié)果觀察結(jié)局分析混雜因素一般人口學(xué)特征，如年齡、性別、職業(yè)疾病史芳香烴有機(jī)溶劑暴露，如笨、二甲苯等職業(yè)因素，如倒班、噪聲、工作體位生活行為，如吸煙、飲酒等膳食營(yíng)養(yǎng)體格檢查，如身高、體重、血壓臨床生化檢查：如肝腎功能血清營(yíng)養(yǎng)素，如維生素B6，B12，葉酸(yèsuān)、鐵蛋白，轉(zhuǎn)鐵蛋白受體尿液檢測(cè)，如β-hcg遺傳易感性，如CYP、GST出生結(jié)局(jiéjú)，如出生體重、孕周受孕時(shí)間早早孕丟失臨床懷孕月經(jīng)功能，如月經(jīng)周期、痛經(jīng)共六十頁(yè)數(shù)據(jù)預(yù)處理數(shù)據(jù)描述單因素(yīnsù)分析初步構(gòu)建論文思路初步數(shù)據(jù)分析03共六十頁(yè)初步構(gòu)建論初步構(gòu)建文章思路提煉結(jié)果04孕婦混苯化合物暴露對(duì)胎兒生長(zhǎng)發(fā)育的影響(yǐngxiǎng)。被動(dòng)吸煙對(duì)女性月經(jīng)功能影響研究。北京某石油化工廠女工苯的內(nèi)暴露研究。芳香烴和母親某些代謝酶基因多態(tài)性對(duì)新生兒出生身長(zhǎng)的影響微粒體環(huán)氧化酶與谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶的遺傳多態(tài)性對(duì)新生兒出生體重的影響.早孕期低濃度苯系物暴露對(duì)胎兒身長(zhǎng)的影響。低濃度混苯對(duì)女工生殖激素分泌的影響。新生兒PON2基因多態(tài)性與早產(chǎn)的關(guān)系。輪班作業(yè)女工排卵日前后的夜班次數(shù)對(duì)妊娠結(jié)局的影響。工效學(xué)因素對(duì)婦女臨床受孕時(shí)間影響的研究。以尿激素標(biāo)記物探討職業(yè)噪聲暴露與紡織女工月經(jīng)功能的關(guān)系?！擦?yè)初步構(gòu)建論文思路深入分析數(shù)據(jù)05智慧與策略統(tǒng)計(jì)學(xué)知識(shí)流行病學(xué)知識(shí)數(shù)據(jù)處理經(jīng)驗(yàn)文獻(xiàn)閱讀其它學(xué)科知識(shí)本專(zhuān)業(yè)知識(shí)共六十頁(yè)初步構(gòu)建論

