R語言入門使用RStudio制作包含Rcpp代碼的R包

第R語言入門使用RStudio制作包含Rcpp代碼的R包目錄1.創(chuàng)建項目2.修改一些文件3.打包4.使用Eigen或其它依賴庫會出現(xiàn)的問題前面博客中有提及，當我們進行模擬想要再次進行提速時，通常都會使用Rcpp將我們的R代碼改成C++代碼。具體Rcpp的使用可參考博客：Rcpp入門R代碼提速方法過程，R語言學習RcppEigen進行矩陣運算。

平時在我們使用的時候，直接使用Rcpp::sourceCpp()就可以直接將我們的C++代碼中的函數(shù)進行導入，這不會遇到什么問題，但如果我們想要使用snowfall進行并行時就不能再這樣做了。遇到的問題在博客中有進行說明：R中兩種常用并行方法——2.snowfall。

而解決這個問題的有效途徑，就是將我們的Rcpp代碼進行打包，然后再對包進行調用。下面我們就來介紹：如何使用RStudio制作包含Rcpp代碼的R包。

1.創(chuàng)建項目

首先我們進入RStudio，然后選擇左上角的File—NewProject。

新建Project后會得到如下圖所示的界面，我們接著選NewDirectory，

再選擇RPackage，

最后在得到如下所示的界面后，我們在PackageName中輸入我們包的名稱，然后再在下面選擇Add，將我們的.cpp格式的C++文件選擇進去（里面是我們的函數(shù)）。最后點擊Createpackage，即可創(chuàng)建一個R包的project了。

創(chuàng)建完之后，RStudio會彈出一個新的界面，如下圖所示。

然后我們需要對下述界面里面的一些配置文件進行一定的修改，然后才能完善我們的R包。

2.修改一些文件

從上面界面的右下角的Files框框中，可以發(fā)現(xiàn)已經(jīng)多出了很多文件，包括DISCRIPTION等文件以及man、R、src三個文件夾。

在R文件夾中存的是R代碼，src文件夾中是C++代碼（包括我們之前添加的C++代碼）。

可能你的C++代碼中只有添加進去.cpp文件，由于我的代碼中不止使用了#includeRcpp.h，還有使用#includeRcppEigen.h，這里注意，一定需要在DISCRIPTION文件的最后添加下面兩行（尤其是LinkingTo，不然會編譯失?。?/p>

Imports:Rcpp

LinkingTo:Rcpp,RcppEigen

此外還可以在DISCRIPTION文件，添加一些作者姓名等一些重要信息。

直接點開DISCRIPTION文件，會如上圖所示，我們直接進行修改即可。這里需要注意一下，Imports里面涉及到軟件的版本，是根據(jù)你R中現(xiàn)有包的版本來，如果想讓更多的電腦使用，在不影響程序使用的前提下，可以適當降低依賴包的版本。

3.打包

最后一步就是打包，這里介紹兩種打包方式：

選擇上方的Build——BuildSourcePackage

點擊右上角的Build中的BuildReload

第一種方法打包成功后，當下面出現(xiàn)DONE字樣時，說明包會在默認路徑下安詳?shù)靥芍恕?/p>

第二種方法打包成功后會自動library載入。

4.使用Eigen或其它依賴庫會出現(xiàn)的問題

如果我們再.cpp文件中使用的不止有Rcpp庫，還有別的庫，比如說Eigen。這時需要注意，用上面的方法打包是失敗的，會顯示沒有Eigen這個庫。

這個解決的方法也很簡單，直接在DISCRIPTION文件的LinkTo后面加上RcppEigen即可，如下圖所示：

可能遇到的其他問題制作R包后載入包內函數(shù)時，出現(xiàn)“…”notavailablefor.Call()forpackage“…”錯誤

問題解決傳送門

R包制作后出現(xiàn)notavailablefor錯誤問題解決

最后，就可以開心地享用新鮮出爐的包來做snowf