Pubmed及Endnote使用PPT課件

1、Pubmed及Endnote基本使用,/pubmed,Welcome to PubMed,使用幫助,檢索詞輸入框,常用工具,更多服務,PubMed基本檢索,自由詞檢索 在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。 例如：檢索腫瘤 (cancer)方面的文章。 在檢索框中輸入：“cancer”，再點擊“Go”按鈕。 PubMed將自動地利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉換成M

2、eSH詞表中規(guī)范的用詞進行檢索，比如，檢索“cancer” 將自動轉換為： neoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields,PubMed基本檢索,布爾邏輯組合 檢索，常用的 邏輯關系詞有 AND，OR， NOT等,邏輯與（AND） -檢出記錄中同時含有檢索詞A和檢索詞B. 如：A AND B,邏輯非（NOT） -在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。 如：A NOT B,邏輯或（OR） -檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時含有檢索詞A和B的文獻。 如：A OR B,PubMed基本檢索,截詞檢索 截詞檢索的

3、作用：擴大檢索范圍，提高查全率。 截詞符： 用*表示，代表多個字符，將*加在檢索詞后可以表示對所有以該詞開頭的詞進行檢索。 如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium，等最多600個單詞。,PubMed基本檢索,強制檢索功能 PubMed允許使用雙引號來強制系統(tǒng)進行短語檢索。 如：在PubMed主頁的檢索提問框中鍵入“single cell”，并用雙引號引起來。點擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會將其作為一個不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫的全部字段中進行檢索。 如果不使用雙引號進行強制檢索，系統(tǒng)就會將其分成2個詞：single和cell檢索，其檢

4、索表達式為：single AND cell. 很明顯這樣的檢索結果是不符號要求的。,主題詞MeSH檢索,醫(yī)學主題詞表數(shù)據(jù)庫(MeSH Database) 利用主題詞進行檢索 方法: 1、點擊主頁右下角的MeSH Database進入主題詞檢索界面； 2、輸入檢索詞后，點擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關主題詞； 3、點擊該主題詞進一步顯示該主題詞的定義、樹狀結構、組配的副主題詞； 4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點擊send to按鈕，進入檢索表達式瀏覽窗口； 5、點擊Search PubMed將顯示檢索結果。,主題詞MeSH檢索,主題詞數(shù)據(jù)庫 在PubMed首 頁導航欄的右 下角,主題詞數(shù)據(jù)

5、庫,主題詞MeSH檢索,輸入普通詞 查找對應主題詞,MeSH,主題詞檢索可 以指導用戶高 質量地檢索醫(yī) 學文獻,主題詞MeSH檢索,一般一個主題 詞還要配合一 個副主題詞進 行組合檢索,選擇副主題詞,Search Box with AND,主題詞MeSH檢索,點Sent to 將 檢索詞添加到 檢索表達式瀏 覽窗口,主題詞MeSH檢索,Search PubMed,主題詞檢索可 以達到比較滿 意的查全率和 查準率,主題詞MeSH檢索,主題詞檢索是 在有主題標引 的Medline數(shù) 據(jù)庫中檢索,主題詞檢索結果,主題詞MeSH檢索,普通詞不是規(guī) 范化的主題詞 檢索結果相關 度低,普通詞檢索結果,Pu

6、bMed全文獲取,通過PubMed檢索出來的文獻，部分我們通過瀏覽摘要即可，部分我們還需要查看全文，以作進一步的研究，那么，我們?nèi)绾潍@取全文呢？ 一：免費的全文,PubMed全文獲取,PubMed收錄 的文獻大約有 5%是免費的 可以直接打開 全文,免費全文可直接打開,PubMed全文獲取,打開PDF全文,免費的全文并 不代表學術價 值低，大部分 的生命科學的 全文都是免費 的,百度、google檢索小技巧 輸入 表面活性劑 filetype:ppt filetype:doc,PubMed全文獲取,二：學校已訂購的全文 如果我們所需要的文獻，學校已訂購了該文獻所在的全文型數(shù)據(jù)庫，我們也可以直接

