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1、附件:中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)項(xiàng)目實(shí)施指南(試行)1組織實(shí)施管理101.1概述101.2實(shí)施保障101.3建設(shè)組織與分工101.4條件建設(shè)要求111.4.1硬件要求111.4.2 軟件要求112 中醫(yī)臨床術(shù)語112.1技術(shù)要求112.2實(shí)施要求122.2.1 技術(shù)路線122.2.2 實(shí)施方案122.3考核與驗(yàn)收133 數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)133.1 技術(shù)要求133.1.1基本要求133.2實(shí)施要求133.2.1實(shí)施籌備133.2.2實(shí)施步驟153.3考核與驗(yàn)收163.3.1模板驗(yàn)收163.3.2系統(tǒng)驗(yàn)收163.3.3數(shù)據(jù)質(zhì)量要求174. 數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析174.1技術(shù)要求174.1.1基本要求
2、174.1.2 擴(kuò)展要求194.2實(shí)施要求194.2.1遵循原則194.2.2基礎(chǔ)設(shè)施要求204.2.3實(shí)施步驟204.2.4任務(wù)分工234.3考核與驗(yàn)收244.3.1 平臺驗(yàn)收244.3.2 成果驗(yàn)收244.4基礎(chǔ)設(shè)施要求244.4.1 硬件254.4.2 軟件254.4.3 數(shù)據(jù)倉庫軟件部署251組織實(shí)施管理1.1概述“中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)”(以下簡稱“共享系統(tǒng)”)是基于臨床科研一體化理念,利用現(xiàn)代信息技術(shù),在標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化的基礎(chǔ)上,充分整合計算機(jī)、數(shù)理統(tǒng)計、數(shù)據(jù)挖掘、人工智能等方法構(gòu)建的中醫(yī)臨床研究的技術(shù)平臺。根據(jù)中醫(yī)臨床研究基地建設(shè)指導(dǎo)意見和中醫(yī)臨床研究基地業(yè)務(wù)建設(shè)要求,構(gòu)建
3、中醫(yī)臨床與科研信息共享系統(tǒng)是中醫(yī)臨床研究基地業(yè)務(wù)建設(shè)的重要任務(wù),是落實(shí)國家中醫(yī)藥管理局關(guān)于基地建設(shè)“一體兩翼”建設(shè)任務(wù)的重要舉措。為了指導(dǎo)、規(guī)范和推進(jìn)各基地中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)建設(shè),特制定中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)項(xiàng)目實(shí)施指南(簡稱“指南”)。1.2實(shí)施保障國家組織開展共享系統(tǒng)的規(guī)范研究,制定相關(guān)技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范和建設(shè)要求;基地在國家統(tǒng)一指導(dǎo)和協(xié)調(diào)下,按照相關(guān)要求開展共享系統(tǒng)建設(shè)。國家中醫(yī)藥管理局與各基地所在省級管理部門,定期對各基地共享系統(tǒng)建設(shè)進(jìn)度與質(zhì)量進(jìn)行檢查?;貞?yīng)當(dāng)把共享系統(tǒng)建設(shè)納入基地建設(shè)總體方案,統(tǒng)籌規(guī)劃,與基礎(chǔ)設(shè)施建設(shè)、學(xué)科??平ㄔO(shè)等協(xié)同推進(jìn),一并落實(shí)。1.3建設(shè)組織與
4、分工(1)國家中醫(yī)藥管理局建立國家中醫(yī)醫(yī)療與臨床科研信息共享系統(tǒng)專家指導(dǎo)小組,負(fù)責(zé)基地共享系統(tǒng)建設(shè)中相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)的制定、數(shù)據(jù)共享協(xié)調(diào)、運(yùn)行管理咨詢和科研方法指導(dǎo);搭建中醫(yī)臨床科研信息學(xué)術(shù)交流平臺,定期組織開展中醫(yī)臨床研究的相關(guān)學(xué)術(shù)活動與技術(shù)交流,培養(yǎng)高素質(zhì)中醫(yī)臨床研究人才。(2)基地要成立共享系統(tǒng)建設(shè)領(lǐng)導(dǎo)小組,設(shè)置相應(yīng)機(jī)構(gòu),配備專職負(fù)責(zé)人員。領(lǐng)導(dǎo)小組組長由醫(yī)院主要領(lǐng)導(dǎo)擔(dān)任,成員應(yīng)當(dāng)包括重點(diǎn)研究病種負(fù)責(zé)人以及科研、信息、醫(yī)務(wù)等職能科室負(fù)責(zé)人。領(lǐng)導(dǎo)小組負(fù)責(zé)制定基地共享系統(tǒng)建設(shè)規(guī)劃;協(xié)調(diào)、組織重點(diǎn)研究病種技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)體系制定、人員技術(shù)培訓(xùn)、硬件建設(shè)、軟件系統(tǒng)安裝、信息系統(tǒng)整合及運(yùn)行調(diào)試等方面建設(shè)任務(wù)。(3)
