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文檔簡(jiǎn)介
1、生物化學(xué)名詞解釋第一章 氨基酸和蛋白質(zhì)氨基酸(amino acid):是含有一個(gè)堿性氨基和一個(gè)酸性羧基的有機(jī)化合物,氨基一般連在-碳上。必需氨基酸(essential amino acid):指人(或其它脊椎動(dòng)物)(賴氨酸,蘇氨酸等)自己不能合成,需要從食物中獲得的氨基酸。非必需氨基酸(nonessential amino acid):指人(或其它脊椎動(dòng)物)自己能由簡(jiǎn)單的前體合成不需要從食物中獲得的氨基酸。等電點(diǎn)(pI,isoelectric point):使分子處于兼性分子狀態(tài),在電場(chǎng)中不遷移(分子的靜電荷為零)的pH值。茚三酮反應(yīng)(ninhydrin reaction):在加熱條件下,氨基
2、酸或肽與茚三酮反應(yīng)生成紫色(與脯氨酸反應(yīng)生成黃色)化合物的反應(yīng)。肽鍵(peptide bond):一個(gè)氨基酸的羧基與另一個(gè)的氨基的氨基縮合,除去一分子水形成的酰氨鍵。肽(peptide):兩個(gè)或兩個(gè)以上氨基通過(guò)肽鍵共價(jià)連接形成的聚合物。蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)(primary structure):指蛋白質(zhì)中共價(jià)連接的氨基酸殘基的排列順序。層析(chromatography):按照在移動(dòng)相和固定相(可以是氣體或液體)之間的分配比例將混合成分分開的技術(shù)。離子交換層析(ion-exchange column)使用帶有固定的帶電基團(tuán)的聚合樹脂或凝膠層析柱透析(dialysis):通過(guò)小分子經(jīng)過(guò)半透膜擴(kuò)散到水(
3、或緩沖液)的原理,將小分子與生物大分子分開的一種分離純化技術(shù)。凝膠過(guò)濾層析(gel filtrationchromatography):也叫做分子排阻層析。一種利用帶孔凝膠珠作基質(zhì),按照分子大小分離蛋白質(zhì)或其它分子混合物的層析技術(shù)。親合層析(affinity chromatograph):利用共價(jià)連接有特異配體的層析介質(zhì),分離蛋白質(zhì)混合物中能特異結(jié)合配體的目的蛋白質(zhì)或其它分子的層析技術(shù)。高壓液相層析(HPLC):使用顆粒極細(xì)的介質(zhì),在高壓下分離蛋白質(zhì)或其他分子混合物的層析技術(shù)。凝膠電泳(gel electrophoresis):以凝膠為介質(zhì),在電場(chǎng)作用下分離蛋白質(zhì)或核酸的分離純化技術(shù)。SDS-
4、聚丙烯酰氨凝膠電泳(SDS-PAGE):在去污劑十二烷基硫酸鈉存在下的聚丙烯酰氨凝膠電泳。SDS-PAGE只是按照分子的大小,而不是根據(jù)分子所帶的電荷大小分離的。等電聚膠電泳(IFE):利用一種特殊的緩沖液(兩性電解質(zhì))在聚丙烯酰氨凝膠制造一個(gè)pH梯度,電泳時(shí),每種蛋白質(zhì)遷移到它的等電點(diǎn)(pI)處,即梯度足的某一pH時(shí),就不再帶有凈的正或負(fù)電荷了。雙向電泳(two-dimensional electrophorese):等電聚膠電泳和SDS-PAGE的組合,即先進(jìn)行等電聚膠電泳(按照pI)分離,然后再進(jìn)行SDS-PAGE(按照分子大小分離)。經(jīng)染色得到的電泳圖是二維分布的蛋白質(zhì)圖。Edman降
5、解(Edman degradation):從多肽鏈游離的N末端測(cè)定氨基酸殘基的序列的過(guò)程。N末端氨基酸殘基被苯異硫氰酸酯修飾,然后從多肽鏈上切下修飾的殘基,再經(jīng)層析鑒定,余下的多肽鏈(少了一個(gè)殘基)被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。同源蛋白質(zhì)(homologous protein):來(lái)自不同種類生物的序列和功能類似的蛋白質(zhì),例如血紅蛋白。第二章 蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)構(gòu)形(configuration):有機(jī)分子中各個(gè)原子特有的固定的空間排列。這種排列不經(jīng)過(guò)共價(jià)鍵的斷裂和重新形成是不會(huì)改變的。構(gòu)形的改變往往使分子的光學(xué)活性發(fā)生變化。構(gòu)象(conformation):指一個(gè)分子中,不改變共價(jià)鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍
6、的原子放置所產(chǎn)生的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時(shí),不要求共價(jià)鍵的斷裂和重新形成。構(gòu)象改變不會(huì)改變分子的光學(xué)活性。肽單位(peptide unit):又稱為肽基(peptide group),是肽鍵主鏈上的重復(fù)結(jié)構(gòu)。是由參于肽鏈形成的氮原子,碳原子和它們的4個(gè)取代成分:羰基氧原子,酰氨氫原子和兩個(gè)相鄰-碳原子組成的一個(gè)平面單位。蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)(protein在蛋白質(zhì)分子中的局布區(qū)域內(nèi)氨基酸殘基的有規(guī)則的排列。常見的有二級(jí)結(jié)構(gòu)有-螺旋和-折疊。二級(jí)結(jié)構(gòu)是通過(guò)骨架上的羰基和酰胺基團(tuán)之間形成的氫鍵維持的。蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)(protein tertiary structure): 蛋白質(zhì)分子處于它的
7、天然折疊狀態(tài)的三維構(gòu)象。三級(jí)結(jié)構(gòu)是在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進(jìn)一步盤繞,折疊形成的。三級(jí)結(jié)構(gòu)主要是靠氨基酸側(cè)鏈之間的疏水相互作用,氫鍵,范德華力和鹽鍵維持的。蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)(protein quaternary structure):多亞基蛋白質(zhì)的三維結(jié)構(gòu)。實(shí)際上是具有三級(jí)結(jié)構(gòu)多肽(亞基)以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)的三維結(jié)構(gòu)。-螺旋(-heliv):蛋白質(zhì)中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個(gè)氨基酸殘基(第n個(gè))的羰基與多肽鏈C端方向的第4個(gè)殘基(第4+n個(gè))的酰胺氮形成氫鍵。在古典的右手-螺旋結(jié)構(gòu)中,螺距為0.54nm,每一圈含有3.6個(gè)氨
