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乙型肝炎病毒核苷(酸)類似物耐藥的監(jiān)測(cè)
繆曉輝2009.5一、HBV耐藥的有關(guān)定義
病毒學(xué)突破(virologicbreakthrough)病毒反跳(viralrebound)生化學(xué)突破(biochemicalbreakthrough)HBV基因型耐藥(genotypicresistance)HBV表型耐藥(phenotypicresistance)臨床耐藥(clinicalresistance)HBV耐藥的有關(guān)定義
病毒學(xué)突破(virologicbreakthrough)指在核苷類藥物治療過(guò)程中,患者的血清HBVDNA水平一度被抑制,但在繼續(xù)治療中血清HBVDNA水平與最低值相比上升或超過(guò)1個(gè)log10(10倍)。HBV耐藥的有關(guān)定義
病毒反跳(viralrebound)指核苷類藥物治療過(guò)程中患者的血清HBVDNA水平一度被抑制,但在繼續(xù)治療中血清HBVDNA升高至>2×104IU/mL或高于治療前水平。
HBV耐藥的有關(guān)定義
生化學(xué)突破(biochemicalbreakthrough)指在核苷類藥物治療過(guò)程中血清丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(ALT)水平一度復(fù)常,但在繼續(xù)治療中血清ALT水平又再次升高。肝臟生活指標(biāo)很多,但是在此僅指ALT。HBV耐藥的有關(guān)定義
HBV基因型耐藥(genotypicresistance)指HBV基因組中的某些位點(diǎn)發(fā)生改變,導(dǎo)致這種藥物對(duì)HBV的抑制作用下降或消失。這種HBV基因變異與HBV的耐藥性有直接因果關(guān)系,通過(guò)這些變異位點(diǎn)的檢測(cè)可判斷HBV有無(wú)耐藥性。HBV耐藥的有關(guān)定義
HBV表型耐藥(phenotypicresistance)通過(guò)體外細(xì)胞培養(yǎng)方法,直接測(cè)定HBV對(duì)某種藥物的敏感性,或者在體外直接測(cè)定HBV聚合酶的活性,敏感性的降低或酶活性的下降均表明有耐藥,即表型耐藥。通常以IC50來(lái)評(píng)估IC50<5倍:敏感IC50在5~10倍:部分耐藥IC50
>10倍:耐藥HBV耐藥的有關(guān)定義
臨床耐藥(clinicalresistance)指臨床出現(xiàn)病毒復(fù)制不能被抑制,或HBV復(fù)制一度被抑制后又出現(xiàn)HBVDNA反跳,同時(shí)伴有ALT升高,或肝炎復(fù)發(fā)的其他臨床證據(jù)。病毒學(xué)反跳或突破的監(jiān)測(cè)HBV基因型耐藥監(jiān)測(cè)HBV表型耐藥檢測(cè)臨床耐藥監(jiān)測(cè)病毒學(xué)反跳或突破的監(jiān)測(cè)HBV基因型耐藥監(jiān)測(cè)時(shí)機(jī)非必須不主張常規(guī)、廣泛應(yīng)用基因型耐藥相關(guān)變異的命名基因型耐藥相關(guān)變異
在HBV多聚酶序列中的位置直接測(cè)序法末端終止法化學(xué)裂解法DNA測(cè)序自動(dòng)化使用特異性引物與單鏈模板DNA退火,在DNA聚合酶作用下進(jìn)行延伸反應(yīng),用ddNTP終止,用PAGE區(qū)分長(zhǎng)度僅相差1個(gè)核苷酸的ssDNA,從而完成測(cè)序的方法。用化學(xué)試劑在A、G、C、T處特定的裂解DNA片段,產(chǎn)生一簇各種長(zhǎng)度的短鏈,經(jīng)過(guò)PAGE放射自顯影可直讀DNA順序。類似末端終止法,所不同的是用熒光染料標(biāo)記,計(jì)算機(jī)自動(dòng)讀出。優(yōu)點(diǎn)簡(jiǎn)便、迅速、應(yīng)用廣泛。不需酶促反應(yīng),可以對(duì)寡核苷酸測(cè)序。①簡(jiǎn)便、快速、準(zhǔn)確可靠。②安全、無(wú)放射性污染。③模板用量大大減少。④測(cè)序能力增強(qiáng)。HBVYMDD變異直接測(cè)序結(jié)果圖譜直接DNA測(cè)序的局限性克隆測(cè)序法克隆測(cè)序法
堿基變異可能導(dǎo)致:①原有位點(diǎn)消失②產(chǎn)生新的位點(diǎn)③識(shí)別位點(diǎn)移位
利用錯(cuò)配引物使PCR產(chǎn)物中產(chǎn)生特異的酶切位點(diǎn)結(jié)果:酶切片段長(zhǎng)、短變化和多、少變化限制性內(nèi)切核酸酶的作用它們能識(shí)別DNA的特異序列,并在識(shí)別序列內(nèi)或其旁切割雙鏈DNA。如:NdeI限制酶的識(shí)別序列和切割位點(diǎn):CA
