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文檔簡介
第五講:BLAST 序列比對,1. Basic Local Alignment Search Tool 2. Compare a query sequence to all the sequences in a specified database,BLAST的常用種類(詳細(xì)見教材): 1、blastn 2、blastp 3、tblastn 4、blastx 5、tblastx,例1:對給定的opsin蛋白進(jìn)行blastp,目標(biāo)數(shù)據(jù)庫為nt,物種為Eukaryota,例2:對給定的olfactory receptor基因進(jìn)行blastn,目標(biāo)數(shù)據(jù)庫為nt,物種為Eukaryota,作業(yè):對給定的2個(gè)基因(test1,test2)分別進(jìn)行 blastn, blastp, tblastn, tblastx, blastx,
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