8、基酸殘基,每個(gè)殘基沿著螺旋的長(zhǎng)軸上升0.15nm.-折疊(-sheet): 蛋白質(zhì)中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構(gòu)象是通過(guò)一個(gè)肽鍵的羰基氧和位于同一個(gè)肽鏈的另一個(gè)酰氨氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(由N到C方向)或者是反平行排列(肽鏈反向排列)。-轉(zhuǎn)角(-turn):也是多肽鏈中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),是連接蛋白質(zhì)分子中的二級(jí)結(jié)構(gòu)(-螺旋和-折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū),一般含有216個(gè)氨基酸殘基。含有5個(gè)以上的氨基酸殘基的轉(zhuǎn)角又常稱為環(huán)(loop)。常見的轉(zhuǎn)角含有4個(gè)氨基酸殘基有兩種類型:轉(zhuǎn)角I的特點(diǎn)是:第一個(gè)氨基酸殘基羰基氧
9、與第四個(gè)殘基的酰氨氮之間形成氫鍵;轉(zhuǎn)角的第三個(gè)殘基往往是甘氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第二個(gè)殘侉大都是脯氨酸。超二級(jí)結(jié)構(gòu)(super-secondary structure):也稱為基元(motif).在蛋白質(zhì)中,特別是球蛋白中,經(jīng)??梢钥吹接扇舾上噜彽亩?jí)結(jié)構(gòu)單元組合在一起,彼此相互作用,形成有規(guī)則的,在空間上能辨認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體。結(jié)構(gòu)域(domain):在蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)內(nèi)的獨(dú)立折疊單元。結(jié)構(gòu)域通常都是幾個(gè)超二級(jí)結(jié)構(gòu)單元的組合。纖維蛋白(fibrous protein):一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有呈現(xiàn)相同二級(jí)結(jié)構(gòu)的多肽鏈許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為單個(gè)細(xì)胞或整個(gè)生物體提供機(jī)械強(qiáng)度,起著
10、保護(hù)或結(jié)構(gòu)上的作用。球蛋白(globular protein):緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的一類蛋白質(zhì),許多都溶于水。典形的球蛋白含有能特異的識(shí)別其它化合物的凹陷或裂隙部位。角蛋白(keratin):由處于-螺旋或-折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成不溶于水的起著保護(hù)或結(jié)構(gòu)作用蛋白質(zhì)。膠原(蛋白)(collagen):是動(dòng)物結(jié)締組織最豐富的一種蛋白質(zhì),它是由原膠原蛋白分子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。每個(gè)原膠原分子都是由3條特殊的左手螺旋(螺距0.95nm,每一圈含有3.3個(gè)殘基)的多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。疏水相互作用(hydrophobic interaction):非
11、極性分子之間的一種弱的非共價(jià)的相互作用。這些非極性的分子在水相環(huán)境中具有避開水而相互聚集的傾向。伴娘蛋白(chaperone):與一種新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它正確折疊成具有生物功能構(gòu)向的蛋白質(zhì)。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形成和沒(méi)有組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)以及大的多亞基蛋白質(zhì)的組裝和解體。二硫鍵(disulfide bond):通過(guò)兩個(gè)(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價(jià)鍵。二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。范德華力(van der Waals force):中性原子之間通過(guò)瞬間靜電相互作用產(chǎn)生的一弱的分子之間的力。當(dāng)兩個(gè)原子之間的距離為它們范德華
12、力半徑之和時(shí),范德華力最強(qiáng)。強(qiáng)的范德華力的排斥作用可防止原子相互靠近。蛋白質(zhì)變性(denaturation):生物大分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照,熱,有機(jī)溶濟(jì)以及一些變性濟(jì)的作用時(shí),次級(jí)鍵受到破壞,導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,使蛋白質(zhì)的生物活性喪失。肌紅蛋白(myoglobin):是由一條肽鏈和一個(gè)血紅素輔基組成的結(jié)合蛋白,是肌肉內(nèi)儲(chǔ)存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。復(fù)性(renaturation):在一定的條件下,變性的生物大分子恢復(fù)成具有生物活性的天然構(gòu)象的現(xiàn)象。波爾效應(yīng)(Bohr effect):CO2濃度的增加降低細(xì)胞內(nèi)的pH,引起紅細(xì)胞內(nèi)血紅蛋白氧親
13、和力下降的現(xiàn)象。血紅蛋白(hemoglobin): 是由含有血紅素輔基的4個(gè)亞基組成的結(jié)合蛋白。血紅蛋白負(fù)責(zé)將氧由肺運(yùn)輸?shù)酵庵芙M織,它的氧飽和曲線為S型。別構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect):又稱為變構(gòu)效應(yīng),是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性喪失的現(xiàn)象。鐮刀型細(xì)胞貧血?。╯ickle-cell anemia): 血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點(diǎn)是病人的血紅蛋白亞基N端的第六個(gè)氨基酸殘缺是纈氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸殘基(Ghe)。第三章 酶酶(enzyme):生物催化劑,除少數(shù)RNA外幾乎都是蛋白質(zhì)。酶不改變反應(yīng)的