5、重點(diǎn)研究病種須配備參與病種研究且熟悉術(shù)語標(biāo)準(zhǔn)制定規(guī)范的固定人員,負(fù)責(zé)梳理歸集與本病種相關(guān)的名詞術(shù)語,提出和更新重點(diǎn)病種相關(guān)的術(shù)語字典,制定、維護(hù)和更新重點(diǎn)病種的病歷模板。(4)基地科研管理或醫(yī)務(wù)部門須建立科研數(shù)據(jù)質(zhì)量控制體系,規(guī)范和監(jiān)督重點(diǎn)病種的數(shù)據(jù)采集過程;指導(dǎo)重點(diǎn)病種術(shù)語、模板和標(biāo)準(zhǔn)體系的建立。配備熟練掌握中醫(yī)理論、具有臨床科研數(shù)據(jù)的分析、挖掘能力的臨床科研方法學(xué)研究人員,開展重點(diǎn)病種療效評價、診療方案優(yōu)化與評價、名老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)總結(jié)和傳承研究等工作。(5)基地信息管理部門須有熟練掌握醫(yī)院his、lis、pacs等系統(tǒng)安全運(yùn)行與維護(hù)的專職人員;配備掌握delphi語言等軟件編程語言和oracl
6、e等專業(yè)數(shù)據(jù)庫開發(fā)應(yīng)用能力的固定人員,負(fù)責(zé)數(shù)據(jù)審核、系統(tǒng)維護(hù)、傳輸數(shù)據(jù)以及數(shù)據(jù)導(dǎo)出等。(6)基地可根據(jù)實(shí)際需要,設(shè)立共享系統(tǒng)建設(shè)專家技術(shù)組,為共享系統(tǒng)建設(shè)提供技術(shù)咨詢、方案審查和質(zhì)量評定等。(7)中國中醫(yī)科學(xué)院深入研究共享系統(tǒng)關(guān)鍵技術(shù)問題,為基地提供共性產(chǎn)品及技術(shù)服務(wù),參加項(xiàng)目的整體部署和人員培訓(xùn),指導(dǎo)制定建設(shè)規(guī)劃與方案。1.4條件建設(shè)要求1.4.1硬件要求共享系統(tǒng)是在整合醫(yī)院lis,pace,his,ris等信息集成網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上的應(yīng)用系統(tǒng)。醫(yī)院的硬件系統(tǒng)如中心機(jī)房配置、綜合布線系統(tǒng)、網(wǎng)絡(luò)建設(shè)、數(shù)據(jù)庫及應(yīng)用服務(wù)器、存儲系統(tǒng)等的配置應(yīng)符合國家(或國際)相關(guān)建設(shè)規(guī)范及技術(shù)標(biāo)準(zhǔn),核心設(shè)備需滿足中醫(yī)臨
7、床研究的需求,并保證基地信息平臺的安全運(yùn)行。1.4.2 軟件要求共享系統(tǒng)建設(shè)的應(yīng)用軟件主要包括:臨床數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)、數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)、數(shù)據(jù)倉庫及分析軟件、集成軟件等。臨床數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)是基于結(jié)構(gòu)化的中醫(yī)電子病歷系統(tǒng),執(zhí)行國家中醫(yī)藥管理局關(guān)于中醫(yī)醫(yī)院信息化建設(shè)功能規(guī)范和電子病歷的各項(xiàng)規(guī)定。其他應(yīng)用系統(tǒng)根據(jù)實(shí)際需要為共享系統(tǒng)的接入提供開放接口,符合中醫(yī)臨床研究的需求,保證基地共享系統(tǒng)的正常運(yùn)行。2 中醫(yī)臨床術(shù)語中醫(yī)臨床術(shù)語集是中醫(yī)、西醫(yī)規(guī)范術(shù)語有機(jī)匯集,是臨床術(shù)語字典、臨床數(shù)據(jù)挖掘利用的基礎(chǔ)和規(guī)范術(shù)語的主要來源和支撐。術(shù)語字典是在數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)中,中醫(yī)臨床規(guī)范術(shù)語應(yīng)用的工具,是臨床數(shù)據(jù)采集模板與病歷書寫的
8、術(shù)語來源。共享系統(tǒng)建設(shè),要求采用統(tǒng)一的中醫(yī)臨床術(shù)語集和主要來自中醫(yī)臨床術(shù)語集的術(shù)語字典。2.1技術(shù)要求重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典為共享系統(tǒng)提供支撐服務(wù)。主要體現(xiàn)在四個方面:支持?jǐn)?shù)據(jù)采集、支持?jǐn)?shù)據(jù)檢索、支持挖掘模型的形成、支持病歷模板的生成。(1)支持?jǐn)?shù)據(jù)采集提供臨床數(shù)據(jù)采集的便捷性及靈活性,同時排除冗余信息。(2)支持?jǐn)?shù)據(jù)檢索支持?jǐn)?shù)據(jù)檢索調(diào)用,可以根據(jù)實(shí)際需要檢索術(shù)語,能將所需術(shù)語及術(shù)語的各種屬性包括同義術(shù)語、編碼等檢索出來。(3)支持挖掘模型的形成支持?jǐn)?shù)據(jù)挖掘模型的形成,為后期數(shù)據(jù)整理、臨床數(shù)據(jù)倉庫建立以及數(shù)據(jù)挖掘研究提供服務(wù),保證數(shù)據(jù)挖掘結(jié)果的真實(shí)性及準(zhǔn)確性。(4)支持病歷模板的生成病歷模板是采