形成文章完整思路文章結(jié)果06結(jié)果是文章的核心結(jié)果的順序絕不是按獲得數(shù)據(jù)的先后(xiānhòu)排列，而是要按企圖說(shuō)明問(wèn)題的邏輯順序排列；不要羅列結(jié)果，要分析，結(jié)果之間要有邏輯聯(lián)系；共六十頁(yè)P(yáng)5P9P7P2P3P10P8p14P11P1P6被動(dòng)(bèidòng)吸煙受孕(shòuyùn)時(shí)間早早孕丟失有機(jī)溶劑暴露孕前營(yíng)養(yǎng)身高體重指數(shù)職業(yè)因素暴露臨床懷孕遺傳易感性早產(chǎn)月經(jīng)周期痛經(jīng)出生體重新生兒身長(zhǎng)、頭圍胎兒宮內(nèi)生長(zhǎng)發(fā)育遲緩旁氏指數(shù)P15P12P13P4共六十頁(yè)被動(dòng)(bèidòng)吸煙受孕(shòuyùn)時(shí)間早早孕丟失有機(jī)溶劑暴露孕前營(yíng)養(yǎng)身高體重指數(shù)職業(yè)因素暴露臨床懷孕遺傳易感性早產(chǎn)月經(jīng)周期痛經(jīng)出生體重新生兒身長(zhǎng)、頭圍胎兒宮內(nèi)生長(zhǎng)發(fā)育遲緩旁氏指數(shù)P7P9P3P2P1P4P15p13P8P10P5P6P11P12P14共六十頁(yè)陳大方,劉彤杉,王黎華,黃因敏,趙一鳴,徐希平.孕婦混苯化合物暴露對(duì)胎兒生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J].疾病控制雜志,1997,04:263-266.陳大方,劉彤杉,楊萍,王黎華,黃因敏,趙一鳴,徐希平.環(huán)境與職業(yè)因素(yīnsù)對(duì)胎兒生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J].環(huán)境與健康雜志,1998,03:6-8.潘小川,丁輝,韓麗力,王黎華,徐希平.被動(dòng)吸煙對(duì)女性月經(jīng)功能影響研究[J].衛(wèi)生研究,1999,01:25-27.朱蘭,潘小川,昊昆昱,池頻頻,王黎華,徐希平.北京某石油化工廠女工苯的內(nèi)暴露研究[J].中國(guó)公共衛(wèi)生,1999,10:53-54.陳大方,王曉斌,王朝曦,王黎華,徐希平.芳香烴和母親某些代謝酶基因多態(tài)性對(duì)新生兒出生身長(zhǎng)的影響[J].北京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2000,05:450-454.陳大方,王朝曦,王曉斌,王黎華,徐希平.微粒體環(huán)氧化酶與谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶的遺傳多態(tài)性對(duì)新生兒出生體重的影響[J].環(huán)境與健康雜志,2000,03:131-134.陳大方,趙一鳴,臧桐華,王黎華,徐希平.早孕期低濃度苯系物暴露對(duì)胎兒身長(zhǎng)的影響[J].疾病控制雜志,2000,02:120-122.陳大方,王曉斌,吳迪,王黎華,徐希平.細(xì)胞色素P450氧化酶MSP1基因?qū)τ袡C(jī)溶劑的易感性與新生兒出生體重的影響[J].環(huán)境與健康雜志,2001,04:208-211.發(fā)表在中華核心期刊(qīkān)文章共六十頁(yè)陳海燕,王心如,徐莉春,LasleyBL,OverstreetJW,戴建國(guó),張綺,邢厚恂,杜冰,徐希平.低濃度混苯對(duì)女工生殖激素分泌的影響[J].中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志,2001,02:12-15.王守林,陳宇煉,陳海燕,徐莉春,曹晉柱,杜冰,王頂賢,施愛(ài)民,徐希平,王心如.某石化企業(yè)和化纖企業(yè)女工不良妊娠結(jié)局的危險(xiǎn)因素分析[J].工業(yè)衛(wèi)生與職業(yè)病,2001,03:140-143.梁紅業(yè),吳白燕,陳大方,陳櫟,徐希平,楊帆,胡海燕.新生兒PON2基因多態(tài)性與早產(chǎn)的關(guān)系[J].遺傳,2002,05:515-518.李佩芝,方自國(guó),潘小川,王黎華,徐希平.輪班(lúnbān)作業(yè)女工排卵日前后的夜班次數(shù)對(duì)妊娠結(jié)局的影響[J].中華勞動(dòng)衛(wèi)生職業(yè)病雜志,2002,05:52-54.吳白燕,梁紅業(yè),陳大方,劉林,楊帆,胡海燕,陳櫟,王桂香,徐希平.新生兒CYP2E1基因5′端RsaⅠ位點(diǎn)多態(tài)性和PON2基因148位點(diǎn)多態(tài)性與早產(chǎn)的關(guān)系[J].遺傳學(xué)報(bào),2003,06:577-583.游良雅,潘小川,陳大方,張金良,黃因敏,徐希平,夏桂芳.苯系混合物對(duì)新婚女工生育功能的影響[J].中國(guó)公共衛(wèi)生,2003,07:109-110.倪佳桐,黃愛(ài)群,楊帆,劉學(xué),徐希平.工效學(xué)因素對(duì)婦女臨床受孕時(shí)間影響的研究[J].疾病控制雜志,2003,05:420-422.李佩芝,潘小川,徐希平,王黎華.以尿激素標(biāo)記物探討職業(yè)噪聲暴露與紡織女工月經(jīng)功能的關(guān)系[J].工業(yè)衛(wèi)生與職業(yè)病,2004,03:130-135.