7、打開或到相應的全文數(shù)據(jù)庫中查找。,Wiley(J Pharm Sci)；Ingenta；Nature,PubMed全文獲取,SpringerLink 和EBSCO等外 文全文庫，一 般學校也有訂 購,學校已訂購,PubMed全文獲取,學校未訂購的 全文，如果不 是免費的，一 般需要付費,學校未訂購,參考文獻管理軟件 Endnote NoteExpress,提綱,Endnote 基本原理 建立文獻數(shù)據(jù)庫（library） 文獻管理 撰寫文章時插入?yún)⒖嘉墨I,科研信息管理工具 Endnote X4,一、Endnote基本原理,科研信息管理工具 Endnote X4,文獻使用過程中的常見問題： 諸多文

8、獻從不同數(shù)據(jù)庫重復下載 文獻存放混亂，難以很快找到需要的文獻 寫論文時，文后參考文獻的編寫非常繁瑣 多次投稿時，要反復修改參考文獻格式 ,個人專題文獻數(shù)據(jù)庫Library *.enl,Filter,Filter,一、Endnote基本原理,圖表,文章標題,期刊名,文摘,出版時間,關鍵詞,讀書筆記,全文,作者,群組管理,Endnote 管理界面,三、建立Endnote文獻數(shù)據(jù)庫,3.0 新建一個Library 3.1 手工錄入文獻 3.2 PDF文件導入和PDF文件夾導入 3.3 利用網(wǎng)絡插件導入 3.4 網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫檢索結果導入 3.5 Google scholar導入 3.6 在線檢索 3.7

9、 全文查找與關聯(lián),科研信息管理工具 Endnote X4,3.0 新建一個專題庫library,創(chuàng)建一個新的數(shù)據(jù)庫,Endnote專題文獻庫的建立,將數(shù)據(jù)庫命名 存放在某個合適的文件夾下,Endnote專題文獻庫的建立,已經(jīng)建立了一個 “data mining” 專題數(shù)據(jù)庫,Endnote專題數(shù)據(jù)庫的界面,分組窗口,文獻顯示窗口,文獻預覽和檢索窗口,3.1文獻導入-手工導入,科研信息管理工具 Endnote X4,3.2 文獻導入-單個PDF文件導入,科研信息管理工具 Endnote X4,3.2 文獻導入-PDF 文件夾導入,科研信息管理工具 Endnote X4,PDF導入的條件,必須是P

10、DF文檔 PDF中必須有DOI（數(shù)字對象標識）號 必須有網(wǎng)絡條件（www.CrossR）,科研信息管理工具 Endnote X4,3.3文獻導入-網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫導入,Web of science Elsevier Springer(Kluwer) wiley(blackwell) Science Nature CNKI(text translation : UTF-8) VIP(text translation : GB2312),科研信息管理工具 Endnote X4,Endnote 文獻導入方法（ISI Web of knowledge平臺）,Endnote 文獻導入方法（ISI

11、Web of knowledge平臺）,選擇文獻,Endnote 文獻導入方法（ISI Web of knowledge平臺）,選擇數(shù)據(jù)庫,Endnote 文獻導入方法（ISI Web of knowledge平臺）,選擇數(shù)據(jù)庫,所選擇的6篇文獻 批量導入Endnote中,Endnote 文獻導入方法（CNKI中文）,由網(wǎng)址進入,Endnote 文獻導入方法（CNKI中文）,保存文件,Endnote 文獻導入方法（CNKI中文）,打開已保存的txt文件,Endnote 文獻導入方法（CNKI中文）,3.4 導入文獻Google Scholar,3.6 文獻導入-Endnote內(nèi)部在線檢索,科研

12、信息管理工具 Endnote X4,3.7. 全文文獻的在線下載,選擇文獻,點此找全文,3.7 全文文獻的在線下載,能夠找到全文的文章在此會有顯示,有標識的文獻代表已將全文文章下載并鏈接在此處，可以直接打開全文 無標識的文獻提供的是全文的URL地址，可以打開鏈接地址看全文,3. 7全文、圖片等資料的關聯(lián),選擇文獻可以添加附件,選擇本地貯存的文件就可以鏈接附件，共可鏈接45個不同類型的文件,3. 7全文、圖片等資料的關聯(lián),選擇文獻打開添加圖片,選擇要添加的圖片,3. 7全文、圖片等資料的關聯(lián),點此添加圖片， 一條文獻只能添加一張圖片,提綱,Endnote基本原理 Endnote下載安裝 建立文獻