14、平衡,只是通過(guò)降低活化能加快反應(yīng)的速度。脫脯基酶蛋白(apoenzyme):酶中除去催化活性可能需要的有機(jī)或無(wú)機(jī)輔助因子或輔基后的蛋白質(zhì)部分。全酶(holoenzyme):具有催化活性的酶,包括所有必需的亞基,輔基和其它輔助因子。酶活力單位(U,active unit):酶活力單位的量度。1961年國(guó)際酶學(xué)會(huì)議規(guī)定:1個(gè)酶活力單位是指在特定條件(25oC,其它為最適條件)下,在1min內(nèi)能轉(zhuǎn)化1mol底物的酶量,或是轉(zhuǎn)化底物中1mol的有關(guān)基團(tuán)的酶量。比活(specific activity):每分鐘每毫克酶蛋白在25oC下轉(zhuǎn)化的底物的微摩爾數(shù)。比活是酶純度的測(cè)量?;罨埽╝ctivation
15、 energy):將1mol反應(yīng)底物中所有分子由其態(tài)轉(zhuǎn)化為過(guò)度態(tài)所需要的能量?;钚圆课唬╝ctive energy):酶中含有底物結(jié)合部位和參與催化底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的氨基酸殘基部分?;钚圆课煌ǔN挥诘鞍踪|(zhì)的結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙或是蛋白質(zhì)表面的凹陷部位,通常都是由在三維空間上靠得很進(jìn)的一些氨基酸殘基組成。酸-堿催化(acid-base catalysis):質(zhì)子轉(zhuǎn)移加速反應(yīng)的催化作用。共價(jià)催化(covalent catalysis):一個(gè)底物或底物的一部分與催化劑形成共價(jià)鍵,然后被轉(zhuǎn)移給第二個(gè)底物。許多酶催化的基團(tuán)轉(zhuǎn)移反應(yīng)都是通過(guò)共價(jià)方式進(jìn)行的??拷?yīng)(proximity effect):非酶
16、促催化反應(yīng)或酶促反應(yīng)速度的增加是由于底物靠近活性部位,使得活性部位處反應(yīng)劑有效濃度增大的結(jié)果,這將導(dǎo)致更頻繁地形成過(guò)度態(tài)。初速度(initial velocity):酶促反應(yīng)最初階段底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物的速度,這一階段產(chǎn)物的濃度非常低,其逆反應(yīng)可以忽略不計(jì)。米氏方程(Michaelis-Mentent equation):表示一個(gè)酶促反應(yīng)的起始速度()與底物濃度(s)關(guān)系的速度方程:=maxs/(Km+s)米氏常數(shù)(Michaelis constant):對(duì)于一個(gè)給定的反應(yīng),異至酶促反應(yīng)的起始速度(0)達(dá)到最大反應(yīng)速度(max)一半時(shí)的底物濃度。催化常數(shù)(catalytic number)(Kcat
17、):也稱為轉(zhuǎn)換數(shù)。是一個(gè)動(dòng)力學(xué)常數(shù),是在底物處于飽和狀態(tài)下一個(gè)酶(或一個(gè)酶活性部位)催化一個(gè)反應(yīng)有多快的測(cè)量。催化常數(shù)等于最大反應(yīng)速度除以總的酶濃度(max/Etotal)?;蚴敲磕γ富钚圆课幻棵腌娹D(zhuǎn)化為產(chǎn)物的底物的量(摩爾)。雙倒數(shù)作圖(double-reciprocal plot):那稱為L(zhǎng)ineweaver_Burk作圖。一個(gè)酶促反應(yīng)的速度的倒數(shù)(1/V)對(duì)底物度的倒數(shù)(1/LSF)的作圖。x和y軸上的截距分別代表米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度的倒數(shù)。競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用(competitive inhibition):通過(guò)增加底物濃度可以逆轉(zhuǎn)的一種酶抑制類型。競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑通常與正常的底物或配體競(jìng)爭(zhēng)同
18、一個(gè)蛋白質(zhì)的結(jié)合部位。這種抑制使Km增大而max不變。非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用(noncompetitive inhibition): 抑制劑不僅與游離酶結(jié)合,也可以與酶-底物復(fù)合物結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km不變而max變小。反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用(uncompetitive inhibition): 抑制劑只與酶-底物復(fù)合物結(jié)合而不與游離的酶結(jié)合的一種酶促反應(yīng)抑制作用。這種抑制使Km和max都變小但max/Km不變。絲氨酸蛋白酶(serine protease): 活性部位含有在催化期間起親核作用的絲氨殘基的蛋白質(zhì)。酶原(zymogen):通過(guò)有限蛋白水解,能夠由無(wú)活性變成具有催化活性的酶
19、前體。調(diào)節(jié)酶(regulatory enzyme):位于一個(gè)或多個(gè)代謝途徑內(nèi)的一個(gè)關(guān)鍵部位的酶,它的活性根據(jù)代謝的需要而增加或降低。別構(gòu)酶(allosteric enzyme):活性受結(jié)合在活性部位以外的部位的其它分子調(diào)節(jié)的酶。別構(gòu)調(diào)節(jié)劑(allosteric modulator):結(jié)合在別構(gòu)調(diào)節(jié)酶的調(diào)節(jié)部位調(diào)節(jié)該酶催化活性的生物分子,別構(gòu)調(diào)節(jié)劑可以是激活劑,也可以是抑制劑。齊變模式(concerted model):相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的一種模式,按照最簡(jiǎn)單的齊變模式,由于一個(gè)底物或別構(gòu)調(diào)節(jié)劑的結(jié)合,蛋白質(zhì)的構(gòu)相在T(對(duì)底物親和性低的構(gòu)象)和R(對(duì)底物親和性高的構(gòu)象)之間變換。這一模式
20、提出所有蛋白質(zhì)的亞基都具有相同的構(gòu)象,或是T構(gòu)象,或是R構(gòu)象。序變模式(sequential model):相同配體與寡聚蛋白協(xié)同結(jié)合的另外一種模式。按照最簡(jiǎn)單的序變模式,一個(gè)配體的結(jié)合會(huì)誘導(dǎo)它結(jié)合的亞基的三級(jí)結(jié)構(gòu)的變化,并使相鄰亞基的構(gòu)象發(fā)生很大的變化。按照序變模式,只有一個(gè)亞基對(duì)配體具有高的親和力。同功酶(isoenzyme isozyme):催化同一化學(xué)反應(yīng)而化學(xué)組成不同的一組酶。它們彼此在氨基酸序列,底物的親和性等方面都存在著差異。別構(gòu)調(diào)節(jié)酶(allosteric modulator):那稱為別構(gòu)效應(yīng)物。結(jié)合在別構(gòu)酶的調(diào)節(jié)部位,調(diào)節(jié)酶催化活性的生物分子。別構(gòu)調(diào)節(jié)物可以是是激活劑,也可以
