實(shí)驗(yàn)三 重組質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化大腸桿菌_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、實(shí)驗(yàn)三重組質(zhì)粒DNA轉(zhuǎn)化大腸桿菌,實(shí) 驗(yàn) 目 的,學(xué)習(xí)將重組質(zhì)粒DNA導(dǎo)入大腸桿菌的方法 學(xué)習(xí)氯化鈣法制備大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞的方法 為下一步重組體篩選做準(zhǔn)備,實(shí) 驗(yàn) 原 理,遺傳學(xué)中轉(zhuǎn)化的基本含義是使細(xì)胞獲得一新的可遺傳的表型性狀。分子克隆中用人工的方法將重組質(zhì)粒DNA導(dǎo)入大腸桿菌細(xì)胞,使攜帶有重組質(zhì)粒的大腸桿菌獲得在抗生素平板上生長(zhǎng)的能力,從而與不攜帶重組質(zhì)粒的的細(xì)菌區(qū)分開(kāi)來(lái),這個(gè)過(guò)程就是轉(zhuǎn)化。 將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化進(jìn)受體細(xì)菌時(shí),需誘導(dǎo)受體細(xì)菌產(chǎn)生一種短暫的感受態(tài)以攝取外源DNA。大腸桿菌細(xì)胞經(jīng)過(guò)一些特殊方法(電擊法、 CaCl2等化學(xué)試劑法)的處理后,細(xì)胞膜的通透性發(fā)生了暫時(shí)性的改變,成為能允許

2、外源DNA分子進(jìn)入的細(xì)胞即感受態(tài)細(xì)胞(Competent cells)。,轉(zhuǎn)化(Transformation) 是將外源DNA分子引入受體細(xì)胞,使之獲得新的遺傳性狀的一種手段,它是微生物遺傳、分子遺傳、基因工程等研究領(lǐng)域的基本實(shí)驗(yàn)技術(shù)。 0.1mol/L CaCl2是一種低滲溶液,在0低溫處理大腸桿菌細(xì)胞時(shí),細(xì)胞膨脹成球形,DNA可吸附在其表面。在短暫的熱沖擊(如42 )下,細(xì)胞可吸收外源DNA。 為了鑒定這些轉(zhuǎn)化子,須利用質(zhì)粒編碼的篩選標(biāo)記,這些標(biāo)記賦予細(xì)菌新的表型,是成功轉(zhuǎn)化的細(xì)菌很容易被篩選出來(lái)。pET32a質(zhì)粒帶有氨芐西林抗性基因(Ampr),其重組體轉(zhuǎn)化的大腸桿菌能夠在含氨芐西林的培

3、養(yǎng)基上生長(zhǎng),而未轉(zhuǎn)化的受體菌則不能再這種培養(yǎng)基上生長(zhǎng)。,Ampr:氨芐西林抗性基因 內(nèi)酰胺酶,多克隆位點(diǎn)(MCS):外源DNA片段的插入位點(diǎn),Amps菌株,Ampr,涂布于含Amp的培養(yǎng)基上,可以生長(zhǎng)。次日可見(jiàn)白色菌落- 轉(zhuǎn)化子。,培養(yǎng)基上含有X-Gal和IPTG時(shí),可使用藍(lán)白斑篩選方法鑒別真正的重組的轉(zhuǎn)化子。,pET32a,pET32a,結(jié)構(gòu)的三大要素: 多克隆位點(diǎn) 選擇標(biāo)記(耐藥性,LacZ) 復(fù)制起始位點(diǎn) 種類: 質(zhì)粒 噬菌體 酵母人工染色體(YAC) 反轉(zhuǎn)錄病毒載體 表達(dá)載體等,pET-32a Vector,The pET System is the most powerful sys

