分離提取質(zhì)粒DNA并用分光光度計測量含量_第1頁
分離提取質(zhì)粒DNA并用分光光度計測量含量_第2頁
分離提取質(zhì)粒DNA并用分光光度計測量含量_第3頁
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文檔簡介

1、分離提取質(zhì)粒 DNA 并用分光光度計測量含量危險評估和安全考慮知情書開始實驗前,請認(rèn)真閱讀以下內(nèi)容,并簽名十二烷基磺酸鈉 (SDS):有毒,具 有腐蝕性,請戴手 套、穿實驗服,如 果濺到皮膚上,請 用大量的水沖洗。氫氧化鈉( NaOH ):具有強 烈腐蝕性,請戴手 套、穿實驗服,如 果濺到皮膚上,請用大量的水沖洗。異丙醇:具有很強 的腐蝕性,戴上手 套,穿上工作服, 如果濺到皮膚上, 請用大量的水沖 洗。微型離心機:很高 的速度旋轉(zhuǎn),要保 證離心管在離心機 中平衡放置,所有 的蓋子都要蓋緊, 有的離心機帶有內(nèi) 蓋,同樣要蓋緊。大腸桿菌 (E.coli):根據(jù) ACDP 目錄 1,危險 性較低,

2、將活細(xì)菌 和其他任何與活細(xì) 菌接觸到的物品放 到指定的廢物缸 內(nèi),然后高壓滅菌 處理,處理完后要 徹底洗手,如果手 沾有細(xì)菌,用抗微 生物的洗潔劑洗手,用消毒劑擦干 任何水滴。簽名:1、學(xué)習(xí)目標(biāo)本實訓(xùn)結(jié)束時,應(yīng)該會以下技能:利 用標(biāo)準(zhǔn)實驗程序分離提取質(zhì)粒 DNA利 用紫外分光光度計測量 DNA 濃度,并判斷提取的 DNA 純度說 出在實驗過程中,每一步試驗的相關(guān)性,并討論在分子生物學(xué)技術(shù)中分離 DNA 能力的重要性。2、實驗方法(1 DNA 的分離 收集 1.5 ml培養(yǎng)液 12 000g離心 1分鐘(確信離心管平衡放置)沉淀細(xì)菌,棄去 上清。備注:小心倒掉所有上清,這樣可以使沉淀盡量干燥。

3、每個離心管加入 200 l GTE溶液,充分混勻沉淀細(xì)菌,于室溫放置 5分 鐘。 加入 400l新配制的堿裂解液,上下溫柔翻轉(zhuǎn)幾次(不要用漩渦器,也不要劇烈 震蕩),輕輕混勻,在冰上放置 5分鐘。備注:細(xì)菌將很快在堿裂解溶液中裂解,如果裂解了,將會觀察到細(xì)胞懸液是澄 清的,如果打開離心管蓋子,會發(fā)現(xiàn)裂解后的溶液變得非常粘稠,像鼻涕一樣。 加入 300l冰預(yù)冷的 3 M 醋酸鉀溶液,溫柔的上下顛倒幾次,在冰上放置 5分 鐘。備注:醋酸鉀中和堿裂解液中的 NaOH ,這時可以看見白色像棉花絮狀的細(xì) 胞碎片和染色體沉淀形成。 最高速離心 1 分鐘,并把上清液轉(zhuǎn)移到一個新的做記號的離心管中。 備注:小

4、心操作,不要吸取任何沉淀,萬一吸取了沉淀,可以再一次離心。 加入 0.6倍體積( 540 l)的預(yù)冷的異丙醇,上下顛倒混勻,室溫放置 2分鐘。 備注:這一步, DNA 從溶液中沉淀下來,可能使溶液看上去有點渾濁,不用 擔(dān)心,這時的 DNA 可能有幾個微克。 最高速離心 1 分鐘,棄去上清。備注: DNA 沉淀肉眼很難看見,但是我們把離心管放入離心機時,可以把離 心管鉸鏈朝外,這樣通過離心, DNA 會沉在鉸鏈正下方的離心管底部。 用1ml 冰預(yù)冷 70% v/v乙醇溶液洗滌兩次。加入乙醇時稍微混勻,離心 30秒, 用微量取樣器移走乙醇。備注:小心!不要把沉淀 DNA 吸走,這時的沉淀更白也更容

5、易看見。 離心 1 分鐘,棄去上清液,空氣中干燥沉淀 510 分鐘。備注:一旦沉淀干燥了,應(yīng)該沒有乙醇?xì)埩魵馕丁?用 50lTE pH 7.5 溶解,加入 1l 10 mg/ml RNAase 溶液,室溫放置 1530分鐘( 2)通過紫外分光光度計測量 DNA 的含量 用 TE 緩沖液作稀釋劑,根據(jù)比色皿對 DNA 溶液進(jìn)行適當(dāng)?shù)南♂?,例?3ml 的比色皿,加入 30l DNA 溶液和 2970 l TE 緩沖液。在 260 nm和280 nm處 測量吸光值,并用 TE 作為對照溶液(空白對照)。 , 計算質(zhì)粒 DNA 的方法:50g/ml的 DNA A260 為1.0。備注:本實驗預(yù)期結(jié)果

6、為: 5ml培養(yǎng)液得到的 DNA 為 2 10g。DNA 的純度:純 DNA A260/A280 的比值是 1.8。備注:如果有蛋白質(zhì)污染,比值 經(jīng)常會降低。 結(jié)果Wavelength (nm Absorbance2602803、考核及評價1)計算提取質(zhì)粒 DNA 的濃度,考慮到稀釋倍數(shù),并做出評價2)計算提取 DNA 溶液 A260/A280 的比值,并判斷純度。3)討論分離提取的 DNA 的 3 個用途。4)在第 10 步為什么要加上 RNase?A 為了降解 RNA ,這樣提取的質(zhì)粒 DNA 就沒有 RNA 污染B 為了降解蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)能使質(zhì)粒和染色體緊密的在一起C 使染色體 DNA 更容易沉淀D 為了降解 DNA ,這樣提取的質(zhì)粒 RNA 就沒有 DNA 污染 E 為了降解細(xì)菌染色體 DNA(5)裂解液中含有 0.2N NaOH,NaOH分子量為 40,如果配制 100ml這種溶液, 應(yīng)該稱多少克 NaOH?A8.0 g B0.4 g C0.8 g D4.0 g E以上都不對( 6)下列

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