9、集系統(tǒng)的核心,重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典應(yīng)支持病歷模板的生成。2.2實(shí)施要求2.2.1 技術(shù)路線2.2.2 實(shí)施方案(1)中醫(yī)臨床術(shù)語集的補(bǔ)充中國中醫(yī)科學(xué)院已研制了中醫(yī)臨床術(shù)語集,作為共同的資源提供給各基地應(yīng)用(各基地只有使用權(quán),版權(quán)屬于中國中醫(yī)科學(xué)院)。在實(shí)施過程中將根據(jù)各基地的使用情況進(jìn)行術(shù)語的補(bǔ)充。(2)重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典的形成根據(jù)基地重點(diǎn)病種研究的典型病歷與相關(guān)文獻(xiàn),收集病種常用的中醫(yī)術(shù)語,建立統(tǒng)一的重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典表結(jié)構(gòu)。將各重點(diǎn)病種的臨床常用術(shù)語及其屬性從中醫(yī)臨床術(shù)語集抽取到重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典。重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典的術(shù)語應(yīng)主要來源中醫(yī)臨床術(shù)語集,若需增加可根據(jù)規(guī)范納入。(3)重點(diǎn)
10、病種臨床術(shù)語字典的維護(hù) 重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典新增術(shù)語的審核。新增術(shù)語進(jìn)入術(shù)語審核表。審核表內(nèi)設(shè)有術(shù)語增加的時間、審核人、審核的時間、審核的結(jié)果。審核人員必須是是給予權(quán)限的重點(diǎn)病種研究專家。對納入到重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典的新術(shù)語給予標(biāo)識。重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典的刪改及修訂 。該字典的刪改及修訂必須是給予權(quán)限的重點(diǎn)病種研究專家,同時保留刪改及修訂的痕跡。2.3考核與驗(yàn)收重點(diǎn)病種臨床術(shù)語字典主要來自中醫(yī)臨床術(shù)語集,形成術(shù)語字典增加、刪除、修訂的機(jī)制與模式。3 數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)3.1 技術(shù)要求3.1.1基本要求(1)提供滿足臨床科研病歷數(shù)據(jù)采集工具采集系統(tǒng)以結(jié)構(gòu)化電子病歷為主要工具,能夠滿足中醫(yī)臨床醫(yī)療業(yè)務(wù)和
11、科研數(shù)據(jù)的同步采集需求。(2)符合電子病歷規(guī)范要求采集系統(tǒng)必須符合衛(wèi)生部電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)、國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)等規(guī)范的要求。(3)具備全面實(shí)時采集臨床信息功能采集系統(tǒng)支持全面、規(guī)范、實(shí)時采集多源、多媒體、多格式的臨床信息(文字、表格、圖片、音頻、視頻等)。(4)與其他醫(yī)療系統(tǒng)間數(shù)據(jù)共享采集系統(tǒng)能夠與醫(yī)院his、lis、pacs等系統(tǒng)集成融合,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)共享。(5)與數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)有機(jī)結(jié)合采集系統(tǒng)數(shù)據(jù)能安全導(dǎo)出,應(yīng)與數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)儲、數(shù)據(jù)挖掘工作有機(jī)結(jié)合,融為一體。(6)科研病歷監(jiān)測功能具備科研病歷質(zhì)量監(jiān)測功能,有效的核查、核對科研病歷數(shù)據(jù)信息。3.2實(shí)施要求3.2.
12、1實(shí)施籌備(1)系統(tǒng)實(shí)施范圍確定確定基地重點(diǎn)病種研究的科室。(2)功能模塊選擇各基地對采集系統(tǒng)提出應(yīng)用需求,項(xiàng)目實(shí)施組對需求進(jìn)行合理分析,選用適合該單位采集系統(tǒng)實(shí)施的功能模塊。(3)基礎(chǔ)設(shè)施要求基地軟硬件設(shè)備到位及網(wǎng)絡(luò)的暢通是結(jié)構(gòu)化電子病歷實(shí)施最基本要求,項(xiàng)目實(shí)施組入場前基地單位必須保證軟硬件設(shè)備到位,各部門科室網(wǎng)絡(luò)暢通。提供用于采集系統(tǒng)、數(shù)據(jù)挖掘分析系統(tǒng)專用服務(wù)器各一臺,滿足臨床、科研病歷數(shù)據(jù)采集、挖掘的實(shí)際應(yīng)用需求。應(yīng)選用當(dāng)前主流數(shù)據(jù)庫管理軟件如oracle等。(4)人員要求基地單位需要建立專職團(tuán)隊(duì)配合采集系統(tǒng)實(shí)施組完成實(shí)施工作。實(shí)施期間以實(shí)施組人員為主,醫(yī)院工作人員協(xié)助,基地科研人員逐步
