Pubmed及Endnote使用PPT課件

1、Pubmed及Endnote基本使用,/pubmed,Welcome to PubMed,使用幫助,檢索詞輸入框,常用工具,更多服務(wù),PubMed基本檢索,自由詞檢索 在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)英文單詞（大寫或小寫均可），點(diǎn)擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在主題詞表，期刊名表，短語(yǔ)表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動(dòng)詞匯匹配功能”。 例如：檢索腫瘤 (cancer)方面的文章。 在檢索框中輸入：“cancer”，再點(diǎn)擊“Go”按鈕。 PubMed將自動(dòng)地利用它的“自動(dòng)詞匯匹配”功能將重要的詞語(yǔ)結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語(yǔ)轉(zhuǎn)換成M

2、eSH詞表中規(guī)范的用詞進(jìn)行檢索，比如，檢索“cancer” 將自動(dòng)轉(zhuǎn)換為： neoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields,PubMed基本檢索,布爾邏輯組合 檢索，常用的 邏輯關(guān)系詞有 AND，OR， NOT等,邏輯與（AND） -檢出記錄中同時(shí)含有檢索詞A和檢索詞B. 如：A AND B,邏輯非（NOT） -在含檢索詞A的記錄中，去掉含檢索詞B的記錄。 如：A NOT B,邏輯或（OR） -檢出記錄中含有檢索詞A或檢索詞B或同時(shí)含有檢索詞A和B的文獻(xiàn)。 如：A OR B,PubMed基本檢索,截詞檢索 截詞檢索的

3、作用：擴(kuò)大檢索范圍，提高查全率。 截詞符： 用*表示，代表多個(gè)字符，將*加在檢索詞后可以表示對(duì)所有以該詞開(kāi)頭的詞進(jìn)行檢索。 如：bacter*，可以檢出bacter，bacteria， bacteriophage ，bacterium，等最多600個(gè)單詞。,PubMed基本檢索,強(qiáng)制檢索功能 PubMed允許使用雙引號(hào)來(lái)強(qiáng)制系統(tǒng)進(jìn)行短語(yǔ)檢索。 如：在PubMed主頁(yè)的檢索提問(wèn)框中鍵入“single cell”，并用雙引號(hào)引起來(lái)。點(diǎn)擊“GO”按鈕，系統(tǒng)會(huì)將其作為一個(gè)不可分割的詞組在數(shù)據(jù)庫(kù)的全部字段中進(jìn)行檢索。 如果不使用雙引號(hào)進(jìn)行強(qiáng)制檢索，系統(tǒng)就會(huì)將其分成2個(gè)詞：single和cell檢索，其檢

4、索表達(dá)式為：single AND cell. 很明顯這樣的檢索結(jié)果是不符號(hào)要求的。,主題詞MeSH檢索,醫(yī)學(xué)主題詞表數(shù)據(jù)庫(kù)(MeSH Database) 利用主題詞進(jìn)行檢索 方法: 1、點(diǎn)擊主頁(yè)右下角的MeSH Database進(jìn)入主題詞檢索界面； 2、輸入檢索詞后，點(diǎn)擊go按鈕，系統(tǒng)將顯示與該詞有關(guān)主題詞； 3、點(diǎn)擊該主題詞進(jìn)一步顯示該主題詞的定義、樹(shù)狀結(jié)構(gòu)、組配的副主題詞； 4、選擇合適的主題詞與副主題詞后，點(diǎn)擊send to按鈕，進(jìn)入檢索表達(dá)式瀏覽窗口； 5、點(diǎn)擊Search PubMed將顯示檢索結(jié)果。,主題詞MeSH檢索,主題詞數(shù)據(jù)庫(kù) 在PubMed首 頁(yè)導(dǎo)航欄的右 下角,主題詞數(shù)據(jù)