4、tem yet developed for the cloning and expression of recombinant proteins in E. coli.,pET-32 cloning/expression region,Vector (pET-32a),Gene fragment (SmPR10),pET32a-SmPR10,材料、設(shè)備及試劑,材料 E. coli DH5菌株: R-、M-、Amp- (轉(zhuǎn)化過(guò)程所用的受體細(xì)胞一般是限制修飾系統(tǒng)缺陷的變異株,即不含限制性內(nèi)切酶和甲基化酶的突變體(R,M),它可以容忍外源DNA分子進(jìn)入體內(nèi)并穩(wěn)定地遺傳給后代。) pET32a-SmP

5、R10質(zhì)粒DNA(濃度:2 ng/l): 實(shí)驗(yàn)室自制 設(shè)備 恒溫?fù)u床;電熱恒溫培養(yǎng)箱;臺(tái)式高速離心機(jī);超凈工作臺(tái);低溫冰箱;恒溫水浴鍋;分光光度計(jì);微量移液槍。,試劑 1、LB固體和液體培養(yǎng)基 LB培養(yǎng)基配方:(單位g/L) 胰蛋白胨 10 酵母提取物 5 NaCl 10 瓊脂粉(1.5%) 15g (注:LB液體培養(yǎng)基不加瓊脂粉) 按配方稱量藥品,加入一定量的ddH2O后置電爐上加熱熔解瓊脂,待瓊脂完全熔解后加入ddH2O定容至1000ml,用NaOH調(diào)節(jié)pH至7.0。121濕熱高壓滅菌20分鐘,待冷卻至60左右,在超凈工作臺(tái)中加入一定量的Amp儲(chǔ)存液,使終濃度為100g/ml,搖勻后用培養(yǎng)

6、皿鋪板。,2、Amp母液: 稱取氨芐西林100mg溶于1mlddH2O中,0.22m濾器過(guò)濾除菌,用1.5ml離心管分裝后儲(chǔ)存于-20冰箱. 3、0.1mol/L CaCl2 溶液: 稱0.56gCaCl2(無(wú)水分析純),溶于50ml重蒸水中,定容至100ml,用0.22m濾器過(guò)濾除菌或高壓滅菌。EP管分裝于4冰箱儲(chǔ)存 . 4、 pET32a-SmPR10質(zhì)粒:實(shí)驗(yàn)室自制,操 作 步 驟,(一) 受體菌的培養(yǎng) 1、取-70或-20貯存的大腸桿菌DH5菌種,在LB培養(yǎng)液中培養(yǎng)過(guò)夜,進(jìn)行活化; 2、取幾微升活化后的菌液(取量視菌的密度而定)在LB平板上涂布,于37培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h;從LB平板上挑

7、取單菌落,接種于3-5ml LB液體培養(yǎng)基中,37下振蕩培養(yǎng)12小時(shí)左右,直至對(duì)數(shù)生長(zhǎng)后期。 3、將該菌懸液以1:100-1:50的比例接種于LB液體培養(yǎng)基中,37振蕩培養(yǎng)2-3小時(shí)至OD600 0.5左右(生長(zhǎng)對(duì)數(shù)期)。(注:這一步非常關(guān)鍵。培養(yǎng)過(guò)度的菌液含有較多的“老”細(xì)胞,制備成感受態(tài)細(xì)胞后其接受外援DNA能力較低,從而導(dǎo)致轉(zhuǎn)化率降低。),(二)、 感受態(tài)細(xì)胞的制備 ( CaCl2 法) 1、將菌液轉(zhuǎn)入1.5ml離心管中,冰上放置10分鐘,然后于4、4000rpm離心10分鐘。 2、棄去上清,用預(yù)冷的0. 1mol/L的CaCl2 溶液1ml輕輕懸浮細(xì)胞,冰上放置10分鐘后,4、4000

