第五章蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)(二)

A．；B.；C.X；D.-曲折；E.回形拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)本文檔共45頁；當(dāng)前第1頁；編輯于星期三\12點41分（1）αα：左手卷曲螺旋（超螺旋）。有二股、三股和四股螺旋，是纖維狀蛋白的主要結(jié)構(gòu)元件。序列上存在七殘基重復(fù)序列。本文檔共45頁；當(dāng)前第2頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第3頁；編輯于星期三\12點41分（2）βαβ：最常見的是Rossman折疊。本文檔共45頁；當(dāng)前第4頁；編輯于星期三\12點41分Zinc-fingermotifThreesecondarystructures(an-helixand2-strandswithananti-parallelarrangement)formafinger-likebundleheldtogetherbyazincion.OftenfoundinDNA-andRNA-bindingproteins.本文檔共45頁；當(dāng)前第5頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第6頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第7頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第8頁；編輯于星期三\12點41分二.結(jié)構(gòu)域1．概念：1．概念：2．結(jié)構(gòu)域類型：(根據(jù)二級結(jié)構(gòu)種類和組合方式)（1）反平行α螺旋：（全α—結(jié)構(gòu)）（2）平行或混合型β折疊片：（α，β—結(jié)構(gòu)）（3）反平行β折疊片結(jié)構(gòu)域：（全β—結(jié)構(gòu)）（4）富含金屬或二硫鍵結(jié)構(gòu)域：本文檔共45頁；當(dāng)前第9頁；編輯于星期三\12點41分蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)－－二級結(jié)構(gòu)本文檔共45頁；當(dāng)前第10頁；編輯于星期三\12點41分Typicaldomainstructuresofglobularproteins本文檔共45頁；當(dāng)前第11頁；編輯于星期三\12點41分第七節(jié)球狀蛋白質(zhì)與三級結(jié)構(gòu)一.球狀蛋白質(zhì)的分類：（根據(jù)結(jié)構(gòu)域）1．全α—結(jié)構(gòu)（反平行α螺旋）蛋白質(zhì)：（1）反平行螺旋束：最常見的是四螺旋束，活性部位——螺旋束的一端，由不同螺旋上的殘基構(gòu)成。（2）珠蛋白型α—螺旋蛋白：（珠蛋白包括去血紅素的肌紅蛋白和血紅蛋白）一級結(jié)構(gòu)上相鄰的兩個螺旋采取接近相互垂直的取向。整條多肽鏈折疊成兩層α—螺旋，兩層螺旋交叉堆疊。本文檔共45頁；當(dāng)前第12頁；編輯于星期三\12點41分反平行螺旋束本文檔共45頁；當(dāng)前第13頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第14頁；編輯于星期三\12點41分珠蛋白型α—螺旋蛋白本文檔共45頁；當(dāng)前第15頁；編輯于星期三\12點41分2．α，β—結(jié)構(gòu)（平行或混合型β折疊片）蛋白質(zhì)：（1）單繞平行β桶：內(nèi)桶——由8個平行β折疊股環(huán)形排列，具高度對稱性，由肽鏈按Rossman折疊方式（βαβ）單向卷繞而成。（2）雙繞平行β片：α、β—結(jié)構(gòu)的中間是由4—9個平行的β折疊股或混合型的β折疊股構(gòu)成的開放β片（馬鞍形扭曲片）。β折疊片的兩側(cè)是α螺旋和環(huán)狀區(qū)段。也是由βαβ單元裝配成，但連接方式與平行β桶不同。核苷酸結(jié)合部位位于β折疊片中肽鏈改變方向處的一個裂隙內(nèi)。本文檔共45頁；當(dāng)前第16頁；編輯于星期三\12點41分單繞平行β桶本文檔共45頁；當(dāng)前第17頁；編輯于星期三\12點41分雙繞平行β片（馬鞍形扭曲片）本文檔共45頁；當(dāng)前第18頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第19頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第20頁；編輯于星期三\12點41分3．全β—結(jié)構(gòu)（反平行β折疊片）蛋白質(zhì)：由4—10個β折疊股構(gòu)成。類型：反平行β桶反平行β片（露面夾心）：含3—15個β折疊股的單層反平行β折疊片，但不閉合成桶。希臘鑰匙β桶：由希臘鑰匙維成果凍卷β桶：類似希臘鑰匙，更復(fù)雜。上下型β桶：β曲折閉合而成，配體結(jié)合部位位于桶的疏水內(nèi)部。本文檔共45頁；當(dāng)前第21頁；編輯于星期三\12點41分上下型β桶本文檔共45頁；當(dāng)前第22頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第23頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第24頁；編輯于星期三\12點41分4．富含金屬或二硫鍵（小的不規(guī)則）蛋白質(zhì)：許多小于100AA的小蛋白質(zhì)或結(jié)構(gòu)域往往不規(guī)則，只有很少量的二級結(jié)構(gòu)，但富含金屬或二硫鍵。它們對蛋白質(zhì)構(gòu)象起穩(wěn)定作用。本文檔共45頁；當(dāng)前第25頁；編輯于星期三\12點41分二．球狀蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的特征：