5、庫(kù),主題詞MeSH檢索,輸入普通詞 查找對(duì)應(yīng)主題詞,MeSH,主題詞檢索可 以指導(dǎo)用戶高 質(zhì)量地檢索醫(yī) 學(xué)文獻(xiàn),主題詞MeSH檢索,一般一個(gè)主題 詞還要配合一 個(gè)副主題詞進(jìn) 行組合檢索,選擇副主題詞,Search Box with AND,主題詞MeSH檢索,點(diǎn)Sent to 將 檢索詞添加到 檢索表達(dá)式瀏 覽窗口,主題詞MeSH檢索,Search PubMed,主題詞檢索可 以達(dá)到比較滿 意的查全率和 查準(zhǔn)率,主題詞MeSH檢索,主題詞檢索是 在有主題標(biāo)引 的Medline數(shù) 據(jù)庫(kù)中檢索,主題詞檢索結(jié)果,主題詞MeSH檢索,普通詞不是規(guī) 范化的主題詞 檢索結(jié)果相關(guān) 度低,普通詞檢索結(jié)果,Pu

6、bMed全文獲取,通過(guò)PubMed檢索出來(lái)的文獻(xiàn)，部分我們通過(guò)瀏覽摘要即可，部分我們還需要查看全文，以作進(jìn)一步的研究，那么，我們?nèi)绾潍@取全文呢？ 一：免費(fèi)的全文,PubMed全文獲取,PubMed收錄 的文獻(xiàn)大約有 5%是免費(fèi)的 可以直接打開(kāi) 全文,免費(fèi)全文可直接打開(kāi),PubMed全文獲取,打開(kāi)PDF全文,免費(fèi)的全文并 不代表學(xué)術(shù)價(jià) 值低，大部分 的生命科學(xué)的 全文都是免費(fèi) 的,百度、google檢索小技巧 輸入 表面活性劑 filetype:ppt filetype:doc,PubMed全文獲取,二：學(xué)校已訂購(gòu)的全文 如果我們所需要的文獻(xiàn)，學(xué)校已訂購(gòu)了該文獻(xiàn)所在的全文型數(shù)據(jù)庫(kù)，我們也可以直接

7、打開(kāi)或到相應(yīng)的全文數(shù)據(jù)庫(kù)中查找。,Wiley(J Pharm Sci)；Ingenta；Nature,PubMed全文獲取,SpringerLink 和EBSCO等外 文全文庫(kù)，一 般學(xué)校也有訂 購(gòu),學(xué)校已訂購(gòu),PubMed全文獲取,學(xué)校未訂購(gòu)的 全文，如果不 是免費(fèi)的，一 般需要付費(fèi),學(xué)校未訂購(gòu),參考文獻(xiàn)管理軟件 Endnote NoteExpress,提綱,Endnote 基本原理 建立文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)（library） 文獻(xiàn)管理 撰寫文章時(shí)插入?yún)⒖嘉墨I(xiàn),科研信息管理工具 Endnote X4,一、Endnote基本原理,科研信息管理工具 Endnote X4,文獻(xiàn)使用過(guò)程中的常見(jiàn)問(wèn)題： 諸多文

8、獻(xiàn)從不同數(shù)據(jù)庫(kù)重復(fù)下載 文獻(xiàn)存放混亂，難以很快找到需要的文獻(xiàn) 寫論文時(shí)，文后參考文獻(xiàn)的編寫非常繁瑣 多次投稿時(shí)，要反復(fù)修改參考文獻(xiàn)格式 ,個(gè)人專題文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)Library *.enl,Filter,Filter,一、Endnote基本原理,圖表,文章標(biāo)題,期刊名,文摘,出版時(shí)間,關(guān)鍵詞,讀書筆記,全文,作者,群組管理,Endnote 管理界面,三、建立Endnote文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù),3.0 新建一個(gè)Library 3.1 手工錄入文獻(xiàn) 3.2 PDF文件導(dǎo)入和PDF文件夾導(dǎo)入 3.3 利用網(wǎng)絡(luò)插件導(dǎo)入 3.4 網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果導(dǎo)入 3.5 Google scholar導(dǎo)入 3.6 在線檢索 3.7