21、是抑制劑。第四章 維生素和輔酶維生素(vitamin):是一類動(dòng)物本身不能合成,但對(duì)動(dòng)物生長(zhǎng)和健康又是必需的有機(jī)物,所以必需從食物中獲得。許多輔酶都是由維生素衍生的。水溶性維生素(water-soluble vitamin):一類能溶于水的有機(jī)營(yíng)養(yǎng)分子。其中包括在酶的催化中起著重要作用的B族維生素以及抗壞血酸(維生素C)等。脂溶性維生素(lipid vitamin):由長(zhǎng)的碳?xì)滏溁虺憝h(huán)組成的聚戊二烯化合物。脂溶性維生素包括A,D,E,和K,這類維生素能被動(dòng)物貯存。輔酶(conzyme):某些酶在發(fā)揮催化作用時(shí)所需的一類輔助因子,其成分中往往含有維生素。輔酶與酶結(jié)合松散,可以通過(guò)透析除去。輔基(
22、prosthetic group):是與酶蛋白質(zhì)共價(jià)結(jié)合的金屬離子或一類有機(jī)化合物,用透析法不能除去。輔基在整個(gè)酶促反應(yīng)過(guò)程中始終與酶的特定部位結(jié)合。尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)和尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADP+):含有尼克酰胺的輔酶,在某些氧化還原中起著氫原子和電子載體的作用,常常作為脫氫酶的輔。黃素單核苷酸(FMN)一種核黃素磷酸,是某些氧化還原反應(yīng)的輔酶。硫胺素焦磷酸(thiamine phosphate):是維生素B1的輔形式,參與轉(zhuǎn)醛基反應(yīng)。黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD):是某些氧化還原反應(yīng)的輔酶,含有核黃素。磷酸吡哆醛(pyidoxal phosphate):是維生素B6
23、(吡哆醇)的衍生物,是轉(zhuǎn)氨酶,脫羧酶和消旋酶的酶。生物素(biotin):參與脫羧反應(yīng)的一種酶的輔助因子。輔酶A(coenzyme A):一種含有泛酸的輔酶,在某些酶促反應(yīng)中作為酰基的載體。類胡蘿卜素(carotenoid):由異戊二烯組成的脂溶性光合色素。轉(zhuǎn)氨酶(transaminase):那稱為氨基轉(zhuǎn)移酶,在該酶的催化下,一個(gè)-氨基酸的氨基可轉(zhuǎn)移給別一個(gè)-酮酸。第五章 糖類醛糖(aldose):一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-1)是一個(gè)醛基。酮糖(ketose):一類單糖,該單糖中氧化數(shù)最高的C原子(指定為C-2)是一個(gè)酮基。異頭物(anomer):僅在氧化數(shù)最高的C原子(
24、異頭碳)上具有不同構(gòu)形的糖分子的兩種異構(gòu)體。異頭碳(anomer carbon):環(huán)化單糖的氧化數(shù)最高的C原子,異頭碳具有羰基的化學(xué)反應(yīng)性。變旋(mutarotation):吡喃糖,呋喃糖或糖苷伴隨它們的-和-異構(gòu)形式的平衡而發(fā)生的比旋度變化。單糖(monosaccharide):由3個(gè)或更多碳原子組成的具有經(jīng)驗(yàn)公式(CH2O)n的簡(jiǎn)糖。糖苷(dlycoside):?jiǎn)翁前肟s醛羥基與別一個(gè)分子的羥基,胺基或巰基縮合形成的含糖衍生物。糖苷鍵(glycosidic bond):一個(gè)糖半縮醛羥基與另一個(gè)分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基之間縮合形成的縮醛或縮酮鍵,常見的糖醛鍵有O糖苷鍵和
25、N糖苷鍵。寡糖(oligoccharide):由220個(gè)單糖殘基通過(guò)糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖(polysaccharide):20個(gè)以上的單糖通過(guò)糖苷鍵連接形成的聚合物。多糖鏈可以是線形的或帶有分支的。還原糖(reducing sugar):羰基碳(異頭碳)沒(méi)有參與形成糖苷鍵,因此可被氧化充當(dāng)還原劑的糖。淀粉(starch):一類多糖,是葡萄糖殘基的同聚物。有兩種形式的淀粉:一種是直鏈淀粉,是沒(méi)有分支的,只是通過(guò)-(14)糖苷鍵的葡萄糖殘基的聚合物;另一類是支鏈淀粉,是含有分支的,-(14)糖苷鍵連接的葡萄糖殘基的聚合物,支鏈在分支處通過(guò)-(16)糖苷鍵與主鏈相連。糖原(glycogen)
26、: 是含有分支的-(14)糖苷鍵的葡萄糖殘基的同聚物,支鏈在分支點(diǎn)處通過(guò)-(16)糖苷鍵與主鏈相連。極限糊精(limit dexitrin):是指支鏈淀粉中帶有支鏈的核心部位,該部分經(jīng)支鏈淀粉酶水解作用,糖原磷酸化酶或淀粉磷酸化酶作用后仍然存在。糊精的進(jìn)一步降解需要-(16)糖苷鍵的水解。肽聚糖(peptidoglycan):N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰唾液酸交替連接的雜多糖與不同的肽交叉連接形成的大分子。肽聚糖是許多細(xì)菌細(xì)胞壁的主要成分。糖蛋白(glycoprotein):含有共價(jià)連接的葡萄糖殘基的蛋白質(zhì)。蛋白聚糖(proteoglycan):由雜多糖與一個(gè)多肽連組成的雜化的在分子,多糖是分子
27、的主要成分。第六章 脂類化合物脂肪酸(fatty acid):是指一端含有一個(gè)羧基的長(zhǎng)的脂肪族碳?xì)滏湣V舅崾亲詈?jiǎn)單的一種脂,它是許多更復(fù)雜的脂的成分。飽和脂肪酸(saturated fatty acid):不含有C=C雙鍵的脂肪酸。不飽和脂肪酸(unsaturated fatty acid):至少含有C=C雙鍵的脂肪酸。必需脂肪酸(occential fatty acid):維持哺乳動(dòng)物正常生長(zhǎng)所必需的,而動(dòng)物又不能合成的脂肪酸,Eg亞油酸,亞麻酸。三脂酰苷油(triacylglycerol):那稱為甘油三酯。一種含有與甘油脂化的三個(gè)脂?;孽?。脂肪和油是三脂酰甘油的混合物。磷脂(phosp
28、holipid):含有磷酸成分的脂。Eg卵磷脂,腦磷脂。鞘脂(sphingolipid):一類含有鞘氨醇骨架的兩性脂,一端連接著一個(gè)長(zhǎng)連的脂肪酸,另一端為一個(gè)極性和醇。鞘脂包括鞘磷脂,腦磷脂以及神經(jīng)節(jié)苷脂,一般存在于植物和動(dòng)物細(xì)胞膜內(nèi),尤其是在中樞神經(jīng)系統(tǒng)的組織內(nèi)含量豐富。鞘磷脂(sphingomyelin):一種由神經(jīng)酰胺的C-1羥基上連接了磷酸毛里求膽堿(或磷酸乙酰胺)構(gòu)成的鞘脂。鞘磷脂存在于在多數(shù)哺乳動(dòng)物動(dòng)物細(xì)胞的質(zhì)膜內(nèi),是髓鞘的主要成分。卵磷脂(lecithin):即磷脂酰膽堿(PC),是磷脂酰與膽堿形成的復(fù)合物。腦磷脂(cephalin):即磷脂酰乙醇胺(PE),是磷脂酰與乙醇胺形成