13、熟悉工作流程和方法,為以后其它科室實(shí)施做好基礎(chǔ)和準(zhǔn)備。(5)系統(tǒng)接口設(shè)計要求系統(tǒng)接口方式采集系統(tǒng)接口方案根據(jù)醫(yī)院的實(shí)際情況或地區(qū)的要求制定,但方案需求要在實(shí)施組入場前明確。組織協(xié)調(diào)醫(yī)院應(yīng)協(xié)調(diào)該院信息系統(tǒng)(his/lis/pacs/ris等)與采集系統(tǒng)間的數(shù)據(jù)交換工作。采集系統(tǒng)能夠與醫(yī)院his、lis、pacs等系統(tǒng)集成融合,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)共享。(6)系統(tǒng)實(shí)施方案與實(shí)施計劃調(diào)研報告項(xiàng)目實(shí)施組進(jìn)行基地項(xiàng)目調(diào)研報告書準(zhǔn)備,包括醫(yī)院項(xiàng)目領(lǐng)導(dǎo)小組成員、醫(yī)院信息化現(xiàn)狀、醫(yī)院硬件建設(shè)情況(如機(jī)房、服務(wù)器等)、醫(yī)院重點(diǎn)科室及臨床科室情況、病歷結(jié)構(gòu)及模板格式、工作場所情況等。接口標(biāo)準(zhǔn)方案確定采集系統(tǒng)與his/lis/
14、pacs等系統(tǒng)的接口方案制定實(shí)施方案與實(shí)施計劃項(xiàng)目實(shí)施組根據(jù)調(diào)研書、接口工作方案,制定基地單位整體實(shí)施方案與實(shí)施計劃。3.2.2實(shí)施步驟(1)項(xiàng)目啟動會準(zhǔn)備會議議程、參加人員、會議通知、會議地點(diǎn)等。(2)環(huán)境檢查檢查服務(wù)器、客戶端環(huán)境基礎(chǔ)搭建環(huán)境(如操作系統(tǒng)、殺毒軟件等)工作是否完成、客戶端及網(wǎng)絡(luò)環(huán)境等是否能連通。(3)接口開發(fā)工作討論討論接口開發(fā)的方案及細(xì)節(jié)內(nèi)容,確定接口開發(fā)計劃。(4)項(xiàng)目啟動會召開領(lǐng)導(dǎo)小組組織,動員相關(guān)各個部門配合項(xiàng)目實(shí)施組進(jìn)行工作,明確下一步的工作計劃。(5)科室調(diào)研對醫(yī)院的情況進(jìn)行初步調(diào)研,對科室進(jìn)行調(diào)研,收集重點(diǎn)病種及臨床科室病歷模板資料。(6)接口開發(fā)與測試根據(jù)商
15、定的接口方案及計劃進(jìn)行接口開發(fā)工作。環(huán)境搭建與接口開發(fā)工作完成后,進(jìn)行實(shí)際聯(lián)調(diào)測試。(7)模板制作重點(diǎn)病種臨床術(shù)語的準(zhǔn)備參照中醫(yī)臨床術(shù)語部分模板生成嚴(yán)格按照衛(wèi)生部發(fā)布電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)及國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)電子病歷系統(tǒng)功能規(guī)范(試行)等規(guī)范的要求進(jìn)行模板制作。模板維護(hù)成立模板維護(hù)小組,專門負(fù)責(zé)重點(diǎn)病種科研模板及其它病種模板的整理制作與維護(hù)工作。負(fù)責(zé)增加、刪改調(diào)整病歷模板中元素內(nèi)容,達(dá)到臨床與科研應(yīng)用要求。(8)實(shí)施計劃確認(rèn)項(xiàng)目負(fù)責(zé)人對實(shí)施整體計劃和階段計劃進(jìn)行確認(rèn),共同配合執(zhí)行計劃(9)環(huán)境搭建安裝服務(wù)器、客戶端環(huán)境,并進(jìn)行調(diào)試(10)科室模板整理根據(jù)科室提供病歷模板需求及格式進(jìn)行模
16、板制作、整理、調(diào)整、測試工作,并與科室及院方負(fù)責(zé)人進(jìn)行模板確認(rèn)(11)培訓(xùn)準(zhǔn)備好培訓(xùn)環(huán)境、材料,對科室進(jìn)行采集系統(tǒng)應(yīng)用培訓(xùn)。包括各功能模塊應(yīng)用、常見問題處理、科研數(shù)據(jù)分析等培訓(xùn)內(nèi)容。采取循環(huán)式培訓(xùn)。(12)系統(tǒng)使用正式運(yùn)行采集系統(tǒng),將實(shí)際入院病人的病歷內(nèi)容按照電子病歷書寫規(guī)范要求填寫。重點(diǎn)病種數(shù)據(jù)采集關(guān)鍵點(diǎn),按照病歷模板設(shè)定內(nèi)容進(jìn)行結(jié)構(gòu)化采集,病歷采集信息根據(jù)結(jié)構(gòu)化程度定期進(jìn)行解析并審核,審核內(nèi)容為前臺采集數(shù)據(jù)與解析后數(shù)據(jù)的一致性?;財?shù)據(jù)中心承擔(dān)基地臨床與科研數(shù)據(jù)匯總、解析任務(wù),負(fù)責(zé)向國家中醫(yī)臨床研究數(shù)據(jù)中心上傳采集數(shù)據(jù)信息。(13)系統(tǒng)維護(hù)對電子病歷應(yīng)用常見問題進(jìn)行收集并整理。定期檢查服務(wù)