TATGGTATACNlaIll限制酶的識(shí)別序列和切割位點(diǎn):CATGNNNGTACNNNPCR-RFLP檢測(cè)HBVYMDD變異PCR錯(cuò)配引物設(shè)計(jì)PCR-RFLP檢測(cè)HBVYMDD變異PCR-RFLP檢測(cè)HBVYMDD變異INNO—LiPA診斷HBVYMDD變異BiologicalSampleAnalyzedataScannermicroarray“Hybridize”arrayerMicroarrayfabricationSamplepreparationMolecularhybridizationDetectionandanalysisDetectionofYMDDMotifMutantsbyOligonucleotideChipsinLamivudine-UntreatedPatientswithChronicHepatitisBVirusInfection。JKoreanMedSci2004;19:541-546.實(shí)時(shí)熒光定量PCR在基因變異中的應(yīng)用HBVDNA>105copies/mlW:M=1:1HBVDNA>105copies/mlW:M=10:1HBVDNA<105copies/mlW:M=10:1:W:M
優(yōu)點(diǎn)不足
靈敏度高需要相對(duì)較貴的熒光PCR儀特異性好需要多條熒光探針,成本高費(fèi)時(shí)短影響因素多,存在一定誤判熔解曲線法檢測(cè)YMDD變異特異性探針,其Tm值不同溶解曲線分析基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOFMS)原理MALDI-TOFMS檢測(cè)
HBVYMDD變異的原理酶切分子量.JPG基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI-TOFMS)優(yōu)點(diǎn):高靈敏度、準(zhǔn)確度、分辨率能發(fā)現(xiàn)相對(duì)比例小于1%的變異株。局限性:設(shè)備昂貴,目前國(guó)內(nèi)難以用于臨床檢測(cè)。AdvancesinMolecularDiagnosisofHBVInfectionandDrugResistance。Int.J.Med.Sci.20052(1):8-161Sensitivityherereferstothelowestlevel(%)atwhichanassaycandetectmixturesofmutantandwild-typevirus.2Informationcontentisconsideredasameasureofatest’sabilitytoprovidebroad,relevantinformationaboutpossiblenewmutations.3Updateabilityassessestheeaseatwhichatestcanbedaptedtoincorporatethedetectionofanewmutation.na,notapplicable.nd,notdetermined.HBV表型耐藥檢測(cè)有兩種途徑:1.細(xì)胞外HBV聚合酶活性分析。2.細(xì)胞藥物敏感性實(shí)驗(yàn)。細(xì)胞外HBV聚合酶活性分析目前常用的研究HBV聚合酶活性模型是將HBV基因組插入桿狀病毒載體,繼而轉(zhuǎn)染昆蟲細(xì)胞而表達(dá)HBV顆粒,應(yīng)用親和層析法純化HBV顆粒后,在細(xì)胞外評(píng)價(jià)藥物對(duì)聚合酶活性的影響。細(xì)胞外HBV聚合酶活性分析細(xì)胞藥物敏感性實(shí)驗(yàn)該方法類似于細(xì)菌藥物敏感試驗(yàn)。目前多采用病毒載體將含有被檢測(cè)的含HBV變異位點(diǎn)的全基因組導(dǎo)入肝細(xì)胞源性細(xì)胞株,然后將各種濃度的核苷類藥物加入培養(yǎng)液,經(jīng)過(guò)一定時(shí)間培養(yǎng)后檢測(cè)細(xì)胞上清中的HBVDNA含量。
細(xì)胞藥物敏感性實(shí)驗(yàn)細(xì)胞藥物敏感性實(shí)驗(yàn)臨床耐藥監(jiān)測(cè)YMDD變異前后病毒載量和ALT的變化HBVMDD變異與病毒學(xué)突破判斷臨床耐藥時(shí)的建議1.結(jié)合核苷類藥物的應(yīng)用史、起始病毒載量、是否合并其他肝病等。2.注意甄別依從性不良。3.結(jié)合基因變異位點(diǎn)。三、需要重視的幾個(gè)問(wèn)題YMDD自然變異的幾組數(shù)據(jù)本實(shí)驗(yàn)室關(guān)于YMDD自然變異
的2組數(shù)據(jù)196例CHB患者中,檢出存在YMDD變異毒株者共21例,檢出率為10.7%。其中YVDD陽(yáng)性20例,YIDD陽(yáng)性1例,YVDD和YIDD同時(shí)陽(yáng)性者0例。183例CHB患者中,檢出
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