13、數(shù)據(jù)庫（library） 文獻管理 撰寫文章時插入?yún)⒖嘉墨I,科研信息管理工具 Endnote X4,四、文獻管理,迅速編輯功能 查重：可以對查重的文獻進行復制、粘貼、保存 分組：有兩級目錄，可通過組合已有組創(chuàng)建新組 檢索：多個字段，包括PDF 找全文,科研信息管理工具 Endnote X4,Endnote X4 的新功能,4.1 增加了迅速編輯的功能,快速編輯欄,Endnote X4 的新功能,4.1 增加了迅速編輯的功能,可以在這里直接編輯,鼠標在修改文獻外可以直接保存,Endnote X4 的新功能,4.2 增加了查重文獻時的編輯功能,Endnote X4 的新功能,4.3 增加了全文檢索

14、的功能,可以對PDF進行全文檢索,提綱,Endnote基本原理 Endnote下載安裝 建立文獻數(shù)據(jù)庫（library） 文獻管理 撰寫文章時插入?yún)⒖嘉墨I,科研信息管理工具 Endnote X4,五、撰寫文章時插入?yún)⒖嘉墨I,選擇參考文獻 在文中插入 選擇參考文獻格式style 保存副本 去掉代碼,科研信息管理工具 Endnote X4,EndNote X4 工具列功能說明:,Citations 部份 : 點擊Insert Citation 會出現(xiàn)以下選項:,查找Endnote中的文獻,插入注釋( Numbered),把EndNote library 中所選文獻 插入 Word 文檔,查找End

15、note中的圖表,66,Citations 部份(續(xù)) :,返回或打開EndNote library,編輯Word 文檔中的引文,通常用于刪除引文及其參考文獻,修改編輯 EndNote 中相應參考文獻, 但第一作者和年代不可修改,67,Bibliography 部份 :,根據(jù)刊名選擇參考文獻格式,更新參考文獻格式,68,Bibliography 部份(續(xù)) :,點擊 Convert Citations and Bibliography 會出現(xiàn)以下選項 :,會取消 Word 文檔中已格式化的 參考文獻只剩引文,可另選 Output Style 后點擊Update Citations and Bi

16、bliography 更新引文與參考文獻格式,投稿時去掉Endnote代碼,Word 2007功能,69,Endnote X4 的新功能,創(chuàng)建文中引用和文后參考文獻的關聯(lián),Endnote X4 的新功能,5.1 創(chuàng)建文中引用和文后參考文獻的關聯(lián),產(chǎn)生了和文后參考文獻對應的鏈接,Endnote X4 的新功能,5.2 擴展編輯引用的功能,可以對文獻引用進行編輯,工具可以對引用文獻格式化或導出,Endnote X4 的新功能,5.3 在endnote中產(chǎn)生word引用的臨時組,引用了文獻,產(chǎn)生臨時組,Endnote X4 的新功能,5.4 在導出文獻庫中識別word的引用,導出traveling

17、library文獻庫,Endnote X4 的新功能,5.5 在導出文獻庫中識別word的引用,在導出的文獻庫中可以顯示word的引用,荷蘭醫(yī)學文摘,PubMed基本檢索,自由詞檢索 在檢索框中鍵入一個或多個英文單詞（大寫或小寫均可），點擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會自動在主題詞表，期刊名表，短語表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動詞匯匹配功能”。 例如：檢索腫瘤 (cancer)方面的文章。 在檢索框中輸入：“cancer”，再點擊“Go”按鈕。 PubMed將自動地利用它的“自動詞匯匹配”功能將重要的詞語結合在一起，并將不規(guī)范的詞語轉換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進行檢索，比如，檢索“cancer” 將自動轉換為： neoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields,Search Box with AND,主題詞MeSH檢索,點Sent to 將 檢索詞添加到 檢索表達式瀏 覽窗口,PubMed全文獲取,學校未訂購的 全文，如果不 是免費的，一 般需要付費,學校未訂