9、 全文查找與關(guān)聯(lián),科研信息管理工具 Endnote X4,3.0 新建一個(gè)專題庫(kù)library,創(chuàng)建一個(gè)新的數(shù)據(jù)庫(kù),Endnote專題文獻(xiàn)庫(kù)的建立,將數(shù)據(jù)庫(kù)命名 存放在某個(gè)合適的文件夾下,Endnote專題文獻(xiàn)庫(kù)的建立,已經(jīng)建立了一個(gè) “data mining” 專題數(shù)據(jù)庫(kù),Endnote專題數(shù)據(jù)庫(kù)的界面,分組窗口,文獻(xiàn)顯示窗口,文獻(xiàn)預(yù)覽和檢索窗口,3.1文獻(xiàn)導(dǎo)入-手工導(dǎo)入,科研信息管理工具 Endnote X4,3.2 文獻(xiàn)導(dǎo)入-單個(gè)PDF文件導(dǎo)入,科研信息管理工具 Endnote X4,3.2 文獻(xiàn)導(dǎo)入-PDF 文件夾導(dǎo)入,科研信息管理工具 Endnote X4,PDF導(dǎo)入的條件,必須是P

10、DF文檔 PDF中必須有DOI（數(shù)字對(duì)象標(biāo)識(shí)）號(hào) 必須有網(wǎng)絡(luò)條件（www.CrossR）,科研信息管理工具 Endnote X4,3.3文獻(xiàn)導(dǎo)入-網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)導(dǎo)入,Web of science Elsevier Springer(Kluwer) wiley(blackwell) Science Nature CNKI(text translation : UTF-8) VIP(text translation : GB2312),科研信息管理工具 Endnote X4,Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（ISI Web of knowledge平臺(tái)）,Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（ISI

11、Web of knowledge平臺(tái)）,選擇文獻(xiàn),Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（ISI Web of knowledge平臺(tái)）,選擇數(shù)據(jù)庫(kù),Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（ISI Web of knowledge平臺(tái)）,選擇數(shù)據(jù)庫(kù),所選擇的6篇文獻(xiàn) 批量導(dǎo)入Endnote中,Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（CNKI中文）,由網(wǎng)址進(jìn)入,Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（CNKI中文）,保存文件,Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（CNKI中文）,打開(kāi)已保存的txt文件,Endnote 文獻(xiàn)導(dǎo)入方法（CNKI中文）,3.4 導(dǎo)入文獻(xiàn)Google Scholar,3.6 文獻(xiàn)導(dǎo)入-Endnote內(nèi)部在線檢索,科研

12、信息管理工具 Endnote X4,3.7. 全文文獻(xiàn)的在線下載,選擇文獻(xiàn),點(diǎn)此找全文,3.7 全文文獻(xiàn)的在線下載,能夠找到全文的文章在此會(huì)有顯示,有標(biāo)識(shí)的文獻(xiàn)代表已將全文文章下載并鏈接在此處，可以直接打開(kāi)全文 無(wú)標(biāo)識(shí)的文獻(xiàn)提供的是全文的URL地址，可以打開(kāi)鏈接地址看全文,3. 7全文、圖片等資料的關(guān)聯(lián),選擇文獻(xiàn)可以添加附件,選擇本地貯存的文件就可以鏈接附件，共可鏈接45個(gè)不同類型的文件,3. 7全文、圖片等資料的關(guān)聯(lián),選擇文獻(xiàn)打開(kāi)添加圖片,選擇要添加的圖片,3. 7全文、圖片等資料的關(guān)聯(lián),點(diǎn)此添加圖片， 一條文獻(xiàn)只能添加一張圖片,提綱,Endnote基本原理 Endnote下載安裝 建立文獻(xiàn)

13、數(shù)據(jù)庫(kù)（library） 文獻(xiàn)管理 撰寫文章時(shí)插入?yún)⒖嘉墨I(xiàn),科研信息管理工具 Endnote X4,四、文獻(xiàn)管理,迅速編輯功能 查重：可以對(duì)查重的文獻(xiàn)進(jìn)行復(fù)制、粘貼、保存 分組：有兩級(jí)目錄，可通過(guò)組合已有組創(chuàng)建新組 檢索：多個(gè)字段，包括PDF 找全文,科研信息管理工具 Endnote X4,Endnote X4 的新功能,4.1 增加了迅速編輯的功能,快速編輯欄,Endnote X4 的新功能,4.1 增加了迅速編輯的功能,可以在這里直接編輯,鼠標(biāo)在修改文獻(xiàn)外可以直接保存,Endnote X4 的新功能,4.2 增加了查重文獻(xiàn)時(shí)的編輯功能,Endnote X4 的新功能,4.3 增加了全文檢索

