PDB數(shù)據(jù)庫中查找蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)_第1頁
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文檔簡介

-一、 PDB數(shù)據(jù)庫中查找蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)1./pdb/home/home.do輸入內(nèi)容：比如2DC32. 查找蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)，在檢索框輸入關(guān)鍵字或名稱。二. 在線觀看三維數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu) 4. 選擇 3D view，可視化蛋白三維結(jié)構(gòu)視圖呈現(xiàn)。由于是遠(yuǎn)程計算機(jī)服務(wù)器進(jìn)行圖型構(gòu)建，且數(shù)據(jù)量較大，需要較長的時間才能在窗口顯示。5.蛋白結(jié)構(gòu)顯示的參數(shù)設(shè)定：自定義設(shè)定腳本選項：二、 下載三維數(shù)據(jù)文件1. 在查詢結(jié)果窗口的右邊找到以下圖型。如圖：選擇Download Files。2確定下載的文件類型，一般根據(jù)你要使用蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)而定。選擇PDB File(Text).3. 用寫字板打開PDB文件，可以看到蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫文件實質(zhì)也是文本文件。4. 下載Pymol，并安裝。點DOWNLOAD進(jìn)入下載，選擇windows版本，并安裝（需要pay money）?；虻酱司W(wǎng)站下載：/gohlke/pythonlibs/#pymol選擇win32，版本。并安裝，需要python編程軟件的支持，可從360軟件管件直接安裝。安裝如圖：使用詳情參見教程，注意打開程序需要找到 python的安裝目錄：C:Python27PyMOL，找到PyMOL.exe文件，雙擊啟動程序。打開2DC3.pdb

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