29、的復(fù)合物。脂質(zhì)體(liposome):是由包圍水相空間的磷脂雙層形成的囊泡(小泡)。生物膜(bioligical membrane):鑲嵌有蛋白質(zhì)的脂雙層,起著畫分和分隔細(xì)胞和細(xì)胞器作用生物膜也是與許多能量轉(zhuǎn)化和細(xì)胞內(nèi)通訊有關(guān)的重要部位。內(nèi)在膜蛋白(integral membrane protein):插入脂雙層的疏水核和完全跨越脂雙層的膜蛋白。外周膜蛋白(peripheral membrane protein):通過(guò)與膜脂的極性頭部或內(nèi)在的膜蛋白的離子相互作用和形成氫鍵與膜的內(nèi)或外表面弱結(jié)合的膜蛋白。流體鑲嵌模型(fluid mosaic model):針對(duì)生物膜的結(jié)構(gòu)提出的一種模型。在這個(gè)
30、模型中,生物膜被描述成鑲嵌有蛋白質(zhì)的流體脂雙層,脂雙層在結(jié)構(gòu)和功能上都表現(xiàn)出不對(duì)稱性。有的蛋白質(zhì)“鑲“在脂雙層表面,有的則部分或全部嵌入其內(nèi)部,有的則橫跨整個(gè)膜。另外脂和膜蛋白可以進(jìn)行橫向擴(kuò)散。通透系數(shù)(permeability coefficient):是離子或小分子擴(kuò)散過(guò)脂雙層膜能力的一種量度。通透系數(shù)大小與這些離子或分子在非極性溶液中的溶解度成比例。通道蛋白(channel protein):是帶有中央水相通道的內(nèi)在膜蛋白,它可以使大小適合的離子或分子從膜的任一方向穿過(guò)膜。(膜)孔蛋白(pore protein):其含意與膜通道蛋白類似,只是該術(shù)語(yǔ)常用于細(xì)菌。被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)(passive t
31、ransport):那稱為易化擴(kuò)散。是一種轉(zhuǎn)運(yùn)方式,通過(guò)該方式溶質(zhì)特異的結(jié)合于一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白上,然后被轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)膜,但轉(zhuǎn)運(yùn)是沿著濃度梯度下降方向進(jìn)行的,所以被動(dòng)轉(zhuǎn)達(dá)不需要能量的支持。主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)(active transport):一種轉(zhuǎn)運(yùn)方式,通過(guò)該方式溶質(zhì)特異的結(jié)合于一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白上然后被轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)膜,與被動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)運(yùn)輸方式相反,主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)是逆著濃度梯度下降方向進(jìn)行的,所以主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)需要能量的驅(qū)動(dòng)。在原發(fā)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程中能源可以是光,ATP或電子傳遞;而第二級(jí)主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)是在離子濃度梯度下進(jìn)行的。協(xié)同運(yùn)輸(contransport):兩種不同溶質(zhì)的跨膜的耦聯(lián)轉(zhuǎn)運(yùn)??梢酝ㄟ^(guò)一個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白進(jìn)行同一方向(同向轉(zhuǎn)運(yùn))或反方向(反
32、向轉(zhuǎn)運(yùn))轉(zhuǎn)運(yùn)。胞吞(信用)(endocytosis):物質(zhì)被質(zhì)膜吞入并以膜衍生出的脂囊泡形成(物質(zhì)在囊泡內(nèi))被帶入到細(xì)胞內(nèi)的過(guò)程。第七章 核酸核苷(nucleoside):是嘌呤或嘧啶堿通過(guò)共價(jià)鍵與戊糖連接組成的化合物。核糖與堿基一般都是由糖的異頭碳與嘧啶的N-1或嘌呤的N-9之間形成的-N-糖鍵連接。核苷酸(uncleoside):核苷的戊糖成分中的羥基磷酸化形成的化合物。cAMP(cycle AMP):3,5-環(huán)腺苷酸,是細(xì)胞內(nèi)的第二信使,由于某部些激素或其它分子信號(hào)刺激激活腺苷酸環(huán)化酶催化ATP環(huán)化形成的。磷酸二脂鍵(phosphodiester linkage):一種化學(xué)基團(tuán),指一分子
33、磷酸與兩個(gè)醇(羥基)酯化形成的兩個(gè)酯鍵。該酯鍵成了兩個(gè)醇之間的橋梁。例如一個(gè)核苷的3羥基與別一個(gè)核苷的5羥基與同一分子磷酸酯化,就形成了一個(gè)磷酸二脂鍵。脫氧核糖核酸(DNA):含有特殊脫氧核糖核苷酸序列的聚脫氧核苷酸,脫氧核苷酸之間是是通過(guò)3,5-磷酸二脂鍵連接的。DNA是遺傳信息的載體。核糖核酸(RNA):通過(guò)3,5-磷酸二脂鍵連接形成的特殊核糖核苷酸序列的聚核糖核苷酸。核糖體核糖核酸(Rrna,ribonucleic acid):作為組成成分的一類 RNA,rRNA是細(xì)胞內(nèi)最 豐富的 RNA .信使核糖核酸(mRNA,messenger ribonucleic acid):一類用作蛋白質(zhì)合
34、成模板的RNA .轉(zhuǎn)移核糖核酸(Trna,transfer ribonucleic acid):一類攜帶激活氨基酸,將它帶到蛋白質(zhì)合成部位并將氨基酸整合到生長(zhǎng)著的肽鏈上RNA。TRNA含有能識(shí)別模板mRNA上互補(bǔ)密碼的反密碼。轉(zhuǎn)化(作用)(transformation):一個(gè)外源DNA 通過(guò)某種途徑導(dǎo)入一個(gè)宿主菌,引起該菌的遺傳特性改變的作用。轉(zhuǎn)導(dǎo)(作用)(transduction):借助于病毒載體,遺傳信息從一個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞。堿基對(duì)(base pair):通過(guò)堿基之間氫鍵配對(duì)的核酸鏈中的兩個(gè)核苷酸,例如A與T或U , 以及G與C配對(duì)。夏格夫法則(Chargaffs rules):所有
35、DNA中腺嘌呤與胸腺嘧啶的摩爾含量相等(A=T),鳥嘌呤和胞嘧啶的摩爾含量相等(G=C),既嘌呤的總含量相等(A+G=T+C)。DNA的堿基組成具有種的特異性,但沒(méi)有組織和器官的特異性。另外,生長(zhǎng)和發(fā)育階段營(yíng)養(yǎng)狀態(tài)和環(huán)境的改變都不影響DNA的堿基組成。DNA的雙螺旋(DNAdouble helix):一種核酸的構(gòu)象,在該構(gòu)象中,兩條反向平行的多核甘酸鏈相互纏繞形成一個(gè)右手的雙螺旋結(jié)構(gòu)。堿基位于雙螺旋內(nèi)側(cè),磷酸與糖基在外側(cè),通過(guò)磷酸二脂鍵相連,形成核酸的骨架。堿基平面與假象的中心軸垂直,糖環(huán)平面則與軸平行,兩條鏈皆為右手螺旋。雙螺旋的直徑為2nm,堿基堆積距離為0.34nm,兩核甘酸之間的夾角是