17、器、客戶端系統(tǒng)運(yùn)行情況。3.3考核與驗(yàn)收3.3.1模板驗(yàn)收應(yīng)遵循如下原則:(1)模板格式完全符合國家電子病歷書寫規(guī)范的標(biāo)準(zhǔn)。(2)病歷模板內(nèi)容遵循科研目的及需求,可有效完成科研病歷數(shù)據(jù)采集。(3)病歷模板中標(biāo)準(zhǔn)化術(shù)語來源于術(shù)語標(biāo)準(zhǔn)知識庫,可實(shí)現(xiàn)病歷內(nèi)容與后臺術(shù)語庫間的關(guān)聯(lián)。(4)保證病歷模板由五類基本元素組成:數(shù)值型、日期型、選擇型、字典型、文本型。(5)重點(diǎn)病種的病歷數(shù)據(jù)需測試幾十份,病歷解析完成后進(jìn)行病歷數(shù)據(jù)字段結(jié)構(gòu)核查。3.3.2系統(tǒng)驗(yàn)收系統(tǒng)在重點(diǎn)病種數(shù)據(jù)采集方面已達(dá)到目標(biāo)要求,同時也完成了本地化的改造工作,運(yùn)行穩(wěn)定,系統(tǒng)驗(yàn)收合格。3.3.3數(shù)據(jù)質(zhì)量要求病歷模板在臨床實(shí)際操作中高效、精確
18、的完成病人從入院記錄、病程記錄、手術(shù)記錄、量表、出院記錄等信息的書寫,其中重點(diǎn)病種臨床研究目標(biāo)涉及的關(guān)鍵信息以及病歷內(nèi)容中包括主訴、現(xiàn)病史、舌象、脈象、實(shí)驗(yàn)室檢查、中醫(yī)診斷、西醫(yī)診斷、辨病辨證依據(jù)等體現(xiàn)中醫(yī)診治特色的病歷內(nèi)容要求全結(jié)構(gòu)化采集。4. 數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析臨床診療數(shù)據(jù)是符合中醫(yī)理論的中醫(yī)診療方法和療效的直接證據(jù),采用結(jié)構(gòu)化采集系統(tǒng)完成數(shù)據(jù)采集之后,進(jìn)行面向臨床研究的數(shù)據(jù)利用研究是基地臨床科研信息共享的核心內(nèi)容和任務(wù)。在該階段,基地臨床研究人員需要基于臨床診療和研究積累,提出新穎合理的分析目標(biāo)。同時也需要根據(jù)臨床研究需求進(jìn)行數(shù)據(jù)清理、數(shù)據(jù)整理與轉(zhuǎn)換,以達(dá)到可靠數(shù)據(jù)分析的數(shù)據(jù)質(zhì)量要求。本
19、階段的研究過程分兩個交叉的研究步驟:數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析平臺的構(gòu)建與臨床數(shù)據(jù)利用分析研究。本技術(shù)與實(shí)施要求用于結(jié)構(gòu)化臨床診療數(shù)據(jù)形成后,進(jìn)行數(shù)據(jù)利用和挖掘分析時,在實(shí)施步驟和任務(wù)安排方面提供指導(dǎo)與參考。4.1技術(shù)要求參照國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)醫(yī)院信息化建設(shè)基本規(guī)范中的中醫(yī)臨床研究分析分系統(tǒng),名老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)傳承分系統(tǒng)和中醫(yī)輔助診療分系統(tǒng)的功能規(guī)范,結(jié)合國家中醫(yī)臨床研究基地臨床科研信息共享的要求,數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析須達(dá)到的技術(shù)要求如下。4.1.1基本要求(1)數(shù)據(jù)抽取、轉(zhuǎn)換與導(dǎo)入(etl)數(shù)據(jù)清理對結(jié)構(gòu)化病歷數(shù)據(jù)進(jìn)行清理,去除關(guān)鍵信息如大病歷癥狀體征、診斷、中藥處方等與關(guān)鍵療效指標(biāo)缺失的患者記錄;數(shù)據(jù)抽
20、取與轉(zhuǎn)換從結(jié)構(gòu)化病歷數(shù)據(jù)庫中抽取適合科研分析的數(shù)據(jù),設(shè)定抽取和代碼轉(zhuǎn)換規(guī)則,實(shí)現(xiàn)對來源病歷數(shù)據(jù)的篩選,并到數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)的自動轉(zhuǎn)換;數(shù)據(jù)導(dǎo)入支持大規(guī)模病歷數(shù)據(jù)到數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)的自動批量導(dǎo)入與匯總處理。(2)數(shù)據(jù)倉庫細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)模型建立囊括中醫(yī)病歷數(shù)據(jù)中患者人口統(tǒng)計學(xué)信息、大病歷、病程、方藥、理化檢查等信息,面向科研分析的關(guān)系數(shù)據(jù)模型,主要用于從病歷數(shù)據(jù)導(dǎo)入?yún)R總的大規(guī)模數(shù)據(jù)存儲;細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)的規(guī)范模型具有與細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)模型類似但較為簡化的數(shù)據(jù)模型結(jié)構(gòu),用于存儲規(guī)范整理后的科研分析數(shù)據(jù)集;大規(guī)模數(shù)據(jù)管理以大型數(shù)據(jù)庫管理軟件如oracle為依托,建立數(shù)據(jù)倉庫的安全訪問、結(jié)構(gòu)化查詢、增刪改處理的客戶端軟件環(huán)境與機(jī)制。