8、rpm離心10分鐘。 3、棄去上清,加入0.1ml預(yù)冷的0. 1mol/L的CaCl2 溶液,輕輕懸浮細(xì)胞。每份100l(注意懸液密度要均勻),冰上放置備用。 4、暫時(shí)不用的感受態(tài)細(xì)胞可置于 -80保存。,注:CaCl2處理后的細(xì)胞比較脆弱,盡量溫柔操作!,(三) 重組質(zhì)粒DNA的轉(zhuǎn)化 質(zhì)粒和感受態(tài)細(xì)胞混和:在100l感受態(tài)細(xì)胞懸液中加入5l重組質(zhì)粒DNA( pET32a-SmPR10 ),輕輕混勻后冰上放置30分鐘。 熱擊:42水浴中熱擊60秒(注:精確計(jì)算時(shí)間,熱擊過(guò)長(zhǎng)將對(duì)細(xì)胞造成傷害),熱擊后馬上置于冰上冷2-5分鐘。 復(fù)蘇:向每管中加入800l LB液體培養(yǎng)基(注:不含Amp),混勻后

9、在37150rpm輕搖培養(yǎng)1小時(shí),使細(xì)菌恢復(fù)正常生長(zhǎng)狀態(tài),并表達(dá)質(zhì)粒編碼的抗生素抗性基因(Ampr )。,思考:熱擊后的細(xì)胞已吸入外源質(zhì)粒,如本實(shí)驗(yàn)中的pET32a,該質(zhì)粒可賦予宿主氨芐青霉素抗性。但是為什么復(fù)蘇時(shí)用的LB培養(yǎng)液不加Amp?,(四)涂布平板篩選轉(zhuǎn)化質(zhì)粒 將管中培養(yǎng)液搖勻后取100l 均勻涂布于含Amp的篩選平板上。 (注:將培養(yǎng)液搖勻后涂布。) 2. 正面向上放置半小時(shí),待菌液完全被培養(yǎng)基吸收后倒置培養(yǎng)皿,37溫箱中培養(yǎng)過(guò)夜,次日觀察實(shí)驗(yàn)結(jié)果。,預(yù)期實(shí)驗(yàn)結(jié)果,感受態(tài)細(xì)胞+重組質(zhì)粒,0.1MCaCl2+重組質(zhì)粒,感受態(tài)細(xì)胞+無(wú)菌水,實(shí)驗(yàn)報(bào)告,思考題 (1). 根據(jù)本實(shí)驗(yàn)?zāi)阏J(rèn)為影響

10、轉(zhuǎn)化率的因素有哪些?(2). 如果實(shí)驗(yàn)中對(duì)照組本不該長(zhǎng)出菌落的平板上長(zhǎng)出了一些菌落,你將如何解釋這種現(xiàn)象?,實(shí)驗(yàn)中要考慮的重要因素,為了提高轉(zhuǎn)化效率, 實(shí)驗(yàn)中要考慮以下幾個(gè)重要因素: 1. 細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài)和密度: 不要用經(jīng)過(guò)多次繼代或儲(chǔ)于的培養(yǎng)菌,最好從-70或-20甘油保存的菌種中直接轉(zhuǎn)接用于制備感受態(tài)細(xì)胞的菌液。細(xì)胞生長(zhǎng)密度以剛進(jìn)入對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期時(shí)為好,可通過(guò)監(jiān)測(cè)培養(yǎng)液的OD600 來(lái)控制。DH5菌株的OD600 為0.5時(shí),細(xì)胞密度在5107 個(gè)/ml左右(不同的菌株情況有所不同),這時(shí)比較合適。密度過(guò)高或不足均會(huì)影響轉(zhuǎn)化效率。,2. 質(zhì)粒的質(zhì)量和濃度: 用于轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒DNA應(yīng)主要是超螺旋態(tài)DNA(cccDNA)。轉(zhuǎn)化效率與外源DNA的濃度在一定范圍內(nèi)成正比,但當(dāng)加入的外源DNA的量過(guò)多或體積過(guò)大時(shí),轉(zhuǎn)化效率就會(huì)降低。10ng的cccDNA即可使100l 的感受態(tài)細(xì)胞達(dá)到飽和。一般情況下,DNA溶液的體積不應(yīng)超過(guò)感受態(tài)細(xì)胞體積的5。 3. 試劑的質(zhì)量: 所用的試劑,如CaCl2 等均需是高純度的(GR.或AR.),并用

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