36、36,每對(duì)螺旋由10對(duì)堿基組成,堿基按A-T,G-C配對(duì)互補(bǔ),彼此以氫鍵相聯(lián)系。維持DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定的力主要是堿基堆積力。雙螺旋表面有兩條寬窄深淺不一的一個(gè)大溝和一個(gè)小溝。大溝(major groove)和小溝(minor groove):繞B-DNA雙螺旋表面上出現(xiàn)的螺旋槽(溝),寬的溝稱為大溝,窄溝稱為小溝。大溝,小溝都、是由于堿基對(duì)堆積和糖-磷酸骨架扭轉(zhuǎn)造成的。DNA超螺旋(DNAsupercoiling):DNA本身的卷曲一般是DNA雙螺旋的彎曲欠旋(負(fù)超螺旋)或過(guò)旋(正超螺旋)的結(jié)果。拓?fù)洚悩?gòu)酶(topoisomerse):通過(guò)切斷DNA的一條或兩條鏈中的磷酸二酯鍵,然后重新纏
37、繞和封口來(lái)改變DNA連環(huán)數(shù)的酶。拓?fù)洚悩?gòu)酶、通過(guò)切斷DNA中的一條鏈減少負(fù)超螺旋,增加一個(gè)連環(huán)數(shù)。某些拓?fù)洚悩?gòu)酶也稱為DNA促旋酶。核小體(nucleosome):用于包裝染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)單位,是由DNA鏈纏繞一個(gè)組蛋白核構(gòu)成的。染色質(zhì)(chromatin): 是存在與真核生物間期細(xì)胞核內(nèi),易被堿性染料著色的一種無(wú)定形物質(zhì)。染色質(zhì)中含有作為骨架的完整的雙鏈DNA,以及組蛋白非組蛋白和少量的DNA。染色體(chromosome):是染色質(zhì)在細(xì)胞分裂過(guò)程中經(jīng)過(guò)緊密纏繞折疊凝縮和精細(xì)包裝形成的具有固定形態(tài)的遺傳物質(zhì)存在形式。簡(jiǎn)而言之,染色體是一個(gè)大的單一的雙鏈DNA分子與相關(guān)蛋白質(zhì)組成的復(fù)合物,DNA中
38、含有許多貯存和傳遞遺傳信息的基因。DNA變性(DNAdenaturation):DNA雙鏈解鏈,分離成兩條單鏈的現(xiàn)象。退火(annealing):既DNA由單鏈復(fù)性、變成雙鏈結(jié)構(gòu)的過(guò)程。來(lái)源相同的DNA單鏈經(jīng)退火后完全恢復(fù)雙鏈結(jié)構(gòu)的過(guò)程,同源DNA之間DNA和RNA之間,退火后形成雜交分子。熔解溫度(melting temperature,Tm):雙鏈DNA熔解徹底變成單鏈DNA的溫度范圍的中點(diǎn)溫度。增色效應(yīng)(hyperchromic effect):當(dāng)雙螺旋DNA熔解(解鏈)時(shí),260nm處紫外吸收增加的現(xiàn)象。減色效應(yīng)(hypochromic effect):隨著核酸復(fù)性,紫外吸收降低的現(xiàn)象
39、。核酸內(nèi)切酶(exonuclease): 核糖核酸酶和脫氧核糖核酸酶中能夠水解核酸分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶。核酸外切酶(exonuclease):從核酸鏈的一端逐個(gè)水解核甘酸的酶。限制性內(nèi)切酶(restriction endonuclease):一種在特殊核甘酸序列處水解雙鏈DNA的內(nèi)切酶。型限制性內(nèi)切酶既能催化宿主DNA的甲基化,又催化非甲基化的DNA的水解;而型限制性內(nèi)切酶只催化非甲基化的DNA的水解。限制酶圖譜(restriction map):同一DNA用不同的限制酶進(jìn)行切割,從而獲得各種限制酶的切割位點(diǎn),由此建立的位點(diǎn)圖譜有助于對(duì)DNA的結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析。反向重復(fù)序列(inverted re
40、peat sequence):在同一多核甘酸內(nèi)的相反方向上存在的重復(fù)的核甘酸序列。在雙鏈DNA中反向重復(fù)可能引起十字形結(jié)構(gòu)的形成。重組DNA技術(shù)(recombination DNA technology):也稱之為基因工程(genomic engineering).利用限制性內(nèi)切酶和載體,按照預(yù)先設(shè)計(jì)的要求,將一種生物的某種目的基因和載體DNA重組后轉(zhuǎn)入另一生物細(xì)胞中進(jìn)行復(fù)制轉(zhuǎn)錄和表達(dá)的技術(shù)。基因(gene):也稱為順?lè)醋樱╟istron).泛指被轉(zhuǎn)錄的一個(gè)DNA片段。在某些情況下,基因常用來(lái)指編碼一個(gè)功能蛋白或DNA分子的DNA片段。第八章 新陳代謝分解代謝反應(yīng)(catabolic reac
41、tion):降解復(fù)雜分子為生物體提供小的構(gòu)件分子和能量代謝反應(yīng)。合成代謝反應(yīng)(anablic reaction):合成用于細(xì)胞維持和生長(zhǎng)所需分子的代謝反應(yīng)。反饋抑制(feedback inbition):催化一個(gè)代謝途徑中前面反應(yīng)的酶受到同一途徑終產(chǎn)物抑制的現(xiàn)象前饋激活(feed-forward activition):代謝途徑中一個(gè)酶被該途徑中前面產(chǎn)生的代謝物激活的現(xiàn)象。標(biāo)準(zhǔn)自由能變化(GO):相應(yīng)于在一系列標(biāo)準(zhǔn)條件(溫度298K,壓力1atm(=101.325KPa),所有溶質(zhì)的濃度都是不是mol/L)下發(fā)生的反應(yīng)自由能變化。GO表示pH7.0條件下的標(biāo)準(zhǔn)自由能變化。標(biāo)準(zhǔn)還原電動(dòng)勢(shì)(EO)
42、:25和pH7.0條件下,還原劑和它的氧化形式在1mol/L濃度下表現(xiàn)出的電動(dòng)勢(shì).第九章 糖代謝酵解(glycolysis):由10步酶促反應(yīng)組成的糖分解代謝途徑。通過(guò)該途徑,一分子葡萄糖轉(zhuǎn)化為兩分子丙酮酸,同時(shí)凈生成兩分子ATP和兩分子NADH。發(fā)酵(fermentation):營(yíng)養(yǎng)分子(Eg葡萄糖)產(chǎn)能的厭氧降解。在乙醇發(fā)酵中,丙酮酸轉(zhuǎn)化為乙醇和CO2。巴斯德效應(yīng)(Pasteur effect):氧存在下,酵解速度放慢的現(xiàn)象。底物水平磷酸化(substrate phosphorlation):ADP或某些其它的核苷-5二磷酸的磷酸化是通過(guò)來(lái)自一個(gè)非核苷酸底物的磷?;霓D(zhuǎn)移實(shí)現(xiàn)的。這種磷酸化