共六十頁(yè)LiS,FangK,WangW,HuY,ChenD.Gene-environmentInteractionamongGSTT1,PON2PolymorphismsandOrganicSolventsonGestationalAgeinaChineseWomenCohort.JournalofAssistedReproductionandGenetics.2014.31(7):881-888.TingWu,YonghuaHu,ChangzhongChen,FanYang,ZhipingLi,ZhianFang,LihuaWang,DafangChen.Passivesmoking,metabolicgenepolymorphismandinfantbirthweightinaprospectivecohortofChinesewomen.AmJEpidemiol2007:166(3):313-322.XueyingQin,YiqunWu,ChangzhongChen,FanYang,ZhipingLi,ZhianFang,LihuaWang,YonghuaHu,DafangChen.Loworganicsolventexposureandcombinedmaternal-infantgenepolymorphismsaffectgestationalage.OccupationalandEnvironmentalMedicine,2008;65(7):482-487.NaLi,HongLiu,YonghuaHu,ChangzhongChen,FanYang,ZhipingLi,ZhianFang,LihuaWang,DafangChen.CYP1A1genepolymorphismsinmodifyingassociationbetweenPassivesmokingandprimarydysmenorrheal.AnnalsofEpidemiology.2007：17（11）：882-888.發(fā)表在SCI期刊(qīkān)文章共六十頁(yè)XiaobinWang,DafangChenetal,GeneticSusceptibilitytoBenzeneandShortenedGestation:EvidenceofGene-EnvironmentInteraction.AmericanJournalofEpidemicology2000;152(8):693-700.DafangChen,XiaobinWang,ChangzhongChen,etal.Exposuretobenzene,occupationalstress,andreducedbirthweight.OccupEnvironMed.2000;57(10):661-667.AlayneG.R.,GoldmanM.B.,DafangChen,etal.PreconceptionhomocysteineandB-vitaminstatusandbirthoutcomesinChinesewomen.AmericanJournalofClinicalNutrition,2002;76(6):1385-1391.VennersSA,WangX,ChenC,WangL,ChenD,etal.PaternalSmokingandPregnancyLoss:AProspectiveStudyUsingaBiomarkerofPregnancy.AmJEpidemiol2004:159(10)993-1001.RonnenbergAG,WangX,XingH,ChenC,ChenD,etal.LowPreconceptionBodyMassIndexIsAssociatedwithBirthOutcomeinaProspectiveCohortofChineseWomen.J.Nutr.2003;133:3449-3455.WangX,ChenC,WangL,ChenD,etal.Conception,EarlyPregnancyLoss,andTimetoClinicalPregnancy:APopulation-BasedStudy.Fertility&Sterility.2003;79(3):577-584.共六十頁(yè)HaE,ChoSI,ParkH,ChenDetal.Doesstandingatworkduringpregnancyresultinreducedinfantbirthweight?OccupEnvironMed2002;44(9):815-21.EunheeHa,

Sung-ilCho,

DafangChenetal,

Parentalexposuretoorganicsolventsandreducedbirthweight.ArchivesofEnvironmentalHealth,

2002;57(3):207-212.ChenC,WangX,ChenD,etal.TofuConsumptionandBloodLeadLevelsinYoungChineseAdults.AmJEpidemiol2001;153(12):1206-1212.Sung-IlCho,AndrewI.Damokosh,LouiseM.Ryan,DafangChen,etal.EffectsofExposuretoOrganicSolventsonMenstrualCycleLength.JOccupEnvironMed2001;43(6):567-561ChenC,ChoS,DamokoshA,ChenD,etalProspectiveStudyofExposuretoEnvironmentalTobaccoSmokeandDysmenorrhea.EnvironmentalHealthPerspectives.Novem