14、的功能,可以對(duì)PDF進(jìn)行全文檢索,提綱,Endnote基本原理 Endnote下載安裝 建立文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)（library） 文獻(xiàn)管理 撰寫文章時(shí)插入?yún)⒖嘉墨I(xiàn),科研信息管理工具 Endnote X4,五、撰寫文章時(shí)插入?yún)⒖嘉墨I(xiàn),選擇參考文獻(xiàn) 在文中插入 選擇參考文獻(xiàn)格式style 保存副本 去掉代碼,科研信息管理工具 Endnote X4,EndNote X4 工具列功能說(shuō)明:,Citations 部份 : 點(diǎn)擊Insert Citation 會(huì)出現(xiàn)以下選項(xiàng):,查找Endnote中的文獻(xiàn),插入注釋( Numbered),把EndNote library 中所選文獻(xiàn) 插入 Word 文檔,查找End

15、note中的圖表,66,Citations 部份(續(xù)) :,返回或打開(kāi)EndNote library,編輯Word 文檔中的引文,通常用于刪除引文及其參考文獻(xiàn),修改編輯 EndNote 中相應(yīng)參考文獻(xiàn), 但第一作者和年代不可修改,67,Bibliography 部份 :,根據(jù)刊名選擇參考文獻(xiàn)格式,更新參考文獻(xiàn)格式,68,Bibliography 部份(續(xù)) :,點(diǎn)擊 Convert Citations and Bibliography 會(huì)出現(xiàn)以下選項(xiàng) :,會(huì)取消 Word 文檔中已格式化的 參考文獻(xiàn)只剩引文,可另選 Output Style 后點(diǎn)擊Update Citations and Bi

16、bliography 更新引文與參考文獻(xiàn)格式,投稿時(shí)去掉Endnote代碼,Word 2007功能,69,Endnote X4 的新功能,創(chuàng)建文中引用和文后參考文獻(xiàn)的關(guān)聯(lián),Endnote X4 的新功能,5.1 創(chuàng)建文中引用和文后參考文獻(xiàn)的關(guān)聯(lián),產(chǎn)生了和文后參考文獻(xiàn)對(duì)應(yīng)的鏈接,Endnote X4 的新功能,5.2 擴(kuò)展編輯引用的功能,可以對(duì)文獻(xiàn)引用進(jìn)行編輯,工具可以對(duì)引用文獻(xiàn)格式化或?qū)С?Endnote X4 的新功能,5.3 在endnote中產(chǎn)生word引用的臨時(shí)組,引用了文獻(xiàn),產(chǎn)生臨時(shí)組,Endnote X4 的新功能,5.4 在導(dǎo)出文獻(xiàn)庫(kù)中識(shí)別word的引用,導(dǎo)出traveling

17、library文獻(xiàn)庫(kù),Endnote X4 的新功能,5.5 在導(dǎo)出文獻(xiàn)庫(kù)中識(shí)別word的引用,在導(dǎo)出的文獻(xiàn)庫(kù)中可以顯示word的引用,荷蘭醫(yī)學(xué)文摘,PubMed基本檢索,自由詞檢索 在檢索框中鍵入一個(gè)或多個(gè)英文單詞（大寫或小寫均可），點(diǎn)擊GO按鈕，PubMed系統(tǒng)會(huì)自動(dòng)在主題詞表，期刊名表，短語(yǔ)表及作者索引中查詢與輸入的詞相匹配的形式，這就是它特有的“自動(dòng)詞匯匹配功能”。 例如：檢索腫瘤 (cancer)方面的文章。 在檢索框中輸入：“cancer”，再點(diǎn)擊“Go”按鈕。 PubMed將自動(dòng)地利用它的“自動(dòng)詞匯匹配”功能將重要的詞語(yǔ)結(jié)合在一起，并將不規(guī)范的詞語(yǔ)轉(zhuǎn)換成MeSH詞表中規(guī)范的用詞進(jìn)行檢索，比如，檢索“cancer” 將自動(dòng)轉(zhuǎn)換為： neoplasmsMeSH Terms OR neoplasmsAll Fields OR cancerAll Fields,Search Box with AND,主題詞MeSH檢索,點(diǎn)Sent to 將 檢索詞添加到 檢索表達(dá)式瀏 覽窗口,PubMed全文獲取,學(xué)校未訂購(gòu)的 全文，如果不 是免費(fèi)的，一 般需要付費(fèi),學(xué)校未訂