43、與電子的轉(zhuǎn)遞鏈無(wú)關(guān)。檸檬酸循環(huán)(citric acid cycle):也稱為三羧酸循環(huán)(TAC),Krebs循環(huán)。是用于乙酰CoA中的乙?;趸蒀O2的酶促反應(yīng)的循環(huán)系統(tǒng),該循環(huán)的第一步是由乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸縮合形成檸檬酸。回補(bǔ)反應(yīng)(anaplerotic reaction):酶催化的,補(bǔ)充檸檬酸循環(huán)中間代謝物供給的反應(yīng),例如由丙酮酸羧化酶生成草酰乙酸的反應(yīng)。乙醛酸循環(huán)(glyoxylate cycle):是某些植物,細(xì)菌和酵母中檸檬酸循環(huán)的修改形式,通過(guò)該循環(huán)可以收乙乙酰CoA經(jīng)草酰乙酸凈生成葡萄糖。乙醛酸循環(huán)繞過(guò)了檸檬酸循環(huán)中生成兩個(gè)CO2的步驟戊糖磷酸途徑(pentose phosp
44、hare parhway):那稱為磷酸已糖支路。是一個(gè)葡萄糖-6-磷酸經(jīng)代謝產(chǎn)生NADPH和核糖-5-磷酸的途徑。該途徑包括氧化和非氧化兩個(gè)階段,在氧化階段,葡萄糖-6-磷酸轉(zhuǎn)化為核酮糖-5-磷酸和CO2,并生成兩分子NADPH;在非氧化階段,核酮糖-5-磷酸異構(gòu)化生成核糖-5-磷酸或轉(zhuǎn)化為酵解的兩用人才個(gè)中間代謝物果糖-6-磷酸和甘油醛-3-磷酸。糖醛酸途徑(glucuronate pathway):從葡萄糖-6-磷酸或葡萄糖-1-磷酸開始,經(jīng)UDP-葡萄糖醛酸生成葡萄糖醛酸和抗壞血酸的途徑。但只有在植物和那些可以合成抗壞血酸的動(dòng)物體內(nèi),才可以通過(guò)該途徑合成維生素C。無(wú)效循環(huán)(futile
45、cycle):也稱為底物循環(huán)。一對(duì)酶催化的循環(huán)反應(yīng),該循環(huán)通過(guò)ATP的水解導(dǎo)致熱能的釋放。Eg葡萄糖+ATP=葡萄糖6-磷酸+ADP與葡萄糖6-磷酸+H2O=葡萄糖+P i反應(yīng)組成的循環(huán)反應(yīng),其凈反應(yīng)實(shí)際上是i。磷酸解(phosphorolysis)作用::通過(guò)在分子內(nèi)引入一個(gè)無(wú)機(jī)磷酸,形成磷酸脂鍵而使原來(lái)鍵斷裂的方式。實(shí)際上引入了一個(gè)磷酰基。半乳糖血癥(galactosemia):人類的一種基因型遺傳代謝缺陷,是由于缺乏磷酸半乳糖尿苷酰轉(zhuǎn)移酶,導(dǎo)致嬰兒不能代謝奶汁中乳糖分解生成的半乳糖。尾部生長(zhǎng)(tailward growth):一種聚合反應(yīng)機(jī)理經(jīng)過(guò)私有化的單體的頭部結(jié)合到聚合的尾部,連接到
46、聚合物尾部的單體的尾部又生成了接下一個(gè)單體的受體。糖異生作用(gluconenogenesis):由簡(jiǎn)單的非糖前體轉(zhuǎn)變?yōu)樘堑倪^(guò)程。糖異生不是糖酵解的簡(jiǎn)單逆轉(zhuǎn)。雖然由丙酮酸開始的糖異生利用了糖酵解中的七步進(jìn)似平衡反應(yīng)的逆反應(yīng),但還必需利用另外四步酵解中不曾出現(xiàn)的酶促反應(yīng),繞過(guò)酵解過(guò)程中不可逆的三個(gè)反應(yīng)。 第十章 生物氧化呼吸電子傳遞鏈(respiratory electron-transport chain):由一系列可作為電子載體的酶復(fù)合體和輔助因子構(gòu)成,可將來(lái)自還原型輔酶或底物的電子傳遞給有氧代謝的最終的電子受體分子氧氧化磷酸化(oxidative phosphorylation):電子從一
47、個(gè)底物傳遞給分子氧的氧化與酶催化的由和i生成與磷酸化相偶聯(lián)的過(guò)程?;瘜W(xué)滲透理論(chemiosnotic theory):一種學(xué)說(shuō),主要論點(diǎn)是底物氧化期間建立的質(zhì)子濃度梯度提供了驅(qū)動(dòng)和和i形成的能量。解偶聯(lián)劑(uncoupling agent):一種使電子傳遞與磷酸化之間的的緊密偶聯(lián)關(guān)系解除的化合物,g2,4二硝基苯酚。P/O比(P/O ratio):在氧化磷酸化中,每1/2O2被還原成ADP的摩爾數(shù)。電子從NADH傳遞給O2時(shí),P/O,而電子從FADH2傳遞給O2時(shí),P/O。高能化合物(high energy compound):在標(biāo)準(zhǔn)條件下水解時(shí),自由能大幅度減少和化合物。一般是指水解釋放
48、的能量能驅(qū)動(dòng)ADP磷酸化合成ATP的化合物。第十一章 脂代謝-氧化:碳氧化降解生成乙酰CoA,同時(shí)生成NADH 和FADH2,因此可產(chǎn)生大量的ATP。該途徑因脫氫和裂解均發(fā)生在位碳原子而得名。每一輪脂肪酸氧化都由四步反應(yīng)組成:氧化,水化,再氧化和硫解。肉毒堿穿梭系統(tǒng)(carnitine shuttle system):脂酰CoA通過(guò)形成脂酰肉毒堿從細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體的一個(gè)穿梭循環(huán)途徑。酮體(acetone body):在肝臟中由乙酰CoA合成的燃料分子(羥基丁酸,乙酰乙酸和丙酮)。在饑餓期間酮體是包括腦在內(nèi)的許多組織的燃料,酮體過(guò)多會(huì)導(dǎo)致中毒。檸檬酸轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(citrate transport
49、 system):將乙酰CoA從線粒體轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)的穿梭循環(huán)途徑。在轉(zhuǎn)運(yùn)乙酰CoA的同時(shí),細(xì)胞質(zhì)中NADH氧化成NAD,NADP+還原為NADPH。每循環(huán)一次消耗兩分子ATP.酰基載體蛋白(ACP):通過(guò)硫脂鍵結(jié)合脂肪酸合成的中間代謝物的蛋白質(zhì)(原核生物)或蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)域(真核生物)。第十二章 氨基酸的代謝生物固氮作用(biological nitrogen fixatio):大氣中的氮被原還為氨的過(guò)程。生物固氮只發(fā)生在少數(shù)的細(xì)菌和藻類中。尿素循環(huán)(urea cycle):是一個(gè)由4步酶促反應(yīng)組成的,可以將來(lái)自氨和天冬氨酸的氮轉(zhuǎn)化為尿素的循環(huán)。循環(huán)是發(fā)生在脊椎動(dòng)物的肝臟中的一個(gè)代謝循環(huán)。脫氨(
50、deamination):在酶的催化下從生物分子(氨基酸或核苷酸)中除去氨基的過(guò)程。氧化脫氨(oxidative deamination):-氨基酸在酶的催化下脫氨生成相應(yīng)的-酮酸的過(guò)程。氧化脫氨實(shí)際上包括氧化和脫氨兩個(gè)步驟。(脫氨和水解)轉(zhuǎn)氨(transamination):一個(gè)-氨基酸的-氨基借助轉(zhuǎn)氨酶的催化作用轉(zhuǎn)移到一個(gè)-酮酸的過(guò)程。乒乓反應(yīng)(ping-pong reaction):在該反應(yīng)中,酶結(jié)合一個(gè)底物并釋放一個(gè)產(chǎn)物,留下一個(gè)取代酶,然后該取代酶再結(jié)合第二個(gè)底物和釋放出第二個(gè)產(chǎn)物,最后酶恢復(fù)到它的起始狀態(tài)。生糖氨基酸(glucongenic amino acid):降解可生成能作為