21、(3)數(shù)據(jù)整理與數(shù)據(jù)導(dǎo)出數(shù)據(jù)整理結(jié)合中醫(yī)臨床術(shù)語系統(tǒng)和臨床信息標(biāo)準(zhǔn)詞典,具有對癥狀體征、診斷、方藥和理化檢查等進(jìn)行規(guī)范和標(biāo)準(zhǔn)化處理的功能;數(shù)據(jù)審核支持對規(guī)范處理前后數(shù)據(jù)的人工審核,并對規(guī)范處理后數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)補(bǔ)充與修改;數(shù)據(jù)格式轉(zhuǎn)換將整理后數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成適合挖掘分析的數(shù)據(jù)格式;數(shù)據(jù)導(dǎo)出將規(guī)范整理后的數(shù)據(jù)導(dǎo)出為常用挖掘分析軟件能夠識別的數(shù)據(jù)輸入格式。(4)多維查詢檢索分別對癥狀體征、診斷、方藥和理化指標(biāo)等從時間、患者人口統(tǒng)計學(xué)信息、醫(yī)生等不同維度進(jìn)行即席查詢(由用戶自定義條件的查詢),實(shí)現(xiàn)面向病種研究需求的臨床數(shù)據(jù)探索性分析。(5)數(shù)據(jù)挖掘分析專用挖掘分析平臺具備基于實(shí)際臨床診療數(shù)據(jù),面向重點(diǎn)病種臨床
22、研究分析需求的專用挖掘分析功能,能夠?qū)崿F(xiàn)辨證經(jīng)驗(yàn)、有效處方和隨癥加減規(guī)律等分析,支持進(jìn)行基于臨床數(shù)據(jù)的有效方藥發(fā)現(xiàn)、臨床優(yōu)化治療方案形成和名老中醫(yī)經(jīng)驗(yàn)傳承研究等各種臨床研究的數(shù)據(jù)挖掘分析任務(wù);適宜挖掘分析算法以中醫(yī)臨床癥證治-效為分析主線,具備數(shù)據(jù)預(yù)處理、混淆因素檢驗(yàn)、分類、聚類、相關(guān)分析、復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析等適宜挖掘分析算法。4.1.2 擴(kuò)展要求(1)多維主題數(shù)據(jù)模型需要構(gòu)建面向主題的多維數(shù)據(jù)模型,以支持高效的多維查詢檢索功能。多維數(shù)據(jù)模型以rolap或molap模式實(shí)現(xiàn),對主題以事實(shí)表和維表形式進(jìn)行建模。(2)多源動態(tài)數(shù)據(jù)整合除結(jié)構(gòu)化電子病歷數(shù)據(jù)源之外,在數(shù)據(jù)倉庫平臺建立針對醫(yī)院其他信息來源如h
23、is,lis和現(xiàn)代臨床試驗(yàn)數(shù)據(jù)庫的動態(tài)數(shù)據(jù)匯總和整合技術(shù),整合基地個性化科研分析數(shù)據(jù)源到數(shù)據(jù)倉庫中。(3)臨床決策與循證支持在數(shù)據(jù)倉庫平臺基礎(chǔ)上,構(gòu)建面向特定病種診療的輔助決策支持功能,實(shí)現(xiàn)從臨床診療中尋找證據(jù)、分析證據(jù)和提煉證據(jù)的方法,輔助形成初步的臨床證據(jù)鏈。(4)高級數(shù)據(jù)挖掘分析多階段序貫治療方案的分析方法基于臨床實(shí)際診療數(shù)據(jù),利用內(nèi)隱對照和馬爾可夫決策過程模型,分析確認(rèn)較優(yōu)的動態(tài)序貫治療方案;有效核心處方與癥藥隨癥加減規(guī)律的分析方法研制發(fā)現(xiàn)并確認(rèn)有效的核心處方的層次復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析方法,以及隨癥用藥加減的藥癥關(guān)系知識的聚類分析方法。4.2實(shí)施要求數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析平臺的實(shí)施包括平臺構(gòu)建和數(shù)
24、據(jù)分析利用研究兩個主要階段。本部分闡述實(shí)施過程中需要遵循的原則、步驟和基本要求。4.2.1遵循原則以基地信息條件和基于實(shí)際臨床數(shù)據(jù)的病種臨床研究需求為基礎(chǔ),將數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析平臺構(gòu)建和病種臨床研究有機(jī)結(jié)合,以基地臨床研究和專職人員為主導(dǎo),進(jìn)行臨床倉庫及挖掘分析平臺的建設(shè)和示范應(yīng)用研究。注意在平臺構(gòu)建時的擴(kuò)展性,支持院內(nèi)的管理決策。4.2.2基礎(chǔ)設(shè)施要求除基本的局域網(wǎng)絡(luò)環(huán)境之外,數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析平臺相關(guān)的硬軟件環(huán)境如下。(1)硬件要求數(shù)據(jù)倉庫服務(wù)器用于分析用數(shù)據(jù)的存儲和管理。在保證運(yùn)行性能如cpu和內(nèi)存的基礎(chǔ)上,重點(diǎn)需要保證大容量的磁盤存儲(最好配置相應(yīng)的盤陣)。多維分析服務(wù)器用于分析報表的