1．球狀蛋白質(zhì)分子含多種二級結(jié)構(gòu)元件：

2．球狀蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)具有明顯的折疊層次：

裝配成結(jié)構(gòu)域或三級結(jié)構(gòu)：

（對于單結(jié)構(gòu)域蛋白或亞基）

二級結(jié)構(gòu)超二級結(jié)構(gòu)

兩個或多個結(jié)構(gòu)域裝配成三級結(jié)構(gòu)：

（對于多結(jié)構(gòu)域蛋白或亞基）

3．球狀蛋白質(zhì)分子是緊密的球狀或橢球狀實體：

什么是裝配密度？

活性部位裝配密度低——是酶與底物、別構(gòu)酶與調(diào)節(jié)物、

蛋白與效應(yīng)物相互作用的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。本文檔共45頁；當(dāng)前第26頁；編輯于星期三\12點41分4．球狀蛋白質(zhì)疏水側(cè)鏈埋藏在分子內(nèi)部，親水側(cè)鏈暴露在分子表面：

疏水核心幾乎全部由β折疊片和α螺旋組成。多數(shù)α螺旋是兩親性螺旋。

5．球狀蛋白質(zhì)分子的表面有一個空穴（裂光、凹槽、口袋）：

它常是結(jié)合底物、效應(yīng)物等配體并行使生物功能的活性部位?？昭ㄖ車植贾S多疏水側(cè)鏈。本文檔共45頁；當(dāng)前第27頁；編輯于星期三\12點41分第八節(jié)膜蛋白的結(jié)構(gòu)

膜周邊蛋白質(zhì)：

包括：膜內(nèi)在蛋白質(zhì)：

脂錨定蛋白質(zhì)：

1.膜內(nèi)在蛋白質(zhì)：

第一種類型：血型糖蛋白

第二種類型：7個跨膜肽段的膜蛋白

（細(xì)菌紫膜紅質(zhì)）

β桶型膜蛋白——膜孔蛋白

本文檔共45頁；當(dāng)前第28頁；編輯于星期三\12點41分第一種類型本文檔共45頁；當(dāng)前第29頁；編輯于星期三\12點41分第二種類型---7個跨膜肽段的膜蛋白本文檔共45頁；當(dāng)前第30頁；編輯于星期三\12點41分第二種類型---β桶型膜蛋白本文檔共45頁；當(dāng)前第31頁；編輯于星期三\12點41分2.脂錨定蛋白質(zhì)：

A酰胺——連接豆蔻酰錨鉤

B硫酯——連接脂肪酰錨鉤

C硫醚——連接異戊烯基錨鉤

D酰胺——連接糖基磷脂酰肌醇錨鉤。本文檔共45頁；當(dāng)前第32頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第33頁；編輯于星期三\12點41分一.蛋白質(zhì)的變性：

定義：

變性的本質(zhì)：

變性產(chǎn)生的后果

變性劑

去污劑

復(fù)性

第九節(jié)蛋白質(zhì)折疊本文檔共45頁；當(dāng)前第34頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第35頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第36頁；編輯于星期三\12點41分本文檔共45頁；當(dāng)前第37頁；編輯于星期三\12點41分二．氨基酸序列決定蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)1．核糖核酸酶的變性與復(fù)性實驗：2．二硫橋在穩(wěn)定蛋白質(zhì)構(gòu)象中的作用本文檔共45頁；當(dāng)前第38頁；編輯于星期三\12點41分一級結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)（一）蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系本文檔共45頁；當(dāng)前第39頁；編輯于星期三\12點41分第十節(jié)亞基締合和四級結(jié)構(gòu)一．概念：

二．四級締合的驅(qū)動力

本文檔共45頁；當(dāng)前第40頁；編輯于星期三\12點41分同種締合：相互作用的表面是相同的，形成封閉的二聚相同亞基之間體，具有一個2重對稱軸。

亞基締合異種締合：相互作用的表面是不同的，開放末端的締合。不同亞基之間三．亞基相互作用的方式本文檔共45頁；當(dāng)前第41頁；編輯于星期三\12點41分四．四級結(jié)構(gòu)