51、糖異生前體的分子,例如丙酮酸或檸檬酸循環(huán)中間代謝物的氨基酸。生酮氨基酸(acetonegenic amino acid):降解可生成乙酰CoA或酮體的氨侉酸。苯酮尿癥(phenylketonuria):是由于苯丙氨酸羥化酶缺乏引起苯丙酸堆積的代謝遺傳病。缺乏丙酮酸羥化酶,苯丙氨酸只能靠轉(zhuǎn)氨生成苯丙酮酸,病人尿中排出大量苯丙酮酸。苯丙酮酸堆積對(duì)神經(jīng)有毒害,使智力發(fā)肓出現(xiàn)障礙。尿黑酸癥(alcaptonuria):是酪氨酸代謝中缺乏尿黑酸酶引起的代謝遺傳病。這種病人的尿中含有尿黑酸,在堿性條件下暴露于氧氣中,氧化并聚合為類似于黑色素的物質(zhì),從而使尿成黑色。第十三章 核苷酸代謝核苷酸磷酸化酶(nuc
52、loside phosphoryalse):能分解核苷生成含氮堿和戊糖的磷酸酯的酶。核苷水解酶(nucloside hydrolase):能分解核苷生成含氮堿和戊糖的酶。從頭合成(de novo synthesis):生物體內(nèi)用簡(jiǎn)單的前體物質(zhì)合成生物分子的途徑,例如核苷酸的從頭合成。補(bǔ)救途徑(salvage pathway):與從頭合成途徑不同,生物分子,例如核苷酸,可以由該類分子降解形成的中間代謝物,如堿基等來(lái)合成,該途徑是一個(gè)再循環(huán)途徑。痛風(fēng)(gout):是尿酸過(guò)量生產(chǎn)或尿酸排瀉不充分引起的尿酸堆積造成的,尿酸結(jié)晶堆積在軟骨,軟組織,腎臟以及關(guān)節(jié)處。在關(guān)節(jié)處的沉積會(huì)造成劇烈的疼痛。別嘌呤醇
53、(allopurinol):是結(jié)構(gòu)上煩惱于黃嘌呤的化合物(在嘌呤環(huán)上第七位是C,第八位是N),對(duì)黃嘌呤氧化酶有很強(qiáng)的抑制作用,常用來(lái)治療痛風(fēng)。自殺抑制作用(suicide substrate):底物煩惱物經(jīng)酶催化生成的產(chǎn)物變成了該酶的抑制劑,例如別嘌呤醇對(duì)黃嘌呤氧化酶的抑制就屬于這種類型。Lesch-Nyhan綜合癥(Lesch-Nyhan syndrome):也稱為自毀容貌癥,是由于次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶的遺傳缺陷引起的。缺乏該酶使得次黃嘌呤和鳥嘌呤不能轉(zhuǎn)換為IMP和GMP,而是降解為尿酸,過(guò)量尿酸將導(dǎo)致Lesch-Nyhan綜合癥。第十四章 DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯半保留復(fù)制(sem
54、iconservative replication):DNA復(fù)制的一種方式。每條鏈都可用作合成互補(bǔ)鏈的模板,合成出兩分子的雙鏈DNA,每個(gè)分子都是由一條親代鏈和一條新合成的鏈組成。復(fù)制叉(replication fork):Y字型結(jié)構(gòu),在復(fù)制叉處作為模板的雙鏈DNA解旋,同是合成新的DNA鏈。DNA聚合酶(DNA polymerase):以DNA為模板,催化核苷酸殘基加到已存在的聚核苷酸3末端反應(yīng)的酶。某些DNA聚全酶具有外切核酸酶的活性,可用來(lái)校正新合成的核苷酸的序列。Klenow片段(Klenow fragment):E.coli DNA聚合酶I經(jīng)部分水解生成的C末端605個(gè)氨基酸殘基片段
55、。該片段保留了DNA聚合酶I的5-3聚合酶和3-5外切酶活性,但缺少完整酶的5-3外切酶活性。前導(dǎo)鏈(leading strand):與復(fù)制叉移動(dòng)的方向一致,通過(guò)連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。滯后鏈(lagging strand):與復(fù)制叉移動(dòng)的方向相反,通過(guò)不連續(xù)的5-3聚合合成的新的DNA鏈。岡崎片段(Okazaki fragment):相對(duì)比較短的DNA鏈(大約1000核苷酸殘基),是在DNA的滯后鏈的不連續(xù)合成期間生成的片段,這是Reiji Okazaki在DNA合成實(shí)驗(yàn)中添加放射性的脫氧核苷酸前體觀察到的。引發(fā)體(primosome):一種多蛋白復(fù)合體,E.coli中的引發(fā)體包
56、括催化DNA滯后鏈不連續(xù)DNA合成所必需的,短的RNA引物合成的引發(fā)酶,解旋酶。復(fù)制體(replisome):一種多蛋白復(fù)合體,包含DNA聚合酶,引發(fā)酶,解旋酶,單鏈結(jié)合蛋白和其它輔助因子。復(fù)制體位于每個(gè)復(fù)制叉處進(jìn)行細(xì)菌染色體DNA復(fù)制的聚合反應(yīng)。單鏈結(jié)合蛋白(SSB):一種與單鏈DNA結(jié)合緊密的蛋白,它的結(jié)構(gòu)可以防止復(fù)制叉處單鏈DNA本身重新折疊回雙鏈區(qū)。滾環(huán)復(fù)制(rolling-circle replication):復(fù)制環(huán)狀DNA的一種模式,在該模式中,DNA聚合酶結(jié)合在一個(gè)缺口鏈的3端繞環(huán)合成與模板鏈互補(bǔ)的DNA,每一輪都是新合成的DNA取代前一輪合成的DNA。逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse
57、 transcriptase):一種催化以RNA為模板合成DNA的DNA聚合酶,具有RNA指導(dǎo)的DNA合成,水解RNA和DNA指導(dǎo)的DNA合成的酶活性?;パa(bǔ)NDA(cDNA):通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄酶由mRNA模板合成的雙鏈DNA。聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR):擴(kuò)增樣品中的DNA量和富集眾多DNA分子中的一個(gè)特定的DNA序列的一種技術(shù)。在該反應(yīng)中,使用與目的DNA序列互補(bǔ)的寡核苷酸作為引物,進(jìn)行多輪的DNA合成。其中包括DNA變性,引物退火和在Tap DNA聚合酶催化下的DNA合成。直接修復(fù)(direct repair):是通過(guò)一種可連續(xù)掃描DNA,識(shí)別出損傷部位的蛋白質(zhì),將損傷部位直接修復(fù)的方法。該修復(fù)方法不用切斷DNA或切除堿基。切除修復(fù)(excision repair):通過(guò)切除-修復(fù)內(nèi)切酶使DNA損傷消除的修復(fù)方法。一般是切除損傷區(qū),然后在DNA聚合酶的作用下,以露出的單鏈為模板合成新的互補(bǔ)鏈,最后用連接酶將缺口連接起來(lái)。錯(cuò)配修復(fù)(mismatch
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