25、應(yīng)用服務(wù),需要保證并發(fā)服務(wù)能力。etl數(shù)據(jù)處理和挖掘分析工作站用于數(shù)據(jù)導(dǎo)入的etl軟件的運(yùn)行和挖掘分析功能,鑒于etl的大規(guī)模數(shù)據(jù)導(dǎo)入和挖掘分析的高計算量,需要配置高端性能的服務(wù)器。(2)軟件要求oracle數(shù)據(jù)庫管理軟件(oracle 9i以上)bo中間件軟件(3)數(shù)據(jù)倉庫軟件部署在oracle數(shù)據(jù)庫環(huán)境中構(gòu)建ods數(shù)據(jù)表、細(xì)節(jié)數(shù)據(jù)表、多維數(shù)據(jù)表、復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析數(shù)據(jù)表以及系統(tǒng)運(yùn)行所需的元信息表等。 bo軟件的安裝和部署,元信息數(shù)據(jù)庫的導(dǎo)入和報表文件的導(dǎo)入處理。 etl和復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析系統(tǒng)的部署。4.2.3實(shí)施步驟(1)數(shù)據(jù)倉庫及挖掘分析平臺構(gòu)建臨床研究平臺由數(shù)據(jù)前處理、數(shù)據(jù)倉庫、專用數(shù)據(jù)挖掘和多
26、維檢索與展示等四部分功能系統(tǒng)構(gòu)成。數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)分析用數(shù)據(jù)的抽取、轉(zhuǎn)換和導(dǎo)入處理;數(shù)據(jù)倉庫系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)分析用數(shù)據(jù)按照臨床研究內(nèi)容涉及的數(shù)據(jù)元素及其關(guān)系進(jìn)行組織和管理,支持結(jié)構(gòu)化查詢、篩選和高效的數(shù)據(jù)分析服務(wù);專用數(shù)據(jù)挖掘分析系統(tǒng)在數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)組織模式的基礎(chǔ)上,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)挖掘分析算法和面向統(tǒng)計分析的數(shù)據(jù)導(dǎo)出接口;多維檢索與展示系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)直接基于數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)的多維檢索與展示,對臨床數(shù)據(jù)中顯性的數(shù)據(jù)關(guān)系從不同維度(證-癥-治-效)進(jìn)行展示。數(shù)據(jù)倉庫系統(tǒng)構(gòu)建在大型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)如oracle已經(jīng)安裝的基礎(chǔ)上,創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫,并生成數(shù)據(jù)倉庫關(guān)系數(shù)據(jù)表。針對臨床研究問題所對應(yīng)的數(shù)據(jù)內(nèi)容,采用數(shù)據(jù)模型設(shè)計軟件,設(shè)計
27、多維數(shù)據(jù)模型,并基于該模型生成數(shù)據(jù)倉庫中相應(yīng)的多維數(shù)據(jù)表;數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)的安裝與運(yùn)行測試在相應(yīng)的硬件服務(wù)器環(huán)境中進(jìn)行數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)的部署,針對采集形成的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換導(dǎo)入配置,形成并進(jìn)行數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換導(dǎo)入運(yùn)行測試,確保處理前后數(shù)據(jù)的一致性;專用數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)安裝與運(yùn)行測試安裝專用數(shù)據(jù)挖掘分析系統(tǒng),完成與數(shù)據(jù)倉庫系統(tǒng)的連接配置,聯(lián)機(jī)篩選數(shù)據(jù)倉庫數(shù)據(jù)形成數(shù)據(jù)集或采用測試數(shù)據(jù)樣例,進(jìn)行數(shù)據(jù)分析功能運(yùn)行測試;多維檢索與分析系統(tǒng)安裝與分析設(shè)計安裝多維檢索與分析系統(tǒng),在多維數(shù)據(jù)模型和臨床分析問題的基礎(chǔ)上,采用分析設(shè)計工具(如水晶報表)進(jìn)行分析報表的設(shè)計和發(fā)布。平臺構(gòu)建實(shí)施流程(2) 臨床數(shù)據(jù)利用分析臨床數(shù)
28、據(jù)分析利用階段主要任務(wù)包括:利用中醫(yī)臨床中采集的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),根據(jù)重點(diǎn)病種和重點(diǎn)科室確定的臨床分析目標(biāo),完成對中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)的前處理、數(shù)據(jù)挖掘分析和臨床研究成果總結(jié)等科研任務(wù)?;谇捌谕诰蚍治鼋?jīng)驗(yàn)和平臺構(gòu)建流程,數(shù)據(jù)利用分析的具體實(shí)施流程分成兩部分內(nèi)容:基于測試平臺的預(yù)分析和基于基地平臺的挖掘分析。基于測試階段的預(yù)分析目的是解決針對基地特定目標(biāo)挖掘分析的所有技術(shù)環(huán)節(jié),并由基地專有挖掘分析人員參與進(jìn)行平臺功能操作的學(xué)習(xí)和實(shí)踐,完成對其的初步培訓(xùn)任務(wù);基于基地平臺的挖掘分析則由基地專有挖掘分析人員和臨床研究人員為主導(dǎo)進(jìn)行常規(guī)挖掘分析應(yīng)用研究,平臺研究組人員提供技術(shù)指導(dǎo)和協(xié)助,并對挖掘分析過程平臺相關(guān)的
29、功能進(jìn)行可能的優(yōu)化和完善。挖掘分析需求的提出根據(jù)臨床診療實(shí)踐和研究積累,基地臨床人員根據(jù)病種研究特點(diǎn)提出面向分析的臨床研究需求,該臨床研究需求需要表達(dá)明確的目標(biāo)與內(nèi)容;挖掘分析需求需要具體化到數(shù)據(jù)的納入條件,研究目標(biāo)中可能涉及的主要臨床數(shù)據(jù)內(nèi)容如診斷、病史、癥狀體征、理化指標(biāo)、藥物和結(jié)局指標(biāo)等;從臨床角度,能夠估計當(dāng)前采集數(shù)據(jù)對該研究目標(biāo)的支持程度。研究目標(biāo)一定要結(jié)合實(shí)際采集的數(shù)據(jù),充分利用基地數(shù)據(jù)存在的優(yōu)勢和特點(diǎn),同時保證與臨床研究核心目標(biāo)相關(guān)的數(shù)據(jù)具有較高的數(shù)據(jù)質(zhì)量;該部分工作由基地臨床研究人員提出,并不需要直接提挖掘分析目標(biāo),僅需要臨床人員熟悉的臨床研究目標(biāo)。平臺技術(shù)組人員可以參與從挖掘
30、分析和臨床診療數(shù)據(jù)的一般情況的角度提供反饋,以達(dá)到臨床人員修改形成相對明確而新穎的面向分析的臨床研究需求。數(shù)據(jù)前處理根據(jù)數(shù)據(jù)分析需求,確定和選擇適合的相關(guān)信息,利用數(shù)據(jù)前處理系統(tǒng)的數(shù)據(jù)篩選、數(shù)據(jù)整理和數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換導(dǎo)出等功能,從中醫(yī)臨床數(shù)據(jù)倉庫中提取和篩選符合科研和臨床要求的結(jié)構(gòu)化臨床數(shù)據(jù);把與分析目標(biāo)相關(guān)的數(shù)據(jù)元素或變量進(jìn)行規(guī)范整理,對整理前后的數(shù)據(jù)進(jìn)行嚴(yán)格的數(shù)據(jù)審核,保證每一例用于分析的數(shù)據(jù)內(nèi)容與臨床病歷內(nèi)容一致,形成用于分析的數(shù)據(jù)集。顯性知識的探索性分析利用多維檢索與分析系統(tǒng)提供的分析功能,對與臨床分析目標(biāo)相關(guān)的報表進(jìn)行即時檢索和操作,并導(dǎo)出分析結(jié)果,結(jié)合臨床知識對導(dǎo)出結(jié)果進(jìn)行解釋與分析。隱性
31、知識的挖掘分析臨床研究基地應(yīng)能夠根據(jù)分析目標(biāo),基于數(shù)據(jù)倉庫整理后的數(shù)據(jù)和專用數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘建模和分析,選擇合適的數(shù)據(jù)挖掘分析方法,操作完成數(shù)據(jù)挖掘分析任務(wù);利用臨床知識和理論從分析結(jié)果中總結(jié)中醫(yī)診療規(guī)律和特點(diǎn),形成中醫(yī)專家知識庫,指導(dǎo)中醫(yī)醫(yī)生的臨床實(shí)踐。結(jié)果闡釋與臨床成果總結(jié)結(jié)果闡釋形成挖掘分析結(jié)果由基地臨床研究人員進(jìn)行解釋,若不能滿足預(yù)期研究目標(biāo),則需要根據(jù)情況回到挖掘分析的各個步驟進(jìn)行數(shù)據(jù)的重新處理和分析;臨床研究成果總結(jié)結(jié)合中醫(yī)基礎(chǔ)理論和預(yù)期臨床研究目標(biāo),由基地臨床研究人員完成挖掘分析結(jié)果的提煉和理論提升,形成臨床研究成果。數(shù)據(jù)利用分析階段實(shí)施流程4.2.4任務(wù)分工(1)原則在平臺構(gòu)建階段以技術(shù)組人員為主,基地臨床研究及其專職人員提供條件支持和建設(shè)需求。在數(shù)據(jù)利用分析階段以基地臨床研究及其專職人員為主,技術(shù)組人員提供技術(shù)指導(dǎo)與輔助。(2)具體任務(wù)與要求平臺構(gòu)建過程中的任務(wù)基礎(chǔ)設(shè)施準(zhǔn)備與專職人員配置準(zhǔn)備相應(yīng)的軟硬件條件,并配置專職數(shù)據(jù)倉庫、數(shù)據(jù)處理和挖掘分析人員;示范數(shù)據(jù)準(zhǔn)備與測試協(xié)助在示范數(shù)據(jù)準(zhǔn)備、數(shù)據(jù)內(nèi)容確定、數(shù)據(jù)整理和分析報表瀏覽測試等步驟提供支持和協(xié)助。數(shù)據(jù)分析利用中的任務(wù)主導(dǎo)并承擔(dān)挖掘分析的主體工作基
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